s*********y 发帖数: 292 | 1 LZ看的很仔细,我感觉他造都不太会造。
像这种正好切掉3个nt的STOP codon的实验,实验设计的时候就不应该决定去做
GFP-RFP fusion之后FRET,GFP的能量都漏给RFP去了,不过一般GFP channel也能测到
,不会100%消失的。但还是那句话,这实验压根就不应该这么设计
总之就是水平有限,没发过大文章也搞不清楚大文章发出来之后的后果。他发文章之前
可能想着把文章搞出来评评职称、交交差,压根就没有想到发出来之后会被那么多媒体
吹到天上去,然后被那么多重复不出来的人揪着不放。现在是骑虎难下了 |
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发帖数: 1 | 2 你对照实验设计好了吗?
连对照都没设计正确,做再多实验有什么用?
你还声明你自己不是傻逼呢。你怕我把你当傻逼吗?
[在 lanceandfei (La Jolla的云彩) 的大作中提到:]
:这年头怎么那么多无聊的人,不好好做实验就知道瞎叫唤?
:我是自己承认的,我们在两种不同细胞系里面可以在两个不同基因上做出基因组水平
的indel,当然需要重复。但是看见了indel,我还能说没看见么?
:现在这些小孩动不动就要打脸?excuse me? 劳资在买买提上混的时候你们小学毕业了
:么?
:无聊询问我一律不接待啊,本人忙得很,正在日本开会中,倒是正好不用翻墙来回复
了呵呵。
:……对某些人来说,失败有如毒药。伟大的人物常因不能忍受失败而变成
庸人。许多人则由于能够忍受失败而成为伟人。一个人能有所成就并在气质上超过常人
,往往正在于其对待失败的态度,而失败是凡人都会经历的。
: 尼克松很喜欢这一段话,当他打点行装返回加利福尼亚的老家,以待东山再起时
,他还把这段话牢记在心。 |
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l******q 发帖数: 52 | 3 这是个好帖,顶一下。严格定义的话,有很大一部分应该算是应用生物信息学。数据一
定是越来越多,但应用生信的路更取决于生物学的发展,如果没有持续产生的新问题,
很快就会有自动化软件取代人工。我思考现在好多公司之所以需要数据科学家,是因为
这些公司的商业模式是新的,所以需要数据科学家帮他们理解他们的运营状况。同样,
通过NGS技术和传统实验技术结合,也有很多新的实验设计出来。有市场的实验设计会
马上有好的自动化工具出来,如MACS;但短期来看,学术界对生物信息学的需求还会增
大。不知道有没有工业界的伙伴在,特别想了解目前工业界的生物信息学岗位主要是在
做啥?也是Perl/Python/R? |
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t***y 发帖数: 1246 | 4 2. 一个成功的商业形态一定要适合当地的文化。比如我感触比较深的就是美国是一个
挺装逼又挺实用的这么一个文化。装逼在哪呢,就是到哪都有些这个那个association
啊,license啊,certificate啊,theory啊。。。你仔细想想是不是,就连当年做个研
究都说你们能不能从重复的实验中提取点可以广泛应用的equation啊,methodology啊
。说白了就是怎么了立牌坊收利益。实用在哪呢,就是这些东西背后都至少给你一个基
本的技能,这样你通过技能和这个装逼的保护能混口饭吃。举个最简单的例子就是HR
block都能这样盈利!!!能够真正给你办好tax的人都不会在哪个小franchise里,在
那里面的人能做的都是你自己学习一下就能做的。那么他就是很简单的出卖自己劳力时
间的一个组织,但是需要consumer target,需要提高valuation,那就整成个HR block
certified tax filer。同理apply to realtor,plumber。。。其实我最受不了的是
这里面有些人刚刚学了点training还没啥practical的知识就信誓旦旦... 阅读全帖 |
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c****n 发帖数: 21367 | 5 开口闭口实验,能不能回去好好把前面文章看看,把自己的“实验设计”教科书重新翻
翻?
跟你说西医西药那个试验设计是前提假设有问题,只有中医这种在人身上几千年
trial and error的结论才准确 -- 无论每个实验有多糙有多不一样,综合平均
是最精确的科学方式。 |
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z**********i 发帖数: 12276 | 6 【 以下文字转载自 TopArticle 讨论区 】
发信人: flybaby (yegu), 信区: Environmental
标 题: 博士两年,中国老板,有机会转统计,怎么办?
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Oct 14 18:34:47 2011, 美东)
小弟2008年来美,在一个烂校读环境三年半了,之前两年硕士毕业,毕业之后和老板商
量后,继续读博士。读的挺偏完全没有在工业界找到工作的可能性。因为是烂校,所以
受到的training也很不好,之前一两年浪费了很多时间就像无头苍蝇。现在总算感觉入
门了,无奈还是兴趣不足,感觉自己不想干这行,也觉得做的东西对科学发展毫无用处
。老板的手段就是push,无论如何要写出文章,之前的实验设计,实验过程,还有数据
分析完全不管。他也没有时间,忙着写proposal拿钱。就这样我还是在这三年半时间里
发了一篇还不错的文章,基于master研究的成果。但是平心而论,老板除了给了我一个
题目外,基本没有给我太多的指导。文章基本属于我自己憋出来的(憋的时候真是无比
难受,常常熬到凌晨3-4点),加上一点运气。
想quit的原因有很... 阅读全帖 |
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c***s 发帖数: 70028 | 7 华中师范大学校徽动态化
华中师范大学校徽动态化
华中师范大学校徽动态化
代表浙江大学的“求是鹰”、俄式风格的哈尔滨理工大学主楼、象征南京的避邪神兽貔貅、表示“同舟共济”的三人划龙舟……这些出自各个高校校徽的图案,如今已经“动起来了”。西安交通大学大三学生卜嘉伟的“大学logo动起来”系列刚一推出即刻在网上爆红,遭众多网友点赞,但也有部分人表示,校徽凝聚了学校的历史和理念,许多知名校徽在全球均有较高的认知度,具有一定的严肃性,“擅自动起来”也是对原作的不尊重。
动态校徽被称“集体卖萌”
校徽到底怎么动?“求是鹰”会飞、主楼像火箭一样直接发射、神兽踢球对决、划龙舟的三人跳起竹竿舞……“感觉萌萌哒!”是多数网友给出的评价。
在北京大学的动态校徽中,上面两人背靠背,组成“北”,下图的人双臂略垂,形同“大”,三个人一起在圆形的空间里逐渐向上舞动,形态很像某种原始舞蹈;中国人民大学的校徽是三个并列的篆书“人”字图形,点开gif图像后看到就是三个“小人”在快速地扭动腰身;西安交通大学的校徽则直接变身成为了“变形金刚”;复旦大学花式颠球的动态校徽则被评为“最应景之作”,网友调侃复旦大学“快去参加世界杯... 阅读全帖 |
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g****t 发帖数: 31659 | 8 你知道什么叫设计实验么?
