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H********g
发帖数: 43926 | 2 细菌通常一个，古生菌（跟细菌有很多不同的原核生物）可以有多个。
Most bacteria have a single circular molecule of DNA, and typically only a
single origin of replication per circular chromosome.[3]
Most archaea have a single circular molecule of DNA, and several origins of
replication along this circular chromosome.[4] |
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c*******e
发帖数: 4642 | 3 我我我，实在忍不住了。。。。。。。。
细菌是单细胞木有细胞核的,called prokaryote，即所谓原核。有细胞核的，比如酵母
，called eukaryote,即所谓真核
一般定义上，起码俺学的microbiology是说，parasite是所有eukaryotic organisms
细菌，病毒都排除在外的 |
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M********n
发帖数: 67 | 4 【 以下文字转载自 Thoughts 讨论区 】
发信人: Meditation (沉思中的安慰), 信区: Thoughts
标 题: 沉思录
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jun 1 00:44:47 2010, 美东)
有时候，我在想，如果我们原本真的是一群小小的原子，分子，躺在混沌的世界里，结
果有一天，老天打了个喷嚏，或是无数个喷嚏——闪电——让小小的分子们手拉手，聚
在了一起，然后他们开始自主不自主的寻找未来。
慢慢的，原核细胞产生，然后真核细胞，然后。。。细节有些忘记了，但大家都知道那
过程。想得机械一点，我们就是由分子，细胞，组装起来的大机器人，如果联想得恐怖
一点——低头看看你的指甲，其实他们产生的角质化过程，跟昆虫外壳变硬的过程差不
多——也就是说，你的指甲，就仿佛是趴在你手指上的，十个昆虫壳。。。如果这个让
你做恶梦，你可以去读圣经，因为那里就完全不一样了。
那么，小分子们组装起我们这个大机器人干什么用呢？简简单单的做个海藻，躺在海里
晒太阳，不好么？如果摄取更多能量是最原始的‘欲望’，那组成了我们人类，这个目
的达到了么？似乎我们摄取能量的效率，并 |
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M********n
发帖数: 67 | 5 有时候，我在想，如果我们原本真的是一群小小的原子，分子，躺在混沌的世界里，结
果有一天，老天打了个喷嚏，或是无数个喷嚏——闪电——让小小的分子们手拉手，聚
在了一起，然后他们开始自主不自主的寻找未来。
慢慢的，原核细胞产生，然后真核细胞，然后。。。细节有些忘记了，但大家都知道那
过程。想得机械一点，我们就是由分子，细胞，组装起来的大机器人，如果联想得恐怖
一点——低头看看你的指甲，其实他们产生的角质化过程，跟昆虫外壳变硬的过程差不
多——也就是说，你的指甲，就仿佛是趴在你手指上的，十个昆虫壳。。。如果这个让
你做恶梦，你可以去读圣经，因为那里就完全不一样了。
那么，小分子们组装起我们这个大机器人干什么用呢？简简单单的做个海藻，躺在海里
晒太阳，不好么？如果摄取更多能量是最原始的‘欲望’，那组成了我们人类，这个目
的达到了么？似乎我们摄取能量的效率，并不如一些低等生物。那，是为了功能多些？
我们确实是比蓝藻功能多些，能在陆上爬了，后来又能跑了，后来又能用两条腿儿跑了
