b*******g
发帖数: 1309 | 1 第二个问题Q-Orbitrap 叫Q-exactive or Q-E
你的理解是对的，C-trap accumulate ion 跟Oribtrap scan ion 可以同时进行的，所
以时间上不累加，长的那个决定总时间。
orbitrap scan time 跟resolution的是正比。就是scan时间越长 ，resolution 越高
。Q-E现在在12Hz下的resolution是17，500，1.5Hz下resolution 是160，000.
Resolution 只跟scan 时间有关。
所以Q-E 最快也要83ms 才能得到一张谱图，最慢667ms一张谱图。
在Orbitrap扫描期间，富集的离子都必须在C-trap里面等着。C-trap accumulation
time 最短10ms以上，可以延长来增加sensitivity (最佳值在250ms左右），但是必须
跟orbitrap的扫描时间匹配。
另外C-trap accumulate ion 跟Oribtrap scan ion 可以同时进行的，所以时间上不累
加，长的那个决定总时间。
如果sensitivi... 阅读全帖 |
|
y*****s
发帖数: 1047 | 2 你的duty cycle是指scan time吗？
duty cycle不是一个时间，是ON和OFF时间的比例...
那么降低scan speed或者说增加pulse的累积次数是因为数据传输速度不够，所以累积
起来，等到上一个scan的数据传输完了再送到电脑记录
但是电脑位数有限，不能累加太多超过上限
所以仍然存在一部分数据不能被记录的现象
看来还硅工摩尔定律搞了几十年还是不给力...
你提到有一个电压可以在pulse OFF时留住离子，最后离子损失不是>99%而是多少呢? |
|
y*****s
发帖数: 1047 | 3 c-trap注射时间应该比ms短很多 所以Q Orbitrap的离子利用效率基本接近QqQ？
但是induction current 检测器跟multiplier的灵敏度相比差多少? |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 4 对的，主要是这个digitizing时间在几个ms甚至更长，数据没办法实时传输。
另外可以用16bit 的digitizer可以存储更多的数据，但是digitizing时间会更长。
pulse off的时间很短，50us，所以我觉得离子损失不会太多，我没有数据
另外detector reset，还有instrument “thinking” time都是在ms level，这些都会
增加dwell time。做QTOF MS/MS的时候，特别是information dependent MS/MS，
instrument “thinking” time 明显很长，在50ms level。 |
|
y*****s
发帖数: 1047 | 5 google了一下Tof
oaTof没有看到有像linear trap那样的电压来留住离子，但是在离子进到pusher前降低
他们的速度。这样进到flying tube的离子占的比重取决于离子通过pusher长度的时间
（而不是pulse ON时间）和在flying tube飞行时间的比例，如果前者比飞行时间短，
则离子基本都进到flying tube。你能否找得到这两个时间到底哪个长？ |
|
y*****s
发帖数: 1047 | 6 看到一个地方说duty cycle是5-20%
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1044030506006
The sensitivity of these oaTOFs strongly depends on the “duty cycle”,
which is defined by the ratio of the ions accelerated by a TOF pusher to the
ions introduced to the pusher. It is typically 5 to 20% [ 4 and 7] because
most of the ions are lost, going through the pusher without being
accelerated during the period between the acceleration pulses of the pusher.
