i*****r
发帖数: 318 | 1 请问您是在哪个软件作图的？我在用R软件，做因子分析，R得出的结果有loadings，还
有共同因子的方差，特殊因子的方差。
还有SSloadings,这个SSloadings是不是特征值？好像在R当中看不到特征值。
我知道SPSS计算当中把特征值大于1的因子都放入计算当中。但是在R当中作因子分析好
像看不到特征值。
不过在R当中做主成分分析可以看到特征值，R可以得出标准差的平方，等于特征值。 |
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i*****r
发帖数: 318 | 2 主成份分析中确定主成份个数好像是看累计贡献率超过70-80%就行。
那么请问因子分析中因子数量怎么确定啊？ |
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p********a
发帖数: 5352 | 3 ☆─────────────────────────────────────☆
wumaths (maths) 于 (Mon Jan 1 21:44:45 2007) 提到:
给出数据我能作因子分析和旋转后的loading矩阵，
可是如果给出loading矩阵，我就不清楚如何求旋转后的矩阵了。
没有原始数据，只有loading，
不过我用splus解决了，不知道sas里面怎么处理
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papertigra (长工胖头猪) 于 (Mon Jan 1 21:48:16 2007) 提到:
proc IML can do that
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wumaths (maths) 于 (Mon Jan 1 21:54:12 2007) 提到:
iml找到了，但是具体哪一个没有找到……
版主能告诉我具体哪一个命令吗？
我正在查找sas帮助
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l*********s
发帖数: 5409 | 4 netflix price 原始的贝叶斯随机矩阵分解解法：
http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?
doi=10.1.1.127.6198&rep=rep1&type=pdf
我的问题是
1)如果没有适当的限制，因子分析的解不是唯一。 这个对MCMC有什么影响？比如，多模态? 边际分布
弥散？
2)要进行多维的预测，怎么做呢？后验密度函数给出预测分布的均值？模？ 如果是模，怎么求经验多元
分布的模？ |
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T*****e
发帖数: 247 | 5 首先，这是个问题。
其次，我列举几种我知道的方法，并稍微评价优缺点。
最后，希望大家补充其它方法。目的是集思广益。
1.找到调控序列（Regulatory elements）
这个可以做promoter bashing，一段一段去掉调控序列中的某一部分。根据剩余部分是
否仍然有表达或者对某个刺激有反应，这样可以推测出Enhancer中哪一段序列是必须的
。这个运气好的话，应该能找出一小段必要的序列。我看有人能找到大概500bp就可以
了，有人能缩小到100bp，还有牛人能缩小到20bp。好吧，那基本离最后的调节序列的
大小不远了。
Pros：思路相对简单，结果相对清楚
Cons：如果调控序列有几个，并且分布不集中，又或者有几个不同的转录因子参与，于
是乎有不同的调控序列且分布分散，那么，很难有干净容易解释的结果。
2.做reporter盲筛
有了Enhancer当然很容易做reporter，从早年的CAT到现在随处可见的luciferase或者
GFP之类的，reporter用的相当普遍。有了reporter想要找转录因子，最简单的就是挨
个试了。过表达或者KD都行。
Pros：rep... 阅读全帖 |
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x*******a
发帖数: 11067 | 6 这个离查明还早得远吧。简单说来，作者是把测量的各种成分的质量，比如说铅、钠、
镁、硫酸根、在不同时间的数据，输入一个多因子分析模型（multivariate factorial
analysis）。通过这个模型，猜出来可能有几个不同的因子在起作用。再根据不同污
染源的特点，将这些因子对号入座。作者分析出来六个主要源，然后判断其中一个是汽
车源。
但是很奇怪的是，作者认为是机动车那个因子排硫量为0。我现在有两个问题：1，多因
子分析未必能区分两个很相似的因子，例如，如果柴油车又吐硫又吐硝（中国柴油含硫
量是美国的五倍），那它会不会合在其他因子里分不出来？2、含量为零的污染源会不
会只是比较清洁的汽油车？
上次看到一个数据，说总数占15%的柴油车，主要是卡车，占中国汽车污染源的60%。如
果柴油车不在这4%里面，那么机动车占10%，这个数据就靠谱了。 |
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x*******a
发帖数: 11067 | 7 这个离查明还早得远吧。简单说来，作者是把测量的各种成分的质量，比如说铅、钠、
镁、硫酸根、在不同时间的数据，输入一个多因子分析模型（multivariate factorial
analysis）。通过这个模型，猜出来可能有几个不同的因子在起作用。再根据不同污
染源的特点，将这些因子对号入座。作者分析出来六个主要源，然后判断其中一个是汽
车源。
但是很奇怪的是，作者认为是机动车那个因子排硫量为0。我现在有两个问题：1，多因
