K**********e
发帖数: 188 | 1 通过ChIP seq得到数百个基因，有什么免费／付费的软件／网站可以对这些基因进行分
析的？也就是找出来大概可以分成
几组，跟细胞周期有关的，跟凋亡有关的，跟什么什么有关的那种。
另外有100多段，每段500bp左右的DNA序列，怎么从这些序列里面找出来motif？
知道的告诉我吧，谢谢！ |
g******w
发帖数: 78 | 2 gsea - for function annotation |
h****n
发帖数: 2552 | |
g********i
发帖数: 207 | 4 we usually do clustering followed by gene ontology analysis. You may use
Cluster 3.0 (free java software) for clustering and DAVID or iGET (online
tools) for gene ontology analysis. If you know how to use matlab, you can
also find several functions for clustering and ontology analysis there. |
y*********1
发帖数: 46 | 5 You can use CEAS (Cis-regulatory Element Annotation System) from Shirley Liu
' lab for motif finding. |
