a***n
发帖数: 86 | 1 材料科学比较特殊，感觉你的认识很模糊，建议你最好了解下材料类研究具体的工作方
式和实验手段，看你自己喜欢不，或者能适应不。科学计算是什么样子的，很好想象，
你应该也了解。如果以后搞计算材料学，学计算好入门，但物理基础很关键。
化学 |
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s******s
发帖数: 13035 | 2 【 以下文字转载自 Statistics 讨论区 】
发信人: shakuras (doskey), 信区: Statistics
标 题: 免费的云计算存储资源 Open Science Data Cloud
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 3 15:29:10 2014, 美东)
免费的云计算存储资源 Open Science Data Cloud
多转几个版。这个是非商业的科研机构，我也没好处可捞，不算违规吧？
有一个Petabyte-scale的云计算资源，可以用来储存数据以及进行科学计算，
有点类似AWS，现在有许多NIH以及NASA等也在使用。这个资源现在对非营利
科研用途是免费的, 上面还有一些pipeline，比如基因组分析一类的。不管
是有大的project或者自己用来玩玩都可以，3/12号有一个demo的seminar
教如何注册和使用。有兴趣的可以快去报名注册。
注册的时候“how did you hear about this OSDC demo", 你填mitbbs
就行, 不要填我的名字shakuras. 我没啥好处可以捞，这个信息完全是... 阅读全帖 |
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s******s
发帖数: 13035 | 3 【 以下文字转载自 Apple 讨论区 】
发信人: shakuras (doskey), 信区: Apple
标 题: 对免费云计算资源感兴趣的
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 3 15:18:17 2014, 美东)
对免费云计算资源感兴趣的
有一个Petabyte-scale的云计算资源，可以用来储存数据以及进行科学计算，
有点类似AWS，现在有许多NIH以及NASA等也在使用。这个资源现在对非营利科
研用途是免费的, 上面还有一些pipeline，比如基因组分析一类的。不管是有
大的project或者自己用来玩玩都可以，3/12号有一个demo的seminar教如何注
册和使用。有兴趣的可以快去报名注册。
注册的时候“how did you hear about this OSDC demo", 你填mitbbs就行,
不要填我的名字shakuras. 我没啥好处可以捞，这个信息完全是内部统计用。
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d... 阅读全帖 |
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s******s
发帖数: 13035 | 4 【 以下文字转载自 Apple 讨论区 】
发信人: shakuras (doskey), 信区: Apple
标 题: 对免费云计算资源感兴趣的
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 3 15:18:17 2014, 美东)
对免费云计算资源感兴趣的
有一个Petabyte-scale的云计算资源，可以用来储存数据以及进行科学计算，
有点类似AWS，现在有许多NIH以及NASA等也在使用。这个资源现在对非营利科
研用途是免费的, 上面还有一些pipeline，比如基因组分析一类的。不管是有
大的project或者自己用来玩玩都可以，3/12号有一个demo的seminar教如何注
册和使用。有兴趣的可以快去报名注册。
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G*******m
发帖数: 16326 | 5 大家最好不要轮不轮的。
我们只讲究科学计算，科学分析。 |
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w****2
发帖数: 12072 | 6 当心灵鸡汤碰到科学——2013高考作文题之荒谬
今年高考，江苏、陕西、河南三省作文题目为涉及科技细节的案例材料。在网友的“围
攻”下，两则作文材料仅一天就被指出重大技术性错误。
2013年江苏高考作文材料：
几位朋友说起这样一段探险经历：他们无意中来到一个人迹罕至的山洞。因对洞中环境
不清楚，便点燃了几支蜡烛靠在石壁上。在进入洞穴后不久，他们发现了许多色彩斑斓
的大蝴蝶安静的附在洞壁上栖息，他们屏住呼吸，放轻脚步，唯恐惊扰了这群美丽的精
灵。数日后再来，他们发现这群蝴蝶早已不在原处，而是远远的退到了更深的洞穴。他
们恍然大悟，也许那里环境更适合吧，小小的蜡烛竟然会带来这么大的影响。
2013年陕西高考作文材料：
一位商人得到一块价值不菲的宝石，但却发现宝石上有一条裂缝，如果能从裂缝处切开
，就能得到两块完美的宝石。
当地许多富有经验的老工匠都不敢去切割这样一块昂贵的宝石，这时，一位年轻工匠勇
敢的站了出来，并且完美的切割出了两块宝石。年轻工匠的师傅感叹的说，有些时候不
仅需要足够的经验，更需要抛却许多顾虑的勇气。
2013年河南高考作文材料：
一个有一道裂痕的钻石，若切割好的话就价值连... 阅读全帖 |
