c***s
发帖数: 70028 | 1 前不久，意大利考古学家声称，他们在佛罗伦萨一座女修道院下面找到了可能是达?芬奇名作《蒙娜丽莎》人物原型的头骨，目前正试图提取DNA并重建此人的面容。
众所周知，DNA分子涵盖了生物遗传所需要的几乎所有信息，研究者早已发现头色、肤色、有无雀斑，眼耳口鼻的大小位置都是由基因决定的。但是以目前的技术水平，直接反映面容特征的DNA信息是零碎和不完整的。
令人惊喜的是，科学家将利用统计学手段研究人类的多个基因和面部特征的关系，一张脸将被定位成231个数据，而这231个数据都一样的两张脸是几乎不可能存在的。如此，我们便有望建立DNA信息决定面部特征的模型。
DNA虽然为法医鉴定提供了极大的便利，但是事实上，德国、比利时以及美国的印第安纳州和怀俄明州明确规定了该手段的非法性。毕竟DNA推断仍可能百密一疏，更何况DNA信息的本质涉及个人的隐私问题。
据英国《每日邮报》5月19日报道，由意大利考古学家希尔瓦诺?文塞提（Silvano Vinceti）教授所领导的团队日前在佛罗伦萨圣厄休拉修道院遗址下面的地窖中挖掘出了一副头骨，目前正试图提取DNA并重建此人的面容。此人的遗体如此受到重视的原因在于她或许就... 阅读全帖 |
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l***d
发帖数: 1828 | 2 http://www.dfdaily.com/html/8755/2011/5/14/604774.shtml
作者 李福洋 来源:东方早报
DNA 储存在细胞核内，生物体在死亡过程中，细胞会逐渐发生自溶，大量酶类如蛋白酶
、DNA酶等释放，细胞的DNA很快会被降解，即便是细胞没来得及自溶，但是天长日久，
微生物进驻组织或细胞，就像寄居蟹一样，在那里吃喝拉撒、生老病死，它们产生的酶
类也会把原细胞内的DNA破坏掉，一般死亡的动物和人的遗体，DNA很难完整保存下来。
最终技术的进步打破了这个咒语，研究人员成功地获得图坦卡蒙的DNA，也成功地得到
了各个木乃伊的DNA指纹图谱。
古埃及法老（国王）的尸体都被做成木乃伊，保存在金字塔里，据传说，冒犯了法老王
的干尸，就会中法老的咒语。在美国电影的渲染下，这个咒语被传得充满玄机，神秘莫
测。似乎在埃及北部第六代塞加拉王朝的法老墓外，或内侧出现类似“咒语”的文字，
据说也只是针对祭司的，好让其尽职保护墓地，而非防盗墓贼设定的神秘“咒语”或机
关。考古学家其实并未在法老墓内发现任何咒语。
既然法老的咒语不一定有，那也就不存在打破一说。不过，法老... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 3 夏荣辉，李江
上海交通大学医学院，上海（200011）
E-mail：e******[email protected]
摘 要：基因的表观遗传学修饰正越来越受到人们的重视，它包括DNA甲基化和组蛋白修
饰，组蛋白修
饰又包括组蛋白乙酰化和组蛋白甲基化。基因的表观遗传学改变在基因转录调节方面有
重要作用。最
近研究较多的是多种组蛋白修饰方式和DNA甲基化在基因转录调节方面的共同作用，本
文详述组蛋白
修饰和DNA甲基化的发生机制，并且总结了组蛋白乙酰化和组蛋白甲基化与DNA甲基化之
间的相互作
用，提示不同位点的组蛋白甲基化与DNA甲基化共同作用于基因转录，并且发挥不同的
作用，具体体
现在组蛋白乙酰化、组蛋白H3K9、H3K27和H4K20甲基化与DNA甲基化协同作用，使基因
发生转录抑
制，而组蛋白H3K4甲基化与基因转录激活有关。
关键词：组蛋白修饰；DNA甲基化；关系
1. 引 言
目前，在研究肿瘤发生发展的过程中，基因的表观遗传学修饰所起的作用日益得到人们
的重视。组蛋
白修饰和DNA甲基化是两种最重要的表观遗传学修饰方式。研究表明，人类几乎所有类
型的肿瘤都存
在组蛋白及DNA甲基化的异常... 阅读全帖 |
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G******e
发帖数: 9567 | 4 DNA Deoxyribonucleic Acid
DNA Department(al) Network Administrator
DNA Does Not Apply
DNA Genentech, Inc (stock symbol)
DNA Did Not Attack (Dana Carvey)
DNA Did Not Attend
DNA Designated National Authority
DNA Do Not Ask
DNA Did Not Answer
DNA Data Not Available
DNA Defense Nuclear Agency
DNA Directia Nationala Anticoruptie (Romanian)
DNA Do Not Answer (cell phone)
DNA Do Not Approve
DNA Distributed interNet Applications
DNA Digital Network Archite... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 5 目前表观遗传学(Epigenetics)通常被定义为基因表达通过有丝分裂或减数分裂发生了
可遗传的改变, 而DNA 序列不发生改变[1, 2]。表观遗传学的机
制主要包括DNA 甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA。DNA 甲基化(DNA methylation)是指
在DNA甲基转移酶(DNA-methyltransferases, DNMTs)的催化下, CpG 二核苷酸中的胞嘧
啶被选择性地添加甲基, 形成5-甲基胞嘧啶[3, 4]。DNA 甲基转移酶有两种, 其中
DNMT1 主要起维持甲基化的作用, 能使半甲基化的DNA 双链分子上与甲基胞嘧啶相对应
的胞嘧啶甲基化, 可参与DNA 复制双链中新合成链的甲基化[5]; 而DNMT3a 和DNMT3b
主要起形成甲基化的作用, 能在未发生甲基化的DNA 双链上进
行甲基化[6]。DNA 甲基化一般与基因的沉默相关,DNA 去甲基化则与基因的活化相关[7
~9]。
组蛋白修饰(Histone modifications) 是指组蛋白的基础氨基末端尾部突出于核小体,
常在转录后发生变化, 包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等翻译后的修饰... 阅读全帖 |
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i***s
发帖数: 39120 | 6 “如果有一个盗窃案发生在北京，是不是要采北京几千万居民的血来比对呢？”肖承海问。
鉴于采血可能对公民权益造成的侵害，杨立新认为，“任何人都可以拒绝强制采集。”
只为揪出学生宿舍里的小偷，山东滨州学院五千多名本科男生全部被采血验DNA。
一位公安系统内部人士向南方周末记者表示，在高校中这样大批量大规模采集普通学生DNA信息，他“从没听说过”。
“用棉签擦擦手指，拿了一根小针扎了一下，把血滴到一张纸上，就完了。”该校政法系一位大三男生说。
但有学生比较敏感：这算不算泄露了隐私？
“安静，不要说话”
采集学生DNA的消息最早出现在滨州学院的百度贴吧上。2013年9月18日晚，“yinbb0”首先发帖：“学校通知明天采集DNA信息，求解释”。
南方周末记者获得该校中文系学生科当天发出的一条飞信通知：“各班班长注意，按照学校和公安局安排，明天下午咱们系所有男生参加DNA抽检备案，要求所有男生务必明天下午2：20在一教308门口集合，所有男生都参加，若不参加者将造成不必要的麻烦。”
