s*****t 发帖数: 1994 | 1 Open Star Cluster M38
Credit & Copyright: NOAO, AURA, NSF
Explanation: Open cluster M38 can be seen with binoculars toward the constellation of
Auriga. M38 is considered an intermediately rich open cluster of stars, each of which is about
200 million years old. Located in the disk of our Milky Way galaxy, M38 is still young enough
to house many bright blue stars, although it's brightest star is a yellow giant shining 900 times
brighter than our Sun. The cluster spans roughly 25 |
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n*******r 发帖数: 1484 | 2 本来以为今年的面试应该都已经结束了,刚刚又接到一个邀请电话面试,是一个工科学
校的faculty cluster hire。第一次接触这种cluster hire,比较懵,他们还提供了电
面会问到的如下问题:
1.What is your vision for your field
2.Given that this is part of a cluster hire: who would your key
collaborators be? (in and outside of **)
--这个outside的collaborator需要是faculty candidate吗,还是已经是faculty的?
3.Is there anything else about yourself that you would like to tell us?
4.Do you have any questions for us?
能请前辈们指点迷津吗?非常感谢! |
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D***a 发帖数: 471 | 3 cluster hire不一定就强调interdisciplinary。有时候是想找某三个学科里,哪个
candidate强就收哪个。有些内部可能有协商,一个系出一个什么的。
这些可以问SC的。最后谁决定,和是不是cluster没大关系。这个也是SC可以给解答的
。home department人的专业意见还是很被看中的,尤其是注重research的地方。
跟SC见面的时候可以多问关于cluster hire。他们会信手拈来,乐意回答。
good luck! |
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c*******e 发帖数: 35 | 4 Kmeans, hierarchical clustering有两种,agglomerative, divisive。Knn不是做
clustering的吧,是classification或者regression。都是supervised。clustering是
unsupervised的。 |
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w*********s 发帖数: 2136 | 5 【 以下文字转载自 Parenting 讨论区 】
发信人: whiteclouds (/ 参考消息 /), 信区: Parenting
标 题: Vaccination Link To H3N2 Death Cluster In Japan Hospital?
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 11 12:47:57 2010, 美东)
http://www.recombinomics.com/News/11071001/H3N2_Akita_Vaccine.html
Vaccination Link To H3N2 Death Cluster In Japan Hospital?
Recombinomics Commentary 13:22
November 7, 2010
25 patients and 8 staffs are suffering from influenza now
29 Oct., vaccinated against the flu
31 Oct., a man died(eighties)
2 Nov., 2 men died(six... 阅读全帖 |
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w*********s 发帖数: 2136 | 6 【 以下文字转载自 Parenting 讨论区 】
发信人: whiteclouds (/ 参考消息 /), 信区: Parenting
标 题: Vaccination Link To H3N2 Death Cluster In Japan Hospital?
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 11 12:47:57 2010, 美东)
http://www.recombinomics.com/News/11071001/H3N2_Akita_Vaccine.html
Vaccination Link To H3N2 Death Cluster In Japan Hospital?
Recombinomics Commentary 13:22
November 7, 2010
25 patients and 8 staffs are suffering from influenza now
29 Oct., vaccinated against the flu
31 Oct., a man died(eighties)
2 Nov., 2 men died(six... 阅读全帖 |
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e**s 发帖数: 513 | 8 I am a biologist and need to do some bioinformatics analysis now. I need to install BLAST and Mira on the cluster. The stuff who maintains the bioinformatic cluster told me it's very difficult to install programs in the cluster (SunOS5.9). He is busy and doesn't want to help.
I wonder if I can do it by myself. I only know tiny bit of linux.
A lot of thanks for any suggestions! |
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e******o 发帖数: 27 | 9 【 以下文字转载自 EE 讨论区 】
发信人: espresso (espresso), 信区: EE
标 题: 有人做fuzzy clustering的么?
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 22 06:14:35 2005), 站内
发信人: espresso (espresso), 信区: Mathematics
标 题: 有人做fuzzy clustering的么?
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Jul 22 06:09:43 2005), 转信
有几个问题想请教:
对于categorical data,
如果attribute很多的话
现在最好的办法是什么?
