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全部话题 - 话题: argonaut
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S*********b
发帖数: 180
1
来自主题: Animals版 - 【珍稀动物】Argonaut
动物名就叫argonaut,不知道中文是什么,就直接用英文了。
话说前几天我发(其实就是转)了个网上读到的文章,里面提到argonaut,还有视频,
很多网友都没看明白这到底是个什么动物,我也没弄明白。之后在网上搜了一下,主要
就是维基百科,趁这次活动,贴出来和大家分享,兼赚包子。
Kingdom: Animalia(动物界)
Phylum: Mollusca(软体动物门)
Class: Cephalopoda(头足类)
Order: Octopoda(八腕目)
Superfamily: Argonautoida(?)
Family: Argonautidae(?)
Genus: Argonauta(?)
这个argonaut和章鱼同属八腕目,算是近亲,不过再往下分就不一样了。这个argonaut
和章鱼最明显的区别就是母的会做壳,主要是护卵,还能起漂浮作用。是从其触手尖端
分泌出的物质形成的,成型后很像鹦鹉螺的壳,所以argonaut通常被叫做paper
nautilu... 阅读全帖
a***a
发帖数: 12425
2
来自主题: Animals版 - 【珍稀动物】Argonaut
传宗接代是大事。
照这样说,公Argonaut交配后断臂,以后还能再XOXO吗?另外,母Argonaut的体内会一
直留着公Argonaut的触手吗,如果下次再要交配岂不是体内还要多一只触手,这样下去
,最多能装下几只触手呢?
K**4
发帖数: 1015
3
来自主题: Biology版 - 说说 CRISPR and Argonaute
最近 DNA/RNA editing 火大,赶着劲头 Koonin 也拿了NAS。问题是学术界怎么和演艺
圈一个特点,评价学术也要看流行度,而不是看贡献多少;大家伙也是不做开创性工作
,一个劲的跟风和数杂志。
说到Argonaute,他后面的东西不比CRISPR少,不是有人感兴趣再做分析发现新系统吗
,其实有意思的结果几年前就出来了,有兴趣的人多看看文献。
s******y
发帖数: 17729
4
来自主题: Biology版 - 说说 CRISPR and Argonaute
这个Argonaute和miRNA里面那个是一样吗?洗手不干很多年了,这个东西不是十几年前
就热过吗
f*******e
发帖数: 109
5
来自主题: Biology版 - 说说 CRISPR and Argonaute
是的,10多年了一直研究到现在,从真核到原核,先是发现Argonaute进行RNA指导的
RNA剪切,后来发现也能进行DNA指导的RNA剪切,2014年发现能进行DNA指导的DNA剪切
。只是找出来的那两个种属的AGO只能在55度有活性,多找几个种属的应该能发现在37
度有活性的AGO并不意外,因为AGO多种细菌广谱存在。

发帖数: 1
6
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27893702
Nat Biotechnol. 2016 Nov 28. doi: 10.1038/nbt.3753. [Epub ahead of print]
Failure to detect DNA-guided genome editing using Natronobacterium gregoryi
Argonaute.
Lee SH1, Turchiano G2,3, Ata H4, Nowsheen S4, Romito M2,3,5, Lou Z6, Ryu SM1
,7, Ekker SC8, Cathomen T2,3,9, Kim JS1,7.
Author information
1Center for Genome Engineering, Institute for Basic Science (IBS), Seoul,
South Korea.
2Institute for Cell and Gene Therapy, Medical Center-University of F... 阅读全帖
S*********b
发帖数: 180
7
来自主题: Animals版 - 【珍稀动物】Argonaut
这是前几天提到argonaut帖子
http://www.mitbbs.com/article_t/Animals/44343.html
y**u
发帖数: 7459
8
来自主题: Animals版 - 【珍稀动物】Argonaut
呵呵,多亏了你的科普。我刚才中文google鹦鹉螺,图片里就出现了argonaut这个李鬼
。。。
a***a
发帖数: 12425
9
来自主题: Animals版 - 【珍稀动物】Argonaut
公Argonaut从一而终,可歌可泣。

their
u***************r
发帖数: 11227
10
来自主题: Headline版 - unidentified_title
发信人: onews(OverseasNews), 信区: Headline
标题: 豪华帆船在平静海面神秘消失 背后疑点重重
发信站: BBS未名空间站(Fri Sep 22 09:21:35 2017,GMT)
驾着帆船环游世界,在很多人眼中代表着诗和远方。
然而,广阔的大海上,却有着难以想象的危险,冰冷的数据会把人拉回现实。
据不完全统计,每年都有大约10,000多条在大洋上航行过的帆船遗骸被找到,然而奇怪的是,而这些船难牺牲者的遗体却往往在一些无人岛上被发现。
没人负责调查,也没有人拥有司法管辖权,那些目击证人们也不用受到询问便能一走了之,留下的是一堆难以解开的谜团…
发生在这位澳大利亚老爷子JohnRice身上的故事,便是典型的一例。
JohnRice是一位前海军工程师,他对航海无比熟悉和热爱,在海军的舰艇上积累了丰富的航海经验之后,Rice很早就给自己确定了遗愿清单上的愿望——驾着帆船环游世界!