其他各系的通知内容也大同小异，均强调是“公安局统一安排”、“以班为单位集合站队，组织好”、“无特殊情况不要缺席”等等... 阅读全帖 |
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H********g
发帖数: 43926 | 7 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: gc01 (gc01), 信区: Military
标 题: 加州理工助理教授钱璐璐发明可分拣运输的DNA机器人，每走一步6纳米zt
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Sep 16 21:58:41 2017, 美东)
华裔女科学家发明可分拣运输的DNA机器人，每走一步6纳米
澎湃新闻记者 王盈颖
2017-09-17 07:55 来源：澎湃新闻
字号
DNA机器人是如何“行走”的（示意） 视频来源：美国加州理工大学(00:17)
一条腿，两只脚，一条胳膊，一只手，身高仅20纳米的DNA机器人正在工作。
它每迈一步的距离是6纳米，是人类步长的亿万分之一。别看这一步，DNA机器人需要5
分钟来完成。遇到目标“货物”时，DNA机器人的“手”会抓起，将其放至目的地。
上述的场景已经变成现实。当地时间9月14日，美国加州理工大学助理教授钱璐璐的实
验室在《科学》杂志发文，介绍了这一具有分拣功能的DNA机器人，其递送货物的成功
率为80%。
“就好像电子机械机器人被送到火星等太遥远而人类不能及的地方，我们希望有一天可
以将分子机... 阅读全帖 |
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d******a
发帖数: 32122 | 8 原文开头====之间的部分怀疑是贴主夹带的私货，可能不是正文附带的部分。
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各地父系汉血统排行：中原官话90，兰银官话区及秦晋方言区85，北方官话区80，羌族
（炎帝系统）80，江淮人70，北吴人65，广府人及西南官话60，闽南，闽北，藏（炎帝
）朝鲜，赣人50，湘人45，客家，内蒙，满人，韩国40，大和族30，新疆 外蒙古10
父系越人血统排行：广府，闽南，南吴40，闽北30，赣人，韩国，日本20，江淮人15，
客家，北吴，满族，朝鲜10，辽胶官话区6，北京-东北官话区4
父系苗瑶血统排行榜：湘人，客家30，赣人20，南北吴，闽北，江淮，西南各10
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世界多个国家的科学家们正在合力完成一项庞大的人类寻根计划，希望通过研究人
类基因的变异来绘制出一幅『人类迁移图』。
中国科学家的研究表明，中国人的祖先源于东非，经过南亚进入中国。这支南亚先民经
过多次迁徙及体内基因突变，逐渐分化成为各个民族。
按科学家的观点，... 阅读全帖 |
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d*********p
发帖数: 1531 | 9 同仁堂：DNA检测不适用于阿胶
法制晚报 03-18 19:41
针对消费者曾先生从同仁堂一款阿胶产品中检测出猪和牛的DNA，未检测出驴的DNA事件
，同仁堂回应称，未检测出驴的DNA是正常现象，因为DNA检测方法根本就不适用于阿胶
产品，对阿胶成分的检测应该用中国药典中的“特征肽链方法”检测。
事件回放消费者送检 质疑同仁堂阿胶造假
据报道，2015年2月，深圳的曾先生先生花了3604元，在深圳市宝安区海雅缤纷城内北
京同仁堂专柜，购买了数盒产品成分中注明含有驴皮的北京同仁堂食用阿胶（纸盒版）
。今年1月11日，他自费向深圳市计量质量检测研究院送样检验了该款食用阿胶，检验
报告显示，产品中检出牛、猪DNA成分，并未检出驴、马DNA成分。
曾先生认为：“这个检验结果，只能说明这是假阿胶！是欺骗消费者。”随后，曾先生
联系到了深圳电视台。深圳市食品药品监督管理局宝安分局也前往该同仁堂专柜开展调
查。
厂家回应为什么检测不到驴的DNA？
那么，是不是未检测出驴的DNA，就说明阿胶产品中不含驴皮成分？药学博士、同仁堂
总工程师田瑞华介绍，驴皮在长时间熬制中降解，检测不到驴的DNA是正常... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 10 据美国有线电视新闻网(CNN)报道，美国只用了几个小时便证实1日在巴基斯坦首都附近一座建筑内击毙的男子就是恐怖大亨奥萨马·本·拉登(专题)。他们如何得知这具头部中弹的尸体就是世界头号通缉犯呢？高级官员在接受美国有线电视新闻网(CNN)采访时给出的答案是：DNA检测比对以及其他手段。
据一名高级官员透露，官员们将在阿伯塔巴德地区击毙的男子的DNA与本·拉登家人的DNA进行比对，最终确认这名男子就是“9·11”恐怖袭击的策划者本·拉登(专题)。现在仍不清楚官员们拥有多少本·拉登家人的DNA样本，或者这些样本来自于哪些人。在2日下午召开的一场新闻简报会上，奥巴马总统的国土安全和反恐顾问约翰·布伦南表示，他们在此次突击行动前就已经获得“初步DNA情报”。官员们指出，在这座建筑击毙的5人中，有一人是本·拉登的儿子。
除了使用DNA鉴定尸体外，官员们还借助可视信息进行身份确认。官员们说，他们进行了照片比对并采用其他面部识别手段。此外，他们还对尸体的面部和身体特征进行了彻底的生物统计分析。美军DNA鉴定计划开拓者、法医病理学家维克托·维德恩表示，美国军方掌握了一些类似本·拉登这样的恐怖组织头目的 D... 阅读全帖 |
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b********g
发帖数: 46 | 11 听胖头鱼老师的言论挺有意思，受启发了。
之所以发这篇帖子是突然发现自己对分裂间期DNA的结构存在误解。此处省略283字。
从体积而言，细胞完全没有必要compact DNA，细胞核有非常充足的空间容纳DNA；从长
度而言，细胞核短了些，所以，细胞核需要folding DNA. 细胞自然是需要提供这些辅
助DNA folding 的蛋白供我们研究的。folding 过程中一个很重要的过程是DNA 的折叠
（bending etc)，一根长长的DNA需要打很多很多的折子（每个折子长约数微米）才能
容纳于细胞核。细胞想了想，打太多折子并维持着，似乎很费力，加点核蛋白 （
histone）吧，虽然增加了体积 （增加体积了也不是什么坏事啊，根据万有引力定律，
信号分子从核孔进来，更容易找到DNA)，但是折子的数目就减少很多了。每个折子之间
加些蛋白 （CTCF, SMC, cohesin etc)来固定下，形成了3C热爱研究的DNA looping。
同一侧的折子上的DNA，也许可以相互作用，就是promoter-enhancer 相互作用了。 同
一侧的折子上的某些基因不需要表达了，直接加些H... 阅读全帖 |
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l********n
发帖数: 260 | 12 美国科学家克雷格·文特尔协助破译了人类基因组，创建了第一个合成细胞，并在海洋
中遍寻新的基因组，可谓合成生命学研究先驱。有着“科学狂人”之称的他，现在又把
目光瞄准了火星。
据《新科学家》杂志网站报道，在日前于纽约举行的连线健康研讨会上，文特尔描述了
