n***3
发帖数: 663 | 1 1. J Physiol. 2010 Apr 15;588(Pt 8):1227-40. Epub 2010 Mar 1.
The calcium-permeable non-selective cation channel TRPM2 is modulated by
cellular acidification.
Starkus JG, Fleig A, Penner R.
2. Prog Biophys Mol Biol. 2010 Sep;103(1):18-27. Epub 2010 May 27.
Chemical physiology of oxidative stress-activated TRPM2 and TRPC5 channels.
Yamamoto S, Takahashi N, Mori Y.
Please send the papers to e*********[email protected]
Thanks! |
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g*********d
发帖数: 233 | 2 MicroRNA 和病毒
作者：王磊
上海交通大学生命学院研究生
摘要：
microRNA(miRNA)是真核生物体内一组内源性的 21—25nt 长的非编码蛋白质的短序列
RNA，它们能通过碱基配对的方式与生物体中的 mRNA 分子相结合来参与调节基因的表
达。自 2000 年至今，miRNA 的研究发展的速度极快并且影响的范围也非常的广泛，而
且分别在2002年和2003年度中miRNA入选了Science杂志年度十大科技突破。因此，
miRNA是 RNA 研究的又一个突破，被称为 RNA 的第二次革命。目前的研究已发现
miRNA 参与了很多重要的生命活动过程涵盖了发育、凋亡、代谢、人类疾病以及病毒侵
染等方面。在病毒侵染宿主和宿主抵抗病毒的过程中病毒编码的 miRNAs 和宿主编码的
miRNAs 均发挥了重要的作用。这无疑为病毒的侵染以及宿主抵抗病毒的侵染的研究提
供了新的思路和新的领域。因此，本文的主要目的在于阐述 miRNA 的一些基本概况以
及在病毒中主要的研究方向和进展，最后对这个具有跨时代意义的小分子进行展望。
关键词：miRNA vmiRNA 功能 宿主的 miR... 阅读全帖 |
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y******8
发帖数: 1764 | 3 Abbreviated Journal Title Impact Factor 5-Year Impact Factor
Immediacy Index Cited Half-Life Eigenfactor Score Article Influence
Score
CELL RES 8.151 5.65 1.962 2.8 0.02329 2.417
NANO RES 4.37 4.389 0.57 1.4 0.00262 2.332
FUNGAL DIVERS 3.803 2.669 1.184 2.7 0.00312 0.59
MOL PLANT 2.784 2.784 0.901 1.3 0.0024 1.308
CELL MOL IMMUNOL 2.765 0.316 57 0.00534
EPISODES 2.122 2.55 0 0... 阅读全帖 |
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a********e
发帖数: 1181 | 4 Mark Rank Abbreviated Journal Title
(linked to journal information) ISSN JCR Data More Information
EigenfactorTM MetricsMore Information
Total Cites Impact
Factor 5-Year
Impact
Factor Immediacy
Index Articles Cited
Half-life EigenfactorTM
Score Article InfluenceTM
Score
41 NAT METHODS 1548-7091 12093 20.717 19.284 4.
268 127 3.2 0.11154 9.873
42 NAT REV MICROBIOL 1740-1526 10351 20.686... 阅读全帖 |
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s****T
发帖数: 100 | 6 nature science 咱就不提了，以下的
PNAS-->JACS,STRUCTURE-->Biophy J, JMB , JPCB --->Biochem, Proteins, Protein
Sci
易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈. |
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m******g
发帖数: 69 | 7 Biochem Biophys Res Commun. 2010 Aug 6;398(4):723-9. Epub 2010 Jul 17.
