由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: hiseq
1 2 3 下页 末页 (共3页)
n*********4
发帖数: 99
1
来自主题: Biology版 - HiSeq的下一代sequencer出来了
Illumina Introduces the HiSeq 2500
Speed and Performance Enhancements Pave the Way to Future Clinical Use
Illumina ILMN +2.61% today introduced the HiSeq(R) 2500, a next-generation
sequencing system that will enable researchers and clinicians to sequence an
entire genome in approximately 24 hours, "Genome in a Day". The HiSeq 2500
leverages the continued technology advancements from both the HiSeq 2000 and
MiSeq(TM) platforms.
"The ability to sequence an entire genome in a day with the same high... 阅读全帖
y***k
发帖数: 40
2
终于有人忍不住下手了,可是到哪里找业务去喂饱这个巨兽呢
=================================================
SAN DIEGO & SHANGHAI--(BUSINESS WIRE)--Mar. 10, 2014-- Illumina, Inc. (
NASDAQ:ILMN) and WuXi PharmaTech (Cayman) Inc. (NYSE:WX), a leading
pharmaceutical, biotechnology, and medical device R&D outsourcing company
with operations in China and the United States, today announced that the
WuXi Genome Center has purchased an Illumina HiSeq X Ten sequencing system.
This new investment will enable WuXi’s clinical genomic ser... 阅读全帖
e**r
发帖数: 1144
3
GA用的是prism tirf,
Hiseq如果是两个面的话应该不可能用prism tirf了
很奇怪是怎么实现的
希望见过的同学能来解惑
k*******3
发帖数: 1909
4
请问illumina GA, HiSeq, MiSeq主要有什么区别?
谢谢!
n**********u
发帖数: 77
5
http://www.illumina.com/systems/sequencing.ilmn
HiSeq 2500/2000 包一个lane 大概有30G的通量,0.3billion的reads,里面可以加
muliplexing index barcode 用来区分每一个样品,如果加一百个barcode的话,理论
上每个样品就有3million个reads,如果我这个是针对16sRNA 全长测序的话(比如说700
好了),也足够放在一起overlap成数量可观的tags了(有人有经验吗?3million
reads 可以reconstruct into how many tags?)但是 barcode 测序有偏向性的风险,
实际上如 10 个 barcode样品,一共测 1G 数据量,并不能保证每个 barcode 样品数
据均为 100M。 Barcode 越多,样品越混乱,越容易产生 Bias。有做过的人吗? 包
lane的话最多能放进几个barcode呢?
v*****k
发帖数: 7798
6
来自主题: _pennystock版 - 射天狼给评价一下这篇文章?
The new frontier of genetic analysis is developing so fast that industry
leader Illumina plans to come out with an iPad app.
Some of Illumina’s ILMN   software used in gene sequencing already
runs in the Internet cloud.
Illumina showed off its new “MiGenome” iPad app at the third annual
Consumer Genetics Show in Boston on June 8, pointing out that it will put
genomic information at a person’s fingertips.
Illumina will soon start shipping a lower-price gene sequencing system in
the... 阅读全帖
j*******e
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7
Postdocs
Multiple postdoctoral positions are available in Dr. Jiankui He’s
laboratory in South University of Science and Technology of China (SUSTC).
Dr. He is building up the Genome Center at SUSTC, with the most advanced
high throughput sequencers such as Illumina Hiseq, Miseq, Ion Torrent and
Roche 454. We are initiating an international collaborative study “The
International Human Immunome Project”. The International Human Immunome
Project aims to sequence the immune repertoire of 10,000 pat... 阅读全帖
n******7
发帖数: 12463
8
擦,这要是真的,玩大了啊
我看摘要,这不光是HiSeq4000,还有hiseq3000和X ten都有这个问题
In 2015, a new chemistry of cluster generation was introduced in the newer
Illumina machines (HiSeq 3000/4000/X Ten) called exclusion amplification (
ExAmp), which was a fundamental shift from the earlier method of random
cluster generation by bridge amplification on a non-patterned flow cell.
