t****p
发帖数: 1504 | 1 最近刚参加了一个Cold Spring Harbor的会议，听到一个talk，觉得真是激动人心。特
此跟大家分享一下。
简单的来说，就是质谱能够鉴别磷酸化的peptide，如果分辨率够高，加上定量，那么
就可以看到整个细胞在某种刺激下蛋白磷酸化随着时间的动态变化。
关键词：
定量的实现：假设同时培养两盘细胞，一盘是正常的培养液，一盘含有稳定重同位素的
arginine和lysine。第一盘加EGF，第二盘对照。如果把两盘细胞等量混合，就可以 看
到某个磷酸化peptide的相对变化。
富集：TiO2可以特异地富集磷酸化的peptide。
分辨率和灵敏度：是不是所有可被磷酸化的peptide都可以被检测到呢？由于人们无法
估计总共有多少磷酸化的peptide，所以不知道能cover百分之几。总之大概有10000个
磷酸化的peptide被检测到。
多点磷酸化：也可以看到。甚至是某个位点的磷酸化依赖于另外一个位点，也可能获得
信息。
定位：把蛋白分为胞质蛋白和核蛋白，可以提供蛋白磷酸化后穿梭细胞核的信息。
时间动态：比如加入EGF，处理不同时间。
Cluster：把磷酸化动态变化相似的蛋白 |
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h**********8
发帖数: 650 | 2 More than acetylation.
EMBO J. 2010 Jan 28.
Crosstalk between C/EBPbeta phosphorylation, arginine methylation, and SWI/
SNF/Mediator implies an indexing transcription factor code.
Kowenz-Leutz E, Pless O, Dittmar G, Knoblich M, Leutz A. |
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c**********r
发帖数: 109 | 3 A Post-doctoral position in structural biology is available to train in
structural biology of proteins of the urea cycle and arginine biosynthesis.
The successful candidate will be mentored in generating and testing
scientific hypotheses related to structural biology and biochemistry. He/she
will work independently on projects under general guidance. Tasks will
include design of study, collection and analysis of data, and reporting of
results at symposia and in peer-reviewed manuscripts.
Educati |
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T**********t
发帖数: 1604 | 4 只要ratio对了，蛋白总是能bind完全的。我不觉得你会有90%的蛋白都label不上
biotin。这个biotin label是通过和蛋白的Lysine或者Arginine反应结合上去的，反应
效率很高。除非你的蛋白里根本没有或者很少K和R残基，否则应该考虑的是over-
labeling的问题而不是label不上的问题。 |
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l*****r
发帖数: 131 | 5 楼上说得对，关键看你的抗体是不是在可溶部分。如果沉淀的是你的抗体，不妨试试2M
Arginin pH4.3，我试过洗脱效果比pH2.5要差点，但还行。另外还有个idea，如果BSA
在Glycine里不沉淀的话，加点BSA试试。如果这个办法可以能给我发个消息吗？祝好运。 |
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a********k
发帖数: 2273 | 6 花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branches in lamellipodia. Cell. 2008 Sep
5;134(5):828-42. PubMed PMID: 18775315; PubMed Central PMCID: PMC2570342.
Cai L, Makhov AM, Bear JE. F-actin... 阅读全帖 |
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f*c
发帖数: 2726 | 7 probablly n-end rule
(no arginine, lysine, leucine, phenylalanine, tyrosine, and tryptophan);
Met, Gly, Ala, Ser, Thr, Val, Pro may be better |
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A******y
发帖数: 2041 | 8 If that's what you want to do, you have to do both positive mutant (Lysine
to arginine) and negative mutant. Although, how many copies of histone H3
are there in human? I know for histone H4 there are more than 14 different
coding regions. |
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C******2
发帖数: 97 | 9 1,加个HA试试。
2，可以考虑用GLYCIN洗脱，感觉比3*FLAG好，特别是如果你已经用了3*FLAG构建了表
达载体。也可考虑用ARGININE洗脱。
搭车问个问题，有人做过非人类细胞的MS吗？具体的难点在哪里，DATABASE的不足？ |
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s******a
发帖数: 472 | 11 Nice...
A forward genetic screen... |
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p********r
发帖数: 147 | 12 NIBS的成功：说明在中国有科研基金，不受外界干扰，还是能做好科研的。但是现在很
多人只是做官，不做学问！ |
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b******y
发帖数: 627 | 13 Nod. But new returns should be more lean to science than politics. good
trend, keep it up. |
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F*Q
发帖数: 3259 | 14 希望不要把美国的体制照搬。学生和博士后还是需要由单位来管理而不是完全由老板掌
握。 |
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w***7
发帖数: 1637 | 15 source：http://bbs.netbig.com/thread-2491712-1-2.html
看了一下，今年不错啊，和清华并驾齐驱。
而且下半年我知道的还有两篇NS。
~~~~~~~~~~~~~~~~~
1.