例如你想验证落体定律,然后弄个拿球去塔上的计划书。
这叫实验设计。
芬特
去检验自己的模型阿,怎么检验,难道就不是设计了 |
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B****l 发帖数: 388 | 9 如果信号系统没有问题,为何要整改?在铁路电务人员对“7·23”温州动车事故
调查组副组长王梦恕发出强烈质疑后,调查组的公信力持续下滑
财新《新世纪》 记者 谷永强 于宁
2011年11月21日,“7·23”温州动车事故调查逼近120天的法定公布时限。国务院
事故调查专家组副组长王梦恕的一番讲话,使得围绕动车事故报告的风波又起。虽然王
很快改口,称自己因工作繁忙不掌握全面情况,所发表观点仅代表个人看法,但在铁路
系统,风波并未就此平息。
王梦恕11月20日在接受《京华时报》采访时透露,专家组负责的技术层面的事故调
查报告已于9月底完成并递交,“经过调查和实验,动车信号技术和设备可以说没有问
题,最大的问题是人员和管理的问题”。他还表示,“那么好的设备交给他们(当地管
理部门)没有好好管理和使用,造成设备坏掉了。设备坏了之后,人工操作也出现问题
。同样设备在别的地方也在使用,都没有出现故障。”
报道发表后,不仅舆论哗然,甬台温线负责相关设备维护的电务部门也因为王将责
任指向“当地管理部门”而震动。
国务院2007年颁布的493号令《生产安全事故报告和调查处理条例》规定,重大事
故调查报告应... 阅读全帖 |
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d*********o 发帖数: 6388 | 10 http://news.xinhuanet.com/fortune/2011-12/25/c_111298996.htm
这是停放在测试线上的实验列车(12月22日摄)。 新华社发(窦欣 摄)
25日,仪式结束后,工人收拾现场。当天,更高速度试验列车落成。车头设计灵感源于中国古代兵器“剑”。
本报讯 我国更高速度试验列车于25日在位于青岛的中国南车四方股份公司落成,四方股份公司副总工程师梁建英称,该列车试验速度超越我国目前所有动车组列车速度。
中国南车董事长赵小刚此前接受媒体采访时称,该试验列车时速将超500公里。
车头设计灵感源于“剑”
当日9时许,一辆车头上披“红盖头”的列车停放在四方股份公司厂房中。从车头轮廓看,其明显与CRH380A“长征火箭”头型不同。仪式开始,掀开“红盖头”后呈现在眼前的车头两侧有棱,造型犹如一把剑。
据中国南车首席技术专家丁叁叁介绍,该头型设计灵感来源于中国古代兵器“剑”,突出尖楔形结构。该列车为6辆编组,全部为动力车,车尾仍沿袭CRH380A“长征火箭”造型。
试验列车尚无具体型号
据中国南车技术人员介绍,该试验列车以CRH380A创新成果为基础,以更高... 阅读全帖 |
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l********k 发帖数: 14844 | 11 生物琐男们先别忙着打嘴仗,设计一个小鼠实验测试坐月子是否有科学道理:
设计不同的吹风、凉水、饮食、光线、运动量等等条件的差异,测试产后几个月实验组
和对照组在体能上是否有显著区别。 |
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t*******a 发帖数: 4055 | 12 综合路边社和爬墙社的报道,第二艘纯国产航母,甚至是第三批国产核动力航母的最新
消息来了!所有消息都是道听途说、人云亦云;消息的主要源头,是从各厂家门口摆摊
阿姨的邻居的儿子的同学他二舅的司机哪里听来的,可靠性到底多高,难以判断;但可
以几年后挖坟来证实准确度。
消息1:大连的002型国产航母(即以前的001A)露面后,112厂的弹射型新舰载机也基
本完成。在002下水的前后公开露面,并且在兴城完成了电磁弹射试飞,证明性能完全
符合要求。112厂接到的歼15A+B的总订单居然高达100架!这说明第一批常规动力弹射
型航母,至少会生产2艘,南北同时展开!
所谓112厂,即国营112厂,就是沈飞的代号;当年苏联援建的156个大项目中的一个。
长期以112厂为内部代号,现在已经解密。
消息2:首批弹射型平板航母,即003型,本来早在2015年就已开工,江南长兴和大连同
时先期制造。原指标:吨位标排58000,满排79000,三条蒸汽弹射,常规油缸拦阻装置
,比小鹰号略小;规划舰载歼15B大约30架、4架涡桨预警机加10架左右的舰载直升机。
但由于国内电磁弹射和拦阻装置进度极快,最高层当机立断,... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 13 地下核试验是把设计的核装置(或核弹头)经过多种复杂的环境考验后,放到一定深度
的地下进行核爆炸,以验证所试验的核装置(或核弹头)是否满足要求,验证理论计算
和工程设计是否正确,以改进设计和为生产提供科学依据等。地下核试验释放到大气中
的放射性物质小,动静也相对小,因此不少国家都进行过地下核试验。从核爆的实战经
验看核爆对人类活动影响有几十年,核污染会随着放射性物质的衰退减小。一般讲地下
核装置位置固定,便于测试,特别有利于近区物理测量;受气象条件影响小,利于安全保
密,可减少对环境的放射性沾染;便于创造模拟高空环境的真空条件,研究某些高空核
爆炸效应;还可研究核爆炸的和平利用,如探索开挖矿藏和制取特殊材料的可能性等。
但是地下核试验产生的压强在100-250万个大气压之间。由于地下核设备的引爆释放出
大量的能量,使得试验点周围区域内相关的地质和设备材料发生蒸发。在这么大压强的
冲击波作用下,最近的岩石会被加热气化。实验产生的高温和压缩的震动波会使试验点
生成空隙和裂隙或者改变洞壁上的结构。相关的地下环境包括地下水中潜在的污染、以
及对环境或农业所产生的影响,对那些可能会发生间接生态影响... 阅读全帖 |
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v**e 发帖数: 8422 | 14 综合路边社和爬墙社的报道,第二艘纯国产航母,甚至是第三批国产核动力航母的最新
消息来了!所有消息都是道听途说、人云亦云;消息的主要源头,是从各厂家门口摆摊
阿姨的邻居的儿子的同学他二舅的司机哪里听来的,可靠性到底多高,难以判断;但可
以几年后挖坟来证实准确度。
消息1:大连的002型国产航母(即以前的001A)露面后,112厂的弹射型新舰载机也基
本完成。在002下水的前后公开露面,并且在兴城完成了电磁弹射试飞,证明性能完全
符合要求。112厂接到的歼15A+B的总订单居然高达100架!这说明第一批常规动力弹射
型航母,至少会生产2艘,南北同时展开!
