l**********1
发帖数: 5204 | 1 人家可能打算否定人类基因组库的现SNP数据内容
by Illumina or Ion or SOLiD or 454
一句话 并行高通量测的样本越多
不同run之间的同一sample (i.e. 乔教主的blood serum sample)
同位点的同SNP的
p<0.05 的可能失去 成了>1.0或其它值
from chip wells interaction with their target might had some error contact (random artificial SNP data)
----Sorry just my thought from his words.
要是其成功了 并提出解决protocol
炸药奖提名至少吧 |
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M*****n
发帖数: 16729 | 2 看看是不是SNP.
表以为别的species是S， 你这儿就没有SNP。
S变成T的SNP是常见的。
现在Genome测得多了，所谓的wildtype是相对的，没有绝对的wildtype.
所谓的reference 其实是most common variant，不是绝对的wild type. |
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h******3
发帖数: 190 | 3 My question is whether GSEA can be used to analyze GWAS snp data. and if so, whether there is a limit on the size of input data.
I am also curious how the program is going to recognize the snp id if it
is not designed for snp data...
If you have an idea, please let me know.Thanks so much~~ |
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o********r
发帖数: 775 | 4 今天的nature news:
http://www.nature.com/news/rna-studies-under-fire-1.10502?gobac
RNA studies under fire
High-profile results challenged over statistical analysis of sequence data.
Erika Check Hayden
25 April 2012
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High-throughput RNA sequencing has yielded some unexpected results in the
past few years — including some that seem to rewrite conventional wisdom in
genetics. But a few of those findings... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 5 sure
搞GWAS SNP RNA-seq 必看的 references:
@ARTICLE{Holmans09,
AUTHOR = {P. Holmans and E. K. Green and J. S. Pahwa and M. A.
Ferreira and S. M. Purcell and P. Sklar and {the Wellcome Trust Case-
Control Consortium} and M. J. Owen and M. C. {O'Donovan} and N. Craddock},
TITLE = {Gene Ontology Analysis of GWA Study Data Sets
Provides Insights into the Biology of Bipolar Disorder},
JOURNAL = {The American Journal of Human Genetics},
YEAR = ... 阅读全帖 |
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s******s
发帖数: 13035 | 6 这就是我说的。作为新药，没有其他人做大量基础研究。你凭什么
知道要按照某种分型做trial而不是按照其他几十种分型做trial？
这也是我说的，为啥按照种族分型的那个药运气好，能按照分型通
过。因为第一次失败的trial的data就在那里，直接mining很自然按照
种族分能看出猫腻，这样就有方向性的做第二次trial.
我没说不可能。不过这个要求第一次做trial的时候，所有的人的
genome全部测过，还要指望sample size够大，能有significant SNP；
还要指望这样的SNP不要太多。这个都是可行的，问题是药厂愿不愿意
这样做；FDA愿不愿意就因为你有几个significant的SNP，就让你再搞
N个trial |
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c*****5
发帖数: 463 | 7 Sorry I can't type Chinese on this computer :( Has anyone used the
Framingham Heart Study SNPs database before? if so, could anyone tell me how
to access the database? I am looking for a specific SNP, which was cited by
a GWAS study in the Framingham Heart Study. However, when I was looking
into the paper, there is no mention of that SNP. any clue? Thanks a bunch!!
! |
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u*********1
发帖数: 2518 | 8 新出炉的ENCODE的regulome的数据库
http://regulome.stanford.edu/index
我想问下，哪里有完整的database可以下载的？这样就可以自己在terminal里分析，而
不是一个个的在browser里query
download里能下载的只有Category1，2，3
另外还有一个问题，
能下载的Caterogy1/2/3的文件的format是：
SNP_name chr1 100 All evidences from ENCODE (say, chip-seq, DHS)
我就是说我能下载到的文件都是提供noncoding SNP和对这个noncoding SNP的
annotation
但如果在browser里直接搜索，随便输入一个coordinate，哪怕不是SNP，也会告诉你这
个位点的score是多少。
也就是说，这个背后肯定有都每个位点的annotation的数据库，而这个数据库目前我下
载不到。
谢谢！ |
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d****n
发帖数: 1637 | 9 rare SNPs 至少要有测续数据才能分析，不怕有false positive,就怕wet lab 的人根
本没办法弄出来。然后就在旁边指责bioinformatics，说，你看，我给你样品，你也搞
不出来吧。
rare SNP 要结合测续平台error 特点，mapping sofeware 特点。
SNPs 分布模型，是可以找出来的。
我们现在可以找到1 in 1,000. to 1 in 10,000.
1 in 1,1000 还可以，1 in 10k 就有点扯淡了。
如果一个 fungus , 5 Million 的genome, 就需要5million x 1000+ coverage.
