y***j
发帖数: 11235 | 1 做一个实验， 细胞需要染色然后sort一下再提RNA。
染色至少冰上30min，另外再flow cytometer里有几十秒钟的时间温度会升到RT甚至更
高.会不会有影响呢？
formalin fix一下再染色会不会影响下一步的RNA提取呢？准备用qiagen的RNeasy
micro kit.
或者有什么其他专门的可以再进细胞的RNAse inhibitor么？ |
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s******s
发帖数: 13035 | 2 没问题，无穷这种FFPE“ formalin-fixed, paraffin-embedded tissue”
的kit，比如qiagen rneasy ffpe kit |
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s********e
发帖数: 427 | 3 The findings, published online on Dec. 14 in Nature Medicine, could restart
work on effective killed-virus vaccines not only for RSV but other
respiratory viruses, researchers say. The new findings also debunk a popular
theory that the 1966 vaccine was ineffective because the formalin used to
inactivate the virus disrupted critical antigens, the substances that
stimulate the production of protective antibodies.
Instead, researchers said, the problem occurred when the antibodies created
by the va... 阅读全帖 |
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s********e
发帖数: 427 | 4 The findings, published online on Dec. 14 in Nature Medicine, could restart
work on effective killed-virus vaccines not only for RSV but other
respiratory viruses, researchers say. The new findings also debunk a popular
theory that the 1966 vaccine was ineffective because the formalin used to
inactivate the virus disrupted critical antigens, the substances that
stimulate the production of protective antibodies.
Instead, researchers said, the problem occurred when the antibodies created
by the va... 阅读全帖 |
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k**l
发帖数: 2966 | 5 帮朋友问的,不知道这个版对不对,还是
应该发到什云帛?,多谢
if a breast cancer tumor sample has been in 10% neutral buffered formalin
for 2-5 hours (certainly less than 6) and then embedded in paraffin for 10+
days, is there anyway to rescue the sample in order to produce accurate FISH
test--as FISH test requires 6 to 48 hours fixation time in 10% neutral
buffered formalin?
a pathologist suggested that he dissolve the paraffin and then put the
samp... 阅读全帖 |
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s********e
发帖数: 427 | 6 我找到了John Hopkins那里的链接。
Hopkins-Led Team Solves Failed Vaccine Mystery
MEDIA CONTACT: Ekaterina Pesheva
EMAIL: e******[email protected]
PHONE: (410) 502-9433
December 15, 2008
Research led by Johns Hopkins Children's Center scientists has figured out
why a respiratory syncytial virus vaccine used in 1966 to inoculate children
against the infection instead caused severe respiratory disease and
effectively stopped efforts to make a better one.
The findings, published online on Dec. 14 in Nature Medicine, ... 阅读全帖 |
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N*********6
发帖数: 2302 | 7 【 以下文字转载自 ebiz 讨论区 】
发信人: Narcissus26 (王语嫣), 信区: ebiz
标 题: (Got)帮师弟寻找一个postdoc 位置 in USA，谢谢 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jan 23 18:33:04 2016, 美东)
发信人: Narcissus26 (Jane), 信区: Biology
标 题: (Got)帮师弟寻找一个postdoc 位置 in USA，谢谢
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 29 08:56:37 2015, 美东)
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recovery of ne... 阅读全帖 |
