f*****y
发帖数: 464 | 1 现有非人类的基因一个，想看promoter有哪些transcription factor binding sites.
我把该基因和人类homolog基因的promoter sequences都作了TFsearch，结果出来有很
大不同，只有少的可怜的TF同时出现在两个结果里。
我理解这个TFsearch的结果是根据人类的TF计算的。我们这个动物基因组刚测出来，它
的TF binding sequence还不知道。这种情况还有没有办法分析呢？
请支招。多谢。 |
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f*****y
发帖数: 464 | 2 谢谢回复。
我用的是kyoto University的TFsearch program, 它用的是TRANSFAC的database.
我不是做transcription的，为了做个gene model的图才想看看promoter. |
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L**********O
发帖数: 1761 | 3 我Google了一下出来一堆，神马PROMO，TFSEARCH。。
谁有经验的介绍一下哪个更好？
谢过～～～ |
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