子分析未必能区分两个很相似的因子，例如，如果柴油车又吐硫又吐硝（中国柴油含硫
量是美国的五倍），那它会不会合在其他因子里分不出来？2、含量为零的污染源会不
会只是比较清洁的汽油车？
上次看到一个数据，说总数占15%的柴油车，主要是卡车，占中国汽车污染源的60%。如
果柴油车不在这4%里面，那么机动车占10%，这个数据就靠谱了。 |
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W*********n
发帖数: 775 | 8 真核生物的基因 （转录出来的是mRNA），打算看一下调控它的转录因子（
transcription factors）,请问是否它的转录因子结合位点一定在转录起始位点上游？
以我的知识我认为：基因转录出来是mRNA, 所以转录酶是RNA聚合酶II，而 RNA聚合酶
II 的转录因子应该是在上游的（不知道这么说是否正确？）。
因为我的目标基因的翻译起始位点在第二个预测的Exon的中部，第一个Exon（500bp）
和第一个Intron（4500bp）比较长， 所以我想知道分析这个基因的转录因子，应该从
第一个Exon之前分析呢，还是应该从翻译起始位点之前分析？
谢谢！ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 9 En
plus 宏观对象的 学科 不能和protein dna ncRNA 等微观对象的学科 比较IF score
无论animal or plant
pls refer:
请动物所公布评估结果，看看有无问题？
作者：亚虎
动物研究所包括分类与系统学、生态与保护、农业虫鼠害综合研究、细胞膜、
生殖生物学（也多数在细胞水平上开展工作）。前三个被叫做“宏观口”，后两
个被叫做“微观口”。多学科混杂的研究所，也是很难用一个尺度评估的单位。
动物所的国际评估结果分为A, B, C三级；之后又按国际评估占70%， 5年来
的绩效占30%加权，再按比例分为A+，A,(A+B)/2, B, C, D， 进而进行资源分配。
但是国际评估和绩效都存在一定的问题。
国际评估分成宏观和微观两个组进行。国际评估委员由12个海外华人学者组
成（真正的国际评估应该找国际同领域专家），他们没能涵盖动物所的所有学科，
而且4个人去考核微观口，8个人考核宏观口，最后统一打分，评估结果能无偏差？
这个意见早已有人提出。
更有甚者，2005年-2008年的所内绩效，主要是根据发表论文的数量和影响
因子乘以1000计算的。由... 阅读全帖 |
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y****d
发帖数: 432 | 10 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: ysxsjd (ysxsjd), 信区: Statistics
标 题: 【★特供★】欧姆社学习漫画统计学
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Apr 9 13:26:46 2011, 美东)
内容简介
你是不是曾经被统计学里奇怪的名词和繁琐的计算所困？不知道在说什么，也不知道该
从哪里人手进行学习？那么，《欧姆社学习漫画:漫画统计学》太适合你了。这是世界
上最简单的统计学教科书，它通过漫画式的情境说明，让你边看故事边学知识，每读完
一篇就能理解一个概念，每篇末还 附有文字说明，只要跟着这些简单的习题进行操练
，你将能在最短的时间内成为统计学达人！
有趣的故事情节丶时尚的漫画人物造型丶细致的内容讲解定能给你留下深刻的印象
，让你看过忘不了。不论你是学生丶上班族或是已经有一家已经属于自己的公司的老板
，活学活用统计学，定会为你的学习与企业发展增添更多的便利。
作者简介
高桥信，1972年生于日本新泻县。毕业于日本九州艺术工科大学（现已更名为日本
九州大学），专攻艺术工科，研究科学信息传输。曾担任资料分析业务和研讨会讲... 阅读全帖 |
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y****d
发帖数: 432 | 11 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: ysxsjd (ysxsjd), 信区: Statistics
标 题: 【★特供★】欧姆社学习漫画统计学
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Apr 9 13:26:46 2011, 美东)
内容简介
你是不是曾经被统计学里奇怪的名词和繁琐的计算所困？不知道在说什么，也不知道该
从哪里人手进行学习？那么，《欧姆社学习漫画:漫画统计学》太适合你了。这是世界
上最简单的统计学教科书，它通过漫画式的情境说明，让你边看故事边学知识，每读完
一篇就能理解一个概念，每篇末还 附有文字说明，只要跟着这些简单的习题进行操练
，你将能在最短的时间内成为统计学达人！
有趣的故事情节丶时尚的漫画人物造型丶细致的内容讲解定能给你留下深刻的印象
，让你看过忘不了。不论你是学生丶上班族或是已经有一家已经属于自己的公司的老板
，活学活用统计学，定会为你的学习与企业发展增添更多的便利。
作者简介
高桥信，1972年生于日本新泻县。毕业于日本九州艺术工科大学（现已更名为日本
九州大学），专攻艺术工科，研究科学信息传输。曾担任资料分析业务和研讨会讲... 阅读全帖 |
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y****d
发帖数: 432 | 12 内容简介
你是不是曾经被统计学里奇怪的名词和繁琐的计算所困？不知道在说什么，也不知道该
从哪里人手进行学习？那么，《欧姆社学习漫画:漫画统计学》太适合你了。这是世界
上最简单的统计学教科书，它通过漫画式的情境说明，让你边看故事边学知识，每读完
一篇就能理解一个概念，每篇末还 附有文字说明，只要跟着这些简单的习题进行操练
