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全部话题 - 话题: prra
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S*******l
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1
一种可能性RatG13, 穿山甲Cov祖先和新冠都有PRRA, 后来蝙蝠和山甲把PRRA丢了,依
然保有infectivity。新冠一直没丢。
而且,可能这个PRRA对新冠致病性根本不重要。石正丽把这个敲掉去感染Hela
expressing hACE2看看就知道了。

发帖数: 1
2
如果病毒学家能有一套令人信服的理论来证明PRRA插入是纯天然的,或这个PRRA能够被
证明是非关键furine酶切位点,那我能够接受

发帖数: 1
3
来自主题: Military版 - 哪位将军能科普一下PRRA?
PRRA直接洗白了五毒所,
无论自然界中找到找不到PRRA,
你少在这挖坑
O**W
发帖数: 58
4
来自主题: Military版 - 豪猪?!兼科普PRRA
以下无责任转载,请各位将军研判。本人非钱老不保证正确性
--------------------------------------
宿主目前可以看到的比较接近的是蝙蝠和穿山甲。
但这两个宿主,其身上携带的病毒,跟这次出现在人类身上的,都有着不一样的地方。
根据SZL课题组于2020年2月3日发表在Nature上的文章(2020年1月23日,该文章发表在
预印本网站BioRxiv)指出,蝙蝠冠状病毒RaTG13 (Bat CoV RaTG13)和新冠病毒在全
基因组层面的序列相同度(sequence identity,也常被称作序列一致性,但不应称作
序列相似性)高达96%。
但在关键的刺突蛋白(图中简称S)上,却又是序列相同度最低的地方,特别是刺突的
受体结合区域(receptor binding domain,简称RBD)。
目前已知的病毒中,蝙蝠冠状病毒RaTG13(上图蓝线)和新冠病毒最近,全基因组层面
的序列相同度达96%。但在关键的刺突蛋白(S)的受体结合区域,序列相同度最低(~
90%)。上图横坐标是新冠病毒基因组核酸位点编号,纵坐标是核酸序列相同度,图片
来自石Zl课题... 阅读全帖

发帖数: 1
5
来自主题: Military版 - 石正丽正面回答PRRA问题
石正丽说的这个已有研究在哪里啊?有没有文献?
“新型冠状病毒绝非人造 ,在蝙蝠中发现了争议的基因位点
新型冠状病毒已被证实为与SARS冠状病毒同源的“姐妹病毒”。南都记者了解到,此前
有研究指出,新型冠状病毒和SARS病毒相比,在基因序列PRRA的位点存在差异,疑似有
“人为插入”的痕迹,引发了网友对“新冠病毒是人造”的猜测。
在直播课堂中,石正丽明确澄清,新型冠状病毒绝对非人造。她解释,已有研究表明,
在蝙蝠提取的冠状病毒中发现了与新型冠状病毒一致的PRRA位点。“这就证明这个位点
不是人为插入的,是在蝙蝠种群里面就有的”。”
s***c
发帖数: 1926
6
https://news.163.com/20/0310/16/F7CDHO470001899O.html
3月9日晚,中科院武汉病毒研究所新发传染病研究中心主任石正丽做客某“2020科学抗
疫”线上公益课堂。她澄清,新型冠状病毒绝非人为制造,华南海鲜市场的关闭确实给
新冠病毒中间宿主的溯源带来了困难。她还提醒,出现下一次蝙蝠冠状病毒跨族群感染
仍是一个大概率事件。
石正丽:新冠病毒绝非人造 建议去蝙蝠栖息地溯源
华南海鲜市场关闭让野生动物样本采集环节缺失
3月9日晚8时,“2020科学抗疫” 系列科普公益直播活动第二期开播,邀请的嘉宾正是
石正丽。这是她自疫情发生以来,首次面向观众对新型冠状病毒相关情况进行科普讲解。
石正丽在直播中指出,在2003年SARS冠状病毒传播时,香港科学家在广东的市场关闭之
前,成功采集了样本,很快发现了和SARS冠状病毒同源性达99.7%的病毒中间宿主,而
随后,学界花了8年时间找到了该病毒的源头宿主是蝙蝠。
石正丽表示,在新型冠状病毒的溯源中,因为华南海鲜市场的关闭,采集野生动物样本
的环节已经缺失。在此情况下,她认为,寻找新冠病毒中间宿主,一是需要通... 阅读全帖

发帖数: 1
7
是发现了与新冠一致的PRRA位点,不是找到了PRRA。

发帖数: 1
8
有个简单的方法就是把PRRA插到蝙蝠病毒里看有什么变化,如果还是不能感染灵长类动
物,那就是自然进化的,
如果变得可以感染灵长类动物,那么就哈哈哈了

发帖数: 1
9
这PRRA到底是哪里来的才是关键

发帖数: 1
10
PRRA问题才是新冠界的哥德巴赫猜想,大家同意这个观点吗?
s***r
发帖数: 270
11
包子本要序列里加PRC一彰显国威,无奈千老手一抖加了个PRRA。。。

