s*********y
发帖数: 387 | 1 我们就提供RNA样品，后面的RT和杂交等，都请他们做。
谢谢 |
l*****8
发帖数: 770 | |
m******5
发帖数: 1383 | 3 我觉得agilent的芯片质量很不错
我最近用了一批，事后RTPCR可重复率非常高，基本上高于2-fold变化的都可以用RT验
证 |
c*2
发帖数: 24 | 4 I vote for Affymetrix. The analysis method for affymetrix data is well
studied (with many open source tools available), which is NOT the case for
agilent arrays. |
m***T
发帖数: 11058 | 5 看ＬＺ问的，是要找service provider，不是选哪个平台吧？虽然据我所知两家也提供
service，但并不以这个为主。多数学校的core lab都会提供这种服务吧，只是平台不
一定用哪家的。 |
m******5
发帖数: 1383 | 6 we bought agilent analysis tool ……
【在 c*2 的大作中提到】
: I vote for Affymetrix. The analysis method for affymetrix data is well
: studied (with many open source tools available), which is NOT the case for
: agilent arrays.
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j****x
发帖数: 1704 | 7 可以说基本上不存在你提到的这种问题
1. 曾经的gold standard for chip data analysis，也就是Genespring软件，早就被
agilent收购了，直至今日，仍然是最好的软件之一。
2. Bioconductor的大部分的包，对Affymetrix, Illumina, Nimblegen, Agilent的支
持都很好。某些特殊的专有芯片除外。当然因为历史原因，很多不再更新的老包仅仅支
持Affymetrix和传统cDNA芯片，自然这些老包基本也都被取代了。
Affymetrix前几年明显在走下坡路，不仅市场占有率第一的位置被Illumina取代，还在
逐步被Nimblegen, Agilent蚕食，自身的问题不少。
【在 c*2 的大作中提到】
: I vote for Affymetrix. The analysis method for affymetrix data is well
: studied (with many open source tools available), which is NOT the case for
: agilent arrays.
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