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全部话题 - 话题: burgess
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l**********n
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1
进化论在科学上的种种难题
一 进化论若干证据分析
(一)胚胎重演论
大多数高中生物学课本中都有一张胚胎发育图,显示鱼、蝾螈、乌龟、鸡、猪、牛、兔
、人等动物在胚胎发育不同阶段的侧面图,其原版收藏在伦敦大学的Bodleian图书馆,
它的作者是十九世纪德国Jena大学的生物学教授海克尔(Ernst Haeckel)。从这张图
得出的结论是,虽然这些动物成年后形态各不相同,但是由于它们是由共同的祖先进化
而来,所以在胚胎发育过程中均有一个形态相似的阶段,这就是“胚胎重演论”(
Ontogeny recaptulates phylogeny)。
可以用“日晷模型”(Hourglass model)来阐述胚胎重演论,其横轴显示进化过程中
形态上的差异,纵轴显示胚胎发育时期,就象日晷一样,胚胎早期都是受精卵,胚胎发
育成熟后,就成了各种形态各异的动物,也就是说,不管这些动物发育成熟后形态上的
差异有多大,但在胚胎发育的某个阶段,其形态仍旧会重演一个类似鱼的形态。这个理
论和模型的价值在于,它提示在胚胎发育的过程中,残留物种进化的痕迹。这个理论强
有力地支持了进化论,并且作为进化论的一个主要证据,... 阅读全帖
d********i
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2
全文转载如下。
-------------
起初神创造-评进化论的由来与谬误
“起初神创造诸天与地”(创一1),这是圣经开宗明义的第一句话,这也是阿波罗八
号登月宇宙飞船上的宇航员首次到达月球外围时,发到地球上的第一个讯息。
当人观赏宇宙的伟大、恢宏、规则、精确,不能不想到其设计者;当人细察地球上亿万
生物的奇姿多彩、变化万千和巧妙配搭,也不能不联想到生命的源头和创始者(徒三15
);当人站在镜子前观看自己身体构造的奇妙,或在夜深人静时思想内心世界的丰富和
良心感觉的可畏,不能不赞叹“因我受造奇妙可畏;你的作为奇妙,这是我心深知道的
”(诗一三九14)。
然而,自一八五九年达尔文发表《物种起源》(The Origin of Species)(这是达尔
文所提出的解释宇宙、生命和人起源的假说),提出进化学说之后,进化的思想就如野
火蔓延,甚至写进许多国家的教科书里。因着进化论的教育,许多人误把进化论当作科
学真理,而把圣经中所启示的“起初神创造”当作不合科学的神话。这一进化学说蒙蔽
人的心思,拦阻人对宇宙创造者和宇宙存在意义的追寻,贬低人生存的意义和价值,导
致社会道德的退化。
本文通过... 阅读全帖
T*****n
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3
来自主题: TrustInJesus版 - 杨百翰真能生啊,过去不知道
摩门教的二代教主。
杨百翰至少有55个妻子及57个子女。
Miriam Work - 1824年结婚 (2 个孩子), included in his will. Miriam是Asa Work
之女. Some of her distant family include Henry Clay Work,Frances Work great
-grandmother of the late Diana, Princess of Wales。
Mary Ann Angell - 1834年结婚 (6 个孩子), in will.
Lucy A. Decker (Seeley) - 1842年结婚 (7 个孩子), in will.
Harriet E. Cook (Campbell) - 1843年结婚 (1 个孩子), in will.
