y*****w
发帖数: 146 | 1 Great, thanks a lot. Based on what you suggested, I found this paper.
"Polyglutamine aggregates stimulate ER stress signals and caspase-12
activation"
Any other suggestions? |
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O******e
发帖数: 4845 | 2 看到一篇发在PLoS One上的小文章，说发明了Broad-Spectrum Antiviral
Therapeutics。
我就是好奇，这东西看起来很酷啊，怎么会发在了PLoS One上？
Todd H. Rider*, Christina E. Zook, Tara L. Boettcher, Scott T. Wick, Jen
nifer S. Pancoast, Benjamin D. Zusman
Lincoln Laboratory, Massachusetts Institute of Technology, Lexington, Ma
ssachusetts, United States of America
Abstract
Currently there are relatively few antiviral therapeutics, and most whic
h do exist are highly pathogen-specific or have other disadvantages. We
have developed a new broad-s... 阅读全帖 |
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j******1
发帖数: 1315 | 6 promega的caspase-3/7 ApoONE的buffer配方是什么？它家的太贵了，我想用来筛选药
物，它家的buffer 实在用不起。也就是个细胞裂解和反应buffer，应该不难配吧。 |
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v*****s
发帖数: 20290 | 8 【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: mutouhui (mutouhui), 信区: Joke
标 题: Re: 麻省科学家发现病毒克星“天龙”
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Nov 13 19:08:54 2011, 美东)
http://web.mit.edu/press/2011/antiviral.html
New drug could cure nearly any viral infection
Researchers at MIT’s Lincoln Lab have developed technology that may someday
cure the common cold, influenza and other ailments.
CAMBRIDGE, Mass. — Most bacterial infections can be treated with
antibiotics such as penicillin, discovered decades ago. However, such drugs
are useless... 阅读全帖 |
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x**y
发帖数: 46 | 9 很有创意，只是还不够完善。看看其他的评论：
Broad-spectrum antiviral strategy
Peter Hare
Journal name:
Nature Biotechnology
Volume:
29,
Page:
885
Year published:
(2011)
DOI:
doi:10.1038/nbt.2014
Published online13 October 2011Most antiviral therapies are pathogen-
specific and likely to select for resistance if the virus can mutate the
drug target. Rider et al. couple the ability to detect long double-stranded
RNA (dsRNA)—a telltale indicator of viral infection in mammalian cells—
with procaspase-activated apoptosis ... 阅读全帖 |
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D*******8
发帖数: 4 | 10 Please don’t dig me out. I am writing this out of my conscience as a
scientist. We are using, largely, the tax payers’ money to explore
mechanisms underlying diseases that we don’t have a cure, yet. We are doing
this in the hope that little bit knowledge can accumulate till one day we
can find that magic bullet. However, there are people out there, their
purpose is to use these money to achieve their personal fames, sometimes
international ones, totally disregarding our original noble cause. I... 阅读全帖 |
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m*********e
发帖数: 378 | 11 我真的只会一点点的并没有写上来啊，银染，southern, northern, caspase activity
, pgp activity, phage display, yeast knock out, point mutation, 果蝇酵母的都
没写的
其实是现在掌握的很好：从前掌握的很好（现在不做但是也能很快捡起来）：现在掌握
的一般1：1：1吧。
我本科的training很辛苦很全面，在实验室整整作了两年的intense banch work，提到
的技术大部分都在那两年学的，当然掌握程度不一样是有的。到了这边自己做课题，有
的技术磨的更好，有的也就荒废了
在这边死在了不大考谱的课题上，就转硕了，training也是照着PhD上的。所以不是一
定要比所有的PhD会的技术少呀。
western, protein expression in mammalian cells, flow cytometry of TUNEL
assay, enzyme assay, GFP, cell and small animal handling 是现在经常做的
realtime, PCR... 阅读全帖 |
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n***3
发帖数: 663 | 12 1. Immunity. 2011 Dec 23;35(6):897-907.
Cellular inhibitors of apoptosis proteins cIAP1 and cIAP2 are required for
efficient caspase-1 activation by the inflammasome.
Labbé K, McIntire CR, Doiron K, Leblanc PM, Saleh M.
2. Immunity. 2012 Feb 24;36(2):215-27.
Inhibitor of Apoptosis Proteins Limit RIP3 Kinase-Dependent Interleukin-1
Activation.
Vince JE, Wong WW, Gentle I, Lawlor KE, Allam R, O'Reilly L, Mason K, Gross
O, Ma S, Guarda G, Anderton H, Castillo R, Häcker G, Silke J, Tschopp J.
3... 阅读全帖 |
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s*****g
发帖数: 7857 | 13 "CST cellsignaling？ good，most work"
--CST mAB有的信号太强了,以至于药物处理和未处理的都看不出差异.不如Poly的好用.