，你将能在最短的时间内成为统计学达人！
有趣的故事情节丶时尚的漫画人物造型丶细致的内容讲解定能给你留下深刻的印象
，让你看过忘不了。不论你是学生丶上班族或是已经有一家已经属于自己的公司的老板
，活学活用统计学，定会为你的学习与企业发展增添更多的便利。
作者简介
高桥信，1972年生于日本新泻县。毕业于日本九州艺术工科大学（现已更名为日本
九州大学），专攻艺术工科，研究科学信息传输。曾担任资料分析业务和研讨会讲师，
现为作家。
著作有《漫画统计学之回归分析》丶《漫画统计学之因子分析》丶《用Excel学回归分
析》（以上由欧姆社出版）《即刻读懂生存时间分析》丶《文科生也可以理解的多变量
解析》（以上由东京图书出版）丶合着有《AHP和交叉分析》（由现代数学社出版），
等等。
... 阅读全帖 |
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f****r
发帖数: 311 | 13 日本东京大学医疗科学研究所中村佑辅教授和他的助手于3月1日、2日连续发表论
文，宣布发现抑制肝癌的遗传因子和修复遗传因子的DNA，有助于治疗癌症和开发抗
癌新药。
中村教授和他的助手古川洋一经过长期对抑制癌遗传因子的研究以及对100名癌症
患者癌细胞的分析，发现了一种抑制肝癌细胞增殖的遗传因子。他们把这种遗传因子注
入到肝癌细胞中，发现癌细胞的增殖受到显著抑制。
中村教授和助手荒川博文还发现了修复遗传因子的DNA以及细胞自杀防癌化的现
象。人体细胞中的DNA受损会导致癌变，如果这种伤害过大不能修复，这一细胞就会
自杀以防止自身癌变。研究中，他们对人体细胞加以紫外线、伽玛射线和抗癌剂，使细
胞所携带的DNA受伤，结果发现"P53R2"遗传因子所制造的蛋白质立刻跑到受伤的细
胞旁，合成修复用的DNA，取代受伤的DNA。"P53"如何指令修复受伤细胞的机理目
前尚不清楚。
利用细胞自杀原理可开发抗癌剂。抗癌剂可使癌细胞受伤超过修复的范围，引导癌
细胞自杀，从而可治疗癌症。目前抗癌剂的原理都是杀灭癌细胞。杀灭它就首先要伤害 |
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I*******o
发帖数: 49 | 14 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: ItoMakoto (ItoMakoto), 信区: Postdoc
标 题: 如何研究转录因子的功能？
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Mar 22 23:32:01 2012, 美东)
我现在有一个影响干细胞的转录因子，表达也很特异，请问如何找该基因的下游或者他
的调节子呢？
我想到几点,请大家补充!
1: 比较野生型，突变体和超表达的材料的芯片表达谱，可以找出一些下游基因；
2：用诱导系统如GR做芯片，也可以找出一些下游基因；
3：用上面的材料做CHIP-seq
4：已知我研究的这个转录因子A与其他转录因子B互作转录下游基因，然后我比较A和B
的芯片表达谱，找共同的基因；
5：分析CHIP的结果，找出下游基因的motif，然后在全基因组搜索？
6：将前面的实验全部再弄一遍cell specific microarray？
请各位补充，特别是实验设计上，有没有巧妙的设计，我这个维持干细胞的转录因子表
达很特异，也发现了它的一些调控子，该如何继续做呢？ |
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u***e
发帖数: 71 | 15 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: uvmee (zhutouzhutou), 信区: Biology
标 题: ———————期刊推荐(癌症偏临床，审稿快， 影响因子无所谓）
发信站: BBS 未名空间站 (Mon May 27 11:33:19 2013, 美东)
帮朋友问 ，不是这个领域的。 他们主要测了某些蛋白在人肾癌组织中的表达 做了PCR
western 免疫组化 还做了点与预后的分析（生存分析）
请大家推荐个合适的期刊，他对影响因子没有要求，就是要审稿快
谢谢诸位 |
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J*******3
发帖数: 1651 | 16 太阳能转换效率研究回顾分析与未来展望
导读：
我国太阳能光电化学转换的研究以实现低价高效利用太阳能为目标，二十年来在不同材
料体系中研究了上百种材料，大大促进了光电转换材料特别是多晶、薄膜半导体及新一
代纳米结构半导体和有机／半导体复合材料的发展。
引言
进入二十世纪以来，人类的工业文明得以迅猛发展，由此引发的能源危机和环境污
染成为急待解决的严重问题，利用和转换太阳能是解决世界范围内的能源危机和环境问
题的一条重要途径。世界上第一个认识到光电化学转换太阳能为电能可能实现的是
Becquere1，他在1839年发现涂布了卤化银颗粒的金属电极在电解液中产生了光电流，
以后Brattain、Garrett及Gerisher等人先后提出和建立了一系列有关光电化学能量转
换的基本概念和理论，开辟了光电化学研究的新领域。1972年Honda和Fujishima应用n-
TiO2电极成功的进行太阳能光分解水制氢，使人们认识到光电化学转换太阳能为电能和
化学能的应用前景。从此，以利用太阳能为背景的光电化学转换成为一个非常活跃的科
学研究前沿。光电化学太阳电池的一个突出的特点是材料制备工艺简单，即使应... 阅读全帖 |
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T*****e
发帖数: 247 | 17 这个很有意思啊，坐等高人进来解答。
我先问问楼主，你这个同一个转录因子，你所谓的不同dosage是怎么得出来的？你自己