Lucy Augusta Adams (Cobb) 1843年结婚 (未育子女); requested cancellation of
her sealing,1846; sealed by proxy to Joseph Smith, 1848; f... 阅读全帖
n**t
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4
【 以下文字转载自 Biology 讨论区,原文如下 】
发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(三)
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Thu Apr 28 17:44:52 2005) WWW-POST
本文献给YL
(三) 不溶的sigma32
四月六号早上,我们开始了第一模块的实验,Burgess教授负责。这老兄研究了一辈子E.Coli的RNA polymerase。E.Coli RNA polymerase 核心酶是一个蛋白质复合体,只有合成RNA的活性,却没有
识别DNA的能力。Sigma系列因子能够识别启动子, 并且与核心酶结合,从而实现转录。我们这个实验
的核心主角就是其中一个因子,叫sigma32。Sigma32可以识别heat shock genes的启动子。Sigma 32
过表达在大肠杆菌里面的时候,绝大部分形成了不溶的包涵体(inclusion body),我们的任务就是要用变性
剂溶解变性不溶的蛋白,然后做重折叠。
所有的buffer几乎都已经配好了
n**t
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5
【 以下文字转载自 Biology 讨论区,原文如下 】
发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(四)
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Thu Apr 28 17:50:21 2005) WWW-POST
本文献给YL
(四)Hydrostatic pressure和跑小柱子的trick
Dr. Burgess 假定我们对蛋白质纯化一无所知,所以讲得很细致。比如他特别提到了disposable
column的用法。这种小柱子很简单,把beads倒进去,冲洗一下就可以用来纯化蛋白了,很方便。
唯一的问题是,由于是依靠重力跑,速度有时候会十分慢。液体流经柱子速度由hydrostatic pressure
(静流体压力)来决定。而hydrostatic pressure又是由实际柱高(即液体经过的长度)来决定。如果你
嫌液体流得太慢(尤其是洗柱子的时候),可以在柱子下端出口连一个长的塑胶管子或者针管,这样速
度会快很多。这是很简单的小trick, 但我觉得对初做蛋白质纯化的人还是很有帮助的。
n**t
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6
【 以下文字转载自 Biology 讨论区,原文如下 】
发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(六)
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Thu Apr 28 18:08:46 2005) WWW-POST
本文献给YL
(六)兴风作浪的乳糖(lactose)
晚上每天都有人做报告,我觉得让我收获最大的是Bill Studier的报告。本来这个报告是后来才听到的,
但是由于Burgess的模块是唯一的涉及大肠杆菌钟表达蛋白的,我把这一段提前来说说。Studier这老哥是
Brookhaven National Laboratory的,一生研究T7 噬菌体,也是T7 RNA polymerase induction
system(pET 系列质粒)的发明者。
T7 系统在大肠杆菌表达蛋白的应用实在太广泛了,但凡表达蛋白的兄弟姐妹们的不可能不知道这个
系统。长话短说,pET系列的质粒都用T7 promoter来控制基因的表达。T7 promoter只能被T7 RNA
pol
n**t
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7
【 以下文字转载自 Biology 讨论区,原文如下 】
发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记(八)
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Fri Apr 29 11:14:36 2005) WWW-POST
本文献给YL
(八)”液体DEAE“
 绕了这么大一圈,现在再回到第一个模块的实验来。前面提到Dr.Burgess要我们
试Gudn HCl溶解sigma32之后的重折叠,结果很糟糕。我们接着试了用sarkosyl做
变性剂的蛋白重折叠。步骤和前一个类似,只是这一次是突然稀释至25倍体积。效果
好了很多,至少没有浑浊现象了。接着我们用Poros HS 50,一种阳离子交换柱,
来把可溶的sigma 分离了出来。为什么这一次用Poros HS 50 而不是前面用的阴离
子交换柱呢?因为sarkosyl带负电,会与阴离子交换柱结合得很好。再加上sigma32
很奇怪,既有负电的表面,又有带正电的表面,所以可以用阳离子交换柱。值得一提
的是绝大部分蛋白质都是偏酸性,所以阴离子交换柱用
r****o
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8
本文献给YL
(四)Hydrostatic pressure和跑小柱子的trick
Dr. Burgess 假定我们对蛋白质纯化一无所知,所以讲得很细致。比如他特别提到了disposable
column的用法。这种小柱子很简单,把beads倒进去,冲洗一下就可以用来纯化蛋白了,很方便。
唯一的问题是,由于是依靠重力跑,速度有时候会十分慢。液体流经柱子速度由hydrostatic pressure
(静流体压力)来决定。而hydrostatic pressure又是由实际柱高(即液体经过的长度)来决定。如果你
嫌液体流得太慢(尤其是洗柱子的时候),可以在柱子下端出口连一个长的塑胶管子或者针管,这样速
