z*********s
发帖数: 38 | 1 和已经报道的nls都比过了，没有相似的。nls大多富含K。我这个蛋白质K比较多，但是
都不连续是分散的。朋友担心这些K在空间结构上是邻近的。 |
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x****6
发帖数: 4339 | 2 看来是研究基因组空间结构的同好，
请问HiC这种技术吧三级结构整出来以后，除了炫酷以外，还有什么用？
nuclei
coordinations
we
real |
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h******g
发帖数: 600 | 3 长一种晶体，长了半天，要么出来白色颗粒，要么出来羽毛状晶体，就是晶体内部像
羽毛一样，这种晶体算单晶吗？可以用来解析空间结构吗？谢谢了。 |
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M*******e
发帖数: 21 | 4 抗击流感唯一有效的药是达菲，通用名是奥司他韦
鹰
奥司他韦
维基百科，自由的百科全书
奥司他韦
IUPAC中文名称 (3R,4R,5S)-4-乙酰氨基-5-氨基-3(1-乙基丙氧基)-1-环己烯-1-羧酸乙酯
INN通用名 Oseltamivir
CADN通用名 奥司他韦
分子式 C16H28N2O4
分子量 312.4 g/mol
CAS号 196618-13-0
ATC代码 J05AH02
半衰期 6～10小时
适应症 流行性感冒
商品名／生产商 达菲／罗氏
奥司他韦（Oseltamivir）是一种作用于神经氨酸酶的特异性抑制剂，其抑制神经氨酸
酶的作用，可以抑制成熟的流感病毒脱离宿主细胞，从而抑制流感病毒在人体内的传播
以起到治疗流行性感冒的作用。奥司他韦是基于结构的合理药物设计的成功案例，在这
种药物的研发过程中大量应用了计算机辅助药物设计的手段，根据靶酶的三维结构有针
对性地设计了高效低毒专一性强的神经氨酸酶抑制剂。
罗氏制药有限公司是奥司他韦的专利持有人，目前他们生产的奥司他韦磷酸盐胶囊剂（
商品名Tamiflu，中国大陆称达菲，港译特敏福，台湾译为克流感）是市场上唯一的奥... 阅读全帖 |
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M*******e
发帖数: 21 | 5 抗击流感唯一有效的药是达菲，通用名是奥司他韦
鹰
奥司他韦
维基百科，自由的百科全书
奥司他韦
IUPAC中文名称 (3R,4R,5S)-4-乙酰氨基-5-氨基-3(1-乙基丙氧基)-1-环己烯-1-羧酸乙酯
INN通用名 Oseltamivir
CADN通用名 奥司他韦
分子式 C16H28N2O4
分子量 312.4 g/mol
CAS号 196618-13-0
ATC代码 J05AH02
半衰期 6～10小时
适应症 流行性感冒
商品名／生产商 达菲／罗氏
奥司他韦（Oseltamivir）是一种作用于神经氨酸酶的特异性抑制剂，其抑制神经氨酸
酶的作用，可以抑制成熟的流感病毒脱离宿主细胞，从而抑制流感病毒在人体内的传播
以起到治疗流行性感冒的作用。奥司他韦是基于结构的合理药物设计的成功案例，在这
种药物的研发过程中大量应用了计算机辅助药物设计的手段，根据靶酶的三维结构有针
对性地设计了高效低毒专一性强的神经氨酸酶抑制剂。
罗氏制药有限公司是奥司他韦的专利持有人，目前他们生产的奥司他韦磷酸盐胶囊剂（
商品名Tamiflu，中国大陆称达菲，港译特敏福，台湾译为克流感）是市场上唯一的奥... 阅读全帖 |
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f*******e
发帖数: 5594 | 6 信息是无处不在的，我们所吃的东西当中，除了化学成分这样的信息之外，还有分子间
的排列顺序与方式、空间结构、相互作用等多种信息。地球上的万物在恒久的岁月当中
，随着日月星体的运行，形成了内部与外部的和谐共存，内部信息也就与外部信息达成