过表达+KD了？这些外源性的表达和你转录之间的关系，你是用什么方法检测的？
我们先讨论一种简单的情形，有没有可能这个转录因子招募了其他的co-factor？
一种更复杂的情形：你这个转录因子和你的靶基因之间的关系仅仅是单向的调节吗？有
没有可能形成反馈？
又或者，你这个转录因子对其自身有没有反馈调节呢？不论正向或者反向？
最后，对同一个靶基因，不考虑你说的dosage的情况下，有时激活，有时抑制的转录因
子应该不少吧。比如Mef2。下游的phenotype很多啊，自己搜搜吧。
坐等大牛进来分析。 |
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V***b
发帖数: 3419 | 18 我现在发现一个蛋白（Nrf1）的mRNA水平在我的癌细胞里是正常细胞的10倍。我该如何
去寻找哪个或者哪些转录因子负责Nrf1的转录调控呢？有几个方案，大家看看行不行：
1. 做Nrf1的promoter序列分析，看看有哪些转录因子可以和这个promoter序列结合。
2. 筛选法：把可能性比较大的转录因子一个个knockdown，然后看哪个负责Nrf1的转录
调控。
3. 钓鱼法：做shRNA screen -- transcript chip
我做这个比较外行，想听听大家的意见。 |
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n*b
发帖数: 5 | 19 ZT 古瓷鉴定 殊途同归——关于中国古陶瓷科技鉴定的构想
作 者 : 钱 冶来源:中国文物信息网
2002年６月４—５日，中国高等科学技术中心在北京召开了“中国古陶瓷科技鉴定研讨
会”。会议由中国科学院上海硅酸盐研究所李家治教授和上海博 物馆汪庆正教授担任
执行主席，由中国科学技术大学王昌燧教授负责学术组织。参加会议的除著名古陶瓷鉴
定专家和陶瓷科技考古专家外，还有一些关心我国文物事 业的院士以及有关部门的领
导。著名物理学家、诺贝尔奖获得者李政道教授，多年来一直十分关注现代科学技术应
用于文物鉴定及建立文物科学鉴定运行体系等项工 作。因此，李政道教授也于百忙之
中亲临会场，并做了主题发言。会上，专家们介绍了近年来古陶瓷研究的新成果，并就
建立中国古陶科技鉴定中心的可行性和有关 事宜，及如何促进科技界与文博界的交流
、合作等话题进行了热烈讨论。
此次研讨会所涉及的古陶无损伤科学鉴定、鉴定体系的建立、运作、监管、法律
依据等内容，探讨得均较深入，其必将在文博界、科技界产生深远影响。现就此次研讨
会综述如下：
一、对古陶瓷科技鉴定的共识
我国古陶瓷源远流长，不仅种... 阅读全帖 |
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p*******9
发帖数: 1860 | 20 替朋友发个招聘广告。一家国内做政务数据的公司。
优势：国内唯一合法拿到公共医疗数据库的公司，又拥有保险牌照，如果做起来了，潜
在市值可能突破百亿。
劣势：公司刚起步两年，有很多不确定因素。
待遇：高于行业平均水平，依照申请人背景而定。具体内容参见下文：
优易数据研究院（北京）招聘启事（数据科学家）
优易数据研究院（以下简称研究院）是依托国家信息中心和电子科技大学的数据资源、
产业资源和智力资源，于2015年成立的综合性国际化交叉学科研究机构。研究院以推动
大数据理论成果产业化为使命，汇聚高层次科研技术人才，聚焦大数据产业化过程及关
键技术研究。研究院下属大数据宏观决策指数、人工智能、市政交通大数据、数据安全
、大数据法治、医疗大数据、保险大数据等七个研究所。研究院与清华大学、北京交通
大学、华中科技大学、苏州大学、上海大学、厦门大学、英国帝国理工学院、美国宾夕
法尼亚大学、美国麻省理工学院、美国加州大学、新加坡南洋理工大学、澳大利亚悉尼
大学等众多国内外高校科研机构建立了广泛的合作关系。
人类社会正在迈向大数据时代，以数据为驱动的新一轮产业革命正在进行。为在精准保
险、智能保险、医疗大... 阅读全帖 |
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V**3
发帖数: 12756 | 21 关于 新冠病毒来源 的专业分析
新冠病毒神秘来源
Original 刘永 大卫深观察 2 days ago
随着新冠肺炎对全球的威胁与日俱增，越来越多的各国专家也对新冠病毒（2019-nCoV
或SARS-CoV-2）的来源投下更多关注的目光。本文从流行病学调查、病毒基因比对、跨
物种感染研究以及关键的“中间宿主”等领域，对新冠病毒来源进行了全景式梳理与深
度挖掘，为读者提供一个深刻而全新的视角。
一、华南海鲜市场：备受争议的“疫源地”
二、病毒学证据：武汉新冠病毒2019-nCoV的基因异样之处
三、石正丽：疑云笼罩的冠状病毒跨物种感染研究
四、穿山甲之谜：突如其来的“中间宿主”
自从武汉爆发新冠肺炎迄今，已经过去了两个月，但科学界对这个神秘的新冠状病毒“
2019-nCoV”（也叫SARS-CoV-2，本文简称新冠病毒）的认识依然十分有限。此次疫情
爆发的源头是华南海鲜市场吗？当局称新冠病毒来自原始宿主蝙蝠，华南农业大学几位
学者甚至声称他们找到了中间宿主穿山甲。但科学界对病毒基因序列的研究以及大量科
学文献的比对查证，均显示这个病毒的来源并非如此简单。
一、华南海鲜市场：备受... 阅读全帖 |
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s*******i
发帖数: 12559 | 22 【教程】星盘怎么看？分析星座命盘的方法 (教程之二)
火特之星 发表于 2010-2-9
学习解读星盘
个人命盘上主要有五大要素：
星体（包括十大星体，五大小行星和一些恒星）、星座（黄道带的十二个区域）、宫位
（以上升点为起点，将黄道分为十二份）、相位（星体间的角度）、基本点（主要指东
