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Biology版 - 请教三个转基因cross老鼠的头痛问题,多谢了
相关主题
wierd genotyping, and need helpgenotyping 问题求助
请教转基因老鼠background strain的问题两个cre的transgenic mice cross有问题
germline transmission是个概率问题吗求助: 大家有没有遇到过这样的问题?
C57BL/6N 为啥生出了白色的老鼠用qPCR检测mRNA,高1000倍,却看不到蛋白
大家帮忙看看这个GFP融合蛋白怎么了?问个RNAi的问题
问homologous recombination,麻烦大大们哪个公司的WB dry transfer system比较好用?
Technician Position Available in Bayarea怎么GENOTYPE HOMOZYGOTE tg MICE
用大量老鼠的同学, 用什么软件/方法管理如果genotyping结果发现一个SNP不符合HWE说明啥?
相关话题的讨论汇总
话题: 老鼠话题: cross话题: control话题: cnull
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1 (共1页)
s******y
发帖数: 220
1
本人老鼠新手,菜鸟上路就要cross三个转基因。
起始条件是:三个蛋白,蛋白C KO,蛋白S overexpression, 蛋白R point mutation
Knock in.
我杂交了 male (C het,S overexpression) 和female (R homo)。
现在第二代开始得到我想要的 Cnull, S overexprssion, R homo.
但是我的这些老鼠的genetic background很不一样,我拿到的 breeder male就是很
mixed 的背景,据说主要是FVB/N, 那个breeder female好点,是C57BL/6, 所以这后代
也杂得很厉害。back cross回去,耗时间太久,请教老鼠达人们我不back cross 老鼠
,OK不?
如果是OK的,那我的control就要很严格的match了,现在需要的control 至少是wt,
Cnull S overexpression。 如果我从cross的后代里, 比如说第二代, 得到了这些
control (wt, Cnull S), 我能不能单独把他们设定为control breeder,这样
genotpying量要少一些。 还是说我必须要从 Chet S overexpression, Rhet 的
breeding pair里面得到这些control呢?
我知道理论上后者可能是最好的,但是老鼠太多了,我单独设定control breeding
pair 可以减少好多genotyping,但是这样可行吗?
希望问清楚了,谢谢xdjm们长期以来的帮助,收益很多。
O******e
发帖数: 4845
2
比较纯的遗传背景是基本要求,建议你不要偷懒,先把这个事情搞定,不然你以后
的结果很难解释。

【在 s******y 的大作中提到】
: 本人老鼠新手,菜鸟上路就要cross三个转基因。
: 起始条件是:三个蛋白,蛋白C KO,蛋白S overexpression, 蛋白R point mutation
: Knock in.
: 我杂交了 male (C het,S overexpression) 和female (R homo)。
: 现在第二代开始得到我想要的 Cnull, S overexprssion, R homo.
: 但是我的这些老鼠的genetic background很不一样,我拿到的 breeder male就是很
: mixed 的背景,据说主要是FVB/N, 那个breeder female好点,是C57BL/6, 所以这后代
: 也杂得很厉害。back cross回去,耗时间太久,请教老鼠达人们我不back cross 老鼠
: ,OK不?
: 如果是OK的,那我的control就要很严格的match了,现在需要的control 至少是wt,

s******y
发帖数: 220
3
谢谢。
主要是那个公鼠比较杂,是个disease model, 给我的人自己好像都是用很mixed的老
鼠做的,杂交进去另一个基因是为了rescue这个病老鼠,现在杂出来的结果初步表明有
了新的基因病老鼠有救了,而且同一背景下的病老鼠还是要死。
如果我需要弄纯的话,需要back cross几代呢?
而且,像这样,male是个mixed(fvb/n为主), female 是C57BL/6, 我要cross到哪
个strain呢/
我听说要弄纯的话,要两三年呢, 有没有快点的办法?
多谢。

【在 O******e 的大作中提到】
: 比较纯的遗传背景是基本要求,建议你不要偷懒,先把这个事情搞定,不然你以后
: 的结果很难解释。

h********n
发帖数: 4079
4
这个课题的目的是什么?
要我说, 只要比较组的老鼠genetic background相同就可以了.
h********n
发帖数: 4079
O******e
发帖数: 4845
6
5代以上就基本可以接受了,所以一年内搞定。
往你disease model's background传。

【在 s******y 的大作中提到】
: 谢谢。
: 主要是那个公鼠比较杂,是个disease model, 给我的人自己好像都是用很mixed的老
: 鼠做的,杂交进去另一个基因是为了rescue这个病老鼠,现在杂出来的结果初步表明有
: 了新的基因病老鼠有救了,而且同一背景下的病老鼠还是要死。
: 如果我需要弄纯的话,需要back cross几代呢?
: 而且,像这样,male是个mixed(fvb/n为主), female 是C57BL/6, 我要cross到哪
: 个strain呢/
: 我听说要弄纯的话,要两三年呢, 有没有快点的办法?
: 多谢。

s******y
发帖数: 220
7
但是给我model的印度姑娘说,她那个disease model就是杂的啊,她们这个model马上
就要发了,不知道会不会有问题,她建议我说控制好control就OK了,我还是想多问几
个人。。。

【在 O******e 的大作中提到】
: 5代以上就基本可以接受了,所以一年内搞定。
: 往你disease model's background传。

s******y
发帖数: 220
8
snoopy所见略同,
目的就是看新杂进去的那个基因能不能救heart failure的小鼠啊,
现在貌似是有戏。
不过那genetic background 乱七八糟的,老板也很concern,看到新老鼠活着他担心是
杂交的artifact,后来新背景下的病鼠挂了,才好点。
不过他也不懂老鼠。。。

【在 h********n 的大作中提到】
: 这个课题的目的是什么?
: 要我说, 只要比较组的老鼠genetic background相同就可以了.

s******y
发帖数: 220
9
谢谢,我看看。

【在 h********n 的大作中提到】
: 我以前问过类似问题, 不少高人给了建议, 不知道对你有没有用:
: http://www.mitbbs.com/article/Biology/31396241_4.html
: http://www.mitbbs.com/article/Biology/31396011_4.html
: http://www.mitbbs.com/article/Biology/31397497_4.html
: http://www.mitbbs.com/article/Biology/31396717_4.html

D*a
发帖数: 6830
10
你们这个领域如果大家都是杂的,你也就无所谓了。不过如果你的课题贯穿好几代的话
,既然无论如何要breeding,那么还是纯化一下背景比较好。
你既然已经有背景问题,control就更要用littermate的了。否则你更说不清楚是不是
artifact。
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如果genotyping结果发现一个SNP不符合HWE说明啥?大家帮忙看看这个GFP融合蛋白怎么了?
genotype 的价格问homologous recombination,麻烦大大们
一个GWAS genotype imputation的问题Technician Position Available in Bayarea
各位师弟师妹,到发考题版来学习一下吧用大量老鼠的同学, 用什么软件/方法管理
wierd genotyping, and need helpgenotyping 问题求助
请教转基因老鼠background strain的问题两个cre的transgenic mice cross有问题
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C57BL/6N 为啥生出了白色的老鼠用qPCR检测mRNA,高1000倍,却看不到蛋白
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话题: 老鼠话题: cross话题: control话题: cnull