Adipocyte-derived microvesicles contain RNA that is transported into
macrophages and might be secreted into blood circulation.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20621060
这篇paper说脂肪细胞分泌的microvesicle里面的RNA可以转移到macrophages里面，然
后macrophage的adiponeticn和resistin会升高。 他们的方法是，建立一个adipocyte
系3T3-L1，然后培养，然后把adipocyte的culture centrifuge, 提取出supernatant，
然后把supernatant进行ultracentrifuge，沉淀出这种microvesicle
请问这种方法是否可行，因为这步的关键是分离提纯microvesicl... 阅读全帖 |
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m****e
发帖数: 489 | 9 Bovine serum albumin reverses inhibition of RT-PCR by melanin.
著者 Giambernardi TA , Rodeck U , Klebe RJ
Biotechniques.1998 Oct ; 25(4):564-6.
Eckhart, L. et al. (2000) Melanin binds
reversibly to thermostable DNA polymerase
and inhibits its activity. Biochem. Biophys.
Res. Comm. 271, 726–30
please send to a********[email protected]. Thank you!! |
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l**********1
发帖数: 5204 | 11 STORM living cell video recording barrier might be fixed by nonlinear
quantum
spectroscopy after 2017 AC (possible)
Alán Aspuru-Guzik Harvard Univ
his team one PNAS paper:
Quantum state and process tomography of energy transfer systems via
ultrafast spectroscopy.
Yuen-Zhou J et al. (2011)
PNAS 108:17615-17620.
key words:
processing ∣ open quantum systems ∣ quantum biology>
link:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21997214
... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 13 STORM living cell video recording barrier might be fixed by nonlinear
quantum
spectroscopy after 2017 AC (possible)
Alán Aspuru-Guzik Harvard Univ
his team one PNAS paper:
Quantum state and process tomography of energy transfer systems via
ultrafast spectroscopy.
Yuen-Zhou J et al. (2011)
PNAS 108:17615-17620.
key words:
processing ∣ open quantum systems ∣ quantum biology>
link:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21997214
... 阅读全帖 |
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o**a
发帖数: 86 | 15 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: ouba (comfortably numb), 信区: Chemistry
标 题: papers help! you bao zi
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 20 16:04:06 2012, 美东)
1. Annu Rev Biophys. 2010;39:387-405.
Protein NMR using paramagnetic ions.
Otting G.
2. Magn Reson Chem. 2006 Jul;44 Spec No:S10-6.
Paramagnetic tagging of diamagnetic proteins for solution NMR.
Rodriguez-Castañeda F, Haberz P, Leonov A, Griesinger C.
Source |
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K*F
发帖数: 120 | 16 请您转发 z******[email protected]
万分感谢！祝您身体健康，财源广进！
Biochim Biophys Acta. 1988 Apr 28;954(1):1-13.
The inducible trimethylamine-N-oxide reductase of Escherichia coli K12:
biochemical and immunological studies.
Silvestro A, Pommier J, Giordano G.
Source
Laboratoire de Structure et Fonction des Biomembranes, CNRS, Marseille,
France.
Abstract
The inducible trimethylamine-N-oxide reductase which migrates on non-
denaturing polyacrylamide gels with an RF of 0.22, has been purified from
the soluble fraction o... 阅读全帖 |
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l*****n
发帖数: 24 | 17 马维骏
博士，研究员，博士生导师，教授
药物基因组学研究组组长
研究方向
从基因表达调控角度进行疾病的致病机理和药物防治研究，重点研究疾病发生
和药物作用下表达调控改变的早期应答基因。在生物体主要生理、病理、药理过程的早
期阶段，早期应答基因(ERG)的表达对其发展起关键作用。这些基因的快速表达具有即
早期急性动力学特征。不仅是转录调控，转录后水平调控同样对基因快速、瞬时表达起
重要作用，这是许多即早应答基因(IRG)的特征。大多数即早基因依赖其mRNA非编码区
的顺式作用元件实现转录后水平的调控。为了深入了解其复杂机制，有必要鉴别表达调
控异常的早期应答基因，系统分析验证各种顺式作用RNA调控元件、结合蛋白及其相互
作用。本实验室重点关注免疫应答及癌症发生相关早期应答基因的转录后调控在疾病发
生和药物防治过程中的影响和作用规律，探索它们在疾病诊治和药物研发方面的应用。
主要包括：
1. 免疫应答或癌症发生相关基因非编码区RNA顺式作用元件的鉴别与特性研究；
2. 即早基因在药物应答过程中的转录后水平调控；
3. 受信号转... 阅读全帖 |
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l********n
发帖数: 260 | 18 Biochim Biophys Acta. 2012 May;1820(5):553-64. Epub 2011 Aug 16.