Therefore, improvement of this low duty cycle o... 阅读全帖 |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 7 对的在Q2跟TOF连接处，有一个octupole 就是重新focus ion，
不是trap住。这个连接还有一个slicer，涉及去除高z方向的动能的离子，以获得高TOF
resolution。这样也会造成离子损失。 但是如果octupole的focus ion 效果好的话，
能减少在slicer上离子损失。
可以看看Agilent 的视频：
http://www.youtube.com/watch?v=R_d-NI0fK7A
你提的这个问题很容易理解，pusher 不是一个点，是一个面，
在pusher这个面之内的ion都会被加速进入flying tube，所以一个pulse后 pusher上的
所有离子就都飞走了。
然后下一批离子从gate 进来，从pusher一端飞到另外一端，这个时间是远小于flying
time 0.05ms的，在下一个pulse 之前，这些离子就损失了，就像你提供的文献说的，
只有5-20%被能等到下一个pulse。这么算的话，时间就是0.01ms 或更短
但是如果从Q2出来的ion飞的越慢，飞过pusher时间越长，越有可能等到下一个pulse，
然后进入... 阅读全帖 |
|
y*****s
发帖数: 1047 | 8 你的描述是做MS而不是MS/MS的情况
Thermo 为啥把collision cell和Q分居c trap两侧，做MS/MS这不是坑爹吗？
1:parent ions从Q选出来穿过c trap 进到collision cell, 2:在里面激发，打碎。
3:碎片从collision cell出来回到c trap
4:从c trap出来进到orbitrap
5: orbitrap 收集数据
5可以和其他步骤同时进行
duty cycle取决于 时间1 和 时间2+3＋4的比例，怎么看都是反刍加便秘。。。
2， 3 和 4 的时间有多长呢？ |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 9 对的，这个系统是从LTQ-oribtrap 直接移植过来的，这样做不用重新设计，
只要共用一条生产线，方便简单，成本低。否则不可能只用LTQ-orbi 一半的钱就能买
到Q-Exactive
另外这个CID是High energy CID，or HCD，跟一般的low energy CID 不一样，高能量
对于peptide fragmentation 有帮助
另外，在HCD部分可以很方便的加上ETD collision source （做protein post-
transnational modification analysis），甚至IR，UV等 做不同的fragmentation
研究
这个都极大的丰富仪器在proteomics 跟蛋白结构鉴定方面的应用。这个是一般的
Collision cell 不能做的。 |
|
y*****s
发帖数: 1047 | 10 我不是说他的collision cell坑爹而是说放的位置很别扭
没看到说可以加个ETD在HCD的后面啊
也许是他的工艺或者成本控制还有问题吧
我想要是有第二家公司可以卖q orbitrap，肯定不会把collision cell这么摆
他这个布局基本和linear trap orbitrap一样，
可是他现在的LTQ Orbitrap 有两个linear trap，可以减少离子损失
就算这所谓HCD一定要放到ctrap边上也应该让用户选择是一个普通的collision cell在
Q后面还是一个HCD加ETD在c-trap边上 |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 11 Q-E就是从 LTQ-orbi 来了，所以布局差不多。本身orbitrap的系统就包括 HCD，C-
trap +orbitrap。作为一个整体来用的话，不用重新设计，这样做制造Q-E最省钱最方
便。肯定比重新设计成Q1+ collision cell+Ctrap+orbi便宜很多。
如果按你说的在Q-E的基础上，再加一个Q2 collision cell的话，加上系统重新设计，
会使得价格很高。而且HCD 跟CID的功能是重合的，没人愿意花钱买个没什么的功能。
另外要maintain 一个新的生产线的话成本很高，如果能合用生产线，成本就下去了。
另外orbitrap scan很慢，orbi scan是比所有步骤里面时间最长的，HCD+C-trap+
injection 总时间还是少于orbi scan 时间，你可以找个文献看看。所以把collision
cell放到前段并不能节省时间提高效率，HCD的位置只是你不习惯而已。功能上一样，
甚至更多。
另外HCD原理使得没法加在正常的QQQ里面，只能放到一个单独的地方，所以只能放到后
面去了。LTQ-orbitrap的HCD 有ETD功能... 阅读全帖 |
|
y*****s
发帖数: 1047 | 12 哪里可以找到Thermo HCD fragmentation的时间和从collision cell转到orbitrap的时
间？还有collision cell的容量。。。orbitrap扫描时间长短本身并不怎么重要，因为
是同时进行不占用时间
我估计activation/fragmentation>10ms,如果加上离子在collision cell， ctrap 和
orbitrap之间传输时间不超过100ms，collision cell的容量足够收集超过0.5s的
parent ion，那效率还是很不错
To
“一台LTQ-orbitrap 100w,一台Q-E才45w，一台普通的QQQ才30w.只做小分子定性跟定量
的话，买Q-E再加QQQ，更便宜，更实用。”
再便宜，我也没钱买，不用帮thermo推销了。。。 |
|
|
b*******g
发帖数: 1309 | 14 i did not work for thermo either.
I will buy one Q-E, one tripleTOF.One for high resolution, one for fast scan.
and two QQQ for quantitation.
I think these are good combinations to achieve all the purposes for small
molecules.
定量 |
|
h*****t
发帖数: 1226 | 15 LTQ-Orbitrap Elite 哪有100万. 70多万拿下了.
collision |
|
b*******g
发帖数: 1309 | 16 你没算 液相 跟 ETD 吧。
一个月前quote LTQ-Orbitrap Elite+ETD+液相 99w 刀，外加4年保修还有11w，总计
110w。
当然了，牛人总是能拿到好价格的，不要钱白送的都有 |
|
h*****t
发帖数: 1226 | 17 I have been using Elite for more than a year. I paid rounghly 750 K for it.