可能最新的novaseq也会有这问题
这要是用来测 tumor samples, 结果完全废了
---
看了一下正文,通篇说hiseq4000是因为他们只有这个测试
Since the HiSeq 3000 and HiSeq X Ten share the same chemistry as t... 阅读全帖
s***a
发帖数: 384
9
来自主题: JobHunting版 - [转]分子生物工作机会 (转载)
【 以下文字转载自 Returnee 讨论区 】
发信人: simva (小铁匠), 信区: Returnee
标 题: [转]分子生物工作机会
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 23 04:20:46 2010, 美东)
华大基因和测序平台的一些介绍您可以通过网站做一些了解http://www.genomics.cn/index.php
- 职位:测序技术负责人、测序技术工程师
职位要求:1、分子生物学或细胞生物学专业背景,英文听说读写能力佳
2、专业技能:具备丰富的分子生物学相关理论基础及分子生物学实验经验
岗位职责:1、领导Hiseq技术组统计收集测序中的技术问题并寻找解决方案
2、确保Hiseq全年质量目标的实现
3、确保Hiseq技术升级目标的实现
4、快速跟进Illumina测序技术的最新进展促进新技术在华大的应用
5、维护与Illumina公司良好的沟通
工作地点:深圳
- 职位:高级实验员
职位要求:1、生物技术、生物科学、生物制药等相关专业、本科以上学历... 阅读全帖
p****o
发帖数: 6
10
公司名称:北京诺禾致源生物信息科技有限公司(Novogene Bioinformatics
Technology Co., Ltd)
工作岗位:美国客户经理
工作地点:北京/美国
薪酬:行业内竞争性薪酬,面议
学历要求:生物,农业,医学相关专业,硕士及以上
公司网址:http://www.novogene.com/
联系方式:[email protected]
/* */
一、岗位职责:
负责所在地区的销售及技术支持业务,包括:
1. 潜在客户挖掘,客户关系维护;
2. 根据客户需求提供项目解决方案,负责项目签订;
3. 跟进项目进展,促进项目顺利进行;
4. 积极了解并反馈市场需求、产品竞争等情况;
5. 能够独立完成销售回款任务;
6. 国际会议的组织参加。
二、岗位要求:
1. 分子生物学、医学、农学相关专业,取得硕士及以上学位。有1年以上海外经历,英
语听说读写能力优秀。全面了解基因组学前沿进展,有高通量测序相关经验优先考虑;
2. 本科或硕士阶段学习过遗传学、分子生物学、基因工程原理等相关课程,有分子生
物学实验经验;
3. 抗压能力强,性格坚韧,亲和力强,反应敏... 阅读全帖
n******e
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11
来自主题: JobMarket版 - 【招聘】Novogene美国客户经理
企业总部位于北京市海淀区学清路38号金码大厦,办公面积4,500m2。技术中心位于天
津市武清区,办公面积11,200m2,其中洁净实验室面积约5,000m2,实验室通过认证获
批国家医疗机构执业许可证和医疗器械生产企业许可证。业务网络遍布国内主要城市,
并设立有香港、美国和英国等海外业务中心。
我们建立了目前国内通量规模最大的基因测序平台,包括10台HiSeq X、10台
HiSeq 2000/2500 、5台Ion Proton、4台MiSeq、1台HiSeq 4000、1台NextSeq 500等最
先进的基因测序仪。高性能计算平台目前物理核数3,592个,计算峰值速度73T flops,
总内存17TB,总存储3.2PB,有效地支撑了生命科学研究、农业育种、食品安全和医疗
健康等领域对大数据分析和存储的需求。
经过四年的快速发展,诺禾致源已成长为国内基因行业的领先企业。现为中关村
国家自主创新示范区金种子企业、瞪羚企业、北京市科技研发机构、软件企业、北京市
企事业专利试点单位、国家高新技术企业,并建设有博士后(青年英才)创新实践基地
。申请67项软件著作... 阅读全帖
n******e
