c**e 发帖数: 2558 | 1 ☆─────────────────────────────────────☆
proteosome (proteosome) 于 (Sat Apr 4 19:31:21 2009) 提到:
我的情况:
★性别:男
★年龄:1975年
★所在地(起码给出state):CA,redlands
★职业情况(学生还是工作): pH.D在读
★简单的物理参数(身高cm/体重kg):170cm/65kg
★当前婚姻状态(从没结过婚/曾婚/丧偶):从没结过婚
★联系方式(email/IM/站内):p*********[email protected]
希望对方:
★性别:女
★年龄: 比我小或相当
★所在地(起码给出state): 洛杉矶地区
★职业情况(学生还是工作): 无所谓
★简单的物理参数(身高cm/体重kg): 不要求
★当前婚姻状态(从没结过婚/曾婚/丧偶): 从没结过婚
在国内工作多年才来美国读书,生活圈子很窄,实验也很忙。希望找个人能够互相关心
,互相支持。希望mm知书懂理,温和善良。有意者请给我mail,有信必复,有照必复。
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p******n 发帖数: 55 | 2 很多人都说施做的不系统,那就来看看:
http://life.tsinghua.edu.cn/faculty/faculty/317.html
主要科研领域与方向:
1.主要运用结构生物学和生物化学的手段研究肿瘤发生和细胞调亡的分子机制,集中于
肿瘤抑制因子和细胞凋亡调节蛋白的结构和功能研究
2.与重大疾病相关膜蛋白的结构与功能的研究
3. 细胞内生物大分子机器的结构与功能研究
第一个方向是施的老本行,从1999年发第一篇论文,到2015年最新G&D论文,前后17年
,细胞凋亡从来没停过;
第二个方向膜蛋白,主要是在做膜内水解酶,从2006年第一篇论文到本周Nature,前后
10年,一直产出;
第三个方向,好像就是一直在做proteosome和spliceosome。与proteosome相关的第一
篇发表在2005年,spliceosome听说是2008年回清华就开始布局做了。第一篇论文发表
在2013年,
他这些随便哪一个方向拿出来都是可圈可点。
而且施的特点就是基本没有单纯结构文章,都是以机理为主,甚至不少单纯的生化论文
。syg这个人你可以不喜欢,但人家的水平在那里,没必要为... 阅读全帖 |
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p******n 发帖数: 55 | 3 很多人都说施做的不系统,看了看他的主页和论文目录,觉得非常系统。
而且听说他虽然自己是做晶体的,但是早在2008年就力排众议要求清华将结构生物学重
点放到电镜上,一口气招了三个电镜PI,建了电镜平台,有了这个基础后来就争取到国
家蛋白质基础设施的电镜平台放在清华(上海是同步辐射、军科院是质谱组学,现在就
电镜冒尖了)。那时候谁能料到2013年以后电镜大爆呢?说明这个人的眼光相当精准,
不是对领域有深入判断,不可能这么有远见。
http://life.tsinghua.edu.cn/faculty/faculty/317.html
隔行如隔山,请内行来说说他的工作是系统还是追热点,或者兼顾了?我这里抛砖引玉。
主要科研领域与方向:
1.主要运用结构生物学和生物化学的手段研究肿瘤发生和细胞调亡的分子机制,集中于
肿瘤抑制因子和细胞凋亡调节蛋白的结构和功能研究
2.与重大疾病相关膜蛋白的结构与功能的研究
3. 细胞内生物大分子机器的结构与功能研究
第一个方向是施的老本行,从1999年发第一篇论文,到2015年最新G&D论文,前后17年
,细胞凋亡从来没停过;
第二个方向膜蛋白,主要是在做膜内... 阅读全帖 |
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p********e 发帖数: 11 | 4 为申请绿卡作准备,苦于缺乏独立审稿机会(给老板审过几十篇,包括stroke,JCBFM,
JCI,Journal of neuroscience etc.,审稿经验丰富).希望有审稿机会的高人能转给
我. 非常感激!我一定会尽心尽力的完成.
PhD: physiology (neuroscience)
Postdoc: hemorrhagic,ischemic stroke
关键词:
neuroprotection,animal models, behavior, neurovascular units injury,
neuroinflammation.