，但功能多了为了啥呢？能量？还是那句话，人类并不是最有效的能量摄取生物啊？
看来，从高级理解低级，和从低级理解高级一样的难 |
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B******y
发帖数: 2255 | 6 呵呵，俺贴块文字：Peter J Bowler的‘Evolution: the history of an idea’，也
是本挺有名的Pro 进化论著作。阁下可以看看化学进化是否被认为现代进化论中的一部分
。
你若看TheRinger的假设问题‘如果有一天人类通过技术手段观察到生命从无到有进化成人的历史过程，你会不会接受进化论’。他也是把‘生命从无到有进化成人’联系在‘进化论’里。那怎么能说俺反对进化论（包括‘生命从无到有’）是打稻草人呢？
（第20章中一块）
生命的起源
一个有助于达尔文主义复兴的相应发展是，产生出第一有关地球上生命起源的现代
理论。在19世纪后期，生命通过“自然发生”起源于非生命物质这一古老的观点终于声
名狼藉，然而进化论者却拿不出合理的理论来解释最初的生命过程是如何开始的。1936
年，俄国生物学家亚历山大·奥巴林从一种新的角度来解答这个问题，他提出以不断增
长的复杂组织水平上的化学进化过程，来取而代之原来的单靠自然发生的观点。这样不
仅扩展了进化思考的范围，同时也再次支持了达尔文主义，因为奥巴林假定，在生命结
构出现之前，自然选择是前生命结构改进的机制... 阅读全帖 |
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B******y
发帖数: 2255 | 7 再来回答大淡水鱼的问题，这算进化论成功的例子，但不能以点盖面，以个别证明全体。
你若看进化论此类的成功，是在个别点上，它的Fail，却是大范围普遍的在整个面上
。
比如进化论最初认为复杂生态系统是在地球历史上漫长年代里不断缓慢进化达成，应
该是近似均匀的漫长过程，但寒武纪生命大爆炸却完全与此对立。仅中国云南澄江距今
5.3亿年的化石中，一下发现了藻类，多孔动物门，腔肠动物门，鳃曳动物门，动吻动
物门，叶足动物门，腕足动物门，软体动物门，节肢动物超门，棘皮动物门，这太可怕
了，因为就剩下了脊索动物门没有发现。而此前的时期只有原核生物。
进化论若是成功，那应该能predict一点这个吧。它完全没有！这些化石的发现跟理论
的完全对立。至今进化论还在试图解释这个问题。
你要看进化论在这些问题面前，它是根据矛盾证据修改理论。寒武纪化石大爆炸发现，马上
修改时间顺序。其实上百年来，它一直在根据矛盾证据修改理论。
进化路径一改再改，时间顺序也一改再改。不断地削足适履，它在整体上的prediction
在哪里？
数学有逼近算法，就是不论初始值多么不正确，若正确的校正机制，总可以不断接近真
解。进化论就... 阅读全帖 |
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j*******7
发帖数: 6300 | 8 http://tieba.baidu.com/p/1749516667
概率计算否定了进化论的核心——基因突变机制
达尔文时代，近代西方科学正处于奠基阶段，对生命现象的认识还很肤浅。那时的人看
到了家养动物的诸多杂种变异，就认为物种也能这样变成其它种，这就是进化。后来，
随着基因的发现和深入研究，学者们才意识到如果基因不发生根本的变化，不管后代表
面与祖先有什么差异，也没有进化意义。然而基因又是极其稳定的，只有不正常的「基
因突变」才能使之发生改变，那么「基因突变」也就成了现代进化论的核心了。这是现
代所有的进化论者公认的。这里，我们就集中分析这个核心理论。
理论和实际上，基因突变产生高级性状的机率几乎是零
基因突变，是一种在基因复制或修复损伤等过程中发生的随机错误，所以又叫随机突变
，本身就是一种病态现象。它发生的机率非常低，大约在万分之一到十亿分之一之间。
低等原核生物的突变率较高，大约为千分之一，而高等类型的生物中，许多基因的突变
率是十万分之一到一亿分之一。
