g******a
发帖数: 63 | 1 最近在做Chromatin IP, 以前都做转录因子结合DNA，一般先做个预测，然后蛋白拉
下来做pcr。老板说想看下转录因子结合后，组蛋白在该基因启动子区域结合的变化。
我想请教一下组蛋白结合在DNA启动子上的什么区域，好方便设计引物？是ATG
start codon附近还是TATA box之类的呢？
另外，如果我选一个促进的，一个抑制的组蛋白，可以选H3K9Ac和H3K9Me2/
H3K27Me2的antibody吗？
以前没有做过组蛋白的问题，请熟手不吝赐教，感激不尽。 |
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g******a
发帖数: 63 | 2 我想以H3K9Me2和H3K9Ac两个组蛋白为例，看他们在DNA上的结合多少，来表明该基因是
被抑制还是被激活。
bp |
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s*********t
发帖数: 600 | 3 H3K9Me2和H3K9Ac不是组蛋白，只是组蛋白H3尾巴上的某个氨基酸的修饰。针对这些修
饰有特异的抗体（当然有的不像自己声称的那么特异）
选K27me3/2 K9me3/2/1 K4me3/2 K9ac看看，再用针对H3的抗体做control，normalize
在TSS前边选几段 做Q PCR
还可以看H2Bub，pol II的磷酸化吧，根据你的实验和对细胞的处理 |
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