A mitochondrial etiology of Alzheimer and Parkinson disease.
Coskun P, Wyrembak J, Schriner SE, Chen HW, Marciniack C, Laferla F, Wallace
DC.
please send to a*************[email protected] |
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S**********e
发帖数: 1789 | 19 给你看看我们系刚进来的助理教授
Vanderbilt University School of Medicine
Fingleton, Barbara Mary , Ph.D. Assistant Professor of Cancer Biology
Publications
Barrett, CW, Fingleton, B, Williams, A, Ning, W, Fischer, MA, Washington, MK
, Chaturvedi, R, Wilson, KT, Hiebert, SW, Williams, CS. MTGR1 is required
for tumorigenesis in the murine AOM/DSS colitis-associated carcinoma model.
Cancer Res, 71(4), 1302-12, 2011.
Koon, HB, Fingleton, B, Lee, JY, Geyer, JT, Cesarman, E, Parise, RA, Egorin,
MJ, Dezube, BJ... 阅读全帖 |
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z***q
发帖数: 907 | 20 Biochem Biophys Res Commun. 1980 Jul 16;95(1):1-6.
A two-dimensional nuclear Overhauser enhancement (2D NOE) experiment for the
elucidation of complete proton-proton cross-relaxation networks in
biological macromolecules.
Kumar A, Ernst RR, Wüthrich K.
Many thanks! |
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D***s
发帖数: 5613 | 22 Yang, Wei更加详尽的education background
http://www-mslmb.niddk.nih.gov/wei/yang.html
Majored in Biochem, 1980-83, Fudan University, Shanghai
B.A. in Biochem, 1985, SUNY at Stony Brook
Ph.D. in Biochem & Mol Biophys. with Wayne Hendrickson, 1991, Columbia
University
Post-doc with Wayne Hendrickson, 1991-92, Columbia University
Post-doc with Tom Steitz, 1992-95, Yale University
At NIDDK, NIH since Dec. 1995, and tenured in May 2000
估计当时是复旦读了3-4年，然后有个国外学习的program（比如CUSBEA）
就到美国来读书拿了个本科学位 |
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B*******o
发帖数: 8 | 23 又查了一下，乖乖不得了，一个蛋白好多名字，Lipasin/RIFL/ANGPTL8，再加上
Betatrophin，太搞了。
不过三个实验室都说是和Triglycerides相关，参见review：
Biochem Biophys Res Commun. 2013 Mar 15;432(3):401-5.
Emerging roles of Lipasin as a critical lipid regulator.
等着看Cell那篇的后续文章... |
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s***m
发帖数: 6197 | 24 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19592714
Gen Physiol Biophys. 2009 Jun;28(2):174-89.
Structure and flexibility within proteins as identified through small angle
X-ray scattering.
Pelikan M, Hura GL, Hammel M.
Thanks in advance! |
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m********8
发帖数: 314 | 25 求帮助下载一片老文献。十分感谢。
Transport of protons and hydrochloric acid through lipid bilayer membranes.
Biochim Biophys Acta. 1981 Feb 20;641(1):183-8. |
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k*****1
发帖数: 454 | 26 我列一下几篇开创性的文章吧
Hegemann是毫无疑问可以拿诺奖的，
Braun, F.-J. und Hegemann, P (1999). Two light activated conductances in the
eye of the green alga Volvox carteri. Biophys. J, 76,1668-1678.
