由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: 代谢物
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w********y
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1
来自主题: PsychoAnalysis版 - 中药的话题
考了考古,大家讨论的都挺有道理的。看着有些意思,我也来说一点意见。药既然要是为
病人准备的,服什么药还是应该视病人的情况而定。对病人有效的,就是好药。
我是学植物的,植物的生物化学不是一般的复杂。起主要作用估计是那些次生代谢物如生
物碱,萜类,酚类物质等。某个化合物的合成代谢途径,功能和结构,大概要花几十年来
了解。不同植物种类之间的差异又是千姿百态。关于中草药的作用,完全了解其毒性和作
用机理,目前可以说几乎是不可能的。另外生病的机理恐怕也不是那么容易搞明白。在不
知道为什么这个药会对这个病起作用的情况下。谨慎从事是有必要的。但是要等什么都弄
明白了才行事,对有些病人来讲未免太迟。
我感觉方舟子的科学太科学,有故做姿态的嫌疑。举的例子虽然有根有据,但不是很恰当
。毒磨菇和草药本来就不是一回事。说“燥热”和“上火”是重金属中毒的症状也不正确
。被毒死一说也有些夸大。现在很多中药都有动物实验和临床试验,也不是光凭经验。再
说,中药应用几千年,这个经验的参考价值如何,大家心中有数。中药的效果是事实。我
亲眼见过中药的奇效,我的邻居,一个被医院判了死刑的16岁男孩,他父母绝望地求助于
某中医
c*******n
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2
来自主题: ECUST版 - 借力细菌“洗”出石油
上海 五朵“金花”三度绽放
日期:2011-01-15 作者:任荃 来源:文汇报

本报讯 (记者任荃)代表我国最高科技水平的国家科技奖昨天在京揭晓,上海培
育的五
朵“金花”又一次绽放在人民大会堂。继2005年和2009年之后,上海科学家第三次同时
获得国家最
高科技奖、国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科技进步奖和国际科技合作奖等国
家科技奖五
大奖项;57个获奖项目(人)占全国授奖总数的15.9%,至此,上海已连续九年获奖总
数占全国比
例保持两位数,连续四年获奖比例达15%以上。

著名医学家、中国工程院院士、上海交大附属瑞金医院教授王振义荣膺国家最高科
技奖,成为
1999年该奖项设立以来上海获此殊荣的第三人。由他开创的“反式维甲酸+氧化砷”的
治疗方案让癌
细胞神奇地“改邪归正”,使患者五年生存率提高到95%,急性早幼粒细胞白血病由此
成为世界上第
一个可治愈的成人白血病。

