p*******8
发帖数: 158 | 1 Instrument vendor often needs that much time to earn money up to $2000.
However, our university is charged for large price for MALDI training (it
estimated to be $5000, which made me and my boss go crazy ) . What a fuck
greedy, taking us as idiots ! If instrument did not work after your sample,
additional charge will be $1000. Also, they require you take chemistry Mass
spectrometry course before training. Anyway,it's impossible to do it by
yourself even if MALDI is available, nobody using i... 阅读全帖 |
|
h*****e
发帖数: 1330 | 2 眼下这个地方只有HPLC-UV detector和MALDI-TOF，没有LC-MS这种高级武器（别笑话，没办法）。本来的想法是HCL全水解交联蛋白后PITC柱前衍生化，然后HPLC分离PITC-AAs，可能会得到未知交联的氨基酸（PITC-AA1-AA2-PITC），然后用MALDI-TOF测分子量（PITC衍生的交联的产物PITC-AA1-AA2-PITC的分子量可能在500~600)，但用了DHB常规MALDI或则NALDI试了试，连PITC-AAs的分子量都看不了。
目前只看到一国内文章上说PITC柱前衍生化的方法只能用UV detect，是不是MS对这种衍生物不work。英文的也没有这样说的 |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 3 哈哈，我一直在想 bruker MALDI 的3-day training 是给谁准备的。。。
（我们仪器装好之后就training了半个小时）
我training 过很多本科生，基本上一个小时后就可以了（不包括使用biotool）
另外，MALDI 是一个很容易上手的仪器，我们training MALDI imaging 也不过只花了3
个小时
like
bugging |
|
j********h
发帖数: 24 | 4 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: jonathanzh (丁丁), 信区: Chemistry
标 题: 问个学术问题，关于MALDI的
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Oct 24 16:39:08 2006)
用MALDI谱计算polymer的分子量和PDI的时候，每个分子量的polymer的数量是对应于m+
H, m+Na, m+K这几个峰的强度之和，还是仅仅对应于m+H的峰的强度？
大家一般是用什么方法从MALDI谱上算出polymer的分子量和PDI的？ |
|
s****e
发帖数: 2934 | 5 ☆─────────────────────────────────────☆
jonathanzh (丁丁) 于 (Tue Oct 24 16:40:34 2006) 提到:
发信人: jonathanzh (丁丁), 信区: Chemistry
标 题: 问个学术问题，关于MALDI的
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Oct 24 16:39:08 2006)
用MALDI谱计算polymer的分子量和PDI的时候，每个分子量的polymer的数量是对应于m+
H, m+Na, m+K这几个峰的强度之和，还是仅仅对应于m+H的峰的强度？
大家一般是用什么方法从MALDI谱上算出polymer的分子量和PDI的？ |
|
s**********8
发帖数: 25265 | 6 maldi can not go that high, but GPC can go much higher. MALDI is still at
research phase, but GPC is widely employed in various industry. try to use
it and it will benefit you in long run. |
|
h*****e
发帖数: 1330 | 7 质谱高手看看
，没办法）。本来的想法是HCL全水解交联蛋白后PITC柱前衍生化，然后HPLC分离PITC-
AAs，可能会得到未知交联的氨基酸（PITC-AA1-AA2-PITC），然后用MALDI-TOF测分子
量（PITC衍生的交联的产物PITC-AA1-AA2-PITC的分子量可能在500~600)，但用了DHB常
规MALDI或则NALDI试了试，连PITC-AAs的分子量都看不了。
种衍生物不work。英文的也没有这样说的 |
|
l****y
发帖数: 398 | 8 not a high hand.
