f***4
发帖数: 886 | 1 我觉得在某种意义上说是死胡同。但是当不住发文章的。
在larvae里观察神经损伤，再生，药物在其中的作用，和成年差别实在是太大了 |
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a********k
发帖数: 2273 | 2 恩，这就是我想说的。larvae太太太不一样了，实在是很难做为一个疾病模型。 |
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S*********e
发帖数: 127 | 4 Bovenkamp DE, Goishi K, Bahary N, Davidson AJ, Zhou Y, et al. 2004.
Expression and mapping of duplicate neuropilin-1 and neuropilin-2 genes in
developing zebrafish. Gene. Expr. Patterns 4:361–70
Cahill PD, Brown BA, Handen CE, Kosek JC, Miller DC. 1987. Incomplete
biochemical adaptation of vein grafts to the arterial environment in terms
of prostacyclin production. J. Vasc. Surg. 6:496–503
Fischer-Colbrie R, Kirchmair R, Kahler CM, Wiedermann CJ, Saria A. 2005.
Secretoneurin: a new player in ang |
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S*********e
发帖数: 127 | 6 Biochem Cell Biol. 1999;77(6):527-42.
Cell adhesion and the actin cytoskeleton of the enveloping layer in the
zebrafish embryo during epiboly.
Zalik SE, Lewandowski E, Kam Z, Geiger B.
a*****[email protected]
thanks alot |
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p*****m
发帖数: 7030 | 7 我其实意思是说要改变现在的animal model （比如说吧 搞autism model，弄个环境刺
激或者孤儿老鼠的model要比single gene mutant model至少在face/content validity
上靠谱），而不是说不要animal model呀，呵呵。iPS是针对之前的drug screen阶段的
想法 这个和animal model不是矛盾的
另外我对HTS的想法就是过分追求throughput放弃了本来可能的在这一步引入的复杂性。
比如说吧 如果不是用in vitro/cell based screen，而是吧screen放到zebrafish或者
什么低等动物去做 在safety和PKPD方面会收获很多额外的好处。我看过些资料 似乎大
部分的lead compounds from HTS在preclinical还有phase I毙掉的 如果之前screen已
经参考了这些因素也许不会浪费那么多钱 当然throughput肯定会受影响。另外就是对于
没有明显target得病现在的HTS不好搞，这个原帖说过了就不说了 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 8 这个我同意 所以我一开始就说了 model的问题不是工业界的问题 是基础研究的问题。
但是这不妨碍他是个破坏pharma pipeline的问题：） 其实我说这些问题也好可能的新
想法也好主要是梳理一下我自己的思路 然后希望有像你这样内行来讨论，比如说我就在
想有没有更好的stroke model来screen drug（上几贴） 等等。
毒性和PKPD我们可以分开说。看起来PKPD的pathway保守型要强得多，比如一个molecul
e怎么过血脑屏障，怎么进细胞，怎么过golgi，等等，因此我是觉得用低等动物像fish
还是很有意义的。
说到毒性，你说的也许对也许不对，问题是我们还不知道答案:) 我知道比如说pfizer和
norvatis就在试探性的做看zebrafish做出来的毒理结果和大动物的有多相似，如果结果
不错的话那就不是问题了，对么？我只是说这是个可能的思路，用来解决现在HTS完全不
考虑毒性导致产出率太低的问题，不是说用fish就是100%可靠的思路。而且你也知道，
用大动物（狗 鼠）来做毒性试验的可靠性也不是100%的，他们和fish的效用差别未必就
是天上地下， |
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t*d
发帖数: 1290 | 9 没有研究过 PKPD。不过说道这个，俺偏一点题：如果日后精确制导的药物传输可以实
现的话（比如通过 nano particle，改造的virus），做个新药是不是就简单多了？
比起用 zebrafish，我个人觉得找 toxicity biomarkers 可能更靠谱一点（纯个人不
靠谱感觉，呵呵）。
就在
molecul
fish
pfizer和
结果
全不 |
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S*********e
发帖数: 127 | 10 Mutagenesis strategies in zebrafish for identifying genes involved in
development and disease.
Amsterdam A, Hopkins N.
Trends Genet. 2006 Sep;22(9):473-8.
MicroRNA-132-mediated loss of p120RasGAP activates the endothelium to
facilitate pathological angiogenesis.
Anand S, Majeti BK, Acevedo LM, Murphy EA, Mukthavaram R, Scheppke L, Huang
M, Shields DJ, Lindquist JN, Lapinski PE, King PD, Weis SM, Cheresh DA.
