b******n 发帖数: 4225 | 1 这个方法看起来很有意思,只是如果有的mutation primer没有annealing到template
strand上,那不就没突变成功么?
10个位点啊,我不相信能有100%的正确性
多少会有一些少于10个位点突变成功的
800
. |
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D*a 发帖数: 6830 | 2 那除了表型有无,也还要看表型严重程度才知道?
还是说30%的penetrance是说30%的后代表型完全突变,70%的完全野生型?
这个叫hypomorph?hypomorph的意思不是说100% 的后代有部分的减弱么?
如果是30%透出来的后代突变程度也不一样,那再加上另一个基因我感觉完全没办法分
析啊。。。 |
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g*****n 发帖数: 241 | 3 谢谢aardlbx,虽然我不太懂您提到的概率方面的解释,不过总体来说我想我大概明白
您的意思。
谢谢lotkaeuler11 以及您给的参考文献,可惜我是做经典遗传的,对数学理解有限,
以后如果这方面基础提高了的话再精读一下 :-)
谢谢Dua,我同意您说的“越复杂的物种调控机制也越复杂”,不过我这次想咨询的是
遗传领域一个比较常见的涉及双突变分析的问题,就是想了解一下通常出现这样的遗传
数据该怎么样去判断是否是同一个pathway,出于简单化的原因,我暂不考虑复杂的调
控机制。我对于两个null allele的双突变结果如何分析比较清楚,但对于两个weak
allele的分析就有点头疼。
谢谢shakuras,我也承认 “没啥两个基因是完全独立的”,但我研究的只是两个基因
的简单关系,而不是从高层面的整个调控网络的角度来研究。 |
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Z**********g 发帖数: 222 | 4 不是做遗传的,试着我的理解:
1. 由于是hypomorph,如果是synergistic,一种可能是a和b在同一pathway上,双突变
后有synergistic效果,另一种可能是不同pathway上,但两pathway彼此有正调控作用
,故双突变也有synergistic效果。
2. 如果a和b处在完全独立的pathway上,应该是additive效果。
3. 如果a和b处在两条pathway上,但彼此有负调控作用,估计就是40%的情况。
4. 30%的情况?a和b处在两条pathway上,但彼此有更复杂的负调控?估计a pathway能
较强的抑制b pathway? |
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b******n 发帖数: 4225 | 5 做过10kb的质粒点突变,赶进度做得不算很精细
土法上马
自己买的PfuUltra II HotStart Fusion DNA Polymerase(stratagene)和DpnI(NEB)
6个clone中2个成功突变了 |
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G******1 发帖数: 13 | 6 比如说知道一个gene promoter上有一个transcription factor的binding site,大概
长8bp,那要突变这8bp里的几个呢?还有怎么知道突变之后的序列不是另外一个
transcription factor的binding site呢? |
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j*****4 发帖数: 43 | 7 我们正在研究的一个课题发现一个基因有polymorphism,但离那个基因的3’端有几十
kb。这个polymorphism与该基因的表达有紧密关系(有些突变会高度上调这个基因的
mRNA和蛋白水平)。我所知道的polymorphism一般在基因的转录调控区域或外显子内含
子之类的,这样的话调控基因的表达比较解释得通。但在距3‘端这么远的
polymorphism怎么调节基因的mRNA水平我就不知道了。有没有可能是因为DNA的三级结
构受到突变的影响?或者是epigenetics的变化引起的?我没有genomic和epigenetic的
背景,诚心向大虾们求教~ 不胜感激~~~ |
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e********r 发帖数: 147 | 8 最近我们研究的一个病原细菌,突变掉一个铁转运蛋白(TonB dependent receptor)
,测出来细胞内的Fe浓度反而上升,遗传互补后也会恢复原水平。
这个结果倒确实是我们想看到的,因为和其它遗传、病理、调控的数据是一致的,彼此
间没有矛盾。特别是这个蛋白的突变会导致细菌致病力上升,说明它存在时会抑制细菌
对铁的吸收。
但奇怪的是,一般来说这类铁转运蛋白都是从外向里运,上面这个数据和以前的认识是
反的。这个故事怎么讲下去?大家给出出主意。 |
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d*p 发帖数: 534 | 9 P53突变的疫苗已经做了好几个临床试验了,这个能发NATURE, 一个是现在免疫治疗热