Even the macromolecule analysis is likely to be dominated by ESI now. MALDI
is more straightforward, but it
can't be coupled to LC. Years ago, our lab used MALDI most of the time. But
now, with orbitrap and synapt,
many people are switching to the electrospray. |
|
L****r
发帖数: 333 | 9 大分子分析主要还是利用LCMS，MALDI能给很多信息，但无法定量，充其量也就是半定
量。定性方面，分子量一大，只能给出平均分子量， MALDI TOF/TOF的碎片信息不足。
Imaging现在很火，但公司里还是使用不多。
希望能够抛砖引玉 |
|
p*******8
发帖数: 158 | 10 Imaging is relatively promising. MaldI's quantification ability is weak,
although it's simple and high tolerance of impurities. Why not do both,
MALDI and ESI? |
|
p*****1
发帖数: 330 | 11 在polymer方面，MALDI 还是最佳选择。
MALDI
But |
|
p*******8
发帖数: 158 | 12 Our lab plans to buy one, but not sure how much budget will need for regular
-use basis. So can you tell me approximately how much for a simple MALDI or
MALDI-MS/MS, based on your experience. I know I can quote with different
companies such like AB Sciex, Bruker, or Micromass. However, I won't be
bothered by their agents right now during this beginning step . By the way,
tell me instrument type and specifications as possible as you can. Thanks. |
|
y***l
发帖数: 1095 | 13 我现在需要design一节实验课，是给高年级本科生major的，三小时长左右的主要用
MALDI-TOF。我们有ULTRAFLEXIII MALDI-TOF一台，但我其实对MS懂的不多，只是附带
着管一下MS，以前的MS经验也不多。我能想到的也就是给个PROTEIN,让学生用TRYPSIN
DIGEST，然后测PEPTIDES，然后做DATABASE SEARCH。但是觉得这个太普通了，就想知
道大家有没有新颖一点，好玩一点的IDEA，有详细步骤更好了，因为偶比较外行的说。
谢谢！ |
|
w******n
发帖数: 13202 | 14 如果是MALDI，是不是教一点imaging的东西，MALDI的特别之处在此。现在也很热。不久的将来，应该是会有很实在的运用。实验设计也不是很难。 |
|
w******n
发帖数: 13202 | 15 哦，这样的话，不推荐用MALDI-TOF，建议做高分辨质谱，比如orbitrap之类。
如果有FT-ICR也可以。
就分子鉴定而言，的确是要ppm非常小了，你2000-4000的分子量，还可以做的很精确的
。electrospray问题不大。
再不济也可用ion mobilty的G2，虽然也是TOF，但是要好很多。
纯粹的MALDI-TOF的强项不是分子鉴定，1000以内还可以凑活，2000以上，就不合乎发
文章的要求了。 |
|
t*****m
发帖数: 73 | 16 平常一直做的是protein,peptide的MALDI，这几天老板让我测一个合成的copolymer，
一半是ammounium iodide的端基,一半是-O-COC(CH3)2Br的端基.M大约3000.查了一下文
献，基本上都是测中性高分子的，除了加Matrix外还要Sodium salt作为cation agent.
我的Matrix用的是2,5-DHB,salt试了NaI和sodium trifluoroacetate.但都不能得到任
何信号，除了在低分子量附近有DHB的峰，剩下的都是噪音。DHB用于高分子的MALDI好
吗？salt选什么好？谁有经验的指导一下！3ks! |
|
T**********t
发帖数: 1604 | 17 请问一下大家一般都送lysate样品去哪儿做2D-Gel+MALDI-TOF？
想找一家价格公道效果也好的，没经验，大家不要见笑。。。
谢谢！ |
|
g****b
发帖数: 143 | 18 【 以下文字转载自 Faculty 讨论区 】
发信人: getjob (bright), 信区: Faculty
标 题: 求牛教授们推荐一片MALDI-TOF做蛋白结构的综述
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 8 10:59:36 2011, 美东)
网上太多，看不过来。
本人外行，不知道选哪一个。知道的牛牛请出来指点一二。
多谢 |
|
b******y
发帖数: 627 | 19 Since when MALDI-TOF can be used for 蛋白结构???? |
|
g****b
发帖数: 143 | 20 MALDI-TOF-MS analysis of protein and DNA.
用analysis可以吗？准确了吗？结构也可以是化学结构，不一定是二级结构。（即使是
二级结构，也可以帮助推断啊。） |
|
r****1
发帖数: 2299 | 21 MALDI TOF能否用来测量POLYMER SIZE DISTRIBUTION呢？一般用什么MATRIX？ |
|
y***e
发帖数: 6082 | 22 当然可以，去看看review吧，有篇MALDIfor polymer的，我记得
MALDI TOF能否用来测量POLYMER SIZE DISTRIBUTION呢？一般用什么MATRIX？ |
|
a****g
发帖数: 62 | 23 First of all, not all polymer can be ionized by MALDI. The polymer has to
contain conjugated structure or heter-atoms. Even if the polymer is
ionizable, mass discrimination can be a issue if molecular weight
distribution is too wide.