我的email:p*********[email protected] |
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p********e 发帖数: 11 | 5 4月份到UCLA作博后,求租2b apartment,有bus到ucla,30分钟左右可以接受,价格不
超过1800。因为有不到两岁baby,希望比较安静,隔马路比较远的小区。
谢谢。
email是:p*********[email protected] |
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S*****s 发帖数: 287 | 6 我想搞清楚一个在细胞质内的突变蛋白是怎么被降解的。这个蛋白的野生型有两种
alternative intron splicing 的 product,姑且叫 wildtype 和 wildtype2 吧。我
在 293 细胞内表达两个 wildtype 和 mutant 蛋白,然后用 proteosome inhibitor
(Lactacystin) 和 lysosome inhibitor (Chloroquine, Leupeptin) 来处理细胞。
实验结果发现 Lactacystin 处理之后 wildtype 蛋白含量不变,wildtype2 含量升高
,但是 mutant 蛋白含量下降了。Chloroquine 和 Leupeptin 处理之后也不见 mutant
蛋白含量升高。Excel 的分析图也随帖附上。这样我就搞不明白这个蛋白是被什么降
解的了。请问版上的各位大牛能不能指点一下,下一步应该从什么角度去研究蛋白降解
?先谢谢大家了! |
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p****s 发帖数: 3153 | 7 可以用native ligation,当然麻烦点,但是应该也不是没有,您说的那多半是ILV标记
法,但是那不利于assignment
当然了,大家不是一古脑的都做巨型蛋白,毕竟没有天然优势,不过去年有人用NMR研
究proteosome的机制我觉得还挺有
意思的,当然没有解结构了,我总是认为结构是重要的,但也不是唯一重要的问题。 |
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k****o 发帖数: 589 | 8
谢谢sunny!看来它们的细胞毒性和我估计的近似。不过还有些疑问想和你探讨一下:
1. 这两种抑制剂应该不适合研究半衰期长的蛋白和mRNA吧?有没有毒性较小的替代抑
制剂?
2. MG132是proteosome抑制剂,为什么可以用它来支持cycloheximide的数据?
3. 研究蛋白和mRNA半衰期,除开放射性元素的pulse-chase,还有没有什么不用同位素
的办法?
多谢指教! |
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C*********m 发帖数: 213 | 9 26S proteosome pathway 还是别的? |
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f*******d 发帖数: 92 | 10 我们想证明在某种treatment 条件下,NfkB pathway turned on by proteosome
degradation of IkBalpha. 老板说一定要S 35 labeling+MG132,然后再IP,看
IkBalpha 的ubiquitination 才能证明它是走的那个pathway. 有什么办法可以绕过这
个实验,还是得到同样的结论呢? 最近想生宝宝,实在不想做这种放射性的实验阿。 |
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f*******d 发帖数: 92 | 11 不能转染,因为要用原代细胞。做western本来能看到IkBalpha已经下降了,但是敏感
度看不到unibiquitination. 所以老板说,要用S35 来提高敏感度。我是觉得,如果加
了MG132,能看到IkBalpha stabalization,那就说明它走的是proteosomal
degradation pathway阿, 为啥一定要看到ubiquitination呢。 |
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C*********m 发帖数: 213 | 12 2 泛素化领域 proteosome现在已经有两个FDA认证的药物了 |
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f*******d 发帖数: 92 | 13 请教熟悉蛋白降解的大拿门。 我最近在做一个蛋白在某种药处理下的降解,用3MA+
NH4Cl 或者 MG132 抑制,都不能
inhibit 它的degradation, 想请教一下,还能看看啥其他的降解通路呢? |
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A******y 发帖数: 2041 | 15 Caspases, calpain, lone protease, etc. |
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f*******d 发帖数: 92 | 16 我们最先想到的就是转录和翻译,查过而且排除了。 |
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f*******d 发帖数: 92 | 18 前面两个都查到了一些资料,但是最后一个Ione protease 没找到啊, 能不能多讲一
点? |
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A******y 发帖数: 2041 | 19 Sorry, it is Lon protease. |
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m****g 发帖数: 530 | 21 Fox Chase癌症研究中心的研究人员称,或许可以通过增强细胞修复自身突变蛋白的能
力,最终达到治疗遗传性疾病的效
果。他们发现,细胞在蛋白酶抑制剂(proteosome inhibitors)的作用下,可产生大量
的分子伴侣Hsp70,这种伴侣蛋白能
够协助氨基酸链折叠成为正确的构象。这项最新发现发表在《PLoS Genetics》杂志上。
据研究人员Warren Kruger介绍,Hsp70能够将发生错误折叠的突变蛋白分开——类似于
解开扭成一团的橡皮筋,并最终
使错误折叠的蛋白恢复到原来的正确构象。如果这种机制也同样适用于人类,那么对科
学家研究因蛋白质错误折叠引起的
某些遗传病提供新的研究方向。
错义突变(missense mutation)往往导致一些遗传病的发生。由于蛋白质的形状取决于
特定氨基酸的排列,因此即使基因发
生了一个很小的突变,也会导致蛋白质产物出现畸形。在该课题中,研究人员对三种因
错义突变导致的遗传病进行研究,
其中两种是遗传性代谢疾病,另外一种是遗传性癌症综合症。
研究人员发现,通过诱导,使细胞中伴侣蛋白Hsp70的水平升高,可以使突变蛋白的恢
复到正常 |
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