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a***d
发帖数: 1998 | 8 您是想说有collapse所以就不可能是chronic的过程吗？
那我真的不知道怎么和你解释了。如果套用你常用的话，有时间多看点书吧：）
另外，刚才回去翻了你以前的帖子，你认为是医生做假的铁证的几个时间点不对
urine test canceled at 04/18/2013 10:11
biopsy 时间 4/18/2016 9:30
你的逻辑是医生看了病理以后觉得有问题，立刻cancel了尿检。
但是病理的片子不是你拿到手就立刻能看。从biopsy做完，拿到标本，住院医gross完
，还要固定，process，bedding，技术员切片，染色，到patholgist看到片子，至少一
天。除非他们是做的冰冻切片。但是gross description里清楚写着the specimen is
received in formalin，所以不可能是冰冻切片。biopsy的标本很小，还夹着血块和其
它组织，在gross的时候不太可能看出什么的。你认为医生看到病理以后为了掩盖过失
立刻cancel 尿检应该不可能的。
not
results
acute |
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a***d
发帖数: 1998 | 9 拜托，是谁不懂装懂。冰冻切片的标本是不能碰福尔马林的。你的gross description
的第一句话就是specimen is received in formalin. 另外biopsy的标本就是显微镜诊
断，grossly就是几毫米长的标本，夹着血块和粘液，还能肉眼看出脂肪变纤维变我也
是醉了。
: 不懂装懂太可怕了，
: 第一， 12号取尿液, 18号活检, 18号之前已经原始数据出来了。也就是根本不
需要活
: 检就可以给诊断。
: 各个实验多长时间出来我都调查了， 尿有机酸大概三天多。
: 第二, 根本不用看病理切片。肝活检出来脂肪淤积看颜色就知道了。这是 gross
: description 的基本要求。
:
: 一知半解太可怕了。我没有这几年研究, 敢这么出来说？砸牌子
: 第三， 速冻很快就可以拿到切片看。这个不需要24小时。但是需要级别比较高
的病理
: 学家看,因为这种情况当天比较急,病人需要早点治疗。
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t**x
发帖数: 20965 | 10 你说得挺有意思我看看
颜色是跟脂肪淤积有关，脂肪淤积和代谢病相关非常高好
我没有说能看到纤维化。
应该是早一天知道这个病。看到伤得太厉害就打算不救了，推一把换掉肝算了。这是医
生的思路。
一个是颜色
一个是是否断 断就是伤得非常重了.
所以只要看到肝脏基本就确认脂肪酸代谢病以及伤到什么程度了。
所以病理提供的信息就不对多了，只能是说不是这个不是那个。。。就是肝本身应该没
有病，怎么会受伤这么重？
: 拜托，是谁不懂装懂。冰冻切片的标本是不能碰福尔马林的。你的gross
description
: 的第一句话就是specimen is received in formalin. 另外biopsy的标本就是显
微镜诊
: 断，grossly就是几毫米长的标本，夹着血块和粘液，还能肉眼看出脂肪变纤维
变我也
: 是醉了。
: 需要活
: 的病理
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a***d
发帖数: 1998 | 11 你一天临床都没做过的人，你确认你懂什么是医生的思路？
如果一个医生有了医疗过失，对病人造成伤害，其他医生risk自己的执照帮他造假的可
能性几乎为零。除非这两个医生是血亲或生死之交。即使同一个医院，不同科室之间互
相竞争斗气看笑话的事情多了。更别说不同州有竞争关系的几大医院，为了你家这根本
没有明确证据算医疗过失的案例，忽然间同气连枝，联合造假，互相包庇。你真的想的
太多了。而且大部分医生和医院的合同关系很松的。独立职业的医生比医院医生收入高
很多。根本不存在医生为了维护铁饭碗帮本院医生要造假的动机。
再回来说说你说的biopsy标本的颜色变化。脂肪变在肝脏表面的确能看到颜色变化。但
是在极小的biopsy标本上，这种颜色变化不明显，而且在formalin里泡过以后，肝脏本
身颜色也有变化。从来没听说biopsy标本能做颜色鉴别的。
: 你说得挺有意思我看看
: 颜色是跟脂肪淤积有关，脂肪淤积和代谢病相关非常高好
: 我没有说能看到纤维化。
: 应该是早一天知道这个病。看到伤得太厉害就打算不救了，推一把换掉肝算了。
这是医
: 生的思路。
阅读全帖 |
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k**********4
发帖数: 16092 | 12 I have yr mom's B...
it's in a formalin jar now.. |
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N*********6
发帖数: 2302 | 13 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: Narcissus26 (Jane), 信区: Biology
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recovery of neuromyelitis optica spectrum disorder is associated with a
lower level of CXCL12 in the human brain. J Neuroimm, 289:56-6... 阅读全帖 |
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b******d
发帖数: 43 | 15 恳请各位咨询一下
我右脚小拇指内侧突然发现一个大概直径3mm的黑痣 三个月以前突然发现 从针尖大小
长到现在2mm x 2mm 所以长得比较迅
外观看是平行线状色素分布，明显有三条平行的黑线组成。我研究了一下，
differential的诊断无外乎是肢端黑色素瘤或者一般黑痣 看网上论文说区分 acral
lentiginous melanoma in situ 和 Acral Junctional Nevus 的最好办法就是看看色
素分布是
parallel ridge pattern 还是 parallel furrow pattern 【1】【2】
文献 【1】
http://cdn.intechopen.com/pdfs-wm/42394.pdf
文献 【2】
Acral junctional nevus versus acral lentiginous melanoma in situ: a
differential diagnosis that should be based on clinicopathologic correlation.
