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全部话题 - 话题: taekjip
1 (共1页)
BG
发帖数: 515
1
最近下载了Taekjip Ha group的软件处理FRET的数据。他的数据采集程序是C++平台的
,在Windows无法运行。他的网站提供的样品数据是.pma格式的。
不知道这里有人了解怎样生成这个.pma格式的文件?
我现在采集的数据是.tif格式的图片和录像。
非常感谢!
L****L
发帖数: 367
2
【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: BigBadBoy (。oоО), 信区: Chemistry
标 题: 请问到UIUC的Taekjip Ha组作薄厚如何?
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Aug 6 08:57:46 2010, 美东)
人绝对是牛人,就是不知道脾气如何,压迫不压迫,版上有没有了解的?谢谢
l**********1
发帖数: 5204
3
STORM Stochastic not deterministic
even Zhuang her SHI-XIONG/SHI-DI Taekjip Ha now want to try other ways:
//physics.illinois.edu/people/profile.asp?tjha
//zhuang.harvard.edu/pi.html
please refer:
In the field of microscopy development there was again a strong emphasis on
high resolution techniques (Hess, Sauer, Hell) and on combined microscopy
techniques to manipulate the sample for example with an AFM or optical
tweezers under optical inspection (Taekjip Ha, Jan Vogelsang, Gopal
Balasubram... 阅读全帖
c**y
发帖数: 127
4
我本人不是做单分子的,我刚去做了一点literature search,
你提到的文章
Ligand-induced conformational changes observed in single
RNA molecules
TAEKJIP HA*, XIAOWEI ZHUANG*, HAROLD D. KIM*, JEFFREY W. ORR†, JAMES R
. WILLIAMSON†,
AND STEVEN CHU*‡
Contributed by Steven Chu, May 27, 1999
是Taekjip Ha博士毕业后去Chu lab做博士后发表的。
再来看这篇,时间上肯定比前一篇要早。
Single-molecule fluorescence spectroscopy of enzyme conformational dynamics
and cleavage mechanism
Taekjip Ha,*†‡ Alice Y. Ting,‡§ Joy Liang,* W. Brett
Ca
a*q
发帖数: 2109
5
STORM每一帧的采样是Stochastic的,但是最后很多帧的数据加起来得到的图像是完全
Deterministic的,因为是由样品里面的所有荧光标记的位置决定的,所以没有什么问
题啊。
Taekjip Ha做的AFM以及Optical Tweezer跟我们讨论的光学显微完全不是一回事。一个是跟
SAXS一样做提纯分子的研究的,一个是做细胞成像的,而且Taekjip Ha现在也在做
PALM/STORM。

ways:
emphasis
on
microscopy
a*q
发帖数: 2109
6
STORM每一帧的采样是Stochastic的,但是最后很多帧的数据加起来得到的图像是完全
Deterministic的,因为是由样品里面的所有荧光标记的位置决定的,所以没有什么问
题啊。
Taekjip Ha做的AFM以及Optical Tweezer跟我们讨论的光学显微完全不是一回事。一个是跟
SAXS一样做提纯分子的研究的,一个是做细胞成像的,而且Taekjip Ha现在也在做
PALM/STORM。

ways:
emphasis
on
microscopy
s****9
发帖数: 932
7
我的2分钱:
你是中国人(如果甚至你现在PhD老板也是中国人),你再找个postdoc老板也是中国人
,太多的中国因素不是好事情。diversity很重要,你应该多接触西方人的工作方式。
另外,如果你未来的老板是白人,那么他的推荐一个中国人的分量会大于一个中国人推
荐另一个中国人大很多。
当然,如果你将来就是回中国,也许这个concern不存在。
也许我太过极端了,我当时PhD老板是中国人(他对我很好,也很support),我当时找
postdoc唯一的坚决就是不找中国人。现在想来,我postdoc跟着现在的老外老板学到了
很多中国文化美德以外的东西。
做结构的牛人多了去了。我不是这个领域的,也能随便说出几个很有意思的实验室。
David Eisenberg,做的非常有意思,computation和structure相结合。我觉得是以后
结构发展的方向之一。
Roderick MacKinnon,做voltage-channel的,炸药奖获得者。
跟你的这个单分子相关的
Taekjip Ha,这个是个棒子,但是工作相当漂亮,也很高产,从diversity的角度,中
国人找韩国人总比中国... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
8
来自主题: Biology版 - 求助 ligand receptor binding
Your comment are right
>但是steroid ligand 是可以直接跨膜的如果挂上荧光标记
But you can try
single-molecule pull-down (SiMPull) assay with YFP
paper NCBI link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21614075
full text pdf link:
htp://saturn.med.nyu.edu/research/mp/littmanlab/Immunology_Journal_Club/
Papers_files/Jain.pdf
by Dr. Taekjip Ha now at
http://bio.physics.illinois.edu/
Ps:
Dr. Ha and
Zhuang Xiaowei with same advisor: Steve Chu at Stanford 12 years ago.
http://www.stanford.edu/group/chugroup/steve_personal... 阅读全帖
o******d
发帖数: 204
9
来自主题: Biology版 - 你不能只知道华人生物学家zz
发信人: laozhong (zhaoke), 信区: LZU_Life
标 题: 你不能只知道华人生物学家
发信站: BBS 兰大西北望站 (2011-12-29 11:22:06 Thu), 站内

