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发信人: affymm (no), 信区: Biology
标 题: 怎样用R 来提取 micrarray 中的regressor variable 的值?
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 2 11:14:36 2009, 美东)
我们用Lmfit 来做回归，原理上是所有的点都有Signal = u + Line + Treat + e, 的
linear model, 我们只知道signal的值，其他的variable的值只能通过这个linear Model得
到， 问题是怎样在R中把细胞系（line）和处理效应（treat）的值取从Linear model得出来，只
知道 怎样取 residue, like fit=lmFit(mymean,design),
Res=residuals(fit,mymean),不知道这个
LmFit对mix model合适不合适？ Signal=u+Line+Treat+Line*Treat+e (mixed model)?
谢谢 |
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