m****n
发帖数: 1066 | 1 R language,windows XP
用 FILE menu的（source R code....）打开一个script(saved in C:///...My
Documents)
却总是出现错误信息，
Error in setwd(dirIn) : cannot change working directory
这个怎么回事？
最后我 open script,,, 然后run all 打开了脚本。
但是 source r code 为什么不行呢？ |
c******d
发帖数: 306 | 2 set ur work pathway to the folder where the source code is. |
m****n
发帖数: 1066 | |
m****n
发帖数: 1066 | 4 did not work.
Thanks.
Anyway, I can load scripts by other means. |
l*h
发帖数: 4124 | 5 verify the directory exist, use full directory path. for example,
setwd("d:\\my_directory")
【在 m****n 的大作中提到】
: did not work.
: Thanks.
: Anyway, I can load scripts by other means.
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k********e
发帖数: 448 | |
l*h
发帖数: 4124 | 7 or make sure "dirIn" is defined.
【在 m****n 的大作中提到】
: R language,windows XP
: 用 FILE menu的（source R code....）打开一个script(saved in C:///...My
: Documents)
: 却总是出现错误信息，
: Error in setwd(dirIn) : cannot change working directory
: 这个怎么回事？
: 最后我 open script,,, 然后run all 打开了脚本。
: 但是 source r code 为什么不行呢？
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l*h
发帖数: 4124 | |
m****n
发帖数: 1066 | 9 Thanks, guys. Another question.
....怎么找exact match 呢？....
比如说1000个gene ID, 想找“ACTB", "LACTB"不算match。
# This is not working!!!
应该怎么找exact match呢？ |
c******d
发帖数: 306 | 10 suppose you have data set, named array.
you want to find all rows, which have gene ID="ACTB"
just array[geneID=="ACTB",] |
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m****n
发帖数: 1066 | 11 我还在入门阶段，
怎么用 grep 和 charmatch 拿到和array相同的结果呢？
Thanks. |
c******d
发帖数: 306 | 12 没看到具体data,真的很难说.贴一个data的图片上来看看就一目了然了 |
l*********s
发帖数: 5409 | 13 能走出这么条非主流的转业本身就很有传奇色彩，Joe Wang值得我们骄傲 |
l*h
发帖数: 4124 | 14 grep 是直接搬来的Unix命令，看Unix/Linux里的解释更好懂
【在 m****n 的大作中提到】
: 我还在入门阶段，
: 怎么用 grep 和 charmatch 拿到和array相同的结果呢？
: Thanks.
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m****n
发帖数: 1066 | |
m****n
发帖数: 1066 | 16 > genes<- c("ACTB","LACTB", "ACTBCC", "AC-TB", "ACTB$")
> grep("ACTB", genes)
[1] 1 2 3 5
> grep("^ACTB$", genes)
[1] 1 |
D******n
发帖数: 2836 | 17 grep(paste('^',Ctrl,'$',sep=''),genes)
ACTB
【在 m****n 的大作中提到】
: > genes<- c("ACTB","LACTB", "ACTBCC", "AC-TB", "ACTB$")
: > grep("ACTB", genes)
: [1] 1 2 3 5
: > grep("^ACTB$", genes)
: [1] 1
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m****n
发帖数: 1066 | |
D******n
发帖数: 2836 | 19 u should have asked it in stat board.
【在 m****n 的大作中提到】
: so smart.
: Thanks.
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l*******d
发帖数: 101 | 20 Alternatively,
> genes<- c("ACTB","LACTB", "ACTBCC", "AC-TB", "ACTB$")
> which (genes=="ACTB")
[1] 1
> Ctrl = "ACTB"
> which (genes==Ctrl)
[1] 1 |
m****n
发帖数: 1066 | 21 Thanks a lot.
我一直觉的生物系人才最多，所以在这里问。 |