And it has ETD. |
|
f********e
发帖数: 2194 | 18 Total 3 papers, all from Bioanalysis.
paper1:
Comparison of triple quadrupole and high-resolution TOF-MS for
quantification of peptides
By Dillen, Lieve; Cools, Willy; Vereyken, Liesbeth; Lorreyne, Willy;
Huybrechts, Tinne; de Vries, Ronald; Ghobarah, Hesham; Cuyckens, Filip
From Bioanalysis (2012), 4(5), 565-579.
http://www.future-science.com/doi/pdf/10.4155/bio.12.3
Paper2:
Comparison of unit resolution SRM and TOF-MS at 12,000 mass resolution for
quantitative bioanalysis of 11 steroids from h... 阅读全帖 |
|
|
m********r
发帖数: 334 | 20 多谢，其实我算的是SRM，rotor没有电压。我开始用的是Model 1，根据公式
U = R*i + d[Flux]/di * di/dt +d[Flux]/d(theta) * d(theta)/dt
= R*i + (L + i*dL/di)*di/dt + i*dL/d(theta)*d(theta)/dt
如图1，输入电流和角度，输出做代数运算后积分，每次积分器都很容易输出无穷大。
然后我改用model 2, Flux作为输入，Flux=L(theta,i)*i,电感用多项式近似后变成电
流的四元方程，怎么算电流？求多项式的根？
还有，Eq4是不是还少了w*F? |
|
z**k
发帖数: 378 | 21 HR通知我准备一台电脑，说下一次电面的时候很有可能会被要求写code。不过信里并没
有提到具体语
言和考试形式。我一时有点乱了阵脚，不知道该准备些什么？不知道有没有人有类似经
验呢？
我并不CS科班出身，虽然resume上有提到Linux, C/C++, Perl, Python等等，不过都是
平时
做project时自己用的，很少针对考试面试做过训练。如果有xdjm参加过类似的面试，
可不可以告诉
我题目的难度大概是怎样？我也好有个心理准备。会是最基本的算法实现，还是像
topcoder SRM
250／500那样的需要解决一个实际问题？（topcoder 900＋以上的题目我从来没做对过
，如果真
的出现类似题目我也只能认命了） |
|
o******6
发帖数: 538 | 22 我还是决定不用standardized regression model了，因为我只想处理
multicollinearity问题，center the variables就可以达到这个目的了，没必要再
standardize，而且model中如果有interaction term的话SRM有些局限性,standard
error of the coefficient for interaction term不是很对。 |
|
R*****s
发帖数: 41236 | 23 Cervelo Dominates 2010 Bike Count Field
http://lavamagazine.com/features/kona/bike-count#axzz1VEGzXqeG
Every year, dozens of triathlon industry employees take a break from the
action of race weekend in Kona to find out what brands are the kings of the
triathlon world. The annual Kona Bike Count involves five hours of tallying
bikes, wheels, saddles, aerobars, aero helmets, power meters, and components
as athletes check in their bikes the day before the race. The count gives
the industry a scope ... 阅读全帖 |
|
i*********5
发帖数: 19210 | 24 http://lavamagazine.com/gear/70-3-worlds-bike-count/#axzz1XZexV
Results from the count that serves as a litmus test for the industry
Posted on September 11, 2011 by The Editors
Bikes
Cervelo: 351
Trek: 149
Felt: 118
Specialized: 116
Scott: 67
Components
Shimano: 1045
SRAM: 426
Campagnolo: 34
Wheels
Zipp: 1544
Hed: 275
Miscellaneous: 185
Mavic: 122
Reynolds: 108
Bontrager: 102
Tires
Continental: 639
Vittoria: 221
Michelin: 138
Zi... 阅读全帖 |
|
f**********e
发帖数: 1994 | 25 比 quarq，SRM 便宜多了。还可以量两脚的 power，还可以在车和车间拆来拆去。值了。 |
|
R*****s
发帖数: 41236 | 26 太高端了，这个power meter对newbie有用么？ |
|
m******r
发帖数: 9604 | 27 http://ironman.com/events/ironman/worldchampionship/the-annual-
Bikes
Cervelo: 483
Trek: 211
Specialized: 170
Felt: 115
Cannondale: 86
Scott: 85
QR: 78
Argon18: 71
Giant: 64
Kestrel: 46
Orbea: 43
Kuota: 42
Ceepo: 37
BMC: 33
Look: 31
Guru: 28
Blue: 27
Fuji: 21
Ridley: 17
Cube: 17
PlanetX: 16
Litespeed: 11
Willier: 11
Storck: 10
Serotta: 9
Pinarello: 8
Parlee: 8
Canyon: 6
Colnago: 6
Stevens: 6
Elite: 6
Griffin: 5
BH: 5
Seven: 5
Teschner: 5
Beyond 4
Isaac: 3
Calfee: 3
Louis Garneau: 3
Jamis: 2
Chee... 阅读全帖 |
|
i*********5
