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全部话题 - 话题: delta32
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w********2
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1
也就是说这货高效率的搞乱了ccr5这个基因,也不在乎你否和ccr5 delta32一样。如果
这样的话,他为啥选的切点和ccr5 delta32的缺失段的起点一样呢?完全可以随便找个
ccr5 frameshift中的点来切,然后让细胞自己乱修。
n**e
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2
来自主题: Military版 - 基因宝宝的核心秘密 (转载)
【 以下文字转载自 Detective 讨论区 】
发信人: nile (nile), 信区: Detective
标 题: 基因宝宝的核心秘密
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 30 01:53:07 2018, 美东)
就在一天之前,2018年11月28日,香港大学李兆基会议中心坐无虚席,中国科学家生物
物理学博士贺建奎在第二届人类基因编辑峰会上作了关于人类第一对基因宝宝诞生的主
题发言并回答了与会者的质问。让我们还是先从科学技术本身出发,去看看贺博士究竟
是怎样把基因宝宝编辑出来的。
首先尼罗河注意到贺博士所谓的道歉。很多人满心盼望着贺博士低头认罪。但是,贺博
士的道歉不是为成功创造基因宝宝的成就道歉。而是为将这一成就首先通过公共媒体发
布而非在专业平台发布对业内人士表示歉意。在尼罗河看来,这纯粹是为了争取科学界
对这一宏伟事业的支持而对他们表示尊重。这证明贺博士很懂得建立统一战线的重要性
。事实上,在决定针对CCR5这个基因进行胚胎编辑之前,他已经通过非公开方式与多位
基因操作的权威专家讨论过,在技术问题上获得了专业认同。
基因宝宝的医学需求和受试者的知情权
艾... 阅读全帖
o****g
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3
Although this is an EXTREMELY limited treatment option for the patients. (
CCR5-delta32 homozygosity is extremely rare in the population, not to
mention you need to match HLA as well, which is already VERY VERY rare) That
's why in the paper the authors actually announced that similar efforts for
other poz patients failed because they could not find a HLA-compatible donor
with the CCR5-delta32 homozygos alleles)
But we might be able to manipulate the patient's own hematopoietic stem
cells to int... 阅读全帖
w********2
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4
来自主题: Military版 - 叔来科普一下基因编辑
也就是说这货高效率的搞乱了ccr5这个基因,也不在乎你否和ccr5 delta32一样。如果
这样的话,他为啥选的切点和ccr5 delta32的缺失段的起点一样呢?完全可以随便找个
ccr5 frameshift中的点来切,然后让细胞自己乱修。
b********g
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5
来自主题: TrustInJesus版 - 我觉得神的设计是最完美的
CCR5-D32,基因突变造成的,并不是应对hiv的基因进化。这种基因突变造成细胞膜表面
receptor损伤。原本是不好的事情,却恰巧损害到hiv的binding site,因为病毒都是
bind在特定的receptor上才能进入host cell,所以hiv就不能攻击了。目前的理论是说,
这种基因突变是variola virus,造成smallpox的病毒引起的。
Up to 20% of ethnic western Europeans carry this mutation, which is rare or
absent in other ethnic groups.9–11 This suggests that the CCR5-delta32
mutation was strongly selected for sometime during European history. Some
researchers have proposed that the plague epidemics that repeatedly swept
Europe during the M... 阅读全帖
t********h
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6
贺某自己在基因编辑峰会上公布的结果
https://m.weibo.cn/status/4311271006839536?

查了贺某的所谓测序结果,气得睡不着。

上半部分应该是胚胎1、胚胎2“可能脱靶区域”的测序结果,“无证据”、“低证据”
。什么个低法?这么敷衍的写几个基因,你吹上天的全细胞测序呢?

下半部分无疑是CCR5的区域,excuse me? 这个根本不是CCR5 delta32基因型啊,根本
没有“柏林病人”的抗艾能力好吗?

1号胚胎(1号女婴)应该是贺某嘴里的“杂合子”了。(是的把活生生的人用这种术语
称呼非常不正确,但我也没办法。)1号女婴缺失了15个碱基对,编译氨基酸182-186(
序列HFPYS)。这个刚好在是膜外的关键linkerECL2上,不仅是HIV病毒gp120结合位点
,也是很多趋化因子结合位点。然而截短5个氨基酸后(即使是在linker)的膜蛋白会
不会正常折叠上膜?何况是杂合体,女婴体内突变蛋白量到哪个程度?这会对人体造成
什么影响??

2号胚胎是两个不同的移码突变。这既不是CCR5 delta 32的基因型,也不是纯合子。如
果... 阅读全帖
t********h
发帖数: 456
7
https://m.weibo.cn/status/4311271006839536?
查了贺某的所谓测序结果,气得睡不着。
上半部分应该是胚胎1、胚胎2“可能脱靶区域”的测序结果,“无证据”、“低证据”
。什么个低法?这么敷衍的写几个基因,你吹上天的全细胞测序呢?
下半部分无疑是CCR5的区域,excuse me? 这个根本不是CCR5 delta32基因型啊,根本
没有“柏林病人”的抗艾能力好吗?
1号胚胎(1号女婴)应该是贺某嘴里的“杂合子”了。(是的把活生生的人用这种术语
称呼非常不正确,但我也没办法。)1号女婴缺失了15个碱基对,编译氨基酸182-186(
序列HFPYS)。这个刚好在是膜外的关键linkerECL2上,不仅是HIV病毒gp120结合位点
,也是很多趋化因子结合位点。然而截短5个氨基酸后(即使是在linker)的膜蛋白会
不会正常折叠上膜?何况是杂合体,女婴体内突变蛋白量到哪个程度?这会对人体造成
什么影响??
2号胚胎是两个不同的移码突变。这既不是CCR5 delta 32的基因型,也不是纯合子。如
果这就算“成功”,那搞生物都失业好了。
这不是一次对基因剪... 阅读全帖

