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全部话题 - 话题: nextseq
1 (共1页)
s******r
发帖数: 1245
1
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
nextseq就是一个大号的miseq,miseq缺点就是reads太少很多东西不能做,hiseq一跑
就是一个多礼拜太慢了,一个实验室也很难一下子凑够sample把flowcell填满,一轮实
验要做很久,nextseq有miseq的flexibility和速度再加上能出几百m的reads,算是真
正属于单个实验室做genome的机器,有钱有需求的弄一台应该会很爽
m***T
发帖数: 11058
2
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
MiSeq的read数好像只有15-20M,不够Exome和RNA-seq的。NextSeq应该能满足,但和
MiSeq&HiSeq不同的是新机器似乎只有两个颜色,所以是不是相应的algorithm也有不同
?买之前最好弄清楚

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7
y*****3
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3
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
这里有个帖子里列了几个比较 http://nextgenseek.com/2014/01/how-does-nextseq-500-compare-with-miseq-and-hiseq/
我没仔细看,不过总的来说nextgen500灵活性比较强,有两个档次的通量。
楼上说的那个我之前也没注意到,看了一下,发现dye还是4种,只是拍照从4张/cycle
变成了2张/cycle,然后用信号的叠加来推断4种base,主要是为了加快测序时间。
目前看来好像只有nextgen500采用了这种two channel的技术,不过我估计以后有可能
其他的系统也会跟进。
h*****g
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4
来自主题: JobHunting版 - careerup 150 上一道题 答案没看懂?
9.7 A circus is designing a tower routine consisting of people standing atop
one another’s shoulders. For practical and aesthetic reasons, each person
must be both shorter and lighter than the person below him or her. Given the
heights and weights of each person in the circus, write a method to compute
the largest possible number of people in such a tower.
EXAMPLE:
Input (ht, wt): (65, 100) (70, 150) (56, 90) (75, 190) (60, 95) (68, 110)
Output: The longest tower is length 6 and includes from to... 阅读全帖
h*****g
发帖数: 312
5
来自主题: JobHunting版 - careerup 150 上一道题 答案没看懂?
9.7 A circus is designing a tower routine consisting of people standing atop
one another’s shoulders. For practical and aesthetic reasons, each person
must be both shorter and lighter than the person below him or her. Given the
heights and weights of each person in the circus, write a method to compute
the largest possible number of people in such a tower.
EXAMPLE:
Input (ht, wt): (65, 100) (70, 150) (56, 90) (75, 190) (60, 95) (68, 110)
Output: The longest tower is length 6 and includes from to... 阅读全帖
s****l
发帖数: 10462
6
有人愿意讨论这里面提及的测序技术吗?优缺点,可行性,第一手经验等等
这里面谁现在是赢家很清楚,但是可见的将来和更远的将来谁会赢?
http://cen.acs.org/articles/92/i33/Next-Gen-Sequencing-Numbers-
全文拷贝如下
试试看图能不能贴上
/1407973177171.jpg
/1408028636124.jpg
OVER STORY
Next-Gen Sequencing Is A Numbers Game
