b******s 发帖数: 5365 | 1 接触凋亡不久,做Annexin V-PI staining 看到有Annexin V-PI+的细胞群。按理说
PI阳性的细胞胞膜一定不完整,Annexin V也会结合上去的啊,是什么导致这样的细胞
群?
我想来想去觉得可能是debris,但问题是我看的结果是凋亡而不是活细胞,这种情况下
gate( flow cytometry)基本上设了thresh hole后绝大多数events都要收集的,是不是
这样造就了这么一群“细胞”?哪位比较熟悉flow 和apoptosis的牛人请指点以下,谢
谢! |
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b******s 发帖数: 5365 | 2 恩,和好几个做了很多年flow的人讨论了一下,这其实并不少见。
主要是被我们实验室一个号称一直做cell death的德国博士后唬住了,那家伙意正严辞
地宣称不可能PI 进去了annexin V还染不上 ,让我这个刚开始做apoptosis的菜鸟迷惑
了一下。
我做flow的时候用了fluorence intensity thresh-hole, 用的gate也是离了一点距离
到原点,按理说应该把最小的碎片给排除了,这种PI单阳性的细胞是不是死亡的时候胞
膜出现了PI可以穿透而Annexin V不能进入的小孔?或者是Annexin V在细胞内和PS结合
不完全造成染色阴性? |
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S*****s 发帖数: 287 | 3 我用过 Invitrogen 的 Annexin V-Alexa488/7-AAD kit,蛮好用。为了回你这个帖我
去 Invitrogen 网站的 Fluorescence SpectraViewer 查了一下,结果贴在后面了。
RFP 的 excitation 和 7-AAD 一样,但是 emission 不一样。RFP 的 emission 是红
色而7-AAD 的 emission 是红外的,flow 机器应该能把两个分开。如果 RFP 的表达量
和细胞凋亡没关系的话更应该如此。真的想省心可以考虑 Annexin V-Alexa488 和
DAPI 一起用,这样三个颜色分得很开肯定不会有问题。 |
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i*******n 发帖数: 48 | 4 some stage of necrosis show Annexin V-PI+ staining
Annexin V 是35KD的蛋白
PI是小分子染料
他们对于膜的通透性的要求是不一样的 |
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m**********d 发帖数: 137 | 5 要分析的细胞表达RFP,跟annexin V/7-AAD有overlap,版上的前辈们有用过其他的试剂
解决这个问题么
谢谢 |
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s****l 发帖数: 395 | 6 看cell death的话,一般发文章有annexin V的数据就够了,买个FITC conjugated的,
很好用,7-AAD或者PI搞multi-color staining有点难度 |
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s*****g 发帖数: 7857 | 7 比如Annexin V/PI ,then Flow,可以快速测早期/晚期Apoptosis
而TUNEL 是根据DNA damage来测Apoptosis. The method should only identify cells
in the last phase of apoptosis.对吗? |
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t*****c 发帖数: 2 | 8 原理上贴壁细胞消化后细胞膜受损,不适宜用Annexin V检测,但我发现有些文献也用
此试剂盒检测贴壁细胞的凋亡情况,困惑中。。。求达人解答,多谢啦! |
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s*****g 发帖数: 7857 | 9 On your histogram:
PI+only (%#) --necrosis (dots on the Left side top)(died)
PI+/Annexin-V+ (%#)--later apoptosis (dots on the Right side top)(died)
PI-/Annexin-V+(%#) --early apoptosis (dots on the Right side bottom)(Not died)
PI-/Annexin-V- (%#)--alive & No apoptosis cells (health cells)(dots on the Left side bottom)
I use The sum of "PI+/Annexin-V+ (later apoptosis)" and "PI-/Annexin-V+(
early apoptosis)" to count Total Apoptosis (%)
You do not need do permeablize. If you permeablize, all ce... 阅读全帖 |
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e**o 发帖数: 345 | 10 第一次做FACS。 用了PI 和Annexin-V 去染死亡和凋亡细胞。结果出来后,他们告诉我
PIsorting 最上边的是死细胞,下边是活细胞,然后中间就是凋亡细胞。但问题是中间
的细胞很大一部分都是 FITC Annexin-V negative。该怎么解释阿? 细胞没有固定和
permeablize。下星期要给老板汇报。不知道怎么解释。特向大家请教。提前谢谢你的
回复。 |
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S*****s 发帖数: 287 | 11 有细胞重新做一次么?如果有的话加一个 permeablized cell 做 positive control。
膜破掉了之后 PI 和 Annexin 都可以自由进出细胞,所以这个 condition 应该是
Annexin 和 PI 都 positive。如果这个条件都做不出信号说明你的试剂坏掉了,要是
这个条件有信号但是你的样品没信号那就是诱导凋亡的条件问题。这个实验做完之后不
管结果如何你都有东西和老板讨论了,good luck! |
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k******y 发帖数: 236 | 12 在贴壁细胞中siRNA了某基因,之后就有大量的碎片漂浮在medium里,镜下看就是小圆
泡,diameter < 10um,而细胞即使trypsin消化下来之后也并不是规则的圆形,这些碎
片并不能uptake trypan blue,计数活细胞(trypan blue-, diameter > 10um) 的数量
有明显减少, 但以trypan blue+ 的%算,并不比对照组减少很多,大概从95%减少到
90%
用FITC-Annexin V和PI double staining,做flow没有看到明显Annexin V+细胞群,
AnnexinV+ PI+细胞群会增加但也不会增加太多(本身%也小于10%)