了某种时序上的一致性。四季变化的时候，我们吃当季的食物，就是利用了食物当中这
种已有的时序一致性信息，来帮助人体更好的适应环境的变化。
信息没有产生过，也没有消失过，只是在不断的转化变动之中。
所以也就不用太多担心黄帝内经的起源与变动的问题。 |
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d***o
发帖数: 761 | 7 http://www.math168.com/sxsh/826.htm
冯康学派对计算数学发展的重要贡献
—— 作者 余德浩
2009-8-24 16:56:48
计算数学是当代数学科学的重要分支,是伴随着计算机的出现而迅速发展并获得
广泛应用的新兴交叉学科,是数学及计算机实现其在高科技领域应用的必不可少的纽带
和工具。计算与理论和实验相并列,已经成为当今世界科学活动的第三种手段,这是二十
世纪后半叶最重要的科技进步之一。值此世界进入新的世纪,国际数学家大会将首次在
我国召开之际,回顾半个世纪来我国计算数学的发展,尤其是以已故冯康院士(1920-1993
)为代表的我国计算数学家群体,即"冯康学派"对国际计算数学发展所做出的重要贡献,
是非常有意义的。当然由于篇幅所限,本文只能涉及部分研究领域和少数专家学者,挂一
漏万在所难免。
冯康先生祖籍浙江绍兴,1920年9月9日出生于江苏南京,6岁迁居苏州。1939年毕
业于省立苏州中学,1944年毕业于中央大学物理系。1945年起先后在复旦大学物理系、
清华大学物理系和数学系任教。1951年转到刚组建的中国科学院数... 阅读全帖 |
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b**s
发帖数: 589 | 8 雷射的功能广泛，不但可以用来辨识商店里的计算机条形码，也可以用来摧毁敌方的空中
飞弹。现在，美国普渡大学（Purdue University）的化学家使用雷射来诱导分子改变形
状。 蛋白质等大分子由多肽链（polypeptide chains）构成，经由多肽链的扭曲与折叠
，来形成独特的三度空间结构，此外，分子也可以再重新构成不同的形状。这种结构上的
改变，可以改变分子与其它分子反应的方式。 科学家使用雷射光来激发两团多链之间的
化学键，只要改变雷射光的波长，就能够将分子转变成不同的形状。主持这项研究的
Timothy Zwier教授表示，“虽然要将这种技术直接应用到蛋白质、 DNA或是其它分子上
，还有相当长的一段路要走。不过，这项成果让我们在将来能够直接改变分子的结构，用
雷射光开启或是关闭其功能。” |
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s****e
发帖数: 2934 | 9 生物谷：我们知道，鸟类的骨骼和树木的树干结构都经过了长期的自然进化，才达到强
度和密度的完美平衡。但是在最新一期Nature Materials上，美国Sandia国家实验室
、新墨西哥大学（UNM）和华盛顿天主教大学与普林斯顿大学的科学家们发表文章，声
称按人为控制的模式自组装的纳米材料能够超过大自然的杰作。
在更加多孔的同时，又不会过于降低强度。
进行该项研究的是美国Sandia国家实验室、新墨西哥大学、凯斯西储大学以及普林
斯顿大学的科学家。项目负责人 Jeffrey Brinker表示，：“微电子学和膜技术领域
往往需要既多孔又坚固的材料，通过自组装我们能够在比自然界中更精细的尺度构建硅
土材料。在非常小的尺度改变材料的结构和机械性能，才有可能制作出微电子学和膜技
术所需要的高硬度、多孔的材料。而新的研究成果使这一切成为可能。”
所谓自组装，一般是指原子、分子或纳米材料通过非共价键作用，在衬底上自发地
排列成一维、二维甚至三维的稳定有序的空间结构。研究人员通过核磁共振、拉曼分光
研究发现，人工方法使硅薄膜结构更加多孔的同时也会使孔壁厚度变得更薄（不到 |
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s*****e
发帖数: 115 | 10 找首次积分，观察相空间结构，基本上是这类问题的标准方法。
