a******g
发帖数: 13519 | 1 12个国家发布共享的92个新冠病毒样本基因组数据。93个样本包含58种单倍型
样本型号编号为H1~H58。这58型病毒都是来自病人采样。
假如这些病毒H1~H58, 只有人感染并在人身上衍化，没有动物寄宿和衍化，
那么，演化关系显示，时间顺序为：
蝙蝠冠状病毒RaTG13-(中间宿主或零号病人)->【1】H13和H38-->【2】H3-->【3】H1--
>H2, H8 ~ H12
【1】H13 来自深圳病人，H38来自美国华盛顿病人。
【2】H3 来自武汉病人，但与华南海鲜市场毫无关联。
【3】H1, H2, H8 ~ H12 来自华南海鲜市场密切相关病人。
H13(深圳病人）和H38(华盛顿病人)的旅行记录表明都是2019年12月底至2020年1月初在
武汉，于是之前大家以为这两个人是在武汉被感染的。
但是（关键点来了）
现有的武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型。
再结合现在大家知道的，病毒潜伏期有20多天，甚至更长。
所以，武汉的病毒，是被从深圳和美国来的病毒携带者输入的，至少目前发现的源头是
这两个地方。
当然，可能还有更早的发源地，例如美国，香港或者台湾某地。 |
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h*********n
发帖数: 11319 | 2 F250这个政庇根本看不懂英文，tmd每次被打脸就换个地方扯淡
论文原文是这么说的
... both H13 and H38 would be suggested as ancestral haplotypes....
... Two main evolutionary paths of available haplotypes can be from H13
through H3 to H1, or
from H38 through H3 to H1 (Figure 3C)....
这tmd说的很明确了，美国的H38演化出H3，H3演化出武汉大爆发的H1 |
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h*********n
发帖数: 11319 | 3 F250这个政庇根本看不懂英文，tmd每次被打脸就换个地方扯淡
论文原文是这么说的
... both H13 and H38 would be suggested as ancestral haplotypes....
... Two main evolutionary paths of available haplotypes can be from H13
through H3 to H1, or
from H38 through H3 to H1 (Figure 3C)....
这tmd说的很明确了，美国的H38演化出H3，H3演化出武汉大爆发的H1 |
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r****n
发帖数: 163 | 4 对“古老的”单倍型H13和H38的病毒样品溯源发现分别是来自深圳的病患（广东首例）
和美国华盛顿州的病患（美国首例）。他们的旅行记录表明应该都是2019年12月底至
2020年1月初在武汉探亲期间被感染的。现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型，
可能是因为现有样品主要采自几家定点医院，而且样品采集时间局限于2019年12月24日
和2020年1月5日。如果能在武汉其他医院早期的病患检测到这两种单倍型，将对于寻找
病毒来源非常有帮助。 |
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发帖数: 1 | 5 H13(深圳病人）和H38(华盛顿病人) 都是武汉病人的H3变异出来的
盹盹盹 |
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a******g
发帖数: 13519 | 6 93个样本包含58种单倍型，演化关系显示，单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型，
通过一个中间载体(mv1，可能是祖先单倍型，也可能是来自中间宿主或“零号病人”)
与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联，并通过单倍型H3衍生出单倍型H1。
与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是H1及其衍生单倍型H2，H8-H12，而一份武
汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关。可见，华南海鲜市场的新冠病毒是从其它地方传
入，再在市场发生快速传播并蔓延。另根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断，也
印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。 |
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a******g
发帖数: 13519 | 7 武汉肯定是找不到比H13和H38更老的，在米国或者香港应该能找到。我大胆猜测，日本
死亡公主号游轮上的患者，很多都是在美国本土就染病了的。 |
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发帖数: 1 | 8 “古老的”单倍型 H13 和 H38 的病毒样品分别来自深圳的病患（广东首例）和美国华
盛顿州的病患（美国首例）。他们的旅行记录表明 2019 年 12 月底至 2020 年 1 月
初都来过武汉。 |
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m******6
发帖数: 6262 | 9 AIRTITE的网站上只有一种38的:
H38 Air-Tite Direct Fit Capsule Morgan - Peace - Ike Dollars, Maple Leaf
但EABY上卖38的, 却细分为Morgan,Peace,Maple Leaf. 不是写在一起.