,第二个可能是metabolism也热吧。从scientific角度来说,没有太新的东西,从应用
角度来说,这个是大家都在做的,各种常见的突变,都会做成治疗性疫苗,这也是我们
正在做的,没想到他们还能发到NATURE。 |
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d*p 发帖数: 534 | 10 P53突变的疫苗已经做了好几个临床试验了,这个能发NATURE, 一个是现在免疫治疗热
,第二个可能是metabolism也热吧。从scientific角度来说,没有太新的东西,从应用
角度来说,这个是大家都在做的,各种常见的突变,都会做成治疗性疫苗,这也是我们
正在做的,没想到他们还能发到NATURE。 |
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V******t 发帖数: 444 | 11 比如,我感兴趣a, b, c, d四个基因,有没有数据库,包含很多测序,能方便地查找她
们在哪些癌症里面突变的?
再比如,我感兴趣A, B, C, D癌症,怎么知道,他们各自的Top10突变基因是什么?
多谢! |
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e********r 发帖数: 147 | 12 A和B的突变体都是删除突变体,所以是null mutation.
A把受体B的信号识别区降解掉,这个结果是完全抑制了B的激酶活性。
不知有何建议? |
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m********2 发帖数: 317 | 13 利用crispr-cas9 system使一个基因失去功能是一个最广泛的应用,但是反过来可以吗
? 即修复基因功能,比如一些cancer是由于单基因突变引起的,应用crispr-cas9
system能否修复这个突变呢?
如果可以的话,对少血液类肿瘤会有一定的应用前景。 |
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x********e 发帖数: 35261 | 14 cancer之类的是累积性突变,难修复
如果是有易感基因突变,倒是可以早期修复 |
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g*******g 发帖数: 45 | 15 在一个细胞系里发现TP53突变,可基因表达还是很高(>1000)。如果P53是抑癌基因,其
突变应该相当于去掉这个蛋白的功能,那么基因表达应该很低才对。
有没有高人指点下,
谢谢! |
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g*******g 发帖数: 45 | 16 在一个细胞系里发现TP53突变,可基因表达还是很高(>1000)。如果P53是抑癌基因,其
突变应该相当于去掉这个蛋白的功能,那么基因表达应该很低才对。
有没有高人指点下,
谢谢! |
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l***y 发帖数: 4671 | 17 突变导致功能丧失继而引发补偿性高表达是很常见的。
另外,凭什么突变就一定导致去掉蛋白质功能?凭什么蛋白质失去功能就一定导致表达
很低?建议回去复习一下生化课本。 |
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m*****z 发帖数: 1451 | 18 哪个突变?是那些hotspot吗?可能是突变体不能被MDM2降解,导致表达量增加。建议
看几篇P53 pathway的review,先有点常识认识吧 |
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e********r 发帖数: 147 | 19 因为项目需要,近期打算对一段基因序列做饱和突变分析,预计将要创建400-450个氨
基酸的定点突变(一次只变一个)。算下来工作量也不算大得不能完成,就算一个人一
个一个地做点突,估计1年左右也就全都能够获得。但好象显得有点儿笨,这么干有没
有什么高通量做点突的技术,既省时间又省精力的? |
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v**********8 发帖数: 1685 | 20 是要一个一个突变往WT上叠加,还是只是在WT上做很多点突变?如果是后者,为啥要一
个一个做一年才能做完?就算用最老土的办法,96孔板一板不就能做96个。。。 |
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发帖数: 1 | 21 以前的方法都是很繁琐的,需要大量的花费时间和经历去筛选那种没有random
integration并且两个拷贝同时被准确突变的细胞。该篇文章首次使用两个donor带有不
同的荧光,来鉴定双拷贝同时被突变的细胞。
Sci Rep. 2016 Dec 2;6:38198. doi: 10.1038/srep38198.