作为一位前船舶工程师,Rice自己动手设计和建造航海的帆船,这艘船的船体和甲板用料都是最好的钢铁,先后两次在加拿大和墨西哥打造,Rice还结合自己多年的海上经验,给这艘帆船配备了许... 阅读全帖
S*****3
发帖数: 720
11
“中国百篇最具影响优秀国际学术论文” 评选所选论文代表了我国科技论文发展的最
高水平。论文源为前一年被SCI(科学引文索引)收录的中国论文。评选综合考虑发表
论文的期刊水平(影响因子和单篇引用次数)、论文类型、热点论文、论文的合作强度
、参考文献数和论文的完整性等方面。
其中生物类包括:
论文题目: Acute promyelocytic leukemia: from highly fatal to highly
curable
论文作者: Wang, Zhen-Yi; Chen, Zhu
所属机构: 上海交通大学医学院瑞金医院
来源期刊: BLOOD, 2008, 111(5):2505-2515
被引次数: 29
作者简介:
陈竺
卫生部部长,中国科学院院士,博士生导师
白血病系统生物学研究组组长
论文题目: Sorting of small RNAs into Arabidopsis argonaute complexes
is directed by the 5 ' terminal nucleotide
论... 阅读全帖
c********n
发帖数: 225
12
【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
项目 结题
date: 2017年8月2日
updated: 2017年8月4日
Note2017080401: added a few notable reviews/summaries
---------------------------------------
- NBT retraction note:
http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n7/full/nbt.3547.html#correction2
原文引用
“Retracted online 02 August 2017
We are retracting our study because of the continued inability of the
research community to replicate the key results in Figure 4, using the
protocols provided in our paper. In this figure we report that the
Natro... 阅读全帖
U**R
发帖数: 34
13
尘埃落定韩春雨? Nature Biotechnology 撤稿 NgAgo!
原创2017-08-03 知社 知社学术圈
海归学者发起的公益学术平台
分享信息,整合资源
交流学术,偶尔风月
北京时间8月3日,在经历过长达一年多的纷争和等待之后,Nature Biotechnology应韩
春雨等作者的要求,撤稿其发表于2016年5月的NgAgo论文。
从一鸣惊人到一波三折再到一声叹息,这一年多,中国学术界和韩春雨走过来了什么样
的历程?“身心疲惫”?NgAgo的争议,是否又就此尘埃落定? 请看知社对这一里程碑
事件的回顾,和业内人士特约独家点评。
首先,我们来回顾一下NgAgo事件的主要发展过程与关键时间节点。
2014年2月,荷兰科学家John van der Oost在Nature杂志发表论文,报道TtAgo可以在
高温条件下体外切割DNA。韩春雨受到启发,开始利用Argonaut进行基因编辑,并在
2014年5月中旬取得关键突破。
2015年6月3日,韩春雨向Nature Biotechnology投稿。12月21日,浙江大学沈啸和韩春
雨提交“以Argonaute核酸酶为核心... 阅读全帖

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14
来自主题: Biology版 - 尘埃落定韩春雨?
首先,我们来回顾一下NgAgo事件的主要发展过程与关键时间节点。
2014年2月,荷兰科学家John van der Oost在Nature杂志发表论文,报道TtAgo可以在
高温条件下体外切割DNA。韩春雨受到启发,开始利用Argonaut进行基因编辑,并在
2014年5月中旬取得关键突破。
2015年6月3日,韩春雨向Nature Biotechnology投稿。12月21日,浙江大学沈啸和韩春
雨提交“以Argonaute核酸酶为核心的基因编辑技术”的专利保护申请。2016年3月21日
,Nature Biotechnology接收韩春雨的投稿,并在5月2日在线发表其题为DNA-guided
genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute论文。
2016年5月8日,多家知名微信公众号以一鸣惊人为题,先后报道韩春雨在极端艰苦与简
陋的条件下,做出世界级的科技成果,韩春雨首次进入大众视野,引发热议,并受到许
多媒体热捧。对于许多处于中国学术体制边缘地带的本土青年学者,韩春雨的成功具有
极大的励志效应,让很多人看... 阅读全帖
U**R
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15
尘埃落定韩春雨? Nature Biotechnology 撤稿 NgAgo!
尘埃落定韩春雨? Nature Biotechnology 撤稿 NgAgo!