作为生科院的学生,一些华人生物学家的名字肯定经常听到,这些人也往往被描述成你心
目中英雄.可是,仅仅知道几个华人生物学家是不够的,在这里就简单列举几个最负盛名
的华人生物学家的同行.
1.王晓东 王晓东在线粒体细胞凋亡途径的贡献无疑是接近诺贝尔奖的工作.在细胞凋亡
领域比王晓东做得好,或水平接近的有
H. Robert Horvitz 因在细胞凋亡的遗传基础方面的工作2002年获得诺贝尔奖.
Suzanne Cory,Stanley Korsmeyer(2005年过世),John Reed等在Bcl-2家族蛋白的研究
工作。
Craig B Thompson在细胞凋亡机理和疾病关系方面做了大量关系,据说人品不是特别好

2,施一公 施一公以发CNS多著称,但是在结构生物学领域,文章数量和重要性不在一
公之下的大有人在,可能由于领域太大了吧。00年以后凭蛋白结构得到诺贝尔奖的就有
... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
10
来自主题: Biology版 - 美国的薄厚该怎么找?
at least CV and your proposal one by one to below PI (show how you can contribute to him/her
after he/she offered you) of course, first you should confirm his/her Publications list that is relative to your
background or interest.
//www.cell.com/contact
Editorial Board
C. David Allis
Geneviève Almouzni
Uri Alon
Angelika Amon
Johan Auwerx
Richard Axel
Cori Bargmann
Konrad Basler
Bonnie Bassler
David Baulcombe
Jeffrey Benovic
Carolyn Bertozzi
Wendy Bickmore
Elizabeth Blackburn
Joan Brugge
Lewis Can... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
11
来自主题: Biology版 - 美国的薄厚该怎么找?
at least CV and your proposal one by one to below PI (show how you can contribute to him/her
after he/she offered you) of course, first you should confirm his/her Publications list that is relative to your
background or interest.
//www.cell.com/contact
Editorial Board
C. David Allis
Geneviève Almouzni
Uri Alon
Angelika Amon
Johan Auwerx
Richard Axel
Cori Bargmann
Konrad Basler
Bonnie Bassler
David Baulcombe
Jeffrey Benovic
Carolyn Bertozzi
Wendy Bickmore
Elizabeth Blackburn
Joan Brugge
Lewis Can... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
12
En
NAS HHMI PI Zhuang Xiaowei
//www.youtube.com/watch?v=SXueOomP_Ss
her spoken english is below Korean US man Taekjip Ha
and
Nanoscopic Imaging of Biomolecules and Cells
May 06, 2008
//www1.cnsi.ucla.edu/events/event-category-view?category_id=419641
S*R
发帖数: 1057
13
感觉各方面都绝配啊,在同一个组咋没擦出火花呢。可惜啊
d****d
发帖数: 214
14
这个话题是不是有点无聊啊?
w***x
发帖数: 265
15
两人有夫妻相,年龄也合适。不过这是宅男对女神想入非非的表现之一吧= =
G**********s
发帖数: 74
16
来自主题: Biology版 - 跟风问biophysics薄厚选择
UIUC的taekjip ha是不是在做single molecule的FRET?
G**********s
发帖数: 74
17
不是。。。倒是想去那边庄小威组来着,木有这个实力啊!另外一个考虑的方向是去
UIUC的Taekjip Ha组里,也是高产的牛人。
B*******y
发帖数: 766
18
人绝对是牛人,就是不知道脾气如何,压迫不压迫,版上有没有了解的?谢谢
i*****s
发帖数: 1170
19
见过几次,感觉人挺随和的
L****L
发帖数: 367
20
啊哈哈哈哈哈哈!!!你去物理版问哈!RB不来化学版的哈!我好喜欢TJ!
L****L
发帖数: 367
21
我帮你转去物理版了哈!
k********p
发帖数: 276
22
From a few personal interactions with him, I feel that he is a very nice
person. Undoubtedly, he's very smart and hard-working. Totally admire him.
s*****g
发帖数: 2666
23
牛人,跟他好好干肯定有前途
个人品行就不知道了
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