这个就需要Genome Analyzer or GAII 整个flow cell的量。
理想情况下是要 HiSeq的来测许。 |
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b****r
发帖数: 17995 | 10 做common SNP 做了好多年，现在做structure variant和罕见mutation为主，真心没觉
得common SNP和大部分common disease关系多大。现在发表的paper也是给我这个感觉
，common SNP确实很多文章都说“有效果”，但是能在不同人群里被反复验证的其实极
少。拍拍脑袋，也就能想起药物代谢的那些，还有MTHFR 677 稍微有点实际意义，实际
上临床应用也极其有限
所以WGS我觉得目前根本没多少优势/意义，要等测序便宜得不行了看看会不会好点，那
得起码3，5年了，也许10年8年。我倒是觉得copy number目前还稍微有用点 |
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m**********2
发帖数: 2646 | 11 You can use the Seqscape software (by applied biosystem I think). You can
put in all the exon information of this gene and import all the sanger
sequencing files at the same time. It will detect the SNPs right away (you
can set the threshhold, for example,call any mutation that is at 25% of the
WT in peak size).
After they made the SNP calls, you can click on each SNP to look at the peak
and determine whether it is homozygous or heterozygous.
The software cost about $4000~6000, but it has a 30-d... 阅读全帖 |
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G**********2
发帖数: 1 | 12 实际上, 演化无时不在进行中. 以下只举两个例子:
1) 农业害虫对杀虫剂的抗性的发展. 农业杀虫剂的广泛使用是在二次世界大战之后
才开始的. 现在农业生产中一个很头痛的问题是害虫对杀虫剂的抗性产生很快. 研究发
现, 有些抗杀虫剂的个体, 它们的杀虫剂解毒酶的基因发生突变. 这些突变使它们比正
常个体更抗杀虫剂. 在很高的选择压下(例如在田间, 施药后仅小于5%的害虫个体存活
下来), 具有这种基因突变的个体比例快速上升, 使杀虫剂效力急剧下降. 这是一个很
明显的随即突变加高压/快速选择(人工田间频繁施药)的例子. 另外, 因为害虫的个体
基数非常庞大, 即使绝大多数被消灭, 该物种仍然因为这些基因突变得以生存. 可以说
, 这是演化的快速版.
2) 演化的慢速版之一就是人类本身. 人类基因组上存在分布广泛的Single
Nucleotide Polymorphism (SNP), 并且, 人与人个体之间SNP是存在差别的. 这足以说
明, 即使是同一个种族, 人和人是不一样的. 我没有读过圣经, 不明白圣经中到底一开
始创造了几个人? 如果从圣经的角度来看, 这些广泛... 阅读全帖 |
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D*a
发帖数: 6830 | 13 23&me就是搞搞什么高血压比别人高两倍，多发性硬化比别人低50%之类的东西，不是这
种临床诊断。他受FDA警告就是因为宣称他的东西有临床benefit。他最准的应该是找
ancestor，别的么...那些paper出来经得住经不住检验还不好说，你做个SNP测序跟那
些东西比，能准哪儿去。本来家族病史就是最准的高风险因子，你搞了个SNP，confirm
了而已，没有任何新信息。
别的机构也是一样，可别去烧钱了。
还有人把自己送了三家机构测了，测出来的互相都不一样。
而且你本身是亚裔，到底西方的数据库有百分之几是能用的都未可知。
另外brca那个美国最高法院的判决出来以后，应该是大家都随便测就好了，费用马上就
会下来了。那个是大量paper和临床证据支撑的，而且是突变，23&me用的SNP有几个进
了临床的。 |
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i*e
发帖数: 352 | 15 没有啥能100%万无一失的，BatchPD那个估计common SNPs都已经考虑了，rare的不清楚
，不过rare的话碰到的概率也小很多。此外individual个体还可能有未知的rare
variants，这个就更控制不了了。
看你之前所说，感觉是用来做validation不是detection的，所以万一有那么几个
readout不一致，换对引物或者用其他方法再验证一下。
我有可能记错，不错homopolymer和repeats在exons没有在3‘或者5’端频繁，有碰到
再分别单个手工设计引物好了。
我自己那个script，主要针对自己的实验目的，是WGS的variant validation，主要是
SNVs和小的Indels，也不单单是exonic，所以大多数面向exons的predesigned primers
就无用了，再说SNPs也没有被先排除。
设计引物的时候，input是VCF，已知的common和rare SNPs （dbSNP142）都有先
flagged，然后primer3的结果只取第一个output，之后in silico PCR再过一次，没过