前联合国副秘书长、前联合国环境规划署执行主任、德籍友好人士克劳斯·托普弗
,多年来致
力于促进中国及上海与国际社会的环境... 阅读全帖
r****p
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3
在鼓楼的那几年吧,又一次我去厕所吁吁,发现小便池前赫然放着七八个塑料大桶.
墙上也没有张贴任何说明解释,但是傻子也明白,是要你吁吁在桶里
于是大家就猜测,学校收集我们的代谢物干吗用, 好像有种说法是校办工厂要提取尿激
酶.
于是激起了大家不大不小的愤怒.
首先,学校不和我们打招呼作解释就提取我们的宝贵小便,说得难听就和养一群家畜一样
,呵呵.
第二,男女不平等.出于可以想象和理解的原因,这种收集方式大概对女生不适用.
第三,恶化环境卫生.大桶都是敞口放的气味四散.另外由于开口不大不容易对准,很容易
吁吁到外面.
这种收集大概持续了3,4个月,也许是攒够了还是怎么,后来就停了.
s*****e
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4
根据科技部2011年4月2日国科办[2011]20号文件,“微生物代谢国家重点实验室(
上海交通大学)”,获准立项建设。
上海交通大学“微生物代谢重点实验室”,由中科院院士邓子新教授领衔,汇聚了一批
优秀的中青年科研骨干,拥有一流的科研设备与条件,在DNA的硫化修饰、抗生素的组
合生物合成、重要环境污染物分解、生物合成与分解的调控机制等研究领域取得了一系
列具有国际影响力的研究成果。
该实验室以微生物代谢途径揭示与改良为目标,开展微生物菌种的筛选、代谢产物
的发现和鉴定、代谢基因的克隆、生化和调控机理的解析、新型代谢物的设计和组合生
物合成、分解、代谢互作以及代谢产物的生物效应评价等全方位的基础与应用基础研究。
研究特色鲜明、实验室定位准确,形成了微生物合成代谢、微生物分解代谢、微生物代
谢互作三个相互联系、互为依托的研究方向。
微生物代谢国家重点实验室的立项建设,必将促进微生物代谢领域的基础理论突破
和我国相关微生物产业的发展。同时,还将有力促进我校相关生命学科的整合与发展,
加快建立国际一流的微生物学科,推进生物化学与分子生物学、遗传学、生物工程、生
物信息学等学科的发展与交叉,形... 阅读全帖
n******u
发帖数: 2121
5
来自主题: Beijing版 - hood请进
你大概混淆了精子和精液的概念
精液作用是提供精子的生存环境,提供营养,转移代谢物什么的,跟体液大概类似。
精液就像是田地,精子就像是庄稼
精液就像是池塘,精子就像是鱼虾
s*****o
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6
【 以下文字转载自 Texas 讨论区 】
发信人: Zamborghini (BMW), 信区: Texas
标 题: 转贴:美国最新最轰动最全面的营养报告
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 12 15:17:00 2012, 美东)
美国最新最轰动最全面的营养报告:吃肉无异于吃毒
美国参议院「营养问题特别委员会」向全美提出的轰动性报告,是有史以来最庞大的饮
食健康报告,全文长达五千页之多。
一.中毒
由于动物被杀之前的极度恐惧和巨大痛苦,使体内的生化作用产生了极大的变异,致使
毒素遍布全身,尸体完全被毒化。
根据大英百科全书的记载, 动物身体中的毒素,包括尿酸与多种毒性分泌物、激素、排
泄物,遍布在血液与身体组织之内,因而提出中肯的见解:「若是与牛肉中所含的百分
之五十六不净的水分相比较,从坚果、豆类及谷类中所得到的蛋白质,显然要纯洁多了
。」  正如我们的身体在恐惧、愤怒或紧张时会得病一样,动物在极度危险的情况下
,体内会产生极大的生化异变。当它们见到同类惨遭屠宰,为了活命而极度挣扎时,体
内的多种荷尔蒙尤其是肾上腺素, 会异常分泌,死后,大量的荷尔蒙便留在了肉中... 阅读全帖
s******2
发帖数: 5274
7
资料图:王静百米夺冠(图片来源:新华社)
今天上午,十一运组委会在济南召开新闻通气会,通报福 建省女子田径运动员王
静兴奋剂违规事件的有关情况和处罚决定。这是继郭丽娜、栗杰兴奋剂违规事件后,本
届全运会上发现的第三例兴奋剂事件。
福建省代表团女子田径运动员王静,在第十一届全运会(以下简称十一运会)组委会
兴奋剂检查部于10月22日实施的赛内兴奋剂检查中, A瓶检测结果呈外源性表睾酮及睾
酮代谢物阳性。
根据国家体育总局《第十一届全国运动会兴奋剂违规处罚办法》等有关规定,十一
运会组委会对福建 省女子田径运动员王静兴奋剂违规事件做出如下处罚:
1、取消运动员王静十一运会的参赛资格和全部比赛成绩(女子100米决赛第1名及
200米预赛第2名);
2、取消福建省代表团十一运会体育道德风尚奖评选资格;
3、给予福建省代表团全国体育系统内通报批评,并通报其上级主管单位;
4、进一步的处罚将根据体育总局的有关规定由相关部门作出。
王静的兴奋剂违规事件再次表明,仍然有少数人为了追逐个人名利心存侥幸、铤而
走险使用兴奋剂。为此,十一运会组委会和国家体育总局再次强调,各代表团要警钟长
鸣,进
p*****y
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8
【 以下文字转载自 Animals 讨论区 】
发信人: ppenney (王晓伍), 信区: Animals
标 题: 【春意闹】几只小鸡连接了健康食物链
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 24 14:01:55 2014, 美东)
声明一下,这是俺死党家的小鸡。人家在四季如春,风景优美,寸土寸金的湾区,竟然
也大园子养鸡养鸭子 养鱼 种菜,招的我压根经常痒痒的。 别说别的,就这几只鸡,
让他们家有了完整的健康的绿色食品食物链。填补了一般老中健康食物链中的断层,不
信么? 那我给你解释解释。
首先,小鸡长大后,要下蛋,而小鸡吃的都是菜地里的虫子和绿叶菜,鸡蛋里就含有
了更多的蛋白质和维生素,而没有鸡饲料里所含有的一些激素,你说,这鸡蛋是不是最
有营养,最绿色?
二 ,小鸡消灭了菜地里的害虫,蔬菜丰产。免去农药残留的恶果,你说这蔬菜是不是
绿色的?
三 鸡粪,纯天然,没有任何激素代谢物的鸡粪,你别嫉妒,都不用你亲自去施肥,小
鸡吃到地里,拉在地里,随手就给菜菜施肥了,你说,人家的菜地能不肥么? 这有肥
,没有病虫害的菜地,长出来的菜是不是全天下秒杀一切后父后母呀。上几家... 阅读全帖
h**2
发帖数: 2841
9
来自主题: Zhejiang版 - 喝酒脸红的人易患癌,zz
对了,突然发现你这个论题里漏洞——喝酒脸红跟酒精代谢物浓度不一定直接相关
现展开下面纯净水式的讨论:
前提:酒精度和醉酒程度成正比
喝酒脸红,根据我们日常观察,和醉酒程度不是成正比的,所以跟血酒精浓度也不成正
比,有的人一喝就红,但是明显没醉,有的人脸煞白,结果已经稀里糊涂了
问一句:脸红的直接原因是什么?是皮肤表面毛细血管扩张。
造成毛细血管大量扩张的原因是什么?
一个可能是毛细血管密度本身就高——这个和体内血管生成angiogenesis的活跃程度有关
另一个是由于alcohol及代谢产物如Aldehyde的作用,这个跟肝脏ALDH2量有关
所以,ALDH2即使被证明跟癌症有关,也不能说脸红跟癌症有关——也可能跟患者体内
angiognesis的活跃程度有关,事实上血管生成angiogenesis的活跃程度跟肿瘤形成
tumorigenesis已经被证明是有密切关系。
l**a
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10
从没吃过啊。