看来楼主得加紧复习了！ |
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s*******t
发帖数: 66 | 11 现在看这段，是不是比较搞笑。
2012年，田刚教授取得重大突破，率先解决了Yau-Tian-Donaldson 猜想。田刚教授先
后受邀在法国巴黎 IHP，美国 Stony Brook 大学，北京国际数学中心等地报告自己的
学术成果，引起了强烈关注和极大反响。其证明综合应用了众多理论，涉及到很多数学
分支，比如微分几何 (Kodaira 嵌入定理)，代数几何(positivity，GIT稳定性)，偏微
分方程(复 Monge-Ampere 方程)，多复分析(Hormander 估计)，度量几何(黎曼度量的
紧性理论)等等。特别是其证明将这些领域完美的联系在一起，完善并推动了这些学科
的发展。 Yau-Tian-Donaldson 猜想的解决也给数学家们提供了一种通过代数几何的方
法来研究Kahler-Einstein度量模空间结构的方法。Yau-Tian-Donaldson 猜想的解决建
立了连接代数几何和微分几何的桥梁，并将推动这两个学科的发展，可以肯定的是这将
会在几何领域的发展史上留下光辉灿烂的一页。 |
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s*******t
发帖数: 66 | 12 现在看这段，是不是比较搞笑。
2012年，田刚教授取得重大突破，率先解决了Yau-Tian-Donaldson 猜想。田刚教授先
后受邀在法国巴黎 IHP，美国 Stony Brook 大学，北京国际数学中心等地报告自己的
学术成果，引起了强烈关注和极大反响。其证明综合应用了众多理论，涉及到很多数学
分支，比如微分几何 (Kodaira 嵌入定理)，代数几何(positivity，GIT稳定性)，偏微
分方程(复 Monge-Ampere 方程)，多复分析(Hormander 估计)，度量几何(黎曼度量的
紧性理论)等等。特别是其证明将这些领域完美的联系在一起，完善并推动了这些学科
的发展。 Yau-Tian-Donaldson 猜想的解决也给数学家们提供了一种通过代数几何的方
法来研究Kahler-Einstein度量模空间结构的方法。Yau-Tian-Donaldson 猜想的解决建
立了连接代数几何和微分几何的桥梁，并将推动这两个学科的发展，可以肯定的是这将
会在几何领域的发展史上留下光辉灿烂的一页。 |
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s***a
发帖数: 4921 | 13 我们知道，鸟类的骨骼和树木的树干结构都经过了长期的自然进化，才达到强度和密度
的完美平衡。美国科学家最近发现，自组装纳米结构能够超越这些自然界的“鬼斧神工
”，在更加多孔的同时，又不会过于降低强度。相关论文发表在6月的《自然—材料学
》上。
进项该项研究的是美国Sandia国家实验室、新墨西哥大学、凯斯西储大学以及普林斯顿
大学的科学家。项目负责人Jeff Brinker表示，“微电子学和膜技术领域往往需要既多
孔又坚固的材料，而新的研究成果使这一切成为可能。”
所谓自组装，一般是指原子、分子或纳米材料通过非共价键作用，在衬底上自发地排列
成一维、二维甚至三维的稳定有序的空间结构。研究人员通过核磁共振、拉曼分光研究
发现，人工方法使硅薄膜结构更加多孔的同时也会使孔壁厚度变得更薄（不到2纳米）
，重新排列后的硅结构也会变得更加紧密和坚固。
此前有研究证实，自然界最优化的骨骼的强度会按照密度平方的比例发生变化，而最新
的研究表明，自组装纳米材料孔性的增加对劲度模量（stiffness modulus）的影响更
小。尤其当纳米材料的孔是立方体结构时，劲度模量会随着自身密度的平方根变化。
Br |
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w********g
发帖数: 186 | 14 汗死....
