c*******g 发帖数: 20 | 1 nwchem初学者很着急的问,
nwchem对激发态优化是不是只能用tddft来做?
tce中的ccsd(t)可不可以用来优化tddft产生的exicted states中的某一个呢、
先鞠躬谢过 |
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h******l 发帖数: 380 | 2 蒋华良,《基于生物信息学的药物新靶标的发现和功能研究》项目首席科学家,男,37岁
,博士。中国科学院上海药物研究所、新药研究国家重点实验室研究员,药物发现与设计
中心主任。国家杰出青年科学基金和中国科学院百人计划获得者。
1995年获中国科学院上海药物研究所博士学位。在国内较早地开展生物大分子复杂体
系超级计算机并行算法和应用研究,发展和完善了一系列生物大分子理论计算和药物设计
方法,开发了从头计算分子动力学并行版;将计算机药物分子筛选软件DOCK4.0移植到国
产超级计算机神威上,并将其并行化;发展并行分子对接软件Parallel-DOCK;将非平衡
态分子动力学模拟软件EGO和大规模计算化学和计算生物学程序NWChem移植到国产超级计
算机上。在应用研究方面,对一系列具有重要生物功能的大分子体系(如钾离子通道、化
学趋同因子受体CXCR4、阿片受体和多巴胺受体),进行了结构模建和分子动力学模拟,
取得了重要结果。针对20余个具有重要药理作用的已知靶标分子(包括酪氨酸激酶、乙酰
胆碱酯酶(AChE)、b分泌酶基、质金属蛋白酶(MMP)和PPARg)进行了药物设计研究,
其中酪氨酸激酶 |
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h********r 发帖数: 821 | 3 CIS也可以,EOMCC也可以,MRCI,MCSCF也可以。。。。。。一般就是制定针对一个态
就可以了(类似gaussian中的root=×)。不过有两点你需要注意:第一是优化用的是
解析能量梯度还是数值的,第二这种计算可能非常非常非常地慢,而且还很可能不收敛
!即使收敛了你也要注意检查是不是你要的态。 |
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h********r 发帖数: 821 | 4 在Mike Frisch的94年paper中只写了公式,列出了Becke的值,没直接说是否重新优化
了参数。当然,在别的开源软件中(如NWChem)b3lyp也就用的是becke的参数值。我想
这些参数值应该由优化过程决定,大致差不多就行了。各种VWN的差异应该比较小。 |
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