发帖数: 1 | 1 ►堆放在仓库中的VX毒剂。（资料图）
撰文 | 汤波（南方周末特约撰稿）
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VX毒剂由英国人在1952年首先发现，是目前毒性最强的神经毒剂，10毫克的VX即可致人
死亡，杀伤作用可持续几小时至几天。近些年来，科学家发现人血清中的丁酰胆碱酯酶
就是这种有机磷毒剂的特效解药，只不过这种解药在人体中存量极少，微乎其微。
2017年2月24日，马来西亚警方说，经过初步化验，13日死亡的朝鲜籍男子身上检测出
化学武器VX神经毒剂成分。这让全世界再次见识了这种有机磷神经毒剂的恐怖威力。作
为有机磷杀虫剂研发过程中的副产品，有机磷毒剂被发现能迅速侵入人体，破坏神经系
统功能，少量毒气即可导致中毒者死亡，成为杀人于无形的大规模杀伤性武器。幸运的
是，人体中竟然藏有这种神经毒气的解药，不过这种解药在人体中极其微量，人类还需
要寻找到新的技术来大量生产它，才可能免受神经毒气之苦。
可怕的神经毒剂
上世纪30年代，德国人在研制杀虫剂时，发现含有有机磷的杀虫剂杀虫效果非常好，开
发出一系列有机磷农药，成为应用最广泛、使用量最大的一类农药。
在研究杀虫剂同时，德国研究人员还意外发现，某... 阅读全帖 |
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m**********t
发帖数: 385 | 2 浙江西湖高等研究院坐落于中国浙江省杭州市西湖区，是一所由国家“千人计划”专家
以及其他顶尖人才领衔创建的新型非营利高端科研机构。研究院目前包括理学、前沿技
术、基础医学和生物学四个研究所，是一所以基础与前沿科学研究为核心，以博士生培
养为起点的高水平科研教学机构。现因发展需要，高研院诚邀海内外优秀科研平台管理
及技术人才加盟。
一、岗位职责及应聘要求：
1. 实验动物中心
1）主治兽医 招聘人数：1名
岗位职责：
a. 负责设施管理，日常运行, 和PI们及实验者沟通，了解需求，做到在满足实验需求
的基础上保障实验动物质量。
应聘要求：
a. 认同西湖大学理念，工作态度端正、吃苦耐劳，具有团队合作精神和服务意识，原
则性和责任心强，有良好的沟通能力；
b. 硕士及以上学历，生物学相关，有小鼠遗传学、兽医学经验者优先；
c. 善于沟通、思路清晰、认真负责、为人踏实、乐于服务；
d. 具有良好的团队合作精神，良好的独立工作及学习能力，积极上进。
2）胚胎操作技术员 招聘人数：1名
岗位职责：小鼠的生物净化、体外受精、精子和胚胎冷冻以及复苏。
应聘要求：
a. 生物学或医学相关专业毕业，硕... 阅读全帖 |
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f****6
发帖数: 4472 | 3 MALDI不错，你多学学用质谱做蛋白分析吧。磷酸化，糖基化和活性的关系什么的，药
厂要这样的人。 |
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m***y
发帖数: 14763 | 4 别幸灾乐祸啊。现在中国老年糖尿病比例也比得过日本了，再过二三十年，阿尔茨海默
也就追上了。
现在，基本上确认阿尔茨海默是蛋白质糖基化的后果。为了伢们，食堂也该停止打饭，
都瓜菜代。 |
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s**x
发帖数: 138 | 5 我研究一种蛋白.一个有趣的现象是: 该PROTEIN(NOT ENZYME) 有2种形式, 一种 有功能,
令一种没有.该蛋白55KD, 糖基化后分泌到细胞外, 分子量80KD.WESTERN BLOT只有一条带
.不可能通过酶切来调节功能.