的重新滚... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 16 赞动手能力！能写个script挺好的。而且你也考虑到了common SNP和repeat的情况，还
能自检错误，很牛逼！
我的情况和你很相似，很多时候不是在exon所以那个library并不好用。我经常也是NGS
的validation，也有new assay的设计，new assay的话就必须尽全力避免common SNP了
纠正一下，刚才发现前面提过的ExonPrimer其实是提供避免SNP和repeat的功能的，所
以理论上还挺好用的，暂时可以说解决我的部分问题。但是就是还是不能测deap
intronic的，也不能随意指定位置，只能 一次产出整个基因的CDS或者cDNA
又搜到一个，这次可以随意指定coordinates了
https://github.com/gantzgraf/autoprimer3
primers |
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a********k
发帖数: 2273 | 17 公司想找几个人看文献，分析数据。不知道有没有高年级的PhD学生或者博后感兴趣赚
点外快的。
比如我们想分析BDNF某一个SNP对那些精神病的风险有影响。我们想要对每个SNP至少分
析20篇病人数据的文章，然后做meta analysis
钱不多，大概$40-50一篇文章吧，也就是1000左右一个SNP。根据我自己的经验，稍微
熟悉一下能够大概1个小时能分析完一篇文章。所以小时工资还是不错的。有兴趣的朋
友站内，可以给个你发的文章证明经验，N作都可以的。 |
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m*********D
发帖数: 1727 | 18 我设计的时候没验证，主要是赶时间。
验证么，就是找一个transfection效率比较高的细胞，这个293显然合适。如果你的细
胞有很高的transfection efficiency,应该更好。理由是不同的细胞系之间会有SNP，
如果运气不好，正好在你的guide sequence之内，那在293验证的结果可能就不完全反
应你的细胞系的效率。
上面是我的理解。这里CRISPR expert多，清指正。我一般设计好guide sequence后，
会PCR一小段我准备用的细胞的genomic cDNA，测序保证没有SNP.上次测了一个2。5KB
片断，有三个SNP,但都不在我的guide sequences之内。 |
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k*****o
发帖数: 148 | 19 通过SNP信息进行关联分析。他们的核心竞争力就是他们的大量人群的SNP data，以及
对SNP信息的解读。 |
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发帖数: 1 | 20 最近做luciferase assay，就是把含有疾病相关的snp的promoter跟luciferase连接在
一起，看snp对promoter的影响。假设snp的ref allele是A, 疾病相关的allele是B
我首先在hek293里做，用lipofectamine3000转染。铺板子（12-well）铺了10个孔，5
个用于allele-a, 5个用于allele－b。先把lipo和dna混合好，然后把mix分给每一个孔。
以上是第一次实验，过两天我会一模一样的重复上述实验。
我想请问这里的5个孔中的每一个孔算是biological replicate还是technical
replicate呢？
而这两次实验算是biological replicate还是technical replicate呢？
之所以问这个问题是因为后来面对转染neuron的实验。neuron比较难转染所以用的是
nucleofection，一次性用cuvette转染100万个细胞，然后分到12-well的3个孔中。
同样的实验过两天我也会一模一样的再重复一次。
对于neuron的转染，分到3个孔中的... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 21 技术重复是看你操作有没有失误；生物重复是看你实验本身（这里是细胞）有没有有统
计意义的差异。
[在 flareon () 的大作中提到：]
:最近做luciferase assay，就是把含有疾病相关的snp的promoter跟luciferase连接在
:一起，看snp对promoter的影响。假设snp的ref allele是A, 疾病相关的allele是B
:我首先在hek293里做，用lipofectamine3000转染。铺板子（12-well）铺了10个孔，5
:个用于allele-a, 5个用于allele－b。先把lipo和dna混合好，然后把mix分给每一个
孔。
:以上是第一次实验，过两天我会一模一样的重复上述实验。
:我想请问这里的5个孔中的每一个孔算是biological replicate还是technical
:replicate呢？
:而这两次实验算是biological replicate还是technical replicate呢？
:之所以问这个问题是因为后来面对转染neuron的实验。neuron比较难转染所以用的是
:nucleofection... 阅读全帖 |
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G***G
发帖数: 16778 | 22 your experiments after two days are biological replicate.
five replicates at the same times are technical replicate.
