d********e
发帖数: 1334 | 1 土人我不太了解这种问题应该发到什么版去，我觉得这里应该有很多牛人，所以来问问
，希望不要bs我，谢谢
有个文章被lab chip 接受了，然后发邀请让我们submit artwork for cover，要1000
英镑，好贵啊！我写信去问publishing editor，问cover的选择标准是啥啊？（想着如
果有啥标准，以后申绿卡的时候还可以算下contribution） 结果editor说，"Covers
are chosen by the editorial team based on the quality of images submitted.
Several authors are invited and we often receive artwork from authors
themselves as a Lab on a Chip cover is highly sought after. " 原来只是取决于
artwork的质量啊，土人被深深的打击了，觉得这个2k挺不值得的。虽然老板很乐意给
这个钱，但我私下觉得很不值得。正在想要不要劝老板不要花这种冤枉钱。... 阅读全帖 |
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k****o
发帖数: 728 | 2 呵呵，作为一个曾经也玩过lab-on-a-chip但也被Lab Chip他家无情拒过的，comment下
：简单地说，既然又不是你花钱，cover一下多好。其实cover的好处更在于，你的工作
更能吸引眼球，间接地提高citation啊，还有可能被其他杂志editor看重在他们的杂志
里high light,尤其是RSC系列的。或者吸引媒体报道。何乐而不为？Lab Chip分也挺高
的。
现在很多工作尤其是你这个field视觉性很重要，我过去一个工作，是那种data很多很
boring的，但content graph弄得很漂亮，给人印象极深，结果paper online不到24h就
有欧洲一个合作者发信给老板要求合作，说这个工作抓住了他的眼球。
Go ahead吧。
1000 |
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c**i
发帖数: 6973 | 3 Taiwan disclosed half a year ago that a few countries in Middle East sought
to divest into computer chip business and invited Taiwan to open a foundry
there.
United Arabic Emirate (UAE) bought the chip-making facility from AMD, the
second largest chip company, after Intel, so that AMD can concentrate on
design.
AMD to Split into Two Operations. New York Times, Oct. 7, 2008.
www.nytimes.com/2008/10/07/technology/07chip.html
My comment: I will them luck. As the report pointed out, UAE has no
exper |
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Z****s
发帖数: 80 | 4 【 以下文字转载自 LosAngeles 讨论区 】
发信人: Zeroes (人生何处不相逢), 信区: LosAngeles
标 题: 漫步云端 @ Potato Chip Rock
关键字: Potato Chip Rock,Mt. Woodson,Hiking,trail
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Oct 26 23:39:56 2010, 美东)
秋高气爽，正是登高的好季节。这周末我们就出发去Potato Chip Rock漫步云端，尽享
湖光山色吧。
集合和停车地点：Lake Poway Recreation Area, $5.00停车费
集合时间：9:30 am, 10/30/2010
Address：
14644 Lake Poway Road
Poway, CA 92064
(858) 668-4770
Parking: Lake Poway Recreation Area, there is parking fee of $5.00 for non-
Poway residents during the peak months April- Octo... 阅读全帖 |
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M****o
发帖数: 13571 | 5 【 以下文字转载自 Food 讨论区 】
发信人: Minsco (没头脑 地 love 胖P!), 信区: Food
标 题: 新手首次奔片片 - Chocolate Chip Muffins
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jun 5 23:42:37 2011, 美东)
今天给娃做的Chocolate Chip Muffins。用了以下材料：
2 eggs, 1/2 cup milk, 1/4 cup cooking oil, 1 bag chocolate chip muffin mix (
哈哈，偷懒了)，加了些葡萄干和压碎了的核桃。
425 F 烤15 min左右。出炉。:D |
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y**********3
发帖数: 339 | 6 chip有家庭收入的要求，收入比较多的不符合chip，具体你可以查查，好像三口之家年
收入要3万一下。
另外，不是每个医院都接受chip，如果非要用可能要换医生转院。
应该不影响绿卡申请。 |
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h*******s
发帖数: 447 | 7 谢谢版主解答。网站上确实有说 目前有保险的不能申请medicaid或chip, 那这合着就
是给不守法的 合法（非法）居民用的？
另外chip perinatal申请的时候是说只要怀孕就行（小孩能有美国籍），不管爸妈的身
份。medicaid的确需要公民。
看到 别的州有些案例是 自己有保险，保险后的自出那部分 也可以用medicaid(chip,
emergency medicaid)支付。
我们也想类似于这样，先不管申请行得通不，不知道以后出入境海关是否会责问： F签
证理应自己有能力支付保险医疗费用，为何要动用国家补助？ |
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v***n
发帖数: 5085 | 8 去家门口的哈迪死吃晚饭
因为要一路开回DC上班所以只好吃快餐
小二已经认识我很久了，大概是4月份时候和我好上的
看我回来了特开心，问我啥专业
我说CS，他说懂不懂怎么买便宜的chip
我想了想说我soft，EE的hard，她们懂chip
他激动了下 给我整个纸袋灌满了chip
我从黑堡一路吃到挪阿挪科才吃了一半
剩下的只好扔掉了 |
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A*f
发帖数: 3067 | 9 that thing is that, say in a skins game, say the ball is on the way,
if you could chip-in, you win the hole, if you chip closer, tap in, you tie
the hole, if you couldn't make up and down to save, you lose the hole.
