b****r
发帖数: 17995 | 1 为什么说找到driving mutation有那么难。我一开始就讲了，现在是做不到，到时候只
要筛的病人，癌组织够多，真正的driving mutation总是会信号越来越强的。因为
driving mutation只要出现了，在它的子代细胞里基本上就总是在那里，类似于我们人
类最后都能用遗传方法追溯到我们唯一的那个母亲，lucy
function 方面的seq我认为不是根本道路。function的东西变化太多
关于你的第三点，首先epimutation也是NGS的强项。另外我不认为epimutation会是致
癌的主流。大部分epimutation根本就不稳定，它在自己那一代细胞里是会造成一些变
化，但你如何指望它都能一代代传下去，造成雪崩一样的本质改变-失去控制的癌变？
起码我没有看到什么好例子
3,
rewire
pathway. |
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j***z
发帖数: 105 | 2 几天不见楼这么高了啊，再次感叹下LZ的挖坑能力。
再谈谈NGS和targeted therapy的问题：
个人觉得NGS的作用是找到potential driver mutation，其意义一是可以为研究提供重
要的信息，二是如果这个mutation是直接druggable的话对于临床治疗有很大意义。和
LZ观点不同，我认为找到怎么target绝大部分的mutation还是一个非常大的挑战，例如
p53和ras, 被发现20多年了还是没有任何有效的治疗方法。所以就算90%的signaling
pathway in cancer的文章都是垃圾但是这方面的研究还是有很大意义的。
可以预见的是由于targeted therapy的发展，未来的十年很多癌症的治疗会有进展-病
人寿命延长，生活质量上升。但是从整体上来说癌症的攻克还是从prevention和early
detection上比较靠谱，lung and colon cancer就是好例子。这点NGS也会很有前景，
这期的science刚有一片文章关于这个：
http://www.sciencemag.org/content/337/6... 阅读全帖 |
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Z**********g
发帖数: 222 | 3 不认为Next Gen Seq在未来可以解决cancer问题。
1.可以认为cancer是基因病，但这是个复杂的基因病。每个肿瘤的突变谱都不一样，每
个肿瘤在不同阶段的突变谱不一样，每个肿瘤在同一阶段不同位置subclones突变
谱也不一样。肿瘤演化是divergent和branched的，如何找到属于特定时间和空间上的
某个肿瘤的真正元凶？在时空上你得知道下一阶段哪些个subclones会dominate。
2.很难说肿瘤的生长是否真正依赖于特定些个mutations。 Oncogene additive现象仅
仅发现于很少数的oncogene上。肿瘤很可能不会真正依赖于某个或某些个driving
mutations上。
3.即使找到了真正的driving/maintaining mutations,它们一定是可以druggable吗？
很多靶点根本不具有druggability。
4.耐药性往往是致命的问题。你还得通过Next Gen Seq建立耐药谱？！
5.肿瘤不单纯是基因病。Epigenetics是重要的因素，microenviroment也是重要的cell
non-aut... 阅读全帖 |
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Z**********g
发帖数: 222 | 4 离治疗还远着吧。结直肠癌中APC, TP53, SMAD4,and KRAS mutations早八百年就知道
了吧，现在有靶向这些的药物吗？？更别说新鉴定的mutation了。对病人有用的信息可
能就是KRAS mutation，可以指导是否用panitumumab或cetuximab靶向药物。 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 5 预先打了伏笔了哈 Wo Kao Nature News
Performance enhancement: Superhuman athletes
Enhancements such as doping are illegal in sport — but if all restrictions
were lifted, science could push human performance to new extremes.
Helen Thompson
18 July 2012
Code breaking
Gene doping — enhancing performance by adding or modifying genes — has
been the subject of locker-room gossip for the past ten years. There are
plenty of natural mutations for which to wish. The Finnish cross-country
skier Eero Mäntyrant... 阅读全帖 |
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S*********s
发帖数: 304 | 6 最基本的一条就是癌细胞harbors a lot of mutations,
这些mutant蛋白需要正确folding的话需要chaperon来辅助。
例如，lots of cancers have kinase mutation or overexpression.
这些kinase需要hsp来辅助他们folding.