所谓112厂,即国营112厂,就是沈飞的代号;当年苏联援建的156个大项目中的一个。
长期以112厂为内部代号,现在已经解密。
消息2:首批弹射型平板航母,即003型,本来早在2015年就已开工,江南长兴和大连同
时先期制造。原指标:吨位标排58000,满排79000,三条蒸汽弹射,常规油缸拦阻装置
,比小鹰号略小;规划舰载歼15B大约30架、4架涡桨预警机加10架左右的舰载直升机。
但由于国内电磁弹射和拦阻装置进度极快,最高层当机立断,... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 15 现急需招聘兼职sci课题设计人员,待遇优厚(生物以及临床专业相关)。
任职要求:
(1)生物医学相关;
(2)英语水平较好,能熟练检索并分析相关专业的英文文献;
(3)具有较高的学术水平,熟练掌握SCI撰写技巧,独立发表过多篇SCI论文;
(4)做事踏实、认真、有较强的责任心。
岗位职责:
能根据要求设计实验方案,确保实验方案切实可行。
有意向的请发简历至[email protected]/* */;并加QQ 573474670 详聊。注明mitbbs+您的名
字专业,谢谢。 |
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t*******l 发帖数: 3662 | 16 设计了一个猪头市场操作策略,急寻小白鼠做做实验,然后汇报结果看看这个是否行得
通。
Step1:在你自己的watchlist上按照涨幅排序,从高到低。注意一定是你自己的watch
list
Step2:把中概剔除
Step3:随机在涨幅最大中选三个,然后买一个月以后deep in the money(比当前交易
价格高出至少20%)的put。选一个买卖差价不大的.
Step4:然后坐看股市云卷云舒,当option获利超过15%,立刻卖出。两周之内不论正负
,也立即close 你的position。
策略设计的动机和依据
1)现在是牛市吗?不是吧。如果不是,那你们疯狂乱买的动力为啥那么强?
2)现在是熊市吗?不知道。但是感觉总体下落压力大于上涨压力。整体涨涨不动,个
股跌时有跌的稀里哗啦。
3)现在是猪市吗?也许吧。但是如果事先没有确立一个position,涨了跌了也只有干
瞪眼,没有份啊。但是确立一个position买股票风险太大啊。所以用少的钱,确立一个
远期的position,所以如上策略出炉。
4)这个不是赌,这个是堵。
青蛙首次奉献炒股策略,请小白鼠踊跃实验。结果好了,请告知。... 阅读全帖 |
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c**r 发帖数: 10001 | 17 苹果 --- A.烟灰缸 B.黑丝带 C.暗红色
方辰按下C.
计算机 --- A.红键盘 B.红舞鞋 C.显示器
方辰按下B.
封闭的屋子里,一台显示器是唯一的光源,当题目出现时,方辰的脸便被染成幽幽的暗
蓝色,这蓝光非常暗淡,似乎连屋子的角落也无法伸展到,只懒懒地围绕着方辰形成一
个不规则的蓝色光球。
题目消失地瞬间,这光球倏地被显示屏收回,方辰陷在完全的黑暗中,连自己的右手都
看不见。右手却异常警觉,微微翘起,像守候猎物的猎人,以最佳状态等待下一道题目。
这间封闭的屋子,是师大心理系的一间实验室。方辰正是做为被试,在参加那个心理实
验。
不是“一个“心理实验,是----“那个“心理实验。
红舞鞋心理实验。
林筱设计的,没有人能参透其中秘密的,“那个“心理实验。
兔子 --- A.火锅城 B.烟灰缸 C.篮球场
方辰按下B.
舞厅 --- A.红苹果 B.蓝精灵 C.霓虹灯
方辰按下C.
这是两个月前开始的,心理系的高材生林筱,忽然推出了一个名为红舞鞋的心理实验。
最初吸引几个被试的是它的报酬,别的实验都是十五元四十分钟左右的价格,红舞鞋实
验给能坚持十分钟不出错的 |
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l**i 发帖数: 8245 | 18 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: sorcin (退一步海阔天空), 信区: Biology
标 题: Re: Re: 决心 退了,大家别留我吧!!
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Sep 8 23:18:21 2007)
我大二就开始在实验室工作了. 暑假三个月也不回家, 就留在实验室做实验. 另外加
上三年硕士, 拿到硕士学位又在学校呆了一年作实验. 所以我出国之前就发过5篇SCI的
文章.
算来到我退的时候已经做了16年的生物研究了. 在我拿到PHD之前包括在国内读硕士的
时候,我都保持早上9点到实验室,晚上11-12点离开实验室(有课就去上课). 一周六天如
此, 周日如果没其他事一般也是呆在实验室.
另外出文章的速度不是线性的,是有加速度的. 你在一个实验室一般前两年出不了什么
东西.两年之后实验室的技术和系统都熟悉了,做实验出结果的速度就会大大加快.只要
你做实验的时候足够细心保证不出任何低级错误, 再加上实验设计充分,一般实验的成
功率很大.