Nat Med. 2010 Aug;16(8):909-14.
a*****[email protected]
thanks alot |
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l***i
发帖数: 168 | 12 只知道
关于 zebrafish, 有 Zfin
关于 mouse， 有 MGI
另外，NCBI 和 Ensembl 是综合性的。
有关于其它常见实验动物模型的genome database吗，比如 drosophila , yeast？ 谢
谢。 |
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L**********O
发帖数: 1761 | 14 赫赫。。。我也不懂zebrafish啥的..。就是听说过。。。
顺便羡慕一下你们志同道合~ |
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f*********t
发帖数: 143 | 15 Thanks a lot in advance. Please send the paper to z*****[email protected]
Zebrafish. 2010 Jun;7(2):199-204.
Photoactivation of the CreER T2 recombinase for conditional site-specific
recombination with high spatiotemporal resolution.
Sinha DK, Neveu P, Gagey N, Aujard I, Le Saux T, Rampon C, Gauron C,
Kawakami K, Leucht C, Bally-Cuif L, Volovitch M, Bensimon D, Jullien L, Vriz
S.
Ecole Normale Supérieure, Laboratoire de Physique Statistique, UMR 8550
CNRS, Paris Cedex, France. |
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m*********r
发帖数: 136 | 16 I cannot get access to the database
y******[email protected]
Thanks |
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d*****r
发帖数: 2583 | 18 ☆─────────────────────────────────────☆
timeonly (圆满) 于 (Thu Dec 23 15:28:05 2010, 美东) 提到:
发信人: desesperado (Estoy), 信区: Military
标 题: 方舟子谈蜂蜜：基本上是高浓度的糖
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 23 12:11:10 2010, 美东)
http://discover.news.163.com/10/1223/10/6OJ4ABLE000125LI.html
核心提示：方舟子认为用人工的方法，可以制造出一种与蜂蜜一模一样成分的东西。其实蜂蜜并不神秘，基本上就是高度浓缩的糖。蜂蜜除了水分，剩下的几乎都是各种各样的糖。蜂蜜的成分会有变化，但大同小异。
中青在线-中国青年报12月23日报道 什么是蜂蜜呢？这个问题似乎很简单，是蜜蜂采集花蜜酿造出来的甜味物质。蜜蜂把花蜜吸到它的第二个胃 ——“蜜胃”里面，在那里进行消化（让花蜜中的蔗糖大部分转化成果糖和葡萄糖），回到蜂巢吐出来，让水分蒸发、浓缩，这样，原来
含水分大约 80%）... 阅读全帖 |
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M*****n
发帖数: 16729 | 20 有关zebrafish的，very impressive.
PS: 俺老婆认为人家talk很pp, 但是不能说人家mm很pp. |
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M*****n
发帖数: 16729 | 21 你这个见解应该去问那个fly lady,
问问他为啥当年不专心研究Drosophila, 反而要转行搞zebrafish genetics.
又快
一个
fis
/r
非常
optomot |
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M*****n
发帖数: 16729 | 22 peoplem对zebrafish 知道点，但是不多。 |
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s******r
发帖数: 2876 | 23 那他是为什么呢？
你这个见解应该去问那个fly lady,
问问他为啥当年不专心研究Drosophila, 反而要转行搞zebrafish genetics.
又快
一个
fis
/r
非常
optomot |
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M*****n
发帖数: 16729 | 24 用鱼screen drug最大的优点就是直接就是in vivo.
俺觉得这个是鱼的最大的potential. zebrafish 的niche就剩这么点了。 |
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f**u
发帖数: 346 | 25 我倒是觉得zebrafish这个东西在发育领域之外可以有用武之地的地方可能不多。
筛药什么的这方面我不懂，所以就不多说了。
如果说不局限在zebra本身，鱼类作为一个整体，我觉得可能是未来Evo-Devo研究的主
力。
现在的Evo-Devo研究最大的问题就是都在做形态方面的研究，完全没有考虑生态。
很多很著名的例子都是找到了哪些基因的什么变化导致了物种形态的变化，
stickleback这种鱼也算是做出了一些贡献。
我觉得以后Evo-Devo一定会考虑生态和性选择，cichlids这类鱼应该是一大热点。
fish |
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M*****n
发帖数: 16729 | 26 evo-devo的研究谁来投资？DOE?DoD? NSF?
