d*******e 发帖数: 10 | |
s**e 发帖数: 1523 | 2 我觉得应该还有。我的一位朋友在做PCP方面的,在筛新的下游基因。还有两个是做
cell adhesion相关的,做和beta catenin相关的一些东西。具体的不是很清楚,不过
申请到了funding。 |
T****r 发帖数: 4006 | |
c*********r 发帖数: 1312 | 4 我LP说这个通路是万金油,好多领域都能和它扯上那么点儿关系。
我们实验室做海胆和海葵的胚胎早期发育中体轴的建立和胚层分化,主要就是Wnt/beta
-catenin和Wnt/PCP这两个通路。现在好像PCP比较热门,和cilia、细胞极性、体轴发
育、果蝇的单眼和翅膀的毛,高等动物内耳毛的发育等等基础问题有关,又和cystic
kidney disease等疾病相关。。。 |
s**e 发帖数: 1523 | 5 PCR在二十年前是很火很火的。。。现在已经消退了很多了。 |
p**i 发帖数: 3525 | 6 海胆和海葵那个进化早一点?
beta
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我LP说这个通路是万金油,好多领域都能和它扯上那么点儿关系。 : 我们实验室做海胆和海葵的胚胎早期发育中体轴的建立和胚层分化,主要就是Wnt/beta : -catenin和Wnt/PCP这两个通路。现在好像PCP比较热门,和cilia、细胞极性、体轴发 : 育、果蝇的单眼和翅膀的毛,高等动物内耳毛的发育等等基础问题有关,又和cystic : kidney disease等疾病相关。。。
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P****d 发帖数: 564 | |
a*****n 发帖数: 2835 | 8 差不多吧,总是很多水文,很多文章都是在瞎掰捣乱
【在 P****d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : ms添乱的比解决问题的多。
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w******n 发帖数: 168 | 9 不过wnt主要的component基本都发现了 就像Nusse同学今年NAS了一样
剩下的像PCP好像主要component也发现的差不多了
像wnt在传统发育学 在果蝇 线虫 斑马鱼 fogg的role基本都比较清楚了
但是关键是“老药新用”比如当时Zou yimin做出来在axon guidance中的作用
或者在synaptic genesis的作用
或者除了体轴发育这种粗调作用外 在local environment中niche的微调作用
我觉得还是很有搞头
beta
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我LP说这个通路是万金油,好多领域都能和它扯上那么点儿关系。 : 我们实验室做海胆和海葵的胚胎早期发育中体轴的建立和胚层分化,主要就是Wnt/beta : -catenin和Wnt/PCP这两个通路。现在好像PCP比较热门,和cilia、细胞极性、体轴发 : 育、果蝇的单眼和翅膀的毛,高等动物内耳毛的发育等等基础问题有关,又和cystic : kidney disease等疾病相关。。。
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c*********r 发帖数: 1312 | 10 海葵早一些。
【在 p**i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 海胆和海葵那个进化早一点? : : beta
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c*********r 发帖数: 1312 | 11 说道微调,刚看了篇文章说Wnt pathway和cell cycle相关,LRP S1490在G2/M期被
CDK14/Cyclin Y磷酸化导致Beta-catenin富集,还是挺有意思的。wnt和细胞周期、纺
锤体、centrosome、oriented cell division等等等等都能扯上点关系。。。
另外,Wnt的主要components基本上发现的差不多了,但不同的条件下哪些蛋白参与了
,怎么参与了还不清楚。比如海葵海胆早期发育(很早很早)时wnt pathway是激活的
,但似乎不需要Wnt ligand的参与;比如LRP、dishevelled等有那么多磷酸化位点,具
体怎么被磷酸化的,还不是很清楚。。。
【在 w******n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 不过wnt主要的component基本都发现了 就像Nusse同学今年NAS了一样 : 剩下的像PCP好像主要component也发现的差不多了 : 像wnt在传统发育学 在果蝇 线虫 斑马鱼 fogg的role基本都比较清楚了 : 但是关键是“老药新用”比如当时Zou yimin做出来在axon guidance中的作用 : 或者在synaptic genesis的作用 : 或者除了体轴发育这种粗调作用外 在local environment中niche的微调作用 : 我觉得还是很有搞头 : : beta
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p**i 发帖数: 3525 | 12 那个好养?