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H********g
发帖数: 43926 | 7 我这个外行都可以猜测，让群众学雷锋至少有两个问题，一是根本不好预测进程，不好
预测进程就不好分配任务；二是学一下雷锋不难，难的是学一辈子雷锋。
因此我提议在算比特币的程序里插入一点算科学的木马代码。或者在emule bitcomet这
些p2p程序里植入科学计算木马。p2p这个的好处是本来数据流量就大，所以很好隐藏通
讯。算比特币的人如果发现总有跟外界的数据交换可能很容易起疑心。 |
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b******t
发帖数: 66 | 8 个人建议一点：
如果对数学（计算数学、科学计算）有特别兴趣和基础，选择这个系还是挺好的；
学好这个专业还是需要个人的勤奋！ |
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w****2
发帖数: 12072 | 9 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: wlwl12 (戒网), 信区: Military
标 题: 当心灵鸡汤碰到科学——2013高考作文题之荒谬
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jun 8 19:18:09 2013, 美东)
当心灵鸡汤碰到科学——2013高考作文题之荒谬
今年高考，江苏、陕西、河南三省作文题目为涉及科技细节的案例材料。在网友的“围
攻”下，两则作文材料仅一天就被指出重大技术性错误。
2013年江苏高考作文材料：
几位朋友说起这样一段探险经历：他们无意中来到一个人迹罕至的山洞。因对洞中环境
不清楚，便点燃了几支蜡烛靠在石壁上。在进入洞穴后不久，他们发现了许多色彩斑斓
的大蝴蝶安静的附在洞壁上栖息，他们屏住呼吸，放轻脚步，唯恐惊扰了这群美丽的精
灵。数日后再来，他们发现这群蝴蝶早已不在原处，而是远远的退到了更深的洞穴。他
们恍然大悟，也许那里环境更适合吧，小小的蜡烛竟然会带来这么大的影响。
2013年陕西高考作文材料：
一位商人得到一块价值不菲的宝石，但却发现宝石上有一条裂缝，如果能从裂缝处切开
，就能得到两块完美的宝石。
当地许多富... 阅读全帖 |
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s******s
发帖数: 13035 | 10 对免费云计算资源感兴趣的
有一个Petabyte-scale的云计算资源，可以用来储存数据以及进行科学计算，
有点类似AWS，现在有许多NIH以及NASA等也在使用。这个资源现在对非营利科
研用途是免费的, 上面还有一些pipeline，比如基因组分析一类的。不管是有
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Cloud (OSDC) on Wed 3/12 @ 11am CT.
The OSDC pro... 阅读全帖 |
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d***a
发帖数: 13752 | 11 如果是你们组里搞计算，用funding来买，不应该这样节省啊。这么长的计算时间，正
常的配置，应该是用Xeon+ECC内存，计算的可靠性要高很多。
GTX650 |
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O*******d
发帖数: 20343 | 12 大量计算的，还是C＋＋快。 java根本不适合计算，天生的速度不行。 你很少听到巨
量计算用java。 C＋＋还有一个优点，就是可以直接跟GPU的库连接，用GPU进行浮点计
算，速度可提高几十倍上百倍。 |
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O*******d
发帖数: 20343 | 13 大量计算的，还是C＋＋快。 java根本不适合计算，天生的速度不行。 你很少听到巨
量计算用java。 C＋＋还有一个优点，就是可以直接跟GPU的库连接，用GPU进行浮点计
算，速度可提高几十倍上百倍。 |
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p*********t
发帖数: 17 | 14 一般情况下计算的瓶颈就是cpu和内存。我想3G以上的cpu本身性能没话说，不会成为瓶
颈。需要选比较大的内存是王道。32位cpu，只能address 4G内存地址，如果你的程序
用到比较大的矩阵乘法，可能会要求大于4G内存，这时候32位机要借助硬盘来暂时存储
数据，速度会慢很多，（20倍或更多）。而64位机可以address 的内存目前可以认为是
海量，所以只要再配个大内存就好了。
现在一般3G的cpu，多核都不便宜。如果仅仅购买一台电脑，要看是否会进行并行计算
，用不到的话没必要买。
另外，单机内存现在16GB算不错的，如果是非常大的计算，说不准32GB也可以考虑。 |
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c***u
发帖数: 190 | 15 现在做个简单的数值计算, 老板需要知道怎样能很快,有效的计算5000x5000的矩阵. 我
本人不是很懂科学计算. 也不是很懂matlab 和mathematics. 有人做过类似的活吗?
