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Biology版 - 几位统计科班能不能帮大伙一个忙
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请教一个简单的数据统计问题统计问题,同样是两组数据比较,anova和t-test的p value不一样
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话题: 统计话题: sas话题: regression话题: theory话题: measure
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1 (共1页)
y***i
发帖数: 11639
1
sgu2000, repast, DaShagen, Dggg和其他大拿,能不能简单说一下
1. 你以前统计专业学习了哪几门重要课程,用到哪几本教科书
2. 你认为哪些课程尤其重要
3. 认为哪些方法、概念在现在的研究中尤其重要(比如这次讨论的multiple comparis
on, ttest),分别是什么研究
4. 哪些软件,编程非常实用,值得一学。
你们要是能提供这些信息,对很多人(包括我)是帮了个大忙。这两天见到一些概念的
深入讨论,获益匪浅,感到的确需要更扎实的系统学习才行。
g*******f
发帖数: 427
2
确实是
我打算给你们一人送一笼包子
f********n
发帖数: 6465
3
不是说F2都转了统计,统计成了继生物之后,有一个被中国人毁掉的专业吗?
h******e
发帖数: 1791
4
我不是大拿,我试着回答你的问题:
1. 你以前统计专业学习了哪几门重要课程,用到哪几本教科书
regression,interpretation of data,design of experiment,他们讨论的内容不超
过这几门的范围。没教科书,用笔记+wikipedia+google过的考试。
2. 你认为哪些课程尤其重要
以上几门再加上inference和基础的probability and statistics。
3. 认为哪些方法、概念在现在的研究中尤其重要(比如这次讨论的multiple
comparison, ttest),分别是什么研究
推荐一本书:intuitive biostatistics,作者是出prism的那家公司老板。或者看看
statistics in prism就行了,这是一个手册似的文件,从prism主页可以down到。
4. 哪些软件,编程非常实用,值得一学。
学统计的一般用r或sas,但不是学统计的话用prism就挺好。
D******n
发帖数: 2836
5

很多,11门,
基础课当然是probablility 和 statistical inference, 应用的当然就是,linear
regression。
comparis
regression,anova,design of experiments.
SAS and/or R

【在 y***i 的大作中提到】
: sgu2000, repast, DaShagen, Dggg和其他大拿,能不能简单说一下
: 1. 你以前统计专业学习了哪几门重要课程,用到哪几本教科书
: 2. 你认为哪些课程尤其重要
: 3. 认为哪些方法、概念在现在的研究中尤其重要(比如这次讨论的multiple comparis
: on, ttest),分别是什么研究
: 4. 哪些软件,编程非常实用,值得一学。
: 你们要是能提供这些信息,对很多人(包括我)是帮了个大忙。这两天见到一些概念的
: 深入讨论,获益匪浅,感到的确需要更扎实的系统学习才行。

D******n
发帖数: 2836
6
此外,对于anova和regression还有DOE, 这本书最经典,囊括很多重要问题。
http://www.amazon.com/gp/product/007310874X/ref=pd_lpo_k2_dp_sr_3?pf_rd_p=48
6539851&pf_rd_s=lpo-top-stripe-1&pf_rd_t=201&pf_rd_i=0256117365&pf_rd_m=ATVP
DKIKX0DER&pf_rd_r=0927RBD5STY2YC9VFE0Q

【在 D******n 的大作中提到】
:
: 很多,11门,
: 基础课当然是probablility 和 statistical inference, 应用的当然就是,linear
: regression。
: comparis
: regression,anova,design of experiments.
: SAS and/or R

D**g
发帖数: 739
7
Here you can find some very useful info. After go through all teh note, you
will be a DANIU too.
http://openwetware.org/wiki/BMJ_Statistics_Notes_series
Another useful website:
http://www.ats.ucla.edu/stat/
y***i
发帖数: 11639
8
多谢多谢。