Nagel, G., Ollig, D., Fuhrmann, M., Kateriya, S., Musti, A.-M., Bamberg, E.,
Hegemann, P. (2002) Channelrhodopsin-1, a light-gated proton channel in
green algae. Science 296, 2395 - 2398
他的薄厚Nagel除了在上面那篇Science的开创性文章里面做出了了ChR1之外，又在03年
的另外一篇PNAS文章里面做出了ChR2。这里的突破就是在动物细胞里面做出了ChR2，而
ChR1只是在藻类细胞里面。这是第二个飞跃。不知道ChR2的功劳是算到Nagel还是
B... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 27 >生物学上，如果一个代谢途径受到外界干扰，
其中一个或几个代谢物被用光（=0），
可以认为这个生物系统达到了一个新的Steady State 吗？
Yes,it called shift of robustness,
references,
paper 1:
Molenaar D et al., (2009).
Shifts in growth strategies reflect tradeoffs in cellular economics.
Mol Syst Biol. 5:323.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19888218
its Fig. 4 D
>L. lactis shifts from the metabolically efficient >mixed-acid fermentation
at low growth rates to lactic acid fermentation at high growth
rates, whereas S. cerevisiae shifts from respiratory m... 阅读全帖 |
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k******y
发帖数: 897 | 28 如题，谢谢。
Biochem Biophys Res Commun. 1991 Aug 30;179(1):416-22.
Glucuronosyl transfer to galactose residues in the biosynthesis of HNK-1
antigens and xylose-containing glycosaminoglycans: one or two transferases?
Curenton T, Ekborg G, Rodén L. |
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w***7
发帖数: 1637 | 29 宋的文章够了，experience不够让人信服。
宋的博士学位在中科院拿的，在us做了3-4 年postdoc。宋在us 待的时间太短，对美国
博士培养体制和科研体制先进之处了解得可能不够。一同面试院长的有几个candidate
文章比宋好。武大可能是看到宋在中科院当个官，搞个管理就把it请过来了。武大应该
找一个在美国拿个PhD，然后在us 做postdoc后海归的当院长。
宋自己的科研做得很好，但对宋领导一个院做出像样的改革，大幅提高整个院科研水平
不太看好。
http://www.bio.whu.edu.cn/News_reads.asp?cid=174&id=2574
学习经历：
1993－1997 南京大学生物科学与技术系，学士
1997－2002 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所，博士
主要工作经历与任职情况：
2002－2005 美国德克萨斯大学西南医学中心，博士后
2005－2014 中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所，研究组长，研
究员，博士生导师，“百人计划”择优支持，“百人计划”终期评估优秀。分子生物学
国家重点实验室... 阅读全帖 |
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w***7
发帖数: 1637 | 30 宋的文章够了，experience不够让人信服。
宋的博士学位在中科院拿的，在us做了3-4 年postdoc。宋在us 待的时间太短，对美国
博士培养体制和科研体制先进之处了解得可能不够。一同面试院长的有几个candidate
文章比宋好。武大可能是看到宋在中科院当个官，搞个管理就把it请过来了。武大应该
找一个在美国拿个PhD，然后在us 做postdoc后海归的当院长。
宋自己的科研做得很好，但对宋领导一个院做出像样的改革，大幅提高整个院科研水平
不太看好。
http://www.bio.whu.edu.cn/News_reads.asp?cid=174&id=2574
学习经历：
1993－1997 南京大学生物科学与技术系，学士
1997－2002 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所，博士
主要工作经历与任职情况：
2002－2005 美国德克萨斯大学西南医学中心，博士后
2005－2014 中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所，研究组长，研
究员，博士生导师，“百人计划”择优支持，“百人计划”终期评估优秀。分子生物学
国家重点实验室... 阅读全帖 |
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b*****n
发帖数: 55 | 31 Biochem Biphys Res Commun, 2014 Jan 17; 443(3):1105-9
CDK inhibitors, p21(Cip1) and p27(Kip1), participate in cell cycle exit of
mammalian cardiomyocytes.