原创2017-08-03 知社 知社学术圈
海归学者发起的公益学术平台
分享信息,整合资源
交流学术,偶尔风月
北京时间8月3日,在经历过长达一年多的纷争和等待之后,Nature Biotechnology应韩
春雨等作者的要求,撤稿其发表于2016年5月的NgAgo论文。
从一鸣惊人到一波三折再到一声叹息,这一年多,中国学术界和韩春雨走过来了什么样
的历程?“身心疲惫”?NgAgo的争议,是否又就此尘埃落定? 请看知社对这一里程碑
事件的回顾,和业内人士特约独家点评。
首先,我们来回顾一下NgAgo事件的主要发展过程与关键时间节点。
2014年2月,荷兰科学家John van der Oost在Nature杂志发表论文,报道TtAgo可以在
高温条件下体外切割DNA。韩春雨受到启发,开始利用Argonaut进行基因编辑,并在
2014年5月中旬取得关键突破。
2015年6月3日,韩春雨向Nature Biotechnology... 阅读全帖
l*******i
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专利已经被法国人申请了:
Title: ENGINEERING MAMMALIAN GENOME USING DNA-GUIDED ARGONAUTE INTERFERENCE
SYSTEMS
Pub. No.: WO/2015/140347 International Application No.
: PCT/EP2015/056113
Publication Date: 24.09.2015 International Filing Date: 23.03.
2015
IPC:
C12N 15/113 (2010.01), C12N 15/90 (2006.01)
Applicants: CELLECTIS [FR/FR]; 8 Rue de la Croix Jarry F-75013 Paris (FR)
Inventors: VALTON, Julien; (US).
DUCHATEAU, Philippe; (FR)
Agent: ZACCO ... 阅读全帖
T*******x
发帖数: 8565
17
来自主题: History版 - 韩春雨论文正式撤稿 (转载)
《自然-生物技术》社论与韩春雨及同事的撤稿声明
原文以Time for the data to speak为标题
发布在2017年8月2日的《自然-生物技术》社论上
标题:是该数据说话的时候了
doi:10.1038/nbt.3938
一项宣称通过Argonaute酶实现基因编辑的研究被撤回,这显示了论文发表后的同行评
议在全天候媒体时代的重要性。
本期,韩春雨及同事撤回了发表于去年5月的一篇论文。该论文称,短5′磷酸化单链
DNA可引导格氏嗜盐碱杆菌核酸内切酶(NgAgo)产生双链断裂,实现对人类基因组的编
辑。论文一发表,便引起科研人员的极大兴趣和媒体的竞相报道。但是很快,在推特
、 博客和其它社交媒体的助燃之下,有关该研究可重复性的质疑开始迅速增多。去年
11月 ,本刊发表了“编辑部关注”(Editorial Expression of Concern),提醒科研
界留 意这些可重复性方面的担忧。为了最终解决这个争议,多个研究小组在数月里生
成了更 多的实验数据。如今尘埃落定,这也是世界各地的许多实验室为澄清NgAgo的功
能而付 出的大量时间、精力和资金的证明。
韩春雨的这篇论... 阅读全帖
L****e
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18
来自主题: SanFrancisco版 - Fremont 上庭记 (1)
昨天在Fremont的Mowry Ave SB与Argonaut Way交叉路口处,当时Mowry Ave SB方向有
红灯,而它的右侧Argonaut Way的车没有移动(估计也是红灯),此时,Mowry Ave SB
有一辆日本车,先是向右拐(以为想进入Argonaut Way),然后与Argonaut Way的车前
面的人行道平行上开,最后重新回到Mowry Ave,直奔I-880.第一次看见这样躲避红灯
躲避摄像头的。
K**4
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19
这个文章提出的DNA-guidedDNAinterference by bacterial Argonaute (or PIWI) 好
像不是很充分阿。首先他自己的实验也表明,Argonaute即结合RNA也结合DNA。
Analysis of co-purifiednucleicacidsrevealedthatTtAgo-associatedRNA (10–150
nucleotides) is preferentially 32 P-labelled in a polynucleotide kinase (PNK
) forward reaction, indicating the presence of 5' hydroxyl groups (Extended
Data Fig. 1c). By contrast, co-purified DNA has a more defined length (13–
25 nucleotides), and is preferentially labelled in a PNKexchangereaction,
indicatingph... 阅读全帖

发帖数: 1
20
我来说说ngAgo的局限:
1.ngAGO是否真如文章所述,不和ssRNA结合。我觉得需要通过通过高通量测序进行验证
,电泳胶的灵敏度太低,看不到不代表没有。
2.ngAgo是否和内源ssDNA或ssRNA结合,如果它的结构和TtAgo类似(包含PIWI,PDZ以
及MID domain),那么这些保守的domain也存在于与ngAgo同源的argonautes(Ago2)
中,需要利用灵敏度比较高的手段才能说明这个问题,保不齐ngAgo会对PIWI或RNAi通
路有影响,5‘p-ssDNA以及5’p-ssRNA在细胞中存在,尤其是在germ cell的分化过程
中以及很多种类的癌细胞中,如果ngAgo和它们结合的话,这将大大限制其在此类细胞
中的应用。
3. ssDNA loading 的问题,目前对于ssDNA load到Argonaute形成DNP的机制尚不清楚