最近做luciferase assay，就是把含有疾病相关的snp的promoter跟luciferase连接在
一起，看snp对promoter的影响。假设snp的ref allele是A, 疾病相关的allele是B
我首先在hek293里做，用lipofectamine3000转染。铺板子（12-well）铺了10个孔，5
个用于allele-a, 5个用于allele－b。先把lipo和dna混合好，然后把mix分给每一个孔。
以上是第一次实验，过两天我会一模一样的重复上述实验。
我想请问这里的5个孔中的每一个孔算是biological replicate还是technical
replicate呢？
而这两次实验算是biological replicate还是technical replicate呢？
之所以问这个问题是因为后来面对转染neur... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 23 我用的是psicheck-2的质粒，就是Renilla和Firefly在同一个plasmid上。Renilla是
control
我研究的这段noncoding序列有复杂的secondary structure，而且大概2kb，所以很可
能这样的序列会影响整个psicheck-2的空间结构和表达，包括作为internal control的
Renilla。
psicheck-2-noncoding-SNP-A和psicheck-2-noncoding-SNP-B，每次我用相同量的质粒
，相同数量的细胞转染，这个internal control的Renilla总是有明显差别；所以觉得
这里的control是没用的，但同时也说明在转录水平SNP-A和B有差别。
所以我的问题是：
1. 还是用这套系统，但我做RNA level的qPCR，我用GAPDH来控制细胞数量，同时我保
证转染加入的plasmid是相
同的量，那么我做出来的表达差别是否可信？可否发表？
2. 当然我可以重新找一个single Renilla vector，把noncoding插到这个vector上，
然后co-tran... 阅读全帖 |
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r**********e
发帖数: 587 | 24 最近在做一些machine learning/data science的工作。
因为过去做过很多genomics，突然有一个想法，比如GWAS里top candidate的解释很困
难，或者基于top candidate来预测疾病几乎不可能。
那么是不是可以用各种machine learning办法来training比如几万个SNP；得到这几万
个SNP和疾病状态的关系呢？
Y = a1x1 + a2x2 + a3x3 + ....anxn (n = SNP number比如几万个)
比如这种最简单的线性关系，然后来寻找W=(a1,a2,a3,...an)这个vector的最优解
去搜了一下，有一些这样的paper，但并不是很多。大量GWAS data都是online
available的，而用python的机器学习package的运算量，也不会太大吧？反正比我们分
析WGS要小很多吧？所以我觉得每一种疾病的GWAS都可以拿来做modeling，看是否可以
得到good estimate of parameters
但为何看到的文章这么少（或许是我孤陋寡闻）？然后也没有看到有很好的ge... 阅读全帖 |
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i*e
发帖数: 352 | 25 GWAS是很多，但是拿到数据，尤其N多个GWAS，也不是很简单
summarized results都不一定好拿
更不要说需要genotypes的情况下
有用GWAS top SNPs做polygenic risk score来预测
AUC对比之前用流行病或者临床指标的模型
结果没有太明显突出增强
也有用全基因组的SNPs做类似的工作
或者增加几个权重，比如SNP annotation或者local ancestray之类的
GWAS已经被统计流行病那拨人玩残了
genotypes是一方面，但是疾病表型是另一方面，而且是最重要的一个
这方面高质量的数据，不一定好拿到
此外像shakuras说的那种进一步结合或者转换到更有生物学意义的数据，可能是一个方法
生物学有时空性
但是目前这种snapshot类型的数据来源
多少能反应生物学，那就另说了
但是能玩 |
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r**********e
发帖数: 587 | 26 Many thanks!
我没有找到正确的关键词polygenic
一搜polygenic，一大堆文章，果然就是被biostatistics玩残了的。
我在想：
1， input selection （应该选择多少snp，是否根据snp的功能分配weight）
2， machine learning的不同model （svm，random forest，linear mixed
regression, sparse regression..）
3, 有如此多不同的疾病
感觉跟作实验一样，也是很多不同hypothesis：assume不同的input snp，尝试不同的
model；然后如此多不同疾病的大量的gwas数据，说不定就碰运气得到好的performance
，然后用到临床上去的？
比如最近这个：
http://www.nature.com/nature/journal/v542/n7639/full/nature21056.html#ref4