Improved bi-allelic modification of a transcriptionally silent locus in
patient-derived iPSC by Cas9 nickase.
http://www.nature.com/articles/srep38198 |
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s*********y 发帖数: 579 | 22 5月底,国际期刊《自然·方法学》刊登了CRISPR-Cas9技术会导致小鼠体内数百个非目
标突变的文章。在引起人们对有“基因魔剪”之称的基因编辑技术CRISPR脱靶性担忧的
同时,这一论文也遭到生物界广泛的批评,认为该发表论文存在实验设计不科学、数据
不充分等问题。
当地时间7月25日,《自然·方法学》就该篇论文发表编辑部关注,“以提醒读者关于
其数据解读的担忧”。
“由于对照组小鼠和接受CRISPR/Cas9编辑的小鼠的背景基因多样性差异不明确,出现
以上结果的另一种可能是正常的遗传多样性。”《自然·方法学》在“编辑部关注”中
引用了驳斥这一论文科学性的一方观点。
“我们在与提出质疑的团体和论文作者保持联系,进一步调查此事。调查一结束,我们
便会通知读者。所有作者均不赞同本期刊发表编辑部关注的决定。”《自然·方法学》
表示。
该论文的作者来自美国哥伦比亚大学医学中心等机构,论文题目为《体内CRISPR-Cas9
编辑引发的不可预测基因突变》。基因编辑指的是人为地对基因进行剔除、插入、修复
。论文称,两只接受CRISPR-Cas9编辑的小鼠的全基因组序列中出现的单核苷酸变化,
是CRI... 阅读全帖 |
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R********t 发帖数: 10 | 23 朋友父亲肺癌,查出有kras突变,请问现在美国对这种基因突变有哪些靶向药?
提前谢过各位的答复了🙏 |
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Q****r 发帖数: 7340 | 25 看出来没
渐变的都发展得不错,突变的,都是假的,其人民就不具备这个素质。这些都要长时间
慢慢改变的。 |
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H*********k 发帖数: 535 | 26 渐变的稳固,因为民众是经过启蒙的。突变的专制的影子还比较深。
韩国台湾日本来讲,日本稍好一点,韩国台湾还要有个过程。
中国的话,时间会更长,因为中国是东亚强化的专制制度的核心。
不管怎么说,从专制到民主共和是人类的必然趋势。 |
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m********y 发帖数: 21909 | 27 渐变到一定程度,就突变了。
中国的事情要看机遇和人,看看出个什么人吧。 |
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l**********e 发帖数: 3149 | 28 世界上民主化的过程有人分析过了,有一些国家是渐变,另外一些是突变。
渐变的国家启蒙运动时间长,革命流血多,那些国家和民族经历了整个民主制度的探索
期,人头滚滚,代价巨大。巨大的代价换来的是民智的开启和对民主的广泛接受,人们
之间达成了一种妥协,这种妥协即是公民与政府之间的妥协,也是每个人自身利益与其
他人利益的妥协。
二战后更多的民主国家的诞生,靠得是外来势力的干预和本国精英的引导。本国多数老
百姓自身并没有参与到民主化的过程当中,更多的人只是被动地接受了这个结果。靠这
个模式成功的很多亚洲国家,台湾日本南韩,马来西亚,以及最近的越南,局部的冲突
是有的,但大多数老百姓其实是坐享其成的受益者,其思想上并没有经历长时间的启蒙
,也没有参与民主制度的探索。
说有什么样的人民就有什么样的政府,或者具体说,中共专制政权是中国老百姓的选择
,这类说法是站不住脚的。民主制度是大势所趋,但在特定的政治环境和历史条件下,
什么时候由专制走向民主,以什么形式过度到民主,老百姓的选择是不重要的,因为老
百姓从来就不会也不可能用同一种声音表达自己的想法。 |