发帖数: 1
12
你算说对了,正因为智商低才不可能搞出PRRA这种四两拨千金的天才之作,如果是人为
的话
q*******6
发帖数: 129
13
智商低才会无知者无畏,越是业界大牛哪个对专业不是充满敬畏?天才之作?这种杀人
武器你会觉得是天才之作?我看你都有这种天才的潜质
[在 lubbock12 (非老非小将) 的大作中提到:]
:你算说对了,正因为智商低才不可能搞出PRRA这种四两拨千金的天才之作,如果是人
为的话
S*******l
发帖数: 4637
14
http://virological.org/t/the-proximal-origin-of-sars-cov-2/398
这篇给了个解释。
去读一下吧。
就是说是进化压力下选择出来的。好比禽流感病毒,在鸡群中传播,会从没有furin
site逐步进化出有furin site。
新冠或者是在一个哺乳动物种群里逐渐完成四氨基酸突变获得对人类超级感染力,发生
武肺。
或者是在人群中传播逐渐攒够的。早期没有PRRA的时候,致病性不高,好像普通感冒,
在特定人群中传播,攒齐了,就爆发了。
在武汉湖北做血清学调查可以帮助找到这个问题答案。
S*******l
发帖数: 4637
15
在哪里还看到过,走私穿山甲的贩子里对冠状病毒血清抗体阳性率12%。云南蝙蝠洞周
围山民阳性率3%。
武肺可能就是在野生动物走私贩卖这个群体里演化成熟的。
还有,可以根据现在新冠病毒的突变率来推算获得PRRA大概需要多长时间。
等我有空去算一下。

发帖数: 1
16
PRRA问题很大
dna序列拿去blast什么都找不到
而且那个地方是移码接进去的
非常像用overlap PCR插进去的

发帖数: 1
17
有了PRRA 基本可以排除实验室泄露可能被排除,可以转守围攻了
"There are also documented instances of the laboratory acquisition of SARS-
CoV-1 by laboratory personnel working under BSL-2 containment29,30. We must
therefore consider the possibility of a deliberate or inadvertent release of
SARS-CoV-2. In theory, it is possible that SARS-CoV-2 acquired the observed
RBD mutations site during adaptation to passage in cell culture, as has
been observed in studies with SARS-CoV5 as well as MERS-CoV31. However, the
acquisition of ... 阅读全帖

发帖数: 1
18
果然是哥德巴赫猜想
作者说如果PRRA是自然进化的话,那么该动物种群的密度非常大才能有效进行自然筛选
,会是什么动物呢?
"In addition, the pangolin CoV does not carry a polybasic cleavage site
insertion. For a precursor virus to acquire the polybasic cleavage site and
mutations in the spike protein suitable for human ACE2 receptor binding, an
animal host would likely have to have a high population density – to allow
natural selection to proceed efficiently – and an ACE2 gene that is similar
to the human orthologue. Further characterization of CoVs in pan... 阅读全帖
S*******l
发帖数: 4637
19
那几个糖基变异对新冠的帮助可能是为了遮盖PRRA, 降低人体免疫系统的检测。
因为这个poly basic sequence人类免疫系统在流感病毒和其他使用class I viral
fusion protein的病毒中经常见到,可能有一定免疫能力。

must
of
observed
the
have

发帖数: 1
20
SARS-CoV-1没有PRRA,照样感染,症状比武汉肺炎还厉害。
不要教条,认为非要这个位点才行,S蛋白的三聚体与ACE2结合很复杂,估计还有其他
co-factor 参与。 只是现在没找到真正的中间宿主,或者说是SARS-1或者MERS的变种
S*******l
发帖数: 4637
21
对的。
做个敲除试验,敲掉PRRA, 看新冠感染性下降不下降,就知道了。

发帖数: 1
22
不光是功能性问题,还是起源性进化性问题,PRRA可以折射出很多问题了,目前已经引
起了国际学术界的广泛关注了,大家都是众说纷纭

发帖数: 1
23
你不要把PRRA问题简单化,不是单纯功能性的问题,破案的线索就在里面呢
O**W
发帖数: 58
24
自中国湖北省武汉市首次报道新型肺炎(COVID-19)以来,关于致病性病毒SARS-CoV-2
的起源一直存在大量讨论和不确定性。截至2020年2月14日,已确诊64473例,其中死亡
1,384例。该病毒显然能够在人与人之间有效的传播。由于目前尚无针对该疾病的疫苗
或特异性疗法,基于存在可能传播到医疗体系较弱的国家风险,WHO已宣布COVID-19疫
情为国际关注的突发公共卫生事件(PHEIC)。
SARS-CoV-2是已知感染人类的冠状病毒科的第七名成员。 其中,三种病毒(SARS CoV-
1,MERS和SARS-CoV-2)可以引起严重的疾病。 四种病毒(HKU1,NL63,OC43和229E)
与轻度呼吸道症状有关。
该论文综述了从可用基因组序列数据的比较分析中可以推断出SARS-CoV-2的起源和早期
进化的方法。 值得注意的是,该论文提出了SARS-CoV-2基因组的显著特征,并讨论了
可能出现这些特征的场景。 重要的是,该分析为“SARS-CoV-2不是实验室产物也不是
有意操纵的病毒”这一论点提供了证据。
通过对α和β冠状病毒(冠状病毒科家族)的基因组比较确定了SAR... 阅读全帖
S*******l
发帖数: 4637
25
再来一个理由PRRA是自然产生而不是人工的。Furin对底物P4-P1的优先是R-X-X-R,特别
是P1应该是R,长链带正电荷,A不是个好选择, 没有支链的最小氨基酸。
实验肯定能证明新冠furin site不是个好底物。
人工设计不会选择这个设计。应该是突变积累的结果。和进化很多过程一样,往往是可
接受解而非最优解。
k******4
发帖数: 73
26
这个PRRA很重要吗?增加了传染性还是增加了毒性?或者说无法自然变异形成?