唉,一说到实验我还是痴心不改. 其实都俱往已. 说实话做生物这么多年让我最寒心的
是在我付 |
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f****n 发帖数: 355 | 19 第九章 几类实验
“研究是一门艺术,即如何设计一些方案去解决那些难题的艺术。”
——彼得·梅达沃爵士(Sir Peter Medwar)
严格他说,每个人所能确信的只是他自己是有意识的。比如说,我知道我是有意识的
。在我看来你的行为举止与我很相似,特别是你使我相信你是有意识的,故而我很有把握
地推断你也是有意识的。倘若我对自己的意识的本质感兴趣的话,我就不必仅仅把研究局
限在自己身上,而完全可以在别人身上做实验,只要他们不是处于昏迷状态。
要揭示意识的神经机制仅仅靠对清醒的受试者进行的心理学实验是不够的。我们还必
须研究人脑中的神经细胞、分子以及它们之间的相互作用。我们可以从死者的脑中获得关
于脑结构的大部分信息。但要研究神经细胞的复杂行为,则必须在活体上做实验。实验本
身并不存在什么难以克服的技术问题。更多的是由于伦理道德方面的考虑使得许多这样一
类实验变得不可能,或是十分困难。
大多数人并不反对在他们的头皮上放置电极来测量脑电波。但是为了直接把电极插入
活体脑组织而要移去部分头骨,即便这只是暂时的,也是众人所不能接受的。即便有人甘
愿为了科学 |
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D*a 发帖数: 6830 | 20 大部分同意你的论据,不过不觉得这说明 现任老板更正确,由于老鼠是生命体,有昼
夜节律,季节节律等,所以早上和晚上的实验结果不同是可以期望的,而这个正是结果
的一部分,而不是说三次实验才能证明nacl到底对blarblarblar的作用是10倍还是2倍
,只能证明早上是10倍,晚上是2倍,然后针对这个有趣的实验现象设计新的实验,进
一步发现原来是某激素导致的。。。 我认为早上和晚上是两个独立实验,哪怕用的是
同一只老鼠。
而三只老鼠的实验组也太小了,我们都是八九只到十几只,老鼠有cage和littermate的
影响,尤其如果只是两倍或者1.2倍这样的变化 (20%的某blarblarblar的增长/降低已
经够高的了),只怕三只老鼠做出来都是一堆P=0.051, 0.049的,反而恰恰忽略了重要
的实验现象。 |
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f********n 发帖数: 6465 | 21 发信人: sorcin (退一步海阔天空), 信区: Biology
标 题: Re: Re: 决心 退了,大家别留我吧!!
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Sep 8 23:18:21 2007)
我大二就开始在实验室工作了. 暑假三个月也不回家, 就留在实验室做实验. 另外加
上三年硕士, 拿到硕士学位又在学校呆了一年作实验. 所以我出国之前就发过5篇SCI的
文章.
算来到我退的时候已经做了16年的生物研究了. 在我拿到PHD之前包括在国内读硕士的
时候,我都保持早上9点到实验室,晚上11-12点离开实验室(有课就去上课). 一周六天如
此, 周日如果没其他事一般也是呆在实验室.
另外出文章的速度不是线性的,是有加速度的. 你在一个实验室一般前两年出不了什么
东西.两年之后实验室的技术和系统都熟悉了,做实验出结果的速度就会大大加快.只要
你做实验的时候足够细心保证不出任何低级错误, 再加上实验设计充分,一般实验的成
功率很大.
唉,一说到实验我还是痴心不改. 其实都俱往已. 说实话做生物这么多年让我最寒心的
是在我付出了将近20年的超乎寻常的努力之后,仍然是两眼一摸黑, |
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y*****3 发帖数: 961 | 22 上周一个名叫“Science Exchange”的网站在美国加州上线,该网站可以让科学家把自
己的研究外包给其他研究者或者研究机构。以下是《自然》杂志对该网站创始人之一的
伊莉莎白•艾奥恩斯的访谈,她过去是位科学家。
“Science Exchange”是什么?
它是一个科学实验的交易平台,与eBay(相当于国内的淘宝网)类似,但交易的商品是
科学知识。用户把想要外包的实验在网上发布之后,提供科研服务的卖家可以对这项工
作展开竞拍。
我们的目的是让研究者能够更便宜得获得专业实验技术支持,同时也更好地利用了核心
机构的闲置资源,从而使科学研究更加高效。
你是怎么产生这个想法的?
当时我是名生物学家,在佛罗里达的迈阿密大学研究乳腺癌。我想做的有些实验超出了
自己的领域,必须寻求外援。然而,寻找供应商的过程极其艰辛,找到之后我又发现付
款有很大麻烦,因为对方不在我们学校的支付系统内。
在与其他科学家的交流中我发现这确实是个严重的问题,但可以通过一个交易平台解决
。今年4月在迈阿密,我们围绕在一张厨房小桌周围聊天,网站就是在那次谈话中起步
的。
为什么研究者会使用这个平台呢?
对买... 阅读全帖 |
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i*e 发帖数: 352 | 23 没有啥能100%万无一失的,BatchPD那个估计common SNPs都已经考虑了,rare的不清楚
,不过rare的话碰到的概率也小很多。此外individual个体还可能有未知的rare
variants,这个就更控制不了了。
看你之前所说,感觉是用来做validation不是detection的,所以万一有那么几个
readout不一致,换对引物或者用其他方法再验证一下。
我有可能记错,不错homopolymer和repeats在exons没有在3‘或者5’端频繁,有碰到
再分别单个手工设计引物好了。
我自己那个script,主要针对自己的实验目的,是WGS的variant validation,主要是
SNVs和小的Indels,也不单单是exonic,所以大多数面向exons的predesigned primers
就无用了,再说SNPs也没有被先排除。
设计引物的时候,input是VCF,已知的common和rare SNPs (dbSNP142)都有先
flagged,然后primer3的结果只取第一个output,之后in silico PCR再过一次,没过
的重新滚... 阅读全帖 |
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W*****n 发帖数: 21 | 24 试着整理了一下.
刚开始有人在Google论坛上说阿狗切不了内源DNA,也切不了转入DNA,自己太衰了,请高
手指点一下.结果有一群人都说阿狗切不动.
突然有个印度小哥debo说阿狗神勇,一试就灵. 与阿狗共转染的GFP质粒表达GFP蛋白明
显下降, 暗示GFP质粒DNA被阿狗切段, Fig 3C 被重复. 众人一追问,debo小哥说没做
DNA实验.看似印度小哥对T7E1实验不太熟. 众人讨论GFP蛋白表达下降也许是由于其他
因素,诸如导向DNA影响转译, 或是GFP质粒DNA转染效率本身在试验组和对照组中就有差
异.也就说对照不严格, 是个假对照. 过了几天, 印度小哥debo悄悄发贴说DNA实验结果
为阴性. 阿狗没有切DNA.
与此同时,更多的人表示Fig4 无法重复. 有人说实验是在293细胞中做的, 也许在HeLa
细胞中会有不同结果. 也有人明确说在HeLa中也不行. 无任何DNA被切证据.
突然又有个澳洲老哥Gaetan Burgio发推特说阿狗神勇,在受精卵中大切内源DNA, 效率
惊人, 而且这次是DNA证据. 有图有真相. 不过老哥好象挺粗心, 图也标错了,引起... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 25 对于韩春雨NBT文章无法重复的问题
需要从Figure 1 开始一步步看
作者的contributions
1. C.H. conceived the study and designed the experiments.
文章 “Story” “Idea” 的设计与发起人
2. X.Z.S. provided intellectual advice on the project and experimental
design.