Tane S, Ikenishi A, Okayama H, Iwamoto N, et al.
Thank you very much in advance for your help and time! |
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a******n
发帖数: 8 | 33 仅统计生命科学学院发表的文章，不包括其它院系发表的生命科学文章。
通讯作者单位。
时间段2009-2014.7五年内。
序号
list
1 SCIENCE, 325(5938): 332-336, 2009
2 SCIENCE, 336（6080）: 477-481, 2012
3 LANCET, 376(9744):895-902, 2010
4 NATURE CELL BIOLOGY, 11(9): 1128-U184, 2009
5 NATURE CELL BIOLOGY, 13(3):263-U425,2011
6 NATURE CHEMICAL BIOLOGY. 2013 Dec 8. doi: 10.1038/nchembio.1406....
7 NATURE COMMUNICATIONS.2013 Jun 3;4:1937. doi: 10.1038/ncomms2924.....
8 NATURE IMMUNOLOGY, 12, 1143-1149, 2011
9 NATURE CHEMICAL BIOLOGY 8 (11) : 897-904,20... 阅读全帖 |
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D**********a
发帖数: 4 | 34 Cell Biochem Biophys (2014) 70:703 DOI 10.1007/s12013-014-9880-0
RETRACTED ARTICLE: Effects of Osteopontin on Expression of IL-6 and IL-8 In&
#64258;ammatory Factors in Human Knee Osteoarthritis Chondrocytes
Weiwu Yao • Xiaodong Chen • De Li • Peng Wang •
Hanlong Xin • Jianhua Wang
The corresponding author and the first author retracted their article.
Due to an incorrect method used in the experiments the data cannot be
reproduced. |
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s******3
发帖数: 7 | 35 The lab of Chuck Sanders at Vanderbilt University has an opening for a
postdoctoral fellow to conduct studies of the structure, folding, and
function of the human KCNQ1 potassium channel.
KCNQ1 is a critical voltage-gated channel in the cardiac action potential.
Mutations in KCNQ1 and its modulatory partner, KCNE1, result in various
cardiac arrhythmias, including long QT syndrome and sudden infant death
syndrome. Mutations can disrupt normal channel function by disrupting
folding, by altering ... 阅读全帖 |
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s***a
发帖数: 43 | 36 【 以下文字转载自 Faculty 讨论区 】
发信人: SWJSJ (BC), 信区: Faculty
标 题: 调研了一下清华最近回去的PI
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Dec 15 16:27:25 2014, 美东)
云老师发了个贴说清华目前的找人标准，很多人不相信。特地调研了一下清华生命学院
最近回去的人的情况，如云老师所说，绝大多数都有2cns，如果只有一篇cns，那基本
上还有>2的子刊。这个不仅仅局限于胖老师经常说的结构生物学，而是所有方向都基本
如此。
当然这些新回去的绝大部分都是千青（有些不是的是因为回去那一年千青还没开始）。
网页上的Title有的是教授，有的是研究员，估计当时还没有统一。但校内一律都是副
教授，也就是相当于这边的AP。我还特地打听了一下，国内的TT制度好像没有Tenured
Associate这一档，清华5年考核通过了就是正经的full professor。
有些老师看不上国内的科研，我就仅列出两位回国后的publication，咱就不说颜宁等
这种Early T的个例了。说两个没太有名气的，还没有评上T的，各位老师可以参考一下
，... 阅读全帖 |
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m******e
发帖数: 459 | 37 不要说两个课题，同一个又怎么样，牛人自有解决之道，请自行参考这两篇：
Cell Mol Life Sci. 2009 Jan;66(1):122-34
Biochem Biophys Res Commun. 2008 Sep;373(4):631-6
注意两篇投稿时间，不谢。 |
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v********a
发帖数: 646 | 38 面对这个1979年的单身女郎，从中专毕业，到参加成人自考拿到同等学历，然后一路逆
袭，最后傲然在苏州大学就职。
只有两个字：佩服
http://hlxy.suda.edu.cn/jiaoxuekeyan/yanjiushengdaoshiminglu/20
王丽，女，教授，硕士研究生导师
研究方向
慢性病运动康复：重症病者包括心脑血管疾病、骨关节系统疾病和终末期肾病等患者的
运动康复。
体能与疾病：体能水平与疾病发生和预后之间的关系；
社区康复：糖尿病、骨质疏松等的社区康复护理干预。
联系方式
电话：0512-65221499 (办公室); 138-1486-1702 (手机)
邮a class="__cf_email__" href="/cdn-cgi/l/email-protection" data-cfemail="3dd99e875154104a5c535a100c7d4e48595c13585948135e53">[email protected]/* */; [email protected]/* */
地址：苏州市十梓街1号苏州大学护理学院本部20... 阅读全帖 |
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a**********3
发帖数: 86 | 39 Laminin 411 and 511 promote the cholangiocyte differentiation of human
induced pluripotent stem cells
Biochem Biophys Res Commun. 2016 May 20;474(1):91-96. doi: 10.1016/j.bbrc.