升西末天顶天底北交福点等）。接着，我以最直观最形象的方式予与说明。
（1）上升点表示我们此生的面具，也就是说今生我们要在人生的舞台扮演一个怎
样的角色。天顶表示我们的人生所能达到的顶点以及达到这个顶点的方式。
举例来说，不知道大家有没有玩过《武林群侠传》？里面游戏玩家将扮演崇拜小虾米的
东方未明（这就是由上升点决定的）。你可以学择正派，反派与中派三种路线发展。如
果你选择走正派路线，还会有两种结局。如果你玩的好就会出现正派完美结局——当上
武林盟主或是像小虾米一样云游四海，如果你玩的不好就会出现正派潦倒结局——和谷
月轩一起流亡江湖，郁郁寡欢，终老一生（这是由天顶决定的）。但当上武林盟主也有
两种方式：一是走正派路线，在武林大会上力挫群雄，粉碎龙王教的阴谋，被推举为武
林盟主；二是先假装归顺龙王教，灭尽... 阅读全帖 |
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h**********n
发帖数: 506 | 23 审稿机会：肾小肿瘤的meta分析 （影响因子：5.7）
有意者请把姓名，单位，邮箱短信给我 |
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u***e
发帖数: 71 | 24 帮朋友问 ，不是这个领域的。 他们主要测了某些蛋白在人肾癌组织中的表达 做了PCR
western 免疫组化 还做了点与预后的分析（生存分析）
请大家推荐个合适的期刊，他对影响因子没有要求，就是要审稿快
谢谢诸位 |
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j****n
发帖数: 3370 | 25 代谢肯定和疾病相关
但问题往往是疾病导致代谢异常 而不是代谢异常引起疾病
貌似从代谢结果来递推分析可能的原因 如基因突变或者表达异常 目前还没有可靠的方
法。如果是由转录因子或者其他调控元件引起的，问题就更复杂了。我们经常会发现，
一个碱基的突变，会引起整个代谢网络的改变。
我们主要做微生物的，做代谢流或者代谢组学分析的时候，只有少数情况可以找到可能
的原因。。。更不用说动物细胞了，太复杂了。。。总感觉这个是个很大的坑，无底洞
的感觉，会不会跳了就出不来了。。。
望胖老师多多指点 |
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w****d
发帖数: 9 | 26 时间经过参见：http://news.eastday.com/s/20120330/u1a6457779.html
患者诊断为强直性脊柱炎， 使用“类克”治疗， 既抗肿瘤坏死因子单抗（Infliximab
）。 其最为常见的副作用是感染，尤其是结核，抗肿瘤坏死因子治疗引起患者结核复
发。 活动性结核发病期间应停用免疫抑制剂。抗结核治疗使用一线药异烟肼，异烟肼
有较强的神经精神副作用，B6可以减少神经病变，精神症状可有抑郁，行为异常及自杀
倾向。两个副作用毁了两个青年。
如果有医患交流记录， 可以用 MEDICAL ETHICS 137 cases 分析。
为年轻的王医生哀悼，也为更年轻的患者惋惜。 悲剧本不应该发生。 |
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D**s
发帖数: 6361 | 27 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: arthir (阿瑟~不懂), 信区: Military
标 题: 11g的85后女博士: 4篇SCI论文 影响因子累积破百
发信站: BBS 未名空间站 (Mon May 8 00:51:55 2017, 美东)
杭婧，清华大学医学院2012级直博生，师从施一公教授，研究方向是剪接体领域的结构生物
学研究。她共发表SCI论文4篇，以第一作者身份在《自然》上发表文章一篇，在《科学》上
发表文章两篇，影响因子累积破百。
2015年9月11日，两篇阐释生命大分子剪接体结构的文章以杂志当期封面的形式，“背靠背
”发表在国际顶尖期刊《自然》上，震惊了学术界。两篇论文的科学意义十分重大，它们不
仅完善了分子生物学的中心法则，而且再次证明了中国生命科学领域近年来的快速发展。让
人没有料到的是，如此重量级论文的共同第一作者，竟然是一名在读的清华女博士生。她，
就是杭婧。
泡实验室是最好的减肥办法
初见杭婧，她穿着一身冬日的装扮，带着一副黑边框眼镜，脖子间围着一条丝巾，整个人简
洁而大方。还没有进会议室的时候，她靠着墙，随性地和我们聊着，... 阅读全帖 |
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c*******e
发帖数: 373 | 28 继续算，就会发现不发散了
数字里，奇数因子越多，一上来数值本身会扩大，似乎是发散的
但是数值变大的过程中，其中的奇数因子会逐渐变少，偶数因子变多，然后就开始收敛了 |
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z*******0
发帖数: 35 | 29 我发现一种生长因子可以促进抑制我细胞的生长，但是可以改变细胞形态，促进细胞分
化，请问如何开展下一步的分析？ 可以研究细胞表面的生长因子receptor和细胞内信
号通路么？应该如何开始？ |
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s********n
发帖数: 1124 | 30 “十年磨一剑”，是中国自主创新药物研发的常态。在初期大环境尚未如今日般利好、
研发之路“荆棘遍布”的情况下，已有许多药物研发者义无反顾地投入了创新药物的长
期工作之中。如今，属于他们的收获之季陆续到来。在此，小编特挑选近五年内的重点
原创药物进行盘点。
（1）肿瘤领域：世界瞩目
埃克替尼我国自主研发的小分子靶向抗癌药物埃克替尼于2011年8月正式上市。此药被