谢谢
BTW,I want large number of clusters too
搞不太清这到底算哪个领域
Math?CS?EE? |
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w*******e 发帖数: 285 | 10 对同样的data set进行clustering,假设一个用kmean,另外一个用其他方法,都生成
相同数目的clusters,比如说5个。那么怎么比较它们之间的距离?有没有什么标准的
做法?要是用hierarchy clustering生成两颗unordered tree,那么有什么标准的
metric可以比较着两棵树之间的距离呢? |
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i******y 发帖数: 70 | 11 intra-cluster 和 inter-cluster distances只能衡量一个clustering result自身的
质量,可能不好比较两个results。
下面这篇文章第三页上的公式或许有用。
Mining The Stock Market: Which Measure Is Best? (Extended Abstract) |
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a******3 发帖数: 170 | 12 http://micans.org/mcl/man/clmdist.html
For each pair of clusterings C1, C2, two numbers are given, say d1 and d2.
Then d1 + d2 equals the number of nodes that have to be exchanged in order
to transform any of the two clusterings into the other, and you can think of
(d1+d2)/2N as the percentage that the two clusterings differ. The split/
join distance has a linearity property with respect to the meet of C1 and C2
, see below. |
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t********e 发帖数: 15 | 13 windows cluster server2003跟linux比在稳定性跟速度方面怎样?用windows cluster
server来做12个cpu,每个cpu都是core duo的cluster,可行吗? |
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w***g 发帖数: 5958 | 14 看了眼那paper,极水。文中先假设了欧式空间,先做k-means (或者k-d tree),然后
对cluster center做spectral cluttering。如果数据真的非常大,那确实得这么做。
但这方法也太显然了,需要发paper吗?
然后spectral clustering最大的好处就是可以处理非欧式空间的数据,甚至都不需要
测度,只要相似度就可以。假设了欧式空间就把spectral clustering这个好处给去掉
了。那还不如直接就k-means得了。
我说的方法目前没人用过。你要有兴趣可以evaluate一下,好的话你可以自己写paper。
注意要写paper的话选dataset的时候一定要选一些非欧式空间的数据,比如我paper中
用的那个EMD。 |
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a***n 发帖数: 1616 | 15 【 以下文字转载自 Programming 讨论区 】
【 原文由 adven 所发表 】
就先不说高维data了。
先说2-D/3-D等有几何意义的data吧。
大家一般handle的是凸cluster,还是凹cluster?
也就是如果给每个cluster画上包围圈的话,这些boundary一般是凸图形,还是凹图形? |
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g***l 发帖数: 18555 | 16 不是,是CLUSTERING,一个SERVER DOWN掉了,另一个SERVER应该接过来,2-NODE
ACTIVE/PASSIVE CLUSTERING,数据库在STORAGE上,只有一个,书上没怎么讲
CLUSTERING,其实很重要的,很多大公司用这个。 |
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y****9 发帖数: 144 | 17 I have read "As a rule of thumb, every table should have a clustered index"
(see http://www.sql-server-performance.com/2007/clustered-indexes/ )
Isn't this a really general rule? Do your production database tables follow
this?
If I understand correctly, this feature corresponds to "Index organized
table" (IOT) in Oracle, generally IOT could be good for look up talbe in
Oracle.
But I have never seen similiar recommendation in Oracle. Interested in
knowing why or whether it is really good to have ... 阅读全帖 |
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v*****r 发帖数: 1119 | 18 You understanding is right, Oracle IOT serves the same purpose as clustered
index in SQLServer (only difference is you can view IOT is PK only clusted
index). Whatever advantage and disadvantage to use IOT applies to clustered
index in SQLServer, so obviously, it is NOT true "As a rule of thumb, every
table should have a clustered index".