我想解决为何该蛋白质有个有功能, 有的没有.查了很多资料, 一直没有看到先例.可能通
过磷酸化这样的方式来调节吗? 好象也没有办法分离这2种形式的蛋白. 到着里问问蛋白
专家, 有何建议. 有人知道同样的先例吗? 有说个不明白的地方,我再补充. 谢先. |
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O******e
发帖数: 4845 | 6 ☆─────────────────────────────────────☆
toptip (老君) 于 (Mon Dec 11 19:21:54 2006) 提到:
刚看到有人讨论做protein interaction。把我最近碰到的几个问题贴这里一下，跟很
多周围的人讨论了也说不出所以然，人多力量大，也许这里有朋友能指点一二。
1 一个蛋白western有两条特异的带，其中一条带是预测的分子量大小，另一条大35kd
。不可能是alternative splicing，不可能是alternative start codon；用DTT或H2O2
处理，条带不变；不可能是糖基化和sumolation。大家说说还可能是什么？
2 另一个蛋白用交联剂交联后从cell lysate纯化，除了自身的带之外有两条shift的带
。打质谱后大的shift条带里有一个已知的结合蛋白，小的shift 35kd，死活打不出新
的蛋白。大家解释一下？
3 做以上两个蛋白的gel filtration。 从第一个fraction到最后一个fraction都有这
两个蛋白分布，量还比较均匀。理论上 |
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s******e
发帖数: 1073 | 7 I got the following from the web, does these mean no specific
phosphorylation or no phosphorylation at all?
"在大肠杆菌中表达的蛋白由于缺少修饰和糖基化、磷酸化等翻译后加工，常形成包涵
体而影响表达蛋白的生物学活性及构象。" |
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n***g
发帖数: 5027 | 9 这个总结不错：
申请精华帖：我了解的Epigenetics牛人一览
我是从C.D.Allis，Danny Reinberg，Tony Kouzarides，Yi Zhang， Yang Shi这几个
人发的文章看起的，这几个人基本上就是目前做表观遗传最牛的一批人了。然后你看看
他们文章citation里面出现频率比较高的人名，那往往就是大牛了，然后一点一点扩展
。个人感觉看CNS及其子刊还是王道。另外推荐一个很好的网站，http://www.epidna.com/ 可以查这个领域最top的lab，也可以查该领域最新的论文。
# ^2 P/ }, _0 h" U8 m) P6 b
; l* o$ y- |- V5 g0 I0 T然后在申请选校的过程中，我也逐渐了解到一些
epigenetics领域的big names和rising stars。所以我感觉看各个牛校的faculty也是
了解一个领域的好学校好lab的方法。我的做法是每看一个学校，就把相关领域做
epigenetics的faculty留下来，然后以后看CNS时或者Journal club上看到熟悉的名字
，就重点关注下。$ ... 阅读全帖 |
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V***b
发帖数: 3419 | 10 有可能是糖基化了。你说说突变了什么，周边序列是什么。 |
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t****p
发帖数: 1504 | 11 我以前也曾看到类似现象，就是一个蛋白有两带，大的用genome sequence怎么解释都
不通，比预计的条带（小带）大20kd左右，后来用sumo，磷酸化啊，糖基化啊一一检测
过去，什么都不是，现在还是不知道什么原因。
还碰到一个情况是把内源蛋白交联，发现有多一条带，大20kd左右，以为交联到了新蛋
白，质谱打了两次，除了这个蛋白序列外没有其它的。问不少人，都说构象的变化导致
20kd的迁移从来没有出现过。迄今为止还没有很让我信服的解释。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 12 你们还在讨论这个啊。我来说一句，大家都在说突变了以后多修饰了，
这种可能性当然有，但是也不大。另一种可能性是突变以后少修饰了。比如
强负电的糖基化，正常蛋白虽然比较大，但是跑的快；突变蛋白少了这个修
饰，虽然小了，但是看起来更大 |
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C*******e
发帖数: 4348 | 13 学习了
谢谢
一直做原核的蛋白
对于posttranslational modification不熟：）
借问一下
如果一个蛋白怀疑有糖基化修饰
第一步该怎么验证呢？ |
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s******y
发帖数: 28562 | 14
糖基化的蛋白跑在一般的SDS-PAGE 里会成一条长长的拖带。
然后用糖水解酶处理之后拖带会消失。 |
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H****s
发帖数: 301 | 15 好孩子，你还是看了我推荐的那些人写的综述的。之所以bacterial display不行，是
因为能够functionally display在细菌表面的蛋白真是太少了。如果你用细菌表达过真
核蛋白，你应该会明白其中的难处。正确的蛋白折叠、可溶性、毒性对于bacterial
display来说是个很大的挑战。酵母不存在此等问题，但酵母的问题在于糖基化修饰。
保持联系吧，说不定以后我能帮你点小忙。 |
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d****h
发帖数: 4291 | 16 你也是老id了
估计是不做这一领域
前面有人说了，植物表达系统，弊端太多了
糖基化，磷酸化，酰胺化.......构象，折叠，任何一点都会影响蛋白活性
他表达出来的真的有没有用，他自己估计都不信
我老是趟过这个烂泥潭的人，这除了忽悠国家863的钱，坑死一代又一代的学生 |
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m**********2
发帖数: 6568 | 17 hehe, you never know. each protein is different. maybe he got lucky.