2016.04.075. Epub 2016 Apr 19.
Laminin receptor on platelets is the integrin VLA-6
Nature 336, 487-9. 1988.
Thanks a lot!
Send to [email protected] |
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W*****s
发帖数: 684 | 43 Sakamoto et al., 1977 Y Sakamoto, Y Akanuma, K Kosaka and B Jeanrenaud,
Comparative effects of native insulin and insulin–dextran complexes on the
metabolism of adipose tissue. Biochim. Biophys. Acta, 498 (1977), pp. 102
–113. Article | PDF (636 K) | | View Record in Scopus | | Cited By in
Scopus (3)
Thanks! |
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o******e
发帖数: 284 | 44 if>1
1 CHEM REV 40.197
2 NAT MATER 32.841
3 CHEM SOC REV 28.760
4 ACCOUNTS CHEM RES 21.640
5 NAT CHEM 20.524
6 ALDRICHIM ACTA 16.091
7 NANO TODAY 15.355
8 ANNU REV PHYS CHEM 14.130
9 ADV MATER 13.877
10 ANGEW CHEM INT EDIT 13.455
11 NANO LETT 13.198
12 COORDIN CHEM REV 12.110
13 SURF SCI REP 11.696
14 ACS NANO 10.774
15 MED RES REV 10.700
16 J PHOTOCH PHOTOBIO C 10.360
17 ADV FUNCT MATER 10.179
... 阅读全帖 |
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o**a
发帖数: 86 | 45 1. Annu Rev Biophys. 2010;39:387-405.
Protein NMR using paramagnetic ions.
Otting G.
2. Magn Reson Chem. 2006 Jul;44 Spec No:S10-6.
Paramagnetic tagging of diamagnetic proteins for solution NMR.
Rodriguez-Castañeda F, Haberz P, Leonov A, Griesinger C.
Source |
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f****n
发帖数: 95 | 46 我在为含氟的丙烯酸酯/丙烯酰胺类高分子寻找good solvent,发现trifluoroacetic
acid (TFA)的溶解能力特别强，很好用。可是，高分子（白色粉末）溶解于新鲜的TFA
之后溶液由无色透明慢慢变为淡黄色透明。
是不是因为TFA是强酸有所谓的发烟现象？浓盐酸就是淡黄色，因为含有少量杂质Cl2
。另外， 含卤素或含硝基的化合物容易变颜色,是少量变质导致的吗？
谢谢！
p.s.
查到有这么一句：“olutions of proteins in trifluoroacetic acid prepared in
vacuo
are clear and colourless; on exposure to air, a purple colour develops.”不
解中···
Nature 174, 509 (11 September 1954); doi:10.1038/174509a0
Anhydrous Trifluoroacetic Acid as a Solvent for Proteins
JOSEPH J. KATZ
Chemistry Di... 阅读全帖 |
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