Why don't you use GPC instead? |
|
r****1
发帖数: 2299 | 24
GPC没做过，不太会啊，看起来比较麻烦，还要有STANDARD来CALIBRATE。如果能用
MALDI看出来就简单很多了。 |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 25 what kind of MALDI do you use?
I often trapped my target plate into the chamber, don't worry. |
|
y***e
发帖数: 6082 | 26 你老板还对你喊打喊杀？
what kind of MALDI do you use?
I often trapped my target plate into the chamber, don't worry. |
|
a******z
发帖数: 1464 | 27 偶经常把bruker得maldi大卸八块，抢救target，呵呵 |
|
h*****e
发帖数: 1330 | 28 已经酸解成氨基酸了，再PITC衍生， 然后HPLC，接着MS（用MALDI/NALDI-TOF），感觉
测不出来 |
|
K****l
发帖数: 861 | 29 最近刚开始用Maldi-MS做DNA
之前用3-HPA/Ammonium in ACN/water作matrix打了几次...都没有信号...
版上有做过类似样品的吗？有什么需要注意的地方吗？
希望不吝赐教
谢谢先... |
|
|
K****l
发帖数: 861 | 31 太感谢了...大赞~~~
能再问一下，你们一般选什么“方法”？我这边MALDI上只有蛋白的方法...
激光强度打多少？大概，30%可以吗？
谢谢 |
|
z**********d
发帖数: 333 | 32 虽然说MS工作机会多，大部分都是小分子，electrospray什么的，做MALDI研究大分子
比如protein, peptides,DNA，工作机会好像不是很多，不知道本领域还能不能有突破
。求高手解答一下。 |
|
p*****1
发帖数: 330 | 33 前提是能够得到good signal, 如果分子量过大，或者样品不够好，ESI会有困难。当然，如果能得到很好的signal，ESI还是优于MALDI |
|
y***l
发帖数: 1095 | 34 谢谢。我再抓住高手问一下，有些有机组里的人，用MALDI-TOF不出峰，但是如果在样
品SPOT后再加一点CuI就出峰，这是什么 原理？ |
|
K********A
发帖数: 917 | 35 帮助IONIZATION？MALDI不熟。估计是Cu2+能络合到被测物上增加charge |
|
b*********2
发帖数: 190 | 36 You may start the session with analyzing simple peptides, or peptide
mixtures. Then follow with the digested protein and database search.
3 hours is pretty short,especially if they have no hands-on experience with
MALDI before. |
|
y***l
发帖数: 1095 | 37 嗯，是的只一个三小时的SESSION的话，做PROTEIN 不合适，而且我自己也没有经验，
所以不做那个好了。要不就买A, B, C, D, E五种PEPTIDE，告诉他们是哪五种，一人给
一个未知PEPTIDE MIXTURE，大概有两三种PEPTIDE，然后每人做一个MALDI，用M/Z判断
自己有哪两三种PEPTIDE，不知道这样会不会太简单。。。
还是说不告诉他们A,B,C,D,E是什么，每一个再做MS/MS，然后根据MS/MS自己推是什么
PEPTIDE？或者有什么网上的数据库可以用的？ |
|
f*********e
发帖数: 1144 | 38 rite, additionally, pierce spin column may complete the process in 15min....
reduction and alkylation will help a lot as well. But sample prep itself is
a big deal for maldi. My suggestion is just to simply mix peptide standards
together. Enough for 3 hours undergrad course.
extent |
|
y***l
发帖数: 1095 | 39 谢谢！很喜欢这个设计，我会给peptide unknown和protein unknown，这样他们可以分
别用RP mode和LP mode，考虑到虽然train一个人，一小时是够了，但本科生要排队用
机子吧，三小时应该差不多了。我觉得用三种方法点板挺好的。不过题外问一下你们这
些常做MALDI的人，这三种点板方式，在实际应用中你们觉得哪种好呢？或者说对于不
同的analyte，有各自适合的方法？
mix |
|
w******n
发帖数: 13202 | 40 打开source很简单，实验室没有人负责clean source的人吗？maldi要经常clean的。我
们这里几乎一个星期clean两次。我闭上眼睛都可以做了。
找人教一下吧，应该不需要service. |
|
l*******e
发帖数: 121 | 41 懂点maldi，可惜不懂nmr
★ Sent from iPhone App: iReader Mitbbs Lite 7.56 |
|
s*****s
发帖数: 255 | 42 Anybody here know MALDI-TOF, bruker?