发帖数: 1
8
你们不知道吧。
只有白人才有ccr5 delta32突变。

发帖数: 1
9
来自主题: Military版 - 贺建奎基因编辑并不成功
转自微博:
UMass做CRISPR的教授Ryder公布了部分GeneEditSummit会议贺建奎所披露的数据,从纯
粹基因编辑的角度让人担忧的是,基因编辑并不成功。
娜娜有两个被编辑的CCR5单倍基因突变体,Ins1和Delta4(为了避免Mosaicity),
Ins1有11个与野生型(WT)完全不同的氨基酸序列,这11个氨基酸也是比经典
CCR5delta32多出来的;Delta4比Delta32多了9个氨基酸,但9个氨基酸序列也和WT完全
不同,也就是说在不考虑脱靶和其他技术威胁的情况下,娜娜每个单倍体CCR5基因被编
辑了完全非自然的CCR5基因。目前尚不知道这对发育意味着什么,因为这两种CCR5突变
从来没有过动物模型甚至没有细胞系研究。这样的突变可能造成显性基因隐性化,或基
因获得新功能,甚至发生机体形态学变化。当然,更不要说脱靶的危害。
而露露并不是CCR5delta32,从所披露的数据来看只有一个单倍体CCR5 WT被随机删除了
15个碱基对(5个氨基酸),和CCR5delta32几乎完全不同。而另一个单倍体基因数据他
并没有公布。所以贺说他进行了测序后确保序列无误... 阅读全帖
a******g
发帖数: 71
10
他可以说切点上游部分得以保留,至少不会得到一个null allele,完全失去功能。当
然了,现在新多出来的这几个氨基酸会有什么影响也不好预测。
s**t
发帖数: 17016
11
有些基因,切掉起始端对最后的功能影响不太大。因为初始的基因,翻译成蛋白的氨基
酸之后,往往在蛋白折叠后被包裹在内部。也就是这部分主要是起的建筑作用,而不是
功能作用。多一点少一点,影响是有的,但不是那么大
不少蛋白,被翻译出来之后,自己会通过修饰将一部分内部的氨基酸链切掉
a******g
发帖数: 71
12
切点在起始端的意义是造成一个特别早的frameshift然后几乎整个蛋白都没了。
s**t
发帖数: 17016
13
不大可能整个蛋白都没有了。贺的基因编辑,和那个北欧突变比起来,改动算小的。最
后造成的影响,应该也没有北欧突变的大
n**e
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14
【 以下文字转载自 Detective 讨论区 】
发信人: nile (nile), 信区: Detective
标 题: 基因宝宝瓜熟蒂落,中国政府何去何从
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Dec 5 12:22:07 2018, 美东)
基因宝宝健康出生,经过基因“深度测序”证明 CCR5被成功编辑。没有发现任何不应
该发生的基因改变。尽管贺建奎博士宣布的结论还有待第三方独立查证。尼罗河相信贺
建奎的测序结果一定是准确的。既然他在单细胞全基因组测序技术上可以独执牛耳,“
深度基因测序”更不会应该出现任何偏差。不论贺建奎冲破了多少红线底线高压线,在
整个实验过程中不得不严格采取保密方式,贺建奎从动物实验,胚胎细胞体外实验,胎
儿基因组监测,直到新生基因宝宝的“深度测序”,客观结果不会以人的意志而改变。
科学的最高道德准则是忠于事实。就凭这一点,贺建奎比那些伪造数据的科学家,歪曲
事实的造谣精们高尚不知多少倍。最新的谣言是一个在未名空间上发帖的“按摩郎”炮
制出来的,他说“双胞胎的DNA序列公布后,现在已经证实他这次不仅脱靶,还打偏了
不少基因序列”。“脱靶”与“打偏了不... 阅读全帖
o****g
发帖数: 657
15
I guess I'm a bit more imaginative.
why don't we just extract the hematopoietic stem cells from the patient,
introduce the delta32 mutation with homologous recombination (this is tricky
because you need to introduce dthis mut on both alleles, which I don't know
is achievable yet) and put the damn thing back to his own body? you don't
have to worry about the HLA compatibility at all.

现在我只希望有医院能重复出这个结果,
光是一个例子,还指不定是怎么回事呢。
白细胞抗原配型,用骨髓库的方法,虽然很难,
但是世界范围内也已经有很多人找到配型。
CCR5-Δ32在欧洲裔白人里面大约10%。
如果是一个白人,这个... 阅读全帖
n****o
发帖数: 2339
16
来自主题: Minnesota版 - 艾滋病毒感染终于可以治愈了
应该是10%左右的白人。查ccr5 delta32突变,不是什么新发现。东亚人黑人里面基本
没有。
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