h******3
发帖数: 190 | 1 有没有办法使得ClustalW的output变为可编辑的format. 比如在aligned two
sequences某部分加下划线什么的。
如果直接copy， paste到word就变成不规则的状态。。。
不知道怎么办。 谢谢。 |
C*******e
发帖数: 4348 | 2 没怎么用在线版的W
我都用单机版的X
在ClustalX里可以输出script
然后用adobe professional可以打开并生成pdf文件
有了pdf文件那就是在adobe里面编辑了
或者你也可以吧pdf转成tif，然后编辑图一样的编辑
【在 h******3 的大作中提到】
: 有没有办法使得ClustalW的output变为可编辑的format. 比如在aligned two
: sequences某部分加下划线什么的。
: 如果直接copy， paste到word就变成不规则的状态。。。
: 不知道怎么办。 谢谢。
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c******r
发帖数: 3778 | 3 copy paste晚之后select all，然后字体选courier new就对齐了。
然后想怎么edit就edit好了。
【在 h******3 的大作中提到】
: 有没有办法使得ClustalW的output变为可编辑的format. 比如在aligned two
: sequences某部分加下划线什么的。
: 如果直接copy， paste到word就变成不规则的状态。。。
: 不知道怎么办。 谢谢。
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h******3
发帖数: 190 | 4
Thanks for help!
But could you enlighten me on how to output script? I cannot figure it out.
【在 C*******e 的大作中提到】
: 没怎么用在线版的W
: 我都用单机版的X
: 在ClustalX里可以输出script
: 然后用adobe professional可以打开并生成pdf文件
: 有了pdf文件那就是在adobe里面编辑了
: 或者你也可以吧pdf转成tif，然后编辑图一样的编辑
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o*****h
发帖数: 293 | 5 texshade if you can use latex
【在 h******3 的大作中提到】
: 有没有办法使得ClustalW的output变为可编辑的format. 比如在aligned two
: sequences某部分加下划线什么的。
: 如果直接copy， paste到word就变成不规则的状态。。。
: 不知道怎么办。 谢谢。
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C*******e
发帖数: 4348 | 6 在ClustalX里alignment做完以后，File->Write Alignment as Postscript，在弹出的
窗口里
应该会问你每一行多少个bp/aa，纸张大小（A4还是letter），横排竖排之类的问题，
改好以后就会
生成一个postcript文件，用adobe professional(如果没有的话可以用免费软件Cute
PDF)是可
以打开并且生成一个pdf文件的，pdf文件生成以后就不需要以前那个postcript文件了。
.
【在 h******3 的大作中提到】
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: Thanks for help!
: But could you enlighten me on how to output script? I cannot figure it out.
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G***y
发帖数: 1082 | 7 Use bioedit
【在 h******3 的大作中提到】
: 有没有办法使得ClustalW的output变为可编辑的format. 比如在aligned two
: sequences某部分加下划线什么的。
: 如果直接copy， paste到word就变成不规则的状态。。。
: 不知道怎么办。 谢谢。
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b*******e
发帖数: 288 | 8 刚到ebi的网站上给你试了试，这是我的方法：
比完之后"View alignment file" -->
保存页面 -->
生成的是******.aln.txt文件 -->
用word打开 -->
一般是选默认的那个编码就行，不过你要看看底下的预览，确定格式是对的-->
打开后，不对齐，因为页面太窄，你在页面设置里把纸张改成横排就可以了 -->
按照你的要求编辑
【在 h******3 的大作中提到】
: 有没有办法使得ClustalW的output变为可编辑的format. 比如在aligned two
: sequences某部分加下划线什么的。
: 如果直接copy， paste到word就变成不规则的状态。。。
: 不知道怎么办。 谢谢。
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h******3
发帖数: 190 | 9
了。
Thanks. I get it. Thanks all! :)
【在 C*******e 的大作中提到】
: 在ClustalX里alignment做完以后，File->Write Alignment as Postscript，在弹出的
: 窗口里
: 应该会问你每一行多少个bp/aa，纸张大小（A4还是letter），横排竖排之类的问题，
: 改好以后就会
: 生成一个postcript文件，用adobe professional(如果没有的话可以用免费软件Cute
: PDF)是可
: 以打开并且生成一个pdf文件的，pdf文件生成以后就不需要以前那个postcript文件了。
:
: .
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