i***r
发帖数: 1035 | 1 很想近一个做蛋白结构的实验室做bioinfor薄厚，正在谈，如果有机会的话，想再经实
验室之前能参加个workshop jump start一下（我是生物背景，但是做的的神经网络，
蛋白结构预测不熟）。
请帮忙找找类似的workshop，只要在美国就行。多谢！！ |
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w********r
发帖数: 1431 | 2 海量的数据出来之后，通过各种分析，可以看到很多以前看不出来的信息，当然这个主
要是bioinfor的人在搞。算法和分析的角度应该挺重要的了 |
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N******n
发帖数: 3003 | 3 波士顿如果没有7万，估计很难找到好的Bioinfor薄厚， |
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u*********1
发帖数: 2518 | 4 那偏僻点的学校的salary也有这么高么
另外，以后大家都来做bioinfor，人越来越多，估计工资就被压下去了吧 |
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S*******e
发帖数: 94 | 5 鄙人bioinfor老博士后，几年前刚来NYC的时候4万2，现在5万出头。税后4万出头，再
去了保险和one bed room的房租剩下不到1万5.
给您提供个现实例子。 |
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u*********1
发帖数: 2518 | 6 谢谢，那bioinfor里学啥，或者要培养什么能力，才能在lab之外发挥啊。。。比如去
industry
别告诉我彻底改行做cs |
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m*******n
发帖数: 124 | 7 搞得我都想跳了，这苦逼的破死刀，真是有种坐牢的感觉啊 |
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b*******n
发帖数: 8420 | 8 bioinfo已经火了快十年了，bench生物变成火坑也已经很久了
“未来掌握在自己手里，所以路怎么走，你们自己选。干杯，各位颇似道。” |
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w********r
发帖数: 1431 | 10 elaine fuchs那里一直挂着广告招bioinfor postdoc
不知道现在招到了没 |
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j****x
发帖数: 1704 | 11 RE这位soldiera朋友的观点，一个路子的文章比较缺乏说服力。
当初Bioinfor界大腕Mark Gerstein手下一员大将去UC系统找位置，手里好文章无数，
但是评审只说了一句就拒掉了：你这里其实只有一篇文章。。。 |
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K**4
发帖数: 1015 | 12 不用官泄了,文章中写的明明白白
其实bioinfor的方法还是很强大的
遗憾的是很多中国PI还没有认识到,
给他机会也抓不住!! |
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u*********1
发帖数: 2518 | 13 Don't read those lengthy bioinformatics book.Simply a waste of time.
Directly go for a project;
Whenever you have problem, simply google; you'll find answers from such
bioinfor forums as Biostar or sequanswer.
For pure coding problem, raise questions in stackoverflow.
Unless you have a very strong mathmatical background and aim to be
specialized in methodology, mostly your project is to solve biological
problems using available approaches.
Very first, learn some most basic shell commands/get fam... 阅读全帖 |
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u*********1
发帖数: 2518 | 14 这段话就是典型的bioinformatician的想法
要么开发自己的methodology，要么按照别人的想法跑跑别人的程序（当然是开发自己
的methodology有趣有含金量的多）
But where is BIOLOGY?