确实运气占很大成分。人类的知识现在不足以准确预测糖基化，磷酸化，酰胺化......
.构象，折叠 etc etc。在植物里表达，也许就有活性，也许就没有。有，你就发了。
没有，你就搭了。要是成功率高，谁还用动物细胞表达啊。但是，看看搞这一行的历史
，和现在的规模，就知道成功率是非常非常低的。但是哪，六和彩也总是有人中的。
you never know.
当然，话又说回来了。他这个估计是呼悠为主。可能性》99%。 |
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B****i
发帖数: 107 | 18 分子量好像大几K，
是一个膜蛋白， 比较容易糖基化， 但在E Coli系统里面应该不太可能
谢谢 |
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s******y
发帖数: 28562 | 19 恐怕不行。楼主说的是，必须先在ER里面被切了，糖基化了，然后再倒回来
进入细胞质。
我唯一知道的事例就是如果某个蛋白在ER里面折叠错了，有时候会被倒过来
放回细胞质进行降解。
天然的蛋白能够自动从ER倒回去的我还真没想到哪个。除非是某些病毒蛋白。 |
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w*******r
发帖数: 23 | 20 Cell经某drug treatment，跑SDS gel 发现目标蛋白shift到比原来小几个KD的位置。
现怀疑是此蛋白的phosphorylation或者glycosylation受到影响，所以想确定到底是哪
个过程被阻断。我想用phosphatase或者deglycosylation kit处理lysate，然后看是否
能重现shifted band。可是有可能dephosphorylation和deglycosylation都能得到与
drug处理后分子量类似的条带。有没有什么简单直接的方法能鉴定这个shift的条带？
希望板友们提供一些好的建议，万分感谢。 |
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b******y
发帖数: 627 | 21 "用phosphatase或者deglycosylation kit处理lysate" is an easy method already. |
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W****7
发帖数: 426 | 22 我觉得这个远没有你想像的“dephosphorylation和deglycosylation”那么简单，很多
修饰，或者构想改变都能引起shift。尤其你说有几个kD那么大的shift如果是
dephosphorylation的话这需要好多位点才能做到吧。 |
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W****7
发帖数: 426 | 23 不过还是那句话，想做就得试，永远都没有简单的东西。。。 |
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y******8
发帖数: 1764 | 24 IP first. The pan-phospho or glyco WB. Phosphatase and deglyco as controls.