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 海葵早一些。
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p**i 发帖数: 3525 | 13 确切吗: 海葵海胆早期发育(很早很早)时wnt pathway是激活的,但似乎不需要Wnt
ligand的参与
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 说道微调,刚看了篇文章说Wnt pathway和cell cycle相关,LRP S1490在G2/M期被 : CDK14/Cyclin Y磷酸化导致Beta-catenin富集,还是挺有意思的。wnt和细胞周期、纺 : 锤体、centrosome、oriented cell division等等等等都能扯上点关系。。。 : 另外,Wnt的主要components基本上发现的差不多了,但不同的条件下哪些蛋白参与了 : ,怎么参与了还不清楚。比如海葵海胆早期发育(很早很早)时wnt pathway是激活的 : ,但似乎不需要Wnt ligand的参与;比如LRP、dishevelled等有那么多磷酸化位点,具 : 体怎么被磷酸化的,还不是很清楚。。。
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c*********r 发帖数: 1312 | 14 海葵好养。海胆很少有养的,都是买来产一次卵就不用了。。。
【在 p**i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 那个好养?
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p**i 发帖数: 3525 | 15 Caltech 的一个大牛专做海胆,前一阵来作报告,有些好奇
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 海葵好养。海胆很少有养的,都是买来产一次卵就不用了。。。
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c*********r 发帖数: 1312 | 16 Eric Davidson吧。海胆领域的超级大牛了!提到Gene regulatory networks就不得不
提他啊!
【在 p**i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Caltech 的一个大牛专做海胆,前一阵来作报告,有些好奇
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p**i 发帖数: 3525 | 17 他到底有多牛?
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Eric Davidson吧。海胆领域的超级大牛了!提到Gene regulatory networks就不得不 : 提他啊!
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c*********r 发帖数: 1312 | 18 他70多岁了,思维敏捷依旧,sea urchin领域第一权威吧。Caltech的人应该更有发言
权,我只是了解一点点,造句用词可能不太恰当,如有不实还请原谅。。。标志性事件
之一是他2002年在science上发表了“the first real scale gene regulatory
network (including about 50 genes)”,对gene regulatory networks (GRN)理论
的发展贡献颇多,经常在顶级杂志上灌水,《The Regulatory Genome》发行了第二版
。现在做sea urchin的大多数都是他的徒子徒孙了。现在的lab很大,很多博后,很多
都在做cis regulatory elements相关的研究。
【在 p**i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 他到底有多牛?
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c*********r 发帖数: 1312 | 19 是我目前见过的publication最多的PI。。。
【在 p**i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 他到底有多牛?
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a***e 发帖数: 1010 | 20 why not create your own direction, instead of jump in something that has
been studied for such a long time?
Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt
pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself. |
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x**w 发帖数: 112 | 21 Eric Davidson
reductionism 的死忠拥趸
Gene tools的最有价值客户 (他实验室至少订过几千条 Morpholino)
不知道什么时候他画的那些“电路图”能在数学上被解释。。。
发信人: ppri (ppri), 信区: Biology
标 题: Re: wnt 通路还有得做没?
发信站: BBS 未名空间站 (Sat May 1 13:45:58 2010, 美东)
他到底有多牛? |
c*********r 发帖数: 1312 | 22 有道理啊,真希望咱也能搞出个新方向
【在 a***e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : why not create your own direction, instead of jump in something that has : been studied for such a long time? : Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt : pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself.
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H******e 发帖数: 100 | 23 Nature. 2010 Apr 22;464(7292):1143-8. Epub 2010 Apr 7.
Generation of a novel wing colour pattern by the Wingless morphogen.
Werner T, Koshikawa S, Williams TM, Carroll SB.
我觉得Sean Carroll的这篇文章很有意思。 |
P****d 发帖数: 564 | 24 好漂亮的照片。是什么?