"搞出来结果给别人分析生物学意义，或者call出来结果bench上找tech验证一下，这种
labor work没有挑战性"
这话说的也太轻巧了。。。
做纯bioinfor而一点不懂biology的问题是，你完全是为别人做嫁衣裳，毫无成就感；
感觉你的整个科学事业都是掌握在别人手里。
而如果自己的expertise是coding是计算，而对生物一点没兴趣，为何不干脆直接去CS
算了。。。现实生活里能运用computing的地方太多了，更加有应用价值，而生物数据
只不过是一个很小的范围。
“做大paper”这种话听起来很无奈很混日子的感觉。我们的目标应该是利用
computation解决科学问题，推动科学发展，大paper只不过是副产物而已。 |
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f*********o
发帖数: 38 | 15 Bioinfor目前欧美在中国公司都有专门的人在做，一些中国大的CRO也有，这些人的
background的基本是海外PHD， 不光bioinformatics，各个公司也会有
cheminformatics和clinical informatics这一块 |
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B*******c
发帖数: 5056 | 16 发现中国已经推出操作简单、界面友好的web service了，基于R。
相信在不久的将来，会进军美国市场，大赚特赚。
对于很多商品，似乎有这样的范式：美国人innovate出新的草胚，东亚人polish后做成
商品赚钱。
那么对于bioinfor软件来讲，美国生信人过度自私的行业保护造成了这一结果。 |
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a*****i
发帖数: 1045 | 17 谢谢，只是没有bioinfor相关的工作经验呢。。。 |
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s*****u
发帖数: 407 | 18 Applications are invited for Postdoctoral Researchers to join research group
in the Department of Biostatistics at the University of Michigan. Research
in the lab focuses on the development of statistical methods and
computational tools for the analysis of large-scale and high-dimensional
biological data from genetic association studies and functional genomic
sequencing studies. Recent work includes: Bayesian hierarchical models to
quantify genome-wide inheritance, Bayesian sparse regression mod... 阅读全帖 |
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e*******o
发帖数: 4654 | 20 单从买买提生物版就可以看出来，bioinfo 的phd 还是比较好找工作的，因为bioinfo
phd 本来就不多，这些年发展很快。
好多对学术丧失兴趣的都当马工或者data scientist了。（生物信息的是最符合data
scientist 的专业之一）
这就导致了，很多做bioinfor 的实验室，其实招人(尤其是postdoc）不容易。尤其是
不是很牛的。
所以，你如果有个生物phd，学学编程，半年或者一年，找个实验室往bioinfo 转还是
比较靠谱的。
只要迈出第一步，会越来越容易的。 |
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a*****i
发帖数: 1045 | 21 要是早知道我就读个bioinfor的master,不读stats,现在找不到工作，肠子都悔清了。
还不如当千老，至少每月还有钱花。 |
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o********c
发帖数: 1257 | 22 个人觉得，转CS可以，不过最好不要和生物沾边， bioinfor容易找，但是工资真不怎
么样。可能：
CS数据库》biostatistics》bioinformatics |
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b****r
发帖数: 17995 | 23 我们学校也算不错的医学院了，bioinfor也是顶级的，多的是做住院医或者MD PHD的时
候做data的，我同年进来的都好几个，没看到谁混出来了。说实在的，有MD的人自己大
部分不愿意做实验，所以有医学和计算机背景的人还真是一点不少。
做医生要赚钱，最简单的办法是学好经济和市场推广，自己开业+雇别的医生给自己打
工，年入大几十万上百万很普通。那种几十个医生的大group，头头的收入可能还要上
数量级，等于是自己有一家中型公司，关键是这公司稳定又来钱快，基本就是一印钞机
，和这种创业公司完全两个概念
在美国做科研，无论你做多么fancy的玩意，发财的几率，甚至是平均收入，都是不行
的。科研是一种奢侈的爱好 |
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e*******o
发帖数: 4654 | 24 想转计算的，学学编程，这样的职位就是你的了。
因为水平稍好一点的bioinfor的phd 直接去马工或者往发考题的路子走了。 |