基因突变能否产生高级特征（性状）呢？对基因的深入研究发现∶这种情况发生的机率
极低。我们知道一个基因的核心是由几百到几千... 阅读全帖 |
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n********n
发帖数: 8336 | 9 送交者: 职老 2015年10月04日19:26:43
(1)俺们知道，无论是进化论还是创造论，在生命这个层面而言，都是依据同样的科学
依据来解释生命的来源。
唯一不同的是，创造论首先强调的是圣经旧约第一部分：创世纪GENESIS，也可以翻译
成：基因生，因为GENE就是指基因，虽然人类一开始并不知道是DNA或者说DNA承载的密
码信息，SIS这个后坠在生物学中指各种“生”，比如ANGIOGENESIS指血管再生--俺是
这个领域的权威和专家，对此不懂的同学，比如D同学，可以提问，嘿嘿。也就是说，
今天的创造论科学家们并非是平空捏造的，首先他们有神的启示，或者说神的话的记载
。因为旧约的第一部份基因生据信最早写于公园前3000千年，也就是现在5千年前，就
人类的文明记载，这个时期绝对不可能是人类自己觉悟出来的，或者说进化来的知识，
甚至那时最原始的科学都尚不存在。以前有人民怀疑这个古代记载，但后来大量的考古
证明，完全证实了这个年代推断，而且只早不晚，因为最近的7000年前的叙利亚泥板有
类似的亚当夏娃的记载。而且这个时期，中国人民的记载也是神的话时期。所以今日的
创造论科学家包括持I... 阅读全帖 |
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r***e
发帖数: 12 | 10 我是临床系本科毕业，当年联系时运气不好，现在一个小烂校学生物，研究原核生物的基
因。我不敢兴趣，想离开这里，转学或工作。听别人说拿医学学士在美国大学可以申请做
POSTDOC,因为他们认为中国的BM就是MD，不知这是不是真的？如果是真的，这样倒是可以
节省很多时间，但不知道我的情况是否适合走这条路。请师兄师姐们指教。谢谢。 |
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W*********n
发帖数: 775 | 11 我本科和硕士7年在海大度过，对海大感情很是深厚！时常去海大校园散步，感觉很美
好、很亲切！
今年6月我将从中科院海洋所的海洋生物学专业博士毕业；希望去美国作博后。我博士
期间做扇贝（软体动物）的分子免疫相关研究，主要是克隆了2个蛋白酶抑制剂基因，
运用real time RT-pcr 对其在菌刺激后的表达规律进行研究，验证其参与了免疫应答
；然后在原核细胞中对基因进行表达，对重组蛋白进行抑制蛋白酶的活性研究，并对其
抑制常数进行实验与计算。本想继续做点pull-down，及RNAi对其相互作用的蛋白进行
研究，并对其体内功能进行研究，但是时间好像比较紧张。
硕士期间做赤潮藻原甲藻属的分子系统生物学研究（18S，28S，ITS区），并对物种特
异性探针及引物的设计作了研究，以期用于赤潮藻的监测。
查阅美国，做海洋生物的分子生物的好像不多，目前查到Dr Warr。
我想让海大校友看看我这个背景（自我感觉比较差，不过咱海洋生物起步比较晚，就这
现状）申请美国哪个方向的比较可行？那些专业，或者那些学校？当然指点一些实验室
最好。
感觉转医学健康相关应该一点戏都没有的；但是"免疫-流行病"，或“ |
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s*****e
发帖数: 970 | 12 为了及时顺应国家对“核工程与核技术”人才日益增长的需求，机械动力学院“核工程
与核技术”专业在校领导的支持下，自2006年起，在原有本科生规模的基础上采用在校
内二年级转专业的方式，成功扩大培养了一批学生，为国家核事业输送一批急需人才。
在前两年的基础上，今年有12名同学成功转入核专业，机械动力学院特将原核专业学生
和新转入核专业学生组成新的专业班级，9月18日，召开了班级成立大会，2006级思政