谢谢 |
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s******s
发帖数: 13035 | 16 免费的云计算存储资源 Open Science Data Cloud
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s******s
发帖数: 13035 | 17 这里有免费的云计算存储资源
有一个Petabyte-scale的云计算资源，可以用来储存数据以及进行科学计算，
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w****u
发帖数: 367 | 18 mark
这里有免费的云计算存储资源
有一个Petabyte-scale的云计算资源，可以用来储存数据以及进行科学计算，
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x*******1
发帖数: 28835 | 19 除了科学计算那些没有经过优化的应用，现在哪个应用需要Exascale 级别的计算力？
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w***u
发帖数: 17713 | 20 这次矿机淘汰下来的计算能力，够中国一般性的科学计算能力得到一个很大的提升吧。
可以在贵州新疆办很大的farm了。 |
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p********e
发帖数: 55 | 21 谢谢大家回复
我可能没说清楚我的问题
imac pro $5k一台，同样的价格买其他server有更好的选择么？
如果买4-5台 imac pro的钱，有更好的选择吗？买一台好的server或者多台不是mac的
server
主要是自己的组做genomics的计算，考虑拿出一半的机器也让系里其他人submit job
我上学时候导师就是买了好几台mac pro做server，和系里的主服务器的存储系统是连
起来的。
系里的服务器不行，我想申请一些计算设备的经费，看看怎么买。现在还不知道具体多
少钱，不过再怎么也应该有几万吧 |
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g****r
发帖数: 1607 | 22 serious的科学计算最好用nvidia 计算用的gpu, 支持ecc, 这个很重要，你要是算不重
要的东西桌面用游戏卡可以。
cuda我不记得支持ati的卡 |
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m*****e
发帖数: 226 | 23 同感，是不是用了旧件？
做计算的机器省的过分不太好，毕竟可信的计算结果才是重要的。
另外，作为爱好者可以自己装服务器，但要是给单位或实验室装机器就要慎重了，因为
有个以后的维修和服务的问题，装好了能得到赞赏，但出了问题就麻烦缠身，而大多数
情况都不会一切顺利的，因为机器要长时间运转，并且个人一般没有经验与能力提供公
司所能够提供的服务。 |
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q********g
发帖数: 10694 | 25 以前发的帖子，稍微更新了一下cpu和机箱。如今内存白菜了。
发信人: qiaqiafeng ($_$), 信区: Hardware
标 题: Re: 想买台台式机跑科学计算。请大虾推荐。
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Feb 25 14:07:05 2011, 美东)
说一个PC搞计算的dream级经济配置：
EVGA Classified SR-2 270-WS-W555-A2
Intel Xeon W3680 3.33GHz ---2
Memory 3X4G --4 任意牌子怎么便宜怎么来
Western Digital Caviar Black WD5002AALX 500GB ----5
TESLA C2070 ---先买一个，慢慢加到3个吧。
SILVERSTONE ST1500 1500W
LIAN LI PC-90 Computer Case (新货）机箱跟普通ATX middle的差不多）
随便搞个30块以内的显卡显示
淘汰15"显示器
淘汰鼠标/键盘
想奢侈一点的：以上三项换成
N GTX580 或 AMD SAPPHIRE 100290SR Radeon... 阅读全帖 |
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l*****o
发帖数: 9235 | 26 如果要搞一个个人计算的台式机做科学计算，需要双精度，既有满矩阵，又有稀疏矩阵
。是自己配好，还是买戴尔的 T5600 比较好？
自己配的话，cooling system 和 主板 怎么选比较好？ 买的话，能拿到更好的折扣吗
？ |
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d***a
发帖数: 13752 | 27 如果对计算正确性的要求高，计算时间长，还是要上xeon+ECC吧。
超频是没有意义的，可靠性不好。 |
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m**********e
发帖数: 12525 | 28 以我经验,你这样搞意义不大.
