s********n
发帖数: 2939 | 1 今年的ICBE (International Conference for Biomolecular Engineering) 在SF举行
四天，今天是正式会议第一天，听了不少presentations，有一些很不错，但也有不少
很一般。大部分是和pharmaceutical相关的，metabolic engineering也不少。
Roger Tsien的talk给我印象最深，整个演讲生动风趣，内容丰富，不愧是大师级人物
。从他的演讲看出他的研究邻域已经从fluorescent proteins转向其他的一些small
fluorescent tags，比如miniSOG。还有就是肿瘤特异性的fluorescent label tags，
已经可以直接应用在肿瘤手术，听得我是热血沸腾啊，真是太有用的技术了，虽然发在
PNAS，感觉比许多CNS的文章有意义多了。
不过听了一天，累死了！
呵呵！ |
w******e
发帖数: 1187 | 2 lz能不能推荐一下BME领域比较知名的会议？刚进这个圈子还比较小白呵呵
多谢！
【在 s********n 的大作中提到】
: 今年的ICBE (International Conference for Biomolecular Engineering) 在SF举行
: 四天，今天是正式会议第一天，听了不少presentations，有一些很不错，但也有不少
: 很一般。大部分是和pharmaceutical相关的，metabolic engineering也不少。
: Roger Tsien的talk给我印象最深，整个演讲生动风趣，内容丰富，不愧是大师级人物
: 。从他的演讲看出他的研究邻域已经从fluorescent proteins转向其他的一些small
: fluorescent tags，比如miniSOG。还有就是肿瘤特异性的fluorescent label tags，
: 已经可以直接应用在肿瘤手术，听得我是热血沸腾啊，真是太有用的技术了，虽然发在
: PNAS，感觉比许多CNS的文章有意义多了。
: 不过听了一天，累死了！
: 呵呵！
|
s********n
发帖数: 2939 | 3 我也不是老手啊，这个conference也是别人推荐的，感觉还不错，牛人很多，比如
frances arnold, roger tsein，他们的presentation都非常棒，虽然我对FA的看法有
些不是很赞同的。还有像Jens Neilsen更是metabolic engineering的大牛前辈，能够
目睹他们的风采还是很值得的。
看你的研究领域，个人觉得这个meeting更fundamental一些，有不少参加者都是做和
pharmaceutics相关的；如果是做biofuels和chemicals的话则可能参加像SIM，ASM比较
好。 |
w******e
发帖数: 1187 | 4 thx! 我做的就是targeted delivery这一块，跟tsien组还有点八杆子能打着的
合作，不过水平有限，实话讲一直看不清这个领域多大成分是忽悠哪些方向是
忽悠，只知道自己做的这块挺多大忽悠的哈哈~
【在 s********n 的大作中提到】
: 我也不是老手啊，这个conference也是别人推荐的，感觉还不错，牛人很多，比如
: frances arnold, roger tsein，他们的presentation都非常棒，虽然我对FA的看法有
: 些不是很赞同的。还有像Jens Neilsen更是metabolic engineering的大牛前辈，能够
: 目睹他们的风采还是很值得的。
: 看你的研究领域，个人觉得这个meeting更fundamental一些，有不少参加者都是做和
: pharmaceutics相关的；如果是做biofuels和chemicals的话则可能参加像SIM，ASM比较
: 好。
|
s********n
发帖数: 2939 | 5 不做这一块，不是很清楚，不过听Tsein的报告感觉挺实在，他们直接用设计的tag标记
肿瘤组织，直接切除！而且是放vedio给我们看的，感觉非常真实。
【在 w******e 的大作中提到】
: thx! 我做的就是targeted delivery这一块，跟tsien组还有点八杆子能打着的
: 合作，不过水平有限，实话讲一直看不清这个领域多大成分是忽悠哪些方向是
: 忽悠，只知道自己做的这块挺多大忽悠的哈哈~
|
l*********1
发帖数: 351 | 6 frances arnold最近几年不给力啊，除了个seq－fitness landscape的文章，新货不多。
Jens Nielson人不错，组里气氛也挺好的，夏天的时侯一起跟他们跳舞，玩得很开。 |
s********n
发帖数: 2939 | 7 是啊，个人更欣赏Tawfik。
多。
【在 l*********1 的大作中提到】
: frances arnold最近几年不给力啊，除了个seq－fitness landscape的文章，新货不多。
: Jens Nielson人不错，组里气氛也挺好的，夏天的时侯一起跟他们跳舞，玩得很开。
|
w******e
发帖数: 1187 | 8 成功例子肯定有的，毕竟Ab/immunoconjugate用作therapeutics已经很成熟了，用到
imaging上其实是换汤不换药。that said，猫腻还是挺多，这个我也刚入行只是
感觉而且呵呵
【在 s********n 的大作中提到】
: 不做这一块，不是很清楚，不过听Tsein的报告感觉挺实在，他们直接用设计的tag标记
: 肿瘤组织，直接切除！而且是放vedio给我们看的，感觉非常真实。
