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Biology版 - 外行问一个transmembrane protein的实验问题
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t********y
发帖数: 749
1
在membrane里面放某种transmembrane protein, 怎么知道放的是正的还是反的呢?
还是两种orientation 都有呢?
特别是PH sensitive channel
谢谢!
i***l
发帖数: 1656
2
都有

【在 t********y 的大作中提到】
: 在membrane里面放某种transmembrane protein, 怎么知道放的是正的还是反的呢?
: 还是两种orientation 都有呢?
: 特别是PH sensitive channel
: 谢谢!

S*****s
发帖数: 287
3
能不能在 C 端或者 N 端带上一个 epitope tag?如果可以的话,不破细胞直接染细胞
表面蛋白,另一组样品破了细胞再染。两组一对照就知道这个蛋白是怎么表达的了。

【在 t********y 的大作中提到】
: 在membrane里面放某种transmembrane protein, 怎么知道放的是正的还是反的呢?
: 还是两种orientation 都有呢?
: 特别是PH sensitive channel
: 谢谢!

i***l
发帖数: 1656
4
他肯定不是用活细胞
是ProteoLiposome重组
两种都有

【在 S*****s 的大作中提到】
: 能不能在 C 端或者 N 端带上一个 epitope tag?如果可以的话,不破细胞直接染细胞
: 表面蛋白,另一组样品破了细胞再染。两组一对照就知道这个蛋白是怎么表达的了。

s*******e
发帖数: 1010
5
体外重组两种朝向应该接近1:1
t********y
发帖数: 749
6
若果都有的话怎么测电导率呢?
那测的数据岂不是很难准确?弄不好还cancel了?

【在 i***l 的大作中提到】
: 他肯定不是用活细胞
: 是ProteoLiposome重组
: 两种都有

s*******e
发帖数: 1010
7
控制channel specific的离子浓度啊

【在 t********y 的大作中提到】
: 若果都有的话怎么测电导率呢?
: 那测的数据岂不是很难准确?弄不好还cancel了?

t********y
发帖数: 749
8
可是这样的话, 再除以expression number或者某种方法得到的总channel 数,
再得到的single channel conductance 根本没办法和 single channel
electrophysiology 的实验比啊?
搞不好连一个数量级都不是的。。
是我理解错什么东西了吗? 麻烦高人指点。。。越来越昏了。。。

【在 s*******e 的大作中提到】
: 控制channel specific的离子浓度啊
i***l
发帖数: 1656
9
是不是+Lipid重组?
重组的话也不是所有蛋白都上去的,想知道数量,照电镜,数平均数,除以2,大概是
真的工作的Channel

【在 t********y 的大作中提到】
: 可是这样的话, 再除以expression number或者某种方法得到的总channel 数,
: 再得到的single channel conductance 根本没办法和 single channel
: electrophysiology 的实验比啊?
: 搞不好连一个数量级都不是的。。
: 是我理解错什么东西了吗? 麻烦高人指点。。。越来越昏了。。。

S*****s
发帖数: 287
10
我不知道 lz 做的是什么方向,表达的是什么蛋白,但是我并不赞同楼上各位说的离子
流动方向。lz 要表达的是 ion channel 还是 transporter?如果是 ion channel 的
话不管蛋白以什么方向跨膜,通道打开之后离子都可以往离子浓度底的那个方向流动。
只是 ligand binding domain 没有接触到 ligand 的那些通道处于关闭状态没有电子
通过而已,而且这个问题在 voltage gated ion channel 里面并不存在。如果是
transporter 的话离子流动是单向的,不过我印象里面这个动作需要能量驱动,应该也
不可能两个方向都有电流然后整体上 cancel 掉。
i***l
发帖数: 1656
11
nobody said cancel 掉 except for LZ
Gated channel or not, it depends..........
no details from LZ, no solution
yep for transporter or non-gated channel, solute gradient matters

【在 S*****s 的大作中提到】
: 我不知道 lz 做的是什么方向,表达的是什么蛋白,但是我并不赞同楼上各位说的离子
: 流动方向。lz 要表达的是 ion channel 还是 transporter?如果是 ion channel 的
: 话不管蛋白以什么方向跨膜,通道打开之后离子都可以往离子浓度底的那个方向流动。
: 只是 ligand binding domain 没有接触到 ligand 的那些通道处于关闭状态没有电子
: 通过而已,而且这个问题在 voltage gated ion channel 里面并不存在。如果是
: transporter 的话离子流动是单向的,不过我印象里面这个动作需要能量驱动,应该也
: 不可能两个方向都有电流然后整体上 cancel 掉。

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