,在细胞内ssDNA load到Argonaute是不是需要其他蛋白质(比如伴侣蛋白,热激蛋白
等)的辅助,甚至Argonaute折叠成functional protein是否需要ssDNA的帮助,这些都
不是很清楚。
... 阅读全帖
l******0
发帖数: 150
21
中青在线石家庄1月12日电(中国青年报·中青在线记者樊江涛) 1月12日,韩春雨和沈
啸通过河北科技大学有关部门向媒体发出了《关于以Argonaute为核心的基因编辑技术
相关专利申请问题的声明》。记者注意到,近日媒体报道以河北科技大学副教授韩春雨
、浙江大学基础医学院研究员沈啸为发明人的专利——以Argonaute核酸酶为核心的基
因编辑技术,因申请人未在规定期限内答复国家知识产权的第一次审查意见通知书,该
专利的申请被视为撤回。2017年1月9日,国家知识产权局发布该专利申请的“视为撤回
通知书”。
韩春雨和沈啸二人在1月12日“声明”中称:“关于以Argonaute为核心的基因编辑技
术相关专利申请,我们已经聘请了具有丰富工作经验的国际一流专利代理机构来进行专
利保护的全球化布局。从知识产权保护策略的角度,我们选择采取国际专利向中国递交
的方式来保护中国国内专利。第一个专利的PCT文本已于2016年提交,并已包括原申请
的中国专利内容。”
2016年5月2日,韩春雨、沈啸等人在国际期刊《自然·生物技术》(Nature
Biotechnology)杂志上在线发表了研究论文《NgAg... 阅读全帖

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22
来自主题: Biology版 - 韩春雨终于撤稿了
《自然-生物技术》社论与韩春雨及同事的撤稿声明
原文以Time for the data to speak为标题
发布在2017年8月2日的《自然-生物技术》社论上
标题:是该数据说话的时候了
doi:10.1038/nbt.3938
一项宣称通过Argonaute酶实现基因编辑的研究被撤回,这显示了论文发表后的同行评
议在全天候媒体时代的重要性。
本期,韩春雨及同事撤回了发表于去年5月的一篇论文。该论文称,短5′磷酸化单链
DNA可引导格氏嗜盐碱杆菌核酸内切酶(NgAgo)产生双链断裂,实现对人类基因组的编
辑。论文一发表,便引起科研人员的极大兴趣和媒体的竞相报道。但是很快,在推特、
博客和其它社交媒体的助燃之下,有关该研究可重复性的质疑开始迅速增多。去年11月
,本刊发表了“编辑部关注”(Editorial Expression of Concern),提醒科研界留
意这些可重复性方面的担忧。为了最终解决这个争议,多个研究小组在数月里生成了更
多的实验数据。如今尘埃落定,这也是世界各地的许多实验室为澄清NgAgo的功能而付
出的大量时间、精力和资金的证明。
韩春雨的这篇论文自去年发... 阅读全帖
i***s
发帖数: 39120
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韩春雨实验室所在的四层老楼新安装上智能门。
韩春雨论文中的关键实验环节。
韩春雨瘦了,一位接近他的人说,最近韩春雨经常做实验到凌晨两三点钟。
他的实验室在河北科技大学一座四层老楼里,红色的外墙伏满了爬墙虎,韩春雨在这一待就是10年。今年5月2日,一篇关于新基因编辑技术NgAgo的论文在国际顶级期刊《自然·生物技术》(Nature Biotechnology)在线发表(后在该刊第34册7月号纸质版发表),作者是河北科技大学副教授韩春雨领衔的课题组。发表后,不仅他个人,连他所在的实验室,都获得了前所未有的关注。为了安全,学校不得不给实验楼安装上刷卡入内的智能门,还布了摄像头。
韩春雨有两间研究室在三楼走廊的尽头。在接待过一波又一波记者,甚至有长江学者来访的房间里,一张白色纸片嵌在插座缝里,上面写着“Arrival of the Argonautes 1.0T and 2.0 Smart! (Ago1.0T和2.0Smart版本的到来!)”,后缀为两个笑脸。实验室在等NgAgo优化版2.0尽快问世。
但NgAgo1.0仍然摇摇欲坠。由于多个实验室无法重复实验,被认为可以超越时兴的CRISPR... 阅读全帖
D**s
发帖数: 6361
24
来源:科学网丁广进博客、BioArt微信公众号
引言:《韩非子·喻老》一文中曾有言曰:“楚庄王莅政三年,无令发,无政为也。右
司马御座而与王隐曰:“有鸟止南方之阜,三年不翅,不飞不鸣,嘿然无声,此为何名
?”王曰:“三年不翅,将以长羽翼;不飞不鸣,将以观民则。虽无飞,飞必冲天;虽
无鸣,鸣必惊人。”
5月2日,Nature系列顶级刊物Nature Biotechnology在线发表了来自河北科技大学生物
科学与工程学院青年教师韩春雨副教授题为“DNA-guided genome editing using the
Natronobacterium gregoryi Argonaute”的重大原创性成果。文章甫一发表,瞬间刷
爆微信朋友圈,这里面有两层原因,其一,该项新的基因编辑手段对目前热火朝天的
CAS9技术提出了挑战;其二,领导该项研究的青年老师所在的单位和个人基本上籍籍无
名(抱歉,请允许我用了这个词)。
“不鸣则已,一鸣惊人”韩春雨老师在Nature?Biotech上发表诺奖级原创成果
Nature Biotechnology文章截图
小编先引用河北科技大学生物科学与工程学院官... 阅读全帖

发帖数: 1
25
Email on ngAgo sent to the ISTT mailing list:
Dear colleagues,
the publication by Gao et al in May in Nature Biotechnology http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27136078 triggered an enormous expectation. This Chinese team led by Chunyu Huan reported that the Argonaute (Ago) protein from a rare haloarchaea, Natronobacterium gregoryi, (NgAgo) would efficiently work for gene editing purposes in human cells. Ago had been described as an DNA-guided endonucleases two years before, through a Dutch-Span... 阅读全帖