"
follow |
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s**********o 发帖数: 14359 | 19 CLUSTER只是一种FAULT TOLERANCE,还有很多种FAULT TOLERANCE的,
比如MIRRORING, LOG SHIPPING,2012还有ALWAYS ON混合的CLUSTERING MIRRORING 和
LOG SHIPPING,还可以跨SUBNET多个SITE的CLUSTERING。ORACLE的那个能搬迁的
DATABASE,
SQLSEVER也出来一个CONTAINED DATABASE,可以不同的SERVER搬迁。 |
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d***a 发帖数: 13752 | 20 老兄,你这个不叫cluster。多台机器联网在一起,装上cluster软件,才叫cluster。
你要装的,是单机服务器吧。
选一台计算性能好的台式机,工作站,或tower server,装上Linux,再装上相应的计
算软件,就可以了。想自己组装硬件,比较方便的是买barebone server,再买处理器
等装上。
多用户支持和ssh server,这些在Unix类系统上都是最基本的功能。花点时间学习一下
Unix/Linux入门指南就可以了。 |
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w******g 发帖数: 67 | 21 I am working on transfer a MPI program from my laptop to one computing
cluster("Docker"). The system specifications are as following:
my laptop
Dell d810 Intel CPU
GCC 4.1.2
"Docker" cluster:
10 nodes , each node runs with 2 AMD64 processors and CentOS4.4
Linux system.
GCC 3.4.6
The problem is that I can compile the program successfully on the cluster.
But when running, it crashes with error(it crashes when I run it on one
processor)
*** glibc detected *** malloc(): memory corruption: 0x00000000 |
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d*******r 发帖数: 3299 | 22 有人用过 Hazelcast 吗? ( https://github.com/hazelcast/hazelcast )
看着很适合做 real time system. 我觉得可以理解为 JVM 版本的, 带 Cluster 模式
的 Redis.
比 memcached 功能强,
比 Redis,有 Cluster 功能,
我在网上跟他们 marketing guys 瞎扯了一会儿,他们说,现在有 4000+ companies
在 production 中使用了。比如 Apple, Cisco ,Ericsson, Hsbc, Morgan Stanley,
American express, AT&T
比如,Apple store 就有 600 多个 nodes 在跑 Hazelcast.
Hazelcast 支持的数据结构,比如分布式map, queue,用起来很简单的样子:
http://www.hazelcast.org/getting-started
Spring 的作者 Rod Johnson 也加入了 Hazelcast:
http://www.hazelcast... 阅读全帖 |
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y****a 发帖数: 4 | 23 【 以下文字转载自 Linux 讨论区,原文如下 】
发信人: yangsa (要拥有一个爱我而且我爱着的女人), 信区: Linux
标 题: Help about Linux clustering, Thanx!
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Mon Aug 30 23:47:17 2004) WWW-POST
I want to set up a linux cluster for computing. Currently, I have 24 linux
machines with the same hardware configurations. I do have several other
machines which can serve as servers. Could you please give me some
suggestions? Thanks.
Software: which linux, and what clustering software?
Network configuration: would 10M etherne |
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a***n 发帖数: 1616 | 24 【 以下文字转载自 Programming 讨论区 】
【 原文由 adven 所发表 】
就先不说高维data了。
先说2-D/3-D等有几何意义的data吧。
大家一般handle的是凸cluster,还是凹cluster?
也就是如果给每个cluster画上包围圈的话,这些boundary一般是凸图形,还是凹图形? |
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r***o 发帖数: 1285 | 25 Explanation: Open clusters of stars can be near or far, young or old, and
diffuse or compact. Open clusters may contain from 100 to 10,000 stars, all
of which formed at nearly the same time. Bright blue stars frequently
distinguish younger open clusters. M35, pictured above on the upper left,
is a relatively nearby at 2800 light years distant, relatively young at 150
million years old, and relatively diffuse, with about 2500 stars spread out
over a volume 30 light years across. An older and more |
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h*******o 发帖数: 4884 | 26 麻烦能不能再解释的清楚一点
我现在的case是就2个group, ctrl 和Treatment
用得actin+GAPDH做得internal control
所有其他的target 都normalize了
然后软件又给出了treatment group的fold change和P value
做cluster/heatmap的时候,有2个选择一个是Pearson Correlation一个是Euclidean
distance.
因为我就2个group,所以我想看看每个group的individual sample怎么cluster
发现不管用那个方法,图都还行,每组6个sample里面5个都cluster在一起,只有一个
会跳到另外一组的sample中间
但是pearson 和Euclidean的差别在于 不同的target gene被放在一起了
这个有区别吗?