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v*********0
发帖数: 941 | 25 负责任的说，你的背景申bioinfor博后没有问题，很多老板都会喜欢要的 |
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v*********0
发帖数: 941 | 26 负责任的说，你的背景申bioinfor博后没有问题，很多老板都会喜欢要的 |
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e*******o
发帖数: 4654 | 27 这个职位看jd 不像senior。
根据jd，ms 毕业，有点bioinfor 的经历的都能胜任。
我觉得要是有bioinfo的phd，这个职位有点over-qualify了。
不过，真不如去做马工。我知道不少生物背景做马工的，没一个后悔离开这个烂坑的。 |
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e*******o
发帖数: 4654 | 28 你看biostar 的帖子大都招postdoc，现在有个趋势是postdoc 招不到，MS 要是能干活
也要了。
市场经济嘛，你给人家一个零头，为啥给你做？不过PI 也有苦处，一个AP 自己的工资
都不一定上六位数，贵了确实招不起。
生物的出路是堵死了，bioinfor可不是，coding厉害的，直接马工，统计差不多，
coding不太差，DS 搞起。 |
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r**********e
发帖数: 587 | 29 受教了
遗憾自己一直没什么RNA-seq的训练
而现在好像bioinfor找工作好多好多都是分析RNA-seq |
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r**********e
发帖数: 587 | 30 请问各位生物信息前辈，都是转到了data science吗？
我觉得我们从bioinfor过度到data science是很自然的。但大家都说data sci的坑远远
不如CS SDE的多
所以还不如直接转CS，毕竟对于转行的人，先入坑是最重要的
一方面要练machine learning这些python，一方面又要补课学java，怕贪心忙不过来 |
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发帖数: 1 | 31 再提个问哈。
我情况比较特殊，在一个不懂生物信息的MD老板那儿做bioinformatics phd。做了不少
project，有纯dry，也有dry+wet的。
但明显老板个人偏向dry+wet的项目
而我自己花时间做了的一些纯dry的项目，他压根直接ignore，当不存在。
请问我是否应该极力要求把dry的东西发表出去？成一个小文章？
另外，如果我computational的东西没能发成paper，请问在我以后找postdoc的时候如
何表现出来？写在linkedin上？
我也花了很多心血，不想浪费
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BTW,我只想靠bioinfor postdoc拿到绿卡，赶紧转data scientsit，对整个学术已经失望
谢谢 |
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发帖数: 1 | 32 ding ding ding
当然是作为过渡。
我在quantitative帖子里提到bioinformatics，意思就是要大家作为过渡。
因为大量生物千老没有半点计算常识，我知道的一些old-fashion发Science的教授，居
然分析十万行数据还停留在excel表格一行行看。另外很多人有家人，身份的牵挂，所
以无法立刻改行成功。
所以bioinformatics是个不错的过渡。可以跟老板要求主动学这个东西，拿着NIH
funding，学着transferable skill，何乐而不为啊？
另外，就算从事bioinformatics，那也比一般的biology postdoc强一百倍。对吧？
bioinfor就是生物里的码工，有quantitative skill，可以跳来跳去。你要做bench的
生物同胞跳一跳？加上biology领域的人大部分数学计算机极其差，反而让
bioinformatician显得“高人一等”，缺了他们压根没法发paper
所以，大家赶紧往这方面转啊，白天分析NGS，写python；晚上就狂补课data
structure，algorithm+数学统... 阅读全帖 |
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e*******o
发帖数: 4654 | 33 赶紧拿绿卡跳吧，bioinfor 这个烂坑，pi 才能拿多少？
另一个帖子谈的li heng， 能到15万？还得跟狗屁不通的reviewer撕逼。 |
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i***r
发帖数: 1035 | 34 多谢jcp，我还记得几年前，我刚开始做bioinfor，就拜读阁下在biology的一篇入门文
章，写的不错。
祝你在科大开始新的篇章 |
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发帖数: 1 | 35 我水货bioinformatics phd（水货意思就是训练不够，一半时间在做实验）
现在在转CS，上课，刷题，做project
但我担心如果到时候自己没能找到CS工作，或许还是先去找bioinfor的工作作为过渡
我就想请教，
1. 现在bioinformatics的市场如何呢？很多人说很好，但主要工作还是在academia。
真是这样的么?