教师郝静，2006级核专业45名学生参加了会议，会议由班主任张志老师主持。
郝静老师宣布2006级核专业班级成立，希望大家在学习上互相切磋，团结一致，共
同进步，争当优秀。班主任张志老师提出三点希望：注意人身安全，积极锻炼良好体魄；
端正学习态度，找准个人发展方向；打造和谐班级，培养民主、团结、活泼的班风学风，
全面发展每个人的个性特长。
会上根据自荐和他荐选出了班委，大家表示要为大家做好服务工作，努力学习，促
进班级同学的凝聚力，促进同学们的学习气氛，为核事业发展贡献自身力量。
[作者]：机械动力学院学生组 |
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j****u
发帖数: 1413 | 13 请见：http://www.ustcif.org/default.php/content/1623/
2013年5月9日，美国霍华德休斯医学研究院(HHMI)宣布全美27位顶尖生命医学学者当选
HHMI研究员，他们从1155名申请者从脱颖而出。何川（中国科大8912校友）成为入选唯
一的华人科学家。美国霍华德休斯医学研究院将在未来五年内投入约1.5亿美元支持生
物医学基础研究。
何川出生于贵州清镇。1989年，何川从贵州凯里第一中学进入中国科大应用化学系学习
。2000年获麻省理工学院博士学位，2000到2002年在哈佛大学做博士后研究。何川在
2010年7月1日晋升为芝加哥大学正教授。从副教授晋升正教授，何川花了两年，打破了
芝大理学院两年半的记录。何川现为芝加哥大学生物物理动态研究所，主任
何川长期致力于通过化学生物学、微生物学及结构生物学相结合的手段，研究和证明多
种临床感染性病原体中的全局性调控蛋白的调控机理，研究和开发针对各种临床感染性
病原体的小分子药物并且发展和使用新型活性位点化学偶联技术，表征和研究原核生物
及真核生物中DNA去甲基修复酶的结构及性质，同时将这些手段进一... 阅读全帖 |
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n******e
发帖数: 623 | 14 嗯，回顾一下，这人出名了。
美科学家14年4次宣称发现外星生命获飞猪奖
http://tech.sina.com.cn/d/2011-04-02/11465364708.shtml
新浪科技讯 北京时间4月2日消息，声称在陨石里发现微生物生命的科学家、美国
宇航局的天体物理学家理查德·胡佛已经获得伪科学最高荣誉——飞猪奖(Flying Pig
Award)，这是每一次愚人节都会颁发的奖项。
这项奖的设立者詹姆斯·兰迪设立飞猪奖的目的，是把它颁发给“最应该摘得此奖
的吹牛者、骗子、灵术倡导者、假冒的科学家和信仰治疗师”。胡佛博士在过去14年间
，曾4次声称已经在陨石里找到生命迹象。他表示，他认为他的发现能回答地球生命的
起源问题，并要求其他科学家拿出证据证明他的发现是错误的。兰迪表示，尽管无人自
告奋勇对胡佛的声称提出质疑，但是也没有科学证据支持他的说法。
胡佛表示，他的结论是在对降落在全球各个偏远地区的微小细菌进行10多年的研究
后得出的。提及将成为5名获此“殊荣”的人之一，他说：“我从未听说过它们(飞猪奖
)，不过要是他们认真阅读了我的论文，他们可能会得出更加明智的结论。大量同行评
... 阅读全帖 |
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d***y
发帖数: 263 | 15 今天腰背太疼了，没法读下去。以下是一些大概印象, 欢迎指正。
1。理论的多，实验的少
2。原核的多，真核的少 （collins JJ 的nature paper好像有跟本错误）
3。 focus on txn 的多，post-txn 的少
4。绝对重要，很多critical gene protein level is very low, understand how noise
is generated or filtered out is very important.