K**W
发帖数: 6346
26
韩春雨回应专利申请逾期:选择申请国际专利
中青在线石家庄1月12日电(中国青年报·中青在线记者 樊江涛) 1月12日,韩春雨和
沈啸通过河北科技大学有关部门向媒体发出了《关于以Argonaute为核心的基因编辑技
术相关专利申请问题的声明》。记者注意到,近日媒体报道以河北科技大学副教授韩春
雨、浙江大学基础医学院研究员沈啸为发明人的专利——以Argonaute核酸酶为核心的
基因编辑技术,因申请人未在规定期限内答复国家知识产权的第一次审查意见通知书,
该专利的申请被视为撤回。2017年1月9日,国家知识产权局发布该专利申请的“视为撤
回通知书”。
韩春雨和沈啸二人在1月12日“声明”中称:“关于以Argonaute为核心的基因编辑
技术相关专利申请,我们已经聘请了具有丰富工作经验的国际一流专利代理机构来进行
专利保护的全球化布局。从知识产权保护策略的角度,我们选择采取国际专利向中国递
交的方式来保护中国国内专利。第一个专利的PCT文本已于2016年提交,并已包括原申
请的中国专利内容。”
c****x
发帖数: 6601
27
关键字: 韩春雨《Nature》论文《自然》
http://www.guancha.cn/culture/2017_08_03_421138_s.shtml
在国内外学者几番公开质疑其可重复性过去一年后,河北科技大学副教授韩春雨关于新
基因编辑技术NgAgo-gDNA的论文已由《自然-生物技术》撤回。
图自百度百科
据澎湃新闻8月3日报道,北京时间8月3日,《自然-生物技术》发表题为《是该数据说
话的时候了》社论,撤回韩春雨团队于2016年5月2日发表在该期刊的论文。澎湃新闻获
悉,论文撤回,是韩春雨主动申请撤回。《自然-生物技术》在社论中表示:“我们现
在确信韩春雨的撤稿决定是维护已发表科研记录完整性的最好做法。”
韩春雨出生于1974年,现为河北科技大学副教授,本科毕业于河北师范大学,硕士就读
于中国农业科学院,在中国协和医科大学取得博士学位。
在学术出版里,受到广泛质疑的论文在期刊的调查和协调下,往往由论文作者主动向期
刊申请撤稿,以减少对论文作者科学信誉的伤害,同时避免更多的科研工作者继续引用
该论文。
在前述社论中,《自然-生物技术》称:“我们也询问了论文作者是否可以解答科研... 阅读全帖
t***h
发帖数: 5601
28
Nature Biotechnology | Editorial | doi:10.1038/nbt.3938
Time for the data to speak
Published online, 2 August 2017
http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.3938.html
在社论中,一项宣称通过Argonaute酶实现基因编辑的研究被撤回,这显示了论文
发表后的同行评议在全天候媒体时代的重要性。
韩春雨的这篇论文自去年发表后所产生的影响力,再怎么夸张地说也不为过,尤其
是在论文的来源地中国。中国媒体纷纷进行报道,以大标题宣告一项全新基因编辑系统
的发现。这无疑是一篇中国去年被报道最多的论文;媒体监测公司融文(Meltwater)
的数据显示,仅在论文发表后的最初两个月,就有将近4000篇相关的中文新闻报道。
NgAgo的轰动之处集中在它有可能补充,甚至取代CRISPR/Cas9基因编辑系统之一点
上。NgAgo有望以一个目标序列进行基因编辑(Cas9不仅需要目标序列,还需要另外一
个附近... 阅读全帖
A********e
发帖数: 354
29
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
p*******g
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30
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
O***n
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31
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
g*********d
发帖数: 233
32
目前表观遗传学(Epigenetics)通常被定义为基因表达通过有丝分裂或减数分裂发生了
可遗传的改变, 而DNA 序列不发生改变[1, 2]。表观遗传学的机
制主要包括DNA 甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA。DNA 甲基化(DNA methylation)是指
在DNA甲基转移酶(DNA-methyltransferases, DNMTs)的催化下, CpG 二核苷酸中的胞嘧
啶被选择性地添加甲基, 形成5-甲基胞嘧啶[3, 4]。DNA 甲基转移酶有两种, 其中
DNMT1 主要起维持甲基化的作用, 能使半甲基化的DNA 双链分子上与甲基胞嘧啶相对应
的胞嘧啶甲基化, 可参与DNA 复制双链中新合成链的甲基化[5]; 而DNMT3a 和DNMT3b
主要起形成甲基化的作用, 能在未发生甲基化的DNA 双链上进
行甲基化[6]。DNA 甲基化一般与基因的沉默相关,DNA 去甲基化则与基因的活化相关[7
~9]。
组蛋白修饰(Histone modifications) 是指组蛋白的基础氨基末端尾部突出于核小体,
常在转录后发生变化, 包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等翻译后的修饰... 阅读全帖
a********k
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33
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branches in lamellipodia. Cell. 2008 Sep
5;134(5):828-42. PubMed PMID: 18775315; PubMed Central PMCID: PMC2570342.