用50uM Z-VAD-FMK caspase inhibitor 与siRNA共同处理细胞, 这些碎片就不会产生,
计数活细胞的数量也不会减少, 和对照细胞没有差别
请问这是否说明细胞有死亡?能否看出是何种死亡方式?谢谢大家! |
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m*****u 发帖数: 15526 | 13 flow做什么?annexin V? annexin V 什么时候开始表达?跟caspase是一个什么时间
对应关系?细胞表达casp9 但不表达casp3会持续多久?谢谢。
间点 |
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M****e 发帖数: 70 | 14 TUNEL labeling of tissue slides would tell you roughly how many apoptotic
cells are present on the slides. or you can try Hoechst staining for DNA
fragmentation. apoptotic cells are stained more bright for Hoechst, which is
thought due to change of chromatin structure. this is usually done with
propidium iodide staining, which stains dead cells bright. so apoptotic cell
is propidium iodide dim, and Hoechst bright. membrane structure change occurs
during apoptosis, and annexin V binds specificall |
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t*e 发帖数: 47 | 16 你的用来做sortdecision的dot plot的x-axis和y-axis分别是什么?
x-axis: FITC Annexin-V
y-axis: PI
是这样么? |
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y******y 发帖数: 107 | 18 Analysis of protein phosphorylation in cisplatin-treated human cells
following annexin V-based separation and multi-antibody screening.
Cancer Genomics Proteomics. 2010 Sep-Oct;7(5):279-86.
请发送到 y*****[email protected] 谢谢。 |
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f******9 发帖数: 39 | 19 Annexin V is the marker for early apoptosis. You may not see any change in
morphology in microscopy.
Since all control work well, you should trust the FACS results. |
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s*****g 发帖数: 7857 | 20 PI+ ANN V-
也有可能是ANN V 抗体(连FIC)的不work了(时间长了,污染了...).(我就遇见过)
当然,如果apoptosis多,也有可能少量的PI+ ANN V-
建议用新KIT再做一次. |
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t*****P 发帖数: 36 | 21 很多ANX V-FITC试剂盒效率很低
可以考虑ANX V-EGFP |
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b******s 发帖数: 5365 | 22 可以,但要很小心操作,特别是容易结团的细胞比如hepG2什么的,另外同时染个PI |
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f********h 发帖数: 183 | 24 Can anybody help me find the full text of this paper?
Luo M, Hajjar KA.
Annexin A2 System in Human Biology: Cell Surface and Beyond.
Semin Thromb Hemost. 2013 Mar 12. [Epub ahead of print]
Email: y****[email protected]
Thanks so much. |
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T****u 发帖数: 424 | 25 很多死法,做Annexin V and PI staining
另外看有没有caspase activation with western of cleaved Caspase or luc
substrate.
不是所有的death都值得研究的,除非,你看到的death有具体的pathway
我们做screen的知道,很多compound扔下去细胞都会死。 |
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f********h 发帖数: 183 | 26 Can anyone help me find this paper?
Please send to: [email protected]
(function(){try{var s,a,i,j,r,c,l,b=document.getElementsByTagName("script");l=b[b.length-1].previousSibling;a=l.getAttribute('data-cfemail');if(a){s='';r=parseInt(a.substr(0,2),16);for(j=2;a.length-j;j+=2){c=parseInt(a.substr(j,2),16)^r;s+=String.fromCharCode(c);}s=document.createTextNode(s);l.parentNode.replaceChild(s,l);}}catch(e){}})();
/* ]]> */
Thanks very much!
Curr Pharm Des. 2007;13(35):3568-75.
The role of annexin II ... 阅读全帖 |
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q******g 发帖数: 3858 | 27 比如mtt assay, BrdU assay, annexin V staining. |
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q******g 发帖数: 3858 | 28 有意思。要看看原文。我一直把sort完的细胞放冰里。
annexin V staining的细胞也是放到冰里。并没有看到更多的细胞凋亡 |
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