最近买的CAPSULE,确装MAPLE LEAF, WILD LIFE 时, 两片不能完全密封, 中间还留着缝
.是币太厚, 还是,尺寸有问题? |
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发帖数: 1 | 10 华南海鲜市场的新冠病毒来自其他地方，这个结论有了基于基因序列的证据。
中国科学院西双版纳热带植物园的研究人员在分析 93 个新型冠状病毒样本基因组数据
后发现，基于 120 个变异位点得到 58 种单倍型（基因类型）中，来自华南海鲜市场
患者样品单倍型与 H1 有关，而作为更古老的基因类型样本 H3、H13 和 H38 则来自华
南海鲜市场之外。这印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。
这个研究印证了此前 1 月 24 日发表在《柳叶刀》的研究结论，即追踪第一批 41 个
确诊病例发现，这批最早在 12 月 1 日报告的病例中，总共有 13 个病例与海鲜市场
无接触史。也就是说，病毒在进入海鲜市场之前就已经潜入武汉居民的生活中。
这个研究由中国科学院西双版纳热带植物园郁文彬联合华南农业大学和北京脑科中心的
科研人员进行，于 2 月 19 日发表在中国科学院科技论文预发布平台 ChinaXiv 上。
作者认为，确定海鲜市场是不是病毒发源地对于寻找病毒的来源，以及确定中间宿主，
对疫情的控制和避免再次爆发具有至关重要的意义。
郁文彬 解释说，这是一种基于种群遗传学的分析方法。一种基因型不... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 11 基于全基因组数据解析新型冠状病毒的演化和传播
2019年12月在湖北武汉爆发了一种新型冠状病毒（SARS-CoV-2）所致的肺炎（现称
COVID-19），新型冠状病毒爆发已两个多月，确定华南海鲜市场是不是唯一的发源地，
对于寻找病毒的来源，以及确定中间宿主，对疫情的控制和避免再次爆发具有至关重要
的意义。中国科学院西双版纳热带植物园联合华南农业大学和北京脑科中心的科研人员
一起收集了全世界各领域共享到GISAID EpiFluTM数据库中覆盖了四大洲12个国家的93
个新型冠状病毒样本的基因组数据（截止2月12日），通过全基因组数据解析，追溯传
染源及扩散路径。研究发现，收到的93个样本包含58种单倍型，可以归纳为五组（图1
），包括3个古老超级传播者单倍型（H1, H3和H13）和2个新的超级传播者单倍型（H56
和mv2）；华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其他地方传入进来，在市场中发生快速传
播蔓延到市场之外；同时，现扩散的病例至少来自于3个途径。新型冠状病毒在2月12日
之前发生过2次明显的种群扩张（分别是12月8日和1月6日）。
华南海鲜市场的新冠病... 阅读全帖 |
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h*********n
发帖数: 11319 | 12 F250这个政庇根本看不懂英文，tmd每次被打脸就换个地方扯淡
论文原文是这么说的
... both H13 and H38 would be suggested as ancestral haplotypes....
... Two main evolutionary paths of available haplotypes can be from H13
through H3 to H1, or
from H38 through H3 to H1 (Figure 3C)....
这tmd说的很明确了，美国的H38演化出H3，H3演化出武汉大爆发的H1 |
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f*******e
发帖数: 2791 | 13 在其他地方看到，好像本版夏将军也提到过
新冠源于 H38 ， H38源于蝙蝠病毒。
H38 只在美国被发现，毒株现在在美国人手里。
版纳文章发表以后，
美国人偷偷大幅修改了，已经发表的基因数据.美帝故意删除了一些基因数据?