原国家卫生部陈竺部长称为民生领域的“两弹一星”，入选2011年“十一五”国家重大
科技成就巡回展；其研究被世界肺癌大会接受为大会报告，亦在美国临床肿瘤学会(
ASCO)年会上被接受为
壁报讨论项目(Poster Discussion)。肿瘤学专家莫树锦(Tony Mok)教授和海斯特(
Rebecca S Heist)教授评价其是继吉非替尼和厄洛替尼之后全球第三个用于晚期肺癌的
表皮生长因子受体(EGFR)-酪氨酸激酶抑制剂(TKI)。
殊荣同至，必有其因，埃克替尼可谓创造了其所在领域的多项“第一”，即全球第一个
TKI互为对照的注册Ⅲ期临床试验、亚洲第一个TKI靶向抗肿瘤药、中国第一个有自主知
识产权的小分子抗肿瘤药以及在中国第... 阅读全帖 |
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D**s
发帖数: 6361 | 31 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: arthir (阿瑟~不懂), 信区: Military
标 题: 11g的85后女博士: 4篇SCI论文 影响因子累积破百
发信站: BBS 未名空间站 (Mon May 8 00:51:55 2017, 美东)
杭婧，清华大学医学院2012级直博生，师从施一公教授，研究方向是剪接体领域的结构生物
学研究。她共发表SCI论文4篇，以第一作者身份在《自然》上发表文章一篇，在《科学》上
发表文章两篇，影响因子累积破百。
2015年9月11日，两篇阐释生命大分子剪接体结构的文章以杂志当期封面的形式，“背靠背
”发表在国际顶尖期刊《自然》上，震惊了学术界。两篇论文的科学意义十分重大，它们不
仅完善了分子生物学的中心法则，而且再次证明了中国生命科学领域近年来的快速发展。让
人没有料到的是，如此重量级论文的共同第一作者，竟然是一名在读的清华女博士生。她，
就是杭婧。
泡实验室是最好的减肥办法
初见杭婧，她穿着一身冬日的装扮，带着一副黑边框眼镜，脖子间围着一条丝巾，整个人简
洁而大方。还没有进会议室的时候，她靠着墙，随性地和我们聊着，... 阅读全帖 |
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k****n
发帖数: 158 | 32 把几个病人和对照组的样品做了几个microarray,通过pattern检索（就是把病人表达选
高对照表达选低，或者反过来）得到了一些基因的list (Probe lists), 请问怎样把这
些基因做一个批量的分析， （信号通路相关的聚类分析，比如细胞生长，细胞爬行，
或者细胞骨架相关，生长因子调节相关 等等）这样的类比分析，希望知道这些病人的
样品中哪一组基因表达改变了。
请指点用什么样的软件，以及简单的建议
谢谢 |
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a****r
发帖数: 12375 | 33 杭婧，清华大学医学院2012级直博生，师从施一公教授，研究方向是剪接体领域的结构生物
学研究。她共发表SCI论文4篇，以第一作者身份在《自然》上发表文章一篇，在《科学》上
发表文章两篇，影响因子累积破百。
2015年9月11日，两篇阐释生命大分子剪接体结构的文章以杂志当期封面的形式，“背靠背
”发表在国际顶尖期刊《自然》上，震惊了学术界。两篇论文的科学意义十分重大，它们不
仅完善了分子生物学的中心法则，而且再次证明了中国生命科学领域近年来的快速发展。让
人没有料到的是，如此重量级论文的共同第一作者，竟然是一名在读的清华女博士生。她，
就是杭婧。
泡实验室是最好的减肥办法
初见杭婧，她穿着一身冬日的装扮，带着一副黑边框眼镜，脖子间围着一条丝巾，整个人简
洁而大方。还没有进会议室的时候，她靠着墙，随性地和我们聊着，脸上总是带着淡淡的笑
容。
2012年9月，杭婧进入清华大学医学院直接攻读博士学位。按照学院的轮转培养制度，她得
以进入到施一公实验室中见习，但见习期满后是否能够留下，还要取决于她的表现。一开始
，杭婧心理压力非常大，一方面是因为新环境中的同学非常优秀，而且都比她进实验室要早
，... 阅读全帖 |
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s*******e
发帖数: 370 | 34 lz很不喜欢目前的工作，已经做了2年了。是在一个医生下面做research，title是
research associate，但其实工作内容和薪水跟postdoc都差不多。医生很忙，研究做
的一般，而且经常面临没有funding的问题。这不，最近又快没有钱了，老板就脾气差
，喜欢经常质问大家，你做了什么，想出什么好idea没有，有什么funding我们可以去
申请。这个时候，大家就要随时准备加班加点，战战兢兢过日子。
这个老板的research也是没有什么专长优势的那种，反正美名其曰，health service
research，就是看看什么热，就做什么。2个月内申请3个R01这样的事情也干过，当然
，一个也没有中。很多时候，我们都感觉做研究是老板的toy，他觉得有趣，就非要弄
过来玩。比如，他发现原来头发可以用来测量stress的水平，就让我们想想，我们可以
用这个来干嘛。我们也不知道啊。他以前也从来没有做过biomarker这方面的东西。或
者哪天他听到了某个比较新的方法，他就要用。比如目前流行的贝叶斯，隐变量，
structure equation modeling，ti... 阅读全帖 |
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l*****6
发帖数: 14 | 35 容易让你丧失理性的6个“非理性因子”
时间：2011-10-11 16:44:30 来源：西安文理学院 作者：邹哲
对生活中常见的非理性因素你会发脾气吗?你晓得什么时候应该发脾气，什么时候不应
该发脾气吗?