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12
来自主题: JobMarket版 - 【招聘】Novogene美国客户经理
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并设立有香港、美国和英国等海外业务中心。
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HiSeq 2000/2500 、5台Ion Proton、4台MiSeq、1台HiSeq 4000、1台NextSeq 500等最
先进的基因测序仪。高性能计算平台目前物理核数3,592个,计算峰值速度73T flops,
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健康等领域对大数据分析和存储的需求。
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国家自主创新示范区金种子企业、瞪羚企业、北京市科技研发机构、软件企业、北京市
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n******e
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13
工作地点:北京
招聘人数:20人
(一)、 岗位职责:
1. 跟进项目进展,及时完善项目信息,促进项目顺利进行;
2. 把握项目的时间节点,保障项目在周期内完成;
3. 审核各项报告,各项任务单准确并及时下达;
4. 对于项目出现的问题,及时与实验部门、信息部门及客户方沟通,最终协调解决;
5. 能够解决基本售后问题;
6. 优化项目运营过程中的流程,提高运营效率;
(二)、 岗位要求
1. 分子生物学、生物技术相关专业硕士学历;
2. 工作责任心强、严谨细心,条理清晰,有一定的统筹能力;
3. 具有良好的沟通能力、人际关系处理能力以及组织协调能力,能够承担较大的压力;
4. 善于发现并解决问题,逻辑思维能力强;
5. 熟练使用办公软件;
6.熟练使用英语,读写顺畅
7.有海外留学或工作经验者优先
公司介绍
北京诺禾致源生物信息科技有限公司于2011年03月15日在中关村成立,企业专注于开拓
前沿分子生物学技术和高性能计算技术在生命科学研究和人类健康领域的应用,致力于
成为全球领先的基因组学产品和服务提供者。我们的业务范围包括科技服务和医学健康
。其中科技服务为全球研究型大学、科研院所... 阅读全帖
s***a
发帖数: 384
14
来自主题: Returnee版 - [转]分子生物工作机会
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工作地点:深圳
- 职位:高级实验员
职位要求:1、生物技术、生物科学、生物制药等相关专业、本科以上学历,英语听说
读写流利;
2、必须有海外留学或工作经验,熟悉分子生物学实验,有实验室工作经验
优先;
3、工作主动性和责任心强,耐心仔细,勤恳踏实,热爱实验室工作;
岗位职责: 1、严格按照SOP要求独... 阅读全帖
m***T
发帖数: 11058
15
来自主题: Biology版 - Pac Bio 的技术怎么样?
和hiseq针对的不是一个市场,所以抢不到什么份额。主要是和miseq争,但miseq还没
上市,所以它暂时还没份额。
我个人的感觉,miseq可能会因为hiseq在ultra-high throughput市场上的domination
而受影响。为什么这么说?因为hiseq的data不能用和其chemistry一样的miseq平台来
validate,所以势必在一定程度上会影响它的销量。当然对于新进入NGS领域的,不存
在这个问题。
另外,Ion能进步这么快基本上是靠lifetech这条大船。Invitrogen和ambion可以有多少resources供它调用,再加上AB在instrument方面的expertise?你看看现在Ion的protocol和kits里面有多少SOLiD的痕迹就知道了
s****l
发帖数: 10462
16
有人愿意讨论这里面提及的测序技术吗?优缺点,可行性,第一手经验等等
这里面谁现在是赢家很清楚,但是可见的将来和更远的将来谁会赢?