实验设计, “One guide-faithful” -Figure 2d?
3. C.H. performed mammalian genome editing.
(Figure 4,5)
文章里让科研界最感兴趣的结果,也是无法被重复验证的主要问题
4. F.G. performed the BLAST search and the in vitro cleavage experiments.
(Figure 1, supplementary figure 2)
大肠杆菌E coli 表达的蛋白
NgAgo 基因编辑功能的初步 in vitro 数据支持
注... 阅读全帖 |
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o*****m 发帖数: 981 | 26 我觉得吧,搞生物的简直不知道自己在做什么,根本不知道实验设计为何物,就上一堆
数据。逻辑思维全无。
你的数据中问题多着呢。
最基本的normalization做了吗? 假设你做了。
实验设计有control样本吗,没control你数据就白做。而且control怎么也得设计三个
以上。
control样本还得是已知某些细胞不表达的,这才是合理的control。
你这个认为400就是表达了, 50就是不表达,这种思维不可取。
某些基因本来就高表达,400这个值或许就是不表达。例如在control中此基因表达3000
某些基因本来就低表达,50或许就是高表达,例如在control中此基因为10
————————————————————————
另外生物学家们,看到一个marker基因表达了,就说这个细胞表达了?殊不知很多细胞
都能表达这个marker基因! 要想说某个细胞类型存在高表达,需要有这个细胞类型
的signature基因列表,然后这个基因列表要显著(起码p<=0.05)富集(enrich)差异
表达基因,或者使用GSEA说明存在富集。
看到生物学家们这么认识问题和做科研,我... 阅读全帖 |
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q****i 发帖数: 6923 | 27
~~~~~~~~~~~~~~~~~
我知道,你要什么“严格”的设计和论证。说实在的现在的这些药物实验的“严格”是
没有意义的,就算当时被实验者的健康正常,谁又能保证留药物在人体中过一遭没有后
遗症呢?实验完之后你对这些人有监控吗?有观察到5-10年以后的状况吗?现实情况
是:没有。
这就是为什么很多人吃了阿司匹林导致血管壁变薄,四肢容易出血(我妈妈的症状)。
阿司匹林不是经过严格实验的很“安全”的药吗?多少人被教育一天一片阿司匹林,多
少人受了害。不仅仅是便宜的阿司匹林,你去看看这些新药,哪个赚钱多的药不是血债
累累。这不都是经过严格实验的药吗?所谓的严格实验有什么用?钱,药厂的腰包肥起
来才是最重要的。
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ft这些人都死掉了,现在西医在拿活人做实验。你替死人操心不提活人操心?
有被治的病人都是你们中医教的呀. |
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t******n 发帖数: 6242 | 28 SN1987A中微子10MeV已经测过了
MINOS 2007年的结果是测的平均值为3GeV的中微子
proton beam的能量不是想随便怎么调就怎么调的,
都是根据实验设计的各个因素,比如baseline长度来优化oscillation的
中微子震荡参数的测量是这类实验的主要设计目的,这个测速度只是副产物,
设计的时候肯定没有想过要调节beam的能量,一般取个最好的中间能量值就不错了。 |
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y*****3 发帖数: 961 | 29 上周一个名叫“Science Exchange”的网站在美国加州上线,该网站可以让科学家把自
己的研究外包给其他研究者或者研究机构。以下是《自然》杂志对该网站创始人之一的
伊莉莎白•艾奥恩斯的访谈,她过去是位科学家。
“Science Exchange”是什么?
它是一个科学实验的交易平台,与eBay(相当于国内的淘宝网)类似,但交易的商品是
科学知识。用户把想要外包的实验在网上发布之后,提供科研服务的卖家可以对这项工
作展开竞拍。
我们的目的是让研究者能够更便宜得获得专业实验技术支持,同时也更好地利用了核心
机构的闲置资源,从而使科学研究更加高效。
你是怎么产生这个想法的?
当时我是名生物学家,在佛罗里达的迈阿密大学研究乳腺癌。我想做的有些实验超出了
自己的领域,必须寻求外援。然而,寻找供应商的过程极其艰辛,找到之后我又发现付
款有很大麻烦,因为对方不在我们学校的支付系统内。
在与其他科学家的交流中我发现这确实是个严重的问题,但可以通过一个交易平台解决
。今年4月在迈阿密,我们围绕在一张厨房小桌周围聊天,网站就是在那次谈话中起步
的。
为什么研究者会使用这个平台呢?