http://www.ncbi.... 阅读全帖 |
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s*******g
发帖数: 170 | 16 Title: Quantifying the Effects of Formalin Fixation on the Mechanical Proper
ties of Cortical Bone Using Beam Theory and Optimization Methodology With Sp
ecimen-Specific Finite Element Models
Journal: Journal of Biomechanical Engineering
我觉得有beam theory, finite element analysis背景就可以了，
有兴趣站内联系。 |
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J****0
发帖数: 2400 | 17 anaesthetic
formalin是防腐剂不是麻醉剂。 |
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t*x
发帖数: 1065 | 18 刚才wiki了一下
“Nail polish ingredients often include toluene. Solvents such as toluene
and xylene are petroleum-based products that have been linked to cancer.
Formaldehyde (also called formalin) may cause allergic reactions in some
people and is unsafe for use by asthmatic people. It is a carcinogen.”
指甲油中除了那些色素，膜生成剂，硬化剂什么的不提，光是说溶剂，里面就经常含有
toluene和xylene（甲苯和二甲苯）。说到甲苯，二甲苯，jms们就知道为什么怀孕时候
不要用了吧？神经毒剂，致癌，致畸。。。好恐怖啊，俺决定就算臭美，有宝宝的时候
也坚决不用。 |
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d*********m
发帖数: 164 | 19 不就是一个普通的护肤品分析网站么？在网站上搜索formalin，有两篇文章提及，粗略
看了一下提到的
两个产品都是hair product。我还真不晓得你的各线产品都含福尔马林的结论是肿么下
的。。。。 |
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N*********6
发帖数: 2302 | 20 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: Narcissus26 (Jane), 信区: Biology
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1. Kang H, Cao S, Chen T, Jiang Z, Liu Z, Li Z, Xu Q, Lin Q, WeiS. The poor
recovery of neuromyelitis optica spectrum disorder is associated with a
lower level of CXCL12 in the human brain. J Neuroimm, 289:56-61, 2015.(co-
first author)
2. Chen T, Li Z, Jiang Z, Liu Z, Xu Q, Huang D, Lin Q, Wei.S (... 阅读全帖 |
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p******e
发帖数: 3689 | 21 又一次去死党家玩
他跟室友坐在饭桌前
两人对着吃斗碗大的面条
都没说话，只是互相对看着
饭桌中间有个液体的瓶子装着东西
这情形非常诡异啊
于是我问：今儿你俩咋了？
死党说：我们打赌，必须看着这个瓶子吃完面条
我：这是什么？
死党：Formalin泡的蛔虫
@#*#@……（@& |
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f***t
发帖数: 2247 | 22 这个有点古龙的味道，稍微改写一下：
黄昏，
餐桌，
两人，
互视无语。
突然，
我：咋了？
他/她：打赌，须盯着该瓶吃面条
我：what's that?
他/她：Formalin泡的蛔虫！ |
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z*******0
发帖数: 35 | 24 1. stocking solution 300mg of Oil red O powder and adding to 100 ml 99%
isopropanol.
2. working solution: 3 part of Oil red ans 2 parts of DI water.