http://cen.acs.org/articles/92/i33/Next-Gen-Sequencing-Numbers-
全文拷贝如下
试试看图能不能贴上
/1407973177171.jpg
/1408028636124.jpg
OVER STORY
Next-Gen Sequencing Is A Numbers Game
As technical and cost barriers fall, instrument firms move their systems
into research and clinical markets
By Ann M. Thayer
Department: Business
Keywords: instrumentation, gene sequencing, diagnostics, genomics, cancer
[+]Enlarge
09233-cover-Openercxd_17647969-690
A... 阅读全帖
d*******3
发帖数: 8598
17
基因产业战:中国基因技术的尴尬
2014-01-06 1 来源:财经国家周刊 作者:陈荣4 V+ Z- R& K4 I# o
% w, d. q- k( e( I
工业化时代的监管思维和手段,有必要作出相应调整。中国对基因这一前沿科技的政策
必须更具前瞻性
没有机场,再好的飞机也难以飞向天空。
中国基因技术正面临这样的尴尬。由于注册死结迟迟未能解开,多地医院开展已久的无
创产前基因检测服务,被国家监管部门三度叫停。- O$ j: k; D* B- B1 s
基因被认为是人类生命科学的顶峰。通向这一顶峰的路上,中国民营机构参与了国际人
类基因组计划,并承担了部分测序任务(1%),所幸没有被完全抛下。
其后,国内基因产业的先行者实现了由参与、接轨到同步及部分引领的跨越发展,并逆
向并购了美国上游公司。但这并不代表取得这场商业战争的完胜。整体观之,中国基因
产业企业在全球竞争中依然处于被动。& J, Y! N* q6 v% D$ a3 E* U
业界认为,坐拥足够大的市场需求,宝贵的主场优势,中国基因技术和产业,完全有理
由做得更好。
但前提是,中国对基因这一前沿科技的政策更具前瞻性,成为这... 阅读全帖
m***T
发帖数: 11058
18
BGI刚説了其在香港的点儿要100台HiSeq 2000和20台SOLiD,用来做国外的样本;在深
圳的点要弄37台HiSeq 2000及5-10台SOLiD,针对国内的市场。
http://www.genomeweb.com/sequencing/bgi-americas-banks-chinese-institutes-vast-sequencing-and-bioinformatics-capacit
n******7
发帖数: 12463
19
恩,hiseq X ten是比较便宜
但是其他的机器变化不大
illumina的政策hiseq X ten只用来做WGS
所以要做其他的seq,比如bisulfite seq,就还是很贵
y******8
发帖数: 1764
20
Ion刚出的时候,我觉得HiSeq会在5年内被取代。
现在Nanopore出来了,Ion如果没有本质的突破,将会和HiSeq同时同命运。
与Nanopore比,Ion的速度处于劣势,读长劣势。
如果是比较raw error的话,Ion也没有优势可言。算法校正上,我对life没有太大的信
心。
最后比较通量,如果Nanopore的膜形状不是平面,而是多曲面,体积不便,这个通量增
加的办法可比Ion downsize well容易多了。
如果Ion不需要bead和emPCR了,估计还有一拼。
t**x
发帖数: 20965
21
人家在中国治病救人
靠服务人民挣钱
今年2月底在美国佛罗里达召开的生物技术领域最有影响力的“全球基因组生物学
与技术进展”(AGBT)大会上,美国科学院院士、北京大学长江讲座及千人计划
教授、北京大学生物动态光学成像中心(BIOPIC)主任谢晓亮代表北大BIOPIC-北医三
院生殖医学研究团队报告了一项最新的单细胞基因组扩增技术成果,首次实现了人类胚
胎在植入女性子宫前的遗传诊断,该技术有望大幅提高辅助生殖(试管婴儿)成功率,
并在其他产前诊断领域具有广泛的应用前景。
该团队由北京大学BIOPIC的谢晓亮实验室、汤富酬实验室及北京大学第三附属医院生殖
医学中心乔杰实验室组成。 他们将谢晓亮哈佛大学实验室去年底发表在《科学》上的
MALBAC(multiple annealing and looping-based amplification cycles) 技术应用
于临床,从而确立了基于单细胞基因组高通量测序的植入前基因诊断新方法。 据外媒
报道,该报告引起与会同行的高度关注并获得了多家媒体报道,冷泉港实验室的
Gholson Lyon 评价说谢晓亮教授的报告... 阅读全帖
t**x
发帖数: 20965
22
谢的工作
MALBAC是谢晓亮教授最新发展出的单细胞基因组扩增方法,与多重置换 (MDA:
Multiple Displacement Amplification) 基因组扩增方法相比,它采用了线性扩增而
非传统的指数扩增方式,因而能够大幅度提高扩增的均一性。
全世界目前每十对夫妇中就有一对面临生育障碍,每年依靠生殖辅助技术降生的婴儿高