【在 h******e 的大作中提到】
: 我不是大拿,我试着回答你的问题:
: 1. 你以前统计专业学习了哪几门重要课程,用到哪几本教科书
: regression,interpretation of data,design of experiment,他们讨论的内容不超
: 过这几门的范围。没教科书,用笔记+wikipedia+google过的考试。
: 2. 你认为哪些课程尤其重要
: 以上几门再加上inference和基础的probability and statistics。
: 3. 认为哪些方法、概念在现在的研究中尤其重要(比如这次讨论的multiple
: comparison, ttest),分别是什么研究
: 推荐一本书:intuitive biostatistics,作者是出prism的那家公司老板。或者看看
: statistics in prism就行了,这是一个手册似的文件,从prism主页可以down到。

y***i
发帖数: 11639
9
多谢,和hehehe说的差不多。

念的

【在 D******n 的大作中提到】
: 此外,对于anova和regression还有DOE, 这本书最经典,囊括很多重要问题。
: http://www.amazon.com/gp/product/007310874X/ref=pd_lpo_k2_dp_sr_3?pf_rd_p=48
: 6539851&pf_rd_s=lpo-top-stripe-1&pf_rd_t=201&pf_rd_i=0256117365&pf_rd_m=ATVP
: DKIKX0DER&pf_rd_r=0927RBD5STY2YC9VFE0Q

y***i
发帖数: 11639
10
不想转统计,只想理解得多点,不要太皮毛。

【在 f********n 的大作中提到】
: 不是说F2都转了统计,统计成了继生物之后,有一个被中国人毁掉的专业吗?
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y***i
发帖数: 11639
11
不错不错。很多书国内也找得到下载,不过这个比较系统。

you

【在 D**g 的大作中提到】
: Here you can find some very useful info. After go through all teh note, you
: will be a DANIU too.
: http://openwetware.org/wiki/BMJ_Statistics_Notes_series
: Another useful website:
: http://www.ats.ucla.edu/stat/

b********n
发帖数: 673
12
统计的Ph.D.还是不容易的。

【在 f********n 的大作中提到】
: 不是说F2都转了统计,统计成了继生物之后,有一个被中国人毁掉的专业吗?
b********n
发帖数: 673
13
不是大拿,回答一下:

30 courses
2. 你认为哪些课程尤其重要
stat inference, multivariate,datamining, measure theory,linear regression,
stochastic process, stochastic differential equation.
comparis
MLE,shrinkage method(like lasso, ridge etc),SVM, linear regression and
generalized linear model
R/SAS/Minitab/Stata/Matlab

【在 y***i 的大作中提到】
: sgu2000, repast, DaShagen, Dggg和其他大拿,能不能简单说一下
: 1. 你以前统计专业学习了哪几门重要课程,用到哪几本教科书
: 2. 你认为哪些课程尤其重要
: 3. 认为哪些方法、概念在现在的研究中尤其重要(比如这次讨论的multiple comparis
: on, ttest),分别是什么研究
: 4. 哪些软件,编程非常实用,值得一学。
: 你们要是能提供这些信息,对很多人(包括我)是帮了个大忙。这两天见到一些概念的
: 深入讨论,获益匪浅,感到的确需要更扎实的系统学习才行。

r****t
发帖数: 10904
14
不是科班,更不是大拿,我学过的多半这儿的都学过。

没学过概率,听学过的说用 grimmet & stirzaker。概率是学统计时恶补的。
不是统计专业的,跟着学过 1 门统计,主要用 casella & berger,还有大家都用的
furguson 那本薄的经典。other texts:
asymptotic theory (regularity conditions on MLE's consistency) 用的是笔记;
resampling 用 efron 1981 paper/1982 booklet, shao & tu 1995;
EM 用 mcLachlan book. C.f. Wu 1982 paper for convergence results.
monte carlo 用了 berger 的一本不过根本没时间读,
还有一堆补充的 text 没时间看记不得名字了,直接用笔记学的。
就一门,只好这门重要了。
comparison, ttest),分别是什么研究
除了前面人说的, 方法上 jackknife/bootstrap, EM 都很重要。st