度会快很多。这是很简单的小trick, 但我觉得对初做蛋白质纯化的人还是很有帮助的。
我知道一个例子。我原来很喜欢女生A, 有一天晚上主动等在她实验室等她做完实验,就开车送她回家。
这一等不得了,从晚上七点等到了凌晨一点。这个过程中,她好像没什么事情,但是每隔20分钟,她就会去
一次cold room。作完实验了之后,我好奇的问她,到底是什么试验花了这么长时间,结果她说她在用一个dispo
r****o
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9
本文献给YL
(六)兴风作浪的乳糖(lactose)
晚上每天都有人做报告,我觉得让我收获最大的是Bill Studier的报告。本来这个报告是后来才听到的,
但是由于Burgess的模块是唯一的涉及大肠杆菌钟表达蛋白的,我把这一段提前来说说。Studier这老哥是
Brookhaven National Laboratory的,一生研究T7 噬菌体,也是T7 RNA polymerase induction
system(pET 系列质粒)的发明者。
T7 系统在大肠杆菌表达蛋白的应用实在太广泛了,但凡表达蛋白的兄弟姐妹们的不可能不知道这个
系统。长话短说,pET系列的质粒都用T7 promoter来控制基因的表达。T7 promoter只能被T7 RNA
polymerase 识别,而这个咚咚大肠杆菌是没有的。但是有一些溶原菌株,染色体里面已经整合入了由
LacUV promoter和lac operon控制的T7 RNA polymerase 基因片断。如果在细菌培养基里面加入
IPTG, 来诱导T7 RNA polymerase 的表达,就可以启动目的蛋白的表
x**w
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g*********s
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11
Boss: Shawn Burgess
Biological NMR and MS
In Vivo and Ex Vivo isotope tracer techniques
Intermediary metabolism of obesity and diabetes
Regulation of carbohydrate and lipid metabolism in liver
最好fresh Ph.D
c********n
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实例记录 - 第三类信息, 第二例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Burgess, Cheng, et al
- 发布时间:2016年11月15日
- 发布平台:Protein & Cell
- 发布方国家:二十家中外实验室, 18所科研院校
- 发布方城市:美国及中国
- 发布方研究机构:
1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.Division of Hematology in Department of MedicineJohns Hopkins University
S... 阅读全帖
c********n
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13
实例记录 - 第三类信息, 第二例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
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c********n
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14
来自主题: Biology版 - 韩春雨要是重复出来就好看了
【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/32034437.html
实例记录 - 第三类信息, 第二例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
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c********n
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【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
实例记录 - 第三类信息, 第二例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
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信息简述:
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- 发布时间:2016年11月15日
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- 发布方城市:美国及中国
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1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.Division of Hematology in Department of MedicineJohns H... 阅读全帖
x****6
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16
“我们讨论的当代进化论就是达尔文主义。”
那是你的定义,当代的进化论的理论核心是种群遗传学,它目前的框架是1930s融合达
尔文自然选择理论和孟德尔基因理论(由摩根补充)形成的neo-synthesis,并且在
1960s木村资生提出的中性理论也融合其中,使非选择(达尔文)的随机机制变成进化
不可或缺的一部分。目前进化到底是选择主导还是漂变主导这种问题都成为学界大争议
,然后你说当代进化论是达尔文主义?如果是这样,还争什么?