|
h*****o
发帖数: 342 | 9 他们用的不算Ab/immunoconjugate，而是用特异性的酶切位点，标记蛋白酶活性- 当然
他们花了很多功夫去优化在活体上标记的特异性，还有就是把特异蛋白酶和肿瘤病理联
系起来。我觉得这块已经做得差不多了，他们都开公司希望在人体上检测了
【在 w******e 的大作中提到】
: 成功例子肯定有的，毕竟Ab/immunoconjugate用作therapeutics已经很成熟了，用到
: imaging上其实是换汤不换药。that said，猫腻还是挺多，这个我也刚入行只是
: 感觉而且呵呵
|
w******e
发帖数: 1187 | 10 thx for sharing.这倒是一个新思路，跟ruoslahti最近一篇science有点像。
不过蛋白酶的位点有很diverse吗？他们又要做basic science（validation of
protease
as cancer biomarker）又要做应用的话还挺苦的。不用Ab，总需要什么其他的
affinity
agent吧？
有没有相关paper推荐一下？thx~
【在 h*****o 的大作中提到】
: 他们用的不算Ab/immunoconjugate，而是用特异性的酶切位点，标记蛋白酶活性- 当然
: 他们花了很多功夫去优化在活体上标记的特异性，还有就是把特异蛋白酶和肿瘤病理联
: 系起来。我觉得这块已经做得差不多了，他们都开公司希望在人体上检测了
|
|
|
G*****m
发帖数: 198 | 11 不知道那个miniSOG发出来没有，除了听说，一直都没搜到文章
【在 s********n 的大作中提到】
: 今年的ICBE (International Conference for Biomolecular Engineering) 在SF举行
: 四天，今天是正式会议第一天，听了不少presentations，有一些很不错，但也有不少
: 很一般。大部分是和pharmaceutical相关的，metabolic engineering也不少。
: Roger Tsien的talk给我印象最深，整个演讲生动风趣，内容丰富，不愧是大师级人物
: 。从他的演讲看出他的研究邻域已经从fluorescent proteins转向其他的一些small
: fluorescent tags，比如miniSOG。还有就是肿瘤特异性的fluorescent label tags，
: 已经可以直接应用在肿瘤手术，听得我是热血沸腾啊，真是太有用的技术了，虽然发在
: PNAS，感觉比许多CNS的文章有意义多了。
: 不过听了一天，累死了！
: 呵呵！
|
s********n
发帖数: 2939 | 12 他们使用polyArg和polyGlu，中间用protease的特异位点链接，当protease切下后，
Cy5标记的polyArg就和肿瘤细胞结合标记了，所以不用抗体。
【在 w******e 的大作中提到】
: thx for sharing.这倒是一个新思路，跟ruoslahti最近一篇science有点像。
: 不过蛋白酶的位点有很diverse吗？他们又要做basic science（validation of
: protease
: as cancer biomarker）又要做应用的话还挺苦的。不用Ab，总需要什么其他的
: affinity
: agent吧？
: 有没有相关paper推荐一下？thx~
|
s********n
发帖数: 2939 | 13 不知道有没有记错，好像是发表了，而且他还列出一堆实验室在用这个东东。
【在 G*****m 的大作中提到】
: 不知道那个miniSOG发出来没有，除了听说，一直都没搜到文章
|
w******e
发帖数: 1187 | 14 poly arg。。。又见CPP啊呵呵。多谢解释。现在的问题只剩下了protease
activity是否足够特异。隐约记得MMPs有很多跟cancer相关，不过biomarker
的validation向来是瓶颈吧。当然，从发paper的角度来讲挺好的了。
【在 s********n 的大作中提到】
: 他们使用polyArg和polyGlu，中间用protease的特异位点链接，当protease切下后，
: Cy5标记的polyArg就和肿瘤细胞结合标记了，所以不用抗体。
|
s********n
发帖数: 2939 | 15 从他的presentation得到的信息是他的技术已经不仅仅是发文章了，已经用在实际的手
术，当然现在只是在小鼠上做。他说已经搞出了一套手术设备，并优化了几次，现在已
经比较成熟。比如他将fluoresence的影像和可见光的重叠可以只切除小鼠脑内的肿瘤
组织，利用其它的荧光标记neuron，以免错杀。据他们的实验结果显示，手术很干净（
用MRI复查），而且术后小鼠的成活率很高，基本达到正常寿命。
这个技术特异性很好，但是肝脏例外，所以手术应用没问题（除了肝脏肿瘤），但是他
们的最终目标是肿瘤特异性的药物（指所有肿瘤），但现在比较大的问题是在肝脏，他
们正在研究方法。
【在 w******e 的大作中提到】
: poly arg。。。又见CPP啊呵呵。多谢解释。现在的问题只剩下了protease
: activity是否足够特异。隐约记得MMPs有很多跟cancer相关，不过biomarker
: 的validation向来是瓶颈吧。当然，从发paper的角度来讲挺好的了。
|
w******e
发帖数: 1187 | 16 这点还挺counter intuitive的。不知道他们用什么formulation。如果是NP，liver应该
是个主要的目的地（所以人们才质疑RNAi在肝脏以外能否work）。如果只是peptide，