向火星派遣一个由机器人控制的基因组测序仪，以对火星上可能存在的外星生命进行基
因组测序的计划。他不是第一个提出这种想法的人，但这类任务成功的可能性有多大？
文特尔的计划将如何实施？
简单来说，他要将机器设备送往火星，这些设备可以自动翻检火星土壤，将任何可能找
到的微生物从中分离出来，为其进行DNA测序，然后将数字化的结果传回地球。利用这
些结果，科学家可以创造一种人工合成的来自火星的基因组版本，进而在地球上重塑火
星生命，轻而易举就解决了将样品带回地球的实际困难。
计划进展如何？
多年来，文特尔一直在尝试从海洋中搜寻DNA，并已经获得了一些有趣的结果。在此次
研讨会上，他表示，相关的技术正由他的研究团队在加利福尼亚州莫哈韦沙漠中选取的
一处与火星环境类似的地点进行测试，以此作为开启火星生命测序任务的前奏。美国国
家航空航天局（NASA）的... 阅读全帖 |
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i***s
发帖数: 39120 | 13 曹操家族DNA确定 破解曹操身世谜团
铁岭、东港两地，都有曹操的后人！
昨日，复旦大学历史学和人类学联合课题组宣布，已经完全确定曹操家族的DNA，目前已找到9支曹操后人(其中6支有家谱记载)，分别来自安徽绩溪、安徽舒城、安徽亳州、江苏海门、广东徐闻、江苏盐城、山东乳山、辽宁东港、辽宁铁岭。
围绕曹操及其家族的身世、遗传之谜也随之逐步破解。目前可以确定，曹操并非汉代丞相曹参的后人，也并非从夏侯氏抱养，这两大历史传言均有误。曹操之父，实际来自家族内部过继。
采集79个曹姓家族血样 梳理258个家谱
本次联合课题组由复旦大学历史系教授、中国魏晋南北朝史学会副会长韩昇和复旦大学现代人类学教育部重点实验室李辉教授领衔，研究时间已有三年的时间。
2009年，河南省安阳市对外宣称发现曹操墓。此消息一出即引发轰动，同时也引发争议。随后，复旦大学人类遗传学实验室宣布，拟用DNA技术开展对曹操家族DNA研究。曹操本是生活在2000年前的历史人物，寻找他的DNA似乎遥不可及。课题随即开始另辟蹊径：能不能用现在人的基因反推曹操的基因，从而破解曹操的身世之谜呢？
要把曹操后人与2000年前的曹操进行“亲子鉴定”... 阅读全帖 |
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N*******e
发帖数: 3872 | 14 你的说法对常染色体、X染色体和一小部分Y染色体是对的。
分子人类学所用的Y-DNA，是Y染色体上不重组的那部分，当然Y染色体也只有一小部分
是跟X染色体发生重组的。因为不重组，所以Y-DNA是整个遗传的，不存在一个人的Y-
DNA的一部分属于一个男人，另一部分属于另一个男人的情况。Y-DNA是严格父系遗传的
。所有携带某个特定突变的男人的Y-DNA，一定有一个共同的男性祖先，他们的Y-DNA就
遗传自这个祖先。按此推论，走出非洲的所有男性人类都有一个共同的男性祖先，这就
是人类进化史上的所谓“亚当”。
同样的，每个人体内的线粒体都来自母亲，只有女儿的线粒体能遗传下去，因此人类的
线粒体是严格母系遗传的。所以存在一个所有人的共同的老奶奶，也即“夏娃”。按现
在分子人类学的计算，“亚当”和“夏娃”不同时，差了好几万年。因为父系和母系遗
传的速度不一样。当然现在有说法认为父亲体内的线粒体也可能有极小的机会进入受精
卵，但这个概率太小，根本不可能实现代代传递，在以万年为尺度的人类进化史上，影
响也是微乎其微的。
但是Y-DNA和线粒体只占整个人基因组的极小部分，人类基因组3个billion的字... 阅读全帖 |
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a**u
发帖数: 8107 | 15 ☆─────────────────────────────────────☆
WaiChi (WaiChi) 于 (Wed Nov 4 20:11:57 2009, 美东) 提到:
DNA 与丑化上帝
现在dna这么进步, 甚至都已经开始了纯人工生命了.
假设, 科技在已经成熟到, 可纯人工生命, 任意造出一个和人类自己
一样完美功\能的人之时, 而科学家们, 却 "刻意" 依照自己, 去做出一
大堆功\能残缺不全的又弱智的残癈人, 然后给他们有限的土地居所,
及生存条件, 科学家们亦向他们表达, 我爰你们, 如你们 "服从" 我,
"感谢" 我, 我就给你们好一点的生存条件及生活环境, 但当然我令
你们永不死, 也永远功\能残缺不全弱残癈.
如果真有任何科学家如上如此玩, 人人肯定骂到他猪狗都不如.
而所谓基督教之神用同样模式, 宣称神有一切大能, 上帝说有就有了,
神爱世人, 神依照自己去做出人, 但却 "刻意" 做出功\能永远缺不全又
弱智, 并使其永不死, 也使其永不能等同上帝的人.
如以上帝之智及其大能, 对比上帝所造出之人, 及和如上科学造人对
比, 则上帝所... 阅读全帖 |
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s*k
发帖数: 144 | 16 排骨, 以下是对您以上的关于DNA拓扑异构酶文章背景知识的一点补充.
对于DNA,当其处于正常生理溶液环境时,每隔10对碱基即大约3.4nm
DNA分子旋转一周(这是1953 Watson and Crick最重要的发现,即DNA的双螺旋).
多于此(每少于10对碱基即互旋360度)的在生理溶液环境下的DNA称之为超螺旋
(supercoil), 少于此的叫欠螺旋,两者在生理溶液中均具有张力(物理里是不是称
其为具有较高自由能?), 对于此,DNA拓扑异构酶使其回复到张力较低的状态是不
需要外能的, 即不消耗ATP, 而DNA拓扑异构酶使DNA达到高张力的状态是需要
外能的(消耗ATP).
在一般生物体中的DNA是处于超螺旋状态,它使DNA两条链缠得更紧, 而在DNA复制或
转录的时候,DNA拓扑异构酶使其解螺旋到常态或欠螺旋状态.
一般从生物里提取的genome DNA是处于常态,但病毒或质粒的DNA常是超螺旋态.
以上讨论均指B型DNA,另外还有A型和Z型DNA,三链DNA,这些是DNA分子在不同
溶液环境下的自然状态,螺旋数与B型不一样.
有两本书值得推荐:
Cantor, C. |
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d******a
发帖数: 32122 | 17 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: didadida (滴滴嗒嗒), 信区: Military
标 题: 追踪八代前“生物密码”： 15年后父系DNA锁定色狼真凶
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Aug 27 21:09:58 2016, 美东)
生物技术还是迟了，如果是15年前，就肯定死刑了
现在凶手得以活命
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追踪八代前“生物密码”： 15年后父系DNA锁定色狼真凶
2016.1.12来源：中国女网
15年前，河南省长葛市的17岁女孩刘颖在下夜班返家途中，被人强奸致死。案情发生后
，警方在女孩的下身提取到了嫌疑人遗留的精斑，但因为周边人员复杂等原因，一直无
法破案。然而15年后，随着生物物证——DNA技术的不断成熟和完善，案情却突然出现
了神奇的转机——
1999年5月8日，对于河南省长葛市市郊居民刘高远来说，是个“黑色”的日子:这天早
上，他年仅17岁的宝贝女儿刘颖在下夜班返家途中遇害了!