谢谢 |
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e**s 发帖数: 513 | 27 I am a biologist and need to do some bioinformatics analysis now. I need to install BLAST and Mira on the cluster. The stuff who maintains the bioinformatic cluster told me it's very difficult to install programs in the cluster (SunOS5.9). He is busy and doesn't want to help.
I wonder if I can do it by myself. I only know tiny bit of linux.
A lot of thanks for any suggestions! |
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N*******k 发帖数: 43 | 28 多谢建议哈,都很中肯啊。
要说明一下哈,这个不是某个 lab 开个小 cluster,而是在筹建一个上得了新闻的比
较大规模的 supercomputer。所以,position,title,工资等都不是我能决定的,而
是我跟多方扯皮妥协最后达成的解决方案中的一部分。也不是独自工作,而是在各方参
与的一个 team 中。所以可能和 PI 制的那种工作环境不太一样,更偏 enterprise 一
些。工作形式也比较正规,比如说打卡等。
这个职位比较适合想转行的同学。IT 行业尤其看资历,所以转行的同学面临入行难。
一旦入行,工资待遇都会升得比较快 -- 毕竟有业界标准么。工资和 job description
前几天贴过的,50-55k,是个 junior level 的位置,适合没有工业界 intern 经验
的新手,我来手把手带。这个工资标准哪里指望能请到 cluster administrator 啊。
只是希望使用过 cluster,管理过 Linux server,会基本的 Linux 管理。大部分做
bioinformatics 的同学都符合这个条件吧。
因为是整个系统从无到... 阅读全帖 |
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B****e 发帖数: 28 | 29 【 以下文字转载自 Linux 讨论区 】
发信人: Betrue (..), 信区: Linux
标 题: 求助:有对linux cluster的maui scheduler熟悉的吗?
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jan 3 13:14:47 2008)
我们实验室的cluster上pbs系统用的是maui scheduler,最近不知道为什么总是会自动
退出,递交的作业排了好久也不运行,查看进程才发现只有pbs_server和pbs_mom在运
行,没有maui的进程。重启pbs后正常几天,maui又会自动关闭。
有没有对cluster管理有经验的能帮忙回答一下这可能是什么问题吗?另外,如果重启
pbs,是不是所有的作业,包括正在运行的和在队列中的作业都要杀掉,然后重新递交?
万分感谢! |
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c*****x 发帖数: 90 | 30 学校里有个计算中心,用的是LINUX的CLUSTER,现在现在想通过SSH连接CLUSTER然后用
SCRIPT后台运行FLUENT。这个CLUSTER用的是SUN GRID ENGINE(SGE),但不知道具体
这个脚本怎么写。有没有哪位兄弟有经验的,指点一二。非常感谢!
t****[email protected] |
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w*********s 发帖数: 2136 | 31 【 以下文字转载自 Parenting 讨论区 】
发信人: whiteclouds (/ 参考消息 /), 信区: Parenting
标 题: Vaccination Link To H3N2 Death Cluster In Japan Hospital?
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 11 12:47:57 2010, 美东)
http://www.recombinomics.com/News/11071001/H3N2_Akita_Vaccine.html
Vaccination Link To H3N2 Death Cluster In Japan Hospital?
Recombinomics Commentary 13:22
November 7, 2010
25 patients and 8 staffs are suffering from influenza now
29 Oct., vaccinated against the flu
31 Oct., a man died(eighties)
2 Nov., 2 men died(six... 阅读全帖 |
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e***o 发帖数: 180 | 32 以前只接触过logitudinal data
感觉Clustered Data虽然有intra-cluster correlation需要model, 但没有with-in
subject factor,怎么把repeated的点联系起来。
比如说, 在longitudinal data, 每个subject都有时间这个with-in subject factor,
所以estimate的时候t=2, t=4, t=6, t=12这些时间点可以对起来。
但在clustered data,比如说同一个老鼠生的n个老鼠仔子,好像说老鼠仔子#1,
老鼠仔子#2,老鼠仔子#3,.....没有意义, 这里顺序只是编号没有任何实际意义。
有谁有这方面经验可以交流一下。 |
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a****y 发帖数: 1035 | 33 I got one balanced cluster data set.K clusters and 30 samples from each
cluster.
My question is, how to calculate the grant mean and the standard error?
Thanks for all of your help! |
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h**t 发帖数: 1678 | 34 Thank you!