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s*****n 发帖数: 1636 | 29 英国伤残运动员斯塔尼福德患有罕见疾病“MDP综合症”,病因缘于单一基因突变,令
身体以为自己过重,即使进食超高热量食物,依然骨瘦如柴。也许“吃不胖”让许多减
肥人士羡慕,但斯塔尼福德自己却为此相当烦心 |
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i***s 发帖数: 39120 | 30 十八大军委突变,刘源出局
据明镜新闻出版集团旗下中共十八大人事报导与分析小组透露,中共十八届新军委人事,将会出现出乎人们意料之外的布局。原来由现任中共中央总书记、中央军委主席胡锦涛及其军队支持者所拟订的军委名单方案,基本上被推翻。在新的军委名单上,与胡锦涛关系接近的将领,只占了一席。而与薄熙来关系亲近、与胡锦涛也关系密切的前国家主席刘少奇之子、总后勤部政委刘源上将,很有可能已被排除在新的军委名单之外。
知情人士向明镜网透露,不少原来人们认为必将晋升进入军委的将领,榜上无名;而一些人们并不太熟悉的“黑马”,却纷纷冒升。
刘 源上将近几年来异常活跃,与前中央政治局委员、重庆市委书记薄熙来一唱一和。军队知情人士说,在今年年初王立军闯入美国总领馆事件发生后,刘源积极为薄熙来避免受到追究而奔走。直到薄熙来的哥哥薄熙成,向薄的支持者发出短信,告诉大家此事已经无可挽回,刘源才收手。一度沉寂之后,他又单独觐见胡锦涛,据称两人相谈甚欢。以至于关于刘源要进入新中央军委的传言,再度甚嚣尘上。甚至有人称,刘源获胡青睐,有可能接任中央军委副主席;最有可能的是升任总政治部主任,运气最差的话,也会由总后政委升任总后... 阅读全帖 |
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g***y 发帖数: 201 | 31 细胞跟细胞不一样你老知道么?
表皮细胞是会更新的。
绝大部分神经细胞是不会换的,一旦形成以后,死一个少一个的。
生殖细胞的precursor,至少在哺乳动物,在胚胎发育早期就跟体细胞分开了,就是说
哪些细胞会有潜力发展成生殖细胞很早就定下来了,这个不是我一拍脑袋就想出来的,
也不是你老不乐意相信就可以无视的,是经过很多诸如细胞标记追踪实验证明了的。这
就让拉马克的理论在细胞水平上很难解释了:既然生殖细胞系在出生前就定下来了,那
么后天获得的性状,如何去影响生殖细胞的基因组呢?
比如我们假设一只长颈鹿的脖子的确是可以拔长的,再闭眼假设脖子的细胞的DNA真的
可以被修饰,那么脖子的细胞们怎么去给生殖细胞通风报信呢?至少现在都没发现这个
机制,而大量的实验事实都支持不定向突变,定向选择的理论。 |
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v*****s 发帖数: 20290 | 32 太祖的思路其实是非常一贯和自恰的,你可以不认同,但要说他突变成愚蠢了,那只能
说明自己眼光水平太低。 |
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d******a 发帖数: 32122 | 33
老毛在搞破坏和整人方面,是一贯的英明神武
在经济上,是一贯的荒唐愚蠢
没什么突变 |
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s******6 发帖数: 748 | 34 和苏联没有关系,只是在那个时间点之前,毛的权力在党内是受到约束的,当时的决策
多少还有点民主集中制,在那之后,毛在底层人民心中的造神运动完成,毛的权力在党
内开始无法束缚。毛开始为所欲为。至于他本人应该是前后一致的,没有什么突变。他
发动文革的一个原因也是对党内过去的约束力量的一种发泄。 |
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p****t 发帖数: 11416 | 36 LZ的意思是人裸奔是一个基因偶然突变造成的,然后就因为有生存优势所以扩散了,
而不像前面大家说的是长期追羚羊选择出来的 |
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f**d 发帖数: 2494 | 37 进化都是基因偶然突变造成的,然后就因为有生存优势所以扩散了。 |