Neal Rosen同志一直在推Hsp90 inhibitor的clinical trial,
但目前为止没有很好地结果，(GARAMYCIN,17-AAG等一系列衍生物)
其实很多东西都能抑制Hsp90,植物及中药中的很多terpinoid家族化合物都可以。
中药不能乱吃啊~~刚刚三期被terminated kidney failure drug RTA402本身就是
Hsp90 inhibitor,虽然一二期骗了很多钱，但最终还是以失败而告终。
业界及学界都不看好Hsp90 inihibitors,原因主要有二：
一方面是由于是没有特异性，后期toxicity会很难办。
另一方面，由于Hsp90/cdc37 complex是kinase的chaperon,
所以... 阅读全帖 |
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r******k
发帖数: 446 | 7 这是真的。 有idh mutation的病人survival 本来就要长于没有idh mutation的 病人
。 主要有idh mutation的glioma多为secondary GBM， 比primary GBM更为benign。 |
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f******g
发帖数: 1003 | 8 IDH1(R132H) mutation increases murine haematopoietic progenitors and alters
epigenetics.
Nature, 2012
These alterations are gain-of-function mutations in that they drive the
synthesis of the 'oncometabolite' R-2-hydroxyglutarate (2HG).
These mutants show increased numbers of early haematopoietic rogenitors and
develop splenomegaly and anaemia with extramedullary haematopoiesis.
表型不是特别明显。
是不是可以人为IDH1的突变只是helper mutation呢? |
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r******k
发帖数: 446 | 9 Knock out? 一般不会做IDH1 knock out， 因为没有任何意义。在glioma和leukemia中
，只存在idh1的mutation，但是不存在deletion， 跟pten什么的还不太一样。 一般都
是做idh1/2 mutation的KI。
target在brian里面的idh mutation的KI的mice是胚胎致死的。 |
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P*******e
发帖数: 27 | 10 After reading the comments about NIH, it seems to me people here has a
misunderstanding about the drug discovery process. People seem to believe
the drug discovery has always progressed like this: target---pathway---
cellular model---animal model---human beings. Indeed this is the well
publicized model or paradigm. But years ago, people used a phenotypic
screening to search for drugs without knowing targets, often directly on
animals. For anti-cancer drugs, many old ones were discovered without
... 阅读全帖 |
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r*******y
发帖数: 48 | 11 1. 我没有做的很细致，但是我看到了dnHes1能antagonize WT Hes1 induced promoter
activity.
That is good;
2. 保守的序列我已经做了突变，但是仍然能看到WT Hes1的激活作用，因为有好几个
potential Hes1 binding sites，所以我不能排除其它的位点不起作用。我现在在做
truncation mutation，想找到Hes1 responsive element。
how long of this promoter you tested? mutation of that conserved binding
site resulted in how much percentage of reduction in its activation compared
with that of the WT promoter by Hes1? in most cases,it w ill not be only
one site that contributes 100% to that activation... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 12 cited from OX dot ac dot uk
6 gene sequencing test for cancer patients on the NHS
Health
Science 25 Mar 13
The first multi-gene test that can help predict cancer patients' responses
to treatment using the latest DNA sequencing techniques has been launched in
the NHS, thanks to a partnership between scientists at the University of
Oxford and Oxford University Hospitals NHS Trust.
The test detects mutations across 46 genes in cancer cells, mutations which
may be driving the growth of the cancer in... 阅读全帖 |
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s******s
发帖数: 55 | 13 http://www.reuters.com/article/2013/05/15/us-cancer-chemo-idUSB
(Reuters) - After decades of using one-size-fits-all therapies to combat
cancer, doctors are using new tools to help decide when their patients can
skip chemotherapy or other harsh treatments.
An approach to oncology that has been in place for decades is beginning to
yield to an arsenal of long-term clinical studies, genetic tests and novel
drugs that target cancer cells and their infrastructure.
"What is happening is a combination ... 阅读全帖 |
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l**********t
发帖数: 5754 | 14 Thanks.
These experiments are about the mutation outcome distribution (whether the
distrubtion following a particular pattern, say uniform) conditioning on
control factors. Logically, you can prove whether the outcome fits a
particular pattern, but you can not prove with certainty that the outcome
does not fit any pattern.
