s*********y 发帖数: 387 | 1 我们就提供RNA样品,后面的RT和杂交等,都请他们做。
谢谢 |
l*****8 发帖数: 770 | |
m******5 发帖数: 1383 | 3 我觉得agilent的芯片质量很不错
我最近用了一批,事后RTPCR可重复率非常高,基本上高于2-fold变化的都可以用RT验
证 |
c*2 发帖数: 24 | 4 I vote for Affymetrix. The analysis method for affymetrix data is well
studied (with many open source tools available), which is NOT the case for
agilent arrays. |
m***T 发帖数: 11058 | 5 看LZ问的,是要找service provider,不是选哪个平台吧?虽然据我所知两家也提供
service,但并不以这个为主。多数学校的core lab都会提供这种服务吧,只是平台不
一定用哪家的。 |
m******5 发帖数: 1383 | 6 we bought agilent analysis tool ……
【在 c*2 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : I vote for Affymetrix. The analysis method for affymetrix data is well : studied (with many open source tools available), which is NOT the case for : agilent arrays.
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j****x 发帖数: 1704 | 7 可以说基本上不存在你提到的这种问题
1. 曾经的gold standard for chip data analysis,也就是Genespring软件,早就被
agilent收购了,直至今日,仍然是最好的软件之一。
2. Bioconductor的大部分的包,对Affymetrix, Illumina, Nimblegen, Agilent的支
持都很好。某些特殊的专有芯片除外。当然因为历史原因,很多不再更新的老包仅仅支
持Affymetrix和传统cDNA芯片,自然这些老包基本也都被取代了。
Affymetrix前几年明显在走下坡路,不仅市场占有率第一的位置被Illumina取代,还在
逐步被Nimblegen, Agilent蚕食,自身的问题不少。
【在 c*2 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : I vote for Affymetrix. The analysis method for affymetrix data is well : studied (with many open source tools available), which is NOT the case for : agilent arrays.
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