As technical and cost barriers fall, instrument firms move their systems
into research and clinical markets
By Ann M. Thayer
Department: Business
Keywords: instrumentation, gene sequencing, diagnostics, genomics, cancer
[+]Enlarge
09233-cover-Openercxd_17647969-690
A... 阅读全帖
p****o
发帖数: 6
7
公司名称:北京诺禾致源生物信息科技有限公司(Novogene Bioinformatics
Technology Co., Ltd)
工作岗位:美国客户经理
工作地点:北京/美国
薪酬:行业内竞争性薪酬,面议
学历要求:生物,农业,医学相关专业,硕士及以上
公司网址:http://www.novogene.com/
联系方式:[email protected]
/* */
一、岗位职责:
负责所在地区的销售及技术支持业务,包括:
1. 潜在客户挖掘,客户关系维护;
2. 根据客户需求提供项目解决方案,负责项目签订;
3. 跟进项目进展,促进项目顺利进行;
4. 积极了解并反馈市场需求、产品竞争等情况;
5. 能够独立完成销售回款任务;
6. 国际会议的组织参加。
二、岗位要求:
1. 分子生物学、医学、农学相关专业,取得硕士及以上学位。有1年以上海外经历,英
语听说读写能力优秀。全面了解基因组学前沿进展,有高通量测序相关经验优先考虑;
2. 本科或硕士阶段学习过遗传学、分子生物学、基因工程原理等相关课程,有分子生
物学实验经验;
3. 抗压能力强,性格坚韧,亲和力强,反应敏... 阅读全帖
n******e
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8
来自主题: JobMarket版 - 【招聘】Novogene美国客户经理
企业总部位于北京市海淀区学清路38号金码大厦,办公面积4,500m2。技术中心位于天
津市武清区,办公面积11,200m2,其中洁净实验室面积约5,000m2,实验室通过认证获
批国家医疗机构执业许可证和医疗器械生产企业许可证。业务网络遍布国内主要城市,
并设立有香港、美国和英国等海外业务中心。
我们建立了目前国内通量规模最大的基因测序平台,包括10台HiSeq X、10台
HiSeq 2000/2500 、5台Ion Proton、4台MiSeq、1台HiSeq 4000、1台NextSeq 500等最
先进的基因测序仪。高性能计算平台目前物理核数3,592个,计算峰值速度73T flops,
总内存17TB,总存储3.2PB,有效地支撑了生命科学研究、农业育种、食品安全和医疗
健康等领域对大数据分析和存储的需求。
经过四年的快速发展,诺禾致源已成长为国内基因行业的领先企业。现为中关村
国家自主创新示范区金种子企业、瞪羚企业、北京市科技研发机构、软件企业、北京市
企事业专利试点单位、国家高新技术企业,并建设有博士后(青年英才)创新实践基地
。申请67项软件著作... 阅读全帖
n******e
发帖数: 57
9
来自主题: JobMarket版 - 【招聘】Novogene美国客户经理
企业总部位于北京市海淀区学清路38号金码大厦,办公面积4,500m2。技术中心位于天
津市武清区,办公面积11,200m2,其中洁净实验室面积约5,000m2,实验室通过认证获
批国家医疗机构执业许可证和医疗器械生产企业许可证。业务网络遍布国内主要城市,
并设立有香港、美国和英国等海外业务中心。
我们建立了目前国内通量规模最大的基因测序平台,包括10台HiSeq X、10台
HiSeq 2000/2500 、5台Ion Proton、4台MiSeq、1台HiSeq 4000、1台NextSeq 500等最
先进的基因测序仪。高性能计算平台目前物理核数3,592个,计算峰值速度73T flops,
总内存17TB,总存储3.2PB,有效地支撑了生命科学研究、农业育种、食品安全和医疗
健康等领域对大数据分析和存储的需求。
经过四年的快速发展,诺禾致源已成长为国内基因行业的领先企业。现为中关村
国家自主创新示范区金种子企业、瞪羚企业、北京市科技研发机构、软件企业、北京市
企事业专利试点单位、国家高新技术企业,并建设有博士后(青年英才)创新实践基地
。申请67项软件著作... 阅读全帖
n******e
发帖数: 57
10
工作地点:北京
招聘人数:20人
(一)、 岗位职责:
1. 跟进项目进展,及时完善项目信息,促进项目顺利进行;
2. 把握项目的时间节点,保障项目在周期内完成;
3. 审核各项报告,各项任务单准确并及时下达;
4. 对于项目出现的问题,及时与实验部门、信息部门及客户方沟通,最终协调解决;
5. 能够解决基本售后问题;
6. 优化项目运营过程中的流程,提高运营效率;
(二)、 岗位要求
1. 分子生物学、生物技术相关专业硕士学历;
2. 工作责任心强、严谨细心,条理清晰,有一定的统筹能力;
3. 具有良好的沟通能力、人际关系处理能力以及组织协调能力,能够承担较大的压力;
4. 善于发现并解决问题,逻辑思维能力强;
5. 熟练使用办公软件;
6.熟练使用英语,读写顺畅
7.有海外留学或工作经验者优先
公司介绍
北京诺禾致源生物信息科技有限公司于2011年03月15日在中关村成立,企业专注于开拓
前沿分子生物学技术和高性能计算技术在生命科学研究和人类健康领域的应用,致力于
成为全球领先的基因组学产品和服务提供者。我们的业务范围包括科技服务和医学健康