Cai L, Makhov AM, Bear JE. F-actin... 阅读全帖
s*********y
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34
来自主题: Biology版 - 热议韩春雨
海内外学者、读者热议“韩春雨”现象
原创 2016-05-10 知识分子 知识分子
韩春雨(右)及其合作者沈啸(左)、高峰(中)。供图:沈啸
编者按:
5月8日,《知识分子》发文(详见《韩春雨:“一鸣惊人”的中国科学家发明世界一流
新技术 | 特稿》)介绍了河北科技大学副教授韩春雨团队发表的NgAgo-gDNA基因编辑
技术的学术贡献和意义后,引发巨大反响。文章发表仅一天,通过《知识分子》在微信
、微博、今日头条、知乎上的传播渠道,就获得超过320万阅读量,近2600条评论。国
内外生命科学界学者纷纷就这项技术的突破性意义发表评论,各方读者也就韩春雨的“
另类出身”在网络上展开评论。《知识分子》搜集并摘编了部分精彩观点,与读者分享。
● ● ●
01
高屋建瓴派
饶毅:北京大学讲席教授
韩春雨的工作对基因编辑技术的推进作用是国际一流的。与现有CRISPR相比,可以看到
的优点是新技术使用DNA,因而更稳定,但还需要更多的研究才能真正比较二者优缺点
以及适用范围的异同。此外,韩春雨在条件有限的情况下做出这样的工作,让我们更加
关注中国广大科技工作者。
鲁白:清华大学医学院教授
在一所不太... 阅读全帖
H****N
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Dear colleagues,
the publication by Gao et al in May in Nature Biotechnology http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27136078 triggered an enormous expectation. This Chinese team led by Chunyu Huan reported that the Argonaute (Ago) protein from a rare haloarchaea, Natronobacterium gregoryi, (NgAgo) would efficiently work for gene editing purposes in human cells. Ago had been described as an DNA-guided endonucleases two years before, through a Dutch-Spanish microbiologist collaborating team (Swarts ... 阅读全帖

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36
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: hanchunyu (), 信区: Military
标 题: 韩春雨是第二个小保方-业界专家的信
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 29 11:59:57 2016, 美东)
Email on ngAgo sent to the ISTT mailing list:
Dear colleagues,
the publication by Gao et al in May in Nature Biotechnology http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27136078 triggered an enormous expectation. This Chinese team led by Chunyu Huan reported that the Argonaute (Ago) protein from a rare haloarchaea, Natronobacterium gregoryi, (NgAgo) would efficiently work for gen... 阅读全帖

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国际转基因技术协会原主席Montoliu博士建议不要再试图重复韩春雨实验结果
澳大利亚国立大学Gaetan Burgion今天撰写长文介绍他试图重复河北科大韩
春雨创立的NgAgo基因编辑技术的经过,得出结论:韩春雨的实验无法重复,而
且与韩在论文所说矛盾;《自然·生物技术》应要求韩公布原始数据;该技术显
然没有前途。
国际转基因技术协会创建者和原主席Lluis Montoliu博士根据这一结果以
及其本人实验室的实验结果,向国际转基因技术协会会员发出一封公开信,建议
停止继续试图验证韩春雨的实验,不要再浪费时间、金钱、人员和项目。
CRISPR谷歌群针对这项技术和韩春雨的文章的调查表明,140个调查回复中,
只有一个(中国神经所仇子龙?)回答该技术起作用,73个回答无效,63个回答
在验证。
From: [email protected]/* */ on behalf of Lluis
Montoliu To: ISTT List
Subject: [ISTT_list] Great disappointment with Ago: Long life to
CRISPR... 阅读全帖
c**i
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38
来自主题: Biology版 - Nature News: The controversy over NgAgo
http://www.nature.com/news/replications-ridicule-and-a-recluse-the-controversy-over-ngago-gene-editing-intensifies-1.20387
Replications, ridicule and a recluse: the controversy over NgAgo gene-
editing intensifies
As failures to replicate results using the CRISPR alternative stack up, a
quiet scientist stands by his claims.