原在长葛市通达纺织厂上班的刘颖，由于单位实行“三班倒”的作息制度，经常加班到
12点... 阅读全帖 |
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g***j
发帖数: 40861 | 18 【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: Terabyte (TBT), 信区: Joke
标 题: 80%的美国人支持“强制性标识含DNA的食物"
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 20 22:39:51 2015, 美东)
DNA和转基因：一个结果让人啼笑皆非的调查
环球科技观光团 发表于 昨天19:09
（Paradoxian，Olak/编译）俄克拉荷马州立大学农业和经济系最近开展的一项民意调
查显示，有80%的美国人支持“强制性标识含DNA的食物”，这一比例基本和支持对“用
基因工程生产的”转基因食品（GMO foods）进行强制性标识的比例一致。俄克拉荷马
州立大学的经济学家杰森·勒斯克（Jayson Lusk）也在自己的博客中介绍了此次调查
的更多细节，与上述两个问题在同一系列的问题还包括是否支持“对含糖汽水征税”，
是否支持“禁止销售大麻”等等。
图示受访者对一系列“政府政策”所持的支持（蓝色）或反对（红色）态度分布。其中
倒数第三和第四项分别为“强制性标识用基因工程生产的食物”和“强制性标识含DNA
的食物”。图片来源：agecon.okst... 阅读全帖 |
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f***y
发帖数: 4447 | 19 https://tech.sina.com.cn/d/f/2019-07-19/doc-ihytcitm3069024.shtml
今天凌晨，最新一期《科学》以研究长文的形式在线发表了中国工程院院士、南开大学
校长曹雪涛课题组的论文。
据论文报道，课题组发现了机体感知与甄别入侵病毒DNA的一种新型天然免疫识别
受体，被称为hnRNP-A2B1的该受体分子，能够在细胞核内特异性地识别病毒DNA，随后
激活天然免疫信号通路和诱导干扰素产生，启动天然免疫应答反应以清除DNA病毒的感
染。
该工作开辟了天然免疫与炎症研究领域的新方向。
突破“禁区”
免疫，是一种重要生理功能，机体依靠这种功能识别“自己”和“非己”，破坏和
排斥入侵的病毒等病原物质，维持自身稳定。
经过多年探索，科学家们在识别外源病原体DNA的分子机制及其抗病毒免疫研究上
取得长足进展。
目前发现的能够识别病毒DNA的天然免疫受体都存在于细胞质中。
例如，2013年，《科学》报道了华人科学家陈志坚团队的重大发现—— 一种被称
为cGAS的蛋白能够识别细胞质里的病毒DNA。
不过，绝大多数DNA病毒感染宿主细胞后会进入细胞核内释放... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 20 最近做一个DNA damage的实验，就是用H2O2来诱导Hek细胞基因组oxidative damage；
然后用FPG这种能识别8-oxoG的酶来切，被切的基因组位点会产生nick，阻碍PCR
polymerase，基于这样的原理做qPCR定量来研究某段序列对于oxidative damage的反
应。
好像这种做法比较少见，大部分DNA damage的研究都是global的。但也有很好的先例比
如：
http://www.nature.com/nature/journal/v429/n6994/abs/nature02661.html
这篇经典的Nature 文章
我按照这篇文章的做法，把genomic DNA进行FPG overnight digestion （DNA+FPG+Neb
buffer+BSA），同时也做了mock control（DNA+水+Neb buffer+BSA），然后qPCR发现
Ct如下：
DNA：25
DNA+FPG+buffer：28
DNA+水+buffer： 28
让我惊讶的是，相比于纯DNA，mock control的DNA+水+buffe... 阅读全帖 |
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s********n
发帖数: 26222 | 21 【 以下文字转载自 Military2 讨论区 】
发信人: smokinggun (硝烟), 信区: Military2
标 题: 从本拉登的DNA谈起,CIA隐秘的DNA收集计划
发信站: BBS 未名空间站 (Fri May 25 10:06:58 2012, 美东)
巴基斯坦判了为CIA收集本拉登家庭DNA的牙医30年监禁，因为DNA最终判定了那个地方
就是本拉登的藏身之处，此事突出了DNA科技在重大事件和人物追踪中的关键作用。内
部消息称CIA有针对世界各国领袖的隐秘DNA收集计划，特别是潜在敌国如中国俄罗斯政
治要人部队高官家属的DNA。 就目前来说，中国共产党各大重要家族，包括叶剑英，邓
小平，李鹏，江泽民，朱镕基，姚依林，习近平等人的DNA信息，美国通过其直系血清
留美家属的血样，已经部分掌握，直系下一代血清和其本人将有二分之一的准确性。中
国部队高官直系家属，军长级别以上的直系血清DNA也在收集之列。世界其他各国的领
袖高官之家族DNA，如印度，俄罗斯，伊朗等国家领袖家族DNA，通过其留美血亲，都在
收集之列。当然，不排除从各国政要在美国访问的过程中，直接从其粪便排... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 22 实验室工作人员演示DNA检测比对的有关情况
今年6月30日，岐山县一个女孩被邻居性侵后杀害，警方抓获了犯罪嫌疑人张大（化名）。可他还有一个同卵双胞胎弟弟，两人的DNA检测结果完全一致。兄弟俩谁是真正的凶手？一时间难住了当地警方。近日，他们的DNA样本被送到位于西安的第四军医大学DNA分型研究中心，在这里真凶浮出水面。
警方技术手段难区分案件一度陷入僵局
“刚开始接到的是这个女孩失踪的报警，我们是按照被拐卖来立案调查的。”岐山县公安局副局长李红旭说，他们最终根据线索找到了嫌疑人张大。警方在现场发现了犯罪嫌疑人张大作案的痕迹，张大对此供认不讳，尤其是现场遗留物中，经检测和张大的DNA完全一致。
案件侦破完毕后，警方将案件移交检察院，但检察院在审理案卷后，发现张大还有一个同卵双生的弟弟张二（化名），两家的房子也紧挨着，而且兄弟俩的DNA检测结果完全一致。那么此案中，张大的弟弟有没有参与？真凶到底是张大还是张二？如果对张大提起公诉，就必须要求排除张二作案的可能。今年9月，岐山县检察院要求县公安局对此案补充侦查。
“我们也有法医，也有DNA检测手段，但是他们弟兄俩是同卵双胞胎，DNA链完全一致，... 阅读全帖 |
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R****a
发帖数: 6858 | 23 美国大规模调查华人血样DNA
文/江南独立记者
（邮箱：d*******[email protected]，欢迎对此事关注的人士提供线索、建议或帮助）
在美国洛杉矶华人聚集区之一的蒙特利公园市，一项眼科健康调查（CHES：CHINESE
AMERICAN EYE STUDY）正在华人社区中展开。
奇怪的眼科检查
在美国定居多年的华人王丁（化名）参与了这项调查，现在他开始为这个调查感到百思
不得其解：“说检查眼睛为何要获取我的血样和DNA？”。
这一切要从9月说起，王丁当时接到CHES工作人员的电话，征询他是否愿意参加这项眼
科健康调查计划。60多岁的王丁眼睛不太好，当他看到这样的免费服务，而且又是当地
一家有名的眼科医院检测，他满口答应下来。
在当地，眼科检查至少要收取65美元的挂号费，如果再加一些眼科治疗，费用可能在几
百美元甚至上千美元，王丁说：“CHES不仅不收费，而且还承诺25美元的车马费。”对
很多像王丁这样的普通华人来说，这是一个诱惑。
王丁在电话里答应检查后，调查组的工作人员来到王丁的家里，对王丁的年龄、遗传病
史、疾病既往史、赴美时间等详细信息一一记录，这些资料都被输入到工作人员随身携... 阅读全帖 |
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S********6
发帖数: 1264 | 24 美国大规模调查华人血样DNA
文/江南独立记者
（邮箱：d*******[email protected]，欢迎对此事关注的人士提供线索、建议或帮助）
在美国洛杉矶华人聚集区之一的蒙特利公园市，一项眼科健康调查（CHES：CHINESE
AMERICAN EYE STUDY）正在华人社区中展开。
奇怪的眼科检查
在美国定居多年的华人王丁（化名）参与了这项调查，现在他开始为这个调查感到百思
不得其解：“说检查眼睛为何要获取我的血样和DNA？”。
这一切要从9月说起，王丁当时接到CHES工作人员的电话，征询他是否愿意参加这项眼
科健康调查计划。60多岁的王丁眼睛不太好，当他看到这样的免费服务，而且又是当地
一家有名的眼科医院检测，他满口答应下来。
在当地，眼科检查至少要收取65美元的挂号费，如果再加一些眼科治疗，费用可能在几
百美元甚至上千美元，王丁说：“CHES不仅不收费，而且还承诺25美元的车马费。”对
很多像王丁这样的普通华人来说，这是一个诱惑。
王丁在电话里答应检查后，调查组的工作人员来到王丁的家里，对王丁的年龄、遗传病
史、疾病既往史、赴美时间等详细信息一一记录，这些资料都被输入到工作人员随身携... 阅读全帖 |
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d******a
发帖数: 32122 | 25 生物技术还是迟了，如果是15年前，就肯定死刑了
现在凶手得以活命
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追踪八代前“生物密码”： 15年后父系DNA锁定色狼真凶
2016.1.12来源：中国女网
15年前，河南省长葛市的17岁女孩刘颖在下夜班返家途中，被人强奸致死。案情发生后
，警方在女孩的下身提取到了嫌疑人遗留的精斑，但因为周边人员复杂等原因，一直无
法破案。然而15年后，随着生物物证——DNA技术的不断成熟和完善，案情却突然出现
了神奇的转机——
1999年5月8日，对于河南省长葛市市郊居民刘高远来说，是个“黑色”的日子:这天早
上，他年仅17岁的宝贝女儿刘颖在下夜班返家途中遇害了!