I know model based clustering and two step clustering are more appropriate
for my data. For some reason, I can only use k-means or hierarchical
clustering to do finsih some demos...
PCA or FA is not preferred; actually we want to keep these many variables...
the
the
It |
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l******9 发帖数: 579 | 35 I am working on data analysis.
Given a group of data vectors, each of them has the same dimension. Each
element in a vector is a floating point number.
V1 [ , , , … ]
V2[ , , , … ]
...
Vn [ , , , … ]
Suppose that each vector has M numbers. M can be 10000.
n can be 200.
I need to find out how to partition the n vectors into sub-groups such that
each vector in one subgroup can be represented by a basic vector in the
subgroup.
For example,
W = union of V1, V2, V3 … Vn
Find subgroup i... 阅读全帖 |
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g****5 发帖数: 1639 | 36 “This idea forms the basis of a clustering procedure in which the number of
clusters arises intuitively, outliers are automatically spotted and
excluded from the analysis, and clusters are recognized regardless of their
shape and of the dimensionality of the space in which they are embedded.”
就看了这么多,我觉得trick就在如何定义outlier里面。本来classification和
outlier finding就是孪生问题,确定一个,另一个就是自然的结果。尼玛先把outlier
给定了,k-mean的k就确定了,一点不奇怪。 |
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C*******a 发帖数: 448 | 37 clustering:
K-means:
hierarchical clustering:
GMM:
Spectral clustering:
讨论一下吧,基本功。 |
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I********2 发帖数: 244 | 38 求教一下有关clustering的问题,
比如说10,000 pairwise 的数据的distance file是1Gb左右的大小,可以用hierarchy
clustering作出几百对非常reasonable的clusters (用numpy和R..)。 如果要scale up
e.g. 100,000 个数据点,光打开distance file这memory占用就过大了, 求教应该如
何处理?
多谢,多谢 |
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l***y 发帖数: 4671 | 39 如果在学校,可以使用公共资源啊。TACC 有公共云,目前接受测试用户,用户可以从
最底层开始配置,想玩什么都可以。要是单纯用cluster,在XSEDE上递交一个一页纸的
startup 申请,一周内就批准,五万个小时的计算时间,在联邦资助的计算中心任选
一个大型cluster,gpu cluster,大型并行文件存储资源,大家经常直接选美国最大的
超级计算机。
玩云或者并行或者大数据,玩的就是规模,或者说没有一定的规模,你根本接触不到核
心的技术问题。比如说玩基于云存储的并行计算,或者超大规模的并行计算,才能体会
到热门技术为什么能解决关键瓶颈。小打小闹,就像在河沟里研究几十万吨巨轮的核心
工艺问题,不现实。比如说如何使用ssd阵列来优化算法,自己怎么玩?TACC提供68个
并行读写服务器来实现lustre,解决并行读写瓶颈问题,这个规模上的并行算法,自己
在家里的机器上怎么学习体会? |
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r***o 发帖数: 1285 | 40 Explanation: Open clusters of stars can be near or far, young or old, and
diffuse or compact. Open clusters may contain from 100 to 10,000 stars, all
of which formed at nearly the same time. Bright blue stars frequently
distinguish younger open clusters. M35, pictured above on the upper left,
is a relatively nearby at 2800 light years distant, relatively young at 150
million years old, and relatively diffuse, with about 2500 stars spread out
over a volume 30 light years across. An older and more |
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E*V 发帖数: 17544 | 41 【 以下文字转载自 WorldNews 讨论区 】
发信人: EUV (???), 信区: WorldNews
标 题: US refuses to sign cluster bomb ban
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Dec 3 16:32:29 2008), 转信
92 others do
http://news.yahoo.com/s/ap/20081203/ap_on_re_eu/eu_norway_cluster_bombs
OSLO, Norway – An Afghan teenager who lost both legs in a cluster bomb
explosion helped persuade his country to change its stance and join nearly
100 nations in signing a treaty Wednesday banning the disputed weapons.