5.实验室有一些ground work,能节省不少时间
conclusion: Seem like worth pursuing a career on this...??? |
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r********s
发帖数: 149 | 16 那我们就来点建设性的讨论吧。你提到的最近几十年的数学方法的发展，是不是指的混
沌理论？不错，生物科班出身的不懂太多数学，因为大部分实验不需要太多的数学知识
，微积分都用不上，顶多用用简单的统计知识。另一方面，搞数学或者是理论物理的又
有多少对一个问题的生物学意义有很深的了解呢？象Crick这样的人，百年难求的。生
物学的复杂性体现在这些方面：从生物体角度来说，从最简单的病毒（自己不能养活自
个，只有一些简单的东西，需要hijack宿主的系统），到稍微复杂的衣原体之类，到原
核类的细菌，到真核类的真菌，这只是单细胞类的。即使是单细胞类的，原核与真核的
调控机理也不一样。多细胞类的，还要考虑细胞与细胞之间的联系，细胞的分化，再到
高等一点，出现了神经系统。还有冷血动物与温血动物的区别，一直到人的意识的产生
。这所有的一切，我们应该都学过。我们就先着眼在细胞的层次上吧。毕竟这是生物的
基础。一个真核细胞里面有多少东西呢？首先是不同的细胞器把细胞分成不同的小空间
，细胞器之间也有联系，比如membrane transfer 之类的。很多细胞器附着在细胞骨架
上，细胞里面的蛋白质浓度非常高。有时 |
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a******g
发帖数: 129 | 17 bob们太年轻了。故事会从195x年开始，除了介绍一下重大发现外，主要8g一下大牛们
，不过最近比较忙，所以会拖的比较长，希望大家谅解，先贴个大刚。
1.原核时代
2.操纵子模型
3.真核时代
4.核小体
5.组蛋白，转录，epigenetics及其他 |
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a******g
发帖数: 129 | 18 1953年，Waston,Crick和Willinkins划时代的DNA double helix结构的建立标志
着生物学进入了分子时代，同时DNA也无可争议的成为人们所探求的核心遗传物质。但
是大家并不知道DNA所携带的遗传信息是如何传递给蛋白质并最终控制生物的表型。当
时的遗传学证据表明RNA极有可能扮演一个中间人的角色，RNA可以将DNA的遗传信息传
递给蛋白质。也正是基于此，发现DNA double helix后的1958年， Crick提出了分子生
物学的中心法则(Central Dogma)：遗传信息由DNA携带，并通过RNA传递给蛋白质并行
使表型。这个模型的重要性不必多说，但是DNA到底是怎样将遗传信息传给RNA并不清楚
。于是乎，大家猜测有一种关键的酶能够负责这一过程。1955年，那个时代最有影响力
的biochemist，Severo Ochoa率先发现了PNPase(Polynucloetides Phosphorylase, 多
聚核苷酸磷酸化酶),这个酶能够直接在体外催化NDPs聚合成RNA。这一发现在当时无疑
是爆炸性的，大家于是乎都觉得RNA聚合 |
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a****o
发帖数: 1786 | 20 赞一个先
Arthur Kornberg 写的一片散文中说， 他们和RNA聚合酶擦肩而过
Arthur Kornberg是Coris 的博士后吧 |
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e****s
发帖数: 1125 | 22 实验之余就喜欢看这类文章，对我门外汉来说，真长知识。 |
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e****s
发帖数: 1125 | 23 实验之余就喜欢看这类文章，对我门外汉来说，真长知识。 |
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K****n
发帖数: 5970 | 27 BBRC不是有人说昨天投稿今天接受？到底是什么等级的杂志涅 |
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e*******e
发帖数: 64 | 29 最bsbsbbrc的
炸药奖的seminal工作也有灌在bbrc上的，1978年
就是这个年头也不乏好工作 |
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w******n
发帖数: 168 | 30 不过现在的bbrc太水了 无数东西无法重复。。。。 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 32 这杂志不管过去牛不牛 现在总体来说是烂了这个没什么疑问把 过去50年沦落的杂
志多了 JBC,J Physiol, JGP FEBS letters blabla 当年也都是发了nobel水平的工
作的;Nature/Cell/Plos系列的兴起又甩掉了一大批当年的老牌杂志 从G&D EMBO到
JCB blabla;将来open access真的牛B了又不知道谁要掉队。这些东西总会发生的
也不能因为伊曾经辉煌过就不承认现实不是 赫赫 |
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w******y