【在 y***i 的大作中提到】
: sgu2000, repast, DaShagen, Dggg和其他大拿,能不能简单说一下
: 1. 你以前统计专业学习了哪几门重要课程,用到哪几本教科书
: 2. 你认为哪些课程尤其重要
: 3. 认为哪些方法、概念在现在的研究中尤其重要(比如这次讨论的multiple comparis
: on, ttest),分别是什么研究
: 4. 哪些软件,编程非常实用,值得一学。
: 你们要是能提供这些信息,对很多人(包括我)是帮了个大忙。这两天见到一些概念的
: 深入讨论,获益匪浅,感到的确需要更扎实的系统学习才行。

y***i
发帖数: 11639
15
多谢多谢太详细了。 我应该说大侠而不是大拿,害得现在每个人都先声明一下不
是大拿 :)

念的

【在 r****t 的大作中提到】
: 不是科班,更不是大拿,我学过的多半这儿的都学过。
:
: 没学过概率,听学过的说用 grimmet & stirzaker。概率是学统计时恶补的。
: 不是统计专业的,跟着学过 1 门统计,主要用 casella & berger,还有大家都用的
: furguson 那本薄的经典。other texts:
: asymptotic theory (regularity conditions on MLE's consistency) 用的是笔记;
: resampling 用 efron 1981 paper/1982 booklet, shao & tu 1995;
: EM 用 mcLachlan book. C.f. Wu 1982 paper for convergence results.
: monte carlo 用了 berger 的一本不过根本没时间读,
: 还有一堆补充的 text 没时间看记不得名字了,直接用笔记学的。

g**********t
发帖数: 475
16
我觉得Casella的那本书不适合生物背景的初学者看,有点难。我给大家推荐我看过的
一本书:probability and statistics by DeGroot。这本书直觉表述比较好,相对也
比较严密(不是严格意义上的数学严密,大概相当于微积分教材的那种严密性)
b********p
发帖数: 875
17
Applied Multivariate Statistical Analysis (5th Ed.) by Richard A. Johnson
and Dean W. Wichern
向量统计。这本书没有特别追求数学上的深度,而是以通俗易懂的方式讲述主要的基本
概念,读起来很舒服,内容也很实用。
K****n
发帖数: 5970
18
俺,默默地心仪这一套

regression,

【在 b********n 的大作中提到】
: 不是大拿,回答一下:
:
: 30 courses
: 2. 你认为哪些课程尤其重要
: stat inference, multivariate,datamining, measure theory,linear regression,
: stochastic process, stochastic differential equation.
: comparis
: MLE,shrinkage method(like lasso, ridge etc),SVM, linear regression and
: generalized linear model
: R/SAS/Minitab/Stata/Matlab

r****t
发帖数: 10904
19
这一套已经不仅仅是统计了。

【在 K****n 的大作中提到】
: 俺,默默地心仪这一套
:
: regression,

b********p
发帖数: 875
20
学了30个courses........
一般stat phd也就上3年课, 大哥你每年上10门统计课阿...

【在 b********n 的大作中提到】
: 不是大拿,回答一下:
:
: 30 courses
: 2. 你认为哪些课程尤其重要
: stat inference, multivariate,datamining, measure theory,linear regression,
: stochastic process, stochastic differential equation.
: comparis
: MLE,shrinkage method(like lasso, ridge etc),SVM, linear regression and
: generalized linear model
: R/SAS/Minitab/Stata/Matlab

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b********n
发帖数: 673
21
我是非名校生物Ph.D.,毕业以后在统计系混。我们是quarter制,所以课比较多。

【在 b********p 的大作中提到】
: 学了30个courses........
: 一般stat phd也就上3年课, 大哥你每年上10门统计课阿...

b********n
发帖数: 673
22
还都在统计的范畴内,生物方面其实随机过程是很常用的。推荐first course in
stochastic process,统计的stat inference最好还是有一些测度的基础比较好,stat
inference 推荐theory of point estimation,Datamining方面推荐Elements in
statistical learning.侧度论还是推荐probability path,比较容易读懂,别的书太难
了,而且用不上。SAS推荐 a little SAS book.