Mass Spec would be the ultimate. |
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b******y
发帖数: 627 | 25 Phosphorylation causes protein running higher is not because of the extra
mass but because of the extra charge. It is common that one or two
phosphorylation sites can cause noticeable upper shift. |
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V***b
发帖数: 3419 | 26 这些蛋白的折叠不需要很多帮助吗？比如chaperone，lectin，folding enzymes...？
另外细胞质里的蛋白都没有二硫键，糖基化吗？
唉，大学课程没学好啊。 |
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b******y
发帖数: 627 | 27 Some proteins do need chaperone for folding and stability and there are
plenty in cytosol, for example, heat shock proteins. Protein surface
disulfide bonds are rare in cytosolic proteins although there are some in
interior of the proteins. 糖基化 is not that common for cytosolic proteins,
either. |
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i****g
发帖数: 426 | 28 学术界的一句名言是“发表或死亡”（publish or perish），意指科学家必须发表论
文，否则就要出局。那些在知名期刊发表大量有影响论文的科学家能获得很高的地位以
及大量基金资助。这种利益驱使已经将学术圈搅得不再纯洁，少数人为了获得竞争优势
不择手段，“学术不端”的案例能经常听到，最常见的就是剽窃他人成果。一些极端情
况下，有科学家甚至会蓄意破坏同事的研究工作。近日，《科学美国人》杂志总结了这
些极端案例。
资助被停，报复同事
不久前，美国西奈山医学中心（位于纽约曼哈顿，是美国最大的医学院附属医院之一）
博士后莫森·霍森卡尼遭到警方逮捕，被控犯有盗窃罪。霍森卡尼今年40岁，伊朗裔，
毕业于哈佛大学医学院，主要研究方向是心脏再生的分子机制。据其他同事介绍，去年
6月霍森卡尼的研究项目不幸被医院方面停掉，理由是研究进展太慢。另外，医院方面
还发现，他提供给院方的关于自身背景的信息“不可靠”。失去基金资助的霍森卡尼非
常恼怒，想到了疯狂报复他的同事，用恶劣手段破坏其实验工作。
受理此案的曼哈顿刑事法庭在法庭文件中说，去年7月1日，霍森卡尼展开了首次报复。
他偷偷溜进实验室，故意将对照... 阅读全帖 |
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u**********d
发帖数: 573 | 30 赞！
很好奇两点：
Fab是怎么进细胞的？如果是endocytosis干的，又是怎么从endosome释放到细胞质里的呢
Fab能不能和GFP做成嵌合蛋白？Fab的糖基化对其特异性影响大不大 |
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B****m
发帖数: 63 | 31 好文。很喜欢这些天版上对交叉学科的讨论，也学习了很多。看来要在这个学科做好，
还要打好很深的数理和计算功底。
我是做实验出身，还有很多数学的知识需要学习补充。根据楼上lotkaeuler11 的观点
，数学是超前于生物学科需要的，以至于癌症等研究领域要继续发展，才能到应用到群
论或泛函。
而我认为当前的数学或者计算工具是不够的。曾经跟一个数学出身，做生物计算的薄厚
聊过，他通过计算来预测蛋白修饰加工。我问他说，某个蛋白的修饰（糖基化，磷酸化
等）可能涉及到一些当前还不清楚的信号和细胞因子，他如何保证预测的准确性。他说
他无法验证预测是不是正确，因为他们不做实验，只计算。
个人认为，对于单变量或者少数变量的过程，便于建立数学模型。而对于涉及多变量的
过程，如病毒致病或者机体发育，则很难建立数学模型。但是生物学家采用数理和计算
工具肯定是将来的大方向，因为只有这样才能更深刻理解自己的数据，助于新发现。 |
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c***y
发帖数: 615 | 32 其实我最奇怪的是, M氧化是我们检测到的唯一的修饰.( 我这里两个体腔共检到241个
蛋白). 作为细胞外蛋白, 我还是期望看到一些糖基化什么的.
而且相同蛋白的相同peptide在不同的体腔的M氧化常有不同.这也是我在想是否应该仔
细比较一下这些不同......