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h*****9 发帖数: 4028 | 38 举个例子,人类非常清楚感冒病毒或细菌产生突变和抗药性的原因。就是DNA/RNA
polyermase 干活的打个盹或被打个岔造成的复制错误么,可是谁又能不让它犯错哪? |
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p****t 发帖数: 11416 | 39 LZ的意思是不存在进化的中间阶段,直接突变成裸体,然后所有人都是
这个裸体猴的后代 |
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d*********t 发帖数: 4393 | 40
我觉得裸毛基因很可能只是一个无害的突变,并不一定对原始人的演化发展有正面的促
进。对人类演化最重要的是大脑或智力的发展,其它一些人类特有的基因都是依附于高
度发达的智力而在人体内保留下来。如果原始人的智力不够发达,不知道穿衣服,那么
裸体的原始人就不能扩散到寒冷的地方。如果原始人智力足够发达,有没有毛都无所谓
,不影响人类占领地球。 |
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d****z 发帖数: 9503 | 41 是渐变,不是突变。春秋里面小国被灭的很多。因为小,不出名而已。战国后期,就那
么几个剩下了,灭一个动静大。 |
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t*****n 发帖数: 1589 | 42 是渐变,比如晋从小国变成超级大国中间就灭了很过同姓国,郑国甚至一开始就以欺诈
手段灭了同姓胡国,上下陵替也是屡有发生,三家分晋是后人选了个标志性事件把这段
连续历史给分开了,当然春秋战国是有很大区别,但不是个突变。
周天子不封赵卫韩也无济于事,名分不是那么重要,早在西周晚期,就有诸侯国称王的 |
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b*****d 发帖数: 61690 | 44 德总理核能政策突变导致所在政党选举遭惨败
http://www.sina.com.cn 2011年03月29日01:55 新京报
在巴符州的选举,是基民盟历史上的分水岭。有关福岛核泄漏的讨论导致了我们今
天的失利……在日本发生这样的事情之后,我重新思考了我所处的位置,我对核电的态
度改变了。
———德国总理默克尔
综合新华社电 德国今年最重要的州选———巴登-符腾堡州议会选举27日举行。当
晚公布的初步计票结果显示,德国总理默克尔领导的基督教民主联盟(基民盟)遭遇惨败
,失去了在该州近58年的执政地位。
绿党获得该州组阁权
初步计票结果显示,基民盟得票率比2006年州选减少大约5个百分点,为39.0%;执
政伙伴自民党得票率比5年前下滑5个百分点,仅为5.3%,勉强超过进入州议会5%的门槛
;受益于反核政策,绿党得票率飙升12个百分点,达到24.2%。
按目前计票结果,绿党和社民党在州议会拥有的席位数已超过半数,首次在该州拥
有组阁权。
执掌巴符州已经58年
巴符州位于德国西南部,是人口大州和富州,戴姆勒、保时捷等汽车制造商总部所
在地。默克尔所属基民盟自1953年以来一直控制巴符... 阅读全帖 |
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v**e 发帖数: 8422 | 45 达赖已经逝世,北京已经着手西藏突变!(未证实,信息来源不清)
2012-02-10 09:53http://www.tpyjs.com/html/jqdm/2012/0210/1324.html
西藏要求干部以临战状态维稳
2012-02-11 09:24 西藏日报
本报拉萨2月8日讯 今天下午,自治区党委书记陈全国主持召开自治区党委常委会议,
传达学习中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林关于做好当前维护稳定工作的重要
指示精神。
自治区领导白玛赤林、郝鹏、杨金山、公保扎西、秦宜智、齐扎拉、董云虎出席会议。
陈全国首先转达了贾庆林主席对全区广大党员干部、各族人民群众以及爱国爱教僧尼的