So these experiements do not answer the fundamental qustion that I have
asked you-- when new species are formed by gene mutations, whether these
mutations are spontanous and... 阅读全帖 |
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n***w
发帖数: 2405 | 15 这两年视觉研究的地震不少，
rd8这个新的突变于12年报导出来，对搞视觉研究的震撼很大，所有实验室回去筛选有
没有这个mutation，因为这个mutation和其他的rd突变不太一样的一点是除了直接的导
致视网膜退变，还有一些其他的表型，这个突变在c57bl/6n的老鼠里，c57bl/6j的没有
事儿。以至于之前有用这个6n做的模型发在很好的期刊上的文章，作者立马回去检查，
重复，确保表型和这个突变无关。
而这段时间的地震是RGC-5这个细胞系，大家也许都听过这个细胞，这个最开始是rat
ganglion cell line，但是呢，最近发现，这个细胞系其实没有在originator's实验室
外存在过，现在流传的RGC-5实际上已经mouse origin的cone photoreceptor cell
line。。。。这个很震惊，因为从最开始到现在已经过去了10多年的时间，用这个细胞
株发表的文章也超过了200多篇，也就是说，究竟有多少结论是站得住脚的，我们无法
得知了。
所以几个vision的journal都相继出社论来警告尤其用细胞系来做实验的，建议要用in
vivo或者pr... 阅读全帖 |
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l******3
发帖数: 25 | 16 请教各位一个问题
我之前转了特定的shRNA，然后建了一个基因knockdown的细胞系。现在我需要在这个细
胞系上转同一个基因的一个mutation，但是之前的shRNA应该会对这个mutation有影响
吧，是不是要先把这个mutation先做个突变然后再转？
有类似经验的朋友吗？请指教
多谢
有好建议的朋友注定有好运：-） |
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T****u
发帖数: 424 | 17 不是医生，只能提些建议。最好还是多咨询医生。
1. 保护孩子首先。
2. 从你描述的症状来看。应该是不能代谢长链脂肪酸, 没法beta-oxidation
LCHAD=Long-chain 3-hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase deficiency
VLCAD=Very long-chain acyl-coenzyme A dehydrogenase deficiency
最后导致长链脂肪酸堆积，导致肝损伤，直至肝硬化。
3.避免长链脂肪酸。这类的疾病用Carnitine or MCT (medium chain triglycerides)
oil supplement.跳过长链脂肪酸代谢那一步(请尊医嘱)
4.我想应该是long chain FA氧化通路上的基因的mutation导致的。
Arnold W. Strauss, MD
是做这方面研究的。你可以试着跟他联系，也许他会感兴趣，可能会帮你检测这些
mutation.
http://www.cincinnatichildrens.org/research/divisions/d/dhc/... 阅读全帖 |
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y**********n
发帖数: 478 | 18 bless宝宝
先尽力回答LZ在另外一个帖子里的前几个问题吧：
1 全基因测序是不是有很多遗传病其实也测不出来，是不是和数据库有关？
是的。只有确定了基因－疾病关系的才能检查出来。另外不同的数据库差别也比较大，
有的更新很慢。
刚才搜了下，这里有最新的关于NICCD的进展，估计新鉴定的这些突变都没有被分析。
By means of direct DNA sequencing, cDNA cloning and SNP analyses, 16 novel
pathogenic mutations, including 9 missense, 4 nonsense, 1 splice-site, 1
deletion and 1 large transposal insertion IVS4ins6kb (GenBank accession
number KF425758), were identified in CTLN2 or NICCD patients from China,
Japan and Malaysia, respectively, making the SLC25A1... 阅读全帖 |
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n**e
发帖数: 2026 | 19 同意，这是权威解释。前一段在这里；
The major hurdle that must be overcome in the development of new inbred
strains from wild populations is inbreeding depression which occurs most
strongly between the F2 and F8 generations. The cause of this depression is
the load of deleterious recessive alleles that are present in the genomes of
wild mice as well as all other animal species. These deleterious alleles
are constantly generated at a low rate by spontaneous mutation but their
number is normally held in check by th... 阅读全帖 |
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s******3
发帖数: 7 | 20 The lab of Chuck Sanders at Vanderbilt University has an opening for a
postdoctoral fellow to conduct studies of the structure, folding, and
function of the human KCNQ1 potassium channel.
KCNQ1 is a critical voltage-gated channel in the cardiac action potential.
