z********u
发帖数: 94 | 1 label蛋白，和DNA结合时有significant quenching，这种情况应该怎么校正
efficiency？或者有没有相关paper推荐？
已经看过Clegg的一些paper，两个问题，一个是有些很具体的校正（比如d+的校正）需
要很多实验，但是我不需要很精确的结论；一个是没有说明dynamic quenching的情况
下怎么校正。所以跑上来问大家。
多谢多谢 | f*********r
发帖数: 10 | 2 quench会改变fluorephore的quantum yield,如果要准确计算FRET你需要知道QY到底被
该变了多少。如果是定性估计，也许可以估计个QY的值。
Chem. Rev. 2006, 106, 1785-1813， 是个不错的review,公式12，13 calculate the
correction of FRET.
【在 z********u 的大作中提到】
: label蛋白，和DNA结合时有significant quenching，这种情况应该怎么校正
: efficiency？或者有没有相关paper推荐？
: 已经看过Clegg的一些paper，两个问题，一个是有些很具体的校正（比如d+的校正）需
: 要很多实验，但是我不需要很精确的结论；一个是没有说明dynamic quenching的情况
: 下怎么校正。所以跑上来问大家。
: 多谢多谢
| x*****o
发帖数: 441 | 3 你这个实验具体是想得出什么结论呢? 如果要求不高我们一般都不校正. 你是做single
molecule FRET 吗? 做这个的人从来不校正的说.
以前实验室做得bulk FRET的实验,就是简单的测Ratio A来校正,操作很简单.
Z.K. Majumdar, R.P. Hickerson, H.F. Noller and R.M. Clegg, Measurements of
Internal Distance Changes of the 30 S Ribosome Using FRET with Multiple
Donor–Acceptor Pairs: Quantitative Spetroscopic Methods, J. Mol. Biol (2005
) 351, 1123–1145.
【在 z********u 的大作中提到】
: label蛋白，和DNA结合时有significant quenching，这种情况应该怎么校正
: efficiency？或者有没有相关paper推荐？
: 已经看过Clegg的一些paper，两个问题，一个是有些很具体的校正（比如d+的校正）需
: 要很多实验，但是我不需要很精确的结论；一个是没有说明dynamic quenching的情况
: 下怎么校正。所以跑上来问大家。
: 多谢多谢
| z********u
发帖数: 94 | 4 多谢多谢
the
【在 f*********r 的大作中提到】
: quench会改变fluorephore的quantum yield,如果要准确计算FRET你需要知道QY到底被
: 该变了多少。如果是定性估计，也许可以估计个QY的值。
: Chem. Rev. 2006, 106, 1785-1813， 是个不错的review,公式12，13 calculate the
: correction of FRET.
| z********u
发帖数: 94 | 5 做的是bulk FRET，因为我想比较两种情况下的区别，然后两个情况的quenching稍有区
别但是efficiency差别很大，所以想能不能correct quenching然后得到更确切的结论
。这篇paper已经读过了，他区别了dynamic quenching和static quenching，但是没有
具体给dynamic quenching的校正。 ratio A就是 FRET acceptor/direct acceptor对
吧，这个要怎么校正呢？
多谢多谢啊。
single
2005
【在 x*****o 的大作中提到】
: 你这个实验具体是想得出什么结论呢? 如果要求不高我们一般都不校正. 你是做single
: molecule FRET 吗? 做这个的人从来不校正的说.
: 以前实验室做得bulk FRET的实验,就是简单的测Ratio A来校正,操作很简单.
: Z.K. Majumdar, R.P. Hickerson, H.F. Noller and R.M. Clegg, Measurements of
: Internal Distance Changes of the 30 S Ribosome Using FRET with Multiple
: Donor–Acceptor Pairs: Quantitative Spetroscopic Methods, J. Mol. Biol (2005
: ) 351, 1123–1145.
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