如果你在开车时，碰到别人从你身边一擦而过，呼啸一声，使你大吃一惊，你是否会破
口大骂呢?很多人会因此发脾气，甚至为此不高兴一天。却不知，对方可能早已高高兴
兴地参加聚会去了。要化解不良情绪，我们不妨以风趣、温和的态度解释当时的情形：
“这家伙，一定是老婆赶着去生孩子。”
然后，一笑置之。
反之，忍住不发脾气永远是好的吗?比如，当你的孩子在念书时，隔壁的音响开得很大
声，你只管忍耐，不去伸张权益，结果如何呢?这种情景下，我们忍住不发脾气，也等
于在纵容别人做不该做的事情。
生活中非理性的因素有很多，我们常常会因为这些非理性的因素而控制不住自己的情绪
，导致一些不应该的后果，为了更好地控制自己的情绪，我们应该先分析一下生活中常
见的非理性因素。
世界之大，我们每个人穷尽一生，能看到、听到、感觉到、体验到的事物极其有限。且
不说浩瀚无限的洪荒宇宙，即使是我们立足的这个渺小的星球，已经... 阅读全帖 |
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c***y
发帖数: 615 | 36 3'端的报道好象很少。最近把一段3'段序列连到luciferase 3'端，与相应的转录因子
共同转化细胞，好像还确实影响luciferase 的表达。该怎样分析可能的机制？多谢 |
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b**********8
发帖数: 349 | 37 2. 由于蛋白A本身又可以和Histone H1竞争与Linker DNA binding, 有无可能所见到的
acetyl-H3K9在genes B promoter region处的结合率降低是由于高表达的蛋白A本身取
代了endogenous H3 和acetylated-H3?
这个还真有可能。很多蛋白不但调节其他转录因子，他本身也可以作为转录因子直接参
与调控靶基因转录。要不再用A蛋白的抗体做个ChIP试试？另外，你可以做个western看
看pan-acetyl-H3K9的水平有没有降低。
楼下继续。 |
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c*****u
发帖数: 4 | 38 最近读了几篇实证文章，发现这个模型用的很多，很想学习一下,感觉这个方法要
是掌握了，应该可以攒出篇文章来。看了一篇paper，这个模型应该是来自于统计中的
因子分析（Factor Analysis)，我理解就是假设这个不可观测到的因子有一个滞后项，
当然后来又有很多变形。
我主要迷惑是：这个模型跟Kalman filter，state-space model是什么关系？这两
个模型我只是大概知道一点，但感觉好像有关系（有篇文章里说是用Kalman filter方
法来估计这个dynamic factor model）。估计这种模型的常用软件是什么？
请高手指点，或者应该看哪些材料就可以更清楚？不盛感激！
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D******n
发帖数: 2836 | 39 Subjective, up to u
can use elbow point. |
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i*****r
发帖数: 318 | 40 能说详细一些吗？比如在哪可以看到elbow point?怎么从elbow point决定取几个
factor?
