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Biology版 - 求助 IMAGE J
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相关话题的讨论汇总
话题: image话题: fiji话题: nis话题: imagej话题: confocal
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L****S
发帖数: 76
1
那位大虾用过 image J 分析 nikon 的confocal 图像? 我以前用的是一款德国的
CONFOCAL 显微镜,图像是.lsm 格式。但是最近适用 nikon 的confocal C1, 图像是.
ids 格式, 但是 image J 却无法打开这个格式。 求大虾帮助。
m*******y
发帖数: 16
2
下载bio format插件,拷贝到imagej的plugin目录下即可
http://www.loci.wisc.edu/software/bio-formats

是.

【在 L****S 的大作中提到】
: 那位大虾用过 image J 分析 nikon 的confocal 图像? 我以前用的是一款德国的
: CONFOCAL 显微镜,图像是.lsm 格式。但是最近适用 nikon 的confocal C1, 图像是.
: ids 格式, 但是 image J 却无法打开这个格式。 求大虾帮助。

p*******r
发帖数: 4048
3
get fiji

是.

【在 L****S 的大作中提到】
: 那位大虾用过 image J 分析 nikon 的confocal 图像? 我以前用的是一款德国的
: CONFOCAL 显微镜,图像是.lsm 格式。但是最近适用 nikon 的confocal C1, 图像是.
: ids 格式, 但是 image J 却无法打开这个格式。 求大虾帮助。

L****S
发帖数: 76
4
感谢mammothcy (mammoth), 你的方法很好用。现在我可以用IMAGE J 打开.ids 的图
片并作ORTHOGONAL VIEWS。
我不太懂puppeteer (舟云) 的方法,不过还是要谢谢你。
我还有一个问题, 今天NIKON 的技术服务给我们展示了NIS Viewer (NIS ELEMENTS
RESOURCE CENTER)http://www.nis-elements.com/resources-downloads.html。 这个软件是专为NIKON 设计的, 可以打开.ids,但是却无法打开.lsm。 其实我对NIS Viewer 不太敢冒,但是我老板被NIS Viewer的volume view 功能吸引了,这个程序可以把Z 轴 图像用360 度旋转的方式展现出来。老板希望我能用IMAGE J 做出同样的效果 (或者想办法用NIS Viewer 打开.lsm-以前用德国货照的图片)。
有谁有什么方法可以解决我的问题吗?
谢谢
s*****j
发帖数: 6435
5
Fiji is "Fiji Is Just ImageJ", google it .
download MBF ImageJ, it has plenty of plugins already installed
http://www.macbiophotonics.ca/downloads.htm
then try "plugin"->"stacks-zfunction" will help.

【在 L****S 的大作中提到】
: 感谢mammothcy (mammoth), 你的方法很好用。现在我可以用IMAGE J 打开.ids 的图
: 片并作ORTHOGONAL VIEWS。
: 我不太懂puppeteer (舟云) 的方法,不过还是要谢谢你。
: 我还有一个问题, 今天NIKON 的技术服务给我们展示了NIS Viewer (NIS ELEMENTS
: RESOURCE CENTER)http://www.nis-elements.com/resources-downloads.html。 这个软件是专为NIKON 设计的, 可以打开.ids,但是却无法打开.lsm。 其实我对NIS Viewer 不太敢冒,但是我老板被NIS Viewer的volume view 功能吸引了,这个程序可以把Z 轴 图像用360 度旋转的方式展现出来。老板希望我能用IMAGE J 做出同样的效果 (或者想办法用NIS Viewer 打开.lsm-以前用德国货照的图片)。
: 有谁有什么方法可以解决我的问题吗?
: 谢谢

L****S
发帖数: 76
6
Thank shanggj (shanggj) so much. Your method works very well for us and it
also solve our postdoc's problem who uses Mac not PC.
Thanks.
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