If you are the one to chip, what would you do?
If you are the partner, what would you do? |
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A*f
发帖数: 3067 | 10 Cool!
I thought Stymie rule can only be used when players are on the green or
around the green.
For my case, I was 10-20 yards away. Now I think back, it would be an eagle
if i chip in. (although i did chip on the same hole, 40 yards away for eagle
before.)
Mentally, I was scared to hit the ball on the green, i ended up chipping far
left, 2-putts for par, not bad though. But next time, I will insist. |
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p*****o
发帖数: 348 | 11 老鹰的DC是Urban的伴郎,Urban推荐给Chip的;
OSU的OC Herman是拿了Chip的推荐信,被Urban录用的
Urban和Chip两个进攻专家,也算是英雄相惜 |
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w******n
发帖数: 13172 | 13 如果对方chip short but stay at baseline，你当然是趁势chip and charge上网了，
这么个大礼不收白不收。当然你得chip出高质量的approach来才行 |
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g*****y
发帖数: 7271 | 14 如果chip回来的球不是特别低的话并且你能到位，应该要能处理好这种球。
如果chip回来比较低，你的握拍太extreme的话，会不好处理。对于
低水平的时候，你应该正反手都能chip回去比较深的球。对于高水平
的话，你一个是到位尽可能早，在高一点的位置够到球，另一个是用
topspin刷球。 |
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k***r
发帖数: 4260 | 16 分别买 FotodioX的adapter 和一个山寨 AF confirm chip，没有
instructions。哪位大侠装过，可以发一份instructions吗？
研究了一下，貌似里面的黑色塑料template是便于安装的。但是
chip的size大于template上的opening size，chip fit不进去，
自然也卡不住 :-( |
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s*****n
发帖数: 10890 | 18 没什么工具 就是剪刀给chip做一个垫片，screwdriver，强力胶。其实就是视频里说的
那些。刚开始可能得花一个晚上 我之前也贴错过 还撬了chip 因为之前买的chip不可调 |
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E***e
发帖数: 3430 | 19 看中了一个副厂鱼眼，纯粹为了玩玩，不想花太多钱
http://www.bhphotovideo.com/c/product/880774-REG/
是手动对焦头，但是说有Focus Confirm Chip
想和各位达人确认一下我对Focus Confirm Chip理解对不对
就是对焦圈需要手动转
但是有chip存在，一旦转对了焦，对焦的指示灯会亮
其实人的作用只是代替马达
而不需要通过肉眼判断对焦是否准确对不对？
视力不好纯眼力对焦实在无能为力，谢谢。 |
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u*******t
发帖数: 149 | 20 huhu,写菜谱不比做菜累呀.
好了,到chocolate chip cookie的时间了.
这个是惦记了很久,一直到上次看irix说起来才想到开始做.