街出售。童子蛋在东阳已成习俗,有人吃了上瘾,有人觉得味臭。童子蛋已在2008年入
选东阳市非物质文化遗产[1]。
元,真是天价“童子尿”童子尿有什么作用呢?
童男者尤良。的确,古代医生有许多采用童子尿作为药引或直接作为药给人们治疗疾病
。元代名医朱震亨医案中有这样的记载:“小便(童子尿)降火甚速。常见一位老妇人
,年逾八十,貌似四十。询其故,......人教服人尿。四十余年矣,且老健无他病....
..凡阴虚火动,热蒸如燎,服药无益者,非小便不能除。”在古代医案中还有不少类似
记载,如用童子尿治疗头痛、咽痛、腹痛、发热、肺痿咳嗽、痔疮等证。用法有直接饮
用、煎煮后饮用、与药同煎服、作酒服、送药饮等: 不褂泄湃擞黾备怪⒑椭惺罨柝
适比猛幼鼓缙淦曛械淖龇╗本草纲目]。
谓之轮回酒、还元汤,隐语也。”意思是小儿为纯阳之体,代表著无限生命力的阳气、
元气充满全身,尿液是肾中阳气温煦产生的,虽然已属代谢物,但仍然保留著真元之气
。不过古人并不是任意使用童尿,还是很有讲究的,如童尿用12岁以下的童子;童子要
忌食五辛热物;男用童女便;女用童男便,童尿斩头去尾等[本草纲目]。
中自饮... 阅读全帖
D****R
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11
来自主题: Zhejiang版 - 一个杭州人的美国求医经历
Author unknown
[一种声音]一个杭州人的美国求医经历
昨天,在19楼看了shenjiangan先生,勾起了无尽的回忆。
首先对shenjiangan先生及家人表示慰问,因为你们所经历的迷茫、痛苦、抉择,我和
老公感同身受。我老公也是两年前查出颈椎肿瘤,我们也体会了天塌下来的感觉,也面
临过手术选择,甚至也找过上海的肖建如医生。
所幸我们两个家庭都走过了这段人生最艰难的时候。唯一不同的是,我们最后选择了去
美国看病。所以故事有了完全不同的走向。
我们之前没有去过美国,没有美国医生的朋友,我们家也仅是小康之家。去美国看病只
是人生绝望中孤注一掷的选择。
我把这段难忘的经历和大家分享,只是想让更多的人知道,绝境还有其他可能。
一、发病
和shenjiangan一样,我老公也是人到中年,家里上有老下有小,甚至很巧的是他也有
个姐姐。
3年前,他时常觉得颈椎酸痛,开始没觉得异常,毕竟现代人十个里面有八个颈椎病。
直到2012年春节,他的颈椎病越发厉害,有时候会觉得手指发麻。于是,催他去检查,
在庆春东路的s医院骨科,拍了MRI,拿到片子找门诊医生看。医生看了半天,沉吟着说
:“你的... 阅读全帖
a***t
发帖数: 6
12
来自主题: Biology版 - 肿瘤新生血管生成(1)
有做新生血管生成的么?
astnt的博客: http://astnt.myresearchspace.cn
http://www.myresearchspace.cn/bbs/viewthread.php?tid=1568
新生血管生成(1)
2007-02-05 16:35:53 / 个人分类:肿瘤新生血管
肿瘤新生血管生成抑制是我博士论文的课题. 待我慢慢来讲述下他的发展历史吧(需要
理一理). 先付上血管生成的照片一张.
肿瘤新生血管抑制来作为抗肿瘤手段的基本理论非常简单: 肿瘤发生发展需要氧气和营
养,肿瘤细胞的转移往往也需要通过临近的血管,因此如果能切断肿瘤附近的血管,理论
上就能够饿死肿瘤细胞,并且阻止肿瘤的转移.
肿瘤的新生血管生成主要有以下几个步骤(见图):
1、肿瘤在很长一段时间内处于休眠期,处于休眠期的肿瘤仅仅依靠组织渗透维持其生
长。肿瘤在生长到1.0-2.0mm3的时候,肿瘤组织氧气,营养物质的提供和代谢物的清除
单靠周围组织渗透已经不能满足其生长的需要。在缺氧(hypoxia)的作用下,缺氧诱
导因子(hypoxia inducible factor, HIF
p****c
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13
来自主题: Biology版 - 请教:我该去争取吗?
一篇文章在organize中,里面80%的data都是我完成的,剩下的20%data是同一个lab的
一个graduate完成的,包括一个model图,和组织中几个测量代谢物含量的graph,实际
上是交给别人用LC-MS和NMR测的,但manuscript是这个graduate写的,因为他是老美。
现在初定并列第一,我在后面,心里有些不爽。因为我的data都是工作量很大的
overexpressing,knockdown,从质粒构建到后来转化,到后来WB,到活性分析,组织
中样品的提取和活性测定,的确很辛苦。但当初我刚来lab的时候,这哥们给我很大的
帮助,带领我熟悉lab,可以说如果没有他的帮助,课题不会进展如此顺利。BTW,这哥
们是深得老板赏识的一个学生。
现在我该去争取一下能否排第一?或者直接和这哥们协商一下?
多谢赐教!
t******y
发帖数: 716
14
成分不明和成分明确对东西是否有害在逻辑上没有相关性。
成分不明的东西可以有害也可以无害,
成分明确的东西同业也可以有害或无害。
另外你所谓的转基因成分明确,也只是你自己的猜想。你要证明转基因成分明确就要首
先对转基因作物从DNA,RNA,蛋白质,次生代谢物,以及其他小分子进行测试,看看转
基因的成分是否真的明确,是否真的和野生型只有转进去的基因的那点差别,转基因不
会影响作物的其他成分发生变化。
实际上我认为,转基因从来都不是一个基因发生变化的事情,而且对整个个体都会产生
影响。当然这些影响是否对人类有害,还需要长期测试验证。而那些鼓吹转基因的安全
的人恰恰忽略了验证这个过程,盲目大跃进。