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 海葵早一些。
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O******e 发帖数: 4845 | 25 Wnt pathway在iPS中的作用被人发了没有?
【在 a***e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : why not create your own direction, instead of jump in something that has : been studied for such a long time? : Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt : pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself.
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c*********r 发帖数: 1312 | 26 谢谢,海胆16细胞时候in situ hybridization的图。DAPI染核,红色的是in situ的信
号,merge。但是这个是sense strand probe,应该是用来做control的,结果却有信号
,老板不信,结果没用。。。
【在 P****d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 好漂亮的照片。是什么?
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c*********r 发帖数: 1312 | 27 那几个factor里有Wnt相关的吗?
【在 O******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Wnt pathway在iPS中的作用被人发了没有?
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t*d 发帖数: 1290 | 28 Roeland Nusse was just elected to National Academy of Sciences.
WNT pathway in stem cell is just becoming hot, I think.
【在 a***e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : why not create your own direction, instead of jump in something that has : been studied for such a long time? : Until you are doing some other biological phenomena and come cross wnt : pathway, it is meaningless to focus on this pathway itself.
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a***e 发帖数: 1010 | 29 If you jumped in wnt pathway now and one day Nusse got a noble prize, you
will have contribute a lot but can't share the prize.
However, if you are the first one to apply iPS in clinics, you will have a
a much better chance to get the noble prize yourself.
【在 t*d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : Roeland Nusse was just elected to National Academy of Sciences. : WNT pathway in stem cell is just becoming hot, I think.
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O******e 发帖数: 4845 | 30 谷了一把,貌似已经很多相关研究了。
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 那几个factor里有Wnt相关的吗?
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c*********r 发帖数: 1312 | 31 isi了一把,只有6篇。都是2009年的。其中第二篇给了个阴阳regulator的说。。。
对iPS不熟,纯属看热闹。
有一点我一直在想,胚胎早期的细胞具有全能性,其实就是胚胎干细胞。在胚胎发育早
期决定性作用的factors,应该也是对干细胞的维持、分化等起作用。那么Wnt相关的一
些基因也应该在iPS中有重要作用吧,毕竟wnt在早期胚胎发育中不可或缺。
难道是因为Wnt的终端Beta-catenin只是transcriptional coactivator而不是
transcription factor。。。那位知道Yamanaka最初有没有做Wnt相关的基因啊?他都
是做的transcription factor吗?
【在 O******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 谷了一把,貌似已经很多相关研究了。
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O******e 发帖数: 4845 | 32 估计是有人试了,可惜没组合成功。
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : isi了一把,只有6篇。都是2009年的。其中第二篇给了个阴阳regulator的说。。。 : 对iPS不熟,纯属看热闹。 : 有一点我一直在想,胚胎早期的细胞具有全能性,其实就是胚胎干细胞。在胚胎发育早 : 期决定性作用的factors,应该也是对干细胞的维持、分化等起作用。那么Wnt相关的一 : 些基因也应该在iPS中有重要作用吧,毕竟wnt在早期胚胎发育中不可或缺。 : 难道是因为Wnt的终端Beta-catenin只是transcriptional coactivator而不是 : transcription factor。。。那位知道Yamanaka最初有没有做Wnt相关的基因啊?他都 : 是做的transcription factor吗?
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g*r 发帖数: 2116 | 33 信号通路这种东西 就像是物理里面的理想状态
只要你愿意做 永远有的做
【在 d*******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 有没有了解这个领域的,能否指点一下?