Mutations in KCNQ1 and its modulatory partner, KCNE1, result in various
cardiac arrhythmias, including long QT syndrome and sudden infant death
syndrome. Mutations can disrupt normal channel function by disrupting
folding, by altering ... 阅读全帖 |
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m*********D
发帖数: 1727 | 21 嘿嘿，准备赌一把。
我这个要mutate的基因是我要用的host cell生长必需的，是一个激素受体。mutant呢
，据说不需要激素也有活性了。所以，就想用没有激素的medium来筛选。希望wt的长不
出来或很慢。
另外，和老板谈了一下，理想状态是两个拷贝都mutate.但一个也能接受。我在想，要
是一个拷贝被knockout,一个被mutate也行。所以，strategy上，我想用两个guide
sequences.两个相距不远，大约是40 bp away。老板让我线赌一把，实在不行，就分两
步，先作stable cell line, 把mutant在这个细胞里表达，然后再来个CRISPR
knockout。
多谢你的指导和建议！这里真不错，都是同行，能相互学很多东西。 |
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r*****m
发帖数: 3619 | 22 跟着米犹吸毒抽风，不晓得自己拿出文章来证明下一个driver mutation 是什么，叫嚣
着让别人证明。
下一个driver mutation 是哪个？说啊？讲啊？上面这些文章只讲了一件事，那就是没
有下一个 driver mutation |
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G******n
发帖数: 289 | 23 不是专家，只是正好做这方面的。
是对表皮细胞检查的。理论上DNA是一致的，除非口腔细胞有突变，且突变数量的细胞
数目足够多。大家习惯性用血液，其实唾液也可以。23andMe就用的是唾液。主要是看
germline mutation。
你要注意看看他们提供的这100个疾病都是什么，每个疾病覆盖多少gene，每个gene覆
盖多少区域，只是coding region还是包括intron和intergenetic。对于某些疾病，预
测性较好，其他的大多数很差……
而且要结合你的ethnicity 和其他character进行预测。
通过这个唾液检测发现的mutation，你可以再order further testing，针对某几个比
较严重的mutation做深一步的test，比如用血液。 |
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l********n
发帖数: 260 | 24 Rank full journal title Total Cites IF
1 ca-a cancer journal for clinicians 18,594 115.84
2 new england journal of medicine 268,652 55.873
4 lancet 185,361 45.217
6 nature biotechnology 45,986 41.514
7 nature 617,363 41.456
12 nature materials 64,622 36.503
13 jama-journal of the american medical association 126,479 35.289
14 nature reviews immunology 28,938 34.985
15 nature nanotechnology 34,387 34.048
16 ... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 25 没错，到底效果如何，都是试出来的，现在都是预测而已。
也许有很多新的driver mutation被挖出来也不一定。虽然说单个就能致病的driver
mutation可能如你所说挖得差不多了，但也许对于任何一"种"肿瘤，实际上其实是很多
种完全不同的肿瘤，癌种是由两个或者多个driver突变的 组合 来定义，治疗方案（不
一定要Imatinib 或者全反式维甲酸这样直接针对突变本身，可以是几种已有的化疗方
案中的一种）才是最优的。这个在血液系肿瘤的临床应用中已经很普遍了，实体瘤则还
有很多工作要做。这个你刚才也基本提到了。
这个中间有很多重要的工作需要完成，一方面是对肿瘤的进一步测序分析（临床学家，
遗传学家和生物信息学家来做这个），一方面是研究这些突变的组合，哪些才是最具有
生物学意义的（其他那些只是passenger mutation），这个是做信号通路的人的拿手好
戏。然后就可以针对这样的组合来进行药物筛选，高通量lab，动物中心和药厂来做这
个工作 |
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b****r
发帖数: 17995 | 26 没错，到底效果如何，都是试出来的，现在都是预测而已。
也许有很多新的driver mutation被挖出来也不一定。虽然说单个就能致病的driver
mutation可能如你所说挖得差不多了，但也许对于任何一"种"肿瘤，实际上其实是很多
种完全不同的肿瘤，癌种是由两个或者多个driver突变的 组合 来定义，治疗方案（不
一定要Imatinib 或者全反式维甲酸这样直接针对突变本身，可以是几种已有的化疗方
案中的一种）才是最优的。这个在血液系肿瘤的临床应用中已经很普遍了，实体瘤则还
有很多工作要做。这个你刚才也基本提到了。
这个中间有很多重要的工作需要完成，一方面是对肿瘤的进一步测序分析（临床学家，
遗传学家和生物信息学家来做这个），一方面是研究这些突变的组合，哪些才是最具有
生物学意义的（其他那些只是passenger mutation），这个是做信号通路的人的拿手好
戏。然后就可以针对这样的组合来进行药物筛选，高通量lab，动物中心和药厂来做这
个工作 |
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o*******a
发帖数: 242 | 27 Nature. 2015 Apr 30;520(7549):683-7. doi: 10.1038/nature14412. Epub 2015 Apr
15.