前的
s********n
发帖数: 2939
15
1. 好氧细菌(16S rRNA鉴定);
2. 不是严格的嗜砷生物(not obligate arsenophile);
3. 此菌在磷存在的条件下生长得更好;
4. 在As+/P-的条件下,细胞中还是含有一定量的磷(从试剂中带入),但砷大概是磷
的7.3倍(文章中显示砷的测定不是很准确),而且此数量的磷据推测不足以满足细菌
生长的需要;
5. As+/P-条件下生长的细胞比As-/P+条件下生长的细胞大,主要是由于产生了PHB;
6. 作者通过实验证明As分布在细胞的各个部分,包括DNA, RNA, protein, lipids和
metobalites(放射性深和磷的分布);
7. 作者讨论提到尽管含As的代谢物尽管相对于P而言很不稳定,但他们推测此菌有一套
应对的方法,比如说利用PHB的疏水环境。
s********n
发帖数: 2939
16
应该是无水环境,貌似这些含砷的代谢物在无水环境下相对稳定?
W********w
发帖数: 771
17
谢谢大家的分享, 听你们一点拨, 胜过Google和看Paper无数。 那我就展开说说这个
project的历史和结果, 看看能不能说服你们这些专家, 并请推荐合适的杂志。
前面说过, 我是做蛋白化学和细胞生物学的。 我做的一个癌症相关蛋白质能够结合某
一体内代谢物,结构已阐明(不是我做的), 我比较了一下结构和dSNP Database发现
这个蛋白有个变意SNP所编码的氨基酸能够决定蛋白结合底物的flexibility (基于结构
的猜想, 需要用NMR做动态分析)。自己用小规模病例测了一下, 确认了SNP。本着无
知者无畏的精神, 在开会时跟两家有Sample的Lab谈合作测定这个SNP, 当然经过千苦
万难, 此处不表。 最后测了大约150个正常人群, 1000个良性肿瘤, 和300个癌症。
都是白人。 正常人群中, 基因型符合Hardy–Weinberg equilibrium, 但在其它两
个人群中不符合。良性肿瘤比正常人群, Minor Allele p=0.01, odds 近2; 癌症比
正常人群,Minor Allele p=0.03, odds 近2;癌症比良性肿... 阅读全帖
s******y
发帖数: 28562
18
我也觉得他走火入魔了。
其实生物上的理论,根本就没有达到可以指点实践的地步,他有点拿着鸡毛当
令箭的程度了。
而且,在免疫学的角度上来讲,很多多糖是可以增强免疫能力的,具体机理
大家都还不明白呢。他那么简单的把各种糖都当成代谢物来看未免过于简单化了
d*****r
发帖数: 2583
19
☆─────────────────────────────────────☆
timeonly (圆满) 于 (Thu Dec 23 15:28:05 2010, 美东) 提到:
发信人: desesperado (Estoy), 信区: Military
标 题: 方舟子谈蜂蜜:基本上是高浓度的糖
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 23 12:11:10 2010, 美东)
http://discover.news.163.com/10/1223/10/6OJ4ABLE000125LI.html
核心提示:方舟子认为用人工的方法,可以制造出一种与蜂蜜一模一样成分的东西。其实蜂蜜并不神秘,基本上就是高度浓缩的糖。蜂蜜除了水分,剩下的几乎都是各种各样的糖。蜂蜜的成分会有变化,但大同小异。
中青在线-中国青年报12月23日报道 什么是蜂蜜呢?这个问题似乎很简单,是蜜蜂采集花蜜酿造出来的甜味物质。蜜蜂把花蜜吸到它的第二个胃 ——“蜜胃”里面,在那里进行消化(让花蜜中的蔗糖大部分转化成果糖和葡萄糖),回到蜂巢吐出来,让水分蒸发、浓缩,这样,原来
含水分大约 80%)... 阅读全帖
g*********3
发帖数: 177
20
来自主题: Biology版 - system biology能解决啥问题
我觉得每个人根据自己的研究领域都可以对system biology有一个定义吧。我个人认为
什么时候能够根据各种数据Infer network from nuclear gene expression to
cytosolic metabolism 那就算是开始有用了。
找biomarker貌似用不着system biology吧,proteomics or microarray就能提供一些
信息了。
颜色,轮廓等这些数据我觉得都是一些浅层的数据,如果能profile细胞内各种代谢物
浓度等等啥的就好了。
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867409015
我觉得这篇文章还是说明了system biology的一些价值的。
s******y
发帖数: 28562
21
啊?可是代谢物大部分都是小分子,用NMR不是正好么?
质谱敏感是敏感,但是不好定量。
V***b
发帖数: 3419
22
好坑,跳吧。一个基因一个基因敲除的时代过去了,现在热点在于研究细胞动态过程,
代谢物的flux。