renal clearance应该很厉害吧。and居然能过BBB，不知道有没有加其他料。印象中
有某peptide能过BBB但不记得是什么了，也不记得有没有paper跟进。
我个人理解medical imaging是否成功，一个是signaling motif要NB：无毒，yield高，
不受autofluorescence影响，穿透性好，etc；一个是targeting motif要NB：足够特异，
target level够高，最好affinity还能恰到好处，half life能控制好。这两方面我觉得
都不容易解决吧。fluorescence在background、穿透性等方面有局限吧？当然这方面如果
tsien组估计最有实力解决。target方面validated biomarker忒少了，
用于imaging，只有一层specificity check也有点安全隐患。
最后formulation当然是PK方面的主要考虑，这个就完全不懂了。
anyway，作为新人，坐井观天瞎评论两句，纯属为了促进讨论呵呵。
【在 s********n 的大作中提到】
: 从他的presentation得到的信息是他的技术已经不仅仅是发文章了，已经用在实际的手
: 术，当然现在只是在小鼠上做。他说已经搞出了一套手术设备，并优化了几次，现在已
: 经比较成熟。比如他将fluoresence的影像和可见光的重叠可以只切除小鼠脑内的肿瘤
: 组织，利用其它的荧光标记neuron，以免错杀。据他们的实验结果显示，手术很干净（
: 用MRI复查），而且术后小鼠的成活率很高，基本达到正常寿命。
: 这个技术特异性很好，但是肝脏例外，所以手术应用没问题（除了肝脏肿瘤），但是他
: 们的最终目标是肿瘤特异性的药物（指所有肿瘤），但现在比较大的问题是在肝脏，他
: 们正在研究方法。
|
h*****o
发帖数: 342 | 17 肝脏，是因为CPP都会对富集到肝脏造成假阳性吗？
【在 s********n 的大作中提到】
: 从他的presentation得到的信息是他的技术已经不仅仅是发文章了，已经用在实际的手
: 术，当然现在只是在小鼠上做。他说已经搞出了一套手术设备，并优化了几次，现在已
: 经比较成熟。比如他将fluoresence的影像和可见光的重叠可以只切除小鼠脑内的肿瘤
: 组织，利用其它的荧光标记neuron，以免错杀。据他们的实验结果显示，手术很干净（
: 用MRI复查），而且术后小鼠的成活率很高，基本达到正常寿命。
: 这个技术特异性很好，但是肝脏例外，所以手术应用没问题（除了肝脏肿瘤），但是他
: 们的最终目标是肿瘤特异性的药物（指所有肿瘤），但现在比较大的问题是在肝脏，他
: 们正在研究方法。
|
h*****o
发帖数: 342 | 18 哪里说可以过BBB了？还没这么NB吧
应该
高，
异，
觉得
如果
【在 w******e 的大作中提到】
: 这点还挺counter intuitive的。不知道他们用什么formulation。如果是NP，liver应该
: 是个主要的目的地（所以人们才质疑RNAi在肝脏以外能否work）。如果只是peptide，
: renal clearance应该很厉害吧。and居然能过BBB，不知道有没有加其他料。印象中
: 有某peptide能过BBB但不记得是什么了，也不记得有没有paper跟进。
: 我个人理解medical imaging是否成功，一个是signaling motif要NB：无毒，yield高，
: 不受autofluorescence影响，穿透性好，etc；一个是targeting motif要NB：足够特异，
: target level够高，最好affinity还能恰到好处，half life能控制好。这两方面我觉得
: 都不容易解决吧。fluorescence在background、穿透性等方面有局限吧？当然这方面如果
: tsien组估计最有实力解决。target方面validated biomarker忒少了，
: 用于imaging，只有一层specificity check也有点安全隐患。
|
w******e
发帖数: 1187 | 19 我看楼上说脑内的肿瘤就想当然了呵呵。还是请楼上再说两句吧呵呵
【在 h*****o 的大作中提到】
: 哪里说可以过BBB了？还没这么NB吧
:
: 应该
: 高，
: 异，
: 觉得
: 如果
|
G*****m
发帖数: 198 | 20 在nature tech什么的，08年，peptide带着RNA过bbb
【在 h*****o 的大作中提到】
: 哪里说可以过BBB了？还没这么NB吧
:
: 应该
: 高，
: 异，
: 觉得
: 如果
|
|
|
w******e
发帖数: 1187 | 21 that must be where I read it. sounded too good to be true hehe
【在 G*****m 的大作中提到】
: 在nature tech什么的，08年，peptide带着RNA过bbb
|
s********n
发帖数: 2939 | 22 不好意思，今天一整天都在参加会议。
我是外行，只是看看热闹而已，说不出所以然，只是抛砖引玉，如果有兴趣就follow
tsein的报告把。 |
s********n
发帖数: 2939 | 23 几天听了一个3rd generation的sequencing技术，非常牛，号称能够直接单分子测序，
而且每个read很长（10kb），而且效率非常高，只要一天就可以完成人基因组的测序（
对比：454和illumina要7天），公司好像叫Pacific Bioscience。 |
