s********n 发帖数: 2939 | 1 今年的ICBE (International Conference for Biomolecular Engineering) 在SF举行
四天,今天是正式会议第一天,听了不少presentations,有一些很不错,但也有不少
很一般。大部分是和pharmaceutical相关的,metabolic engineering也不少。
Roger Tsien的talk给我印象最深,整个演讲生动风趣,内容丰富,不愧是大师级人物
。从他的演讲看出他的研究邻域已经从fluorescent proteins转向其他的一些small
fluorescent tags,比如miniSOG。还有就是肿瘤特异性的fluorescent label tags,
已经可以直接应用在肿瘤手术,听得我是热血沸腾啊,真是太有用的技术了,虽然发在
PNAS,感觉比许多CNS的文章有意义多了。
不过听了一天,累死了!
呵呵! |
w******e 发帖数: 1187 | 2 lz能不能推荐一下BME领域比较知名的会议?刚进这个圈子还比较小白呵呵
多谢!
【在 s********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 今年的ICBE (International Conference for Biomolecular Engineering) 在SF举行 : 四天,今天是正式会议第一天,听了不少presentations,有一些很不错,但也有不少 : 很一般。大部分是和pharmaceutical相关的,metabolic engineering也不少。 : Roger Tsien的talk给我印象最深,整个演讲生动风趣,内容丰富,不愧是大师级人物 : 。从他的演讲看出他的研究邻域已经从fluorescent proteins转向其他的一些small : fluorescent tags,比如miniSOG。还有就是肿瘤特异性的fluorescent label tags, : 已经可以直接应用在肿瘤手术,听得我是热血沸腾啊,真是太有用的技术了,虽然发在 : PNAS,感觉比许多CNS的文章有意义多了。 : 不过听了一天,累死了! : 呵呵!
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s********n 发帖数: 2939 | 3 我也不是老手啊,这个conference也是别人推荐的,感觉还不错,牛人很多,比如
frances arnold, roger tsein,他们的presentation都非常棒,虽然我对FA的看法有
些不是很赞同的。还有像Jens Neilsen更是metabolic engineering的大牛前辈,能够
目睹他们的风采还是很值得的。
看你的研究领域,个人觉得这个meeting更fundamental一些,有不少参加者都是做和
pharmaceutics相关的;如果是做biofuels和chemicals的话则可能参加像SIM,ASM比较
好。 |
w******e 发帖数: 1187 | 4 thx! 我做的就是targeted delivery这一块,跟tsien组还有点八杆子能打着的
合作,不过水平有限,实话讲一直看不清这个领域多大成分是忽悠哪些方向是
忽悠,只知道自己做的这块挺多大忽悠的哈哈~
【在 s********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我也不是老手啊,这个conference也是别人推荐的,感觉还不错,牛人很多,比如 : frances arnold, roger tsein,他们的presentation都非常棒,虽然我对FA的看法有 : 些不是很赞同的。还有像Jens Neilsen更是metabolic engineering的大牛前辈,能够 : 目睹他们的风采还是很值得的。 : 看你的研究领域,个人觉得这个meeting更fundamental一些,有不少参加者都是做和 : pharmaceutics相关的;如果是做biofuels和chemicals的话则可能参加像SIM,ASM比较 : 好。
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s********n 发帖数: 2939 | 5 不做这一块,不是很清楚,不过听Tsein的报告感觉挺实在,他们直接用设计的tag标记
肿瘤组织,直接切除!而且是放vedio给我们看的,感觉非常真实。
【在 w******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : thx! 我做的就是targeted delivery这一块,跟tsien组还有点八杆子能打着的 : 合作,不过水平有限,实话讲一直看不清这个领域多大成分是忽悠哪些方向是 : 忽悠,只知道自己做的这块挺多大忽悠的哈哈~
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l*********1 发帖数: 351 | 6 frances arnold最近几年不给力啊,除了个seq-fitness landscape的文章,新货不多。
Jens Nielson人不错,组里气氛也挺好的,夏天的时侯一起跟他们跳舞,玩得很开。 |
s********n 发帖数: 2939 | 7 是啊,个人更欣赏Tawfik。
多。
【在 l*********1 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : frances arnold最近几年不给力啊,除了个seq-fitness landscape的文章,新货不多。 : Jens Nielson人不错,组里气氛也挺好的,夏天的时侯一起跟他们跳舞,玩得很开。
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w******e 发帖数: 1187 | 8 成功例子肯定有的,毕竟Ab/immunoconjugate用作therapeutics已经很成熟了,用到
imaging上其实是换汤不换药。that said,猫腻还是挺多,这个我也刚入行只是
感觉而且呵呵
【在 s********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 不做这一块,不是很清楚,不过听Tsein的报告感觉挺实在,他们直接用设计的tag标记 : 肿瘤组织,直接切除!而且是放vedio给我们看的,感觉非常真实。
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h*****o 发帖数: 342 | 9 他们用的不算Ab/immunoconjugate,而是用特异性的酶切位点,标记蛋白酶活性- 当然
他们花了很多功夫去优化在活体上标记的特异性,还有就是把特异蛋白酶和肿瘤病理联
系起来。我觉得这块已经做得差不多了,他们都开公司希望在人体上检测了
【在 w******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 成功例子肯定有的,毕竟Ab/immunoconjugate用作therapeutics已经很成熟了,用到 : imaging上其实是换汤不换药。that said,猫腻还是挺多,这个我也刚入行只是 : 感觉而且呵呵
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w******e 发帖数: 1187 | 10 thx for sharing.这倒是一个新思路,跟ruoslahti最近一篇science有点像。
不过蛋白酶的位点有很diverse吗?他们又要做basic science(validation of
protease
as cancer biomarker)又要做应用的话还挺苦的。不用Ab,总需要什么其他的
affinity
agent吧?