Yuan W, Wu T, Fu H, Dai C, Wu H, Liu N, Li X, Xu M, Zhang Z, Niu T, Han Z,
Chai J, Zhou XJ, Gao S, Zhu B
Dense Chromatin Activates Polycomb Repressive Complex 2 to Regulate H3
Lysine 27 Methylation
Science, DOI: 10.1126/science.1225237, Aug. 24, 2012
2.
Liu B, Du H, Rutkowski R, Gartner A, Wang X
LAAT-1 Is the Lysosomal Lysine/Arginine Transporter That Maintains Amino
Acid Homeostasis
S... 阅读全帖 |
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k*****1
发帖数: 454 | 16 你这个给DNA双螺旋通电的例子举的不对。S4 是在细胞膜层里面，所以理论上如果任何
的带电氨基酸移动除了收到电场力之外，还会收到范德华力的影响--这种额外的分子作
用力可能来自脂分子，也可能来自于和S4相连的其他片段。所以在这种错综复杂的作用
力的情况，你还要保持“刚性移动”，你得需要类似于苯环结构那样的刚性平面才行，
才能保证在移动的过程当中，每个S4的氨基酸分子都能保持在一个平面上。这就是直觉
上我觉得你的结论不准确的原因。物理背景的人往往必须要依靠自己的直觉在自己不熟
系的领域内进行判断。
尽管我对结构生物学来说完全是外行，我还是随便google了一下。关于voltage-sensor
有一些最新的研究成功，证明了我的观点，就是voltage-sensor在电场当中的运动方式
远比刚性移动复杂，比如说：
（1）"Structural basis for gating charge movement in the voltage sensor of a
sodium channel", Vladimir Yarov-Yarovoy,et.al. P.N.A.S, (2012).
这... 阅读全帖 |
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d******n
发帖数: 29 | 17 J Pharm Sci. 2013 Mar;102(3):813-26.
Investigation of histidine stabilizing effects on LDH during freeze-drying.
Al-Hussein A, Gieseler H.
Pharm Res. 2003 Dec;20(12):1952-60.
Influence of histidine on the stability and physical properties of a fully
human antibody in aqueous and solid forms.
Chen B, Bautista R, Yu K, Zapata GA, Mulkerrin MG, Chamow SM.
Protein Expr Purif. 2011 Nov;80(1):91-6. doi: 10.1016/j.pep.2011.05.014.
Epub 2011 May 26.
Effects of L-arginine on solubilization and purificati... 阅读全帖 |
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f******g
发帖数: 1003 | 18 A vaccine targeting mutant IDH1 induces antitumour immunity
Monoallelic point mutations of isocitrate dehydrogenase type 1 (IDH1) are an
early and defining event in the development of a subgroup of gliomas1, 2, 3
and other types of tumour4, 5, 6. They almost uniformly occur in the
critical arginine residue (Arg 132) in the catalytic pocket, resulting
in a neomorphic enzymatic function, production of the oncometabolite 2-
hydroxyglutarate (2-HG)7, 8, genomic hypermethylation9, 10, 11, genet... 阅读全帖 |
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b******y
发帖数: 627 | 19 Is the receptor structure or its homolog's available? If so, do conservation
mapping to its surface. I would predict the binding pocket is 1) conserved;
2) positively charged especially Arginine; 3) some aromatics for pi-pi
interaction with bases of nucleic acid. This is the cheapest and first step
for whatever following up experiments.
If no structure available whatsoever, do a structure with/without ligand.
