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全部话题 - 话题: crinept
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r*******e
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1
【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: reclapple (加菲鲸), 信区: Chemistry
标 题: 有人对2D-NMR比较了解嘛?
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jun 9 15:23:00 2010, 美东)
rt,看文献碰到这么一种谱。
[15N 1H]-CRINEPT-HMQC
全称是coherence relaxation enhanced polarization transfer(CRINEPT)
Heteronuclear Multiple Quantum Coherence (HMQC)
这个是用来解蛋白结构的。
我很不理解的是,怎么把每个cross peak 与相应的amino acid 对应起来?然后又怎么
能通过cross peak 强度位置来算结构呢?
r*******e
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2
来自主题: Chemistry版 - 有人对2D-NMR比较了解嘛?
rt,看文献碰到这么一种谱。
[15N 1H]-CRINEPT-HMQC
全称是coherence relaxation enhanced polarization transfer(CRINEPT)
Heteronuclear Multiple Quantum Coherence (HMQC)
这个是用来解蛋白结构的。
我很不理解的是,怎么把每个cross peak 与相应的amino acid 对应起来?然后又怎么
能通过cross peak 强度位置来算结构呢?
g*****n
发帖数: 36
3
每一个amino acid 在你说的CRINEPT 或HMQC谱图上对应一个cross peak,
这些只能给出蛋白的backbone信息,
如要解结构,这还远远不够,还得做很多3D实验。
另外也不一定用NMR,可以用X-Ray,
NMR灵敏度不太高,需要大量蛋白。
推荐一个NMR中文wiki
http://www.nmrwiki.cn
这里还有一个专业的NMR论坛
http://www.chinanmr.cn/forum.php
p****s
发帖数: 3153
4
你说得不对,他所说的CRINEPT-HMQC-TROSY是一个谱而不是几个。
我不太了解xray需要多少蛋白,不过做液相NMR就算是很大的蛋白我想几mg就够用了。
NMR和xray是互补的实验而不是相互竞争,真正做NMR的人也不会直接跟xray竞争。NMR
可以提供很多dynamics的信息,这是xray无法做到的;而且NMR可以做溶液里甚至是细
胞组织内的状态,而xray需要单晶(似乎也有用微晶的,我不懂了)。现在NMR已经发
展成了一个很强大的方法,通过single scan NMR,以后做real time估计都是可以实现
的。
从本质上来说NMR当然是不灵敏的方法,远没有其他光谱方法灵敏,但是我认为(当然
是我自己的观点)它能提供最接近生理条件的结构信息。“不用NMR也可以用xray"这说
法有点好笑,有些蛋白就长不出晶体,你怎么做xray呢,呵呵。当然NMR有分子量的限
制,要做大的体系首先还是应该考虑xray。我自己认为NMR是更有灵活性的方法,而且
就算解不出高分辨率的三维结构还是一样可以提供很多有用的信息。
g*****n
发帖数: 36
5
来自主题: Chemistry版 - 有人对2D-NMR比较了解嘛?
每一个amino acid 在你说的CRINEPT 或HMQC谱图上对应一个cross peak,
这些只能给出蛋白的backbone信息,
如要解结构,这还远远不够,还得做很多3D实验。
另外也不一定用NMR,可以用X-Ray,
NMR灵敏度不太高,需要大量蛋白。
推荐一个NMR中文wiki
http://www.nmrwiki.cn
这里还有一个专业的NMR论坛
http://www.chinanmr.cn/forum.php
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