如果计算时间超过一天,最好上超级计算机,这样debug容易跟上.
不然工作进度严重受损.
desktop只有在计算规模不超过小时数量级的前提下有意义,你这些
机器选来选去的区别就是2小时还是3小时的差别,我觉得意义不大.
都等了2小时了,你说再灌1小时的水又如何? |
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t*****z
发帖数: 1598 | 29 谢谢指点!GTX650这样的入门N卡的双精度gflops跟A家的几款挖矿神卡比可以说是忽略
不计吧。即使是这样的低端卡,我插上去后计算时间也有显著缩短(我的计算的确是用双
精度的)。我想买块好点的卡恐怕就可以缩短一个数量级了吧。 |
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P******X
发帖数: 482 | 30 还有人给专门做计算的机器超频。真是开眼界
真正做大量计算必须上Xeon+ECC memory,现在还要加上Telsa。Xeon CPU跟memory卡之
间的数据流带宽是i7的2~5倍。什么纸给你显示的是一样的？ Telsa之类被叫作co-P也
不是只是多了一个node |
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d***a
发帖数: 13752 | 31
这个你倒是不用担心，有什么重要的发现，你算第二遍，第三遍校验就行了。不过有很
小的概率，你的程序有可能错过重要的发现。
主要的问题是你没有必要在这种几百元的事情上耗时间。纳税人一年在一个有support
的PhD学生上，至少要花四五万美元，postdoc至少七八万美元。如果你有什么计算要求
，应该大大方方向组里提出来，花个一两万美元不是什么大的开销。
你这样花时间的方式也不对。你应该把时间花在优化程序上。编译优化很容易拿到几十
个百分点的性能，数据优化可以拿到几十个百分点到几倍的性能，算法和计算流程优化
可以拿到几倍到上十倍的性能，比花在攒机上的时间有意义多了。而且很明显，攒机不
是你的长处。
如果你真的是budget有限，买个Dell XPS 8700，配大内存，再加个好的GPU就行了。 |
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b***a
发帖数: 67 | 32 不好意思，让大拿见笑了。主要还是出于学习的目的，想问问市面上有哪些比一般家庭
用的笔记本计算能力强大一些，内存也可以的，其他配置可以从简的本子。起码可以用
来做一些用到GPU和Multicore并行计算的练习。大概也知道实用性有限，所以也不想投
资太多。 谢谢。 |
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m**u
发帖数: 541 | 33 撇开市场， 就纯编程的角度来讲，仍然推荐C++，不要使用.NET啥的。对于你的情况来
说，你的软件工程复杂度很低，C++是个很好的平衡，既保证了计算速度又保证了一定
的高级语言特性用于处理相对复杂一些的情况。
.NET也好，Java也好，俺测试的结果和C++做计算还是有差距的。 |
|
m****0
发帖数: 837 | 34 已经等了好几年了，也不在于一时。
问题是这个工具，一半的代码在PLC上，用户可以直接看到所有的ＰＬＣ代码。如果用
户可以看到这个工具的配置代码，就完全透明了。
没有计算，全部是产生数据表，生成报告，另外就是生成代码下载到PLC。 计算量几乎
没有，但是有相当多的循环，一个地方出错可能要调试很久。
很多时候电脑不能上网，很多时间在工厂里手机信号都没有的地方，有什么解决方案？ |
|
r****c
发帖数: 1494 | 35 我也是ME的，不牛。周围玩Python的人很多，因为比较像Matlab。最近有些人在用
Julia，不知如何。只有写solver的人可能还有用些Fortran，不过Solver网上有很多，
什么cvode之类的，下就是了。
但是你如果做物理仿真，据我了解State of the Art的做法应该是GUI部分用程序语言
，计算用专业仿真软件制作的FMU。例如Python就可以很简单做到整一套了。
https://pypi.python.org/pypi/PyFMI
我个人推荐Modelica语言，不过免费的编译器只有opemodelica和jmodelica。
当然有些公司准备通过直接卖计算部分的FMU来赚钱。 |
|
t**********e
发帖数: 134 | 36 这里有人做过几十个Tb或几百Tb的数据计算吗，没有的话就别争了。那你们的计算数据
太小了
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.2.2 |
|
m********5
发帖数: 17667 | 37 嗯，我以前做过的是50TBytes左右
但是数据量大，不见得计算量大
有的数据只有20-30GB, 但是计算量大得多 |
|
m**u
发帖数: 541 | 38 撇开市场， 就纯编程的角度来讲，仍然推荐C++，不要使用.NET啥的。对于你的情况来
说，你的软件工程复杂度很低，C++是个很好的平衡，既保证了计算速度又保证了一定
的高级语言特性用于处理相对复杂一些的情况。
.NET也好，Java也好，俺测试的结果和C++做计算还是有差距的。 |
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m****0