2. bioinformatics招聘的流程是类似于CS那种“网投+内推+OA+面试”，还是生物的那
种“publication+老板牛推”模式呢？
或者说他们看中啥呢？我估计industry和academia的不同。academia模式像生物，而
industry的类似CS？ |
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发帖数: 1 | 36 的确，如果不是为了做faculty，不然哪个CS PHD会来做bioinfor这个坑，而且才7万一
年。 |
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发帖数: 1 | 37 为啥说bioinfor岗位少呢？是和cs比？还是和benchwork比啊 |
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发帖数: 1 | 38 “我的焦虑在于，我现在做的，其实都是现成的pipeline，我自己写代码，也只是非常基
础的。根本不涉及任何CS、machine learning或者统计的东西”
我简直觉得这是我自己写的帖子
我的情况跟LZ一模一样，或许跑一跑pipeline是目前90%bioinfor从业者的现状
但我跟你不同的是，我老板不管学生前途，逼迫我做benchwork，一再拖着加实验不让
我毕业；各种unpredictable，今天说的话明天就忘记了或者变卦了，所以我忍无可忍。
看到我老板那张脸我就诅咒他赶紧去死，所以我为了身心健康必须quit。
所以，你甚至连什么去genomics大公司都不用care，你只用care一条：
你老板可以保证让你顺利毕业，而不是到时候用各种理由拖着你不毕业，甚至逼迫
你做实验
只要满足这一条，你就一定要拿到PhD，同时赶紧趁着大好时光狂刷题找SDE工作，你甚
至可以申请做SDE intern。
但如果你看出半点老板变态的端倪(你lab之前的PhD多少年毕业，比如)，就要做好quit
的准备 |
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n********r
发帖数: 195 | 39 真是想不开啊！
发信人: oceangui (当归), 信区: Pharmaceutical
标 题: 生物信息的人想找个大药厂的暑期intern靠谱吗？
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Sep 29 17:53:35 2011, 美东)
本人PhD第二年，EECS里做bioinformatics的，做些systems biology的计算。
觉得生物制药这个行业一是永远有市场，二是准入有门槛，所以打算以后在这里发展，
而不是去那些传统IT。可板上给的感觉是制药现在都很困难？
这样还能找到intern吗，药厂还是会优先要搞生物、化学的人吧，是不是有闲心了才会
找bioinfor的？
新手新领域，牛们指点迷津，谢谢！ |
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h*****t
发帖数: 1226 | 40 千万不要搞个“四不像”。
现在正经的bioinfor的博士和硕士都不好找工作。 喜欢硬件的就去仪器公司。 |
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d*******n
发帖数: 217 | 41 能提供一下在哪里看到的信息吗? 我用的是monster, simply hired, biospace, ccl,
极少有找cheminfor的. bioinfor的现在职位爆棚, 基本上每个大学都在招. |
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h********3
发帖数: 4 | 42 各位xdjm，在下现是国内一211学校大四学生，学的是bioinformatics，研究生也是读这个方向，准备研究生毕业来美
读phd。在大三的时候，由于课程的需要，我了解过personalized medicine，对这个方向非常感兴趣，并打算将这个作为
我未来的事业来奋斗。在了解了一些学科后，欣喜的发现美国有这方面的program，也就是pharmacogenomics。我看了
ucsf,ucsd的说明，感觉我bioinfor的背景跟这个学科还是比较match的。
但是，我还是有一些问题，希望各位前辈指点：
（1）虽然有这样的program，但是貌似不多，（好像只有ucsf，ucsd几所才有phd的program），那么申请的时候是
不是非常的困难？
（2）我本科学的基本是数学生物计算机，统计懂一点，药学只上过一门药学基础，pharmacogenomics是不是比较看
重申请者的药学背景呢？我这样的背景申请有希望吗？
（3）如果申请不到这样的program，那么有没有什么学校是做personalized medicine相关的研究的呢？
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h********3
发帖数: 4 | 43 Thanks a lot!