了。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 33 跑歪倒不会，会越跑越宽， 每个空孔都要加上sample buffer。
多数蛋白都是梯度胶比较好，有些糖基化啥比较厉害的，可能普通胶好 |
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s********x
发帖数: 472 | 34 很常见的修饰，大部分是糖基化，也可能是连接了lipid。
蛋白比与其大0.5到一倍很常见。 |
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s****r
发帖数: 736 | 35 连夜把文章下了看了
其实就GLUT1而言，还有很多可以做。他们做了两个点突变，一个去糖基化，一个固定
了对内释放形态(inward-open confirmation)的结构。
撇去第二个点突变可能引发的争议不谈，就现在的的认知出发，其实更有趣的是对内型
和对外型的动态变化。虽然文章最后给了一个可能的模型，这个dynamic behavior, 我
个人看还能出篇cns。至少也会是NSMB. |
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r*****m
发帖数: 3619 | 36 最大的问题是还没有在四维时空上监控大分子的手段。即使有这个手段，计算一个细胞
的数据，就要全球的计算能力算几个月。
没有这些数据，根本没法提hypothesis，你总得看到一点迹象，然后去验证。
尤其是细胞膜的磷脂大分子，糖基化大分子，现在根本没有什么方法去研究这些分子在
干什么，和谁相互作用。
生物信号全是指数级别的放大，一个hormone 分子就让一个细胞天翻地覆。正反馈，负
反馈，多个loop 稳定调控，这些理论都有了很好的应用。 |
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s*****5
发帖数: 52 | 37 你好。我现在不负责仪器的维护和校正，因为lab有专门的人在做，老板觉得这样管理
比较reproducible. 而且我们的方法比较固定化，不做太多LC-MS方面方法的
development。我其实有相当一部分工作都是做high dimensional data的analysis,以
及后面的clustering之类的，我这种奇葩背景是不是很难找到工作呢？ lab有另一部分
工作做SRM/MRM定量的，是不是转到那个方面比较好呢？
re. PTM的问题，一点浅见：感觉很热门，但是PTM的很多文章都比较少有特别solid的
结论，characterize的居多吧。之前thermo的一个proteomics group的scientist说，
protein abundance都被研究烂了，key solution一定在PTM上，所以thermo投了很多钱
研究糖基化等修饰的新方法，所以也许是个新的趋势吧 |
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s*****5
发帖数: 52 | 38 你好。我现在不负责仪器的维护和校正，因为lab有专门的人在做，老板觉得这样管理
比较reproducible. 而且我们的方法比较固定化，不做太多LC-MS方面方法的
development。我其实有相当一部分工作都是做high dimensional data的analysis,以
及后面的clustering之类的，我这种奇葩背景是不是很难找到工作呢？ lab有另一部分
工作做SRM/MRM定量的，是不是转到那个方面比较好呢？
re. PTM的问题，一点浅见：感觉很热门，但是PTM的很多文章都比较少有特别solid的
结论，characterize的居多吧。之前thermo的一个proteomics group的scientist说，
protein abundance都被研究烂了，key solution一定在PTM上，所以thermo投了很多钱
研究糖基化等修饰的新方法，所以也许是个新的趋势吧 |
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B***v
发帖数: 113 | 39 所以所有可能的氨基酸序列都可能被糖基化？
难道不是NxS/T motif？ |
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c******n
发帖数: 16403 | 41 http://www.sciencetimes.com.cn/m/user_content.aspx?id=276163
CNS顶尖刊物撤稿名单
1/Science/ 美国一组科学家在最新一期《科学》杂志上刊登撤稿声明，宣布将他们200
4年发表在《科学》上的一篇高被引论文撤销。这篇论文描述了一种新型蛋白质糖基化方
法，通讯作者为美国斯克里普斯研究所的Peter Schultz。论文作者称他们无法重复实验
结果，记录了原初实验细节的实验室笔记也不知所踪。
2/Current Biology/《当代生物学》杂志2007年发表的一篇论文近日被原作者撤销。该