发帖数: 837 | 39 已经等了好几年了，也不在于一时。
问题是这个工具，一半的代码在PLC上，用户可以直接看到所有的ＰＬＣ代码。如果用
户可以看到这个工具的配置代码，就完全透明了。
没有计算，全部是产生数据表，生成报告，另外就是生成代码下载到PLC。 计算量几乎
没有，但是有相当多的循环，一个地方出错可能要调试很久。
很多时候电脑不能上网，很多时间在工厂里手机信号都没有的地方，有什么解决方案？ |
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r****c
发帖数: 1494 | 40 我也是ME的，不牛。周围玩Python的人很多，因为比较像Matlab。最近有些人在用
Julia，不知如何。只有写solver的人可能还有用些Fortran，不过Solver网上有很多，
什么cvode之类的，下就是了。
但是你如果做物理仿真，据我了解State of the Art的做法应该是GUI部分用程序语言
，计算用专业仿真软件制作的FMU。例如Python就可以很简单做到整一套了。
https://pypi.python.org/pypi/PyFMI
我个人推荐Modelica语言，不过免费的编译器只有opemodelica和jmodelica。
当然有些公司准备通过直接卖计算部分的FMU来赚钱。 |
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t**********e
发帖数: 134 | 41 这里有人做过几十个Tb或几百Tb的数据计算吗，没有的话就别争了。那你们的计算数据
太小了
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.2.2 |
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m********5
发帖数: 17667 | 42 嗯，我以前做过的是50TBytes左右
但是数据量大，不见得计算量大
有的数据只有20-30GB, 但是计算量大得多 |
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A*****s
发帖数: 13748 | 43 以前一直用MATLAB和C，没有用过OO的
想请教一下比如做矩阵计算一般用什么类库呢？
另外，Daoqi Yang这本书有没有电子版啊？
C++ and Object-oriented Numeric Computing for Scientists and Engineers
还有什么值得推荐的讲解OO数值计算的书呢？
谢谢 |
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l******n
发帖数: 9344 | 44 做计算不行,我台式机上2 core Xeon E5 + NVIDIA Quadro K2000 Graphics card还是
太慢
准备自己攒个cluster做计算 |
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f***e
发帖数: 5443 | 45 异质异步多机远程,
早就有很多了，帮助科学计算的 |
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l******t
发帖数: 55733 | 46 15分钟教程的可以吗？
你那个科学计算，是一个主任务还是每人提交自己的任务？ |
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y*j
发帖数: 3139 | 47 这里的比较没有考虑电力传输的费用，根据一般的费用计算，它基本和发电成本差不多
。轨道的维护费用也没有考虑，这个费用随着使用越来越贵。夜间必须停车检修轨道。
所以即使不考虑轨道的建造费用，能源成本相差不大，但飞机的速度快多了。唯一可骄
傲的是国产化。 |
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发帖数: 1 | 48 中国高铁部件绝大部分是外国制作，装配是在中国而已。
: 这里的比较没有考虑电力传输的费用，根据一般的费用计算，它基本和发电成本
差不多
: 。轨道的维护费用也没有考虑，这个费用随着使用越来越贵。夜间必须停车检修
轨道。
: 所以即使不考虑轨道的建造费用，能源成本相差不大，但飞机的速度快多了。唯
一可骄
: 傲的是国产化。
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z*******h
发帖数: 346 | 49 科学计算上有用，simulation啥的。openmp还是不错的，大大简化了multithreading编
程。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8 |
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R*******n
发帖数: 428 | 50 > 数学家看了，感觉太无聊。
数学家看了说这个计算严格说起来应该用积分。因为65公斤的人
和65+8=73公斤的人打两小时球消耗的能量是不一样的。体重逐
渐增加，消耗的能量也逐渐增加，所以要用到积分。：） |
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