发帖数: 19210 | 28 Quarq超过了PowerTap和SRM，可以考虑考虑。 |
|
i*********5
发帖数: 19210 | 29 Quarq, Powertap, SRM, Garmin, Power2Max, Vector
by Jack Mott
"Do I really need a power meter?" – an often asked question, with a clear
answer. No, you do not need a power meter. Norman Stadler became a two-time
Kona champ pacing himself by just "going all out." Eddy Merckx managed to
win approximately every bike race he ever entered without one, and set an
hour record that stood for 28 years. However, when that hour record finally
was broken by Chris Boardman, it was done with extensive use of a... 阅读全帖 |
|
i*********5
发帖数: 19210 | 30 【 以下文字转载自 Cycling 讨论区 】
发信人: ironman2015 (KONA 2020?), 信区: Cycling
标 题: 功率表价格大战开始! Power Meter Pricing Wars: Let The Games Begin
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Apr 21 15:28:04 2015, 美东)
Power Meter Pricing Wars: Let The Games Begin
http://www.dcrainmaker.com/2015/04/power-meter-pricing-wars.htm
The Winds are a Shifting:
Over the past few weeks there have been a number of notable price drops by
power meter companies. While some of these price drops may seem reactionary
to news from PowerTap’s new products... 阅读全帖 |
|
i*********5
发帖数: 19210 | 31 【 以下文字转载自 Cycling 讨论区 】
发信人: ironman2015 (KONA 2020?), 信区: Cycling
标 题: 功率表价格大战开始! Power Meter Pricing Wars: Let The Games Begin
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Apr 21 15:28:04 2015, 美东)
Power Meter Pricing Wars: Let The Games Begin
http://www.dcrainmaker.com/2015/04/power-meter-pricing-wars.htm
The Winds are a Shifting:
Over the past few weeks there have been a number of notable price drops by
power meter companies. While some of these price drops may seem reactionary
to news from PowerTap’s new products... 阅读全帖 |
|
i*********5
发帖数: 19210 | 32 Procycling gear-guru Jamie Wilkins has spent the last seven months testing
nine of the best power meters, and here are his findings...
The meters on test -
SRM
Quark ELSA RS
Power2Max Type S
Verve InfoCrank
Stages
Rotor INpower
Garmin Vector 2
PowerTap P1
PowerTap GS |
|
w*******y
发帖数: 60932 | 33 Hi All,
GIven the upcoming zombie apocolypse, now is the time to prepare!
TargetsportsUSA.com is having a sale on al of their major calibers for their
Hornady Zombie ammo, buy it by the case and fget fre shipping! I
personally recommend stocking up mostly on the 12ga 00, along with a couple
of tactical short barrel 12 guage shot guns, i.e. Mav 88(best value IMO, iy'
s a 500 really, but 100 cheaper normally),Mossberg 500,or Rem 870, or if you
have a higher budget a couple of "SRM Arms 16 Ro... 阅读全帖 |
|
w****2
发帖数: 12072 | 34 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: wlwl12 (戒网), 信区: Military
标 题: 有数据有真相：台湾现代化与国民党关系不大
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Oct 12 17:51:44 2011, 美东)
有数据有真相：台湾现代化与国民党似乎关系不大
（１）农业
台湾：1927年台湾灌溉面积占耕地面积47.4%。1930年代开始大量使用化肥，完成近代
农业的绿色革命。1939年台湾农业人口占总人口比例低于50%。
大陆：1952年灌溉面积为1995.5万公顷，不足农地总面积20%。1978年灌溉面积4996.5
万公顷，超过农地总面积的40%（２０１１年灌溉面积为４８％）。这40%多灌溉农地是
产出能力最高的高产田，是目前中国粮食的主要来源。除此之外，人民公社时期还修有
一亿多亩比较高产的梯田，决定性地改造了黄淮海平原，开发出如北大荒这类大粮仓。
（２）教育
台湾：1943年小学入学率为71.3%。此外，在县市乡镇都有完备的各级政府组织、金融
体系、司法体系、邮政体系和农会体系，与详尽的户政、兵役、地籍等档案资料。台湾
在1940年代... 阅读全帖 |
|