【在 r****t 的大作中提到】
: 这一套已经不仅仅是统计了。
d*******a
发帖数: 518
23
非常敬仰

【在 b********n 的大作中提到】
: 不是大拿,回答一下:
:
: 30 courses
: 2. 你认为哪些课程尤其重要
: stat inference, multivariate,datamining, measure theory,linear regression,
: stochastic process, stochastic differential equation.
: comparis
: MLE,shrinkage method(like lasso, ridge etc),SVM, linear regression and
: generalized linear model
: R/SAS/Minitab/Stata/Matlab

r****t
发帖数: 10904
24

一直不明白 SAS 的书和 SAS document比起来,到底多了些什么东西?不知道从哪儿检
了本,翻着觉得很垃圾,都后悔拿回来。
随机的入门课还有不用 greg lawler 的?i thought that was the default text. "
first course" could be a little too old. measure theory 没学过,觉得太基础了
,对 stochastic calculus更有用,转金融的应该学。

【在 b********n 的大作中提到】
: 还都在统计的范畴内,生物方面其实随机过程是很常用的。推荐first course in
: stochastic process,统计的stat inference最好还是有一些测度的基础比较好,stat
: inference 推荐theory of point estimation,Datamining方面推荐Elements in
: statistical learning.侧度论还是推荐probability path,比较容易读懂,别的书太难
: 了,而且用不上。SAS推荐 a little SAS book.

d*******a
发帖数: 518
25
嗯这本身我也喜欢
简单易懂。

【在 b********p 的大作中提到】
: Applied Multivariate Statistical Analysis (5th Ed.) by Richard A. Johnson
: and Dean W. Wichern
: 向量统计。这本书没有特别追求数学上的深度,而是以通俗易懂的方式讲述主要的基本
: 概念,读起来很舒服,内容也很实用。

b********n
发帖数: 673
26
可能你是大侠,和一般人水平不一样,不过,SAS little book 是我知道比较系统和比
较基础的入门书。当然,牛仁布需要这样的书。
measure theory是统计系里所有课中最难的一门,甚至很多统计系的faculty都交不了
这门课。不过,这门课室必须的,不然决大部分的统计理论都很难懂。随机很重要,而
且很难懂,不过,很多neural信号传导的模型都是随机的。

【在 r****t 的大作中提到】
:
: 一直不明白 SAS 的书和 SAS document比起来,到底多了些什么东西?不知道从哪儿检
: 了本,翻着觉得很垃圾,都后悔拿回来。
: 随机的入门课还有不用 greg lawler 的?i thought that was the default text. "
: first course" could be a little too old. measure theory 没学过,觉得太基础了
: ,对 stochastic calculus更有用,转金融的应该学。

r****t
发帖数: 10904
27
我捡到的不是你推荐的那本。
我连 measure theory 都不懂,怎么称大侠。随机也只学了半本,快还给老师了。
measure thoery 学概率的应该学,学统计的不一定吧。

【在 b********n 的大作中提到】
: 可能你是大侠,和一般人水平不一样,不过,SAS little book 是我知道比较系统和比
: 较基础的入门书。当然,牛仁布需要这样的书。
: measure theory是统计系里所有课中最难的一门,甚至很多统计系的faculty都交不了
: 这门课。不过,这门课室必须的,不然决大部分的统计理论都很难懂。随机很重要,而
: 且很难懂,不过,很多neural信号传导的模型都是随机的。

s*r
发帖数: 2757
28
so you are claiming Stat masters do not actually understand stat because
they do not learn measure theory

【在 b********n 的大作中提到】
: 可能你是大侠,和一般人水平不一样,不过,SAS little book 是我知道比较系统和比
: 较基础的入门书。当然,牛仁布需要这样的书。
: measure theory是统计系里所有课中最难的一门,甚至很多统计系的faculty都交不了
: 这门课。不过,这门课室必须的,不然决大部分的统计理论都很难懂。随机很重要,而
: 且很难懂,不过,很多neural信号传导的模型都是随机的。

s*******2
发帖数: 499
29
Casella的统计推断不涉及测度论,是一本经典的入门书。国内有些高校,非统计专业
本科或者硕士统计课就用的是这本书。