原在长葛市通达纺织厂上班的刘颖，由于单位实行“三班倒”的作息制度，经常加班到
12点以后才能下班，刘高远每次都会接送女儿下夜班。
5月7日晚上8点，刘颖又迎来了一个夜班时间。当晚女儿走后，家里却突然来了客人，
刘高远便陪着客人多喝了几杯酒，不觉微醺。待客人走后，刘高远便卧在床上躺了一会
。谁知，当他一觉醒来后，已是5月8日凌晨1点多了，竟错过了接女儿回家的时间!
... 阅读全帖 |
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c****x
发帖数: 6601 | 26 BannonUSA3发于 2018-05-18 08:21, 论坛: Chats&&华人闲话
标 题: 新竹小六女遭狼叔性侵懷孕 驗DNA發現孩子是親哥哥的
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: gc01 (gc01), 信区: Military
标 题: 新竹小六女遭狼叔性侵懷孕 驗DNA發現孩子是親哥哥的 发信站: BBS 未名
空间站 (Wed May 16 23:48:20 2018, 美东)
小六女遭狼叔性侵懷孕 驗DNA發現孩子是親哥哥的 分享留言列印
2018-05-16 19:28聯合報 記者郭宣彣╱即時報導
新竹小六女童遭叔叔覬覦，趁家人不在之際，壓制女童性侵得逞，女童懷孕，整起事件
才被家人發現，家人協助進行引產，驗DNA卻發現孩子並非叔叔，而是親哥哥。女童痛
哭說，哥哥看完A片對她性侵，哥哥也認錯。檢方最近偵查終結，依強制性交罪嫌起訴
哥哥。
檢警調查，小六女童（12歲）2年前2個月月經沒來，母親以為只是月經不順，母帶女兒
就醫後發現懷孕5個月，馬上協助女童進行引產手術。女兒告訴母親，「被叔叔玷污」
，母親氣得回家跟丈夫訴苦。
當時，女童父親... 阅读全帖 |
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t*******y
发帖数: 21396 | 27 生物神经网络与机器学习的碰撞，Nature论文提出DNA试管网络识别手写数字
近日，来自加州理工学院的研究人员开发出一种由 DNA 制成的新型人工神经网络。该
网络解决了一个经典的机器学习问题：正确识别手写数字。该项研究中，研究者用了
36 个手写数字 6 和 7 作为测试例子，结果表明这种新型神经网络能够正确识别出所
有的数字。该研究是在生物工程助理教授 Lulu Qian 的实验室中完成的。相关论文于
7 月 4 日上传网络，并将出现在 7 月 19 日的纸质版《Nature》杂志上。
科学家们已经从 DNA 中开发出一种人工神经网络，能够识别嘈杂和高度复杂的分子信
息。
加州理工学院的研究人员开发了一种由 DNA 制成的人工神经网络，可以解决一个经典
的机器学习问题：正确识别手写数字。这项研究迈出了重要一步，证明我们具备了将人
工智能编程到合成生物分子回路中的能力。
「尽管研究者刚刚开始尝试在分子机器中创造人工智能，但其潜力是不可否认的，」
Qian 表示。「电子计算机和智能手机使得现代人类的能力高于 100 多年前，与此类似
，在未来的近百年里，人工分子机器可能制造出由分子组成... 阅读全帖 |
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T******e
发帖数: 18290 | 28 DNA和转基因：一个结果让人啼笑皆非的调查
环球科技观光团 发表于 昨天19:09
（Paradoxian，Olak/编译）俄克拉荷马州立大学农业和经济系最近开展的一项民意调
查显示，有80%的美国人支持“强制性标识含DNA的食物”，这一比例基本和支持对“用
基因工程生产的”转基因食品（GMO foods）进行强制性标识的比例一致。俄克拉荷马
州立大学的经济学家杰森·勒斯克（Jayson Lusk）也在自己的博客中介绍了此次调查
的更多细节，与上述两个问题在同一系列的问题还包括是否支持“对含糖汽水征税”，
是否支持“禁止销售大麻”等等。
图示受访者对一系列“政府政策”所持的支持（蓝色）或反对（红色）态度分布。其中
倒数第三和第四项分别为“强制性标识用基因工程生产的食物”和“强制性标识含DNA
的食物”。图片来源：agecon.okstate.edu
对此结果，《华盛顿邮报》撰文称，如果美国政府真的要推行强制性政策来标识含有
DNA的食物，那个标签看起来可能会是这样的：
警告：本品含有脱氧核糖核酸（deoxyribonucleic acid，DNA）。总医官（Surgeon
Gener... 阅读全帖 |
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y***i
发帖数: 11639 | 29 “现在dna这么进步, 甚至都已经开始了纯人工生命了.”规范的说法是 现在dna人
工操作的技术这么进步。。。。。
简单科普一下吧，也许都是你知道的。
DNA是每个生命人人都有，而且几乎每个个体间都至少都有点不同的“建造图纸”（
如下，同卵双胞胎是例外），DNA是
１。一种细胞核内的物质，
２。 他是一条长链（或者说一条长双链）
３。每个细胞里都有一条DNA链，同一生物内几乎所有细胞里的DNA都是一样的。
这是一个细胞克隆能出整个生物的原因。
４。DNA基本上决定了你长什么样子。同卵双胞胎长得几乎一样，是因为他们的DNA是相
同的。
５。从分子角度而言，DNA决定何时何地，如何生产细胞内的几万种蛋白质。这些蛋白
质再决定细胞，器官，个体。。。。等等。
DNA技术是指人工改变DNA，再造出有这个DNA的个体。比如让老鼠受精卵的DNA里插入一
段，要求他生产一种本来是水母才有的，发绿光的蛋白质，从这个受精卵出来的老鼠就
全身发绿光。这叫DNA技术。（也就是把本来是水母的一小段DNA插到老鼠DNA里） |
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i***s
发帖数: 39120 | 30 除了电视剧、演义小说和历史文献，人们了解“乱世枭雄”曹操或许有了新途径。近日，复旦大学历史学和人类学联合课题组发布了关于曹操家族DNA研究的最新成果，发现了一种罕见的家族内共有的基因类型。网民对此议论纷纷，该成果的科学性和可信度有多高？对历史研究有怎样的价值？且听课题组专家怎么说。
质疑一：凭什么100%确定曹操家族基因？
据悉，上述课题组由复旦历史系教授、中国魏晋南北朝史学会副会长韩昇和复旦现代人类学教育部重点实验室李辉教授领衔。通过现代基因反推和古DNA检测双重验证，他们认为已100％确定了曹操家族的共有基因类型。
网民脑海中充满了问号。“曹操的身世一直是个历史谜团，曹操墓尚未确认，没有曹操本人的DNA，专家凭什么100％确定其家族共有的基因呢？”网民“一路有你快乐”说。
课题组专家回应，要把曹操家族后人与近两千年前的曹操进行“亲子鉴定”，锁定曹操的DNA特性显得尤其重要。李辉说，课题组从2009年起在全国征集曹操后代（男性）的静脉血样本。采集对象包括79个曹姓家族的280名男性和446个夏侯、操等姓氏在内的男性志愿者，最终样本总量超过1000例。
与此同时，课题组专家对全国各地2... 阅读全帖 |
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L*****k
发帖数: 13042 | 31 【 以下文字转载自 Xibei 讨论区 】
发信人: LeChuck (111088), 信区: Xibei
标 题: 合肥大学生DNA鉴定羊肉串 66摊点仅2成真货
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Sep 18 13:25:39 2014, 美东)
合肥大学生DNA鉴定羊肉串 66摊点仅2成真货
2014-09-18 10:30:01 来源: 人民网(北京) 有14126人参与
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大学生鉴定羊肉串
合肥 个摊点仅两成真货
DNA
66
夏天到了，傍晚，到大排档、路边摊，烤上几串羊肉串，再来瓶啤酒，想必是不少人，
在夏天最喜欢选择的一种解暑休闲方式。然而最近，安徽大学学生薛纯，通过DNA检测
的方式，对合肥66个摊点的肉串进行了肉类成分检测，结果出乎意料，在采集的66个样
品中羊肉只占大约两成。
A
测试肉串成了
毕业论文内容
安徽大学2009级生物科学专业大四毕业生薛纯是一名动物爱好者，他一直担心一些无良
商家会捕杀流浪动物来降低烤肉串成本。