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x********e
发帖数: 35261 | 14 考验各位将军英文水平的时候来了。想好了再说话，免得露马脚。
Of the 13 genomes from the United States, three were from the same patient
in Washington encoding the same haplotype H38, while the other three samples
encoded eight haplotypes, covering all five groups (Figure 3A), so the
sources of imported infections are complicated. Three haplotypes (H1 (
California), H19 (Wisconsin), and H38 (Washington)) were linked to Wuhan,
and three (H19 (Wisconsin), H35 (Arizona), H42 (California)) to five (H41 (
California) and H58 (Illin... 阅读全帖 |
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q*******6
发帖数: 129 | 15 你是智商低理解不了原文啊还是故意要把水搅浑？H38是从武汉被感染后回的美国，对
吗？
[在 helloterran (hi you) 的大作中提到：]
:H38这个原始单倍体毒株只有美国有。
:美国也是所有国家里唯一集齐了5大类新冠病毒的
:武汉疫情泛滥那么久，来源只有一个孙子辈的H1毒株。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 16 **************************前言******************************
这个数据分析是受到华农最新文章的影响。初心是想独立验证一下华农文章里分组的合
理性已经对病毒起源演化的推论。华农文章掀起了一股“美国投毒阴谋论”。我个人立
场是，我只做数据分析并进行有限推测，如果数据不足或者采样有偏差，我倾向于等信
息更充分再更新结论。
**************************原帖******************************
我抽空利用GISAID的数据库和美国官方发言做了个比对，锁定“零号”病人。顺带证明
一下我一个月之前所说加州要沦陷的预言。再顺便评两句华农新文章的准确度。
Figure1：我把GISAID 108个病毒基因组按照divergence cluster，得到两个分型很独
特的clade。
发散状的clade对应华农的C group，树状分支的clade对应B group。每一支是一个样品
，包括107个病人样品和1个海鲜市场的环境样品。支的长度代表分化程度。注意！这图
只是按分化程度作图，并不等于中心点是“... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 17 有意思的来了，另外两个古老的毒株，居然都没出现在武汉序列里：
“对“古老的”单倍型H13和H38的病毒样品溯源发现分别是来自深圳的病患（广东首例
）和美国华盛顿州的病患（美国首例）。他们的旅行记录表明应该都是2019年12月底至
2020年1月初在武汉探亲期间被感染的。现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型，
可能是因为现有样品主要采自几家定点医院，而且样品采集时间局限于2019年12月24日
和2020年1月5日。如果能在武汉其他医院早期的病患检测到这两种单倍型，将对于寻找
病毒来源非常有帮助。
华南海鲜市场的毒株，是另外一个古老类型H3的孙子辈,,也是唯一的一个出现在武汉上
传序列的古老型。
但是深圳和美国的病例，都有实实在在武汉暴露史，并且发病时间符合目前的潜伏期。
H3的衍生物H1，由经过一次某种宿主变异才有了华南海鲜市场的病毒亚型，在如此短的
时间里，一个病毒两次变异，我觉得华南海鲜市场的病毒来源，是揭开谜底的关键一环。 |
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发帖数: 1 | 18 旅美经济学者何清涟3月4日在推特发文指，国际病毒基因库网站（GISAID）每天更新新
冠病毒的进化树，到3月3日为止，已收录全球135个新冠病毒株基因序列，所有病毒共
同祖先都是武汉新冠病毒。今年2月，中科院西双版纳热带植物园发表论文指，通过研
究全球93个新冠病毒样本，共发现58种单倍型。从演化关系来看，单倍型H13和H38是其
中比较古老的单倍型。而最早的H13和H38病毒样品，分别来自中国深圳和美国华盛顿州
，这两名患者分别于2019年12月底和2020年1月初在武汉被感染。 |
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K*T
发帖数: 11 | 19 囧 贴一个南大的....
算法导论瞩目
1 明朝那些事儿 当年明月著 中国友谊出版公司 2006- K248.09/H8
5613
2 苏菲的世界 (挪)乔斯坦·贾德 作家出版社 1996 I533.45/H1 4509
3 货币战争 宋鸿兵编著 中信出版社 2007 F831.9/H9 4184
4 围城 钱钟书著 人民文学出版社 2003 H319.4:I24/H46 3220
5 芒果街上的小屋 桑德拉·希斯内罗丝著 译林出版社 2006 H319.4:I71
/H187 3100
6 算法导论 (美) Thomas H. Cormen ... [等] 著 机械工业出版社 2006
TP301.6/H87 3073
7 红太阳是怎样升起的:延安整风运动的来龙去脉 高华著 中文大学出版社
2000 D264/H1 3072
8 明朝那些事儿.典藏本 当年明月著 ... 阅读全帖 |
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a******g
发帖数: 13519 | 20 枉废菌斑这么多千老，我看来半天，竟然没一个千老给这个病毒信息图写了分析文章。
最后还得由我这个码工，靠这几天突击学习来的基因知识，来干千老的活。 |
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i******r