我因为要在研二的时候申请，所以比较怕到时候没有合适的program,非常感谢你的建议
，我研究生阶段会尽量多发文章。
我觉得pharmacogenomics是有可能会起到改革作用，而现在bioinfor更多是一种辅助的
科研，我还是希望能够做一些带
来实际改变的研究。
guidance
job
follow |
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o******i
发帖数: 92 | 44 本人PhD第二年，EECS里做bioinformatics的，做些systems biology的计算。
觉得生物制药这个行业一是永远有市场，二是准入有门槛，所以打算以后在这里发展，
而不是去那些传统IT。可板上给的感觉是制药现在都很困难？
这样还能找到intern吗，药厂还是会优先要搞生物、化学的人吧，是不是有闲心了才会
找bioinfor的？
新手新领域，牛们指点迷津，谢谢！ |
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o******i
发帖数: 92 | 45 本人PhD第二年，EECS里做bioinformatics的，做些systems biology的计算。
觉得生物制药这个行业一是永远有市场，二是准入有门槛，所以打算以后在这里发展，
而不是去那些传统IT。可板上给的感觉是制药现在都很困难？
这样还能找到intern吗，药厂还是会优先要搞生物、化学的人吧，是不是有闲心了才会
找bioinfor的？
新手新领域，牛们指点迷津，谢谢！ |
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h********3
发帖数: 4 | 46 各位xdjm，在下现是国内一211学校大四学生，学的是bioinformatics，研究生也是读这个方向，准备研究生毕业来美
读phd。在大三的时候，由于课程的需要，我了解过personalized medicine，对这个方向非常感兴趣，并打算将这个作为
我未来的事业来奋斗。在了解了一些学科后，欣喜的发现美国有这方面的program，也就是pharmacogenomics。我看了
ucsf,ucsd的说明，感觉我bioinfor的背景跟这个学科还是比较match的。
但是，我还是有一些问题，希望各位前辈指点：
（1）虽然有这样的program，但是貌似不多，（好像只有ucsf，ucsd几所才有phd的program），那么申请的时候是
不是非常的困难？
（2）我本科学的基本是数学生物计算机，统计懂一点，药学只上过一门药学基础，pharmacogenomics是不是比较看
重申请者的药学背景呢？我这样的背景申请有希望吗？
（3）如果申请不到这样的program，那么有没有什么学校是做personalized medicine相关的研究的呢？
小弟知道这个专业可能不如biostat那么好 |
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S******n
发帖数: 90 | 47 FYI
目前有Biostat、SAS、Bioinfor的多个级别岗位。含Manager Principal 与AD级别岗位
。如果您有回大陆工作的打算，是否方便聊两句？ 我的微信18616096822 |
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r**********e
发帖数: 587 | 48 你说的是药厂或者industry里bioinfor吗？
学术界都很低 |
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r**********e
发帖数: 587 | 49 你说的是药厂或者industry里bioinfor吗？
学术界都很低 |
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l*******r
发帖数: 39279 | 50 乐死了
也不知道你们能不能领悟其中的幽默
此人水平很高，写作能力也很强
发信人: Vermillion (Vermillion), 信区: Biology
标 题: 分生做到头
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 14 01:43:47 2011, 美东)
搞生物的人多，大家都拼命的找方向，最后结果就是一勺烩。分生就是生物的缩影。
也就是十几年前，一套好的分生结果就是一篇好文章。那时光景，有分生，有生化，有
生理，有免疫等等。各自守着自己的一亩三分地。变化也是从那时候开始了。各自圈子
里的一点novelty很快就折腾光了，于是大家就开始互相瞅，指望着到别人家里去打饭
吃。交叉呀交叉。做免疫的也开始WB了，要机制不是？做结构的也要啊，还有搞行为唔
的，加点分生才够标新。看起来分生吃香了，实际上纯分生再也发不出文章了。你费半
天劲，克隆来克隆去就找个磷酸化位点有嘛用啊？
生理/免疫/结构/行为....，任何一个领域再加点分生，又算过了几年好日子，成就了
一批新PI。但好日子也太短暂了，也就是到03，04年吧，模仿的人一多，又hold不住了
。怎么办？上耗子。KO，KI的折腾小... 阅读全帖 |
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