薛纯告诉记者，他是学校动物保护协会的一名会员，看到有新闻报道说广东有捕流浪猫
狗用作羊肉串，就想看看羊肉串里有没有这些肉。经过... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 32 谢贤狄波拉和谢霆锋
张柏芝偷偷被公婆做亲子鉴定
“锋芝”婚变不断有旁人加入战局，昨天，音乐人许常德的一篇微博引发轩然大波：“我的友人目前在处理张柏芝的某些工作，她发现张已有些生病的状态，很多演出都有不能出席的状态，我就跟她说，换做是谁在那么多重的压力下，一定要小心情绪方面的疾病，对于这对公婆，则要提醒，就算不顾媳妇，也要想想验DNA这样的事对两个孙子的影响，真是够了!真是婆媳矛盾呀。”此微博一出，眼尖的网友立刻围观，并不断转发称许常德确认狄波拉和谢贤带孙子验DNA。或许是眼见情况失控，很快许常德删除了该微博内容，并发了一段内容相对和缓的文字。怀疑孩子非亲身，给孩子做亲子鉴定，这在娱乐圈并不鲜见。
孙志浩和贾静雯
孙志浩：台湾女星贾静雯离婚案终于落下尘埃，女儿的监护权最终归属贾静雯。据悉，此次离婚，让贾静雯此前的一些丑闻不断爆料，与内地某男星暧昧偷情，甚至有媒体爆料，当年未婚先孕的贾静雯被公婆逼着给孩子验证DNA，贾静雯也借此得到了清白。
曾志伟：前不久关淑怡带着十来岁的孩子出现在媒体面前，当年的私生子风波再度成为焦点，人们一度认为孩子的父亲就是曾志伟，但曾志伟拒不承认。台湾媒体更是爆料... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 33 死者赖玲玲楼下，案发当时屋檐右角就有摄像头
增城一宗错综复杂的蹊跷死亡案，时至今日，困扰了家属、律师、办案机关整整三年。2012年3月22日，23岁的江西女子赖玲玲被人发现手脚被捆、颈系皮带、头缠胶带，惨死在广州增城一间出租屋。案发后，警方从现场绑缚物品、死者身上提取出多人DNA成分，证实女子系出租屋内遭捆绑、强奸，扼压颈部致严重机械性窒息死亡。
翌日，第一时间发现死者的薛孝辉，旋即接受调查并被控杀人。证据之一是捆绑死者身上的绳索、皮带、胶带，存有其DNA峰值大。同时，他还有另一身份，系死者赖玲玲的情人。其作案动机被认为是死者生前拍下一段性爱视频，提出结婚要求惹怒自己。
案发后的第18个月，警方在检察院、法院的“要求”下，通过比对DNA追捕到另一涉案人赵某义。然而其供述他确有捆绑、强奸赖玲玲，但这来自薛孝辉为摆脱情人纠缠的“有偿雇佣”，其作案离开时女子并未死亡。一具女尸，残留下多人的DNA，到底是谁所为？单干还是合谋？因不服一审判决，薛孝辉近日上诉至广东省高院，要求核查案中的诸多疑点。
A、昔日的情人
来增城打工10年，湖北女子严晓雯从未想到，丈夫薛孝辉在外面竟然有个江西情人。而这位叫... 阅读全帖 |
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d*******i
发帖数: 257 | 34 那么，让我们再一次回到我们的主题上来吧。有一个事实我们需要注意，那就是，克里
克在他的自传中，极力地避开了一些事情，而这对揭开螺旋结构至关重要。另外，书里
还细致地描写了评价科学者的科学者们所设的陷阱。克里克在弗兰克琳完全不知情的情
况下，盗用了她所研究出的关于DNA的资料。
1952年，弗兰克琳将自己的研究结果整理成年度报告提交给了英国医学研究机构。该机
构是一个公开地为她提供科研经费的组织。作为研究者，弗兰克琳有义务将自己的研究
成果向其汇报，然后该机构才能以此判断是否要继续为她提供经费，这在当时是很普遍
的做法。所以，弗兰克琳就很用心地将自己的研究成果尽可能详细地整理到报告中去。
但是，她所提交的报告，并不是什么学术论文，所以也就没有必要去通过什么专业科学
者的审查，也无须进行发表。报告里都是一些未经发表的研究数据，拥有预算权的英国
医学研究机构的成员们都能看到这份报告书。这就意味着，弗兰克琳的这份报告与研究
论文一样，可能被那些专业科学者们看到。
在那些科学者们当中，有一个人叫马克斯·佩鲁茨。这个人是英国医学研究机构的成员
，在克里克所在的剑桥大学研究所里担任克里克的指导员。弗... 阅读全帖 |
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s********n
发帖数: 26222 | 35 巴基斯坦判了为CIA收集本拉登家庭DNA的牙医30年监禁，因为DNA最终判定了那个地方
就是本拉登的藏身之处，此事突出了DNA科技在重大事件和人物追踪中的关键作用。内
部消息称CIA有针对世界各国领袖的隐秘DNA收集计划，特别是潜在敌国如中国俄罗斯政
治要人部队高官家属的DNA。 就目前来说，中国共产党各大重要家族，包括叶剑英，邓
小平，李鹏，江泽民，朱镕基，姚依林，习近平等人的DNA信息，美国通过其直系血清
留美家属的血样，已经部分掌握，直系下一代血清和其本人将有二分之一的准确性。中
国部队高官直系家属，军长级别以上的直系血清DNA也在收集之列。世界其他各国的领
袖高官之家族DNA，如印度，俄罗斯，伊朗等国家领袖家族DNA，通过其留美血亲，都在
收集之列。当然，不排除从各国政要在美国访问的过程中，直接从其粪便排泄物
中收取其个人的全DNA。
不仅美国潜在对手国家，美国的盟国之政要的DNA也在收集之列，比喻说日本，
韩国，法国等领导人家系的DNA也在数据库收集的序列中。 |
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s*****e
发帖数: 970 | 36 利用特定的DNA结构——DNA核酶可以构建各种DNA分子逻辑门，这为DNA计算机的发展
奠定了基础。
在国家自然科学基金委、中国科学院、科技部和上海市科委的支持下，中科院上海应
用物理研究所的樊春海研究员与上海交通大学Bio-X中心的贺林院士、张治洲教授（现为
天津科技大学教授）通过深入的学科交叉与合作，应用DNA核酶研制成功一类新型的“DNA
逻辑门”。相关研究结果已发表在日前出版的著名化学杂志《德国应用化学》上。
DNA计算是计算机科学和分子生物学相结合而发展起来的新兴研究领域。由于DNA分子
具有强大的并行运算和超高的存储能力，DNA计算将可能解决一些电子计算机难以完成的
复杂问题，而且也可能在体内药物传输或遗传分析等领域发挥重要作用。虽然DNA计算未
来潜力无穷，但是当前仍然有许多瓶颈技术和基础问题需要解决，其中基于DNA分子的逻
辑门就是实现DNA计算的一个重要基础。
DNA核酶是一种通过体外进化筛选出来的具有特定酶活性的核酸结构，在该项研究中 |
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L*****k
发帖数: 13042 | 37 合肥大学生DNA鉴定羊肉串 66摊点仅2成真货
2014-09-18 10:30:01 来源: 人民网(北京) 有14126人参与
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大学生鉴定羊肉串
合肥 个摊点仅两成真货
DNA
66
夏天到了，傍晚，到大排档、路边摊，烤上几串羊肉串，再来瓶啤酒，想必是不少人，
在夏天最喜欢选择的一种解暑休闲方式。然而最近，安徽大学学生薛纯，通过DNA检测
的方式，对合肥66个摊点的肉串进行了肉类成分检测，结果出乎意料，在采集的66个样
品中羊肉只占大约两成。
A
测试肉串成了
毕业论文内容
安徽大学2009级生物科学专业大四毕业生薛纯是一名动物爱好者，他一直担心一些无良
商家会捕杀流浪动物来降低烤肉串成本。
薛纯告诉记者，他是学校动物保护协会的一名会员，看到有新闻报道说广东有捕流浪猫
狗用作羊肉串，就想看看羊肉串里有没有这些肉。经过和论文指导老师协商，薛纯决定
测试烤肉串里肉的种类作为自己的毕业论文研究方向。
薛纯说，后来和指导老师商量一下，觉得肉串里有这些流浪猫的肉，可能性不是很大，
因为分析了一下那些肉的货源不是很稳定，没有一个充分的货源供给，最后实验结果也
证明了这一点。
想法一决定... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 38 谈谈和蛋白打交道的日子 （一）
序
笔者已经做了多年和蛋白相关的科研与服务，产品研发生产以及产业化。在这里分享一
下与蛋白打交道这些年带来的一些感想。其实所有的科学研究都是用来解决人类已经和
即将遇到的各种各样的问题的，只有解决了问题才会有更大的存在价值。
第一篇 DNA测序， Sanger Style - 纪念Frederick Sanger