你对当代进化生物学的理解基本是大众科普读物的水平,读读道金斯的selfish gene基
本上可以得出你的结论,但那不是当代进化论。
Paper: http://www.nature.com/nrg/journal/v9/n12/full/nrg2473.html
——————————————————————————————————
“其机理中的突变产生适应性的新物种和性状不能被分子遗传学证明,而且与分子遗传
学相矛盾”
不码字了,上paper
http://science.sciencemag.org/content/sci/323/5915/779.full.... 阅读全帖
x****6
发帖数: 4339
17
你这是想当然了,
NS是“杂志”,面对普罗大众:只要是受过正规本科教育的人都是它们的目标人群。古
生物学/考古在社会上可比结构生物学要流行和重要得多。如果不是搞结构的,谁特么
会去关心剪接体长什么样?恐怕研究昆虫的生物学家都无感,更别说其它行业的人了。
但是考古和古生物就不一样了。整出个恐龙来,令小朋友惊艳不已,产生对科学的兴趣
。或者如大家拿的burgess shale那种,呈现出如奇幻得像外星生物世界一样的化石群
,只要是个有好奇心和想象力的人都会产生兴趣吧。
再比如去年发在science上的考古文章,通过地质学和考古学研究,找出了4000年前黄
河上游发生大洪水并且导致甘肃喇家文化灭绝的证据。这尼玛一样太重大了,为大禹
治水提供了事实依据,从而为夏朝的存在提供了前提条件。我们祖宗号称自己5000年文
明看来不是梦。这项工作的意义难道不甩你一个蛋白质复合体的裸照一光年?
a****n
发帖数: 53
18
最近在找博士后,原来是做合成的,但是对生物医药和能源方面的功能分子研究很感兴
趣。这个转移恐怕是要下很大决心的,反正我是心里很矛盾。换个领域也希望能找个好
的老板,这样在这块地里发展也许会好点,个人认为。不知道大家怎么看呢?
谢谢!
n*****g
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19
你不去的话,把offer让给我吧
d********w
发帖数: 1110
20
跟他吃过一次饭,感觉人挺Nice的。他是英国过来的,西汉姆联队的忠实球迷。做的挺
不错,文章发的也不错。可以考虑。
a********m
发帖数: 201
21
are you guys serious? I can't believe it!
真是不敢相信,还有人想去他的组!!!
最近他没钱了吧?即使有钱,劝大家如果有别的offer 就千万别来。
a********m
发帖数: 201
n*****g
发帖数: 4117
23
这年头,找个位置不容易啊
l**u
发帖数: 132
24
他人品也没有那么差吧
老美不喜欢他,但是他对中国人还是不错的
d********w
发帖数: 1110
25
What I said are things about 2 years ago. Is his group changed much recently
?
y***e
发帖数: 6082
26
上次去加州开会,和朋友聊起UC某校某几个教授,人家的反应跟你说的一模一样

are you guys serious? I can't believe it!
真是不敢相信,还有人想去他的组!!!
最近他没钱了吧?即使有钱,劝大家如果有别的offer 就千万别来。
p********7
发帖数: 18007
d********w
发帖数: 1110
28
既然这么多人不建议,楼主还是要慎重了。。
n*****g
发帖数: 4117
x*o
发帖数: 1037
e*****m
发帖数: 87
31
对外人挺好的,对自己学生就难说拉哦
s********u
发帖数: 1783
32
狗狗,你太饥不择食啦。。。。
H***s
发帖数: 75
33
你就别挖苦人家狗狗哥了, 对了, Happy B-Day~~
n*****g
发帖数: 4117
34
我这也是木得办法啊
a****n
发帖数: 53
35
谢谢了,
abcRh老兄好像是知道内情的
n*****g
发帖数: 4117
36
好了好了,我也正儿八经的说2句吧。
根据我当年在 TAMU 的感觉,俺参观过他的组,跟他以及他的学生也 talk 过几次。他的组很累。做的东西么。偶不懂,不过看文章么,不算
差。
s********u
发帖数: 1783
n*****g
发帖数: 4117
q*****e
发帖数: 433
39
怎么连100年前得老坑也被你翻出来了阿
n*****g
发帖数: 4117
q*****e
发帖数: 433
41
思路是好得阿, 其实也不用把眼光局限在做xxx分子. 你看人家Venter, 研究human
genome到后来联想到engineer algae genome, Exxon Mobil给砸了那么多钱去搞.