研究的,如果走omics的路
z*t
发帖数: 863
23
磁场频率达到800M Hz就能分得比较好
但这种机器据说市面上卖几百万美刀
现在常规的是400M Hz
用nmr最爽是可以non-invasive测细胞/组织代谢物,对clinical sample或者rare
sample比较适用。而且如果你找的合适的nmr信号标记细胞,你可以in vivo观测细胞
s******y
发帖数: 28562
24
来自主题: Biology版 - 小分子 vs 多肽
不是一个好主意。
病毒本身就是一个很麻烦的事情,
而且,如果用病毒的话,就很难控制给药和停药的时间。
虽然理论上可以用可诱导promoter来控制什么时候开始给药,但是实践操作
起来很麻烦。
比方说用小分子什么的可以试药,比方说先开一两个星期,看到疗效不好
就换一种,但是用病毒的话,一旦放进去了就永远的在体内了。你要换一种
药的话很麻烦。一是没有那么多的不同的可诱导promoter来给你用,二是
大部分可诱导promoter都是对代谢物产生反应的,所以放在人体里几乎不能
避免会出现一个程度的表达。
q****m
发帖数: 116
25
现在想设计一个实验,用流式细胞仪分离GFP的单个细胞,然后测得细胞的代谢物水平
,但是不知道流式细胞仪的测得过程是否对细胞代谢或者测得结果有影响,请问各位大
侠,有没有这方面的经验,是否这样做过?给点意见,谢谢大家
t******y
发帖数: 716
26
转基因的可能危害包括几种可能,1. 直接影响人体细胞健康,譬如转基因作物的此生
代谢物含有有毒成分。2. 影响体内的细菌群体平衡。其中,人体本身的基因构成,个
体差异也会对转基因产生不同的反应。人类的健康严重依赖周围的环境,譬如体内的微
生物,肠道微生物对人体的健康非常关键,食物的构成对肠道菌群的分布有很大影响。
W*****o
发帖数: 1780
27
来自主题: Biology版 - 批评sunnyday同学一下
1.有过报道转BT的玉米花粉落到其他植物上可以杀死蝴蝶的幼虫。或者猎食性昆虫吃了
中毒的害虫也中毒.....
2.少量昆虫发生在作物接近收获的时候,或者在换季时少量害虫才出现,害虫已经来不
及大量繁殖下一代了。如果虫子密度不大不会对最终的生产造成大的影响。,所以可以
不必施药了。
3.有过报道转基因棉花大量种植之后,棉铃虫大为减少,但另外一种蝽大量增加。虫子
的竞争并不一定只在食物层面。有可能在其他领域。比如一种昆虫会吃掉其他昆虫的卵
,又或者一种昆虫导致植物的防御系统激活(产生二级代谢物)对自己危害不大因为自
己有降解酶,但将其他昆虫趋避或者毒死从而抑制。

生抗
r******0
发帖数: 244
28
来自主题: Biology版 - 生物学求助
生物学上,如果一个代谢途径受到外界干扰,
其中一个或几个代谢物被用光(=0),
可以认为这个生物系统达到了一个新的Steady State 吗?
l**********1
发帖数: 5204
29
来自主题: Biology版 - 生物学求助
>生物学上,如果一个代谢途径受到外界干扰,
其中一个或几个代谢物被用光(=0),
可以认为这个生物系统达到了一个新的Steady State 吗?
Yes,it called shift of robustness,
references,
paper 1:
Molenaar D et al., (2009).
Shifts in growth strategies reflect tradeoffs in cellular economics.
Mol Syst Biol. 5:323.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19888218
its Fig. 4 D
>L. lactis shifts from the metabolically efficient >mixed-acid fermentation
at low growth rates to lactic acid fermentation at high growth
rates, whereas S. cerevisiae shifts from respiratory m... 阅读全帖
z*t
发帖数: 863
30
whatever pathways很可能是正常细胞或者组织也利用的pathway(也就是说是tumor
metabolism的副产物),只能说依赖程度会有不同,针对这些whatever pathway做
target最大的问题就是毒性的问题,毕竟cancer还没有牛逼到自己生生造出来几个
functional gene的水平,想想第一代化疗药不都是抗代谢物嘛,比如氨甲喋呤,5-FU
之类的。当然idh1/2这种neomorphic mutation就另外算了

does
s******y
发帖数: 28562
31
来自主题: Biology版 - 2015年影响因子新出炉

。。
这个需要用一些新的角度去考虑问题。单纯针对代谢物基本上是行不通的,glutamine,
2-deoxyglucose 的途径都有人试过,都失败了。具体怎么搞大家还没有想清楚。但是
一个思路就是通过调节代谢让癌细胞保持在一个可控的范围内,不要让他们进一步恶化。
K******S
发帖数: 10109
32
那不就是化学?难道是生物?光会背代谢通路本科生就行。
做代谢比较难的是最终代谢物的鉴定,学生物的化学训练一般都不够,一个有机物的名
字有时候都叫不出来,而且一般bioanalytical 的手段比如NMR,mass spec 什么的也接
触不多。