2013年11月20号，Frederick Sanger 去世了， 享年95岁。Sanger是DNA测序之父，获
得过两次诺贝尔奖， 一个是1958年蛋白测序， 另一个是1980年DNA测序。虽然DNA结构
发现的比蛋白晚， 但毕竟是genetic code，master script。ATCG四个碱基的组合比蛋
白的20个氨基酸的天文数字组合可更容易研究找规律了。人天生就是个好奇的动物，
最喜欢找规律, 尤其喜欢从简单的地方入手，所以围绕DNA的研究在Watson-Crick的碱
基配对这个简单地规律被发现以后，起来的就比蛋白快了很多。其实DNA和蛋白， 就像
是帅才和将才， 他们的用处是不同的，需要出色的帅才（DNA）订好了方向，能干的将... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 39 谈谈和蛋白打交道的日子 （一）
序
笔者已经做了多年和蛋白相关的科研与服务，产品研发生产以及产业化。在这里分享一
下与蛋白打交道这些年带来的一些感想。其实所有的科学研究都是用来解决人类已经和
即将遇到的各种各样的问题的，只有解决了问题才会有更大的存在价值。
第一篇 DNA测序， Sanger Style - 纪念Frederick Sanger
2013年11月20号，Frederick Sanger 去世了， 享年95岁。Sanger是DNA测序之父，获
得过两次诺贝尔奖， 一个是1958年蛋白测序， 另一个是1980年DNA测序。虽然DNA结构
发现的比蛋白晚， 但毕竟是genetic code，master script。ATCG四个碱基的组合比蛋
白的20个氨基酸的天文数字组合可更容易研究找规律了。人天生就是个好奇的动物，
最喜欢找规律, 尤其喜欢从简单的地方入手，所以围绕DNA的研究在Watson-Crick的碱
基配对这个简单地规律被发现以后，起来的就比蛋白快了很多。其实DNA和蛋白， 就像
是帅才和将才， 他们的用处是不同的，需要出色的帅才（DNA）订好了方向，能干的将... 阅读全帖 |
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c******i
发帖数: 4091 | 40 http://phys.org/news/2013-01-ancient-dna-reveals-humans-years.h
Ancient DNA reveals humans living 40,000 years ago in Beijing area related
to present-day Asians, Native Americans
January 21, 2013
Ancient DNA reveals humans living 40,000 years ago in Beijing area related
to present-day Asians, Native Americans Enlarge The leg of the early modern
human from Tianyuan Cave was used for the genetic analysis as well as for
carbon dating. Credit: MPI for Evolutionary Anthropology An international
team ... 阅读全帖 |
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c******i
发帖数: 4091 | 41 http://phys.org/news/2013-01-ancient-dna-reveals-humans-years.h
Ancient DNA reveals humans living 40,000 years ago in Beijing area related
to present-day Asians, Native Americans
January 21, 2013
Ancient DNA reveals humans living 40,000 years ago in Beijing area related
to present-day Asians, Native Americans Enlarge The leg of the early modern
human from Tianyuan Cave was used for the genetic analysis as well as for
carbon dating. Credit: MPI for Evolutionary Anthropology An international
team ... 阅读全帖 |
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u*****a
发帖数: 9489 | 42 因为以前在change.org签过华人反歧视请愿的东西，所以邮箱经常收到网站推送的一些
新的请愿。平常我都不怎么看的，因为多数比较无聊，但这个看起来有料。
我给个摘要：1995年，这个女的被强奸了，她认为是A男干的，并在法庭上作证指认了
这个人，然后A被判入狱十一年，后来刑满释放。但后来的DNA检测却表明A是被冤枉的
，真正的强奸犯是B男。然后这个女的很内疚，发了这个请愿请大家签名，推广DNA检测
在司法上的应用。
具体细节，大家自己看吧。
In 1995, I found myself on a journey I would never wish on another human
being. I learned that the man whom I had identified in court as my rapist
and was sent to prison – the man whose face, breath and evilness I had
dreamt about for 11 years – was innocent.
Through post-conv... 阅读全帖 |
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d***e
发帖数: 3497 | 43 难道不能从大洋洲，美洲，亚洲，欧洲走出来的？
晚期智人是在大约20万年前，在非洲某处进化而来的。但是我们这个物种又是怎样遍及
世界其他地方的呢？
人类是在一次大移居中涌出非洲，还是在几万年的时间里一波一波地离开那片大陆的？
这是人类进化中最大的问题之一，它已经困扰了科学家数十年之久。
现在他们可能找到了答案。
星期三，《自然》(Nature)杂志发表了一系列前所未有的基因分析报告，三个不同研究
团队都得出结论，非洲之外所有人类的祖先都可以追溯到5万年到8万年前离开非洲的一
批人。
奥布雷·林奇是澳大利亚Wongatha土著人群体中的一位老人，他参加了一项基因分析研
究，该研究或许有助于揭示古代人类的迁徙。
►奥布雷·林奇是澳大利亚Wongatha土著人群体中的一位老人，他参加了一项基
因分析研究，该研究或许有助于揭示古代人类的迁徙。PREBEN HJORT/MAYDAY FILM
“我觉得三组研究基本上说的都是同一件事，”华盛顿大学的约书亚·M·阿基(Joshua
M. Akey)说，他为这个新研究撰写了一篇解释性文章。“我们知道，非洲有多次向外
界传播人口，但现在我们可以... 阅读全帖 |
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t*********5
发帖数: 2 | 44 生化与细胞所在DNA去甲基化机制研究中获得重要进展：发现一种新的修饰碱基
2011-08-08 10:02:00 | 来源： | 【大 中 小】【打印】【关闭】
在高等生物的基因组DNA中除含有腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)四
种常见的碱基形式外，还含有胞嘧啶的修饰形式：5-甲基胞嘧啶（5mC），被称为第5种
碱基。而且它可以进一步被氧化为5-羟甲基胞嘧啶（5hmC），也被称为第6碱基。这些
修饰形式在表观调控中都具有重要的作用，但它们如何被可逆转变为胞嘧啶(C)还不清
楚。中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的工作证明，DNA中
的5mC和5hmC都可以被Tet家族的双加氧酶进一步氧化为第7种碱基：5-羧基胞嘧啶（