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27
PRRA真是太扎眼了,哪里来的呢?

发帖数: 1
28
新冠起源的核心问题就是PRRA问题,大家同意吗?

发帖数: 1
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来自主题: Military版 - PRRA不可能通过重组出现吧
但是mers其他前后序列也全不一样吧
可是这PRRA 是纯插入,前后序列都和其他病毒一致
S*******l
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30
来自主题: Military版 - PRRA不可能通过重组出现吧
穿山甲和蝙蝠丢失了PRRA。
S*******l
发帖数: 4637
31
来自主题: Military版 - PRRA不可能通过重组出现吧
怎么说不过去,蝙蝠和穿山甲不是中间宿主,只是病毒是同宗。这俩相似度都不够,说
明还有更接近新冠的带PRRA的病毒没发现。

发帖数: 1
32
来自主题: Military版 - PRRA不可能通过重组出现吧
如果能找到带PRRA的原装自然病毒,一切都好说
k******4
发帖数: 73
33
来自主题: Military版 - 哪位将军能科普一下PRRA?
现在的问题是不是没有在自然界中找到PRRA?
如果真找到了 五毒所就可以洗白白了吗?
k******4
发帖数: 73
34
来自主题: Military版 - 哪位将军能科普一下PRRA?
那为啥都在纠结PRRA?现在不是还没找到吗 不代表以后找不到
还是说这玩意自然界中基本不可能产生?

发帖数: 1
35
PRRA的来源问题一旦搞清楚了,新冠问题才能拨云见日,大家说对吧

发帖数: 1
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看来白人对PRRA免疫,股市不免

发帖数: 1
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如果敲除了PRRA,新冠的致病力会大大降低,那么就多少会说明一些问题
如果没有影响,那就是自然突变
五毒所,你们听到了吗?

发帖数: 1
38
不做一下实验,你怎么知道PRRA是不是关键致病力基因,如果不是呢?

发帖数: 1
39
这会儿还可以再做一个PRRA反向插入野生冠状病毒实验,看看对比,
估计肯定有人开始做了,只不过大家都心照不宣,什么也挡不住科学家的好奇心

发帖数: 1
40
五毒所发表过的病毒都没有PRRA

发帖数: 1
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不,是完整的PRRA,完美的设计

发帖数: 1
42
PRRA的插入非常诡异之处是在于插完之后,它的上下游序列还跟自然病毒序列相比丝毫
不差,这种现象在大自然病毒重组过程中确实是非常罕见的

发帖数: 1
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furin site 很重要,流感,HIV, sars 都早有报道...你翻翻furin的文章再逼逼
你跟我说furin site 很重要,所以说是夏威夷的锅?
你应该说,美国某某某实验室证明PRRA重要,所以是美国的锅
你放个R有屁用

发帖数: 1
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PRRA是老鼠肝炎冠状病毒furin位点

发帖数: 1
45
穿山甲病毒换成和新冠一样的RBD也感染不了人
必须插入PRRA

发帖数: 1
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来自主题: Military版 - 石正丽说发现 PRRA 了?
石正丽明确澄清,新型冠状病毒绝对非人造。她解释,已有研究表明,在蝙蝠提取的冠
状病毒中发现了与新型冠状病毒一致的PRRA位点。“这就证明这个位点不是人为插入的
,是在蝙蝠种群里面就有的”
https://new.qq.com/omn/20200310/20200310A0EA2900.html

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他说的那个文章反证了PRRA是人工来的
插入PAA, 但是前面有一段也丢了,不整齐是自然突变的一大特征

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48
不是人造的,根本不可能是人工泄露,自然界的冠状病毒现在还找不到PRRA呢

发帖数: 1
49
我只是再探讨这种可能性,如果自然界发现有PRRA插入冠状病毒,我绝不会再提,
关键这个插入实在是太干净太整齐了,前后序列原封不动叫人怎能不起疑心

发帖数: 1
50
对不起,从PRRA插入被发现的那一刻,我都是自己按照自己的逻辑和常识分析问题
与共产宣传与石正丽都没有任何关系
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