。其中科技服务为全球研究型大学、科研院所... 阅读全帖
d**********7
发帖数: 17
11
来自主题: StartUp版 - 创业
有经验的前辈给出出主意吧,我现在在一个NGS实验室主管,有多年分子生物学和生物
信息学经验,最近一个同事鼓动我创业,做NextSeq 相关的服务公司,调查了下市场,
钱景还是很乐观的,我们能做到别人做不了的服务。但是不知道怎么开始,到哪儿去找
投资,完全的没头绪。也欢迎有类似经验和想法的朋友私信我,也许你也能加入到我们
的创业group。
c*z
发帖数: 157
12
来自主题: Biology版 - 回国创业_分子诊断
1000$ 单个样品做library,单独一个lane测?包括bioinfo分析吗?还是直接base
space出结果
如果凑满48/96个,做library, 然后nextseq pool在一起不深度测,感觉现在就做的下来
s*****g
发帖数: 87
13
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
Illumina的新产品,版上有大牛用过没?成本和效果如何?
感觉性能在MiSeq和HiSeq之间
y*****3
发帖数: 961
14
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
我没用过,但是我觉得是个很好的机子。非常灵活,适合独立实验室,医院等。
s*****g
发帖数: 87
15
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
谢谢回复!
我们可以算是一个独立实验室,主要需要做exome sequencing 和 RNA sequencing, 不
需要做de novo human genome sequencing,加上预算有限,所以准备买一台这个试试
看。 Miseq似乎不能满足exome sequencing 的要求。
s*****g
发帖数: 87
16
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
这我倒没注意。谢谢提醒!
c**********6
发帖数: 1173
17
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
是两个颜色
T - green
C - red
A - mix of green and red
G - dark

cycle
y*****3
发帖数: 961
18
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
你说的对,但是不冲突吧。。。
http://res.illumina.com/documents/products/techspotlights/techs
m***T
发帖数: 11058
19
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
我感觉G用dark来表示是不是会有问题?如果是合成错误或其它测序错误导致的dark情
况怎么处理?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7
s*****g
发帖数: 87
20
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
另外问一句,有大牛用过illumina的base space 吗,有必要买他们的这个服务吗?
a********k
发帖数: 2273
21
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
多少银子一台啊?
c******e
发帖数: 124
22
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
我觉得dark没有什么问题,只要一开始的那些碱基G不要太多,这样定位就没有什么问
题,位置定好之后,这里是不是dark都不重要了,因为已经知道这个地方有个cluster
了。
我倒是觉得如果dark了,质量数据是多少就比较不好说了,呵呵。
另外如果是red,green,及其Mix,还有dard, phasing不好做。。。如果MiSeq只用两
种dye,照道理讲read应该更短,因为越到后面越不好phasing。。。
也许我理解错了。
s*****g
发帖数: 87
23
来自主题: Biology版 - NextSeq 500 Desktop Sequencer
一台 $250,000
k*****o
发帖数: 148
24
来自主题: Biology版 - illumina的MiniSeq有人关注么?
缩小版的Nextseq。如果需要经常就测几十M reads,应该用得着
自己买的优势是测序速度快,不用等。但是per read的cost可能比facility 或者公司
测要高。
m******5
发帖数: 1383
25
如题,想pool 18个sample在一个NextSeq flowcell里
有没有什么软件可以check barcode之间的compatibility的?

发帖数: 1
26
来自主题: Biology版 - 大家对Nova seq怎么看?
相当于iPhone7 升级到iPhone7s。
对学术界的facility没啥影响,还是NextSeq好用。速度提高更没用。生物实验也不差
那两三天。
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