Dermatologist-level classification of skin cancer with deep neural... 阅读全帖 |
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e*********6
发帖数: 3453 | 27 目前有一种遗传相关疾病，有大概一半病人对治疗没反应，却天天打针很痛苦，目前有
测得的SNP，每个病人有几万个信号，但是训练样本只有几十个，prediction的准确度
非常低，基本等同瞎猜。
有什么办法能通过SNP数据，对病人预后进行预测？如能能带到很高准确率，这样就可
以提前判断出哪类病人对治疗无效，就不用让人天天额外受苦了。
一个具体问题，GWAS测得SNP有没有local motif？就是语言上的这种单词的高频的固定
组合？ |
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a***r
发帖数: 420 | 28 这个是染色体上的SNP的密度图示，如果我有所有SNP的position，要如何画出这样的图
呢？
我的大致思路是：
raw data是每个SNP的position编号，
由此建立一个覆盖整个染色体的，一定长度的小片段密度的dataset
画出密度图
我的问题是，
1. 这些小片段是否需要overlap each other
2. 在SAS/R里什么package/function画heatmap比较好?R的heatmap? 我没用过，但我看
他画出来的都是方的，要把23条染色体像这个图这样美型地line-up要怎么做呢？
谢谢大家~:) |
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r*****o
发帖数: 140 | 29 SVM我不熟。
但是我用randomForest做过GWAS。一般而言，如果predictor间有相关，importance
score可能会biased。所以我们一般先按照SNP间的LD去掉一部分marker。同时，盲目地
将一大堆噪音SNP加入RF，效果也不一定好，所以我们往往先优选一部分，这样下来，
做RF的SNP只有1万左右。用R还是可以做得。
如果你真的有几万个，建议你用randomJungle，速度快一点。 |
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H**********f
发帖数: 2978 | 30 你说的很不清楚
感觉你说的最开始的办法应该是把SNP当成了连续变量（虽然只取1,2,3）检验allelic
effect，1个自由度
后来加个哑变量应该就是把SNP当成分类变量检验genotypic effect，2个自由度
SNP效应的实际模型一般比较符合第一个模型，这时2df检验损失效能。 |
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H**********f
发帖数: 2978 | 31 你说的很不清楚
感觉你说的最开始的办法应该是把SNP当成了连续变量（虽然只取1,2,3）检验allelic
effect，1个自由度
后来加个哑变量应该就是把SNP当成分类变量检验genotypic effect，2个自由度
SNP效应的实际模型一般比较符合第一个模型，这时2df检验损失效能。 |
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m*n
发帖数: 695 | 32 非常抱歉，我刚刚看到您的回复。 好久没人回我的问题， 我以为没人理， 就没再跟
踪。
非常感谢您的指点！ 谢谢！！！
我定义SNP 的 三个 genotype 为1,2,3， 均为nominal ，按您说的，如果不定义哑变
量， spss 也是把这个分类变量当作连续变量来分析？
那SNP分析时， 我要不要做哑变量呢？ 或是两种方法都做， 分别解释allelic
effect 和genotypic effect？
楼下还有”石头”前辈说的additive model, 要不要设哑变量？additive model 解释
的是 allelic effect 还是 genotypic effect？
SNP 和统计我都是新手， 烦请您再点拨点拨。
allelic |
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H**********f
发帖数: 2978 | 33 nominal应该就是categorical，所以你做的应该就是2df genotypic test。之后应该以
频率比较高的那个genotype比如AA作为reference，AG和GG弄成2个哑变量做回归，这样
可以看AG和GG各自对应AA的odds ratio，就能看出SNP效应的模式了。
应该也做一下（allelic） additive model，一般的复杂性状（疾病）相关SNP都比较
符合这个模型。把SNP当成连续变量，AA，AG，GG取值0,1,2，没有哑变量。这个模型可
以看allele G相对于allele A的odds ratio。
以上做完之后如果发现有明显的显隐性，可以用显隐性模型，上面石头提到了 |
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x*******8
发帖数: 1254 | 34 邓亚军，中国最早的一代DNA鉴定师之一，8年以前，当她从一个法医偶然转行到亲子鉴
定。8年间，2万余例DNA亲子鉴定，他们当中有20多岁的年轻人，也有六七十岁的老人
，无论孩子是1岁、两岁还是三四十岁，他们都想知道这个孩子是不是自己的。
70多岁老汉怀疑30岁儿子非亲生
鉴定室会遇到形形色色的人，有一个很极端的案例，是一个70多岁的老头，他纠结
了30多年，儿子都30多岁了，我有什么办法可以把我儿子的样本拿到，还不让儿子觉察