其实选择性这个东西真的很有趣
我最近可能找我们这边有没有人作simulation看一下那几个polymer的空间结构
还有在溶液里面可能的结构
如果我们看这几个polymer
no hydrophilic groups而且,主要都是片状结构
那么肯定不能像SDS那样行程micelle去做包裹
而且如果参考Arnold的那篇用sodium cholate做gradient centrifugation的那篇
SC的结构,对于其hydrophobic部分
也是这样的一个片状结构
而且也是对高chiral angle的管子有更好的选择性
应该可以告诉我们一些什么东西
我觉得如果有谁能观察到或者模拟出来具体是怎么样wrap在CNT上面
应该会是很好的突破口 |
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J*******3
发帖数: 1651 | 15 费米面、布里渊区和一维体系的派尔斯相变
聚乙炔中的π电子可以在相邻碳原子之间跃迁，因此π电子可以导电。但纯净的聚乙炔
中虽然与碱金属相似，有一个导电电子，却是绝缘体，电导率很小。只有掺入受主杂质
[缺电子体]或施主杂质[给电子体]，聚乙炔的电导率才会有大幅度的提高。
为什么聚乙炔与碱金属相同，每一个原子都有一个导电的电子却不能导电，是绝
缘体或半导体！这与它们空间结构的维度性差别有关：碱金属具有三维晶体结构，而聚
乙炔是一维体系。
一条普遍的物理规律是：具有一维结构的材料，即使每个电子都有导电的价电子，
也不能导电[更准确的是低温下不能导电]。
设一维体系的长度为L，其中有N个可以自由运动的电子，当电子运动时，设其动
量为P，波数K与P之间的关系是。用k=p/h表示,电子波函数也可以转化为用波数表达的
形式。当电子在长度为L的直链中运动时，其波函数要满足周期性的边界条件，即要求
在链的两端波函数要相等。根据这一条件得到波数K只能取分立值。
固体物理中常用K作为坐标轴来表示电子的运动状态，以K为坐标轴的空间称为K空
间，也可称为动量空间，对于一维空间 |
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m******a
发帖数: 476 | 16 二相性是因为位置(点粒子)和动量(平面波)是一组对偶量。
所有的对偶量之间都有二相性，不仅仅是波／粒。 这个和空间结构没有必然联系。 |
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m********e
发帖数: 1156 | 17 日期： 2013-05-27 信息来源： 工学院
近日，《物理评论快报》（Physical Review Letters）发表了陈十一课题组题为“三
维可压缩湍流的动能级串”（Cascade of Kinetic Energy in Three-Dimensional
Compressible Turbulence, Phys. Rev.Lett. 110, 214505,2013）的论文，报道了陈
十一课题组有关可压缩湍流中的能谱结构和能量级串机理的最新研究成果。该研究工作
在湍流与复杂系统国家重点实验室陈十一教授和北京大学应用物理与技术研究中心贺贤
土院士的联合指导下，由王建春博士、杨延涛博士等合作完成。论文链接：http://link.aps.org/doi/10.1103/PhysRevLett.110.214505
可压缩湍流广泛存在于各种工程应用和自然现象中，如超声速飞行器、受控热核反应、
高温燃烧流动、星系的形成和演化等。近年来，高马赫数可压缩湍流的流动机理是湍流
研究的一个热点。在之前的研究成果基础上（Phys. Rev. Lett. 108, 214505,2012... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 18 说一点从量子态生成时空的基本思想
时空为何物，一直是千百年来人类迷惑不解的问题，从牛顿的绝对rigid时空到爱因斯
坦的仿射时空和黎曼时空结构，都是对时空特性的描述而没有涉及时空的本质。
时空的结构就是要弄清楚为何我们会有平直的无引力的时空，为何又会有在物质能量分
布时的弯曲的时空。空间的结构（距离，面积，体积）是什么决定的，时间又是被什么
确定的，为何我们的宇宙膨胀，为何我们有热力学上单向的时间箭头，我们的时间是均
匀流逝的么？