有没有相关paper推荐一下?thx~
【在 h*****o 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 他们用的不算Ab/immunoconjugate,而是用特异性的酶切位点,标记蛋白酶活性- 当然 : 他们花了很多功夫去优化在活体上标记的特异性,还有就是把特异蛋白酶和肿瘤病理联 : 系起来。我觉得这块已经做得差不多了,他们都开公司希望在人体上检测了
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G*****m 发帖数: 198 | 11 不知道那个miniSOG发出来没有,除了听说,一直都没搜到文章
【在 s********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 今年的ICBE (International Conference for Biomolecular Engineering) 在SF举行 : 四天,今天是正式会议第一天,听了不少presentations,有一些很不错,但也有不少 : 很一般。大部分是和pharmaceutical相关的,metabolic engineering也不少。 : Roger Tsien的talk给我印象最深,整个演讲生动风趣,内容丰富,不愧是大师级人物 : 。从他的演讲看出他的研究邻域已经从fluorescent proteins转向其他的一些small : fluorescent tags,比如miniSOG。还有就是肿瘤特异性的fluorescent label tags, : 已经可以直接应用在肿瘤手术,听得我是热血沸腾啊,真是太有用的技术了,虽然发在 : PNAS,感觉比许多CNS的文章有意义多了。 : 不过听了一天,累死了! : 呵呵!
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s********n 发帖数: 2939 | 12 他们使用polyArg和polyGlu,中间用protease的特异位点链接,当protease切下后,
Cy5标记的polyArg就和肿瘤细胞结合标记了,所以不用抗体。
【在 w******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : thx for sharing.这倒是一个新思路,跟ruoslahti最近一篇science有点像。 : 不过蛋白酶的位点有很diverse吗?他们又要做basic science(validation of : protease : as cancer biomarker)又要做应用的话还挺苦的。不用Ab,总需要什么其他的 : affinity : agent吧? : 有没有相关paper推荐一下?thx~
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s********n 发帖数: 2939 | 13 不知道有没有记错,好像是发表了,而且他还列出一堆实验室在用这个东东。
【在 G*****m 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 不知道那个miniSOG发出来没有,除了听说,一直都没搜到文章
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w******e 发帖数: 1187 | 14 poly arg。。。又见CPP啊呵呵。多谢解释。现在的问题只剩下了protease
activity是否足够特异。隐约记得MMPs有很多跟cancer相关,不过biomarker
的validation向来是瓶颈吧。当然,从发paper的角度来讲挺好的了。
【在 s********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 他们使用polyArg和polyGlu,中间用protease的特异位点链接,当protease切下后, : Cy5标记的polyArg就和肿瘤细胞结合标记了,所以不用抗体。
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s********n 发帖数: 2939 | 15 从他的presentation得到的信息是他的技术已经不仅仅是发文章了,已经用在实际的手
术,当然现在只是在小鼠上做。他说已经搞出了一套手术设备,并优化了几次,现在已
经比较成熟。比如他将fluoresence的影像和可见光的重叠可以只切除小鼠脑内的肿瘤
组织,利用其它的荧光标记neuron,以免错杀。据他们的实验结果显示,手术很干净(
用MRI复查),而且术后小鼠的成活率很高,基本达到正常寿命。
这个技术特异性很好,但是肝脏例外,所以手术应用没问题(除了肝脏肿瘤),但是他
们的最终目标是肿瘤特异性的药物(指所有肿瘤),但现在比较大的问题是在肝脏,他
们正在研究方法。
【在 w******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : poly arg。。。又见CPP啊呵呵。多谢解释。现在的问题只剩下了protease : activity是否足够特异。隐约记得MMPs有很多跟cancer相关,不过biomarker : 的validation向来是瓶颈吧。当然,从发paper的角度来讲挺好的了。
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w******e 发帖数: 1187 | 16 这点还挺counter intuitive的。不知道他们用什么formulation。如果是NP,liver应该
是个主要的目的地(所以人们才质疑RNAi在肝脏以外能否work)。如果只是peptide,
renal clearance应该很厉害吧。and居然能过BBB,不知道有没有加其他料。印象中
有某peptide能过BBB但不记得是什么了,也不记得有没有paper跟进。
我个人理解medical imaging是否成功,一个是signaling motif要NB:无毒,yield高,
不受autofluorescence影响,穿透性好,etc;一个是targeting motif要NB:足够特异,