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d****u 发帖数: 1553 | 34 那个海胆做完实验能吃吗?要是能吃我申请去他们实验室。最爱吃海胆了 |
c*********r 发帖数: 1312 | 35 如果再加上Wnt和其它信号通路的cross talk的话,可研究的东东还真不少。。。 |
c*********r 发帖数: 1312 | 36 你都是怎么吃啊?推荐一下吧。我唯一一次吃海胆是在国内,海胆炒饭,可能做得不地
道,感觉一般。
在日式的饮食里,听说uni(发音wūni?)是比较贵而其比较好的一种海胆卵。wiki了
一把:“In Japan, sea urchin is known as uni (ウニ?), and can retail for as
much as $450/kg”。所以有几次我们刚拿到新鲜的海胆卵,一个日本博后拿个移液器
洗了两百微升,打到嘴里了。。。有人录像为证。
我们用的海胆都是野生的,有公司潜水到海底捞的。实验只用注射点KCl刺激肌肉收缩
把卵或精子出来。然后那些海胆就不用了。这样的话其实那些海胆可以食用吧。我们一
个学期积累一箱海胆。。。海胆死后被腐蚀之后的壳也很漂亮。
【在 d****u 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 那个海胆做完实验能吃吗?要是能吃我申请去他们实验室。最爱吃海胆了
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a****d 发帖数: 1919 | 37 I believe that beta-catenin is one of his 24(or a different number)
transcription factors for the first iPS induction experiment.It turned out
that beta-catenin is not the necessary one for iPS as we learned now.
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : isi了一把,只有6篇。都是2009年的。其中第二篇给了个阴阳regulator的说。。。 : 对iPS不熟,纯属看热闹。 : 有一点我一直在想,胚胎早期的细胞具有全能性,其实就是胚胎干细胞。在胚胎发育早 : 期决定性作用的factors,应该也是对干细胞的维持、分化等起作用。那么Wnt相关的一 : 些基因也应该在iPS中有重要作用吧,毕竟wnt在早期胚胎发育中不可或缺。 : 难道是因为Wnt的终端Beta-catenin只是transcriptional coactivator而不是 : transcription factor。。。那位知道Yamanaka最初有没有做Wnt相关的基因啊?他都 : 是做的transcription factor吗?
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d****u 发帖数: 1553 | 38 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃,不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看,弄
熟了吃绝对是浪费,一定要吃生
的,新鲜海胆。我没直接打开吃过,都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道
,绝了,我一般都是稍微沾一点点
青芥和酱油,往嘴里一放,软软滑滑的,好吃啊!说到这里我自己的口水都出来了。
as
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 你都是怎么吃啊?推荐一下吧。我唯一一次吃海胆是在国内,海胆炒饭,可能做得不地 : 道,感觉一般。 : 在日式的饮食里,听说uni(发音wūni?)是比较贵而其比较好的一种海胆卵。wiki了 : 一把:“In Japan, sea urchin is known as uni (ウニ?), and can retail for as : much as $450/kg”。所以有几次我们刚拿到新鲜的海胆卵,一个日本博后拿个移液器 : 洗了两百微升,打到嘴里了。。。有人录像为证。 : 我们用的海胆都是野生的,有公司潜水到海底捞的。实验只用注射点KCl刺激肌肉收缩 : 把卵或精子出来。然后那些海胆就不用了。这样的话其实那些海胆可以食用吧。我们一 : 个学期积累一箱海胆。。。海胆死后被腐蚀之后的壳也很漂亮。
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y**s 发帖数: 6809 | 39 。。。。。。。。
海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃,不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看,弄
熟了吃绝对是浪费,一定要吃生
的,新鲜海胆。我没直接打开吃过,都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道
,绝了,我一般都是稍微沾一点点
青芥和酱油,往嘴里一放,软软滑滑的,好吃啊!说到这里我自己的口水都出来了。
as
【在 d****u 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃,不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看,弄 : 熟了吃绝对是浪费,一定要吃生 : 的,新鲜海胆。我没直接打开吃过,都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道 : ,绝了,我一般都是稍微沾一点点 : 青芥和酱油,往嘴里一放,软软滑滑的,好吃啊!说到这里我自己的口水都出来了。 : : as
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d****u 发帖数: 1553 | 40 c-myc是wnt的target gene吧
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 那几个factor里有Wnt相关的吗?
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c*********r 发帖数: 1312 | 41 Good to know. Thanks!
【在 a****d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : I believe that beta-catenin is one of his 24(or a different number) : transcription factors for the first iPS induction experiment.It turned out : that beta-catenin is not the necessary one for iPS as we learned now.