对买... 阅读全帖 |
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W**********E 发帖数: 242 | 30 很有意思哈,你到ds版多发发这类问题
首先做testing,你需要定义要解决的问题,例如
1)是否打电话是个影响客户回归贷款因素?可以是打不打电话(yes,no),可以是不打
电话,打一个电话,打两个电话(0,1,2)等等
2)是否发信是个影响客户回归贷款因素?可以是发信不发信(yes,no),可以是不发信
,发一封信,发两封信(0,1,2) 等等
3)欠费时间长短。 (0-30,30-60,60-90,90-120)等等
下一步你需要做的是设计实验方案+randomization,从你描述的来看,你们没做实验设
计和randomization,所以只是观察现有的政策,要想分析个各因素的影响基本上一团乱
麻,可能有些time varying causal inference methods能用上但难度不少。
我可以提个方案,可能不符合你的实际情况哈,只当抛针引玉。假定我们想研究上面3
个因素对回归贷款的影响:
1) 打电话 (yes, no)
2) 发信 (yes, no)
3) 时间(0-30,30-60,大于60天)。
每个人贷款违约时间不是一个可控制可随机分配的因素,我们可以在... 阅读全帖 |
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W**********E 发帖数: 242 | 31 很有意思哈,你到ds版多发发这类问题
首先做testing,你需要定义要解决的问题,例如
1)是否打电话是个影响客户回归贷款因素?可以是打不打电话(yes,no),可以是不打
电话,打一个电话,打两个电话(0,1,2)等等
2)是否发信是个影响客户回归贷款因素?可以是发信不发信(yes,no),可以是不发信
,发一封信,发两封信(0,1,2) 等等
3)欠费时间长短。 (0-30,30-60,60-90,90-120)等等
下一步你需要做的是设计实验方案+randomization,从你描述的来看,你们没做实验设
计和randomization,所以只是观察现有的政策,要想分析个各因素的影响基本上一团乱
麻,可能有些time varying causal inference methods能用上但难度不少。
我可以提个方案,可能不符合你的实际情况哈,只当抛针引玉。假定我们想研究上面3
个因素对回归贷款的影响:
1) 打电话 (yes, no)
2) 发信 (yes, no)
3) 时间(0-30,30-60,大于60天)。
每个人贷款违约时间不是一个可控制可随机分配的因素,我们可以在... 阅读全帖 |
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s******r 发帖数: 655 | 32 从十号工程的十八年奋战到二十号工程的三年首飞——小议中国航空工业发展思路和飞
机研制流程的转变
送交者: 赤松子5 2011年04月04日09:42:57 于 [世界军事论坛] 发送悄悄话
从十号工程的十八年奋战到二十号工程的三年首飞——小议中国航空工业发展思路和飞
机研制流程的转变
作者: witman007 发布日期: 2011-4-04 查看数: 379 出自: http://www.fyjs.cn
十号工程,即歼十的发展计划。先看看我引用别人的歼十发展进度。
1982年1月12日刘华清传达邓小平关于拿出5亿元搞一个性能好的歼击机的指示。
1983年9月16日审查、评议选用发动机问题。
1986年1月25日立项,并列为国家重大专项。
1991年8月30日全尺寸金属样机试制成功。
1997年5月30日完成01架飞机总装。
1997年10月24日完成首飞前全机静力试验。
1997年12月7日进行首滑试验
1998年3月23日首飞成功
1999年12月15日通过全机100%静力试验。
2003年3月10日交付部队领先试用
2003年12月1日完成“低空大表速”试飞
2003年1... 阅读全帖 |
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b*****d 发帖数: 61690 | 33 清华校史馆展出胡锦涛成绩及朱镕基实验报告
http://www.sina.com.cn 2011年04月23日02:46 新京报
本报讯 (记者郭少峰)昨天,清华大学校史馆和新清华学堂正式落成。在清华校史
馆里展出了清华大学百年的历史,其中有近两百件实物均属首次展出。
包括胡锦涛总书记在清华学习工作的情况汇报,还有前国务院总理朱镕基在校期间
与同学一起完成的实验报告等。
胡锦涛“工作成绩”亮相校史展
展览物品历时五年收集整理汇集,其中有近千幅图片。记者发现,一份由清华大学
于1965年7月递交给北京市和教育部的《关于我校政治辅导员工作的情况》的报告中,
在介绍政治辅导员发挥的作用时列举了胡锦涛总书记当年在清华大学的工作成绩。
工作情况报告介绍:“学生文艺社团副团长、政治辅导员胡锦涛,在担负的政治工
作中努力钻研党的方针政策,群众反映和他能谈心里话。”
报告还透露,“胡锦涛学习成绩全部优秀。他还是业余文艺积极分子,参加了舞蹈
创作和演出等。”
朱镕基做实验研究发电机
清华校史展同时还展出了章希博、孙络生和朱镕基等人完成的实验报告。这份“交
流电机实验”科目的报告题目是“交流发电机的并... 阅读全帖 |
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b*******y 发帖数: 4304 | 34 中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
中国 北京 100871北京大学 1生命科学学院 2医学部
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在中国使用了上千年的传统药物,能否改善现代人类的健康?在中国,有些人不认为这
是问题,而在中国以外的世界,中药并非现代人类普遍使用药物的主要来源。
对中药有两种截然相反的看法:在现代医学进展到今天后中药意义很小,甚至毫... 阅读全帖 |
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r****n 发帖数: 575 | 35 饶毅:转基因考验中国媒体(附 答司马南 崔永元)
(2014-01-13 22:54:15)
转载▼
[ 2014/1/13 16:40:13 凯迪社区 > 猫眼看人
转基因食品安全在国际科学界有普遍的共识;
中文反转基因的人没有一位分子生物学专家。
中国政府对转基因舆论并无政治立场和偏向;
转基因安全与否是无关政治立场的科学问题。
转基因提供中国媒体证明自己有质量的机遇;
中国媒体可以通过转基因问题提高基本水平。
毋庸讳言,中国的媒体和从业的媒体人恐怕普遍认为自己质量不高的一个重要原因是在
重大事件上没有自由。现在,转基因成为中文世界广泛关注的事件,而政府没有控制其
讨论,所以,转基因实际给中国有良心的媒体和媒体人提供了一个重要的契机,向社会
展示自己有自由的时候能够为社会负责任地提供有质量的信息。
在中国,科学家和科学界对转基因的讨论都不可能有效,如果媒体本身质量低的话。中
文的媒体将西方上不了正规媒体的黄色小报内容作为热点,令人惊讶地不为媒体人所不
耻、不为社会所唾弃,而不断在中国推出成为社会思潮和风波,证明中国媒体质量有很
大改进空间。
任何科学都允许争论,而且科学界内部对科学... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 36 全程观看直播。丫的英语太烂,加上我知识有限。很多没听太懂,有错或漏的地方请指
正。
报告环节:
1,动物实验已经有脱靶。
2,继续人胚胎实验,还是有脱靶
3,继续人体实验,8对夫妇,一对生下双胞胎。还有一对在怀孕
4, 生下的双胞胎。CCR5敲除不完全的一个, 彻底脱靶的一个
5,追踪18年
提问环节
1,针对实验目的提问:胚胎没有遗传疾病,没有HIV感染, 为什么要搞基因编辑?
回答:没听明白。好像帅锅给父母
2,针对技术环节:你对CCR5了解多少?
回答:不知所云。几本是什么也不知道
3,针对proposal提问:谁看看了proposal?
回答:4个教授。 Rice的好像有参与。 自己的团队看了。
4,针对Funding 来源提问:钱哪来的?
回答:男科大一部分,自己出一部分 (自己的公司?还是另有其人?)
5,针对知情权:父母是否充分知情?与父母讨论的人是否受过训练?
回答:父母是well educated。与父母讨论的人没有受过训练。
6, 针对出生婴儿:谁对他们今后负责?
回答:balabala没听懂!