A molecular mechanism of artemisinin resistance in Plasmodium falciparum
malaria.
Mbengue A1, Bhattacharjee S1, Pandharkar T1, Liu H2, Estiu G2, Stahelin RV3,
Rizk SS1, Njimoh DL4, Ryan Y1, Chotivanich K5, Nguon C6, Ghorbal M7, Lopez-
Rubio JJ7, Pfrender M8, Emrich S9, Mohandas N10, Dondorp AM11, Wiest O12,
Haldar K1.
Abstract
Artemisinins are the cornerstone of anti-malarial drugs. Emergence and
spread of resistanc... 阅读全帖 |
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m*********D
发帖数: 1727 | 28 你是说发一个method? 关键是你真要引进一个mutation的时候，你这插入的两个“带有
不同的颜色”的HDR templates（大约是表达GFP一类吧）就会影响你想改变的基因的表
达吧？类似的已经发表了，但只用了一个带颜色的template （GFP),你看看
BioTechniques,57:115-124.他们拿到homozygous的概率蛮高的，有没有必要两个不同
颜色的template，会有疑问。
我最近也完成了point mutation，都是只改变一个amino acid,发现拿到的homozygous
的概率大约是拿到heterzygous的一半。但拿到heterzygous的概率大约是1 out of
1000-1500 transfected cells. 也就是homozygous的概率是大约1/2000-3000。我是用
了mutant的特性来筛选的，没有在HDR template插入任何东西，就是引入point
mutation和几个不改变amino acid的突变，如restriction enzyme sites. 没有筛选，
确实比较费劲。 |
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m*****e
发帖数: 129 | 29 Rank Full Journal Title Total Cites Journal Impact Factor
1 CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS 20,488 131.723
2 NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE 283,525 59.558
3 NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY 25,460 47.12
4 LANCET 195,553 44.002
5 NATURE BIOTECHNOLOGY 48,650 43.113
6 NATURE REVIEWS IMMUNOLOGY 31,545 39.416
7 NATURE MATERIALS 72,306 38.891
8 NATURE REVIEWS MOLECULAR CELL BIOLOGY 36,784 38.602
9 NATURE 627,846 ... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 30 It's an interesting question. To the best of my knowledge, no RNA-seq
alignment tool was designed to tolerate CRISPR-mediated indels to date. I'm
not an RNA-seq expert, so it's possible that there are some on the way. You
can also email Luca Pinello, the author of CRISPResso. He might know more,
and he's a really nice guy.
Here I'm trying to think about a solution. There are two situations - I don'
t know which one is your case.
a) The sample for RNA-seq was derived from a single mutant clone. I... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 31 如果进行单细胞外显子组测序，越早出现的driver mutation，应该在大部分细胞含有
，而越晚出现的passenger mutation，则只有少部分细胞含有。
是不是？有没有这类研究？
[在 postdogtoral (to-be-postdog) 的大作中提到：]
:driver有选择优势，但是只占突变的一小部分
:大多数情况下的突变是中性突变
:driver有自然选择，所以driver mutation一般都由许多cancer cells携带，早期的突
:变几乎全部携带
:passenger如果与抗药性相关的话，也会在治疗中受到选择 |
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发帖数: 1 | 32 Synthetic lethality arises when a combination of deficiencies in the
expression of two or more genes leads to cell death, whereas a deficiency in
only one of these genes does not. The deficiencies can arise through
mutations, epigenetic alterations or inhibitors of one of the genes. In a
synthetic lethal genetic screen, it is necessary to begin with a mutation
that does not kill the cell, although may confer a phenotype (for example,
slow growth), and then systematically test other mutations at ... 阅读全帖 |
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b*****n
发帖数: 34 | 33 这两个文章结果不错，但是病人样本太小，病人可能都是精挑细选，更倾向对免疫疗法
有反应的（这个是根据以前一些一期试验的经验，没有依据）。个人对cancer vaccine
持怀疑态度，主要是因为：
1. 这个mutational load theory本身就很有瑕疵，如果看看几篇N Eng J Med的文章，
有疗效和没有疗效的患者mutational burden本身重叠部分就很大，加上现在很多被认
为是low mutational burden的肿瘤类型，对checkpoint反应率也没差太多。所以
antigen response 到了一定程度后，就是看microenvironment的抑制情况了。如果只
是作为maintenance therapy，那就回到20年前了，很难和新一代的制剂抗衡。
2. 即便是早期的cancer testis antigen vaccine, long peptide vaccine 也可以产
生类似于这个文章里的T 细胞反应，不过疗效在established tumour里微乎其微。这两
个文章也是看的复发率，大量的suppressive fact... 阅读全帖 |