For biochemical experiments, UV-crosslinking and then MS-ID isn't a bad
option. |
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n*****g
发帖数: 4117 | 20 ☆─────────────────────────────────────☆
windf (gentle west wind) 于 (Mon May 11 15:50:29 2009) 提到:
谁能介绍几种单体含氨基(-NH2 or -NH)的polymer? 要commercially availble的,查si
gma-aldrich,居然没找到。
☆─────────────────────────────────────☆
hillhong (hillhong) 于 (Mon May 11 15:57:15 2009) 提到:
polylysine, poly arginine
si
☆─────────────────────────────────────☆
windf (gentle west wind) 于 (Mon May 11 16:03:59 2009) 提到:
多谢回复！
请问有没有不含其它heteroatom的？比如像poly(vinylaniline)之类的
☆──────────────────────────────── |
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g*****1
发帖数: 54 | 21 Influence of a hydrophobic enviromment on the structure of arginine-
carboxylate salt bridge
Author(s): Feng Y, Liu L, Mu TW, Guo QX
Source: CHINESE JOURNAL OF CHEMISTRY Volume: 20 Issue: 10 Pages:
958-962 Published: OCT 2002 |
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d****i
发帖数: 360 | 22 Journal of Materials Science: Materials in Medicine
Volume 22, Number 3, 469-479, DOI: 10.1007/s10856-011-4243-5
Synthesis and characterization of ionic charged water soluble arginine-based
poly(ester amide)
Jun Wu, Martha A. Mutschler and Chih-Chang Chu
Thanks a lot! |
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w******e
发帖数: 953 | 24 Remineralization efficacy of a toothpaste containing 8% arginine and calcium
carbonate on enamel surface
Huang, Y.. American Journal of Dentistry Volume: 26 Issue 5 (2013) ISSN:
0894-8275 |
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W***u
发帖数: 789 | 25 金橘的營養價值
1. 金橘對防止血管破裂，減少毛細血管脆性和通透性，減緩血管硬化有良好的作用；
2. 金橘對血壓能產生雙向調節，高血壓、血管硬化及冠心病患者食之非常有益；
3. 金橘有行氣解郁，消食化痰，有生津利咽醒酒的作用；
4. 常食金橘還可增強機體的抗寒能力，防治感冒。
[返回]金橘的選購
優質金橘形體小，稍呈橢圓，果實個頭與核桃相仿，肉質緊密，與外皮不易剝離，一般
都帶皮食用；核少或無核，顏色由表到里均為橙黃或金黃色，味酸甜，口感細脆，脈絡
極少，帶有柑橘類特有的清香味。
[返回]金橘適合的人群
一般人群均可食用
1. 胸悶郁結、不思飲食者或傷食飽滿、醉酒口渴者，急慢性氣管炎、肝炎、膽囊炎、高血壓、血管硬化者更加適合食用；
2. 脾弱氣虛者不宜多食，糖尿病患者、口舌碎痛、牙齦腫痛者忌食。
[返回]金橘的食療功效
金橘性溫、味辛甘酸；
具有行氣解郁、生津消食、化痰利咽、醒酒的作用；
是脘腹脹滿、咳嗽痰多、煩渴、咽喉腫痛者的食療佳品。
[返回]金橘的食用建議
食用每次5個左右
1. 很多營養素集中在皮中，故食之切勿去皮；
2. 用糖或蜜腌漬后食療效果更佳。
[返回]《全國中草藥匯編... 阅读全帖 |
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g****g
发帖数: 1828 | 26 板蓝根（常用别名：靛青根、蓝靛根、大青根）是一种中药材。中国各地均产。板蓝根
分为北板蓝根和南板蓝根，北板蓝根来源为十字花科植物菘蓝（Isatis tinctoria L.
）和草大青（I. indigotica Fort.）的根；南板蓝根为爵床科植物马蓝（
Baphicacanthus cusia (Nees) Brem.）的根茎及根。具有清热解毒、凉血消肿、利咽
之功效。可到大有恒中药材库查询购买。
目录
基本特征
1. 物种名称
2. 药材基源
3. 药物应用鉴别
4. 中药化学成分
5. 药理作用
药理学
1. 药代动力学
2. 药(毒)理学
医学药理作用
药用特征
1. 药性论述
2. 药方选录
3. 临床应用
4. 用药注意事项
现代研究
1. 主要成分:
2. 药理作用:
其他资料
1. 药用植物栽培
2. 板蓝根的食... 阅读全帖 |
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k*****e
发帖数: 372 | 27 hypocortisolism 导致 hypoNa 主要因为Ald不够，不能保Na
hypothyroidism导致hypoNa的原因不完全清楚，但还是主要是SIADH，有个理论是甲低
导致CardiacOutput低，renal perfusion不足，ADH就过度分泌，导致低钠
这是reference：
Hanna, FW, Scanlon, MF. Hyponatraemia, hypothyroidism, and role of arginine-
vasopressin. Lancet 1997; 350:755 |
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R**********n
发帖数: 473 | 28 Thanks so much!
arginine- |
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l*****n
发帖数: 81 | 29 不知道是不是MELAS syndrome.我们ICU收治过一个20岁左右，给CoQ10，Riboflavin，L
-arginine，病情有了很大改善。临床检查特征是持续性乳酸水平升高。
仅供参考。 |
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f****o
发帖数: 2770 | 30 我讲话难听由于家庭遗传，真不好意思。
我吧书本上的东西全部贴出来，你能看懂多少算多少吧。
Heart Failure
DEFINITION
Heart failure (HF) is a clinical syndrome caused by the inability of the
heart to pump sufficient blood to meet the metabolic needs of the body.
Heart failure can result from any disorder that reduces ventricular filling
(diastolic dysfunction) and/or myocardial contractility (systolic
dysfunction).
PATHOPHYSIOLOGY
Causes of systolic dysfunction (decreased contractility) are reduction in
muscle mass (e.g., myocardial infarctio... 阅读全帖 |
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p*******g
发帖数: 2976 | 31 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时，深深的鄙视一下自己的无聊行径！！
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖 |
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