这里是抄袭来的材料清单:
1 cup (2 sticks) unsalted butter, room temperature
1 1/2 cups packed light-brown sugar
1/2 cup granulated sugar
1 teaspoon pure vanilla extract
1 large egg
2 cups all-purpose flour
1/2 teaspoon baking soda
1/2 teaspoon salt
12 ounces semisweet chocolate, coarsely chopped, or 1 twelve-ounce bag
semisweet chocolate chips
我都是在店里买的散装的,chocolate chip它有很多种,买那种颗粒最小的就好了.
然后把butter,sugar mix在一起搅拌,我没有电动搅拌机, |
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p*****e
发帖数: 7299 | 22 http://www-03.ibm.com/press/us/en/pressrelease/21474.wss
Made in IBM Labs: 10 Chip Breakthroughs in 10 Years
Armonk, NY - 03 May 2007: Today's announcement by IBM (NYSE: IBM) of a major
breakthrough in chip design -- called 'airgap' -- bookends a decade of
innovation from IBM Labs that have transformed the IT industry with new
materials and design architectures to build smaller, more powerful and
energy efficient chips.
IBM's pioneering work to move the industry from aluminum to |
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s********l
发帖数: 1195 | 23 就是听了一耳朵，原理大概就是类似DNA micro chips，用antibody develop出protein
chips，用途就是大规模快速检测蛋白含量。听说现在大制药公司已经研究有卖成品
chip的了，这里有谁用过么？介绍一下经验吧，谢谢！ |
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m*********n
发帖数: 215 | 24 请问版上有人熟悉ChIP-seq么？用细胞系表达HA-tag的蛋白然后isolate chromatin做
ChIP-seq。不知道大概需要多少细胞才能得到比较好的浓度的chromatin？按说HA的
antibody是相当好了。如果有熟悉ChIP的前辈可以帮忙指点下，非常感谢！！ |
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m*********n
发帖数: 215 | 25 谢谢楼上各位分享经验！
我们实验室刚刚开始做ChIP-seq，有一个学生做这个，说是揣摩了很久的protocol。
我plate了25million N2A cells给他，他还说Chromatin浓度不够。我吐血。。。因为
transfection看起来很好，细胞很健康。就算撑死细胞死了5million吧，那还有
20million活着呢。因为我自己不做这个，所以也不是很懂。但是我总觉得>20 million
cells怎么可能不够。如果做ChIP的话是more than enough。虽然说ChIP-seq大概需要
更多的chromatin，但是因为表达的蛋白是HA-Tag的，HA的抗体非常非常好，所以
Chromatin的浓度要求应该比一般蛋白的要低。
我就是很不明白为什么总是说Chromatin不够。前面说用Primary culture做,我Culture
了4个litter（35个胚胎）的小鼠皮层，那个学生也说是细胞不够。。。所以我觉得不
对劲。但是老板也说不出个所以然来。实验拖拉着我急死了。
不知道前辈用的是什么Protocal呢？可以分享下吗？ |
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e******x
发帖数: 9 | 26 看到这里有很多牛人都做过CHIP试验。 想请教一下大家：
（1）一般做完IP以后大家是怎么purify pulled-down chromatin DNA的？ 我看到网上
说可以
用PCR purification Kit 直接纯化，请问这里有人试过吗？
（2） 我最近才开始摸索条件，上一次实践结果，一个sonicated lysate sample 还可
以， 但另
外一个IgG control 有阳性。请问可能什么地方出现问题了呢？
（3）大家有什么好的protocol可以推荐一下啊？我只是需要做一个简单的Myc-tag的
CHIP. 抓下来
Chromatin DNA 看看几个结合位点再两个条件下有没有变化。最后的结果想用Real-
time做。上次
买了一个Active Motif 的CHIP Kit. 但发现最后的elute buffer 好像和我的SYBR Mix
不兼
容，严重影响PCR反应 （必须稀释20倍以上）。
望高人指点， 万分感谢！！！！ |
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m******5
发帖数: 1383 | 27 现在做chip on chip的成本是多少呢？
通常是走什么流程？ 自己是只要收集样品然后送公司么？通常哪些公司负责做这个？ |
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m******5
发帖数: 1383 | 28 谢谢！！能展开说说么?另外能否给些reference?我们这里一个做发育的实验室，最近