target level够高,最好affinity还能恰到好处,half life能控制好。这两方面我觉得
都不容易解决吧。fluorescence在background、穿透性等方面有局限吧?当然这方面如果
tsien组估计最有实力解决。target方面validated biomarker忒少了,
用于imaging,只有一层specificity check也有点安全隐患。
最后formulation当然是PK方面的主要考虑,这个就完全不懂了。
anyway,作为新人,坐井观天瞎评论两句,纯属为了促进讨论呵呵。
【在 s********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 从他的presentation得到的信息是他的技术已经不仅仅是发文章了,已经用在实际的手 : 术,当然现在只是在小鼠上做。他说已经搞出了一套手术设备,并优化了几次,现在已 : 经比较成熟。比如他将fluoresence的影像和可见光的重叠可以只切除小鼠脑内的肿瘤 : 组织,利用其它的荧光标记neuron,以免错杀。据他们的实验结果显示,手术很干净( : 用MRI复查),而且术后小鼠的成活率很高,基本达到正常寿命。 : 这个技术特异性很好,但是肝脏例外,所以手术应用没问题(除了肝脏肿瘤),但是他 : 们的最终目标是肿瘤特异性的药物(指所有肿瘤),但现在比较大的问题是在肝脏,他 : 们正在研究方法。
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h*****o 发帖数: 342 | 17 肝脏,是因为CPP都会对富集到肝脏造成假阳性吗?
【在 s********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 从他的presentation得到的信息是他的技术已经不仅仅是发文章了,已经用在实际的手 : 术,当然现在只是在小鼠上做。他说已经搞出了一套手术设备,并优化了几次,现在已 : 经比较成熟。比如他将fluoresence的影像和可见光的重叠可以只切除小鼠脑内的肿瘤 : 组织,利用其它的荧光标记neuron,以免错杀。据他们的实验结果显示,手术很干净( : 用MRI复查),而且术后小鼠的成活率很高,基本达到正常寿命。 : 这个技术特异性很好,但是肝脏例外,所以手术应用没问题(除了肝脏肿瘤),但是他 : 们的最终目标是肿瘤特异性的药物(指所有肿瘤),但现在比较大的问题是在肝脏,他 : 们正在研究方法。
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h*****o 发帖数: 342 | 18 哪里说可以过BBB了?还没这么NB吧
应该
高,
异,
觉得
如果
【在 w******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这点还挺counter intuitive的。不知道他们用什么formulation。如果是NP,liver应该 : 是个主要的目的地(所以人们才质疑RNAi在肝脏以外能否work)。如果只是peptide, : renal clearance应该很厉害吧。and居然能过BBB,不知道有没有加其他料。印象中 : 有某peptide能过BBB但不记得是什么了,也不记得有没有paper跟进。 : 我个人理解medical imaging是否成功,一个是signaling motif要NB:无毒,yield高, : 不受autofluorescence影响,穿透性好,etc;一个是targeting motif要NB:足够特异, : target level够高,最好affinity还能恰到好处,half life能控制好。这两方面我觉得 : 都不容易解决吧。fluorescence在background、穿透性等方面有局限吧?当然这方面如果 : tsien组估计最有实力解决。target方面validated biomarker忒少了, : 用于imaging,只有一层specificity check也有点安全隐患。
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w******e 发帖数: 1187 | 19 我看楼上说脑内的肿瘤就想当然了呵呵。还是请楼上再说两句吧呵呵
【在 h*****o 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 哪里说可以过BBB了?还没这么NB吧 : : 应该 : 高, : 异, : 觉得 : 如果
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G*****m 发帖数: 198 | 20 在nature tech什么的,08年,peptide带着RNA过bbb
【在 h*****o 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 哪里说可以过BBB了?还没这么NB吧 : : 应该 : 高, : 异, : 觉得 : 如果
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w******e 发帖数: 1187 | 21 that must be where I read it. sounded too good to be true hehe
【在 G*****m 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 在nature tech什么的,08年,peptide带着RNA过bbb
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s********n 发帖数: 2939 | 22 不好意思,今天一整天都在参加会议。
我是外行,只是看看热闹而已,说不出所以然,只是抛砖引玉,如果有兴趣就follow
tsein的报告把。 |
s********n 发帖数: 2939 | 23 几天听了一个3rd generation的sequencing技术,非常牛,号称能够直接单分子测序,
而且每个read很长(10kb),而且效率非常高,只要一天就可以完成人基因组的测序(
对比:454和illumina要7天),公司好像叫Pacific Bioscience。 |