谢谢。 |
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D******n
发帖数: 2836 | 41 plot ur eigen values
for example
*
*
* * *
the third one is the elbow point, then u take 3 |
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z********1
发帖数: 774 | 43 这个会是真的吗？
新宿武士：NHK和《读卖新闻》都援引日本国立感染症研究所的分析说，从中国政府提
供的人感染H7N9禽流感病毒的基因讯息分析，最初感染、死亡的上海两名男患者与安徽
一名女患者的病毒都是容易繁殖的特定遗传因子，说明禽流感已发生了容易感染人体细
胞表层的异变。东北大学的病毒学教授押谷仁提醒：一定要注意。 |
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s**********a
发帖数: 1853 | 44 原来ML就是这个玩意儿啊？
我还以为什么因子分析，聚类分析，主成分分析，现在早没人搞了呢。
真是out了。 |
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Z******5
发帖数: 435 | 45 最近在做一个转录因子，发现UCSC上有ChIP-seq的数据，想弄下来做个全面分析。
现在能做到的是：从ftp上下载bigWig数据，然后用bwtool过滤，然后转成Wig格式，然
后再转成Bed格式，然互再提交到GREAT做分析。
问题是：过滤后的数据转为Bed有 300M 左右，但是GREAT只能提交50M且不超过50000个
element，这样上传的文件基本只有5M左右，或者更低。
请问有啥好办法能够一次性注释300M或者更大的Bed文件呀？ |
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m****g
发帖数: 530 | 46 据8月5日《新英格兰医学杂志》在线发表的一项报告显示，无论男女，血清性激素结合
球蛋白(SHBG)水平低都强烈预示
着2型糖尿病风险增加，而水平高则预示着风险降低。
波士顿哈佛公共卫生学院理学博士Eric L. Ding及其同事指出，SHBG水平的预测能力可
能高于糖化血红蛋白水平和C反
应蛋白(CRP)水平等传统的危险因素。
这些结果是通过对妇女健康研究(Women’s Health Study，WHS)的数据进行多项不同的
分析得到，然后又在对医生健
康研究II(Physicians’ Health Study II)的数据所做的多项深层分析中得以重现。研
究者表示，“这些结果是通过对两个独
立队列采用多种分析法和做亚组分析获得，具有说服力且一致，证实性激素结合蛋白可
能在基因水平和表型水平对2型
糖尿病发病起着重要作用，而且SHBG可能是2型糖尿病发病风险分层和早期干预治疗的
一个重要靶点。”
据认为，SHBG的主要作用是结合循环中的激素，特别是与循环中的雄激素和雌激素相结
合。新近已有研究表明，SHBG
与糖稳态有关联，其基因的多处变异均与胰岛素抵抗有关。
Ding博士及其同事 |
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S*******r
发帖数: 11017 | 47 1.
=== SHFE的价格只适用于国内用户,是服务国内市场的.SHFE没有必要去和LME争夺国际
市场上的定价权,因为这必须以放弃本国的金融安全为代价(之前已经跟你论证过了),而
且SHFE在可预期的未来没有可能跟LME争夺定价权,既无必要也无可能,这事你就不要纠
结了.
>>>谁跟你说SHFE的价格之适用于国内用户？前面还觉得你做过期货，现在看，也就是
吹牛。如果中国期货价格只是国内价格，干嘛路透社要在国际终端上列入中国价格？如
果中国期货价格只是国内价格，为什么外资投行挤破头要拿中国期货经纪资格？要在中
国交易所买席位？
===外资银行为啥要挤破头要拿中国期货经纪资格？要在中国交易所买席位? 直接原因
是因为他们现在买不到进不了.所以我说SHFE价格外资参与不了.SHFE的存在意义是为了
服务国内市场,没有必要也没有可能去和LME争.
2.
== 进入交割的保证金100%还叫保证金?请指明哪里有条纹规定交割时要付100%合约价格?
>>>呵呵，您连交割月要100%保证金都不知道，看来从来都没有做过期货交割。如果你
不信，那就打个赌好了。
=== 不用打赌,你贴个明文规定上来就好.... 阅读全帖 |
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c****i
发帖数: 323 | 48 家里的情况:LG TT AP,四十出头了,苦逼生物医学专业.从博后开始基本每两到三年换个
工作; LP文科专业,半职工作,两个孩子都还小.
LG现在是AP的第五年,tenure-track第二年,tenure-clock是四年,手上有一笔基金还可
以支持两年.好,现在系里说没钱支付一半的工资了,要求半年内走人.如果要自己的
grant来全部cover工资的话,那基本实验室就玩不转了...
LG正在申请R01, 且不说多难拿,就算他拿到了,是不是有这几种可能:1.跟系里协商留下
来;2.去其他学校重新开始tenure-clock. 3.去烂校直接申请tenured position (这种
是不是极少可能)
好,算他最后拿到了tenure,得45+了吧,以后还是得靠funding吃饭,但过了45,还拼得动
么,没有funding的话,是不是也很难混,工资降到30%什么的...LP一人的工资基本不能养
家糊口,只能添砖加瓦.要等到两个孩子上大学,LG得保证一直有grant到60岁...
这种情况,是不是得考虑归? 也不知国内高校的职位稳定不, 像他这样的情况,能申请个
省级的特聘教授啥的吗... 阅读全帖 |
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a*****h
发帖数: 484 | 49 而且光是说5篇一作很难做判断，影响因子1点几和3+的五篇区别就很大! |
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t********2
发帖数: 315 | 50 最近为这个事情头痛死了，想请大牛们分析一下我这种情况应该怎么组织我的材料（
DIY）。我的case属于特别弱的，但是再等下去要发疯了，希望2-3个月内能交上去，赌
一把吧。
整体情况是美国50名左右Ph.D.,top school的postdoc。老板是top school的full
professor，头衔一大堆。我的NIW在2010年已批。
1.文章特别少。Peer-review的一共只有6-7篇（全英文），其中一作只有2篇，剩下的
都是N作。优势是除了本科和博士生早期发的2篇，剩下的（包括两篇1作）都是领域内
Top文章，影响因子都在10-15之间。这些文章分布在3个领域。
2.Top publishing company要出版一本大百科全书，邀请老板写几个小的chapter。这
几个chapter是我跟老板co-author的。律师evaluate的时候说这个非常impressive，但
是不知道怎么吹最好，因为这个东西虽然写完了也提交了，但是这大百科全书最终还没
出版（工程浩大）。出版社正在他们的网站上更新这个大百科全书的topic，我一共写
了三个，现在网上只能查到一个。可... 阅读全帖 |
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