:代谢要求啥化学。不就是生化代谢通路吗?
K******S
发帖数: 10109
33
那不就是化学?难道是生物?光会背代谢通路本科生就行。
做代谢比较难的是最终代谢物的鉴定,学生物的化学训练一般都不够,一个有机物的名
字有时候都叫不出来,而且一般bioanalytical 的手段比如NMR,mass spec 什么的也接
触不多。

:代谢要求啥化学。不就是生化代谢通路吗?
n**e
发帖数: 2026
34
来自主题: Biology版 - 方舟子青蒿素谎言大观
好吧,难得出来一个认真的人。要深挖真相尼罗河愿意奉陪。不过要记住。焦点论题是
青蒿素口服是否吸收。下面这个链接可以接受吧。青蒿素用法内容与我前面引用的一样
。多了动力学内容。
有一种东西叫专业直觉。我不用查都知道青蒿素没有吸收的问题。查给你看是为了给你
这种人科普的。
===[[药动学]]===

青篙素口服后由肠道迅速吸收,0.5~1小时后[[血药浓度]]达高峰,4小时后下降一半
,72小时血中仅含微量。它在[[红细胞]]内的浓度低于[[血浆]]中的浓度。吸收后分布
于组织内,以肠、肝、肾的含量较多。本品为脂溶性物质,故可透过[[血脑屏障]]进入
脑组织。在体内[[代谢]]很快,[[代谢物]]的结构和性质还不清楚。主要从肾及肠道排
出,24小时可排出 84%,72小时仅少量残留。由于代谢与[[排泄]]均快,有效血药浓
度维持时间短,不利于彻底杀灭疟原虫,故复发率较高。青篙素[[衍生物]]青篙酯,T1
/2为0.5小时,故应反复给药。
[[肌肉注射]],首次剂量0.2g,6-8小时以后给药0.1g,第二,第三日各肌肉注射0.1g,总量
0.5g.重症第4日再给0.1g,或... 阅读全帖
T****i
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35
少数纯代谢酶的突变相对好解释。其他的比如家族遗传性的Alzheimer,知道几个基因
吧?机理清楚吗?连APP到底是致病还是保护机制都争议了20年。很多代谢酶的突变也
是一样,是哪个前体的积累还是哪个产物的代谢物缺失致病?这就是我说的中间层次的
。微观的基因,宏观的病,根据基因可以预测疾病不假,但中间过程不清楚。即使预测
,一这是基于已知的“具体知识”的预测,不是基于原理的预测,二这是统计的预测,
不是精确预测。打个比方,还是看Alzheimer,涉及到APP代谢的酶有多个,每个酶有多
个亚基。你知道APP和PS1突变能导致Alzheimer,你只可以做些纯生化实验,那么你能
推出其他有关酶的什么突变肯定会致病?
l**********e
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我觉得你不一定要从肠道中分离,你可以先看看肠道总有哪些细菌(估计已经有人做了
),然后用其中的一种益生菌喂老鼠(肠道微生物free的老鼠,我好像看过),然后再
做研究。一种一种的做就好了,否则会很难解释数据的(如果是好多种)。另外,我不
知道细菌在肠道中的数量能否控制,感觉不行,但某些突变体也许可以。至于定量的问
题,你可以根自然状态下的作比较,如果能找到关键代谢物,那就可以比较了。
s******9
发帖数: 283
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想法几十年前就有了,就是缺好用的技术。其中一个难点的如何把合成代谢物的基因都
找全。和微生物基因簇不一样,植物的基因是分散开的。不过测序技术发展了应该可行
了。其次是植物多基因的异源表达容易遇到困难。这些年Chris Walsh组出来当PI的敢
选植物的不多,都知道不容易。
c*********r
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我说一个方向,说的不好,欢迎大家讨论。
我也觉得很多工业界的有价值的东西在学术界是看不到的。比如说现在学术界很少有实
验研究微生物发酵酿造。但在工业界微生物发酵在制药、食品、生产某些原材料等方面
都是至关重要,某些特殊的菌种和发酵工艺都是保密级别的,不可能在公共数据库和文
章里找到的。
现在随着测序、合成生物学、CRISPR等技术的发展,越来越多的微生物资源被测序,所
以就有希望能改良现有菌种和开发新的菌种。如果能把这些技术应用到发酵上,哪怕能
提高生产效率1个百分点或者减少损失的频率,都意味着巨大的利润空间。当年对
CRISPR的发现做出很大贡献的就有欧洲的一个生产酸奶的公司,他们利用对噬菌体有免
疫的菌种来抵御噬菌体对细菌的伤害避免酸奶变坏。
说到酸奶,不知道大家有没有吃过Chobani Greek Yogurt。这是美国销量第一的Greek
Yogurt,这个公司每年销售额有1 billion以上,43岁的owner兼CEO就靠做酸奶身价有
将近2 billion。当然他的成功更多是商业上的成功,但是好的发酵菌株和工艺也是必
不可少的。
再举个例子,八九年前本科时候,国内我们微生... 阅读全帖