量子信息的研究为解决时空本质问题提供了新的思路，简单的说，就是时空是量子态结
构生成的，是量子态空间的信息分布模式和量子态的复杂度造成的。
观点一： 时空是靠纠缠建立的，纠缠是构建时空的粘合剂。如果只考虑时空的空间分
量，那么纠缠从两方面构建空间的结构，一个是距离，一个是面积。在量子信息生成时
空的图像中，距离是靠互信息决定的，就是两个系统之间的距离由二者的互信息描述，
互信息越大，距离越短，对于最大纠缠的系统，其距离为0. （这一点是有疑问的，因
为虫洞就是最大纠缠产生的，但虫洞不可穿越，所以这里面缺少了一个因素，就是复杂
度，复杂度会对距离有影响）。一个... 阅读全帖 |
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w*****r
发帖数: 239 | 19 问题在于细菌DNA分子是否是想象的纯平直的环，如果其自身形成二级
甚至三级结构，就有可能由相对较小的蛋白分子调控较大的区间，多
cis-acting factor离得很远却密切相关也都市由于行成空间结构而造成
联系，由此想下去，是否在prokaryotic cell中存在DNA的高级结构到
是个很好的领域，老排可以试试 |
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g******e
发帖数: 492 | 20 大家如果看过比奥依*卡萨雷斯的小说，一定对宇宙的
多重性有所耳闻吧，复合的宇宙，眩晕，转瞬即逝的
爱情..........。
假设整个宇宙可以由统一的波函数来描述，psi(x,t,s,m,h,e...),
基本含义就是在时空的某一点具有内禀自由度的场函数，
(实物粒子是场的激发态)。由于空间结构的奇异性，导致
psi在复域上存在奇点，因而psi的相角将导致直接的动力学
效应。我们就象在复杂的黎曼面上，于是我们与其他世界的
区别就是在于我们是生活在不同的相空间中。
其它世界可以和我们一样用相同的时空坐标来刻划。比如
在眼前出现的这行字，在相同的空间中在多重的世界里被不同
的你赞赏着。你与那些与你相似的动物只能通过相空间的自发
破缺相联系。
我相信很多人都有过这种经历，这种感觉"似曾相识"的时候，
那就是宏观破缺的一种直观体验。 |
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w*********a
发帖数: 156 | 21 实在对不起，是我表达有问题。
这四个点没有空间结构上的关系，我本来说是正方形纯粹是为了叙述的。
我想知道的是第四个点上的值，而不是第四个点的位置
你也可以想象这四个点就是四个随机变量，他们的mean和互相的covariance知道，
那么知道三个点的取值，对于第四个点应该也知道了部分的有用信息， 比如它的
conditional variance应该没有原来的variance大了。
我想知道的是有没有一套理论是研究这种类型的问题的
谢谢回复啊，呵呵 |
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d******e
发帖数: 7844 | 22 大师啊，你以为这世间上除了随机模型之外，没有别的模型了？
蛋白质空间结构，是典型的拓扑问题，经常用图论和几何来分析。
系统生物学，很多都涉及到力学模型，用偏微分方程来描述，甚至涉及到大量的有限元
计算
。
序列的frequency pattern查找，大量的算法问题。
还有很多问题只是用了最简单的统计工具来做预处理，核心问题都不使用统计模型来解
决。
比如Gene network，网络构建可能依靠一些简单的统计工具，比如Coexpression
Network,
但是核心分析工具涉及大量的网络拓扑。
大师啊，你真是无知者无谓的典型代表啊。
异。 |
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p********a
发帖数: 5352 | 23 ☆─────────────────────────────────────☆
Dreamer1122 (MX) 于 (Sat Aug 13 18:04:55 2011, 美东) 提到:
Biostatistics is the analysis of biological data using statistical
mathematics.