David Cyranoski
08 August 2016
SHIJIAZHUANG, CHINA
A controversy is escalating over whether a gene-editing technique proposed
as an alternative to the popular CRISPR–Cas9 sys... 阅读全帖
c********n
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39
【记录历史】NgAgo’2016 – 第一阶段Milestones 修订版
我们生活在一个奇妙的时代。
在这个时代,由于生物技术的进步,我们的生老病死,我们的衣食住行, 都
在不断地经受着各种微妙的,或是革新性的变化所带来的压力。
我们的思维方式,我们的行为准则,我们的道德底线,也在不停地被考验着。
到了2016年,CRISPR/Cas9基因编辑技术,已经日渐成熟。任何生命体,包括
我们赖以繁衍的生殖细胞,我们的DNA,都有可能很容易被修改。基因编辑技
术的应用,也成为了各种投资的宠儿。
而在2016年夏天,中国河北科技大学的韩春雨实验室,在Nature
Biotechnology(NBT)杂志上,发表了一篇论文,宣布了一个“新的、高效
的基因编辑技术 – NgAgo/gDNA”的诞生。
这篇文章,引起了世界各地业界同行的广泛重视,大规模重复验证NgAgo基因
编辑功能的各种信息,在网络上不断地更新着。
三个多月了,无法重复验证NgAgo的数据不断地出现,至今为止,还没有人能
够发布任何正式的,可重复实验结果。
研究人员们越来越困惑,也越来越担心,韩春雨和他的同事们在NBT发表的
Ng... 阅读全帖

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40
专利视为被撤回事件
2017年1月9日,据国家知识产权局消息,以河北科技大学副教授韩春雨、浙江大学基础
医学院研究员沈啸为发明人的专利——以Argonaute核酸酶为核心的基因编辑技术,因
申请人未在规定期限内答复国家知识产权的第一次审查意见通知书,该专利的申请被视
为撤回。
回应专利被撤回
1月12日,韩春雨和沈啸通过河北科技大学有关部门向媒体发出了《关于以Argonaute为
核心的基因编辑技术相关专利申请问题的声明,表示:“关于以Argonaute为核心的基
因编辑技术相关专利申请,我们已经聘请了具有丰富工作经验的国际一流专利代理机构
来进行专利保护的全球化布局。从知识产权保护策略的角度,我们选择采取国际专利向
中国递交的方式来保护中国国内专利。第一个专利的PCT文本已于2016年提交,并已包
括原申请的中国专利内容。”
p*******g
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41
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
x****6
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42
crispr这个免疫系统也不是现在这个主流的教授发现的,而是欧洲一个发酵制品公司发
现的。按照你的思路,朵得娜张峰教堂都没有原创权了。
同样的,14年的发现之前的十年就发现了argonaute蛋白主导的RNA干扰,并已经得了一
个炸药奖。而那时候就知道了argonaute蛋白可以和核糖核酸结合并且进行targeting,
而14年发现的这个homologue只不过是使用脱氧核糖核酸作为底物。按照你的思路,也
这只是一个改进罢了。
w********2
发帖数: 632
43
NgAgo is a single-stranded DNA (ssDNA)-guided Argonaute endonuclease, an
acronym for Natronobacterium gregoryi Argonaute. NgAgo binds 5′
phosphorylated ssDNA of ~24 nucleotides (gDNA) to guide it to its target
site and will make DNA double-strand breaks at the gDNA site. Like the
CRISPR/Cas system, NgAgo was reported to be suitable for genome editing,[1]
but this has not been replicated. In contrast to Cas9, the NgAgo–gDNA
system does not require a protospacer adjacent motif (PAM).
这个好像更容易应用些?
l****z
发帖数: 29846
44
by Jammie
Let’s just go and round it up to a cool billion since anything Obama
touches winds up costing us far more than is ever originally reported. Now
we have a trifling discrepancy of a few hundred million from earlier
reports about the mess that is Solyndra.