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来自主题: Biology版 - 三分之二癌症只因运气不好?
本文首发于2017年4月6日《南方周末》
近日,国内外主流媒体纷纷以“大多数癌症发生因运气不好”为题或类似题目,报道一
项2017年3月24日发表在美国《科学》杂志的研究成果,该研究指出癌症相关的基因突
变有三分之二是随机的,这不仅在学术界引起科学家广泛争论,也给普通民众带来极大
的困惑。
新论文,旧争论
癌症是所有恶性肿瘤的总称,都是由于一些细胞关键基因发生突变,导致细胞分裂和增
殖无法控制而造成的病变,而引发基因突变的原因多种多样,归纳起来则包括环境因素
、遗传因素,以及近年来发现的基因随机突变。一直以来,各国卫生部门、防癌公益组
织和医生都告诉大家,只要采取健康生活方式、避免接触致癌物等积极措施,大多数癌
症可以预防,很多科学研究也支持这一观点。
但是,来自美国约翰·霍普金斯大学的克里斯蒂安·托马赛蒂(Cristian Tomasetti)
、李路(Lu Li)和伯特·沃格斯坦(Bert Vogelstein)合作,2017年3月24日在美国
《科学》杂志在线发表了他们的最近研究成果,再次挑战了这一观点。
该研究小组基于423个国际癌症数据库,通过复杂的数学模型,分析了全球69个... 阅读全帖
c*********r
发帖数: 1312
40
来自主题: Biology版 - NGS vs mass spectrometry
我的一点感觉,一个很重要的不同在于NGS等DNA/RNA测序可以做de novo assembly/
discovery,MS做蛋白、代谢物等测序高度依赖于数据库,没有办法做de novo,数据库
里没有的,即使检测到了,也很难知道是什么东东,而且成本高。
什么时候MS也能做de novo assembly,来发现数据库里没有的序列和结构了,那时绝对
又会是一个推广MS应用的大高潮。
f*******9
发帖数: 74
41
来自主题: Biology版 - NGS vs mass spectrometry
代谢质谱好像比较小众,虽然我觉得很有用啊,现在癌症发文章的很多都测代谢物。

发帖数: 1
42
数字化、智能化、联网:寻找碳基生命的硅基未来
2017-06-07
“一旦计算机可以学习,整个世界都不一样了。”在不久前的“慈善+”2017跨界公益
论坛上,致力于把管理健康的权利还给每一个人的碳云智能创始人兼CEO王俊,向在场
观众构筑了一条碳基生命通往健康未来的硅基之路。
他认为,生命本身其实是一个学习系统,数字化、智能化、联网,将是未来碳基生命最
重要的发展方向,碳云智能要做的,就是构建一个生命的学习系统,从个体学习起,最
终帮助每个人管理自己的数字生命。以下为王俊演讲实录:
一只七星瓢虫引发的思考
这件事情要从我在北大上本科时讲起。这是我在北大的本科毕业论文,那是92年的时候
,25年前,个人计算机刚刚发达,所有人都把计算机当成一个大型的计算器。在那个时
候,我们在思考一个问题,我们想能不能做一个机器,模拟生物学的一些行为?我当时
本科论文做的是关于机器瓢虫的,自然界里面,蚜虫在一片叶子上是集团分布的,瓢虫
吃蚜虫时先开始随机行走,碰到食物之后不断转圈,直到把食物吃完,又继续随机行走
,这是自然界捕食行为的模式。
能不能在不告诉计算机的情况下,让计算机自己学会这样去吃食物?当时... 阅读全帖

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43
来自主题: Biology版 - 马兜铃酸致肝癌 问题的严重性
一种草药的阴暗面:可致肝癌的感冒药、药酒与小儿咳喘颗粒
一篇马兜铃酸的重磅论文,正在科普圈疯传,干脆把它写出来,周知一下。
该文发表在权威医学期刊《Science Translation Medicine》上,并荣登该杂志封面。
上一次马兜铃酸上封面还是1993年,当时发现了它可致肾癌(导致肾病的剂量只需130
毫克)。这一次则是发现它还可致肝癌。祸害完了肾脏又祸害肝脏,怪不得有网友调侃
马兜铃酸实在是天造地设的“理想毒药”。
也就是说,含马兜铃酸的中药,是中国人容易得肝癌的罪魁祸首之一。
(一个瞎想:独裁者杀人,是不是除了投放黄曲霉素,也可以喂他吃含马兜铃酸的中药
,名正言顺地治病、正大光明地投毒?一药多用,中药真是中华文明的大宝库。)
下面是一张确定含有马兜铃酸成分的中成药名单,大多是感冒药、止咳药和除湿镇痛药
酒,许多家庭抽屉中都能找到。现在,你可以把它们找出来全丢到垃圾桶了:
喘息灵胶囊,肺安片,复方蛇胆川贝散,鸡鸣丸,鸡苏丸,七十味松石丸,十三味疏肝
胶囊,胃福颗粒,消咳平喘口服液,新碧桃片,香藤胶囊,杜仲壮骨胶囊,杜仲壮骨丸
,风湿宁药酒,复方风湿药酒,复方拳参片,祛风除湿... 阅读全帖