论文称查明了一个维持果蝇健康细胞活性的特定基因。撤销声明说，撤销的原因是，用
作分离基因活性的遗传模型以及后来的遗传交叉（genetic cross）存在错误。
3/Nature Genetics/《自然—遗传学》2003年发表的一篇关于癫痫的论文近日被撤销，
原因是发现了一些明显的错误，否定了原研究的主要发现。
4/Stem Cells and Development/以英国纽卡斯尔大学Karim Nayernia为首的英德两国科
学 |
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l*********1
发帖数: 351 | 42 觉着他做小分子药物糖基化做得还不错的，这两年怎么突然没什么动静了。求内幕。 |
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q****0
发帖数: 282 | 43 http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/201
发酵工程对于我国国民经济建设、国家产业转型升级发展以及国家可持续发展，都具有
举足轻重的地位和作用，同时它也是国家科技发展中长期规划所明确指出的有关生物技
术产业化发展的关键内容。目前，发酵工程已成为一个学科跨度很大的学科，特别是随
着生命科学的发展，发酵工程的内涵也发生了巨大变化，它已成为一个以针对生命为特
征的、多学科交叉的前沿性学科。华东理工大学生物工程学院的张嗣良教授就是这样一
位杰出的发酵工程科学技术专家。50多年来他一直奋战在科研和教学的第一线，在发酵
工程事业上不断创新，为我国的发酵工程事业做出了突出贡献。
精诚所至 铸就辉煌
1963年，张嗣良以优异成绩毕业于我国第一个抗生素制造专业——华东化工学院抗
生素制造工学专业。他曾先后担任华东化工学院化学合成制药教研组主任，华东化工学
院制药厂厂长兼总工程师，华东化工学院生化工程研究所所长，华东理工大学生物工程
学院副院长、教授，华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室副主任，国家生化工
程技... 阅读全帖 |
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q****0
发帖数: 282 | 44 http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/201
发酵工程对于我国国民经济建设、国家产业转型升级发展以及国家可持续发展，都具有
举足轻重的地位和作用，同时它也是国家科技发展中长期规划所明确指出的有关生物技
术产业化发展的关键内容。目前，发酵工程已成为一个学科跨度很大的学科，特别是随
着生命科学的发展，发酵工程的内涵也发生了巨大变化，它已成为一个以针对生命为特
征的、多学科交叉的前沿性学科。华东理工大学生物工程学院的张嗣良教授就是这样一
位杰出的发酵工程科学技术专家。50多年来他一直奋战在科研和教学的第一线，在发酵
工程事业上不断创新，为我国的发酵工程事业做出了突出贡献。
精诚所至 铸就辉煌
1963年，张嗣良以优异成绩毕业于我国第一个抗生素制造专业——华东化工学院抗
生素制造工学专业。他曾先后担任华东化工学院化学合成制药教研组主任，华东化工学
院制药厂厂长兼总工程师，华东化工学院生化工程研究所所长，华东理工大学生物工程
学院副院长、教授，华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室副主任，国家生化工
程技... 阅读全帖 |
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o*****y
发帖数: 699 | 45 11101433 彭君 中南大学 “补丁”马氏过程
及其相关问题的研究 A0110 青年科学基金项目 22
2012-1-1 2014-12-31
2 11101434 徐勇 中南大学 无限时滞随机泛
函微分方程及其在种群动力系统中的应用 A011003 青年科学基金项目
22 2012-1-1 2014-12-31
3 11101435 周岳 中南大学 三类常数项恒等
式的数学机械化研究 A0116 青年科学基金项目 22
2012-1-1 2014-12-31
4 11102239 李地元 中南大学 ... 阅读全帖 |
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u**********d
发帖数: 573 | 46 要看其它的修饰是不是要对MS的结果进行一次专门的search？比如根据特定氨基酸残基
的理论分子量的变化。
好多糖基化的情况是多糖，可能还带分支，MS来分析的话，样品是不是要经过特殊的处
理，数据分析是不是有不同？去年来看到好几次糖蛋白组的文章在MCP上面，你有兴趣
可以去参考一下。
不同体腔的氧化程度差异这个问题挺有意思，不过M的氧化是不是最好的检测方式呢？
氧化差异如果单指用氧分子来氧化的情况的话，就可能受氧含量的影响，也可能受氧化
酶的含量以及活性的影响。 |
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