5caC）；此外，胸腺嘧啶DNA糖基化酶（TDG）可以特异性地识别这一新的碱基修饰形式
，并将其从基因组中切除。2011年8月4日，《Science》杂志在线发表了这项关于DNA去
甲基化机制的研究发现。这项研究由徐国良、李林、丁建平实验室及中科院药物所等单
位合作完成，副研究员贺宇飞、博士后李滨忠等承担了主要工作。
动植物生长... 阅读全帖 |
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w********h
发帖数: 12367 | 45 日本科学家制成世界首个人造DNA
新浪科技讯 北京时间7月8日消息，据国外媒体报道，日本的科学家日前称，他们最近
成功地合成出了世界首个几乎是百分之百的人造DNA分子。这一新技术不仅将有助于改
进基因治疗方法，甚至还能驱动未来的纳米级电脑或者其它高科技装备。
世界首个人造DNA分子诞生
在即将于7月23日出版的最新一期《美国化学协会会刊》上，日本科学家将公布他
们的这项最新研究成果。多年来，科学家们一直在探索一种储存密度更大，存储状态更
稳定的信息载体。由于脱氧核糖核酸(DNA)有一大特性，就是能够携带生物体的大量基
因物质。它惊人的信息存贮容量给科学家们以启迪。他们试图研制人造DNA作为未来的
新型信息载体。利用人造DNA存储信息，即所谓的生物存储，这是对DNA上述特性的充分
利用。科学家们此前还曾利用过首个大肠杆菌的DNA，之后让酵母细胞来复制DNA，然后
将它们组装到一个人造染色体上。目前，DNA技术已经可以应用于制造简单电路。
众所周知，DNA的核苷酸序列是遗传信息的贮存形式。DNA一般是通过四种基本构件
(核苷酸)对蛋白质进行编码，决定蛋白质中氨基酸排列顺序。此前，已有一些科 |
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i*****s
发帖数: 15215 | 46 艺术概念图，展示了神秘的大脚怪。美国兽医梅尔巴-科特彻姆表示大脚怪是一种
未知人族动物与现代人的混血儿
新浪科技讯 北京时间11月30日消息，据国外媒体报道，美国“DNA诊断”（DNA
Diagnostics）公司公布的一份新闻稿指出，基因检测结果证实传说中的大脚怪是人类
的近亲，在大约1.5万年前出现。此项研究由德克萨斯州的兽医梅尔巴-科特彻姆进行。
她指出一种未知的人族动物曾与现代人中的女性交配，孕育出毛发浓密的人族混血，也
就是所说的大脚怪。不过，科学界对这一观点持怀疑态度。
“DNA诊断”公司公布的新闻稿称：“一组科学家通过为期5年的DNA研究证实奇特
的人族混血儿确实存在，通常被称之为‘大脚怪’或者‘北美野人’，生活在北美洲。
DNA排序研究显示传说中的北美野人是人类近亲，出现在大约1.5万年前。”
为了进行此项研究，科特彻姆从所谓的大脚怪样本中提取了3个完整的细胞核基因
组。基因组排序结果显示大脚怪的mtDNA与现代智人相同，但nuDNA比较奇特，来自于一
种与智人和其他灵长类动物存在血缘关系的未知人族动物。新闻稿称：“我们的数据显
示北美野人是一个混血儿，父亲是一种未知的... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 47 5000余枚雷管被盗，省、市领导相继批示要求迅速破案，公安部督办，“证据之王”DNA比对成功，最终却发现嫌疑人根本不具备作案条件，六亿分之一的误差概率在此案中出现……
白水县近百名专案民警历时59个昼夜，分赴山西、四川、河北等6省23县市破获此案，犯罪嫌疑人贾某、廖某2人以涉嫌盗窃爆炸物被刑拘，唐某等8人以涉嫌买卖爆炸物被刑拘。
省市领导批示要求公安机关迅速破案
9月11日，白水县公安局接到县龙泉煤炭有限责任公司报案，称该矿井下库房5000余枚雷管被盗。案情重大，县公安局刑警大队民警立即赶往现场调查。办案民警李云平说，由于案件涉及爆炸物品数目较多，省、市领导都作了重要批示，要求公安机关迅速破案；公安部也将此案列为督办案件。9月12日上午，白水县公安局成立专案组，60余民警组成摸排组、视频排查组、重点人员线索核查组等4个小组，对案件展开调查。
“我们以龙泉煤矿人员为主，并对周围村庄的闲散人员以及历年打击过的涉爆人员为重点对象，排查了5000余人。”李云平表示，同时还在设立的关卡口对2万多车辆进行了拍照、调查。
DNA比对“冤枉”永寿一男子
9月20日，在距龙泉公司1公里处的白云路旁庄稼地... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 48 法医物证司法鉴定所副主任医师张晓楠女士，拿起两份不同的碎骨标本，准备进行DNA比对
地产开发挖掘中，两家遗骨被混在一起，一边是去世20多年的爸爸，一边是去世30多年的姥姥。如何分开混在一起的遗骨，令延安的两家人烦恼不已。经过第四军医大学DNA分型研究中心20多天的努力，谜底近日终于揭开。
分离遗骨面临三难题
6月6日，第四军医大学DNA分型研究中心接待了一群来自延安的人，包括法医、开发商及互不认识的两家人，他们拿着一大包东西—混在一起、难以区分的遗骨。两家人反映说，延安当地一家房产开发商在施工挖掘时将两家的坟地挖出，逝者的遗骨混在一起分不清，家属报案后警方介入，因为无法处理，于是到该中心进行司法鉴定。
昨日上午，第四军医大学DNA分型研究中心主任吴元明说，其中一家家属是母子俩，老太太70多岁了，拄着拐杖颤颤巍巍，她的老伴去世了20多年，“遗骨放在哪里，她就跟到哪里，不断地重复：不能把人家的骨头埋到我家坟里。”另一方家属是40多岁的姐妹俩，她们的姥姥去世30多年，母亲也已去世，现在要求辨认清楚姥姥的遗骨。
吴元明说，这起鉴定仍面临3个难题。首先，寻找父亲遗骨的可以通过父系亲子鉴定的方式来... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 49 大学生鉴定羊肉串
夏天到了，傍晚，到大排档、路边摊，烤上几串羊肉串，再来瓶啤酒，想必是不少人，在夏天最喜欢选择的一种解暑休闲方式。然而最近，安徽大学学生薛纯，通过DNA检测的方式，对合肥66个摊点的肉串进行了肉类成分检测，结果出乎意料，在采集的66个样品中羊肉只占大约两成。
A
测试肉串成了
毕业论文内容
安徽大学2009级生物科学专业大四毕业生薛纯是一名动物爱好者，他一直担心一些无良商家会捕杀流浪动物来降低烤肉串成本。
薛纯告诉记者，他是学校动物保护协会的一名会员，看到有新闻报道说广东有捕流浪猫狗用作羊肉串，就想看看羊肉串里有没有这些肉。经过和论文指导老师协商，薛纯决定测试烤肉串里肉的种类作为自己的毕业论文研究方向。
薛纯说，后来和指导老师商量一下，觉得肉串里有这些流浪猫的肉，可能性不是很大，因为分析了一下那些肉的货源不是很稳定，没有一个充分的货源供给，最后实验结果也证明了这一点。
想法一决定，薛纯便开始了实施的过程。他用了两个月的时间，足迹踏遍了合肥四个主城区，从合肥66个摊点买了66串烤肉串回来作为样本。
B
检测确认
各种肉的种类
接着，薛纯开始用基因结合各种分子生物手段对样本... 阅读全帖 |
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H****g
发帖数: 14447 | 50 DNA profiling的灵敏度和可靠度如何解决？
也就是说，检测中的一类错误是，一个人的DNA不相符，结果检测成相符（可靠度）；
二类错误是，一个人的DNA相符，却检测成不相符（灵敏度）。
如果是要提高可靠度，就是要最大限度的减少一类错误的概率，也就是统计学里所说的
Neyman–Pearson准则，设定一类错误的概率必须少到极点，然后再降低二类错误的概
率。这样就是避免冤枉一个人。
所以这就涉及到，刑事检验里的DNA profiling的检验概率设定阈值是多少了。是千分
之一？万分之一？有没有懂行的id给普及一下？
假设设定的概率是千分之一，就意味着，1000个人里面，会有一个人的DNA本来不相符
，但是却被误判为DNA相符。
另外，现在涉枪案都不用做弹道检测了？只靠指纹和DNA就行？还是这次是特事特办呢？
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http://www.cq.xinhuanet.com/2012-08/14/c_112724316.htm
今年1月江苏南京持枪抢劫杀人案发之后，江苏警方进一步确定他的DNA等重要信息，重
庆公安局在分析系列案件犯罪嫌疑人作案特点的基础上，加大了排查... 阅读全帖 |
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