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m******c
发帖数: 830 | 34 It's the opposite. Melanoma is the tumor type with the highest mutation load
among all tumor types. Therefore, most immuno-oncology trials start with
melanoma, including PD-1 and tumor vaccines, because high mutation load
means higher tumor immunogenecity. It is a 软柿子. Mutation load in lung
cancer is high, too, and is one of the FDA approved anti-PD-1 therapy
indications. |
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y******m
发帖数: 143 | 35 这是发表在STM2013年的文章，实际上发现了HBV引起的突变和AA signature类似，但是
他们把它归为可能由AA引起的。最精彩的是最后一段，因为这些病人的AA exposure的
信息没法获取，所以推测是由AA引起的。这个还能没牙齿点嘛！！！仔细看了下，2017
年的样本也许就是2013年的样本，这个HBV样本AA signature分布和2017年的图2是基本
一样的。
We detected 11 cases exhibiting strong AA (or AA-like) mutational signatures
using the following criteria: (i) A > T is the most frequent mutation
category or there are ≥10 exonic A:T to T:A transversions; (ii) ≥33% of
the A:T to T:A transversions are associated with a C|TAG sequence context;
and (iii) a s... 阅读全帖 |
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y******m
发帖数: 143 | 36 这是发表在STM2013年的文章，实际上发现了HBV引起的突变和AA signature类似，但是
他们把它归为可能由AA引起的。最精彩的是最后一段，因为这些病人的AA exposure的
信息没法获取，所以推测是由AA引起的。这个还能没牙齿点嘛！！！仔细看了下，2017
年的样本也许就是2013年的样本，这个HBV样本AA signature分布和2017年的图2是基本
一样的。
We detected 11 cases exhibiting strong AA (or AA-like) mutational signatures
using the following criteria: (i) A > T is the most frequent mutation
category or there are ≥10 exonic A:T to T:A transversions; (ii) ≥33% of
the A:T to T:A transversions are associated with a C|TAG sequence context;
and (iii) a s... 阅读全帖 |
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w********g
发帖数: 107 | 37 as your calculation:
( 9/50) x (1/2) x( 1/10) x (1/2)= 0.0045
but the correct answer in this question is (B) 0.045 =( 9/50) x (1/2) x( 1/
10) x (1/2)
Actually, 0.045 is the best answer here but not the perfect one.
I saw another version of this question as below:
A man is a known heterozygous carrier of a mutation that causes
hemochromatosis (AR). Suppose that 1% of the general population consists of
homozygotes for this mutation. If the man mates with somebody from the
general population, wh... 阅读全帖 |
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x****n
发帖数: 893 | 38 in a study of mutations that reduce the activity of a cytoplasmic enzyme, a
mutation is found that results in substitution of an alanine residue for the
serine residue normally present at position 127 in the enzyme. This
mutation is most likely to reduce the activity of the enzyme by preventing
which of the following?
a. attachment of farnesyl group
b. attachment of n-linked oligosaccharides
c. formation of disulfide bonds
d. phosphorylation of the enzyme
e. targeting of the enzyme to the correc... 阅读全帖 |
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d****y
发帖数: 2180 | 39 鱼鳞病英文是：Ichthyosis vulgaris
Ichthyosis vulgaris (also known as "Autosomal dominant ichthyosis,"[1]
and "
Ichthyosis simplex"[1]) is a skin disorder causing dry, scaly skin. It
is
the most common form of ichthyosis,[2]:486 affecting around 1 in 250
people.
[3] For this reason it is known as common ichthyosis. It is usually an
autosomal dominant inherited disease (often associated with filaggrin),
although a rare non-heritable version called acquired ichthyosis exists.
It is generally considered to... 阅读全帖 |
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I****a
发帖数: 407 | 40 1. On the contrary, BRAF inhibitor is used for mutated BARFV600E
2. EGFR monocloncal antibody is only useful in KRAS wild type patient
because mutated KRAS does not need upstream EGFR signaling to activate
downstream targets.