7, 最后提问:会不会用到你孩子身上。
回答:我孩子有遗传疾病的话,第... 阅读全帖 |
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T*****n 发帖数: 2456 | 37 来自主题: LeisureTime版 - 说说中医 中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
中国 北京 100871北京大学 1生命科学学院 2医学部
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在中国使用了上千年的传统药物,能否改善现代人类的健康?在中国,有些人不认为这
是问题,而在中国以外的世界,中药并非现代人类普遍使用药物的主要来源。
对中药有两种截然相反的看法:在现代医学进展到今天后中药意义很小,甚至毫... 阅读全帖 |
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l*****f 发帖数: 13466 | 38 这个报道有点标题党了。 饶毅那篇2011年的文章写的很详细的。注意引用文献里,有
张昌绍1948年在科学杂志发的文章。
http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-478156.html
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
中国 北京 100871北京大学 1生命科学学院 2医学部
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在... 阅读全帖 |
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w******a 发帖数: 362 | 39 对搞写作的不太了解,试着把韩寒想象成了一个搞生物的。
那么故事开篇就应该是这样的……
一个17岁的少年韩寒发表了一篇PNAS的paper,他是该篇文章的唯一作者(既是第一作者
--说明实验室是由该少年独立完成,又是通讯作者--说明所有的想法及实验设计均由该
少年独立完成。当然实验需要经费,在致谢中感谢了XX学校的韩XX教授,及自然基金委
资助给韩XX教授的基金)。文章一出,被国内各界人士惊为天人。一些大学生物系教授
也不禁发出感叹,就算是国内的众多博士研究生也没有几个人能发出PNAS级别的文章的。
………………
尽管该少年除生物方面有惊人天赋外,语数外物化 5门高考科目没有一门能考及格的,
依然破例被北大生科院录取,并在毕业后顺利留校任教,从事生物专业的研究工作,一
年也能发上一两篇4-5影响因子的文章。
作为一个从事生物相关研究超过10年的生物WSN,我很好奇其它生物WSN及其它不同学科
的同学对以下一些问题的看法。
1.一个17岁的少年,其英语,生物背景是否足够强大让他能大量阅读并理解生物相关的
最新研究进展?
在17岁之前的课余时间里是否有足够的时间来学习英语,生物背景知识,阅读... 阅读全帖 |
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r****7 发帖数: 2282 | 40 毋庸讳言,中国的媒体和从业的媒体人恐怕普遍认为自己质量不高的一个重要原因是在
重大事件上没有自由。
现在,转基因成为中文世界广泛关注的事件,而政府没有控制其讨论,所以,转基因实
际给中国有良心的媒体和媒体人提供了一个重要的契机,向社会展示自己有自由的时候
能够为社会负责任地提供有质量的信息。
在中国,科学家和科学界对转基因的讨论都不可能有效,如果媒体本身质量低的话。中
文的媒体将西方上不了正规媒体的黄色小报内容作为热点,令人惊讶地不为媒体人所不
耻、不为社会所唾弃,而不断在中国推出成为社会思潮和风波,证明中国媒体质量有很
大改进空间。
任何科学都允许争论,而且科学界内部对科学进展都有批评,然后才有进展。对转基因
农作物和食品,科学界特别是植物分子生物学界,自身有严格的标准远高于媒体、内容
超出一般人的议论。
在这样的情况下,植物分子生物学界对应用转基因有普遍的共识,而不是有很多争论,
对于其中具体科学问题需要严格、也需要有对策。在这样的情况下,世界卫生组织、世
界粮食组织、美国科学院、美国医学会和美国药品食品管理局才会多次声明转基因食品
无异于一般食品的安全性问题。
中文媒体常常不严谨... 阅读全帖 |
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C********g 发帖数: 9656 | 41 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: bullmoney (Monk Tang of Stock Market), 信区: Military
标 题: 饶毅雄文: 敬请毛轮批判第一段, 第一段以后不用看
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 12 15:51:27 2011, 美东)
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
中国 北京 100871北京大学 1生命科学学院 2医学部
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史... 阅读全帖 |
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C********g 发帖数: 9656 | 42 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: bullmoney (Monk Tang of Stock Market), 信区: Military
标 题: 饶毅雄文: 敬请毛轮批判第一段, 第一段以后不用看
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 12 15:51:27 2011, 美东)
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
中国 北京 100871北京大学 1生命科学学院 2医学部
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史... 阅读全帖 |
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c**r 发帖数: 10001 | 43 【 以下文字转载自 Ghost 讨论区 】
发信人: cher (不需要), 信区: Ghost
标 题: 红舞鞋心理实验 (一)
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jan 2 19:44:39 2007), 转信
苹果 --- A.烟灰缸 B.黑丝带 C.暗红色
方辰按下C.
计算机 --- A.红键盘 B.红舞鞋 C.显示器
方辰按下B.
封闭的屋子里,一台显示器是唯一的光源,当题目出现时,方辰的脸便被染成幽幽的暗
蓝色,这蓝光非常暗淡,似乎连屋子的角落也无法伸展到,只懒懒地围绕着方辰形成一
个不规则的蓝色光球。
题目消失地瞬间,这光球倏地被显示屏收回,方辰陷在完全的黑暗中,连自己的右手都
看不见。右手却异常警觉,微微翘起,像守候猎物的猎人,以最佳状态等待下一道题目。
这间封闭的屋子,是师大心理系的一间实验室。方辰正是做为被试,在参加那个心理实
验。
不是“一个“心理实验,是----“那个“心理实验。
红舞鞋心理实验。
林筱设计的,没有人能参透其中秘密的,“那个“心理实验。
兔子 --- A.火锅城 B.烟灰缸 C.篮球场
方辰按下B.