要上chip，不知道第二步'on chip'到底该自己建还是给公司做 |
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m******5
发帖数: 1383 | 29 谢谢！！能展开说说么?另外能否给些reference?我们这里一个做发育的实验室，最近
要上chip，不知道第二步'on chip'到底该自己建还是给公司做 |
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h*********e
发帖数: 55 | 30 想对ChIP-chip的序列进行一些motif的分析，但不知道怎么得到这些序列。
一般文章里都会有一个excel文件，里面有peak的chromosome location.有什么简单的
方法或程序得到这些序列吗？
谢谢！ |
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g*******f
发帖数: 427 | 31 最近在做 ChIP 看PPARgamma 的转录调控，一个月了也没出什么结果，用的是
Millipore 的EZ ChIP Kit, IgG阴性对照总是出现挺强的带，， RNA Polymerase2 阳
性对照的带却很弱，似乎没有理由怀疑试剂盒的RNA Polymerase2 抗体有问题啊? 以前
做NF-kappaB 一直都做得挺好的，只是用的是不同的试剂盒而已。 还请做这个方面的
指教一二。多谢了
BTW，偶然翻到了尚永丰的主页，上面有这么一句 "在世界上首次建立了哺乳动物细胞
染色质免疫沉淀技术（ChIP）"
http://www.bjmu.edu.cn/art/2009/12/6/art_8_39651.html
让我觉得挺 shock 的，原来这个技术是他"建立"的 难以置信啊 |
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d****7
发帖数: 109 | 32 PPARgamma的ChIP有难度，但是RNA polII的ChIP signal应该很强啊，你说IgG信号强，
我觉得
很可能是试剂盒的buffer污染了，我当初用Millipore的方法的时候就出现了这个问题
，我的TF没信
号，IgG信号极强。后来觉得是污染，我就自己配Buffer，不用试剂盒的buffer，然后
就变成IgG和
我的TF都没带了，至少解决了污染问题。
后来我发现，Millipore这个方法有SDS在lysis buffer里，对于结合力强或者表达量高
的蛋白很容
易出结果，比如SRF,ELK1之类的，我的TF表达量低，结合力也弱，怎么做都出不来，后
来我换了个
protocol，是Riachar Young's Lab protocol，就好了！
尚勇丰建立ChIP,真搞笑，哈哈 |
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g*******f
发帖数: 427 | 33 最近在做 ChIP 看PPARgamma 的转录调控，一个月了也没出什么结果，用的是
Millipore 的EZ ChIP Kit, IgG阴性对照总是出现挺强的带，， RNA Polymerase2 阳
性对照的带却很弱，似乎没有理由怀疑试剂盒的RNA Polymerase2 抗体有问题啊? 以前
做NF-kappaB 一直都做得挺好的，只是用的是不同的试剂盒而已。 还请做这个方面的
指教一二。多谢了
BTW，偶然翻到了尚永丰的主页，上面有这么一句 "在世界上首次建立了哺乳动物细胞
染色质免疫沉淀技术（ChIP）"
http://www.bjmu.edu.cn/art/2009/12/6/art_8_39651.html
让我觉得挺 shock 的，原来这个技术是他"建立"的 难以置信啊 |
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d****7
发帖数: 109 | 34 PPARgamma的ChIP有难度，但是RNA polII的ChIP signal应该很强啊，你说IgG信号强，
我觉得
很可能是试剂盒的buffer污染了，我当初用Millipore的方法的时候就出现了这个问题
，我的TF没信
号，IgG信号极强。后来觉得是污染，我就自己配Buffer，不用试剂盒的buffer，然后
就变成IgG和
我的TF都没带了，至少解决了污染问题。
后来我发现，Millipore这个方法有SDS在lysis buffer里，对于结合力强或者表达量高
的蛋白很容
易出结果，比如SRF,ELK1之类的，我的TF表达量低，结合力也弱，怎么做都出不来，后
来我换了个
protocol，是Riachar Young's Lab protocol，就好了！
尚勇丰建立ChIP,真搞笑，哈哈 |
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j****x
发帖数: 1704 | 35 这个实在太多了，商业软件例如DNASTAR，NextGENe，CLC，Genomatix等等都有比较成
熟的模块，界面也相对友好，价格自然不菲。
免费软件更是层出不穷，PeakSeq，F-Seq，USeq，CisGenome，ChromaSig，ChiPDiff，
MACS，SISSRs，ChIP-Seq Simulator，QuEST，FindPeaks，GLITR，WTD/MSP/MTC，
ERANGE3，都出生名门，还有一堆基于R的代码就不提了，自己去看paper吧。
新手的话，个人推荐CisGenome，功能强大，也不用自己编译调试，或者webserver比如
ChIP-Seq Tool Set（http://havoc.genomecenter.ucdavis.edu/cgi-bin/chipseq.cgi）；
ChIP-Seq Analysis Server（http://ccg.vital-it.ch/chipseq/），在线分析，省心省力。 |
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d****7
发帖数: 109 | 36 这个问题我也不确定，以下是我的一些拙见，如有错误，欢迎指出：
现在一般有两种normalization方法：%Input和fold enrichment.
