b*****s
发帖数: 345 | 1 用这个做dna测序。。。我看还是把心思花在别的，比如nanopore还实际一些 |
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s******s
发帖数: 13035 | 3 CG应该是两块, 一种是整合各种测序仪和技术, 给外面提供服务, 这个
其实做的很不错. 另一方面, 是有自己的测序技术, 这个比较低调, 我有
点记不得了, 可能是read length比较长比较准? 可能做其他测序的辅助,
还是很有好处的. 这两个方面其实都是华大需要的, 一个是自己技术, 一个
是美国市场.
不过, 当年收购CG的时候我们bbs就讨论了, 有这钱还不如投资nanopore,
毕竟技术更新换代太快了, 当然风险比较大.
另外, 前两年惊闻华大研发出自己的测序仪了, 不知道啥牛X的技术, 我就
只看到flyer, 发现技术指标很眼熟, 网上一查和454一模一样. 估计今年华
大又要发明第二代测序仪了,嘿嘿嘿 |
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s******s
发帖数: 13035 | 4 CG应该是两块, 一种是整合各种测序仪和技术, 给外面提供服务, 这个
其实做的很不错. 另一方面, 是有自己的测序技术, 这个比较低调, 我有
点记不得了, 可能是read length比较长比较准? 可能做其他测序的辅助,
还是很有好处的. 这两个方面其实都是华大需要的, 一个是自己技术, 一个
是美国市场.
不过, 当年收购CG的时候我们bbs就讨论了, 有这钱还不如投资nanopore,
毕竟技术更新换代太快了, 当然风险比较大.
另外, 前两年惊闻华大研发出自己的测序仪了, 不知道啥牛X的技术, 我就
只看到flyer, 发现技术指标很眼熟, 网上一查和454一模一样. 估计今年华
大又要发明第二代测序仪了,嘿嘿嘿 |
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c******o
发帖数: 1184 | 5 nanopore 不是想投就能投的
Pacbio 更现实些 |
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h*********r
发帖数: 2844 | 11 我看PacBio最先完蛋吧。都是单分子，long read，但是accuracy高很多。 |
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s****l
发帖数: 10462 | 12 PacBio 难道还在竞争名单上吗？早歇菜了吧。有意思的是Roche竟然跟他签了什么个合
同买断什么来着。Roche眼光绝对有问题。454就买死了，呵呵。 |
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s****l
发帖数: 10462 | 13 要说Illumina老板还是有眼光，买了solexa发了大财。如果ONT成功的话，他居然有15%
的股份。好像好说如果第三家开价买ONT的话，Illumina有优先权同等价格购买。
要看看ONT到底是驴子还是马了。
不过没搞懂，Illumina竟然买Varinata而不是Sequnom |
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s******s
发帖数: 13035 | 15 这个玩意儿好山寨不? 比如改造一下酶, 或者换其他的蛋白一类的. |
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M********r
发帖数: 142 | 16 这么小就能高通量测序？
原理我知道，体积怎么做到这么这么小的？
不贵的话，岂不是每个实验室都能买一个。以后高通量测序会不会变成和QPCR，
western一样的实验，想做就做？ |
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s******s
发帖数: 13035 | 17 这个通量比较小的. 而且应该是一次性的吧, 成本比qpcr高的多了.
这个虽然cool, 不过我还没想出来有啥特别的用途, 除了野外或者
没有facility的实验室, 时间要求比较高的? |
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s****l
发帖数: 10462 | 18 通量应该比较小，另外一款的GridIon大些。不过通量跟体积没有关系，都是分子水平
的体积。 |
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M********r
发帖数: 142 | 19 探测器应该很精密吧 能测到很小的电压变化 怎么做成那么小的？ |
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s****l
发帖数: 10462 | 20 如果只是测电压的话，一个平方厘米上可以做出几百万的感应器，Ion Torrent就是这
样的。
ONT这个不需要洗液（至少一次性的MinIon如此），所以不需要太大容器来装溶液，Ion
Torrent就需要洗液，所以得有几个大瓶子挂外面，但是Ion Torrent的chip也很小，
两三个平方厘米而已。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 21 它这个没这么多. ion torrent是完全电子产品, 像集成电路那么做.