发帖数: 1175 | 22 看来是国内泄露无疑了，舆论导向显然鳖想甩锅。
但是即便是外来病原，也没法解释在从武汉源头的事实。看来鳖给自己埋了各种病毒变
异，说明鳖研究生化武器比较全面而已。
华南海鲜市场显然是鳖打出的烟幕弹，鳖自己都不清楚哪个具体渠道，所以阻挠国外专
家核实。 |
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发帖数: 1 | 24 卧槽，我们老将不是一直说海鲜市场不是真正的源头吗？
我一个月前的帖子就反对野味说了。 |
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i******r
发帖数: 1175 | 28 仅仅说明鳖研究了多种的病毒变异。
武汉是中心，几个月都不愿外国专家调查起源，鳖自己都不知道或者在隐瞒源头。 |
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i******r
发帖数: 1175 | 30 狡辩个屁，发现一万种变异又如何？粉毛脑子瓦特了。源头不是武汉吗？鳖还是没理清
源头具体在哪里。海鲜市场不是鳖自己说的，现在不是打自己脸？还打的挺狠的。
无非是生化大泄露，鳖自己还没搞清源头和途径。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 31 我昨天就发了分析文。本版都是文盲，对硬货不感冒 |
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发帖数: 1 | 32 你那篇“硬货”整个就是尿路结石。
一点一点艰难地往外挤一个自以为尿的结论，浑然不顾尿出来的其实是血。 |
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i******r
发帖数: 1175 | 33 逻辑都不清楚。证明病毒多种变种能说明源头在哪里了？循环论证？别吹自己是码农了
，丢码农的脸了吧。 |
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O**W
发帖数: 58 | 34 这张图上显然H3不是最古老啊，怎么老在说H3最老？ |
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i******r
发帖数: 1175 | 35 逻辑都不清楚。证明病毒多种变种能说明源头在哪里了？循环论证？别吹自己是码农了
，丢码农的脸了吧。 |
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x********e
发帖数: 35261 | 36 武汉的病毒肯定是输入的，在海鲜市场发生了第一次扩张，导致C型株在武汉大规模扩
散 |
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a******g
发帖数: 13519 | 37 米国被曝是病毒源头，老将们都很悲愤呐，吼吼吼！ |
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a******g
发帖数: 13519 | 38 从爆发的第一天开始，我就一直强调武汉军人运动会。
其实，从小我周围的人都说我有干侦探的天分。 |
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发帖数: 1 | 40 好吧，先不管美国投毒，你这是要把野生动物的帽子摘掉吗？
五毒所要哭了。 |
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a******g
发帖数: 13519 | 42 怎么能不管？！现在最重要的事就是揪出投毒凶手，告慰死难的国人同胞！
你们老将的良心都让🐕吃了？ |
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发帖数: 1 | 43 就这么几例就下这么大的结论？再说了，美国和台湾的都是轻证患者，文章包括的武汉
病例是轻症患者还是重症会是死亡？他们完全可能是二次感染时取的样，第一次感染的
病毒已经被机体清除？
没有这些信息，所谓的深入分析都是过分解读、都是瞎扯淡。 |
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g***x
发帖数: 1587 | 44 老将们都信中国流感死亡八万八，这是中国数据。饿死三千万都研究的原始数据也来自
中国人口统计。你是说所有老将都是傻逼吗？这个骂得好啊。 |
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g****y
发帖数: 72 | 46 美国上传的数据是从在武汉染病跑到美国来的输入性病例获得的，原来是中国把0号病
人运到美国了。怪不得一直不公布0号病人。
武汉能明确不上传早期病人的数据，而有选择性的上传跟华南海鲜市场有关的病例，明
显是想掩盖什么，并且很清楚源头在哪。 |
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a******g
发帖数: 13519 | 47 轻症患者就表示不是源头？现在相关报道越来越多了，想知道更多细节，自己狗去吧。 |
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发帖数: 1 | 49 三千万的数据是邓挫党和洋爹拍脑袋的，然后算法搞笑
具体可以去看邓挫党原统计局局长文章
[在 gjstx (gjstx) 的大作中提到：]
:老将们都信中国流感死亡八万八，这是中国数据。饿死三千万都研究的原始数据也来
自中国人口统计。你是说所有老将都是傻逼吗？这个骂得好啊。 |
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发帖数: 1 | 50 你也配当马工，逻辑漏洞百出！1 号目前测的只有深圳和美国，但是难道就能保证武汉
本地就没有1号吗？！还有感染了1号的人会不会再感染2号或者更多呢？谁规定每个人
只能感染
一种？！
：12个国家发布共享的92个新冠病毒样本基因组数据。93个样本包含58种单倍型
：样本型号编号为H1~H58。这58型病毒都是来自病人采样。 |
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