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来自主题: Biology版 - 马兜铃酸致肝癌 问题的严重性
一种草药的阴暗面:可致肝癌的感冒药、药酒与小儿咳喘颗粒
一篇马兜铃酸的重磅论文,正在科普圈疯传,干脆把它写出来,周知一下。
该文发表在权威医学期刊《Science Translation Medicine》上,并荣登该杂志封面。
上一次马兜铃酸上封面还是1993年,当时发现了它可致肾癌(导致肾病的剂量只需130
毫克)。这一次则是发现它还可致肝癌。祸害完了肾脏又祸害肝脏,怪不得有网友调侃
马兜铃酸实在是天造地设的“理想毒药”。
也就是说,含马兜铃酸的中药,是中国人容易得肝癌的罪魁祸首之一。
(一个瞎想:独裁者杀人,是不是除了投放黄曲霉素,也可以喂他吃含马兜铃酸的中药
,名正言顺地治病、正大光明地投毒?一药多用,中药真是中华文明的大宝库。)
下面是一张确定含有马兜铃酸成分的中成药名单,大多是感冒药、止咳药和除湿镇痛药
酒,许多家庭抽屉中都能找到。现在,你可以把它们找出来全丢到垃圾桶了:
喘息灵胶囊,肺安片,复方蛇胆川贝散,鸡鸣丸,鸡苏丸,七十味松石丸,十三味疏肝
胶囊,胃福颗粒,消咳平喘口服液,新碧桃片,香藤胶囊,杜仲壮骨胶囊,杜仲壮骨丸
,风湿宁药酒,复方风湿药酒,复方拳参片,祛风除湿... 阅读全帖
t*****z
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45
赞同。我一个朋友研究微生物生理学,自学DL,用在他的研究中,给代谢物的循环建模。
o**********g
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46
帮我师姐发帖,希望能找到合适的访问学者位置,下面是她的基本信息,可直接联系其
本人,谢谢!
施树云,女,1979年生,博士,中南大学副教授,湖南省青年骨干教师,中南大学升华
育英学者。已于2011年获得国家留学基金委公派留学项目资助,指派国家为美国,可于
2012年任何时间到美国进行研究工作,研究领域可为分析化学,药物分析学,药物临床
药理学等相关方向。
2001年-2004年,中南大学分析化学专业,硕士;
2004年-2007年,浙江大学药物分析学专业,博士,研究内容天然产物活性成分的指纹
图谱研究及活性成分分离和结构鉴定;
2007年-2009年,中南大学临床药理研究所,博士后,研究内容为药物体内代谢物结构
鉴定及药物与生物大分子的作用研究;
2009年迄今,中南大学化学化工学院副教授,研究方向为分析化学、天然药物化学和临
床药理学。主持了国家自然科学基金(21005089),中央高校基本科研业务费(
201012200015),湖南省自然科学基金(10JJ4006),湖南省科技计划(2009RS3030),中
国博士后基金(20080440991),第二批中国博士后科学基金特别资... 阅读全帖
o**********g
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帮我师姐发帖,希望能找到合适的访问学者位置,下面是她的基本信息,可直接联系其
本人,谢谢!
施树云,女,1979年生,博士,中南大学副教授,湖南省青年骨干教师,中南大学升华
育英学者。已于2011年获得国家留学基金委公派留学项目资助,指派国家为美国,可于
2012年任何时间到美国进行研究工作,研究领域可为分析化学,药物分析学,药物临床
药理学等相关方向。
2001年-2004年,中南大学分析化学专业,硕士;
2004年-2007年,浙江大学药物分析学专业,博士,研究内容天然产物活性成分的指纹
图谱研究及活性成分分离和结构鉴定;
2007年-2009年,中南大学临床药理研究所,博士后,研究内容为药物体内代谢物结构
鉴定及药物与生物大分子的作用研究;
2009年迄今,中南大学化学化工学院副教授,研究方向为分析化学、天然药物化学和临
床药理学。主持了国家自然科学基金(21005089),中央高校基本科研业务费(
201012200015),湖南省自然科学基金(10JJ4006),湖南省科技计划(2009RS3030),中
国博士后基金(20080440991),第二批中国博士后科学基金特别资... 阅读全帖
o**********g
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帮我师姐发帖,寻找合适的访问学者位置,下面是她的基本信息,可直接联系其本人,
谢谢!
施树云,女,1979年生,博士,中南大学副教授,湖南省青年骨干教师,中南大学升华
育英学者。已于2011年获得国家留学基金委公派留学项目资助,指派国家为美国,可于
2012年任何时间到美国进行研究工作,研究领域可为分析化学,药物分析学,药物临床
药理学等相关方向。
2001年-2004年,中南大学分析化学专业,硕士;
2004年-2007年,浙江大学药物分析学专业,博士,研究内容天然产物活性成分的指纹
图谱研究及活性成分分离和结构鉴定;
2007年-2009年,中南大学临床药理研究所,博士后,研究内容为药物体内代谢物结构
鉴定及药物与生物大分子的作用研究;
2009年迄今,中南大学化学化工学院副教授,研究方向为分析化学、天然药物化学和临
床药理学。主持了国家自然科学基金(21005089),中央高校基本科研业务费(
201012200015),湖南省自然科学基金(10JJ4006),湖南省科技计划(2009RS3030),中
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C*********2
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来自主题: Chemistry版 - 谁做过UPLC-MS/MS?
大分子的,代谢物的鉴定
w******n
发帖数: 13202
50
一般而言,就是先把一定量的动物组织打碎(homogenize),然后加有机溶剂(可以用丙
酮),沉淀,离心除去蛋白,然后浓缩液体,过各种柱子,最后上lc/ms。
关键是如果你的中间代谢物的稳定性如何。
查询下文献吧,大把大把的
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