我觉得两种都非常重要，简要来说，fold enrichment是衡量你所看得区域是否是bona
fide target的标准，而%Input给你一个大概的概念，看binding强不强，很多人说（我
也不确定）一般TF的强度在0.01%-1%，而hitone神马的都很强(2%以上？)。
Biogene同学说:“0.01%几乎与IgG的信号差不多了，这时候很难确定真实TF binding信
号，还是背景，还怎么算fold enrichment？”
对于这一点，其实不一定，normal IgG信号的强度真不好说，我现在也不知道IgG的信
号跟什么有关，可能不同公司的normal IgG不同，不同IP buffer得到的IgG信号不同，
不同wash buffer得到的信号也不同，比如大家看这篇nature文章，通篇的ChIP信号都
是0.0001%数量级的：
http://www.nature.com/nature/journal/v47... 阅读全帖 |
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d****7
发帖数: 109 | 37 书里都是那么说的，具体细节我估计没人清楚。而且formaldehyde crosslink protein
-dna只是理论上的，如果你看最早的那篇发明ChIP的文章，文章里说，在in vitro的情
况下，formaldehyde只能有效的crosslink nuceosome-dna interaction，但是却不能
crosslink TF-DNA （他们似乎只测试了lacz）。
另外，modENCODE的Julie Ahringer跟我们说，她和Steven Henikoff都觉得
formaldehyde不能有效的crosslink protein-dna，而大家在做ChIP的时候，只是将
nucleosome crosslink到DNA上，然后其他的TF只是crosslink到nuclesome上了，间接
的crosslink到DNA上。
对于reverse crosslink，只是习惯性的加热overnight。
formaldehyde的浓度，大家用的差别还是挺大的，有些人用1%，有些人用1.5%，有些人
室温crosslink，有些人37度，有些人在formalde... 阅读全帖 |
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d****7
发帖数: 109 | 38 IgG本来就不是什么好的control，我们做ChIP时，不仅用IgG，还用negative region
primer做control
对于ChIP下来的DNA，这个跟你的蛋白的表达量，IP的细胞数有关，比如我的TF表达量
很低，我用20碟10cm dish才ChIP下来10ng DNA，如果是histone的话，估计会很多。
对于Protein G，我这有个鼠单抗，是IgG1，与protein G结合的一点也不好，必须用另
一种beads，叫Pan Mouse IgG Dynabeads，这个beads是pre-conjugated human
monoclonal ab to mouse IgG，结合的不错。但让我费解的是，同样是鼠单抗，同样是
IgG1，Flag M2抗体就和Protein G能perfectly结合。
Rabbit |
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F**********6
发帖数: 90 | 39 做了几次CHIP，每次对照IgG都能扩增出很弱的条带（实验组的条带很强！）。请问如
何解决对照IgG有弱条带的问题？
看了些别人发表的CHIP实验数据，绝大部份对照IgG基本上没有条带。但偶然能看到一
两篇文章里的CHIP实验数据里的对照里有弱的条带。
多谢指教 |
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b*******a
发帖数: 62 | 40 最近在准备Chip DNA送测序，size什么的都没问题，唯一的问题就是DNA的
concentration太低，请问各位大虾如何提高chip DNA的产量？最关键的步骤是什么？
谢谢！ |
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w*********n
发帖数: 439 | 41 不好意思阿。非常感谢你的热心帮助。我现在在做简单的chip-PCR，不久就会做chip-
seq.我这几天为chip的事情都要被老板压垮了，挨了不少骂，所以没回。，
非常抱歉。 |
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H****n
发帖数: 26 | 42 自己折腾了好久，还是解决不了问题，只好来版上请教大牛了。
DNA shearing to 150-700 bp, Input DNA 量是～100ug，抗体用Abcam的anti-HA （
ChIP grade， 5ug for each IP）
抗体结合的buffer 配方是（ChIP dilution buffer： 20mMTrisHC PH8.0， EDTA PH8.