达五十万。 但是,受限于目前辅助生殖过程中胚胎筛选的技术水平,胚胎成功移植并
最终产下婴儿的成功率仅为30%左右。
据介绍,成功率之所以如此之低,主要是由于传统受精卵筛选的方法不够精确。通常,
为了降低各类风险,例如怀上多胞胎,可导致流产的子痫前症以及大出血等,医生们只
能将一个胚胎移植入子宫。 传统的筛选依据主要是受精卵的形态,而形态判断主要依
靠医生的主观经验,可见传统方法的精确度是难以保证和提高的。 胚胎移植成活率低
的主要原因之一在于各类染色体异常。 因此,植入前的全基因组遗传筛查不但可以最
大限度地提高移植胚胎成活率,提高试管婴儿的健康水平,而且可以大幅降低医疗费用
,减轻孕妇的痛苦,为社会和病人节约大量资源。
据北医三院生殖医学中心主任乔杰... 阅读全帖

发帖数: 1
23
来自主题: Classified版 - Field Specialist Needed - Biotech NGS area
Field Specialist - Seattle, Bay Area, Texas, NY. PA, Los Angeles.
Organization
Novogene, headquartered in Beijing with branches in the U.S. and U.K., is a
leading genomics solution provider with cutting edge bioinformatics
expertise and the largest Illumina-based sequencing capacity in China.
Committed to quality service and scientific excellence, Novogene has
achieved rapid growth and industry recognition by working in partnership
with diverse healthcare, educational and research institutions a... 阅读全帖
s**u
发帖数: 9035
24
Faculty position in human genomics at the Institute for Genome Sciences,
University of Maryland, Baltimore
The Institute for Genome Sciences is seeking a new faculty member at
the Assistant/Associate/ Professor level in the area of human genomics/
bioinformatics.
The Institute currently has 23 highly collaborative faculty working on
the human microbiome, human genome sequencing, genetic variation,
cancer genomics, host/pathogen interactions, and other areas of
interest related to modern genomics... 阅读全帖
s**u
发帖数: 9035
25
发信人: shmu (shmu), 信区: Biology
标 题: Opening Faculty position in human genomics, UMB
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Oct 17 08:04:37 2011, 美东)
Faculty position in human genomics at the Institute for Genome Sciences,
University of Maryland, Baltimore
The Institute for Genome Sciences is seeking a new faculty member at
the Assistant/Associate/ Professor level in the area of human genomics/
bioinformatics.
The Institute currently has 23 highly collaborative faculty working on
the human microbiome, human genome ... 阅读全帖
l***s
发帖数: 841
26
来自主题: Faculty版 - 有人用过GeneWIZ 吗?
不大懂fosmid。是HiSeq shortgun sequencing吗? 我一般是是在自己学校里做。
genome assembly是个问题,commercial services容易做不好,尤其不是常见genome的
话。

formid

发帖数: 1
27
来自主题: JobMarket版 - Field Specialist Needed - Biotech NGS area
Field Specialist - Seattle, Bay Area, Texas, NY. PA, Los Angeles.