大家买新出来的CST mAB要千万小心啊!而且现在经济不好,这种去找他们,屁都不放一个
.根本不给你换Poly的.POLY的就能看出差异!我们实验室至少有十种CST mAB把我们坑了!
Ex:
Caspase 3
LC3B
BCL2 |
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a****k
发帖数: 1130 | 14 HT29 cell: TNF-α + Smac mimetic + z-VAD-fmk
FADD null human T cell leukemia Jurkat cells: TNF-α
HeLa cell: ectopic expression of RIP3 + knock down caspase-8 + TNF-α +
Smac mimetic
etc......... |
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n***3
发帖数: 663 | 15 1. Immunity. 2012 Mar 23;36(3):388-400.
Inflammasome Activators Induce Interleukin-1α Secretion via Distinct
Pathways with Differential Requirement for the Protease Function of Caspase-
1.
2.Immunity. 2012 Mar 23;36(3):313-5.
Dangerous Liaisons: Mitochondrial DNA Meets the NLRP3 Inflammasome.
Please send the papers to e*********[email protected]
Thanks ! |
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s******a
发帖数: 472 | 16 不同细胞不一样，不同神经细胞也不一样，还和你所谓的外部刺激的种类强弱有关。一
旦达到阈值激活caspase正反馈，大家都死的很快。 |
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a*****x
发帖数: 901 | 17 可以做一些简单的caspase activity或者cell calcium之类简单的assays，如果有变化
也就提供了部门机制。同时可以从另一个方向看这个蛋白敲除是否mimic某种疾病表型
，然后这种疾病中是否有很多这个疾病的突变。 总之要么弄一点phenotype （in vivo
level的），要么弄一点mechanism，这样投CNS希望大一些，reviewers喜欢问这些问
题。 |
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i*******n
发帖数: 48 | 18 这种情况应该是Necrosis
你最好加Caspase inhibitor block apoptosis，再看PI+有没有变化。
很多时候的death是mixed form.
microarray不能说明什么问题，因为所谓的apoptosis相关的基因不是那么绝对的。
另外一个就是看细胞形态，necrosis能看到细胞破裂。
Good Luck.
necrosis)
necrotic |
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s****l
发帖数: 395 | 19 做个activated caspase + PI的flow比较准
necrosis)
necrotic |
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A******d
发帖数: 571 | 20 我做过很多次caspase-3的western blot,从来没有看到和control的区别，包括用高浓
度的药物和staurosporin，以及从2小时到4天.所以这让我怀疑可能我的细胞的确没有
apoptosis，至少在我的药物处理下。观察方面，通常能看到细胞变圆开始脱壁，但是
从来没有发现细胞破裂的，好像在破裂之前都已经detach了。 |
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w*********n
发帖数: 439 | 21 有没有在做apoptosis实验室的大虾？
我老板突然对非caspase 途径诱导apoptosis特别感兴趣（像AIF，AMID）
请问那位大虾知道做这个有没有前途？ |
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w*********n
发帖数: 439 | 22 多谢指教，我老板想做AIF，AMID等这些caspase非依赖的基因，请问你对这个有了解吗？ |
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y********7
发帖数: 87 | 24 我们现在用的是找nih的一个小组要的。small molecular inhibitor,还不错！ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 25 RE LZ
just try to get States Top 10 college/University/Institute of your field/s
their recent 3 Ys PhD
dissertations ASAU Could. Then have a look a lol
for example:
"Metabolic Regulation of Caspase-2"
by
Marisa Rae Buchakjian
Department of Pharmacology and Cancer Biology
Duke University (2010)
HTTP: //dukespace.lib.duke.edu/dspace/handle/10161/3806
review, |
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j******1
发帖数: 1315 | 26 检测caspase-3／7活性就数它家的好，平时都只用标准用量的1／10，太贵了。最近要
用很多，有人知道配方吗？有包子 |
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t***n
发帖数: 2 | 27 The Royal Swedish Academy of Sciences has dedicated the award the Gregori
Aminoff Prize in Crystallography 2014 to: Yigong Shi Tsinghua University,
Beijing, China
”for his groundbreaking crystallographic studies of proteins and protein
complexes that regulate programmed cell Death”