One of my friend uses it and want to know if any free version software can
analysis its output file? Any ideas?
Deeply appreciate! |
|
b******e
发帖数: 545 | 43 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: baicaiye (baicaiye), 信区: Chemistry
标 题: 求教：MALDI TOF质谱的精确度
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jun 8 21:11:11 2015, 美东)
谁能给讲讲ＭＡＬＤＩ ＴＯＦ质谱的精确度的允许范围。
我的质谱误差从２０到５００ｐｐｍ之间，能用吗？我的分子的分子量在２０００－４
０００之间，是一系列不同分子量（不同数目的取代基）的化合物的混合物打出来的。
误差到了３００ｐｐｍ （分子量差别就是０．５－１．５之间吧）左右的话能报道吗？
如果能有相关的文献就最好了
谢谢！ |
|
d*****r
发帖数: 39446 | 44 【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
maldi 已经成为本俱乐部的正式成员, 特此通知. |
|
d*****r
发帖数: 39446 | 45 【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
maldi 已经成为本俱乐部的正式成员, 特此通知. |
|
d*****r
发帖数: 39446 | 46 【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
maldi 已经退出本俱乐部, 特此通知. |
|
d*****r
发帖数: 39446 | 47 【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
maldi 已经成为本俱乐部的正式成员, 特此通知. |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 48 你果然是MALDI imaging 黑啊
不过你提的问题都是不错的问题，也确实是目前MALDI imaging存在的问题
不过还是那句话，LC/MS不是万能的，MALDI imaging确实是有力的补充
in situ的检测还是跟萃取得到不一样的信息的，比如萃取可能会破坏一些native
conformation,有时native conformation disorder才是关键。
另外有时biomaker分布才是关键，如果萃取的话，
每一块tissue都dissect出来还是比直接imaging烦很多
现在的MALDI的速度跟自动化程度，跟数据处理都提高很多了，
imaging的速度很快，关键是样品制备，也比以前快跟容易很多
还有你前面说的定量的问题，也不是不可以解决的
另外现在imaging 慢慢开始朝bioimaging以外的方向发展，这些都蛮有意思的
总之，不是一无是处，还是有research的意义所在的
imaging |
|
w********g
发帖数: 447 | 49 MALDI imaging确实没啥工作。虽然每个大药厂里都有人搞，但是人数也就是一两个。
一般需要MALDI imaging support的project很少很少，所以不会大规模的雇佣人做这个
。早两年运气比较好靠这个进公司也就进了。当时靠这个找到工作的很多人现在也不是
full time的做maldi imaging，因为其实根本没什么活可做。大部分在公司玩maldi
imaging的最后都变成了副业。也就是闲下来没事，发两个paper玩玩，在公司里面增加
点exposure。还有很多人最后在部门内干脆都转行干别的了。现在一般很少有公司专门
雇人做这个，之前一波招的人足够用了。 |
|
m******r
发帖数: 1904 | 50 ☆─────────────────────────────────────☆
hmis (hmis) 于 (Sat Aug 4 22:21:02 2012, 美东) 提到:
请在此贴后报名。 名额有限，报名截止70楼.
此次的 VIP 名单（上次match talk第四季 写感想的童孩）
Meganli1998
cusmle
Ashlin
kittencute
wherewhen123 同声传译
Sarah
mmmouse2010 (mmmouse2010)
zilkr00 (Rubimaks)
gosarah
alexanda (鸭梨山大)
Sarah2 (Sarah)
incentive (incen)
hanabi (Ken)
walleva (eva)
lancom2008 (xiaoxiao)
xiaobeibao (小背包)
zilkr00 (Rubimaks)
pking
ilovemilktea (milk tea)
ducklingdong
xiaoliuliu (xiaoliuliu)
dongyang (dongyang)
leeky1978 (le... 阅读全帖 |
|