Organization
Novogene, headquartered in Beijing with branches in the U.S. and U.K., is a
leading genomics solution provider with cutting edge bioinformatics
expertise and the largest Illumina-based sequencing capacity in China.
Committed to quality service and scientific excellence, Novogene has
achieved rapid growth and industry recognition by working in partnership
with diverse healthcare, educational and research institutions a... 阅读全帖
D*****r
发帖数: 356
28
来自主题: Returnee版 - 征人回国创业(基因测序方向)
illumina的吧,是hiseq 和myseq中间的那个吧。这东西真的很烧钱不过做出来也很。
。。。来钱的。。
f**********e
发帖数: 1994
29
这个看财务报表可以猜出来。卖给个体研究单位的大多是照价卖的,这 454/AB/ILMN
都一样。但我是很难相信 genome center; sanger, BGI 几十台几百台进全是近 list
price 上的。别说是 HiSeq, 就是 GA 也要几十个M.
j***a
发帖数: 10844
30
来自主题: Biology版 - next generation sequencing technology
Nice summary!
这是个烧钱的买卖,GA II还没用多久,HiSeq 2000又来了,没有相当的经济实力是做
不了的,再过
几年等cost降到$30-100/genome的时候(哪怕是$1000/genome也行)就会大大降温了。

是:
m***T
发帖数: 11058
31
你在二代platform象SOLiD和HiSeq上怎么enrich target,在Ion上的道理是一样的。
Jonathan M. Rothberg应该是个Apple饭。我挺佩服它的,弄了几家startup,然后时机
一成熟就卖出去。而且几家公司的影响力都不小。

lol
d******e
发帖数: 1424
32
来自主题: Biology版 - NGS,到底谁会赢得这个市场?
最新一期Nature Methods有一篇"",列Torrents of sequence出了几家NGS方面值得关
注的公司:http://www.nature.com/nmeth/journal/v8/n1/pdf/nmeth.f.330.pdf
其中有:
Ion Torrent Personal Genome Machine;
PacBio RS system;
AB SOLiD 5500;
Illumina HiSeq 2000;
Roche 454 GS FLX
这篇文章用Torrents of sequence做标题,而且Ion Torrent 和ABI都是Life
Technologies的,呵呵。
e**r
发帖数: 1144
33
有人见过没?
看简介好像和GA差别比较大
那个dual-surface是怎么回事?
上下两面用两个镜头吗?还是改变focus?
四个相机怎么布置的?
s******9
发帖数: 283
34
喜欢这个讨论。
我原来还一直好奇他们怎么只把polyacrylamide涂在flow cell的一个面上,干嘛不两
个面一起来。两个面的autofocus都好解决?
s******s
发帖数: 13035
35
btw, bridge PCR是illumina啥时候申请的专利?ms这个赚便宜很大
e**r
发帖数: 1144
s******9
发帖数: 283
37
我猜测dual surface imaging, flow cell下面是prism tirf,上面是objective tirf,
这样只用同一个objective. flow cell不太可能在扫描时反转,同时必须靠tirf保证
imaging的质量。
感觉他们的flow cell技术含量很高。2% polyacrylamide浓度选择很有道理,第一,不
容易脱落,第二,扩增出来的cluster可以深入胶里面。
s******s
发帖数: 13035
38
来自主题: Biology版 - Beijing Genomics Institute很牛啊
solid或者hiseq基本每次百G以上。ion的计算其实比较鬼,因为
illumina什么的cluster generation什么的都算在里面了
y******8
发帖数: 1764
39
来自主题: Biology版 - 求科普Next Generation Sequence
Thanks.
I thought using Illumina HiSeq, two rounds would be enough
to give me candidates.

using
m***T
发帖数: 11058
40
来自主题: Biology版 - Pac Bio 的技术怎么样?