?他一遍一遍地打电话，鉴定师就告诉他，那就买包好烟，把他叫你家里去，让他抽一
下，把这个烟头留给我们就行。
8岁“小冬”仍未找到生父
一位亲子鉴定专家告诉记者，曾有一个怀孕的女子挺着大肚子过来做亲子鉴定，接
连测试了三个男子的样本，才最终确定。“今年一年就有3例类似的情况。”8岁的“小
冬”，则是一个“悲剧”的孩子，出生不久便被爸爸怀疑为非亲生子。去年，他被带到
广州某大学法医鉴定中心进行亲子鉴定，结果出来，他不是爸爸的亲骨肉，父母随之离
婚。之后，妈妈为了寻找“小冬”的生父，先后三次带着三个男子的样本过来鉴定，但
都不是孩子生父。
TIPS：DNA亲子鉴定测试准... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 1065 | 35 http://bbs.cantonese.asia/thread-15099-1-1.html
你们这个什么门牙就是土著的证据不大站的住脚啊
同为复旦大学现代人类研究中心的李辉副教授在一次访谈中解释说道，分子人类学用的
是非基因的DNA序列。因为基因是有生理功能的，是不能随便变化的。如果基因随便变
的话，我们人的健康状况就会受到影响。
而在他们的分子人类学研究里，在研究的材料方法上有两个基本点，一个是非基因，一
个是单倍遗传。线粒体DNA和Y染色体DNA就是单倍遗传分子。在Y染色体上，基因也很少
，大部分都是非基因序列。在非基因序列中，会分析两种突变类型。一种叫做单核苷酸
多态突变(即SNP)，它的突变很罕见，也很稳定。同一个突变历史上不会重复出现，也
不会变回去。所以全世界Y染色体各种类型的结构关系就是据此构建的。另一种叫做短
串联重复突变(STR)，这种突变是在不断变长变短的，而且变化是匀速的。所以只要调
查到突变的总量，再除以突变的速度，就可以得到Y染色体各种类型的产生时间了。
也就是说，通过这种叫做SNP和STR的DNA分子的突变规律，突变分子的出现时间可以被
推断出来。M16... 阅读全帖 |
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y*h
发帖数: 25423 | 36 邓亚军，中国最早的一代DNA鉴定师之一，8年以前，当她从一个法医偶然转行到亲子鉴
定。8年间，2万余例DNA亲子鉴定，他们当中有20多岁的年轻人，也有六七十岁的老人
，无论孩子是1岁、两岁还是三四十岁，他们都想知道这个孩子是不是自己的。
鉴定室会遇到形形色色的人，有一个很极端的案例，是一个70多岁的老头，他纠结了30
多年，儿子都30多岁了，我有什么办法可以把我儿子的样本拿到，还不让儿子觉察?他
一遍一遍地打电话，鉴定师就告诉他，那就买包好烟，把他叫你家里去，让他抽一下，
把这个烟头留给我们就行。
8岁“小冬”仍未找到生父
一位亲子鉴定专家告诉记者，曾有一个怀孕的女子挺着大肚子过来做亲子鉴定，接连测
试了三个男子的样本，才最终确定。“今年一年就有3例类似的情况。”8岁的“小冬”
，则是一个“悲剧”的孩子，出生不久便被爸爸怀疑为非亲生子。去年，他被带到广州
某大学法医鉴定中心进行亲子鉴定，结果出来，他不是爸爸的亲骨肉，父母随之离婚。
之后，妈妈为了寻找“小冬”的生父，先后三次带着三个男子的样本过来鉴定，但都不
是孩子生父。
TIPS：DNA亲子鉴定测试准确率可达99.99999%
目前，... 阅读全帖 |
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t**********8
发帖数: 1683 | 37 东方人（东亚人），白人（欧洲人）以及黑人（非洲人）。 粗心的狂暴
核心会员7《Race，Evolution and Behavior》/《种族，进化与行为》
过去20年的研究主要集中于三个主要种族之间的差异，这三个种族是东方人（东亚
人），白人（欧洲人）以及黑人（非洲人）。在这篇论文中我集中讨论这三个种族。
在通过对於脑体积，智力，性格，性行为，繁殖，成长率，生命周期，犯罪以及家
庭稳定等研究，东方人作为一个整体在这个谱线的一端，黑人在另一端，白人在中间。
整体上，东方人显示了较慢的成熟期，较低的繁殖率，较低性活动率，较大的脑体积以
及较高的智商。黑人则完全相反。白人在中间（但更靠近东方人）。
（表一）（选自种族、进化和行为一书，第5页）
黑人，白人，东方人的平均差异：
脑体积
头颅容积： 黑人（1267）、白人（1347）、 东方人（1364）
cortical神经元（单位百万）：黑人（13185），白人（13665）、东方人（13767
）
智力
智商：黑人（85）、白人（100）、东亚（106）
文化成就：黑人（低）、白人（高）、东亚（高）
繁殖
双胞胎（ 每1000新生儿）：黑... 阅读全帖 |
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M*****8
发帖数: 17722 | 38 2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
多数到顶。墙街已深入插管，吸血在即。
排列依次为，号码，股票符号，收市价。
#0001, A , 44.6000
#0002, AA , 7.9010
#0003, AAGIY , 17.1600
#0004, AAMRQ , 4.7300
#0005, AAN , 28.9700
#0006, AAON , 24.7400
#0007, AAP , 83.2000
#0008, AAUKY , 9.5300
#0009, ABAX , 50.2800
#0010, ABCP , 1.0000
#0011, ABT , 34.7400
#0012, ACAT , 51.5000
#0013, ACE , 92.3800
#0014, ACGL , 52.3700
#0015, ACH , ... 阅读全帖 |