0 2mM, NaCl 150mM, SDS 0.01%, TritonX-100 1%）. 抗体incubate Overnight,
millipore的beads用dilution buffer 洗三遍，然后BSA block overnight 第二天加进
去，3-4hours.
还有，做的是tissue的ChIP（表达这个TF的细胞只占细胞总数的8%-10%），为了让固定
的1%甲醛渗透更快点，用tripsin消化了
组织（之前直接用SDS裂解组织也做过，效果也不好），固定10min.
wash： 1 low salt ->1 high salt->1 LiCL suffer->2* TE
问题: 1.... 阅读全帖 |
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n********k
发帖数: 2818 | 43 I don't know but I know Ab is likely the No1 factor for ChIP, esp ChIP-seq,
so when buy antibody, look for ChIP-Seq grade or verified... |
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G********e
发帖数: 528 | 44 我没有做成功过tissue的，不好下结论，猜测可能洗不干净，不过你的wash过程也没太
大问题。
你觉得tissue的ChIP和in vitro培养的cells的ChIP做起来有什么不同吗？
我最近也打算尝试tissue的ChIP |
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w********r
发帖数: 1431 | 45 之前查过，
很多ChIP是用embryo做的，也有用liver的。都比较嫩，把组织研磨一下基本就可以当
cell用了。
后来我们做muscle的ChIP，比较结实，发现磨半天也磨不碎。。。
后来我就拿剪子狂剪，剪成很细碎的小块，固定15分钟，固定完了用PBS洗洗，放在
lysis buffer里洗洗，匀浆。ChIP-Seq的结果很好 |
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y********g
发帖数: 782 | 46 目的是想要证明A和B两个转录因子binding在一起。
方法1：IP
方法2：荧光显微镜
问题在方法3：如果想证明两个转录因子physical binding在一起，哪个方法是对的？？
a) 用抗体拉A，然后+蛋白酶, 做qPCR (引物直接用设计好的，跨B的binding site的）
b) 用抗体拉A，然后用抗体B拉，然后+蛋白酶, 做qPCR (引物直接用设计好的，跨B的
binding site的），那还要不要做 qPCR 来检测 A的binding activity 啊 (用第一次
Chip的样品，还是用Re-CHIP的样品来测啊？）Re-CHIP的时候，不可避免的会有丢失哦
~~
这个实验可行么？
谢谢~~~ |
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s******s
发帖数: 13035 | 47 说这个没意义，完全看你chip啥了。
chip本来需要量大，主要是因为sonication方便。你用酶切
或者其他方法，又chip histone这种大路货，就不需要很多 |
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L****e
发帖数: 499 | 48 ChIP 有的好做很容易就做出来，有的很难，最关键的是抗体要好。我最近一个用常规
方法怎么都做不出来，后来用了一种 biotin ChIP, 就是将目的基因和一种 biotin
ligase 同时表达，让目的基因biotinated, 然后用streptavadin dynal bead 做ChIP
，这个biotin 最大的好处就是非常特异。你不妨试一试 |
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L****e
发帖数: 499 | 49 ChIP 有的好做很容易就做出来，有的很难，最关键的是抗体要好。我最近一个用常规
方法怎么都做不出来，后来用了一种 biotin ChIP, 就是将目的基因和一种 biotin
ligase 同时表达，让目的基因biotinated, 然后用streptavadin dynal bead 做ChIP
，这个biotin 最大的好处就是非常特异。你不妨试一试 |
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