反复测就和HiSeq和SOLiD区别不大了,running cost一下子就上去了,而且大家肯定不
希望在一个还没被证明的平台上花那么多的钱。唯一的优势是read length长。
不过它家这几天刚release了Ecoli的data,似乎别人的总体评价还相对正面。只是内部
data有多大水分这个不好说。
A*****n
发帖数: 243
41
来自主题: Biology版 - Pac Bio 的技术怎么样?
316的数据貌似看上去还可以,至少Ion Torrent进步的速度挺快的。
不过能从hiseq和miseq那里抢到多少份额还真不好说,
A*****n
发帖数: 243
42
你们不会是自己实验室有hiseq机器吧?连bcl这一步都得自己做?
这样的话有钱买仪器,更应该有钱买软件或者培训人啦。
华大的数据质量不清楚,不过几个大公司sequencing倒都是外包到华大,然后自己做后
续分析的。
w*****i
发帖数: 54
43
谢谢大家。。。我们实验室是新买了hiseq,目前还在调试,主要是样本处理这一阶段。
结果分析说是要找人合作的,估计老板正在找吧,还没人做。我就一步一步学着该怎么
做。这个我是一点基础都没有,做bench work倒是不在话下。看大家给我介绍的这些,
我。。。我还是放弃了吧。。。
M*****n
发帖数: 16729
44
靠,大家一窝蜂都上hiseq了
s******y
发帖数: 137
45
来自主题: Biology版 - DEEP SEQUENCEING? ANY SUGGESTION
我最近投的RNA-seq文章就被要qPCR验证了,至于不同时间做出来的结果,也很难说以后就可以一直比较,我们组以前最早的数据是35bp,single end,好不容易最近用100bp Paired
end 又重测了一遍,现在新的样本又都去跳hiseq了。所以这个不同时间做出来的数据
也方便比较也很难说。
h***0
发帖数: 248
46
来自主题: Biology版 - 请教Bioinformatics职业规划~~~

NGS = next generation sequencer 就是我们说的新一代测序技术,或者说这个技术得
到的数据,反正你懂的
比如BGI家的137台(好像)Illumina HiSeq 2000高通量测序仪
用这种测序仪或技术,可以得到DNA-seq、small RNA-seq、transcriptomic、ChIP-seq
、meta-genomics的数据,
我说 我做NGS,就是说我的研究对象是NGS产生的数据,这些高通量的数据(比如说用重测
序做GWAS)自己就能做一个大项目来研究(你PCR就不行了)
因为我们不但要分析这些高通量数据,我们还有整合大量的已知的功能数据,生物学资源
,预测的功能数据,系统生物学等BLABLA的
我表达能力不好,不知道说明白了没
s******s
发帖数: 13035
47
我k,变化大了。hiseq-X出来以后,测序成本第二次突飞猛退。
你要看那张更新版本的和莫尔law对比的图就知道了。
m***T
发帖数: 11058
48
hiseq-X对于临床的意义不太大,至少现在。目前在临床上基本上是panel based的test
,连whole exome的都非常少,不过前些日子atena刚宣布有条件支持whole exome,所
以可能会加速它进入临床的速度
s******s
发帖数: 13035
49
来自主题: Biology版 - NGS 二代测序分析,大家来评评
never done mapping myself, but FYI
1. histone marker和TF的Chip-seq protocol应该非常不一样,不知道你是不是用的一
个protocol
2. hiseq现在一条lane大概200m reads, 50bp的话,略微不到40G的data.

70
,
with
binding
s**u
发帖数: 9035
50
Faculty position in human genomics at the Institute for Genome Sciences,
University of Maryland, Baltimore
The Institute for Genome Sciences is seeking a new faculty member at
the Assistant/Associate/ Professor level in the area of human genomics/
bioinformatics.
The Institute currently has 23 highly collaborative faculty working on
the human microbiome, human genome sequencing, genetic variation,
cancer genomics, host/pathogen interactions, and other areas of
interest related to modern genomics... 阅读全帖
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