亲切慰问和良好祝愿。陈全国说,贾庆林主席的重要指示既对自治区维稳工作给予充分
肯定,又对深入开展反对达赖集团分裂祖国活动的斗争、保持西藏社会的长治久安提出
了明确要求。充分体现了贾庆林主席对西藏工作的高度重视,为我们进一步做好西藏维
护稳定工作指明了明确方向、提供了强大动力,我们要以贯彻落实贾庆林主席的重要批
示精神为契机,全力抓好各项维稳措施的落实,牢牢把握反分裂斗争主动权,以西藏社
会大局和谐稳定的... 阅读全帖 |
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j*****8 发帖数: 3635 | 46 昨天刚听人讲这个,不过他说的是当妈的老一岁基因就会突变多少 |
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T**********e 发帖数: 29576 | 47
这个因为家庭父母岁数一般匹配,还真不好十分确定。这个论文的统计分析是父方年龄
和后代突变的有很强统计关联(p=3.33x10^-8),母方没有统计联系 (p=0.49)。 |
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c****h 发帖数: 4968 | 48 女儿一个比一个靓,90岁的澳门赌王表示突变压力不大。 |
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w*********g 发帖数: 30882 | 49 外蒙政局突变:收回蒙古大好时机到来
作者:zykaido / 时间:2012-04-17 09:15:11 / 来源:网络 外蒙古发生大事前
总统被捕:一场激烈的内战展开 www.junshijia.com 军情第一站 中广网北京4月14
日消息据中国之声《央广新闻》报道,蒙古国前总统恩赫巴雅尔13日早晨
外蒙古发生大事前总统被捕:一场激烈的内战展开 www.junshijia.com 军情第一站
中广网北京4月14日消息据中国之声《央广新闻》报道,蒙古国前总统恩赫巴雅尔
13日早晨6点左右在家中被捕,有电视台对此过程进行了直播。 转自米尔军情网 http://www.junshijia.com
13日,蒙古前总统恩赫巴雅尔被捕的过程中,属于蒙古人民革命党的媒体TV9电视
台直播现场实况。当时,大批警察和便衣警察包围了恩赫巴雅尔的家,并强行入内进行
逮捕。逮捕行动中,由于恩赫巴雅尔的保卫人员进行抵抗,警察朝天开枪示警。
当时有4名国家大呼拉尔议员以及蒙古人民革命党大批党员和支持者聚集在恩赫巴
雅尔家外进行保护。报道说,现场没有造成人员伤亡。恩赫巴雅尔是2009年卸任总统的
,目前... 阅读全帖 |
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u*****a 发帖数: 9489 | 50 【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: flycry (乞力马扎罗的雪), 信区: WaterWorld
标 题: 30岁以上的剩男基本是不能找的,基因已突变
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Mar 22 22:03:15 2015, 美东)
30岁其实也就是青年的中间段,在现代社会结婚与否早就不那么重要了,可是30岁
,果然是一个门槛吗?三十岁是男人而立之年,都说男人三十一朵花,但似乎并不是一
朵不带刺的花。
某女年近三十,老资格剩女一名,征战相亲市场数年后,她得出一个宝贵的结论:
正常年代的正常男人,只要不是演艺圈人士不是不婚主义,只要他还有人要,三十岁之
前,起码都结过一次婚了。
肯定有多名三十岁男人跳出来,指责这个结论不对:我就三十多了,我还没结婚,
我哪里不正常?但是你仔细想想,一个中国大陆的男人,不是在纽约不是在伦敦不是在
港台,三十岁怎么可能还没结婚?谁都知道成家立业的先后问题,在你三十岁能立起来
之前,就该有了个美满家庭。要不怎么说一个没结婚的男人,生意场上没有信誉?
我表哥今年正好三十,作为一名优秀男青年,他备受各年龄层次妇女喜爱。不... 阅读全帖 |
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