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c*********r 发帖数: 1312 | 42 那你赶快申请去Davidson实验室吧,我们的海胆都是从加州寄过来的。
【在 d****u 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃,不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看,弄 : 熟了吃绝对是浪费,一定要吃生 : 的,新鲜海胆。我没直接打开吃过,都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道 : ,绝了,我一般都是稍微沾一点点 : 青芥和酱油,往嘴里一放,软软滑滑的,好吃啊!说到这里我自己的口水都出来了。 : : as
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c*********r 发帖数: 1312 | 43 下次我一定试一下!LP在旁边威胁我下次一定要带回来几只。。。
【在 d****u 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 海胆这玩意爱吃的人觉得特别爱吃,不爱吃得一点都不爱吃。但是从我得尝试来看,弄 : 熟了吃绝对是浪费,一定要吃生 : 的,新鲜海胆。我没直接打开吃过,都是吃的寿司店的刺身。但是新鲜海胆的那个味道 : ,绝了,我一般都是稍微沾一点点 : 青芥和酱油,往嘴里一放,软软滑滑的,好吃啊!说到这里我自己的口水都出来了。 : : as
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c*********r 发帖数: 1312 | 44 wiki了一下,“Myc is activated upon various mitogenic signals such as Wnt,
Shh and EGF (via the MAPK/ERK pathway).”看来Wnt比较上游。在胚胎发育里也是。
可能太上游的信号通路不会“直接”诱导细胞。。。(也许长期来看有可能?也许还更
多能一些??)
【在 d****u 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : c-myc是wnt的target gene吧
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c*********r 发帖数: 1312 | 45 不好意思,刚看到你的帖子。这个问题我没有深究过,只是附和老板和前辈们的结论。
在海胆和海葵中,Wnt pathway被激活的地方,以beta catenin作为marker,是
gastrulation的地方。我们实验室以前的数据显示,Wnt ligand不是localized。但是
Wnt pathway中的dishevelled在卵细胞甚至更早就localize在植物极,而且是必需的。
据说Wnt ligands的knock down都没有明显的表现性缺陷但是老板的文章里Dishevelled
下调后影响胚胎发育。不知道这些信息是否够证明Wnt ligands不参与早期的这些事件
。。。
早期的胚胎发育有些独特,是从一个巨大的单细胞开始的,和之后的多细胞的体系有所
不同吧。
Wnt
【在 p**i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 确切吗: 海葵海胆早期发育(很早很早)时wnt pathway是激活的,但似乎不需要Wnt : ligand的参与
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d****u 发帖数: 1553 | 46 这个wnt信号在发育中的作用在很多阶段都有报道,有时候是促进发育,有时候又是促
进分化。各个实验室都在灌水。还有
经典和非经典信号。所以具体Wnt信号到底起到什么做用还是很多人都在做,而且还不
是能发个好文章什么的。
Dishevelled
【在 c*********r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 不好意思,刚看到你的帖子。这个问题我没有深究过,只是附和老板和前辈们的结论。 : 在海胆和海葵中,Wnt pathway被激活的地方,以beta catenin作为marker,是 : gastrulation的地方。我们实验室以前的数据显示,Wnt ligand不是localized。但是 : Wnt pathway中的dishevelled在卵细胞甚至更早就localize在植物极,而且是必需的。 : 据说Wnt ligands的knock down都没有明显的表现性缺陷但是老板的文章里Dishevelled : 下调后影响胚胎发育。不知道这些信息是否够证明Wnt ligands不参与早期的这些事件 : 。。。 : 早期的胚胎发育有些独特,是从一个巨大的单细胞开始的,和之后的多细胞的体系有所 : 不同吧。 :
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d****u 发帖数: 1553 | 47 beta-catenin单独是没有转录活性的,严格来说是个转录激活因子,必须和TCF/LEF结
合才有转录活性。
【在 a****d 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : I believe that beta-catenin is one of his 24(or a different number) : transcription factors for the first iPS induction experiment.It turned out : that beta-catenin is not the necessary one for iPS as we learned now.
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