生物医药方向是好了, 不过要小心转成生物男, 建议你找找这些网上或者现实中这种
和energy和life science相关得special interests group, 都聊聊再看这坑应该怎么跳
n*****g
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c**k
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43
来自主题: CivilEngineering版 - top 50 design firms sourcebook -TRANSPORTATION
top design firms sourcebook
TRANSPORTATION
THE TOP 50 IN TRANSPORTATION
RANK* FIRM
1 AECOM Technology Corp.
2 URS
3 Parsons Brinckerhoff Inc.
4 Jacobs
5 The Louis Berger Group
6 CH2M HILL Cos.
7 HNTB Cos.
8 Parsons
9 HDR
10 PBS&J
11 TransCore
12 Carter & Burgess Inc.
13 Kimley-Horn and Associates Inc.
14 STV Group Inc.
15 TranSystems Corp.
16 Earth Tech Inc.
17 KBR
18 Michael Baker Corp.
19 Wilbur Smith Associates
20 Edwards and Kelcey Inc.
21 Gannett Fleming
22 Bechtel
23 CDI Business Soluti
s*******u
发帖数: 5796
44
来自主题: CivilEngineering版 - 业内新闻#%¥&×
业界巨头 Jacob 成功收购业内小牛 Carter & Burgess
c**k
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45
来自主题: CivilEngineering版 - 请问transportation consulting公司都有哪些
top design firms sourcebook
TRANSPORTATION
THE TOP 50 IN TRANSPORTATION
RANK* FIRM
1 AECOM Technology Corp.
2 URS
3 Parsons Brinckerhoff Inc.
4 Jacobs
5 The Louis Berger Group
6 CH2M HILL Cos.
7 HNTB Cos.
8 Parsons
9 HDR
10 PBS&J
11 TransCore
12 Carter & Burgess Inc.
13 Kimley-Horn and Associates Inc.
14 STV Group Inc.
15 TranSystems Corp.
16 Earth Tech Inc.
17 KBR
18 Michael Baker Corp.
19 Wilbur Smith Associates
20 Edwards and Kelcey Inc.
21 Gannett Fleming
22 Bechtel
23 CDI Business Solutions
k**u
发帖数: 10502
46
来自主题: CivilEngineering版 - 这个冬天有点冷,公司开始裁人了
应该不是Jacobs了,我一个朋友在那里,说大部分业务是政府部门的(institutional)
,很忙。
但是最近买了Carter & Burgess, 裁了一堆那边过来的做商业项目的人。
另外RTKL也裁了很多。
我所在的住宅规划和设计业界,很多公司已经缩水到三四年前最大规模的一小半(20%-
70%等)。
这些公司一般都规模相对小一些,原来几十个人到两三百吧。
楼主如果是那种超大公司,名字说说也无妨的。
w*****3
发帖数: 2301
47
Company Name
Street
City
State
Zip Code
Phone
Fax
Associate EH&S Consultant
4301 W William Cannon Dr Ste B150-178
Austin
TX
78749
ATC Associates Inc
140 Heimer Rd Ste 675
San Antonio
TX
78232
(210) 496-3434
(210) 496-1397
ATC Associates Inc
4153 Bluebonnet Dr
Stafford
TX
77477
(281) 240-0154
(281) 240-8909
ATC Group Services Inc
30 Bent Creek Ct
Stafford
VA
22554
(540) 286-0741
Atkins
6504 Bridge Point Pkwy Ste 200
Austin
TX
78730
(512) 342-3395
(512) 327-2453
Axis Contracting Inc
PO Box 360715
... 阅读全帖
l*******y
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48
来自主题: Quant版 - 这个是不是MS的quant?
最近才知道quant这个job,今天看到这个招工信息,不知道对大家有没有用处。
还有一个问题,什么是phd ops?
PhD Ops with Morgan Stanley - Process Driven Trading
Full Time Position: Associate, New York City
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Morgan Stanley will interview at ***** on Jan. 26th for positions with its
Process Driven Trading group. Please see the group and job descriptions
below, and If interested submit your resume. We are posted on *****. You can
send also questions and resumes directly to me at charline.burgess@
morganstanley.com
Th
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