舞厅 --- A.红苹 |
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s******y 发帖数: 28562 | 44 中国大型实验装置“科大一环”实现常态运行
2015年11月04日 09:40 来源:中国新闻网 参与互动
中国大型实验装置“科大一环”实现常态运行
中新网合肥11月4日电 (记者 吴兰)记者从中科大采访获悉,中国首台大型反场箍
缩磁约束聚变实验装置“科大一环”,初步实现装置常态化运行。目前每两分钟即可获
得一次放电,最大等离子体电流可达180千安。
反场箍缩磁约束聚变实验装置“KedaToruseXperiment”(KTX,中文简称“科大一环”)
是中国“国家磁约束核聚变能发展研究专项”支持的大型装置建设项目。项目总指挥刘
万东教授介绍,反场箍缩磁约束,与当前国际上热门的“人造小太阳”——“ITER”、
“EAST”是同一类型的基础性能源的装置,旨在解决未来人类能源问题。相比于“ITER
”、“EAST”的“高大上”,“科大一环”的“简单性”在工程技术上更具有可操作性
,是先进磁约束变位形探索研究的重要平台。而超导“ITER”、“EAST”具有相当的难
度。
刘万东教授形象化比喻“科大一环”装置犹如一个“炉子”,简言之就是既能实现
炉内的快速升温,又能实现良好保温效果。“科大一环”装... 阅读全帖 |
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U********S 发帖数: 1896 | 45 那区别不是在PC2上。
你可以在partek里加个elipsoid,用默认的2SD,应该可以看到把两个细胞组混在一起
的时候有没有基因的两种情况分离的比单独的时候更开,也就是像你看到的有更多的
DEG。
我觉得主要问题不在于DEG数量多少而在于分析是否合理,把两个不同的cell合在一起
恐怕不是一个合理的分组方法,除非你的实验设计比较特别。
另外这个是细胞实验还是动物实验,如果是细胞实验的话恐怕实验过程或者芯片处理过
程有些问题,否则不应该有这么大的变异,尤其是红色小点那一组,蓝点那组也不是太
好。可以用所有基因/probe作个hierachical clustering heatmap看一下,红色的那两
组恐怕会混在一起。动物实验的话倒是可以看到这种情况。 |
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t*****6 发帖数: 75 | 46 直接入正题
免疫学方面的实验,开发新的检测工具。
实验过程中具有很多实验因子,暂时可以分类
a为能看到进行测量的因子,比如color;
b看不到的测量不到的因子,抗原抗体相互反应;
c可以测算出来的因子,抗体量,抗原量,缓冲溶液,各种试剂的量
现在不太想一个个实验进行重复(正交,响应面),然后反反复复的优化得到最佳结果
(最佳因子)。
有没有一种理论或者方法,大概这样的:这么多影响因子里面,如何设计或者预测这些
因子相关性,然后给出因子重要程度以及相互作用以及可能的最佳组合,在其给出结果
后进行实际实验?
这个预测不用太精确,只要能给出大概方向或者成功率教好的方向就行。 |
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l*******r 发帖数: 407 | 47 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=2237&do=blog&i
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在中国使用了上千年的传统药物,能否改善现代人类的健康?在中国,有些人不认为这
是问题,而在中国以外的世界,中药并非现代人类普遍使用药物的主要来源。
对中药有两种截然相反的看法:在现代医学进展到今天后中药意义很小,甚至... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 48 获得性遗传看似是被一系列实验否定的,最著名如德国生物学家魏斯曼的割老鼠尾巴实
验,我认为此实验并不合理。
打个比方如蒸馒头,放在蒸屉中长时间蒸,热蒸汽进入到馒头里边长时间作用,这样馒
头从里到外就都熟啦。倘馒头只是短暂的蒸一会,只是表面有点变化,而内部还是生的
。割老鼠尾巴实验正如上述短暂的蒸一下馒头,老鼠只是短时间便失去了尾巴这一性状
,而这并不能深入影响到老鼠内部的遗传物质,要影响到内部遗传物质必须要一个长时
间的对某个性状的不断刺激。
所以我简单设计了个实验:选择性状相同的两组老鼠,每组老鼠都给予充足的食物,适
当的隔离以使它们不至于发生打斗伤亡,合理的性别比例使每只老鼠都能繁殖后代,而
不会因为交配繁殖权大打出手,造成有的老鼠无后代。但两组老鼠的大环境是不同的,
一组放在一个比较寒冷的环境下;另一组则放在一个比较炎热的环境下。若干代后,我
们来对比两组老鼠,看它们有什么显著差别。本实验尽量减少生存竞争 自然选择对老
鼠种群的影响,而突出它们外在生存环境的差异,观察外在生存环境对老鼠种群的影响
。我估计两组老鼠会有很多性状的差别,其中寒冷一组皮毛会比炎热一组浓厚。浓厚的
体毛,是... 阅读全帖 |
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p******1 发帖数: 1388 | 49 我靠!! 作鸡真的很不容易!
联想到以前, 老板的FUNDING年度报告到期了, 但实验数据拿不出手....于是联合一个
新来的老中, 做计算的, 要求从受体结合实验的数据里找到规律. 但同一结构类型的化
合物, 药理结果完全分散状态, 根本集中不了. 于是老中的老婆, 号称日本PHD来着,也
做计算的, 就挑选其中有用的数据, 也就是跟理论计算相对吻合的结果写报告. 中间几
次修改数学模型, 才得到个大概的说得过去的结果. 用另一个做计算的学生的话来说,
虽然都是垃圾化合物, 但如果能用理论解释结果, 也算是没有白费工夫.
再后来, 要求从已有的数据来预测新设计化合物的药理实验结果, 本来是本系的一个组
做受体结合实验, 但出于大家都可以理解的原因,老板在外面重新找了个人来做实验,
结果出奇的好, 虽然都不是什么很好的先导化合物, 但结果和理论预测非常吻合. 老板
靠这个申请到了X00万,轰动一时, 校报, 本地报纸都报道了,大幅标语也挂到了系楼的
正前面, 好似中国文革的那架势. 还有电视台来录像,我被恶心到了...... 另一个老中
千老很配合, 也因此得到了殊荣:从普通博士后升... 阅读全帖 |
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c***s 发帖数: 70028 | 50 美国旧金山的艺术家兰迪-萨拉凡设计的一款有趣的胸罩,女性只要拍一拍手,胸罩便会自行脱下。这款胸罩采用电池驱动,利用一块电磁铁控制开关。如果有人在附近拍手,胸罩的挂钩便会打开
虽然给人一种怪异的感觉,萨拉凡研发的技术也带有一定实用性,例如对关节炎患者和身体有残疾的人来说,因为他们在脱胸罩的时候面临很大难度。他的设计灵感来自于他在叙利亚市场上看到的一款怪异的高科技胸罩。随后,他照猫画虎,研制了这款胸罩
北京时间7月20日消息,据国外媒体报道,美国旧金山的艺术家兰迪-萨拉凡设计了一款有趣的胸罩,佩戴着只要拍一拍手,胸罩便会自行脱下。这款胸罩采用电池驱动,利用一块电磁铁控制开关。如果有人在附近拍手,胸罩的挂钩便会打开。如此设计让人不免联想到影片《春满夏令营》中出现的画面。
萨拉凡的设计灵感来自于他在叙利亚市场上看到的一款怪异的高科技胸罩。随后,他照猫画虎,研制了这款胸罩。他表示:“第一次读到有关叙利亚内衣的文章时,我就被震惊了。西方人往往认为阿拉伯文化在性方面非常保守,实际上,他们在女用内衣技术方面显然走在我们前面。因此,我决定将提高西方内衣技术作为我的一个使命。我发现完成这项任务所需做的第一... 阅读全帖 |
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