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Biology版 - 土问:human proteome size??
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w******e
发帖数: 1187
1
隐约记得是100,000,因为有alternative splicing,但google不到
这个数字,倒是有地方写30,000.
请指点。多谢!
w******e
发帖数: 1187
2
ding~

【在 w******e 的大作中提到】
: 隐约记得是100,000,因为有alternative splicing,但google不到
: 这个数字,倒是有地方写30,000.
: 请指点。多谢!

K******S
发帖数: 10109
3
swissprot或者IPI的数据库里2万多个,要是算上ALTERNATIVE SPLICING和各种
MODIFICATION那可就海了去了

【在 w******e 的大作中提到】
: 隐约记得是100,000,因为有alternative splicing,但google不到
: 这个数字,倒是有地方写30,000.
: 请指点。多谢!

K**4
发帖数: 1015
4
好像两个版本
普遍接受的版本是人类基因组测序计划颁布的30000个
后来那个celera公司的颁布的是60000个
有人之后发了文章比较了下
然后提出应该是45000,取了个中间值

【在 w******e 的大作中提到】
: 隐约记得是100,000,因为有alternative splicing,但google不到
: 这个数字,倒是有地方写30,000.
: 请指点。多谢!

j****x
发帖数: 1704
5
human protein-coding gene的数目目前“官方”的是估计是20000-25000个,广泛采用
的数字是23000个左右,其中20000个左右已经明确确认。(http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/faq/genenumber.shtml
关于这个human gene的数目,2000-2003年间冷泉港曾经搞过一次广为人知的竞猜活动
GeneSweep,最后,猜得最少的那个家伙拿了大奖,呵呵,当时确实让众人大跌眼镜
j****x
发帖数: 1704
6
考虑到不同的alternative isoforms,human proteome size至少应该在100K的级别,
至于确切数字,一时半会估计是搞不清的
S**********l
发帖数: 3835
7
alternative isoform用什么工具分析?

【在 j****x 的大作中提到】
: 考虑到不同的alternative isoforms,human proteome size至少应该在100K的级别,
: 至于确切数字,一时半会估计是搞不清的

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这些文章是垃圾还是宝贝? 改变社会认识了吗?要分析一些isoform,请问到底有哪些数据是RNA concentrated的?
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