The cost to taxpayers for the failure of solar panel company Solyndra
may be much higher than the $535 million dollar federal loan guarantee the
company received. After the company went bankrupt in last August, 2011, the
Energy Dep... 阅读全帖
G***Y
发帖数: 9698
45
来自主题: NewYork版 - 《纽约生活》8月27日─9月2日
《纽约生活》8月27日─9月2日
August 26, 2012 06:05 AM
【8月27日 星期一】
●「贾森和亚哥号」Jason and the Argonauts
时间:8pm
地点:曼哈坦下东城东河公园(East River Park),FDR高速路边介於蒙哥马利街(
Montgomery St.)至东12街
查询:http://www.nycgovparks.org/events/2012/08/27/jason-and-the-argonauts
门票:免费。Faux-Real戏剧公司以既传统又现代的摇滚音乐剧形式,重新演绎由希腊
神话改编成的「贾森和亚哥号」,用张狂的表演以及鼓、吉他、厚底鞋、面具和戏装,
讲述贾森在女神的帮助下带领一行人搭乘亚哥号、寻找金羊毛的经典故事。
●「第三类接触」电影展映
时间:8pm至10pm
地点:皇后区康寧汉公园(Cunningham Park),Union Turnpike和196街交口
查询:http://www.nycgovparks.org/events/2012/08/27/movies-under-the-stars
门票:... 阅读全帖
a***e
发帖数: 2427
46
来自主题: SanFrancisco版 - 请教Saratoga的小学选哪所比较好
去APT看一下族群分布就行了。按照白人比例由高到底分别是 Saratoga, Foothill,
Argonaut . 当然,亚裔最多的Argonaut 也是比Cupertino要少很多的。
Acadamic 认真的态度也是随着白人的增加而减少。反正到了初中就都到一块儿去了。
b****o
发帖数: 806
47
来自主题: Toronto版 - 多伦多 指南
一日游
从湖滨码头区(Harbourfront)出发,在按大略湖畔散步,到约克码头中心(Youk Quay
Centre)参观画廊与花园.然后,乘渡轮上多伦多.下午,途经安大略美术馆,前往布
鲁尔-约克维尔(Bloor-Ypukville),在 Movenpick’sBistretto & La Pecherie 海味
餐厅饱吃一顿海鲜大餐,然后,在附近琳琅满目的各种商店里闲逛数小时.
晚上,去麦迪逊大道俱乐部(Madison Avenue Pub)喝上几杯,然后,沿着皇后西街(
Queen West)找几家餐厅,品尝各种不同口味的美食.最棒的是,去看一场真人秀.
二日游
第二天,前往安大略皇家博物馆(Royqal Ontario Museum),造访独特的Baldwin村,在
圣·劳伦斯集市(St Lawrence Market)用午餐.下午,参加我们的徒步游逛多伦多的闹
市区.晚上,在蒙特利尔爵士餐吧(Montreal Bistro & Jazz Club)欣赏一场迷你型爵
士乐表演,在Danforth Ave大街细细品味晚场MEZES(希腊TAPAS),同时再喝上几杯.
四日游
... 阅读全帖
b****o
发帖数: 806
48
来自主题: Toronto版 - 多伦多 指南
一日游
从湖滨码头区(Harbourfront)出发,在按大略湖畔散步,到约克码头中心(Youk Quay
Centre)参观画廊与花园.然后,乘渡轮上多伦多.下午,途经安大略美术馆,前往布
鲁尔-约克维尔(Bloor-Ypukville),在 Movenpick’sBistretto & La Pecherie 海味
餐厅饱吃一顿海鲜大餐,然后,在附近琳琅满目的各种商店里闲逛数小时.
晚上,去麦迪逊大道俱乐部(Madison Avenue Pub)喝上几杯,然后,沿着皇后西街(
Queen West)找几家餐厅,品尝各种不同口味的美食.最棒的是,去看一场真人秀.
二日游
第二天,前往安大略皇家博物馆(Royqal Ontario Museum),造访独特的Baldwin村,在
圣·劳伦斯集市(St Lawrence Market)用午餐.下午,参加我们的徒步游逛多伦多的闹
市区.晚上,在蒙特利尔爵士餐吧(Montreal Bistro & Jazz Club)欣赏一场迷你型爵
士乐表演,在Danforth Ave大街细细品味晚场MEZES(希腊TAPAS),同时再喝上几杯.
四日游
... 阅读全帖
t**l
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49
来自主题: Biology版 - 求助一道题目的思路
如果动物的B 的geonme已经知道,说明有关耐冻的基因基本都知道了,找出所有有关耐
冻基因的3 UTR,做bioinfoamativ target prediction, 然后克隆这些3 UTR做荧光素
酶实验,建立到一个细胞系可以over express ,这个MIR,做 luciferase assay,找出
functional read out. 如果有钱有精力,做一个screen,克隆这个动物B的所以3'UTR
,然后做screen,找出target。
另外一个找TARGET的方法是reverse genetic, 建立一个生物比较相似的细胞系,KO 这
个mir, 然后做CLIP-SEQ
HITS-CLIP (CLIP-Seq) of Argonaute has been applied to decode microRNA-target
interaction maps.[5][6][7] The application of CLIP-Seq/HITS-CLIP methods
has significantly reduced the rate of false p... 阅读全帖
T*****e
发帖数: 247
50
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
标题 DNA-guided DNA interference by a prokaryotic Argonaute
摘要
RNA interference is widely distributed in eukaryotes and has a variety of
functions, including antiviral defence and gene regulation1, 2. All RNA
interference pathways use small single-stranded RNA (ssRNA) molecules that
guide proteins of the Argonaute (Ago) family to complementary ssRNA targets:
RNA-guided RNA interference1, 2. The role of prokaryotic Ago variants has
r... 阅读全帖
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