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M*****8
发帖数: 17722 | 39 2013年7月9日最新的1688个看跌的股票。
多数到顶。墙街已深入插管，吸血在即。
排列依次为，号码，股票符号，收市价。
#0001, A , 44.6000
#0002, AA , 7.9010
#0003, AAGIY , 17.1600
#0004, AAMRQ , 4.7300
#0005, AAN , 28.9700
#0006, AAON , 24.7400
#0007, AAP , 83.2000
#0008, AAUKY , 9.5300
#0009, ABAX , 50.2800
#0010, ABCP , 1.0000
#0011, ABT , 34.7400
#0012, ACAT , 51.5000
#0013, ACE , 92.3800
#0014, ACGL , 52.3700
#0015, ACH , ... 阅读全帖 |
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t**********8
发帖数: 1683 | 40 问题多了去了，是全面的问题，不是局部的问题。
过去20年的研究主要集中于三个主要种族之间的差异，这三个种族是东方人（东亚
人），白人（欧洲人）以及黑人（非洲人）。在这篇论文中我集中讨论这三个种族。
在通过对於脑体积，智力，性格，性行为，繁殖，成长率，生命周期，犯罪以及家
庭稳定等研究，东方人作为一个整体在这个谱线的一端，黑人在另一端，白人在中间。
整体上，东方人显示了较慢的成熟期，较低的繁殖率，较低性活动率，较大的脑体积以
及较高的智商。黑人则完全相反。白人在中间（但更靠近东方人）。
正文：
黑人，白人，东方人的平均差异：
脑体积
头颅容积： 黑人（1267）、白人（1347）、 东方人（1364）
cortical神经元（单位百万）：黑人（13185），白人（13665）、东方人（13767
）
智力
智商：黑人（85）、白人（100）、东亚（106）
文化成就：黑人（低）、白人（高）、东亚（高）
繁殖
双胞胎（ 每1000新生儿）：黑人（16）、白人（8）、东亚（4）
贺尔蒙：黑人（高）、白人（中等）、东亚（低）
性器官：黑人（大）、白人（中）、东亚（小）
**频率：黑人（... 阅读全帖 |
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T**********e
发帖数: 29576 | 41 4w-8w年前泥人和人类大量混合交配，现代欧亚人保留了1%以上的泥人基因，以中国北京
汉族人保留了1.4%为世界最多，平均略高于中国南方汉人。最后泥人很可能融入现代人
种继而消失。
How Neanderthal DNA Changed Humans
------
The researchers analyzed genetic variants in 846 people of non-African
heritage, 176 people from sub-Saharan Africa and a 50,000-year-old
Neanderthal.
The clearest indicator that a gene variant came from a Neanderthal was if
the variant appeared in some non-Africans and the Neanderthal, but not in
the sub-Saharan Africans.
Levels of Neanderthal ancestry differ in E... 阅读全帖 |
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l*******1
发帖数: 16217 | 42 古埃及法老Y-DNA测试: 从“R1b”图坦卡蒙到“E1b1a”拉姆西斯三世
从炎黄文明体系出发，推测古埃及王室为Q系，底层民众有黑种人E系和白种人闪族J系
等。
这种推测受到的主要挑战是中东DNA测试Q系详细数据的不完整，甚至是保密状态或者阴
谋论状态。这种保密性体现在：
相关北非Q系数据不入有关基因测试数据库，虽然已知北非有不少Q，今天埃及也有大约
2-3%的Q
2001年初开始或在中东和中美洲发现Q1a1，当然包括埃及地域，但是后来这一发现却被
有关方面故意掩盖了。相关论文见：Sengupta et al. 2006, Spencer-Wells et al.
2001, Underhill etal. 2000等论文显示：Q1a1分布在从中东到亚洲的区域。(
Distributed throughout the Middle East andAsia, including Chinese, Korean,
Dungan,and Hazara populations)
埃及政府已经声明古埃及法老基因测试只能有古埃及政府控制执行。且拒绝公布任何古
埃及法老的基因信息。
稍微有点正... 阅读全帖 |
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D***r
发帖数: 7511 | 43 啥都测，相当于“科学算命”。国家不管控要出乱子。
我也试了几个：
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你是一个有自控力的人吗？ SNP: rs6528024 | Gene: GPM6B
* Cases in this section is created by the users. WeGene is not responsible
for the curation of the contents. ?