Professor Yigong Shi, Photo: School of Life Sciences, Tsinghua UniversityIn
order for an organism to survive, its cells need to be replaced regularly;
for each cell that dies a new cell has to be created. Programmed c... 阅读全帖 |
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k******y
发帖数: 236 | 28 在贴壁细胞中siRNA了某基因，之后就有大量的碎片漂浮在medium里，镜下看就是小圆
泡，diameter < 10um，而细胞即使trypsin消化下来之后也并不是规则的圆形，这些碎
片并不能uptake trypan blue，计数活细胞(trypan blue-, diameter > 10um) 的数量
有明显减少, 但以trypan blue+ 的％算，并不比对照组减少很多，大概从95％减少到
90％
用FITC-Annexin V和PI double staining，做flow没有看到明显Annexin V+细胞群，
AnnexinV+ PI+细胞群会增加但也不会增加太多(本身％也小于10％)
用50uM Z-VAD-FMK caspase inhibitor 与siRNA共同处理细胞, 这些碎片就不会产生，
计数活细胞的数量也不会减少, 和对照细胞没有差别
请问这是否说明细胞有死亡？能否看出是何种死亡方式？谢谢大家! |
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x****a
发帖数: 607 | 29 大家怎么看，我觉得有点不靠谱
目前一个在武汉的企业号称用溶瘤病毒药抗癌，
应用生物科技手段将呼吸道合胞病毒基因改造后使其丧失致病能力的同时具有抗癌功效
：只选择性杀死癌细胞,不杀伤正常人体细胞；能有效杀伤耐药癌细胞且抗癌谱广，机
体不产生耐药性。
抗癌机制独特：
Ø病毒直接杀伤作用；
Ø通过胞内线粒体机制导致癌细胞凋亡：
§ 线粒体膜上PT-PORE机构发生改变，通道持续开发，进而造成线粒体肿胀破裂；
§ 线粒体膜电位降低；
§ Caspase 9- 依赖性/ 非依赖性双重机制；
Ø诱导局部干扰素大量产生激发系统免疫力协助抗癌；
Ø能杀伤P53抗癌基因阳性和阴性的癌细胞； |
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a******a
发帖数: 283 | 30 像这些直接水解细胞用来做PCR的，样品稳定程度怎么样？caspases应该很容易被激活
分解掉DNA吧？ |
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c******a
发帖数: 267 | 31 难得看到板上有一些学术的讨论，很有回学校上课的感觉。
霍夫同学好像也是老id啦，不过这段评论我觉得写的有些片面；
肿瘤很复杂，不同组织来源的肿瘤一定不能一概而论。比如说血液肿瘤和实体瘤的差别
巨大。cancer stem cell这个概念最初是从leukemia里提出来的，而实体瘤里面的csc/
tumor
initiating cell现在还是一团糊涂。而且我个人觉得为什么有tumor initiating cell
这个说法，就是cancer stem cell这个说法在很多肿瘤上面太多人觉得太牵强，所以采
取这个模糊的说法。
而分化和肿瘤绝对不是绝对相反的关系。去看看病理切片就好了，比如说肺癌，有些肿
瘤确实低分化，但是有些就分化的程度非常高。就像apoptosis一样，虽然肿瘤细胞都
抗凋亡,但是肿瘤组织里经常是ki67增殖指标和caspase-3凋亡指标都高。
而且我认为肿瘤的发病过程(carcinogensis)和肿瘤的治疗也不是完全逆转的关系，治
疗并不一定要完全去reverse这个过程。比如说p53mutation在过半肿瘤里都发现；但是
在治疗时，p53wt的乳腺癌细... 阅读全帖 |
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L*****e
发帖数: 288 | 32 赞原创！赞挖掘精神~
这又是咱们华人在mitochondrial领域具有巨大贡献的例子～
Yufeng 通过观察现象和深厚的知识背景首先意识到mitochondrial和apoptosis可能的
潜在关系；
Guido Kroemer观察到mitochondria会在细胞凋亡前失活；
Don Newmeyer在cell-free system 发现mitochondria的作用。
而真正在细胞上最早把Cytochrome c释放和激活capsase关联起来直接证明线粒体参与
凋亡的还是Xiaodong同志以及后来的Ruth Kluck：（一个Cell，一个science，引用都
是4000+）
Ruth Kluck worked to purify the key factor, and found that its production
was blocked by Bcl-2. Then Xiaodong Wang published his first brilliant
paper (of many!), showing that cytochrome c acti... 阅读全帖 |
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r**a
发帖数: 121 | 34 如果是staining的话，cell signaling的我用了挺好的 |
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s**u
发帖数: 9035 | 35 我喜欢Promega 的kit，能做染色和WB |
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g*********5
发帖数: 2533 | 37 cst 1:400 wb 小鼠样品仍然没有信号... |
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r***e
发帖数: 2539 | 39 有positive control吗？
另外跑的什么%胶？ |
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g*********5
发帖数: 2533 | 40 no. I used the Bistris 4-12% gel. |
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T****u
发帖数: 424 | 41 一般是mitochndria pathway的apoptosis的激活。
cytoC->Apoptosome(Apaf1/Casp9/CytoC/ATP)-》Casp7/Casp3
一般染色染Cleaved Casp3,这是executional Caspase
但有过几篇paper说
1）参与neuron里面的某些信号通路的激活
2）参与iPS的产生。
具体细节要擦查文献，以前看过，没有follow.