3. EGFR tyrosine kinase inhibitor is good for EGFR mutated patient
4. ALK TKI is good for ALK-EML4 translocation patient. |
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y******a
发帖数: 590 | 41 it's unlikely to be Blau. Blau is caused by an autosomal dominant mutation
of NOD2 gene. if both parents are healthy, the affected kid most likely has
a de novo mutation of the gene. it would be very unlikely for two kids
have same de novo mutation. Blau patients usually have arthritis, uveitis
and granulomatous dermatitis. So, skin biopsy, ophthalmology consult and
genetic test are important for diagnosis. do they have rash and skin biopsy
?
If it's confirmed that they have Blau, oral ... 阅读全帖 |
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yf
发帖数: 272 | 42 It's unfortunate that such a young man is facing serious cancer problem. As
a oncologist, I am here to give my two cents though I haven't seen the
patient yet.
First: What is the type of lung cancer and what stage? This is very
important. If patient has stage four squamous cell carcinoma. There are
limited chemotherapy options. The chemo agent that can be used are Cisplatin
or carboplatin in combination with paclitaxol or Gemcitabine. Some old
regimens such as vinorelbine can be used too. Second... 阅读全帖 |
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d*****c
发帖数: 23 | 43 有人hold吗？公司的研发还在继续，Multikine的三期可能快开始了。
我转封CVM头的信。现在股价短期适中。
－－－－－－－－－
CEL-SCI Corporation Releases Letter to Shareholders
VIENNA, VA, July 7, 2009 – The following letter is being released by CEL-
SCI Corporation (NYSE AMEX: CVM) to its shareholders:
Dear Fellow Shareholders:
Recently we have been hearing a great deal about the pandemic caused by the
H1N1 swine flu. You may think to yourself, this is no big deal since it
does not seem that serious and, look what happened to bird flu - it
disappear... 阅读全帖 |
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O*******d
发帖数: 20343 | 44 你显然是生物外行，科盲。难怪那么幼稚。 要攻击进化论，先把进化论的理论搞清楚
了再发言。
1. Archidiacono, N., Storlazzi, C.T., Spalluto, C., Ricco, A.S., Marzella
, R., Rocchi, M. 1998. ‘Evolution of chromosome Y in primates.’ Chromosoma
107:241-246.
2. Britten, R.J. 2002. ‘Divergence between samples of chimpanzee and
human DNA sequences is 5% counting indels.’ Proceedings National Academy
Science 99:13633-13635.
3. Fujiyama, A., Watanabe, H., Toyoda, A., Taylor, T.D., Itoh, T., Tsai,
S.F., Park, H.S., Yaspo, M.L., Lehrach, H., C... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 45 诺贝尔奖爆露最大丑闻，真相浮出
诺贝尔医学奖项爆露最大丑闻，把奖项给了残害无数生灵，残害人类的日本骗子科学家
。这是人类历史上最悲哀的时刻。我所有的研究都揭示癌症，老年痴呆，糖尿病现阶段
广泛地流行，是日本人几十年孜孜不倦刻意造成的，是一种人造的疾病。他们给亿万的
生灵造成了终生的痛苦，他们应该被送上反人类的法庭去审判，而不是被奖赏。他应该
被逮捕，交代日本人是用什么样的手段伤害全世界无辜的人群的，如何制造癌症，老年
痴呆，糖尿病患者的。如何通过这些人体实验，给医药公司攫取了大量的财富。今年的
获得者是Yoshinori Ohsumi. 查看了一下去年的获得者，竟然也有个日本凶手Satoshi
Omura. 他的研究更是惨不忍睹，他的一生就是罪恶的一生，不知道害死了多少无辜的
人。只有中国的获得者是无辜的，值得敬佩的，以身献身科学的。说到底，如果不是这
些可恨的美国人，日本人传播这些寄生虫，我们的科学家也不用有那么多的牺牲来攻克
这些难题。有一天，我睡在沙发上，发现有人刺进了我的鼻子里，不知道他们往我身上
注射了什么。为什么我知道，因为他们研究的这些东西都用在了我的身上，和我身边的