这个我记得低好几个数量级
Ion |
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b****r
发帖数: 17995 | 22 我日，这个太有意义啦。首先按它自己说的，成本，速度，需要的样品两，都极大提高
了。最主要的这玩意是基于单分子而且阅读长度长得多得多。现在的鸟枪技术，漏洞是
很多的，比如重复多一点的地方就几乎map不了。
都这么久了，这次又不给data，我严重认为又是骗人的/！！ |
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s****l
发帖数: 10462 | 23 如果ONT所说的都是可以做到的，除了准确度不高之外（这个一定要提高，否则其他再
好都不行了），其他的都是很显而易见的优点。最大的优点就是sample prep简化，说
是只要6个eppendorf管子。将来还要简化成一步即可的sample prep。加上它的快速性
，基本上任何需要快速知道结果的测序工作它都是首选了。另外，长序列在很多时候有
短序列不可替代的优势，比如splicing。 |
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c*******e
发帖数: 5818 | 24 简单看了一下，没太看懂基本原理，谁给简单讲一讲。sample处理完了，nanoball生成
后，用类似microarray杂交的荧光测序，这probe coverage怎么算，要是穷尽，的多少
啊，另外，如用reference genome，这snp怎么测出。 |
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f*******e
发帖数: 628 | 26 nanoball 是 complete genomics 的东西。 |
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f******t
发帖数: 2699 | 27 对repetitive region算是大问题。靠重复测小片段给大片段纠错，跟用illumina的效
果差不多，基本失去了长片段的意义。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 28 pacbio的反复测和illumina两个概念. |
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f******t
发帖数: 2699 | 29 你是说它绕圈儿测？还是它用自己的小片段给长片段纠错？Pacbio的10K，大片段比例
太低，准确率也不够，对超长的重复序列基本没用，测基因组还是可以的。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 30 绕圈测还是不错的. 不过这pacbio已经死了, idea牛技术跟不上也没用啊 |
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h*********r
发帖数: 2844 | 36 我看PacBio最先完蛋吧。都是单分子，long read，但是accuracy高很多。 |
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s****l
发帖数: 10462 | 37 PacBio 难道还在竞争名单上吗？早歇菜了吧。有意思的是Roche竟然跟他签了什么个合
同买断什么来着。Roche眼光绝对有问题。454就买死了，呵呵。 |
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s****l
发帖数: 10462 | 38 要说Illumina老板还是有眼光，买了solexa发了大财。如果ONT成功的话，他居然有15%
的股份。好像好说如果第三家开价买ONT的话，Illumina有优先权同等价格购买。
要看看ONT到底是驴子还是马了。
不过没搞懂，Illumina竟然买Varinata而不是Sequnom |
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s******s
发帖数: 13035 | 40 这个玩意儿好山寨不? 比如改造一下酶, 或者换其他的蛋白一类的. |
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M********r
发帖数: 142 | 41 这么小就能高通量测序？
原理我知道，体积怎么做到这么这么小的？
不贵的话，岂不是每个实验室都能买一个。以后高通量测序会不会变成和QPCR，
western一样的实验，想做就做？ |
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s******s
发帖数: 13035 | 42 这个通量比较小的. 而且应该是一次性的吧, 成本比qpcr高的多了.
这个虽然cool, 不过我还没想出来有啥特别的用途, 除了野外或者
没有facility的实验室, 时间要求比较高的? |
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s****l
发帖数: 10462 | 43 通量应该比较小，另外一款的GridIon大些。不过通量跟体积没有关系，都是分子水平
的体积。 |
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M********r
发帖数: 142 | 44 探测器应该很精密吧 能测到很小的电压变化 怎么做成那么小的？ |
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s****l
发帖数: 10462 | 45 如果只是测电压的话，一个平方厘米上可以做出几百万的感应器，Ion Torrent就是这
样的。
ONT这个不需要洗液（至少一次性的MinIon如此），所以不需要太大容器来装溶液，Ion
Torrent就需要洗液，所以得有几个大瓶子挂外面，但是Ion Torrent的chip也很小，
两三个平方厘米而已。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 46 它这个没这么多. ion torrent是完全电子产品, 像集成电路那么做.
这个我记得低好几个数量级
Ion |
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b****r
发帖数: 17995 | 47 我日，这个太有意义啦。首先按它自己说的，成本，速度，需要的样品两，都极大提高
了。最主要的这玩意是基于单分子而且阅读长度长得多得多。现在的鸟枪技术，漏洞是
很多的，比如重复多一点的地方就几乎map不了。
都这么久了，这次又不给data，我严重认为又是骗人的/！！ |
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s****l
发帖数: 10462 | 48 如果ONT所说的都是可以做到的，除了准确度不高之外（这个一定要提高，否则其他再
好都不行了），其他的都是很显而易见的优点。最大的优点就是sample prep简化，说
是只要6个eppendorf管子。将来还要简化成一步即可的sample prep。加上它的快速性
，基本上任何需要快速知道结果的测序工作它都是首选了。另外，长序列在很多时候有
短序列不可替代的优势，比如splicing。 |
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c*******e
发帖数: 5818 | 49 简单看了一下，没太看懂基本原理，谁给简单讲一讲。sample处理完了，nanoball生成
后，用类似microarray杂交的荧光测序，这probe coverage怎么算，要是穷尽，的多少
啊，另外，如用reference genome，这snp怎么测出。 |
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