Bioinformatics is the analysis and processing of biological data sets,
particularly very large ones like the type generated by the human genome
project or gene chips. The volume of information from these modern
techniques is absolutely massive and so searching that information for data
that is relevant to your particula... 阅读全帖 |
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m***f
发帖数: 1622 | 24 他的BLUE BRAIN PROJECT要变成整个欧洲的human brain project了
你恐怕不知道吧！
到时可能有很多美国这边的huamn connectome project的实验室参与其中，最后可
能形成一个全球合作性的大项目。
但美国这边的human connectome project已经开始很多年，所以里面是合作还是竞争会
有些纠葛。
皮层的三维空间结构，以及皮层与皮层间的功能链接，没有N个实验室联合协作，是不
可能的。
--以上消息并不完全确定,含有小道消息 |
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m***f
发帖数: 1622 | 25 他的BLUE BRAIN PROJECT要变成整个欧洲的human brain project了
你恐怕不知道吧！
到时可能有很多美国这边的huamn connectome project的实验室参与其中，最后可
能形成一个全球合作性的大项目。
但美国这边的human connectome project已经开始很多年，所以里面是合作还是竞争会
有些纠葛。
皮层的三维空间结构，以及皮层与皮层间的功能链接，没有N个实验室联合协作，是不
可能的。
--以上消息并不完全确定,含有小道消息 |
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x***u
发帖数: 6421 | 26 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: ntkrnl (ntkrnl), 信区: Military
标 题: 《中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定》全文
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 15 06:50:59 2013, 美东)
新华社北京11月15日电 中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定
(2013年11月12日中国共产党第十八届中央委员会第三次全体会议通过)
为贯彻落实党的十八大关于全面深化改革的战略部署，十八届中央委员会第三次全体
会议研究了全面深化改革的若干重大问题，作出如下决定。
一、全面深化改革的重大意义和指导思想
(1)改革开放是党在新的时代条件下带领全国各族人民进行的新的伟大革命，是当代
中国最鲜明的特色。党的十一届三中全会召开三十五年来，我们党以巨大的政治勇气，
锐意推进经济体制、政治体制、文化体制、社会体制、生态文明体制和党的建设制度改
革，不断扩大开放，决心之大、变革之深、影响之广前所未有，成就举世瞩目。
改革开放最主要的成果是开创和发展了中国特色社会主义，为社会主义现代化建设提
供了强大动... 阅读全帖 |
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y***y
发帖数: 4957 | 27 http://www.oc.org/gb_txt/oc0064/lifescienceforum2-leafhuang.htm
遥想当年池塘中
文/黄力夫 文
达尔文进化论里最大的一个假设，就是进化是随机的。但是，在地球短短的40几亿年的历
史中，能随机产生这麽复杂的进化吗？我们来看一个简单的例子：
活不下去的细菌
设想在地球某地方有一个火山。火山附近有个小池塘，池塘里有一些很简单的像细菌一样
的单细胞生物，一直在随机地突变。有一天，火山突然爆发，池塘的温度一下升高了摄氏
40度。请问，在这个筛选的机会中，池塘里的细菌，存活的机率有多大？
我们知道，高温导致细胞死亡的原因，是因为生物体的蛋白质会变性。蛋白质是一个氨基
酸所组成的高分子，它在细胞里存在的状态不是一条直线，而是缠起来像个毛线团。这个
毛线团看起来很混乱，但是它的三度空间结构是非常必要的，决定了这个蛋白的活性。
高温加热的结果，这毛线团就散开了。散开的毛线团是没有活性的。要这个毛线团在高温
下不散开，在原来没有化学键的地方，就必须要产生一个新的化学键。这就一定要有基因
上相应的序列改变，也就是生物学家所谓的突变。
现代生物学 |
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