Good Luck. |
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m*****u
发帖数: 15526 | 42 flow做什么？annexin V？ annexin V 什么时候开始表达？跟caspase是一个什么时间
对应关系？细胞表达casp9 但不表达casp3会持续多久？谢谢。
间点 |
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s*****g
发帖数: 7857 | 43 其实也有专门和caspase识别的kit for flow cytometry.只是我没有用过。 |
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h***a
发帖数: 145 | 44 http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0011224003000
Caspase-mediated apoptosis and cell death of rhesus macaque CD4+ T-cells due
to cryopreservation of peripheral blood mononuclear cells can be rescued by
cytokine treatment after thawing
Surojit Sarkara, Vandana Kaliab, Ronald C Montelaroa,
Thank you very much!! |
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s*****g
发帖数: 7857 | 45 俺这么做过。但是要分子量相差大点，带之间才没有干扰。不是每种都行的。而且但一
每个抗体背景要好。
目前我最多的是PARP 和caspase-3混用可以。
p-AKT最好不要和其他抗体混用。 |
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k*****n
发帖数: 417 | 46 人家施一公又是院士又是清华校长助理，“铁哥们”的饶毅还在北大憋屈着。。
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2014/12/309031.shtm
施一公出任清华大学校长助理
据清华新闻网报道，12月9日上午，匈牙利罗兰大学（E?tv?s Loránd University，简
称ELTE）校长巴纳?德布勒森及罗兰大学孔子学院院长郝清新一行来访清华大学，校长
助理施一公在工字厅会见了德布勒森一行。
施一公与德布勒森会谈。
据了解，这是施一公首次在媒体上以清华大学校长助理身份出现。
会谈中，施一公首先代表清华大学欢迎德布勒森首次来访，并感谢罗兰大学在今年9月
底热情接待了清华大学副校长谢维和一行的访问。德布勒森介绍了罗兰大学在匈牙利的
重要地位及对同中国院校开展国际合作的强烈愿望。他说，匈牙利政府专为中国留学生
设立了奖学金，以吸引更多中国留学生前往匈牙利学习生活。
德布勒森还提出设想，以推进两校在师生交换、学生联合培养及联合科研等多方面的实
质性合作。施一公表示愿意积极推进合作，建立长期友好关系。
施一公简介（来自中国科学院官网）
结构生物学家。清华大... 阅读全帖 |
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A******y
发帖数: 2041 | 47 Caspases, calpain, lone protease, etc. |
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l********n
发帖数: 260 | 48 两年一次的中科院院士增选总是你那么令人瞩目，鉴于2011年和2013年产生的系列“事
件”，本次科学院院士增选选择了直接公布了第二轮名单。何以见得？2011年初步候选
名单77人，进入第二轮30人，最终当选9人（朱玉贤、张学敏、张明杰、李林、赵玉沛
、康乐、黄路生、舒红兵、葛均波）；2013年初步候选名单88人，第二轮没有公布，最
终当选9人（金力、赵继宗、施一公、桂建芳、高福、韩家淮、韩斌、程和平、郝杰）
。从名单上看纯临床医学背景1-2个，作物遗传昆虫~2个，纯生命科学和医学基础5-6个
；2015年实际上是直接进入第二轮名单，候选人30个。
虽然2015年生命学部院士候选人没有首轮名单，但是根据几个一级专业学会（遗传
、生化分子、细胞）推荐的名单约略可以知道部分候选人信息，这部分详见博文2015年
院士增选生命科学领域部分公示名单，不过很遗憾细胞生物学会推荐的董晨教授没能进
入第二轮，国内免疫领域董晨教授的学术水平国内应在Top3（个人觉是No.1^_^），此
次没能进入第二轮可能主要是因为回国时间短。一下是摘录清华官网对董教授的介绍：
董晨教授是世界上著名的免疫学家... 阅读全帖 |
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w*******2
发帖数: 75 | 49 诚恳求审稿！！！
The key words related to my research field is listed below:
Biology and Life Sciences, Biochemistry, Apoptosis, Caspase-3, Galectin-3,
Matrix Metalloproteinase-1, Melanoma, Oncology, Cancer Metastasis, Cancer
Treatment, Neogenin-1, Photodynamic Therapy, Radio-frequency Ablation;
Clostridium Difficile Infection (CDI), vaccine, toxicology, Immunology,
Infectious Disease, Inflammation, TPL2, MAPK signaling cascades, Signal
transduction.
My email:
[email protected]/* */
Thank you so m... 阅读全帖 |
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h********r
发帖数: 12 | 50 J Med Chem. 2005 Nov 3;48(22):6779-82.
First-in-class pan caspase inhibitor developed for the treatment of liver
disease. |
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