3. filter the working solution
4. Formalin fix sample. wash with DI water.
5. add 60% isopropanol and incubator for 5 mins
6. remove the Isoproponal and add Oil red for 15 mins
7. wash with tab water. |
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b**c
发帖数: 161 | 25 "A Novel Proximity Assay for the Detection of Proteins and Protein Complexes
Homodimerization in Formalin-fixed, Paraffin-Embedded Cell Lines and Breast
Cancer Tissue"
Diagnostic Molecular Pathology:
March 2009 - Volume 18 - Issue 1 - pp 11-21
My email address: d********[email protected]
Thanks so much! |
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s****6
发帖数: 34 | 26 Is it possible to get clinical tissues blocks (Formalin fixed parafin-
embedded) from China for a RO1 grant proposal? I am looking for chances to
collaborate with a big hospital in China, but not sure about the relevant
policies in US and China. Anybody knows about this kind of issues? Thanks a
lot for your pointers! |
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q******g
发帖数: 3858 | 30 laser capture microscope 用的是固定后的样品， 可以做qPCR. |
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s******s
发帖数: 13035 | 31 想想Chip－chip怎么做的？做Chip多数都是先fix的，
最多加热一下就解crosslink了 |
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e*r
发帖数: 103 | 32 如果解crosslink的话 RNA recovery 能达到做少呢？ |
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y***j
发帖数: 11235 | 33 看了这种FFPE，但是都是比较大量细胞的。
几百以至于几十个个细胞的kit比较少。
另外就是recovery怎么样呢？ |
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s******a
发帖数: 252 | 34 The fixing does affect RNA quality. It's doable, but you need try hard to
get good reproducibility. |
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e*r
发帖数: 103 | 35 Do you have some suggestions? I mean how to get good RNA. |
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l******u
发帖数: 936 | 36 Chip - Chip
是做DNA吧.
别人是要抽RNA做microarray, 肯定不行. |
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l******u
发帖数: 936 | 37 你fix, 然后还有染色RNA 还要 facs
RNA都降解的很多了, RIN number 很难到6.0
做array 就不可靠了. |
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l******u
发帖数: 936 | 39 6.5
我自己LCM后的样品底线是7.5, 基本都是8.0以上.
RIN 越高, 结果越可信. |
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l******u
发帖数: 936 | 41 我LCM是切冰冻片.
就用100% EtOH 固定加脱水.
我用自己发明的方法通过参照点系列切片法定位细胞. 参照片子可以用任何方法染色,
目标片子不染色, 用100% EtOH 固定加脱水, 然后可以通过参照片上的定位找到目标
片上的细胞. 切下的细胞抽RNA,最高可以达到 9.0 以上的RIN. |
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e*r
发帖数: 103 | 42 每次能得到多少RNA呢？总量。 测的时候取多少呢？ |
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l******u
发帖数: 936 | 43 切的细胞多RNA就多啊 ,取决你切多少细胞.
一般每个动物细胞20-50 pg total RNA.
用 Agilent Bioanalyzer 测 RNA quality 只要1微升
但是 Agilent Bioanalyzer 测RNA 浓度不准确,
所以要用nano drop 测浓度,
但是浓度在 在 20ng/微升以下, nanodrop 也测不准 |
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M*****e
发帖数: 279 | 44 If you are interested in cell proliferation, phosphorylated Histone H3 S10
antibody is better.
Ki67 is not M-phase specific. Histone H3 pS10 is relatively M-phase specific.
You can use 1:50 to 1:100 for Histone H3 pS10 on Formalin fixed paraffin
embedded tissue section. You can recycle the antibody (add sodium azide) and
re-use it later. |
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h********n
发帖数: 4079 | 46 实验室的阿三把cancer cell注射到老鼠皮下, 几周以后长成肿瘤, 然后杀老鼠切下肿
瘤称重, 一切都很平常. 小组汇报的时候一看, 每个肿瘤有5g重, 大家质疑之.
会后我和他一起把存在formalin里面的肿瘤拿出来一看, 这位大哥注射细胞的时候太靠
近大腿, 切的时候把整个大腿连骨头带肉切下来, 算在肿瘤的重量里面......
我震惊了...... |
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n***w
发帖数: 2405 | 47 或者你可以用点formalin之类的固定，比如说PREFER，PERFIX,等等。
然后送去做paraffin section
如果自己做frozen section, 4%PFA 可以了，没必要加glutaraldehyde. |
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s****g
发帖数: 265 | 48 怀孕了可是还要接触formalin 和xylene， 虽然都在hood里做，但怎么老是觉得不安全
。 |
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y****y
发帖数: 123 | 49 德国一家公司的CD31据说是唯一可以染老鼠paraffin的
但是好像二抗那步比较麻烦
明天去看看号
顺便问一下BD的CD31染冰冻用什么固定比较好?
formalin可以么 |
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q******g
发帖数: 3858 | 50 我想从FORMALIN FIXED的样品里提蛋白，用什么LYSIS BUFFER比较好啊？我现在用RIPA
BUFFER,但提不出蛋白啊。 |
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