... 阅读全帖 |
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h*i
发帖数: 3446 | 46 算了，我还是给你科普一下。
基因树是如何排的？是根据一些独特的突变来排的。越老的基因突变，共享这个突变的
基因就越多。为啥说人类是非洲起源的，就是因为非洲以外的所有人都共享一个突变，
在非洲内部，有的人这个突变，有的人没有，学术上就说非洲的基因分化最高。
现在说N。N的定义是具有突变M231的Y基因组。当然，M231出现以后，突变继续发生，
所以N下面还有很多分支。有的突变更老，就离N这个树的根更近，被N下面更多的基因
共享，其起源地的基因分化就会更高。
如果N起源于芬兰，那么，芬兰N的分化就会最高。但事实是反过来的，芬兰人的N基因
分化最低。芬兰人的N都共享一个突变M178，这是在N基因树一片
叶子的地方，离根还差几步，这之间有其他的突变发生，所以说，芬兰不是N的起点
，而是终点。
而在别的地方，比如东南亚，N基因的分化最高，各种N下面的分支都有，所以说东南亚
是N的起源地。
http://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_N-M231#N-M178
Y-chromosomes that display the M231 mutation that d... 阅读全帖 |
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e*u
发帖数: 10016 | 47 山西吉林局地多种动物异常 疑祸起转基因玉米
[导读]大老鼠消失、母猪爱生死胎、狗肚子里都是水，此外，羊也出现异常情况。全国
闻名的生猪集散地，很多村子的养猪业已经变得萧条。而这些出现异常的动物，几乎都
吃过同一种玉米——先玉335。
这是一组我们无法给出一个明确新闻由头的报道，因为诸如大老鼠消失、母猪爱生死胎
、狗肚子里都是水等等动物异常现象，已经存在了一段时间。当地的农民会忧虑，还可
能放弃养殖业，甚至将其当成笑谈。他们逐渐习惯了这种异常，我们却无法视若无睹。
在中国乃至世界，反对转基因和支持转基因的两方都打得不可开交，科学、利益、健康
、破坏……转基因的争议围绕着这些关键词愈演愈烈。我们无意卷入其中，但当种种动
物异常现象摆在眼前，转基因却突然又成了绕不开的话题。也许，争议、发现异常并非
坏事，它可以警醒人类，那些未知的不确定的风险，其实近在身边。
老鼠不见了
——山西、吉林动物异常现象调查
美国的专利记录显示，中国大量种植的玉米种子“先玉335”的父本PH4CV的类别编号指
示为转基因农作物，“如果是这样的话，山西、吉林等地的各种动物异常反应就有了比
较合理的解释”
一直深受鼠患... 阅读全帖 |
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R****a
发帖数: 6858 | 48 大棋局与9/11
来源: ognc 于 2013-02-22 16:08:44[档案] [博客] [旧帖] [转至博客] [给我悄悄
话] 本文已被阅读：63次
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The Moral Decoding of 9-11
By Prof. John McMurtry
(Journal of 9/11 Studies) - I was sceptical of the 9-11 event from the first
time I saw it on television. It was on every major network within minutes.
All the guilty parties were declared before any evidence was shown. The
first questions of any criminal investigation were erased. Who had the most
compelling motives for... 阅读全帖 |
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e*****s
发帖数: 7359 | 49 the key point here is, even you put one of our ancestral species in history
in a same environments a second time, they would not necessarily evolve into
the same intellectual primate like humans again.
Evolution is the result of combined effect of natural selection, mutation,
genetic drift and other factors, among which, mutation and genetic drift are
random, or stochastic, you can not repeat. |
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t******r
发帖数: 8600 | 50 【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: mutate (mutate), 信区: Stock
标 题: 悲催的老实男人们 ZT
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 12 16:43:57 2013, 美东)
干了几年新生儿科医生，开始的时候天真的以为，见到的都是那些刚出生的天真无邪的
小BABY，天天肯定欢乐无比。
干了这么几年才发现，我还是图样图森破，BABY父母的那些事还真是让人纠结，本
吊不是高帅富，好歹有个女神护着，但现在都快有心理阴影了，发几贴发泄一下，说说
平常不敢说的事。
本吊在ICU工作，就是刚出生的有问题的BABY或者有潜在问题的BABY都要送进来护
着，封闭的科室，家长嘛，就在窗口办个手续，我们在窗口问病史不免要问到很多私人
的东西，就是这样的过程就够斗智斗勇的了。
首先问你老婆孕几产几啊？（妈妈刚生完，一般都是爸爸来办手续），很多人都肯
定的回答“第一次怀孕，第一个小孩”。哎，其实你缴费前我就看过产科病例了，孕3
产1，你老婆之前打过2次，你不知道吧，当然我是在心里说得。。。你问我为什么产科
知道，因为一般女人发现自己怀孕都是刚开始的时... 阅读全帖 |
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