【在 g**********t 的大作中提到】
: 我觉得Casella的那本书不适合生物背景的初学者看,有点难。我给大家推荐我看过的
: 一本书:probability and statistics by DeGroot。这本书直觉表述比较好,相对也
: 比较严密(不是严格意义上的数学严密,大概相当于微积分教材的那种严密性)

s*******2
发帖数: 499
30
Sheldon Ross的introduction to probability models也是一本很常见的随机过程入门书。

【在 r****t 的大作中提到】
: 我捡到的不是你推荐的那本。
: 我连 measure theory 都不懂,怎么称大侠。随机也只学了半本,快还给老师了。
: measure thoery 学概率的应该学,学统计的不一定吧。

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K****n
发帖数: 5970
31
差点儿成我committee,据说人挺nice

书。

【在 s*******2 的大作中提到】
: Sheldon Ross的introduction to probability models也是一本很常见的随机过程入门书。
c******d
发帖数: 306
32
这本书不能算入门书吧。要吃透不是那么容易。课后题目还是很难的,很多科班出身的
,作起来也比较费力。
当然,如果你是牛人,可能小菜一叠。

【在 s*******2 的大作中提到】
: Casella的统计推断不涉及测度论,是一本经典的入门书。国内有些高校,非统计专业
: 本科或者硕士统计课就用的是这本书。

r****t
发帖数: 10904
33
IMO, stochastic process has to be taught after some basic knowledge of
measure theory. For this reason this book is usually used for undergraduate
courses.

门书。

【在 s*******2 的大作中提到】
: Sheldon Ross的introduction to probability models也是一本很常见的随机过程入门书。
r****t
发帖数: 10904
34
It is the default text for statistics in master level, easier than what the
professors wish, but difficult enough to give a good training.
Usually the book is easier than what is taught in the class. My professor was
quite a hard stone, teaching beyond the supplement/appendix of this book, e.
g. "regularity condition" in MLE's consistency proof, etc etc. I understood
nothing in the two weeks when he talked about it, feeling lucky that i might
not have to understand it like those stats ph.d.s...

【在 c******d 的大作中提到】
: 这本书不能算入门书吧。要吃透不是那么容易。课后题目还是很难的,很多科班出身的
: ,作起来也比较费力。
: 当然,如果你是牛人,可能小菜一叠。

r****t
发帖数: 10904
35
... Why is he not on your committee, then?

【在 K****n 的大作中提到】
: 差点儿成我committee,据说人挺nice
:
: 书。

K****n
发帖数: 5970
36
找了个更牛的,呵呵

【在 r****t 的大作中提到】
: ... Why is he not on your committee, then?
n*****n
发帖数: 3123
37
bso啊

【在 K****n 的大作中提到】
: 找了个更牛的,呵呵
n*****n
发帖数: 3123
38

这个furguson 那本薄的经典,能说下具体的书名吗?多谢

【在 r****t 的大作中提到】
: 不是科班,更不是大拿,我学过的多半这儿的都学过。
:
: 没学过概率,听学过的说用 grimmet & stirzaker。概率是学统计时恶补的。
: 不是统计专业的,跟着学过 1 门统计,主要用 casella & berger,还有大家都用的
: furguson 那本薄的经典。other texts:
: asymptotic theory (regularity conditions on MLE's consistency) 用的是笔记;
: resampling 用 efron 1981 paper/1982 booklet, shao & tu 1995;
: EM 用 mcLachlan book. C.f. Wu 1982 paper for convergence results.
: monte carlo 用了 berger 的一本不过根本没时间读,
: 还有一堆补充的 text 没时间看记不得名字了,直接用笔记学的。

D*a
发帖数: 6830
39
记了一大堆书名打算慢慢看,新人再问众大侠个菜问题:
还是想继续搞生物,应该先看哪几本入门的书阿?
1 (共1页)
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关于SEM和SD的争议ttest的提问
请问高手们一个统计学问题microarray 统计问题
请教一个microarray基因选出多少合适的问题问个初级统计问题
请教大家个问题关于ttest请教:microarray的false negative
请教一个简单的数据统计问题统计问题,同样是两组数据比较,anova和t-test的p value不一样
我就抛砖引玉了吧如何算P value?
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