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a*o
发帖数: 19981 | 2 这个onboard flash有91M空间，不尴不尬的，貌似比较基本的pkg也都能装上了？
不上X桌面的话就不用搞个USB flash占个口了吧？
哥现在才装了最基本的ntfs-3g + samba + e2fs，已经用掉近一半了。
/dev/mtdblock3 91.0M 41.1M 49.9M 45% /opt
torrent那个最好？ctorrent？ |
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n*7
发帖数: 51 | 3 Shirodkar, S., M. Ewen, J. A. DeCaprio, J. Morgan, D. M. Livingston, and
T. Chittenden. "The Transcription Factor E2F Interacts with the
Retinoblastoma Product and a p107-Cyclin A Complex in a Cell Cycle-
Regulated Manner." Cell 68, no. 1 (1992): 157-166.
Hayles, J., D. Fisher, A. Woollard, and P. Nurse. "Temporal Order of S
Phase and Mitosis in Fission Yeast Is Determined by the State of the
p34cdc2 Mitotic B Cyclin Complex." Cell 78, no. 5 (1994): 813-822.
oaixil AT hotmail.com |
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j********r
发帖数: 156 | 4 accumulates in M phase, and is rapidly degraded upon entering G1 phase. 大家猜
猜这个蛋白是干啥的。It might be subject to the transcriptional regulation by
E2F
family proteins.
貌似这个蛋白对M phase exit起作用。Not sure where to pursue next, 盼大牛指点
一下！ |
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s******y
发帖数: 28562 | 5 BRCA1 那个是怎么样的？能不能讲讲？
Rb是哪一个Rb? retinoblastoma? 如果是这个的话那么其实是和我说的意思正好相反了。因为retinoblastoma的磷酸化会使得它失去结合E2F的活性。而我希望找一个
磷酸化后获得活性的例子。 |
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q**********0
发帖数: 335 | 6 Thanks. Do you know whether Rb-E2F pathways is intact in HepG2?
line. |
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l******g
发帖数: 1145 | 7 Rb-E2F pathways 用HeLa的不少,还有用T98G的——和我专业无关，只是qualify考试时
写这个题目，念了些文章。 |
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i***l
发帖数: 4182 | 8 The Rb/E2F pathway modulates neurogenesis through direct regulation of the
Dlx1/Dlx2 bigene cluster
J Neurosci. 2012 Jun 13;32(24):8219-30.
Please send to i******[email protected], appreciate a lot. |
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发帖数: 1 | 9 多谢。
1. 这是一个关键的问题，可能也是生物建模里最有挑战性的问题。还好细胞周期调控
是一个很老的领域，从已发表的文献里面我们可以找到一些测量的参数值，其他的一些
还是只能设置到生理水平附近的数值。不过在系统分析和仿真这一部分，我们做了参数
敏感性分析，也就是在很大数值范围内来赋予参数值，来看对输出有没有影响。尽管我
们没有能够遍历所有的参数空间，但是我们的分析证明在很大的参数空间里证明系统能
够维持稳定的输出。并且我们做了系统简化分析，在核心调控单元(Rb&E2F)里给出了动
力学的数学解析分析和数学预测。而且这些预测是和已有的知识不一样的，这些都被后
面的单细胞分析所证实。
2. 如果您仔细读文章尤其是建模那一部分的话就会发现，我们没有用模型fit数据，而
是恰恰相反，是由动力学方程得出和常识不一样的预测，而后由定量的实验系统加以证
明。
3. 对系统更加准确的描述应该使用随机模型，比如Gillespie算法或者近似的随机微分
方程，可以在描述动力学的同时也描述系统随机性的一面，不过我们这篇文章侧重于系
统的动力学特性，常微分方程组是足够的。我们也有做过随机微分方程组的分析，结论... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 10 对于scale up之后系统失不失真，实际上是一个怎么样对系统准确描述的问题。具体到
每一个微分方程实际上只有两个方面：对调控的数学表达和参数值的量化。如果这两方
面能做到尽量准确，那么最终对于整个系统的描述也应该比较靠谱。关于第一个方面，
需要尽可能知道每个元件，这是生物化学应该做的事情。同时也需要对各种不同的调控
类型建立准确的数学描述，这是生物物理可以解决的问题。我觉得不同的调控类型，像
转录调控，磷酸化，降解，各种epigenetic调控等等对于系统动力学的影响是不一样的
，而他们各自或许会遵守一些共同的规律，能够了解这些规律就可以把方程式写的准确
。而对于系统参数的测量，现在也有很多生物物理手段可以办到。
基因的序列只能决定每个组成元素的功能，而有关各个基因的表达动力学曲线才蕴含着
系统的性质，因为它是由与它有调控关系的其他节点决定的。所以，能准确测量尽可能
多的节点的动力学特性对了解系统的性质至关重要，它可以验证我们的数学分析正不正
确，如果不正确，我们需要回过头去看看我们的模型忽略了哪些东西。数学分析和实验
验证是一个相辅相成的过程。
关于细胞整个系统，我觉得他也是模块化... 阅读全帖 |
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s****y
发帖数: 682 | 11 看了几篇文章，没有见到用commercial，多是自己lab搞的或者是gift。请有经验的给
讲解一下。 |
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