所谓延迟享受，就是指延期满足自己的欲望，以追求自己未来更大的回报，这几乎是犹
太人教育的核心，也是犹太人成功的最大秘密。暂且不说你是喜欢延迟享受还是及时行
乐，让我们从科学研究的角度先了解下自己的基因是如何决定的吧～
在这篇文献中，通过对23,217位有欧洲血统的参与者关于延迟享受的能力进行研究，得
出最显著相关的单核苷酸多态性位点是rs6528024（P = 2.40×10 -8），位于基因
GPM6B的内含子中。
My Result: CC - 你在面对诱惑时相比其他基因型可能更不容易控制住自己！
Accurate 552
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谁是最强大脑？ ... 阅读全帖 |
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X****i
发帖数: 1877 | 44 【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: XiuShi (致力为花街散财，造福散户), 信区: Stock
标 题: 【2019年1月9日的 1,200 个股票的短期谷底和高峰的预测】
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jan 9 19:01:30 2019, 美东)
【2019年1月9日的 1,200 个股票的短期谷底和高峰的预测】
熊市策略是逢高峰就卖空，谷底补空平仓，如此周而复始。要少做多。
熊市性质是多数日子前盘价位高，后盘价位低，如此制造下跌的趋势。
对比预测，如果股价越极端，散户获暴利的机会和风险其实反而越佳。
花街的捣蛋，挤空或砸价，其实是制造极端价供精明的散户收割暴利。
花街这么做绝非善意，而是要吓唬散户在其人为的极端价割肉出局。
花街有用之不尽的代理基金和资金充炮灰，可以任性的挤高峰砸谷底。
花街有别人的代理钱来任性，用大量炮灰钱可以买出涨价，砸出跌价。
股票最不定因素，就是花街每天对散户的捣蛋，尤其挤高峰和砸谷底。
以下是为蝌蚪们提供的最基本，炒股绝对须要遵守，的注意事项：
1. 预备大量(>=50%)现金，准备用来收割花街人为制造的捣蛋极端价... 阅读全帖 |
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s***d
发帖数: 15421 | 45 tg这时候 应该支持snp 支持苏格兰独立 加入欧盟 英国脱欧后了.snp已经是UK第二大
党了 |
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w********g
发帖数: 3780 | 46 你说说为什么TG不敢这么做？
: tg这时候 应该支持snp 支持苏格兰独立 加入欧盟 英国脱欧后了.snp已经是UK
第二大
: 党了
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y****g
发帖数: 36950 | 48 DRD4基因多态性和许多人类特征和疾病相关。参考5个DRD4 多态性位点：
1.C-521T （即本解读所用到的位点）
2.C-616G （微基因不支持该位点）
3.A-809G （基本所有人都是A）
4.EXON 3 （非SNP）
5.120bp tandem duplication （非SNP）
的研究表明，DRD4多态性可能和性欲，性兴奋，和性功能相关。
其中rs1800955位点(也写作 C-521T 或者 -521C/T)，可能和性欲相关。
检测结果
参考文献
基因名：DRD4 基因位点：rs1800955
CC1793人骚 —— 但算是比较淑女（男）了TT3617人非常骚 —— 泰迪那种
CT5226人很骚 —— 平均水平 |
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t**********8
发帖数: 1683 | 49 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: twinlight198 (雙灯), 信区: Military
标 题: 从碱基对等纯生物学角度探讨东方人，白人及黑人的区别
发信站: BBS 未名空间站 (Mon May 27 21:08:40 2013, 美东)
东方人（东亚人），白人（欧洲人）以及黑人（非洲人）。 粗心的狂暴
核心会员7《Race，Evolution and Behavior》/《种族，进化与行为》
摘要 过去20年的研究主要集中于三个主要种族之间的差异，这三个种族是东方人（东亚
人），白人（欧洲人）以及黑人（非洲人）。在这篇论文中我集中讨论这三个种族。
在通过对於脑体积，智力，性格，性行为，繁殖，成长率，生命周期，犯罪以及家
庭稳定等研究，东方人作为一个整体在这个谱线的一端，黑人在另一端，白人在中间。
整体上，东方人显示了较慢的成熟期，较低的繁殖率，较低性活动率，较大的脑体积以
及较高的智商。黑人则完全相反。白人在中间（但更靠近东方人）。
正文：
黑人，白人，东方人的平均差异：
脑体积
头颅容积： 黑人（1267）、白人（1347）、 东方人... 阅读全帖 |
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X****i
发帖数: 1877 | 50 【 以下文字转载自 Stock 讨论区 】
发信人: XiuShi (致力为花街散财，造福散户), 信区: Stock
标 题: 【2019年1月9日的 1,200 个股票的短期谷底和高峰的预测】
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jan 9 19:01:30 2019, 美东)
【2019年1月9日的 1,200 个股票的短期谷底和高峰的预测】
熊市策略是逢高峰就卖空，谷底补空平仓，如此周而复始。要少做多。
熊市性质是多数日子前盘价位高，后盘价位低，如此制造下跌的趋势。
对比预测，如果股价越极端，散户获暴利的机会和风险其实反而越佳。
花街的捣蛋，挤空或砸价，其实是制造极端价供精明的散户收割暴利。
花街这么做绝非善意，而是要吓唬散户在其人为的极端价割肉出局。
花街有用之不尽的代理基金和资金充炮灰，可以任性的挤高峰砸谷底。
花街有别人的代理钱来任性，用大量炮灰钱可以买出涨价，砸出跌价。
股票最不定因素，就是花街每天对散户的捣蛋，尤其挤高峰和砸谷底。
以下是为蝌蚪们提供的最基本，炒股绝对须要遵守，的注意事项：
1. 预备大量(>=50%)现金，准备用来收割花街人为制造的捣蛋极端价... 阅读全帖 |
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