能跟NIH比吗？制药是NIH的投资方向。
zebrafish 的春天快来了。 |
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M*****n
发帖数: 16729 | 27 跟lab/PI有关系
但是最关键俺觉得还是跟你研究的system有关系。
Zon lab 研究的blood development在zebrafish里面搞了N年了，丫的弟子门人无数，
而且这个system被大多数peer都接受了，所以不是特别难的sell
如果你搞一个新的system, 没有人搞过，初始阶段一定很困难，必须convince NIH来投
资你的system。
我估计Zon开始的时候一定也挺困难的，不过那时候美国可能钱还比较多，不是太难受。
现在NIH的钱越来越少，要搞新东西，一定加倍困难。 |
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c******m
发帖数: 884 | 28 好歹zebrafish算是vertebrate, 还是要比fly/worm进化了的。 |
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b*********l
发帖数: 490 | 29 My in situ doesn't work at all.
I run out the dig labeled RNA probe in gel and it looks pretty good. Then I
use 100ng-400ng in 200ul hyb mix in a trial experiment, both the Roche AP (1
antisense and sense probes. For NBT/BCIP staining, no blue color showed up.
I am wondering if somebody could give me some suggestions. Thank you very
much. |
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l*****a
发帖数: 1431 | 30 do you have a positive control? |
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b*********l
发帖数: 490 | 31 No, I dont have.
That's why I feel very frustrated, I don't know what's the problem..... |
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l*****a
发帖数: 1431 | 32 by positive control, I mean a probe that you know for sure will work.Those
easy working genes, like myod, krox20,shh. |
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x**w
发帖数: 112 | 33 1. try to get some probes as control (ntl, myoD or somehing)
2.fix the embryos with fresh prepare PFA |
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a********k
发帖数: 2273 | 34 2 is very important for in situ. For the first point, you need a positive
control probe that labels your specific tissue as a good control, those
published by other labs should work for you. |
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b*********l
发帖数: 490 | 35 So you mean I can buy probes from company? |
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b*********l
发帖数: 490 | 36 非常感谢。在哪里能买到contrl probe 啊？ |
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l*****a
发帖数: 1431 | 38 I can send you my myod construct, if you pay for the shipping. |
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l*****a
发帖数: 1431 | 39 I can send you my myod construct, if you pay for the shipping. |
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a******n
发帖数: 392 | 40 根据我做了几年的 in situ 的经验，不需要DEPC处理的水，任何一个步骤都不需要。4
％ PFA 固定24小时，样品里的
mRNA不用担心被降解。
been |
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a********k
发帖数: 2273 | 41 it is true when you get a result...but it is not true when you are dealing
with some low-expression genes. I got results from both, but I always use
DEPC water later on.
。4 |
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M*****n
发帖数: 16729 | 42 you can buy it from me. :-D
BTW, myoD is a probe for muscle, but if you are looking for some other
organs ,better get a positive control for those organs instead.
muscle is just too easy to stain, not a perfect control for internal organs.
BTW, i don't take credit card, but a starbucks gift card is OK. |
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M*****n
发帖数: 16729 | 43 it is already better to over-think it than under-think it.
try every way you can to make sure in situ works. then you can be lazy and
save some steps later.
been |
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b*********l
发帖数: 490 | 44 thank for the offer:)
organs. |
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s******r
发帖数: 2876 | 45 那冰冻组织和福尔马林fix的组织，哪一个更适合做in situ，
请问各有什么利弊？
根据我做了几年的 in situ 的经验，不需要DEPC处理的水，任何一个步骤都不需要。4
％ PFA 固定24小时，样品里的
mRNA不用担心被降解。
been |
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X******n
发帖数: 914 | 47 话说一个牛校PPMM携K99/CNS/牛老板到一top20大学找faculty，面试报告很是精彩，
chalk talk略显不足。有一好事faculty去问系主任的看法。系主任说做fish需要系里
提供养鱼的房间，不象老鼠，系里早已经有了老鼠房，这是一个很大的disadvantage。
这只是道听途说的，如果实力超群的话，一个养鱼房算的了什么。 |
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s******r
发帖数: 2876 | 49 fly不需要什么特殊的设备吧。
就算是养果蝇，也需要两个fly rooms. |
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c****r
发帖数: 199 | 50 这说的是前两天热门话题的mm吗？这学校也怪了，如果不想出钱搞鱼房，为啥面试做鱼
的？ |
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