发帖数: 8040 | 33 说历史有头用啊？
要是历史有用， 阿三和中国人就不用跑米国来屁挨着地和postdog了 |
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e*******e
发帖数: 64 | 34 毫无疑问也承认现实呀
我不知道也没认为他过去很牛啊
我就是说他上面过去有过好东西
现在还是有至少在我看来
虽然我觉得它总体可能还不如cell research
不能说牛journal没有烂文章，烂journal就没有好文章啊 |
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p*****m
发帖数: 7030 | 35 这个当然阿 这不是泛泛而论么 虽说具体情况具体分析 不过大概的区别还是可以看
出来的吧 所以你不用bs... |
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Y**********j
发帖数: 369 | 40 Roger Kornberg有什么贡献能“带领”炸药奖？不吝赐教 |
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l*********i
发帖数: 332 | 41 转录的文章是要顶的！
这么多年了，终于又有人写这种文章了，哈哈哈哈。
跟着俺的老路走，看来你有朝一日也会被人肉地，不过trust me, it doesn't hurt
that much. |
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a******g
发帖数: 129 | 42 我照你学的，现在不写，恐怕有些名字和事情，大家以后就不知道了。 |
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a******g
发帖数: 129 | 44 1959-1960年间，RNA聚合酶的发现为转录研究奠定了酶学基础，接下来的问题顺理成章
就是转录是如何被调控的。于是在1961年的cold spring harbor symposia on
quantitative biology会议上，两个法国佬Jacob和Monod根据已知的遗传和生化证据提
出了操纵子模型，其具体内容我不多说了，每本教科书上都有介绍。这个模型最关键之
处在于预测了一个可以和DNA结合的抑制因子。这个因子与DNA的结合阻止了RNA聚合酶
对DNA的识别。同年他们将这篇经典文章发在了JMB上。不过他们的模型实在太领先于时
代了，以至于5年之后，大家才找到这个传说中的抑制因子。1966和67年, Harvard的两
位大拿Walter Gilbert(发明DNA化学测序法和Sanger一起拿1980年Nobel的那位)和Mark
Ptashne（1997年Laskar）先后在大肠和lamba噬菌体中找到了61年Jacob和Monod预测
的抑制因子。此时操纵子模型就不在是模型了，而成为了教科书中的经典理论，而且影
响了以后整个领域。不过原核转录的研究并没有完结，因为 |
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i********f
发帖数: 206 | 45 会不会是因为在原核和真核里面, t-RNA三联体密码的偏好性不同
cellulose
atgcagttacttcgctgtttttcaatattttctgttattgcttcagttttagcacaggaactgacaactatatgcg
agcaaatcccctcaccaactttagaatcgacgccgtactctttgtcaacgactactattttggccaacgggaaggc
aatgcaaggagtttttgaatattacaaatcagtaacgtttgtcagtaattgcggttctcacccctcaacaactagc |
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c**********5
发帖数: 653 | 46 我做的是5‘， 原核。
结果还没出来，不敢乱说 |
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C*******e
发帖数: 4348 | 47 只做过3'的RACE,原核,所以要用adaptor
做得是RNA-ligase-mediated-3'-RACE |
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h***e
发帖数: 146 | 48 天然产物合成研究基本上在原核生物的放线菌（红霉素，daptomycin），粘细菌（埃博
霉素），以及真核的真菌（青霉素和洛伐他丁）。因为操作容易，有工业价值。
以前基本上是从化合物到生物合成基因簇，随着sequenceing的发展，有更多的orphan
gene cluster被发现，从基因到化合物现在很fashion，有好多技术就是来发现克隆和
表达（异源）这些biosynthetic pathway的。
另外一些PKS和NRPS的基因都非常大，一般都克隆技术都比较困难。
lz说的第一个问题，我感觉主要是调控的问题吧，比如promoter，transcriptionial
factor。 可以换promoter或者删掉负调控基因来实现。
2，这些生物合成基因大多都很大而且很多都很敏感的，点突变都会引起产量的大幅下
降。 |
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