Afghanistan was initially reluctant to join the pact |
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X****i 发帖数: 1877 | 43
Factor Analysis <> Trait Cluster
意思和应用面不一样吧。
另外,我讨厌学术界倾向故弄玄虚,用意思模糊的名词。
至少 “Trait Cluster”是显意,即 Self-Explanatory。 |
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L******k 发帖数: 33825 | 44 http://www0.gsb.columbia.edu/students/organizations/clusterq/index.html
==============================================
Welcome to Cluster Q, Columbia Business School's LGBT community. Whether it'
s recruiting, awareness or socializing, Cluster Q has an active events
schedule every semester open to all MBA, EMBA and PhD students, faculty, our
alumni, students at other Columbia graduate schools and our straight allies
within the Business School. |
|
C**k 发帖数: 275 | 45 同一个 学校 同时有Cluster hiring and Department Hiring,
Cluster hiring 我的方向招聘的人也可能会安排在 这个系.
这样要不要都申请? |
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e*****s 发帖数: 273 | 46 菜鸟不是很懂,没有infrastructure,能自己弄两台tower来build个小cluster放在一
般的房间里么?
因为我有两个DELL PowerEdge,放在lab里,今天系主任咨询能不能帮忙settle个
Cluster啥的放在一间屋里给系里用。一头雾水中。 |
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w***g 发帖数: 5958 | 47 还不如去amazon ec2上跑。有不少超大的dataset Amazon已经host了,还省得自己下载
了。除非你真有那么多东西要一刻不停地算,ec2肯定是又省心又省钱。独立的HPC确实
省钱,你要是去supermicro买机器的话估计能比学校订购的价钱省一半。学校的话基本
上是给dell送钱。不过你得有一个像我这样的学生管理cluster才行,而且学生一玩上
cluster就不写paper了。 |
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x****n 发帖数: 405 | 48 上周结束了一个on site,排名很靠后的一个州立大学。第一次经历cluster hiring,
自己周围的朋友也没有类似的经历可以参考,所以写下来供大家参考,也顺便求bless。
申请的时候看到广告上写的是学院cluster hiring,没有具体到哪个系,但职位的描述
和自己研究方向比较吻合,就申了。
电面的时候就有点奇怪,先是两个和我专业不相干的人面了一把,聊的时间很短,只有
12分钟。电面完了,自己感觉不好,觉得肯定挂了,结果一周之后收到系里通知说要再
电面一次。这次电面时间很长,聊了差不多一个小时。聊完后,系主任又发e-mail让我
补充了一些技术细节。两周之后收到了on-site 邀请。
on site. 第一天下午,系主任到机场pick up,入住酒店后,和系主任以及另外两个
senior faculty一起吃晚饭。主要聊了聊自己的工作经历和研究方向,顺便聊了聊当地
的一些情况。
第二天早上,和系里一个新faculty吃了个早餐。吃完早饭后,首先和两个其他系的
associate head聊了半小时,主要聊了下和他们系潜在的合作和funding source。接下
来和两... 阅读全帖 |
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j*****e 发帖数: 128 | 49 谁来通知你不中要。我们很大程度上是search chair 在哪个系,就由哪个系到各个学
院/系协调。
我们一般candidate 来之前,各个系已经初步vote 这个人如果来的话,我们系会不会
要他/她,如果不要,基本上faculty 不会见面。如果要,那么系里尽可能多的老师参
加见面。所以,home department很重要。从你的行程也可以判断一二。
我们有些情况是,一个人可能有几个地方感兴趣,那么可能就会joint appointment 比
如,这个人onsite 之后,我们会vote 50% 还是100% with us. 但是,junior faculty
的话我们不倾向joint appointment。
我们去年一个cluster Hire 招了5个人,基本search committee 里的人人有份,各领
一个回家了。这是multiple position, 这种情况下委员会里politics 比较重要,但
基本上来之前,心里已经有数了,自己系会不会要,如果来的话. 另外一个cluster
hire, 是university level的director, on... 阅读全帖 |
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j****9 发帖数: 2295 | 50 【 以下文字转载自 Linux 讨论区 】
发信人: jack19 (jack), 信区: Linux
标 题: 问个mysql cluster的问题
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 8 14:33:58 2010, 美东)
Situation: You received SMS notification that your MySQL cluster management
server is unresponsive and the node management daemon refuses to start.
Outline the steps you would take to solve this problem.
这个怎么答呢? |
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